SAXSdb — 1ytz

▼

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Troponin T

Gallus gallus

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3）与蛋白拷贝数一致	链 T； UniProt 156–262	未记录	Troponin I × 1 （P68246） Troponin C × 1 （P02588） DR6 ALPHA-[4-(1,1,3,3 - TETRAMETHYLBUTYL)PHENYL]-OMEGA-HYDROXY-POLY(OXY-1,2-ETHANEDIYL) × 3 CA CALCIUM ION × 4	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；298 K；0.4 M NaH2PO4/1.6 M K2HPO4, 200 mM NaCl, 0.1 M immidazole, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K	分辨率 3.00 Å R-free 0.338
2	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric（6）与蛋白拷贝数一致	链 T； UniProt 156–262	未记录	Troponin I × 2 （P68246） Troponin C × 2 （P02588） DR6 ALPHA-[4-(1,1,3,3 - TETRAMETHYLBUTYL)PHENYL]-OMEGA-HYDROXY-POLY(OXY-1,2-ETHANEDIYL) × 6 CA CALCIUM ION × 8	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；298 K；0.4 M NaH2PO4/1.6 M K2HPO4, 200 mM NaCl, 0.1 M immidazole, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K	分辨率 3.00 Å R-free 0.338

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB	相对当前条目 1YTZ	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
1YV0 Crystal structure of skeletal muscle troponin in the Ca2+-free state 提交 2005-02-14	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 T 156–262（107 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；277 K；1.6 M tri-Sodium Citrate dihydrate, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K	分辨率 7.00 Å R-free 0.359
1YV0 Crystal structure of skeletal muscle troponin in the Ca2+-free state 提交 2005-02-14	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric	链 T 156–262（107 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 4	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；277 K；1.6 M tri-Sodium Citrate dihydrate, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K	分辨率 7.00 Å R-free 0.359
2W49 ISOMETRICALLY CONTRACTING INSECT ASYNCHRONOUS FLIGHT MUSCLE 提交 2008-11-24	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 36 PDB 声明：36-meric	链 1 148–237（90 aa）片段：RESIDUES 148-237 链 4 148–237（90 aa）片段：RESIDUES 148-237 链 7 148–237（90 aa）片段：RESIDUES 148-237 链 Y 148–237（90 aa）片段：RESIDUES 148-237	未记录	CA CALCIUM ION × 16	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 20 MM MOPS BUFFER, 5 MM NAN3, AND MGCL2, ATP, CACL2, AND EGTA IN VARYING MILLIMOLAR CONCENTRATIONS；20 MM MOPS BUFFER, 5 MM NAN3, AND MGCL2, ATP, CACL2, AND EGTA IN VARYING MILLIMOLAR CONCENTRATIONS cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 HELIUM；SMASH AGAINST A LIQUID HELIUM COOLED GOLD COATED COPPER MIRROR	分辨率 35.00 Å
2W4U Isometrically contracting insect asynchronous flight muscle quick frozen after a length step 提交 2008-12-02	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 36 PDB 声明：36-meric	链 1 148–237（90 aa）片段：RESIDUES 148-237 链 4 148–237（90 aa）片段：RESIDUES 148-237 链 7 148–237（90 aa）片段：RESIDUES 148-237 链 Y 148–237（90 aa）片段：RESIDUES 148-237	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 20 MM MOPS BUFFER, 5 MM NAN3, AND MGCL2, ATP, CACL2, AND EGTA IN VARYING MILLIMOLAR CONCENTRATIONS；20 MM MOPS BUFFER, 5 MM NAN3, AND MGCL2, ATP, CACL2, AND EGTA IN VARYING MILLIMOLAR CONCENTRATIONS cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 HELIUM；SMASH AGAINST A LIQUID HELIUM COOLED GOLD COATED COPPER MIRROR	分辨率 35.00 Å
2Z5H Crystal structure of the head-to-tail junction of tropomyosin complexed with a fragment of TnT 提交 2007-07-12	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 T 58–112（55 aa）片段：Residues 58-112	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；293 K；pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 2.89 Å R-free 0.247

