22fx

Cryo-EM structure of mouse heavy-chain apoferritin at 1.24 A on CRYO ARM 200 II

Method: ELECTRON MICROSCOPY D_max: 72.3 Å Quality: REASONABLE

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Ferritin heavy chain

Mus musculus

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	蛋白同源多聚体同源多聚体蛋白 × 24 PDB 声明：24-meric（24）与蛋白拷贝数一致	链 A； UniProt 1–182	未记录	FE FE (III) ION × 24 ZN ZINC ION × 24	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.5；20 mM HEPES-NaOH pH 7.5, 300 mM NaCl, 1 mM dithiothreitol (DTT) cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE；3 ul sample, 20 s blot time	分辨率 1.24 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB	相对当前条目 22FX	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
22IX cryo-ET subtomogram-averaged structure of mouse heavy-chain apoferritin resolved at 2.71 Angstroms 提交 2026-01-13	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 24 PDB 声明：24-meric	链 A 1–182（182 aa）链 B 1–182（182 aa）链 C 1–182（182 aa）链 D 1–182（182 aa）链 E 1–182（182 aa）链 F 1–182（182 aa）链 G 1–182（182 aa）链 H 1–182（182 aa）链 I 1–182（182 aa）链 J 1–182（182 aa）链 K 1–182（182 aa）链 L 1–182（182 aa）链 M 1–182（182 aa）链 N 1–182（182 aa）链 O 1–182（182 aa）链 P 1–182（182 aa）链 Q 1–182（182 aa）链 R 1–182（182 aa）链 S 1–182（182 aa）链 T 1–182（182 aa）链 U 1–182（182 aa）链 V 1–182（182 aa）链 W 1–182（182 aa）链 X 1–182（182 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 38	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5；30 mM HEPES 150 mM NaCl 1 mM DTT cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.71 Å
23WJ Subtomogram average of Apoferrtin (11x11) using CRYO ARM 300II 提交 2026-02-23	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 24 PDB 声明：24-meric	链 A 6–177（172 aa）链 B 6–177（172 aa）链 C 6–177（172 aa）链 D 6–177（172 aa）链 E 6–177（172 aa）链 F 6–177（172 aa）链 G 6–177（172 aa）链 H 6–177（172 aa）链 I 6–177（172 aa）链 J 6–177（172 aa）链 K 6–177（172 aa）链 L 6–177（172 aa）链 M 6–177（172 aa）链 N 6–177（172 aa）链 O 6–177（172 aa）链 P 6–177（172 aa）链 Q 6–177（172 aa）链 R 6–177（172 aa）链 S 6–177（172 aa）链 T 6–177（172 aa）链 U 6–177（172 aa）链 V 6–177（172 aa）链 W 6–177（172 aa）链 X 6–177（172 aa）	未记录	FE FE (III) ION × 6 ZN ZINC ION × 24	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.10 Å
3WNW Structure of Mouse H-chain modified ferritin 提交 2013-12-17	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 24 PDB 声明：24-meric	链 A 1–182（182 aa）链 B 1–182（182 aa）链 C 1–182（182 aa）链 D 1–182（182 aa）链 E 1–182（182 aa）链 F 1–182（182 aa）链 G 1–182（182 aa）链 H 1–182（182 aa）链 I 1–182（182 aa）链 J 1–182（182 aa）链 K 1–182（182 aa）链 L 1–182（182 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 40 FE FE (III) ION × 8 GOL GLYCEROL × 24 K POTASSIUM ION × 4	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；286 K；0.1M Na-cacodylate PH 6.5, 0.2 M Mg-Ac, 30% MPD, vapor diffusion, sitting drop, temperature 286K	分辨率 2.24 Å R-free 0.265
