2agh

Structural basis for cooperative transcription factor binding to the CBP coactivator

Method: SOLUTION NMR
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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Myb proto-oncogene protein

Mus musculus

UniProt P06876

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 3 Crebbp protein × 1 (P45481) Zinc finger protein HRX × 1 (Q03164) 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 MYB_MOUSE
Isoform —
PDB实体 1
链与序列区间 作者链 A; PDB构建体 1–25; UniProt 291–315

Crebbp protein

Mus musculus

UniProt P45481

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 3 Myb proto-oncogene protein × 1 (P06876) Zinc finger protein HRX × 1 (Q03164) 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 CBP_MOUSE
Isoform —
PDB实体 2
链与序列区间 作者链 B; PDB构建体 1–87; UniProt 586–672

Zinc finger protein HRX

Homo sapiens

UniProt Q03164

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 3 Myb proto-oncogene protein × 1 (P06876) Crebbp protein × 1 (P45481) 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 HRX_HUMAN
Isoform —
PDB实体 3
链与序列区间 作者链 C; PDB构建体 1–31; UniProt 2839–2869

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中;数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护,因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id2agh
沉积日期 deposition_date2005-07-26
结构标题 titleStructural basis for cooperative transcription factor binding to the CBP coactivator
关键词 keywordsTranscription; TRANSCRIPTION
实验方法 methodSOLUTION NMR
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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

2agh__assembly_1__model_8

Assembly 1 · Model 8 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

2agh__assembly_1__model_8 | I(q)

10-2 10-1 105 106 q (1/Angstrom) I(q)
100 个绘图点;横轴和纵轴均采用对数尺度。

2agh__assembly_1__model_8 | P(r) · Pending

新版 assembly/model P(r) 尚未计算 此处仅保留位置,不展示旧数据 r (Angstrom) P(r)
P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。
Rg(Guinier)18.21 Å
Rg(电子密度)16.80 Å
总 Rg17.93 Å
原子数2339
残基数143
排除体积20664 ų
最大 q0.500 Å⁻¹
Assembly Model 结构单元 聚集说明 状态 CRYSOL 操作
1 1 2agh__assembly_1__model_1 trimeric (3) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 2 2agh__assembly_1__model_2 trimeric (3) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 3 2agh__assembly_1__model_3 trimeric (3) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 4 2agh__assembly_1__model_4 trimeric (3) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 5 2agh__assembly_1__model_5 trimeric (3) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 6 2agh__assembly_1__model_6 trimeric (3) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 7 2agh__assembly_1__model_7 trimeric (3) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 8 2agh__assembly_1__model_8 trimeric (3) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 9 2agh__assembly_1__model_9 trimeric (3) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 10 2agh__assembly_1__model_10 trimeric (3) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 11 2agh__assembly_1__model_11 trimeric (3) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 12 2agh__assembly_1__model_12 trimeric (3) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 13 2agh__assembly_1__model_13 trimeric (3) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 14 2agh__assembly_1__model_14 trimeric (3) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 15 2agh__assembly_1__model_15 trimeric (3) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 16 2agh__assembly_1__model_16 trimeric (3) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 17 2agh__assembly_1__model_17 trimeric (3) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 18 2agh__assembly_1__model_18 trimeric (3) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 19 2agh__assembly_1__model_19 trimeric (3) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 20 2agh__assembly_1__model_20 trimeric (3) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (3)

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6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 2 domains

SCOP 2.08 (1 domains)

结构域编号 domain_idd2aghb_
类 Class classa — All alpha proteins
折叠类型 Fold folda.12 — Kix domain of CBP (creb binding protein)
超家族 Superfamily superfamilya.12.1 — Kix domain of CBP (creb binding protein)
家族 Family familya.12.1.1 — Kix domain of CBP (creb binding protein)

CATH v4.4 (1 domains)

结构域编号 domain_id2aghB00
类 Class class1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology246 — Serum Albumin; Chain A, Domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily20 — Coactivator CBP, KIX domain
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7. 引用文献 (1)