共 4 个其他 PDB 条目、5 个 assembly。打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	TNNT3_CHICK
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 T； PDB构建体 1–107； UniProt 156–262

Troponin I

Gallus gallus

UniProt P68246

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3）与蛋白拷贝数一致	链 I； UniProt 1–182	未记录	Troponin T × 1 （P12620） Troponin C × 1 （P02588） DR6 ALPHA-[4-(1,1,3,3 - TETRAMETHYLBUTYL)PHENYL]-OMEGA-HYDROXY-POLY(OXY-1,2-ETHANEDIYL) × 3 CA CALCIUM ION × 4	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；298 K；0.4 M NaH2PO4/1.6 M K2HPO4, 200 mM NaCl, 0.1 M immidazole, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K	分辨率 3.00 Å R-free 0.338
2	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric（6）与蛋白拷贝数一致	链 I； UniProt 1–182	未记录	Troponin T × 2 （P12620） Troponin C × 2 （P02588） DR6 ALPHA-[4-(1,1,3,3 - TETRAMETHYLBUTYL)PHENYL]-OMEGA-HYDROXY-POLY(OXY-1,2-ETHANEDIYL) × 6 CA CALCIUM ION × 8	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；298 K；0.4 M NaH2PO4/1.6 M K2HPO4, 200 mM NaCl, 0.1 M immidazole, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K	分辨率 3.00 Å R-free 0.338

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB	相对当前条目 1YTZ	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
1VDI Solution structure of actin-binding domain of troponin in Ca2+-free state 提交 2004-03-22	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 131–182（52 aa）片段：residues 131-182	未记录	未记录非水小分子	SOLUTION NMR mmCIF 未提供已读取条件	分辨率未提供
1VDJ Solution structure of actin-binding domain of troponin in Ca2+-bound state 提交 2004-03-22	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 131–182（52 aa）片段：residues 131-182	未记录	未记录非水小分子	SOLUTION NMR mmCIF 未提供已读取条件	分辨率未提供
1YV0 Crystal structure of skeletal muscle troponin in the Ca2+-free state 提交 2005-02-14	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 I 1–137（137 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；277 K；1.6 M tri-Sodium Citrate dihydrate, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K	分辨率 7.00 Å R-free 0.359
1YV0 Crystal structure of skeletal muscle troponin in the Ca2+-free state 提交 2005-02-14	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric	链 I 1–137（137 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 4	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；277 K；1.6 M tri-Sodium Citrate dihydrate, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K	分辨率 7.00 Å R-free 0.359
2W49 ISOMETRICALLY CONTRACTING INSECT ASYNCHRONOUS FLIGHT MUSCLE 提交 2008-11-24	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 36 PDB 声明：36-meric	链 2 4–144（141 aa）片段：RESIDUES 4-144 链 5 4–144（141 aa）片段：RESIDUES 4-144 链 8 4–144（141 aa）片段：RESIDUES 4-144 链 Z 4–144（141 aa）片段：RESIDUES 4-144	未记录	CA CALCIUM ION × 16	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 20 MM MOPS BUFFER, 5 MM NAN3, AND MGCL2, ATP, CACL2, AND EGTA IN VARYING MILLIMOLAR CONCENTRATIONS；20 MM MOPS BUFFER, 5 MM NAN3, AND MGCL2, ATP, CACL2, AND EGTA IN VARYING MILLIMOLAR CONCENTRATIONS cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 HELIUM；SMASH AGAINST A LIQUID HELIUM COOLED GOLD COATED COPPER MIRROR	分辨率 35.00 Å
2W4U Isometrically contracting insect asynchronous flight muscle quick frozen after a length step 提交 2008-12-02	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 36 PDB 声明：36-meric	链 2 4–144（141 aa）片段：RESIDUES 4-144 链 5 4–144（141 aa）片段：RESIDUES 4-144 链 8 4–144（141 aa）片段：RESIDUES 4-144 链 Z 4–144（141 aa）片段：RESIDUES 4-144	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 20 MM MOPS BUFFER, 5 MM NAN3, AND MGCL2, ATP, CACL2, AND EGTA IN VARYING MILLIMOLAR CONCENTRATIONS；20 MM MOPS BUFFER, 5 MM NAN3, AND MGCL2, ATP, CACL2, AND EGTA IN VARYING MILLIMOLAR CONCENTRATIONS cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 HELIUM；SMASH AGAINST A LIQUID HELIUM COOLED GOLD COATED COPPER MIRROR	分辨率 35.00 Å