5OBA Structure of a modified mouse H-chain ferritin with a lanthanide binding motif 提交 2017-06-26	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 24 PDB 声明：24-meric	链 A 1–177（177 aa）链 B 1–177（177 aa）链 C 1–177（177 aa）链 D 1–177（177 aa）链 E 1–177（177 aa）链 F 1–177（177 aa）链 G 1–177（177 aa）链 H 1–177（177 aa）链 I 1–177（177 aa）链 J 1–177（177 aa）链 K 1–177（177 aa）链 L 1–177（177 aa）链 M 1–177（177 aa）链 N 1–177（177 aa）链 O 1–177（177 aa）链 P 1–177（177 aa）链 Q 1–177（177 aa）链 R 1–177（177 aa）链 S 1–177（177 aa）链 T 1–177（177 aa）链 U 1–177（177 aa）链 V 1–177（177 aa）链 W 1–177（177 aa）链 X 1–177（177 aa）	突变：H177G 突变：H177G 突变：H177G 突变：H177G 突变：H177G 突变：H177G 突变：H177G 突变：H177G 突变：H177G 突变：H177G 突变：H177G 突变：H177G 突变：H177G 突变：H177G 突变：H177G 突变：H177G 突变：H177G 突变：H177G 突变：H177G 突变：H177G 突变：H177G 突变：H177G 突变：H177G 突变：H177G	FE FE (III) ION × 32	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；294 K；Ammonium sulphate, Tris-HCl	分辨率 2.85 Å R-free 0.170
5OBB Structure of a modified mouse H chain ferritin with a lanthanide binding motif in complex with Terbium 提交 2017-06-26	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 24 PDB 声明：24-meric	链 A 1–177（177 aa）链 B 1–177（177 aa）链 C 1–177（177 aa）链 D 1–177（177 aa）链 E 1–177（177 aa）链 F 1–177（177 aa）链 G 1–177（177 aa）链 H 1–177（177 aa）链 I 1–177（177 aa）链 J 1–177（177 aa）链 K 1–177（177 aa）链 L 1–177（177 aa）链 M 1–177（177 aa）链 N 1–177（177 aa）链 O 1–177（177 aa）链 P 1–177（177 aa）链 Q 1–177（177 aa）链 R 1–177（177 aa）链 S 1–177（177 aa）链 T 1–177（177 aa）链 U 1–177（177 aa）链 V 1–177（177 aa）链 W 1–177（177 aa）链 X 1–177（177 aa）	未记录	TB TERBIUM(III) ION × 32	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；294 K；ammonium sulphate, TRIS-HCl	分辨率 2.65 Å R-free 0.173
6S61 Apoferritin from mouse at 1.84 angstrom resolution 提交 2019-07-02	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 24 PDB 声明：24-meric	链 A 1–182（182 aa）链 B 1–182（182 aa）链 C 1–182（182 aa）链 D 1–182（182 aa）链 E 1–182（182 aa）链 F 1–182（182 aa）链 G 1–182（182 aa）链 H 1–182（182 aa）链 I 1–182（182 aa）链 J 1–182（182 aa）链 K 1–182（182 aa）链 L 1–182（182 aa）链 M 1–182（182 aa）链 N 1–182（182 aa）链 O 1–182（182 aa）链 P 1–182（182 aa）链 Q 1–182（182 aa）链 R 1–182（182 aa）链 S 1–182（182 aa）链 T 1–182（182 aa）链 U 1–182（182 aa）链 V 1–182（182 aa）链 W 1–182（182 aa）链 X 1–182（182 aa）	未记录	FE FE (III) ION × 6 ZN ZINC ION × 24	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 1.84 Å
6SHT Molecular structure of mouse apoferritin resolved at 2.7 Angstroms with the Glacios cryo-microscope 提交 2019-08-08	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 24 PDB 声明：24-meric	链 A 1–182（182 aa）	未记录	FE FE (III) ION × 24 MG MAGNESIUM ION × 24	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.73 Å R-free 0.254
6V21 Mouse heavy chain apoferritin determined using single-particle cryo-EM at 200 keV 提交 2019-11-21	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 24 PDB 声明：24-meric	链 A 5–178（174 aa）链 B 5–178（174 aa）链 C 5–178（174 aa）链 D 5–178（174 aa）链 E 5–178（174 aa）链 F 5–178（174 aa）链 G 5–178（174 aa）链 H 5–178（174 aa）链 I 5–178（174 aa）链 J 5–178（174 aa）链 K 5–178（174 aa）链 L 5–178（174 aa）链 M 5–178（174 aa）链 N 5–178（174 aa）链 O 5–178（174 aa）链 P 5–178（174 aa）链 Q 5–178（174 aa）链 R 5–178（174 aa）链 S 5–178（174 aa）链 T 5–178（174 aa）链 U 5–178（174 aa）链 V 5–178（174 aa）链 W 5–178（174 aa）链 X 5–178（174 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE；3 uL of sample/grid was manually blotted for 4 seconds prior to immediate plunge-freezing in liquid nitrogen-cooled ethane.	分辨率 1.75 Å
