Regulatory protein cro
Enterobacteria phage lambda
当前结构中的状态
| Assembly | 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与共同组分 | 实验方法与环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 蛋白单体 单体 蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白拷贝数一致 | 链 A； UniProt 1–66 | 突变：A33W, F58D, Y26Q | 无其他共同聚合物 | SOLUTION NMR NMR测量条件：pH 5.3；293 K；离子强度（mmCIF原始值）no salt added；压力 ambient NMR测量条件：pH 6.1；293 K；离子强度（mmCIF原始值）no salt added；压力 ambient NMR测量条件：pH 6.1；298 K；离子强度（mmCIF原始值）no salt added；压力 ambient NMR样品组成：2.5 mM lambda Cro A33W/F58D/Y26Q U-13C, 50mM Na-phosphate, 90% H2O, 10% D2O, 0.01% sodium azide, 1 mM TSP | 90% H2O/10% D2O NMR样品组成：5 mM lambda Cro A33W/F58D/Y26Q U-15N, 50mM Na-phosphate, 90% H2O, 10% D2O, 0.01% sodium azide, 1 mM TSP | 90% H2O/10% D2O NMR样品组成：5 mM lambda Cro A33W/F58D/Y26Q unlabelled, 50mM Na-phosphate, 90% H2O, 10% D2O, 0.01% sodium azide, 1 mM TSP | 90% H2O/10% D2O NMR样品组成：5 mM lambda Cro A33W/F58D/Y26Q U-15N, 50mM Na-phosphate, 100% D2O, 0.01% sodium azide, 1 mM TSP | 100% D2O | 分辨率未提供 |
数据库中的同蛋白其他状态
以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。
| 其他 PDB | 相对当前条目 2A63 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法与环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1COP THREE-DIMENSIONAL DIMER STRUCTURE OF THE LAMBDA-CRO REPRESSOR IN SOLUTION AS DETERMINED BY HETERONUCLEAR MULTIDIMENSIONAL NMR 提交 1995-06-23 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 D
1–66（66 aa）
链 E
1–66（66 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | SOLUTION NMR mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率未提供 |
| 1D1L CRYSTAL STRUCTURE OF CRO-F58W MUTANT 提交 1999-09-17 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 A
1–61（61 aa）
片段：LAMBDA CRO REPRESSOR
|
突变：F58W | SO4 SULFATE ION × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；298 K；2.2 M NH4SO4, 6% isopropanol, including a layer of Hampton's "Al's oil", pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298.K
|
分辨率 2.10 Å R-free 0.258 |
| 1D1L CRYSTAL STRUCTURE OF CRO-F58W MUTANT 提交 1999-09-17 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
1–61（61 aa）
片段：LAMBDA CRO REPRESSOR
|
突变：F58W | SO4 SULFATE ION × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；298 K；2.2 M NH4SO4, 6% isopropanol, including a layer of Hampton's "Al's oil", pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298.K
|
分辨率 2.10 Å R-free 0.258 |
| 1D1L CRYSTAL STRUCTURE OF CRO-F58W MUTANT 提交 1999-09-17 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 3 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
1–61（61 aa）
片段：LAMBDA CRO REPRESSOR
|
突变：F58W | SO4 SULFATE ION × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；298 K；2.2 M NH4SO4, 6% isopropanol, including a layer of Hampton's "Al's oil", pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298.K
|
分辨率 2.10 Å R-free 0.258 |
| 1D1M CRYSTAL STRUCTURE OF CRO K56-[DGEVK]-F58W MUTANT 提交 1999-09-17 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 A
1–60（60 aa）
片段：LAMBDA CRO REPRESSOR
链 B
1–60（60 aa）
片段：LAMBDA CRO REPRESSOR
|
突变：K56[DGEVK]-F58W 突变：K56[DGEVK]-F58W | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；298 K；4.8 M SODIUM FORMATE, 0.5% BETA-OCTYLGLUCOSIDE, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 2.05 Å R-free 0.298 |
| 1ORC CRO REPRESSOR INSERTION MUTANT K56-[DGEVK] 提交 1995-10-30 | 突变/修饰不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
1–66（66 aa）
|
突变：INS(K56-DGEVK) | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 1.54 Å |
| 2ECS Lambda Cro mutant Q27P/A29S/K32Q at 1.4 A in space group C2 提交 2007-02-14 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 A