共 5 个其他 PDB 条目、6 个 assembly。打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	TNNI2_CHICK
Isoform	—
PDB实体	2
链与序列区间	作者链 I； PDB构建体 1–182； UniProt 1–182

Troponin C

Gallus gallus

UniProt P02588

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3）与蛋白拷贝数一致	链 C； UniProt 1–162	未记录	Troponin T × 1 （P12620） Troponin I × 1 （P68246） DR6 ALPHA-[4-(1,1,3,3 - TETRAMETHYLBUTYL)PHENYL]-OMEGA-HYDROXY-POLY(OXY-1,2-ETHANEDIYL) × 3 CA CALCIUM ION × 4	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；298 K；0.4 M NaH2PO4/1.6 M K2HPO4, 200 mM NaCl, 0.1 M immidazole, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K	分辨率 3.00 Å R-free 0.338
2	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric（6）与蛋白拷贝数一致	链 C； UniProt 1–162	未记录	Troponin T × 2 （P12620） Troponin I × 2 （P68246） DR6 ALPHA-[4-(1,1,3,3 - TETRAMETHYLBUTYL)PHENYL]-OMEGA-HYDROXY-POLY(OXY-1,2-ETHANEDIYL) × 6 CA CALCIUM ION × 8	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；298 K；0.4 M NaH2PO4/1.6 M K2HPO4, 200 mM NaCl, 0.1 M immidazole, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K	分辨率 3.00 Å R-free 0.338