7A4M Cryo-EM structure of mouse heavy-chain apoferritin at 1.22 A 提交 2020-08-20	构建体不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 24 PDB 声明：24-meric	链 A 6–177（172 aa）	未记录	FE FE (III) ION × 24 ZN ZINC ION × 24	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20mM HEPES pH 7.5 150mM NaCl cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 1.22 Å
7KOD Cryo-EM structure of heavy chain mouse apoferritin 提交 2020-11-08	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 24 PDB 声明：24-meric	链 A 1–182（182 aa）链 B 1–182（182 aa）链 C 1–182（182 aa）链 D 1–182（182 aa）链 E 1–182（182 aa）链 F 1–182（182 aa）链 G 1–182（182 aa）链 H 1–182（182 aa）链 I 1–182（182 aa）链 J 1–182（182 aa）链 K 1–182（182 aa）链 L 1–182（182 aa）链 M 1–182（182 aa）链 N 1–182（182 aa）链 O 1–182（182 aa）链 P 1–182（182 aa）链 Q 1–182（182 aa）链 R 1–182（182 aa）链 S 1–182（182 aa）链 T 1–182（182 aa）链 U 1–182（182 aa）链 V 1–182（182 aa）链 W 1–182（182 aa）链 X 1–182（182 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 1.66 Å
7TB3 cryo-EM structure of MBP-KIX-apoferritin 提交 2021-12-21	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足同源多聚体；蛋白 × 24 PDB 声明：24-meric	链 A 7–182（176 aa）链 B 7–182（176 aa）链 C 7–182（176 aa）链 D 7–182（176 aa）链 E 7–182（176 aa）链 F 7–182（176 aa）链 G 7–182（176 aa）链 H 7–182（176 aa）链 I 7–182（176 aa）链 J 7–182（176 aa）链 K 7–182（176 aa）链 L 7–182（176 aa）链 M 7–182（176 aa）链 N 7–182（176 aa）链 O 7–182（176 aa）链 P 7–182（176 aa）链 Q 7–182（176 aa）链 R 7–182（176 aa）链 S 7–182（176 aa）链 T 7–182（176 aa）链 U 7–182（176 aa）链 V 7–182（176 aa）链 W 7–182（176 aa）链 X 7–182（176 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.57 Å
7TBH cryo-EM structure of MBP-KIX-apoferritin complex with peptide 7 提交 2021-12-22	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足异源复合物；蛋白 × 48 PDB 声明：48-meric	链 A 7–182（176 aa）链 B 7–182（176 aa）链 C 7–182（176 aa）链 D 7–182（176 aa）链 E 7–182（176 aa）链 F 7–182（176 aa）链 G 7–182（176 aa）链 H 7–182（176 aa）链 I 7–182（176 aa）链 J 7–182（176 aa）链 K 7–182（176 aa）链 L 7–182（176 aa）链 M 7–182（176 aa）链 N 7–182（176 aa）链 O 7–182（176 aa）链 P 7–182（176 aa）链 Q 7–182（176 aa）链 R 7–182（176 aa）链 S 7–182（176 aa）链 T 7–182（176 aa）链 U 7–182（176 aa）链 V 7–182（176 aa）链 W 7–182（176 aa）链 X 7–182（176 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.30 Å
8BK9 Cryo-EM structure of mouse heavy-chain apoferritin at 2.1 A plunged 5ms after mixing with b-galactosidase 提交 2022-11-08	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 24 PDB 声明：24-meric	链 A 1–182（182 aa）链 B 1–182（182 aa）链 C 1–182（182 aa）链 D 1–182（182 aa）链 E 1–182（182 aa）链 F 1–182（182 aa）链 G 1–182（182 aa）链 H 1–182（182 aa）链 I 1–182（182 aa）链 J 1–182（182 aa）链 K 1–182（182 aa）链 L 1–182（182 aa）链 M 1–182（182 aa）链 N 1–182（182 aa）链 O 1–182（182 aa）链 P 1–182（182 aa）链 Q 1–182（182 aa）链 R 1–182（182 aa）链 S 1–182（182 aa）链 T 1–182（182 aa）链 V 1–182（182 aa）链 W 1–182（182 aa）链 X 1–182（182 aa）链 Y 1–182（182 aa）	未记录	FE FE (III) ION × 6	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5；contains Amaranth dye (acid red 27) 32 mM cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.10 Å