1–66（66 aa）
链 B
1–66（66 aa）
|
突变：Q27P, A29S, K32Q 突变：Q27P, A29S, K32Q | SO4 SULFATE ION × 4 ACT ACETATE ION × 4 CL CHLORIDE ION × 1 LI LITHIUM ION × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；298 K；80% saturated lithium sulfate, pH 5.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298.0K
|
分辨率 1.40 Å R-free 0.175 |
| 2ECS Lambda Cro mutant Q27P/A29S/K32Q at 1.4 A in space group C2 提交 2007-02-14 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
1–66（66 aa）
链 B
1–66（66 aa）
|
突变：Q27P, A29S, K32Q 突变：Q27P, A29S, K32Q | SO4 SULFATE ION × 8 ACT ACETATE ION × 8 CL CHLORIDE ION × 2 LI LITHIUM ION × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；298 K；80% saturated lithium sulfate, pH 5.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298.0K
|
分辨率 1.40 Å R-free 0.175 |
| 2ORC CRO REPRESSOR INSERTION MUTANT K56-[DGEVK], NMR, 32 STRUCTURES 提交 1998-01-20 | 突变/修饰不同 实验环境不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
1–66（66 aa）
|
突变：INS(K56-DGEVK) | 未记录非水小分子 |
SOLUTION NMR
NMR测量条件
pH 4.6；298 K
|
分辨率未提供 |
| 2OVG Lambda Cro Q27P/A29S/K32Q triple mutant at 1.35 A in space group P3221 提交 2007-02-13 | 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 A
1–66（66 aa）
|
突变：Q27P, A29S, K32Q | SO4 SULFATE ION × 2 EPE 4-(2-HYDROXYETHYL)-1-PIPERAZINE ETHANESULFONIC ACID × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；298 K；1.5 M lithium sulfate, 0.1 M Na Hepes, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298.0K
|
分辨率 1.35 Å R-free 0.171 |
| 2OVG Lambda Cro Q27P/A29S/K32Q triple mutant at 1.35 A in space group P3221 提交 2007-02-13 | 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
1–66（66 aa）
|
突变：Q27P, A29S, K32Q | SO4 SULFATE ION × 1 EPE 4-(2-HYDROXYETHYL)-1-PIPERAZINE ETHANESULFONIC ACID × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；298 K；1.5 M lithium sulfate, 0.1 M Na Hepes, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298.0K
|
分辨率 1.35 Å R-free 0.171 |
| 2OVG Lambda Cro Q27P/A29S/K32Q triple mutant at 1.35 A in space group P3221 提交 2007-02-13 | 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 3 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 A
1–66（66 aa）
|
突变：Q27P, A29S, K32Q | SO4 SULFATE ION × 2 EPE 4-(2-HYDROXYETHYL)-1-PIPERAZINE ETHANESULFONIC ACID × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；298 K；1.5 M lithium sulfate, 0.1 M Na Hepes, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298.0K
|
分辨率 1.35 Å R-free 0.171 |
| 3ORC CRYSTAL STRUCTURE OF AN ENGINEERED CRO MONOMER BOUND NONSPECIFICALLY TO DNA 提交 1998-04-23 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白–DNA 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：trimeric |
链 A
2–61（60 aa）
|
突变：INSERTION (K56-DGEVK) | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.6；293 K；COCRYSTALS WERE OBTAINED BY MIXING A 1.5 MOLAR EXCESS OF THE 7BP DNA FRAGMENT WITH CRO K56-[DGEVK], COMBINING WITH AN EQUAL VOLUME OF PRECIPITANT BUFFER (140MM AMMONIUM ACETATE, 31% PEG 3350, 100MM ACETATE BUFFER PH 4.6), THEN EQUILIBRATING AGAINST THE PRECIPITANT BUFFER VIA THE HANGING-DROP METHOD AT ROOM TEMPERATURE., vapor diffusion - hanging drop, temperature 293K
|
分辨率 3.00 Å |
| 4CRO PROTEIN-DNA CONFORMATIONAL CHANGES IN THE CRYSTAL STRUCTURE OF A LAMBDA CRO-OPERATOR COMPLEX 提交 1992-01-15 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白–DNA 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：tetrameric |
链 A
1–66（66 aa）
链 B
1–66（66 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；pH 6.9；NA CACODYLATE, NACL, pH 6.90, VAPOR DIFFUSION
|
分辨率 3.90 Å |