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB	相对当前条目 1YTZ	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
1AVS X-RAY CRYSTALLOGRAPHIC STUDY OF CALCIUM-SATURATED N-TERMINAL DOMAIN OF TROPONIN C 提交 1997-09-19	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–90（90 aa）片段：N-TERMINAL DOMAIN, RESIDUES 1 - 90	未记录	CA CALCIUM ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 7.5；72 % AMMONIUM SULFATE 100 MM TRIS 2 % MPD, 5 MM CALCIUM CHLORIDE PH 7.5	分辨率 1.75 Å R-free 0.250
1AVS X-RAY CRYSTALLOGRAPHIC STUDY OF CALCIUM-SATURATED N-TERMINAL DOMAIN OF TROPONIN C 提交 1997-09-19	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 1–90（90 aa）片段：N-TERMINAL DOMAIN, RESIDUES 1 - 90	未记录	CA CALCIUM ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 7.5；72 % AMMONIUM SULFATE 100 MM TRIS 2 % MPD, 5 MM CALCIUM CHLORIDE PH 7.5	分辨率 1.75 Å R-free 0.250
1BLQ STRUCTURE AND INTERACTION SITE OF THE REGULATORY DOMAIN OF TROPONIN-C WHEN COMPLEXED WITH THE 96-148 REGION OF TROPONIN-I, NMR, 29 STRUCTURES 提交 1998-07-19	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–90（90 aa）片段：REGULATORY	未记录	未记录非水小分子	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 6.85；303 K；离子强度（mmCIF原始值）100 mM KCL；压力 1 NMR样品组成 H2O	分辨率未提供
1CTA DETERMINATION OF THE SOLUTION STRUCTURE OF A SYNTHETIC TWO-SITE CALCIUM-BINDING HOMODIMERIC PROTEIN DOMAIN BY NMR SPECTROSCOPY 提交 1992-11-12	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 93–126（34 aa）链 B 93–126（34 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	CA CALCIUM ION × 2	SOLUTION NMR mmCIF 未提供已读取条件	分辨率未提供
1CTD DETERMINATION OF THE SOLUTION STRUCTURE OF A SYNTHETIC TWO-SITE CALCIUM-BINDING HOMODIMERIC PROTEIN DOMAIN BY NMR SPECTROSCOPY 提交 1992-11-12	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 93–126（34 aa）链 B 93–126（34 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	CA CALCIUM ION × 2	SOLUTION NMR mmCIF 未提供已读取条件	分辨率未提供
1JC2 COMPLEX OF THE C-DOMAIN OF TROPONIN C WITH RESIDUES 1-40 OF TROPONIN I 提交 2001-06-07	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 89–163（75 aa）片段：residues 89-163 of GB entry 212778	未记录	CA CALCIUM ION × 2	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 6.8；303 K；离子强度（mmCIF原始值）0.1；压力 ambiant NMR样品组成 ~1.3 mM C-domain of Sqeletal Troponin C, 1.9 mM of TnI peptide (residues 1-40), 100 mM KCl, 10 mM Imidazole, 1 mM DSS \| 90% H2O/10% D2O	分辨率未提供
1NCX TROPONIN C 提交 1996-06-02	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–162（162 aa）	未记录	CD CADMIUM ION × 2 SO4 SULFATE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 1.80 Å
1NCY TROPONIN-C, COMPLEX WITH MANGANESE 提交 1996-06-02	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–162（162 aa）	未记录	MN MANGANESE (II) ION × 2 SO4 SULFATE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 2.10 Å
1NCZ TROPONIN C 提交 1996-06-02	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–162（162 aa）	未记录	TB TERBIUM(III) ION × 2 SO4 SULFATE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 1.80 Å
1NPQ structure of a rhodamine-labeled N-domain Troponin C mutant (Ca2+ saturated) in complex with skeletal Troponin I 115-131 提交 2003-01-18	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1–90（90 aa）片段：TnC, residues 1-90	突变：E56C, E63C	CA CALCIUM ION × 2	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 6.5；303 K；离子强度（mmCIF原始值）320 mM KCl；压力 ambiant NMR样品组成 320 mM KCl, 10 mM imidazole, 1.3% NaN3, pH 6.5, ~1mM sNTnC.2Ca2+.TnI115-131.BR56-63 \| 90% H2O/10% D2O	分辨率未提供
1PON SITE III-SITE IV TROPONIN C HETERODIMER, NMR 提交 1996-04-02	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 93–126（34 aa）片段：SITE III AND IV 链 B 129–162（34 aa）片段：SITE III AND IV	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	未记录非水小分子	SOLUTION NMR mmCIF 未提供已读取条件	分辨率未提供
1SKT SOLUTION STRUCTURE OF APO N-DOMAIN OF TROPONIN C, NMR, 40 STRUCTURES 提交 1998-04-06	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–90（90 aa）片段：N-DOMAIN, RESIDUES 1-90	未记录	未记录非水小分子	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 6.7；277 K；离子强度（mmCIF原始值）50mM KCL；压力 1 NMR样品组成 WATER	分辨率未提供