8BKA Cryo-EM structure of mouse heavy-chain apoferritin at 2.7 A plunged 35ms after mixing with b-galactosidase 提交 2022-11-08	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 24 PDB 声明：24-meric	链 A 1–182（182 aa）链 B 1–182（182 aa）链 C 1–182（182 aa）链 D 1–182（182 aa）链 E 1–182（182 aa）链 F 1–182（182 aa）链 G 1–182（182 aa）链 H 1–182（182 aa）链 I 1–182（182 aa）链 J 1–182（182 aa）链 K 1–182（182 aa）链 L 1–182（182 aa）链 M 1–182（182 aa）链 N 1–182（182 aa）链 O 1–182（182 aa）链 P 1–182（182 aa）链 Q 1–182（182 aa）链 R 1–182（182 aa）链 S 1–182（182 aa）链 T 1–182（182 aa）链 V 1–182（182 aa）链 W 1–182（182 aa）链 X 1–182（182 aa）链 Y 1–182（182 aa）	未记录	FE FE (III) ION × 6	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5；contains Amaranth dye (acid red 27) 32 mM cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.70 Å
8BKB Cryo-EM structure of mouse heavy-chain apoferritin at 2.2 A plunged 205ms after mixing with b-galactosidase 提交 2022-11-08	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 24 PDB 声明：24-meric	链 A 1–182（182 aa）链 B 1–182（182 aa）链 C 1–182（182 aa）链 D 1–182（182 aa）链 E 1–182（182 aa）链 F 1–182（182 aa）链 G 1–182（182 aa）链 H 1–182（182 aa）链 I 1–182（182 aa）链 J 1–182（182 aa）链 K 1–182（182 aa）链 L 1–182（182 aa）链 M 1–182（182 aa）链 N 1–182（182 aa）链 O 1–182（182 aa）链 P 1–182（182 aa）链 Q 1–182（182 aa）链 R 1–182（182 aa）链 S 1–182（182 aa）链 T 1–182（182 aa）链 V 1–182（182 aa）链 W 1–182（182 aa）链 X 1–182（182 aa）链 Y 1–182（182 aa）	未记录	FE FE (III) ION × 6	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5；contains Amaranth dye (acid red 27) 32 mM cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.20 Å
8EMQ Mouse apoferritin heavy chain with zinc determined using single-particle cryo-EM with Apollo camera. 提交 2022-09-28	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 24 PDB 声明：24-meric	链 A 6–177（172 aa）链 B 6–177（172 aa）链 C 6–177（172 aa）链 D 6–177（172 aa）链 E 6–177（172 aa）链 F 6–177（172 aa）链 G 6–177（172 aa）链 H 6–177（172 aa）链 I 6–177（172 aa）链 J 6–177（172 aa）链 K 6–177（172 aa）链 L 6–177（172 aa）链 M 6–177（172 aa）链 N 6–177（172 aa）链 O 6–177（172 aa）链 P 6–177（172 aa）链 Q 6–177（172 aa）链 R 6–177（172 aa）链 S 6–177（172 aa）链 T 6–177（172 aa）链 U 6–177（172 aa）链 V 6–177（172 aa）链 W 6–177（172 aa）链 X 6–177（172 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 24 FE FE (III) ION × 6	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5；DTT are added freshly before use. cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 1.66 Å
8EN7 Mouse apoferritin heavy chain without zinc determined using single-particle cryo-EM with Apollo camera. 提交 2022-09-28	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 24 PDB 声明：24-meric	链 A 6–177（172 aa）链 B 6–177（172 aa）链 C 6–177（172 aa）链 D 6–177（172 aa）链 E 6–177（172 aa）链 F 6–177（172 aa）链 G 6–177（172 aa）链 H 6–177（172 aa）链 I 6–177（172 aa）链 J 6–177（172 aa）链 K 6–177（172 aa）链 L 6–177（172 aa）链 M 6–177（172 aa）链 N 6–177（172 aa）链 O 6–177（172 aa）链 P 6–177（172 aa）链 Q 6–177（172 aa）链 R 6–177（172 aa）链 S 6–177（172 aa）链 T 6–177（172 aa）链 U 6–177（172 aa）链 V 6–177（172 aa）链 W 6–177（172 aa）链 X 6–177（172 aa）	未记录	FE FE (III) ION × 6	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5；DTT are added freshly before use. cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 1.68 Å