| 4CRO PROTEIN-DNA CONFORMATIONAL CHANGES IN THE CRYSTAL STRUCTURE OF A LAMBDA CRO-OPERATOR COMPLEX 提交 1992-01-15 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白–DNA 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：tetrameric |
链 C
1–66（66 aa）
链 D
1–66（66 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；pH 6.9；NA CACODYLATE, NACL, pH 6.90, VAPOR DIFFUSION
|
分辨率 3.90 Å |
| 4CRO PROTEIN-DNA CONFORMATIONAL CHANGES IN THE CRYSTAL STRUCTURE OF A LAMBDA CRO-OPERATOR COMPLEX 提交 1992-01-15 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 3 蛋白–DNA 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：tetrameric |
链 E
1–66（66 aa）
链 F
1–66（66 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；pH 6.9；NA CACODYLATE, NACL, pH 6.90, VAPOR DIFFUSION
|
分辨率 3.90 Å |
| 5CRO REFINED STRUCTURE OF CRO REPRESSOR PROTEIN FROM BACTERIOPHAGE LAMBDA 提交 1998-04-17 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 B
1–66（66 aa）
链 O
1–66（66 aa）
|
未记录 | PO4 PHOSPHATE ION × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
microdialysis or batch；pH 7.5；CRYSTALS WERE OBTAINED IN THE PRESENCE OF ABOUT 1.2M PHOSPHATE BY MICRODIALYSIS OR BATCH TECHNIQUES., pH 7.5, microdialysis or batch
|
分辨率 2.30 Å |
| 5CRO REFINED STRUCTURE OF CRO REPRESSOR PROTEIN FROM BACTERIOPHAGE LAMBDA 提交 1998-04-17 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 A
1–66（66 aa）
链 C
1–66（66 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
microdialysis or batch；pH 7.5；CRYSTALS WERE OBTAINED IN THE PRESENCE OF ABOUT 1.2M PHOSPHATE BY MICRODIALYSIS OR BATCH TECHNIQUES., pH 7.5, microdialysis or batch
|
分辨率 2.30 Å |
| 5CRO REFINED STRUCTURE OF CRO REPRESSOR PROTEIN FROM BACTERIOPHAGE LAMBDA 提交 1998-04-17 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 3 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 24 PDB 声明：24-meric |
链 A
1–66（66 aa）
链 B
1–66（66 aa）
链 C
1–66（66 aa）
链 O
1–66（66 aa）
|
未记录 | PO4 PHOSPHATE ION × 12 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
microdialysis or batch；pH 7.5；CRYSTALS WERE OBTAINED IN THE PRESENCE OF ABOUT 1.2M PHOSPHATE BY MICRODIALYSIS OR BATCH TECHNIQUES., pH 7.5, microdialysis or batch
|
分辨率 2.30 Å |
| 5CRO REFINED STRUCTURE OF CRO REPRESSOR PROTEIN FROM BACTERIOPHAGE LAMBDA 提交 1998-04-17 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 4 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
1–66（66 aa）
链 B
1–66（66 aa）
链 C
1–66（66 aa）
链 O
1–66（66 aa）
|
未记录 | PO4 PHOSPHATE ION × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
microdialysis or batch；pH 7.5；CRYSTALS WERE OBTAINED IN THE PRESENCE OF ABOUT 1.2M PHOSPHATE BY MICRODIALYSIS OR BATCH TECHNIQUES., pH 7.5, microdialysis or batch
|
分辨率 2.30 Å |
| 6CRO CRYSTAL STRUCTURE OF LAMBDA-CRO BOUND TO A CONSENSUS OPERATOR AT 3.0 ANGSTROM RESOLUTION 提交 1998-04-22 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白–DNA 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：hexameric |
链 A
2–61（60 aa）
|
未记录 | SO4 SULFATE ION × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.9；293 K；CRO PROTEIN WAS SUSPENDED IN 20MM SODIUM CACODYLATE PH6.9 THEN MIXED WITH A 30% EXCESS OF THE 19BP DNA FRAGMENT. THE COMPLEX WAS THEN MIXED WITH AN EQUAL VOLUME OF PRECIPITANT SOLUTION (70MM AMMONIUM SULFATE, 13% PEG3350) AND ALLOWED TO EQUILIBRATE VIA THE HANGING DROP METHOD AT ROOM TEMPERATURE. COCRYSTALS TYPICALLY TAKE 3-4 MONTHS TO APPEAR., vapor diffusion - hanging drop, temperature 293K
|
分辨率 3.00 Å |
共 11 个其他 PDB 条目、21 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态
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| UniProt名称 | RCRO_LAMBD |
| Isoform | — |
| PDB实体 | 1 |
| 链与序列区间 | 作者链 A； PDB构建体 1–66； UniProt 1–66 |