1SMG CALCIUM-BOUND E41A MUTANT OF THE N-DOMAIN OF CHICKEN TROPONIN C, NMR, 40 STRUCTURES 提交 1997-02-04	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–90（90 aa）片段：N-DOMAIN	突变：E41A	CA CALCIUM ION × 1	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 6.7；303.15 K	分辨率未提供
1TNP STRUCTURES OF THE APO AND CALCIUM TROPONIN-C REGULATORY DOMAINS: THE MUSCLE CONTRACTION SWITCH 提交 1995-07-07	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–90（90 aa）	未记录	未记录非水小分子	SOLUTION NMR mmCIF 未提供已读取条件	分辨率未提供
1TNQ STRUCTURES OF THE APO AND CALCIUM TROPONIN-C REGULATORY DOMAINS: THE MUSCLE CONTRACTION SWITCH 提交 1995-07-07	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–90（90 aa）	未记录	CA CALCIUM ION × 2	SOLUTION NMR mmCIF 未提供已读取条件	分辨率未提供
1TNW NMR SOLUTION STRUCTURE OF CALCIUM SATURATED SKELETAL MUSCLE TROPONIN C 提交 1995-08-23	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 2–163（162 aa）	突变：T130I	未记录非水小分子	SOLUTION NMR mmCIF 未提供已读取条件	分辨率未提供
1TNX NMR SOLUTION STRUCTURE OF CALCIUM SATURATED SKELETAL MUSCLE TROPONIN C 提交 1995-08-23	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 2–163（162 aa）	突变：T130I	未记录非水小分子	SOLUTION NMR mmCIF 未提供已读取条件	分辨率未提供
1TOP STRUCTURE OF CHICKEN SKELETAL MUSCLE TROPONIN-C AT 1.78 ANGSTROMS RESOLUTION 提交 1993-08-11	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–162（162 aa）	未记录	CA CALCIUM ION × 2 SO4 SULFATE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 1.78 Å
1YV0 Crystal structure of skeletal muscle troponin in the Ca2+-free state 提交 2005-02-14	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 C 1–162（162 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；277 K；1.6 M tri-Sodium Citrate dihydrate, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K	分辨率 7.00 Å R-free 0.359
1YV0 Crystal structure of skeletal muscle troponin in the Ca2+-free state 提交 2005-02-14	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric	链 C 1–162（162 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 4	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；277 K；1.6 M tri-Sodium Citrate dihydrate, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K	分辨率 7.00 Å R-free 0.359
1ZAC N-DOMAIN OF TROPONIN C FROM CHICKEN SKELETAL MUSCLE, NMR, MINIMIZED AVERAGE STRUCTURE 提交 1998-04-07	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–90（90 aa）片段：N-DOMAIN, RESIDUES 1-90	未记录	未记录非水小分子	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 6.7；277 K；离子强度（mmCIF原始值）50mM KCL；压力 1 NMR样品组成 WATER	分辨率未提供
2W49 ISOMETRICALLY CONTRACTING INSECT ASYNCHRONOUS FLIGHT MUSCLE 提交 2008-11-24	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 36 PDB 声明：36-meric	链 0 5–163（159 aa）片段：RESIDUES 5-163 链 3 5–163（159 aa）片段：RESIDUES 5-163 链 6 5–163（159 aa）片段：RESIDUES 5-163 链 9 5–163（159 aa）片段：RESIDUES 5-163	未记录	CA CALCIUM ION × 16	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 20 MM MOPS BUFFER, 5 MM NAN3, AND MGCL2, ATP, CACL2, AND EGTA IN VARYING MILLIMOLAR CONCENTRATIONS；20 MM MOPS BUFFER, 5 MM NAN3, AND MGCL2, ATP, CACL2, AND EGTA IN VARYING MILLIMOLAR CONCENTRATIONS cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 HELIUM；SMASH AGAINST A LIQUID HELIUM COOLED GOLD COATED COPPER MIRROR	分辨率 35.00 Å
2W4U Isometrically contracting insect asynchronous flight muscle quick frozen after a length step 提交 2008-12-02	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 36 PDB 声明：36-meric	链 0 5–163（159 aa）片段：RESIDUES 5-163 链 3 5–163（159 aa）片段：RESIDUES 5-163 链 6 5–163（159 aa）片段：RESIDUES 5-163 链 9 5–163（159 aa）片段：RESIDUES 5-163	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 20 MM MOPS BUFFER, 5 MM NAN3, AND MGCL2, ATP, CACL2, AND EGTA IN VARYING MILLIMOLAR CONCENTRATIONS；20 MM MOPS BUFFER, 5 MM NAN3, AND MGCL2, ATP, CACL2, AND EGTA IN VARYING MILLIMOLAR CONCENTRATIONS cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 HELIUM；SMASH AGAINST A LIQUID HELIUM COOLED GOLD COATED COPPER MIRROR	分辨率 35.00 Å
4TNC REFINED STRUCTURE OF CHICKEN SKELETAL MUSCLE TROPONIN C IN THE TWO-CALCIUM STATE AT 2-ANGSTROMS RESOLUTION 提交 1987-09-28	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 2–162（161 aa）	未记录	CA CALCIUM ION × 2	X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 2.00 Å