8J5A Single-particle cryo-EM structure of mouse apoferritin at 1.19 Angstrom resolution (Dataset A) 提交 2023-04-21	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 24 PDB 声明：24-meric	链 A 6–177（172 aa）	未记录	NA SODIUM ION × 24	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 NITROGEN	分辨率 1.19 Å
8J5A Single-particle cryo-EM structure of mouse apoferritin at 1.19 Angstrom resolution (Dataset A) 提交 2023-04-21	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 6–177（172 aa）	未记录	NA SODIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 NITROGEN	分辨率 1.19 Å
8J5A Single-particle cryo-EM structure of mouse apoferritin at 1.19 Angstrom resolution (Dataset A) 提交 2023-04-21	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 6–177（172 aa）	未记录	NA SODIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 NITROGEN	分辨率 1.19 Å
8PVC Structure of mouse heavy-chain apoferritin determined by cryoEM at 100 keV 提交 2023-07-17	实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 24 PDB 声明：24-meric	链 A 1–182（182 aa）	未记录	FE FE (III) ION × 24 ZN ZINC ION × 24	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.60 Å
8RQB Cryo-EM structure of mouse heavy-chain apoferritin 提交 2024-01-17	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 24 PDB 声明：24-meric	链 A 6–177（172 aa）链 B 6–177（172 aa）链 C 6–177（172 aa）链 D 6–177（172 aa）链 E 6–177（172 aa）链 F 6–177（172 aa）链 G 6–177（172 aa）链 H 6–177（172 aa）链 I 6–177（172 aa）链 J 6–177（172 aa）链 K 6–177（172 aa）链 L 6–177（172 aa）链 M 6–177（172 aa）链 N 6–177（172 aa）链 O 6–177（172 aa）链 P 6–177（172 aa）链 Q 6–177（172 aa）链 R 6–177（172 aa）链 S 6–177（172 aa）链 T 6–177（172 aa）链 U 6–177（172 aa）链 V 6–177（172 aa）链 W 6–177（172 aa）链 X 6–177（172 aa）	未记录	FE FE (III) ION × 6 ZN ZINC ION × 24	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 1.09 Å
8T4Q 2.07 Angstrom CryoEM Structure of Heavy Chain Apoferritin from Mus Musculus From 200kV Microscope 提交 2023-06-09	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 24 PDB 声明：24-meric	链 A 6–177（172 aa）链 B 6–177（172 aa）链 C 6–177（172 aa）链 D 6–177（172 aa）链 E 6–177（172 aa）链 F 6–177（172 aa）链 G 6–177（172 aa）链 H 6–177（172 aa）链 I 6–177（172 aa）链 J 6–177（172 aa）链 K 6–177（172 aa）链 L 6–177（172 aa）链 M 6–177（172 aa）链 N 6–177（172 aa）链 O 6–177（172 aa）链 P 6–177（172 aa）链 Q 6–177（172 aa）链 R 6–177（172 aa）链 S 6–177（172 aa）链 T 6–177（172 aa）链 U 6–177（172 aa）链 V 6–177（172 aa）链 W 6–177（172 aa）链 X 6–177（172 aa）	未记录	FE FE (III) ION × 24	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.07 Å
8TU7 Cryo-EM structure of Apoferritin collected by EPU on Glacios at 2.5 Angstrom resolution 提交 2023-08-15	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 24 PDB 声明：24-meric	链 A 1–182（182 aa）链 B 1–182（182 aa）链 C 1–182（182 aa）链 D 1–182（182 aa）链 E 1–182（182 aa）链 F 1–182（182 aa）链 G 1–182（182 aa）链 H 1–182（182 aa）链 I 1–182（182 aa）链 J 1–182（182 aa）链 K 1–182（182 aa）链 L 1–182（182 aa）链 M 1–182（182 aa）链 N 1–182（182 aa）链 O 1–182（182 aa）链 P 1–182（182 aa）链 Q 1–182（182 aa）链 R 1–182（182 aa）链 S 1–182（182 aa）链 T 1–182（182 aa）链 U 1–182（182 aa）链 V 1–182（182 aa）链 W 1–182（182 aa）链 X 1–182（182 aa）	未记录	FE FE (III) ION × 6 ZN ZINC ION × 24	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.50 Å
