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1zwo

NMR structure of murine gamma-S crystallin

Method: SOLUTION NMR Dmax: 58.1 Å Quality: GOOD
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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Gamma crystallin S

Mus musculus

UniProt O35486

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白单体 单体 蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白拷贝数一致 链 A； UniProt 1–177 未记录 无其他共同聚合物 SOLUTION NMR NMR测量条件：pH 6；298 K；离子强度（mmCIF原始值）25 mM imidazole, 10 mM KCl, 0.04% NaN3；压力 1 NMR样品组成：0.7-1.5 mM gS, 25 mM imidazole, pH 6.0, 10 mM KCl, 0.04% NaN3, 25C. Dipolar couplings measured in 2H/15N/13C gammaS, in stretched polyacrylamide gel, and in 3 mg/mL Pf1 (gelled), 120 mM KCl; 90% H2O, 10% D2O | 90% H2O/10% D2O 分辨率未提供

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 1ZWO Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
1ZWM NMR structure of murine gamma-S crystallin 提交 2005-06-03 实验环境不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–177（177 aa）
未记录 未记录非水小分子 SOLUTION NMR
NMR测量条件 pH 6；298 K；离子强度（mmCIF原始值）25 mM imidazole, 10 mM KCl, 0.04% NaN3；压力 1
NMR样品组成 0.7-1.5 mM gS, 25 mM imidazole, pH 6.0, 10 mM KCl, 0.04% NaN3. Dipolar couplings measured in 2H/15N/13C gammaS, in stretched polyacrylamide gel, and in 3 mg/mL Pf1 (gelled), 120 mM KCl; 90% H2O, 10% D2O | 90% H2O/10% D2O
分辨率未提供
2A5M NMR structure of murine gamma-S crystallin from joint refinement with SAXS data 提交 2005-06-30 实验环境不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–177（177 aa）
未记录 未记录非水小分子 SOLUTION NMR
NMR测量条件 pH 6；291.4 K；离子强度（mmCIF原始值）25 mM IMIDAZOLE, 10 mM KCL, 0.04% NaN3；压力 1
NMR样品组成 0.22 mM gamma-S crystallin, 25 mM imidazole, pH 6.0, 10 mM KCl, 0.04% NaN3, 10 mM DTT, for SAXS data. All NMR conditions as reported for 1ZWM | 90% H2O/10% D2O
分辨率未提供
6MYG Mouse Gamma S Crystallin L16 Octamer 提交 2018-11-01 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 A 1–178（178 aa）
链 B 1–178（178 aa）
链 C 1–178（178 aa）
链 D 1–178（178 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；297 K；0.15 M Sodium acetate pH 5.0, 22% PEG MME 550, 8% PEG 300
分辨率 2.92 Å R-free 0.284
7RJ0 Mouse Gamma S Crystallin L16 Octamer 提交 2021-07-20 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 A 2–178（177 aa）
链 B 2–178（177 aa）
链 C 2–178（177 aa）
链 D 2–178（177 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5；297 K；0.15 M sodium acetate, pH 5.0, 22% PEG550 MME, 8% PEG300
分辨率 2.92 Å R-free 0.290
9Z75 Crystal Structure of Wild-type Mouse Gamma(S)-Crystallin 提交 2025-11-16 构建体不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 6–178（173 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277.15 K；0.1 M HEPES, 0.5% v/v Jeffamine
分辨率 1.83 Å R-free 0.193

共 5 个其他 PDB 条目、5 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 CRBS_MOUSE
Isoform —
PDB实体 1
链与序列区间 作者链 A； PDB构建体 1–177； UniProt 1–177

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

SAXS profile for 1zwo

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

P(r) distribution for 1zwo
下载 Download
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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id1zwo
沉积日期 deposition_date2005-06-04
结构标题 titleNMR structure of murine gamma-S crystallin
关键词 keywords;alignment, deuteration, liquid crystal, Pf1, relaxation, RDC, residual dipolar coupling, molecular fragment replacement, MFR, Structural Protein ;; STRUCTURAL PROTEIN
实验方法 methodSOLUTION NMR
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3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

回转半径 Rg (Guinier) rg_guinier18.46 Å
回转半径 Rg (电子) rg_electron18.10 Å
零角强度 I(0) i02566180000.00
分子量 molecular_weight413730.0 kDa
排除体积 excluded_volume509460 ų
包络体积 envelope_volume42318 ų
水化壳体积 shell_volume18647 ų
包络直径 envelope_diameter63.4 Å
壳层 Rg shell_rg25.07 Å
包络 Rg envelope_rg19.40 Å
形状 Rg shape_rg18.07 Å
总 Rg total_rg18.28 Å
总原子数 total_atoms56640
残基数 n_residues3540
球谐函数阶数 n_harmonics20
q 范围 q_range— – 0.5000 Å−1
数据点数 n_points101
壳层类型 shell_typedirectional
溶剂电子密度 solvent_density0.3340 e/ų
壳层衬度 contrast_shell0.0300 e/ų
CRYSOL 版本 crysol_version4.1.3
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4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

最大尺寸 Dmax dmax58.1 Å
Rg (实空间) rg_real18.48 Å
Rg 误差 (实空间) rg_real_error0.40 Å
I(0) (实空间) i0_real2.5660e+09
I(0) 误差 (实空间) i0_real_error3.0940e+07
Rg (倒空间) rg_reciprocal18.48 Å
I(0) (倒空间) i0_reciprocal2566000000.0000
解质量估计 total_estimate0.8200
解质量评级 solution_quality GOOD a GOOD solution
P(r) 峰数 n_peaks2
主峰位置 r_peak_primary19.1 Å
偏度 Skewness skewness0.308
峰度 Kurtosis kurtosis-0.560
角度范围 angular_range— – 0.4300 Å−1
当前正则化参数 α current_alpha0.0000
最高正则化参数 α highest_alpha1073000.0000
实空间数据点数 n_real_points74
GNOM 版本 gnom_version4.1.3
质量判据 quality_criteria AN1: 0.000; Oscil: 0.893; Stabil: 0.999; Sysdev: 1.000; Positv: 1.000; Valcen: 0.980; Smooth: 0.000
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5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

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6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (1)

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7. 折叠分类 (SCOP + CATH) 4 domains

SCOP 2.08 (2 domains)

结构域编号 domain_idd1zwoa1
类 Class classb — All beta proteins
折叠类型 Fold foldb.11 — gamma-Crystallin-like
超家族 Superfamily superfamilyb.11.1 — gamma-Crystallin-like
家族 Family familyb.11.1.1 — Crystallins/Ca-binding development proteins
结构域编号 domain_idd1zwoa2
类 Class classb — All beta proteins
折叠类型 Fold foldb.11 — gamma-Crystallin-like
超家族 Superfamily superfamilyb.11.1 — gamma-Crystallin-like
家族 Family familyb.11.1.1 — Crystallins/Ca-binding development proteins

CATH v4.4 (2 domains)

结构域编号 domain_id1zwoA01
类 Class class2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture60 — Sandwich
拓扑 Topology topology20 — Gamma-B Crystallin; domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — Crystallins
结构域编号 domain_id1zwoA02
类 Class class2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture60 — Sandwich
拓扑 Topology topology20 — Gamma-B Crystallin; domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — Crystallins
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8. 引用文献 (1)

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9. 文件与曲线 (10)