共 22 个其他 PDB 条目、24 个 assembly。打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	TNNC2_CHICK
Isoform	—
PDB实体	3
链与序列区间	作者链 C； PDB构建体 1–162； UniProt 1–162

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	1ytz
沉积日期 deposition_date	2005-02-11
结构标题 title	Crystal structure of skeletal muscle troponin in the Ca2+-activated state
关键词 keywords	troponin, muscle, thin filament, actin binding, calcium, CONTRACTILE PROTEIN; CONTRACTILE PROTEIN
实验方法 method	X-RAY DIFFRACTION

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3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

回转半径 Rg (Guinier) rg_guinier	28.71 Å
回转半径 Rg (电子) rg_electron	27.85 Å
零角强度 I(0) i0	36825000.00
分子量 molecular_weight	46437.0 kDa
排除体积 excluded_volume	58045 Å³
包络体积 envelope_volume	80684 Å³
水化壳体积 shell_volume	25091 Å³
包络直径 envelope_diameter	99.7 Å
壳层 Rg shell_rg	33.89 Å
包络 Rg envelope_rg	27.58 Å
形状 Rg shape_rg	27.84 Å
总 Rg total_rg	28.57 Å
总原子数 total_atoms	3249
残基数 n_residues	390
球谐函数阶数 n_harmonics	20
q 范围 q_range	— – 0.5000 Å⁻¹
数据点数 n_points	101
壳层类型 shell_type	directional
溶剂电子密度 solvent_density	0.3340 e/Å³
壳层衬度 contrast_shell	0.0300 e/Å³
CRYSOL 版本 crysol_version	4.1.3

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4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

最大尺寸 Dmax dmax	94.0 Å
Rg (实空间) rg_real	28.65 Å
Rg 误差 (实空间) rg_real_error	0.67 Å
I(0) (实空间) i0_real	3.6820e+07
I(0) 误差 (实空间) i0_real_error	5.2150e+05
Rg (倒空间) rg_reciprocal	28.68 Å
I(0) (倒空间) i0_reciprocal	36830000.0000
解质量估计 total_estimate	0.8957
解质量评级 solution_quality	GOOD a GOOD solution
P(r) 峰数 n_peaks	2
主峰位置 r_peak_primary	41.0 Å
偏度 Skewness skewness	0.131
峰度 Kurtosis kurtosis	-0.581
角度范围 angular_range	— – 0.2750 Å⁻¹
当前正则化参数 α current_alpha	0.0000
最高正则化参数 α highest_alpha	4428000.0000
实空间数据点数 n_real_points	56
GNOM 版本 gnom_version	4.1.3
质量判据 quality_criteria	AN1: 0.000; Oscil: 0.901; Stabil: 1.000; Sysdev: 1.000; Positv: 1.000; Valcen: 0.954; Smooth: 0.984

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5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

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6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (6)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	Troponin T
分子量 formula_weight	12694.7 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	T
原子数 atom_count	3282

MGASYSSYLAKADQKRGKKQTARETKKKVLAERRKPLNIDHLNEDKLRDKAKELWDWLYQLQTEKYDFAEQIKRKKYEIVTLRNRIDQAQKHSKKAGAKGKVGGRWK

来源 Source

来源生物 organism	Gallus gallus
通用名 common_name	chicken
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9031
宿主生物 host_organism	Escherichia coli BL21(DE3)

实体 2 Entity 2 polymer

描述 description	Troponin I
分子量 formula_weight	21116.2 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	I

SDEEKKRRAATARRQHLKSAMLQLAVTEIEKEAAAKEVEKQNYLAEHSPPLSLPGSMQELQELSKKLHAKIDSVDEERYDTEVKLQKTNKELEDLSQKLFDLRGKFKRPPLRRVRMSADAMLRALLGSKHKVNMDLRANLKQVKKEDTEKEKDLRDVGDWRKNIEEKSGMEGRKKMFEAGES

来源 Source

来源生物 organism	Gallus gallus
通用名 common_name	chicken
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9031
宿主生物 host_organism	Escherichia coli BL21(DE3)