8TU8 Cryo-EM structure of Apoferritin collected by SerialEM on Glacios at 2.1 Angstrom resolution 提交 2023-08-15	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 24 PDB 声明：24-meric	链 A 1–182（182 aa）链 B 1–182（182 aa）链 C 1–182（182 aa）链 D 1–182（182 aa）链 E 1–182（182 aa）链 F 1–182（182 aa）链 G 1–182（182 aa）链 H 1–182（182 aa）链 I 1–182（182 aa）链 J 1–182（182 aa）链 K 1–182（182 aa）链 L 1–182（182 aa）链 M 1–182（182 aa）链 N 1–182（182 aa）链 O 1–182（182 aa）链 P 1–182（182 aa）链 Q 1–182（182 aa）链 R 1–182（182 aa）链 S 1–182（182 aa）链 T 1–182（182 aa）链 U 1–182（182 aa）链 V 1–182（182 aa）链 W 1–182（182 aa）链 X 1–182（182 aa）	未记录	FE FE (III) ION × 6 ZN ZINC ION × 24	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.10 Å
8TUE Cryo-EM structure of Apoferritin collected by Leginon on Glacios at 2.1 Angstrom resolution 提交 2023-08-16	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 24 PDB 声明：24-meric	链 A 1–182（182 aa）链 B 1–182（182 aa）链 C 1–182（182 aa）链 D 1–182（182 aa）链 E 1–182（182 aa）链 F 1–182（182 aa）链 G 1–182（182 aa）链 H 1–182（182 aa）链 I 1–182（182 aa）链 J 1–182（182 aa）链 K 1–182（182 aa）链 L 1–182（182 aa）链 M 1–182（182 aa）链 N 1–182（182 aa）链 O 1–182（182 aa）链 P 1–182（182 aa）链 Q 1–182（182 aa）链 R 1–182（182 aa）链 S 1–182（182 aa）链 T 1–182（182 aa）链 U 1–182（182 aa）链 V 1–182（182 aa）链 W 1–182（182 aa）链 X 1–182（182 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 24 FE FE (III) ION × 6	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.10 Å
9IUY Cryo-EM structure of mouse heavy-chain apoferritin resolved at 1.51 Angstroms 提交 2024-07-22	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 24 PDB 声明：24-meric	链 A 1–182（182 aa）链 B 1–182（182 aa）链 C 1–182（182 aa）链 D 1–182（182 aa）链 E 1–182（182 aa）链 F 1–182（182 aa）链 G 1–182（182 aa）链 H 1–182（182 aa）链 I 1–182（182 aa）链 J 1–182（182 aa）链 K 1–182（182 aa）链 L 1–182（182 aa）链 M 1–182（182 aa）链 N 1–182（182 aa）链 O 1–182（182 aa）链 P 1–182（182 aa）链 Q 1–182（182 aa）链 R 1–182（182 aa）链 S 1–182（182 aa）链 T 1–182（182 aa）链 U 1–182（182 aa）链 V 1–182（182 aa）链 W 1–182（182 aa）链 X 1–182（182 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 32 K POTASSIUM ION × 24 FE FE (III) ION × 6	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5；30 mM HEPES, 150 mM NaCl, 1mM DTT cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 1.51 Å
9WAL Apoferritin (118% Super resolution Nyquist, 236% physical Nyquist) by PASR on Acquisition-time Super Resolution K3 data 提交 2025-08-12	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 24 PDB 声明：24-meric	链 A 5–178（174 aa）链 B 5–178（174 aa）链 C 5–178（174 aa）链 D 5–178（174 aa）链 E 5–178（174 aa）链 F 5–178（174 aa）链 G 5–178（174 aa）链 H 5–178（174 aa）链 I 5–178（174 aa）链 J 5–178（174 aa）链 K 5–178（174 aa）链 L 5–178（174 aa）链 M 5–178（174 aa）链 N 5–178（174 aa）链 O 5–178（174 aa）链 P 5–178（174 aa）链 Q 5–178（174 aa）链 R 5–178（174 aa）链 S 5–178（174 aa）链 T 5–178（174 aa）链 U 5–178（174 aa）链 V 5–178（174 aa）链 W 5–178（174 aa）链 X 5–178（174 aa）	未记录	FE FE (III) ION × 6	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 1.67 Å