实体 3 Entity 3 polymer

描述 description	Troponin C
分子量 formula_weight	18261.2 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	C

ASMTDQQAEARAFLSEEMIAEFKAAFDMFDADGGGDISTKELGTVMRMLGQNPTKEELDAIIEEVDEDGSGTIDFEEFLVMMVRQMKEDAKGKSEEELANCFRIFDKNADGFIDIEELGEILRATGEHVTEEDIEDLMKDSDKNNDGRIDFDEFLKMMEGVQ

来源 Source

来源生物 organism	Gallus gallus
通用名 common_name	chicken
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9031
宿主生物 host_organism	Escherichia coli BL21(DE3)

实体 4 Entity 4 non-polymer

描述 description	ALPHA-[4-(1,1,3,3 - TETRAMETHYLBUTYL)PHENYL]-OMEGA-HYDROXY-POLY(OXY-1,2-ETHANEDIYL)
分子量 formula_weight	1527.9 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	3

实体 5 Entity 5 non-polymer

描述 description	CALCIUM ION
分子量 formula_weight	40.1 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	4

实体 6 Entity 6 water

描述 description	water
分子量 formula_weight	18.0 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	33

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7. 折叠分类 (SCOP + CATH) 7 domains

SCOP 2.08 (3 domains)

结构域编号 domain_id	d1ytzc_
类 Class class	a — All alpha proteins
折叠类型 Fold fold	a.39 — EF Hand-like
超家族 Superfamily superfamily	a.39.1 — EF-hand
家族 Family family	a.39.1.5 — Calmodulin-like

结构域编号 domain_id	d1ytzi1
类 Class class	h — Coiled coil proteins
折叠类型 Fold fold	h.1 — Parallel coiled-coil
超家族 Superfamily superfamily	h.1.25 — Troponin coil-coiled subunits
家族 Family family	h.1.25.2 — Troponin I

结构域编号 domain_id	d1ytzt1
类 Class class	h — Coiled coil proteins
折叠类型 Fold fold	h.1 — Parallel coiled-coil
超家族 Superfamily superfamily	h.1.25 — Troponin coil-coiled subunits
家族 Family family	h.1.25.1 — Troponin T

CATH v4.4 (4 domains)

结构域编号 domain_id	1ytzC01
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology	238 — Recoverin; domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — EF-hand

结构域编号 domain_id	1ytzC02
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology	238 — Recoverin; domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — EF-hand

结构域编号 domain_id	1ytzI01
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	20 — Up-down Bundle
拓扑 Topology topology	5 — Single alpha-helices involved in coiled-coils or other helix-helix interfaces
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	350 — Troponin complex, TnI/TnT subunit

结构域编号 domain_id	1ytzT00
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	20 — Up-down Bundle
拓扑 Topology topology	5 — Single alpha-helices involved in coiled-coils or other helix-helix interfaces
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	350 — Troponin complex, TnI/TnT subunit

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8. 引用文献 (1)

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晶胞边长 a length_a	138.608 Å
晶胞边长 b length_b	138.608 Å
晶胞边长 c length_c	83.676 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	90.00 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	90.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	8

空间群 space_group	P 43 21 2
空间群编号 int_tables_number	96
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	3.000 Å
最低分辨率 resolution_low	25.000 Å
R 因子 r_factor	0.2893
R_work r_work	0.2893
R_free r_free	0.3375

fit	/app/data/saxs_computation/yt/1ytz/1ytz.fit
pddf	/app/data/pr_computation/yt/1ytz/1ytz.pr.out
profile	/app/data/saxs_computation/yt/1ytz/1ytz.dat

Crystal structure of skeletal muscle troponin in the Ca2+-activated state

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Troponin T

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

Troponin I

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

Troponin C

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (6)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 3 Entity 3 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 4 Entity 4 non-polymer

实体 5 Entity 5 non-polymer

实体 6 Entity 6 water

7. 折叠分类 (SCOP + CATH) 7 domains

SCOP 2.08 (3 domains)

CATH v4.4 (4 domains)

8. 引用文献 (1)

9. 文件与曲线 (10)

Files (7)

Curves (3)