共 26 个其他 PDB 条目、28 个 assembly。打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	FRIH_MOUSE
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 1–182； UniProt 1–182

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

下载 Download SAXS (.dat) P(r) (.pr.out) CIF

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	22fx
沉积日期 deposition_date	2026-01-09
结构标题 title	Cryo-EM structure of mouse heavy-chain apoferritin at 1.24 A on CRYO ARM 200 II
关键词 keywords	apoferritin, METAL BINDING PROTEIN; METAL BINDING PROTEIN
实验方法 method	ELECTRON MICROSCOPY

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3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

回转半径 Rg (Guinier) rg_guinier	19.23 Å
回转半径 Rg (电子) rg_electron	18.43 Å
零角强度 I(0) i0	8184210.00
分子量 molecular_weight	20234.0 kDa
排除体积 excluded_volume	24961 Å³
包络体积 envelope_volume	29416 Å³
水化壳体积 shell_volume	14408 Å³
包络直径 envelope_diameter	70.2 Å
壳层 Rg shell_rg	23.42 Å
包络 Rg envelope_rg	18.86 Å
形状 Rg shape_rg	18.39 Å
总 Rg total_rg	19.36 Å
总原子数 total_atoms	2779
残基数 n_residues	173
球谐函数阶数 n_harmonics	20
q 范围 q_range	— – 0.5000 Å⁻¹
数据点数 n_points	101
壳层类型 shell_type	directional
溶剂电子密度 solvent_density	0.3340 e/Å³
壳层衬度 contrast_shell	0.0300 e/Å³
CRYSOL 版本 crysol_version	4.1.3

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4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

最大尺寸 Dmax dmax	72.3 Å
Rg (实空间) rg_real	19.39 Å
Rg 误差 (实空间) rg_real_error	0.65 Å
I(0) (实空间) i0_real	8.1840e+06
I(0) 误差 (实空间) i0_real_error	1.0480e+05
Rg (倒空间) rg_reciprocal	19.37 Å
I(0) (倒空间) i0_reciprocal	8184000.0000
解质量估计 total_estimate	0.6952
解质量评级 solution_quality	REASONABLE a REASONABLE solution
P(r) 峰数 n_peaks	2
主峰位置 r_peak_primary	19.1 Å
偏度 Skewness skewness	0.565
峰度 Kurtosis kurtosis	-0.152
角度范围 angular_range	— – 0.4150 Å⁻¹
当前正则化参数 α current_alpha	0.0000
最高正则化参数 α highest_alpha	2465000.0000
实空间数据点数 n_real_points	73
GNOM 版本 gnom_version	4.1.3
质量判据 quality_criteria	AN1: 0.000; Oscil: 0.490; Stabil: 1.000; Sysdev: 1.000; Positv: 1.000; Valcen: 0.562; Smooth: 0.000

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5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

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6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (4)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	Ferritin heavy chain
分子量 formula_weight	21097.6 kDa
EC 编号 ec_number	1.16.3.1
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A
原子数 atom_count	3395

MTTASPSQVRQNYHQDAEAAINRQINLELYASYVYLSMSCYFDRDDVALKNFAKYFLHQSHEEREHAEKLMKLQNQRGGRIFLQDIKKPDRDDWESGLNAMECALHLEKSVNQSLLELHKLATDKNDPHLCDFIETYYLSEQVKSIKELGDHVTNLRKMGAPEAGMAEYLFDKHTLGHGDES

来源 Source

来源生物 organism	Mus musculus
通用名 common_name	house mouse
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	10090
宿主生物 host_organism	;Escherichia coli 'BL21-Gold(DE3)pLysS AG' ;

实体 2 Entity 2 non-polymer

描述 description	FE (III) ION
分子量 formula_weight	55.8 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	1

实体 3 Entity 3 non-polymer

描述 description	ZINC ION
分子量 formula_weight	65.4 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	1

实体 4 Entity 4 water

描述 description	water
分子量 formula_weight	18.0 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	201

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8. 引用文献 (1)

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晶胞边长 a length_a	1.000 Å
晶胞边长 b length_b	1.000 Å
晶胞边长 c length_c	1.000 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	90.00 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	90.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	—

空间群 space_group	P 1
空间群编号 int_tables_number	1
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	1.24 Å
分辨率测定方法 resolution_method	—
颗粒数 num_particles	615248

fit	/app/data/saxs_computation/2f/22fx/22fx.fit
pddf	/app/data/pr_computation/2f/22fx/22fx.pr.out
profile	/app/data/saxs_computation/2f/22fx/22fx.dat