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2cef

Phosphorylation of the Cytoplasmic Tail of Tissue Factor and its Role in Modulating Structure and Binding Affinity.

Method: SOLUTION NMR Dmax: 33.3 Å Quality: REASONABLE
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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

TISSUE FACTOR

物种未注明

UniProt P13726

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白单体 单体 蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白拷贝数一致 链 A； UniProt 277–295 片段：TISSUE FACTOR CYTOPLASMIC DOMAIN, RESIDUES 277-295 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 无其他共同聚合物 SOLUTION NMR NMR测量条件：pH 6；285 K；离子强度（mmCIF原始值）0 NMR样品组成：90% WATER 10% D2O 分辨率未提供

数据库中的同蛋白其他状态

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其他 PDB 相对当前条目 2CEF Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
1AHW A COMPLEX OF EXTRACELLULAR DOMAIN OF TISSUE FACTOR WITH AN INHIBITORY FAB (5G9) 提交 1997-04-10 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 C 33–251（219 aa） 片段：EXTRACELLULAR DOMAIN
链 F 33–251（219 aa） 片段：EXTRACELLULAR DOMAIN
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 7；TF-5G9 CRYSTAL WERE GROWN IN 1.7-2.0M AMMONIUM SULFATE, 0.1M SODIUM CITRATE, PH 5.0-5.5, 0.2% 2-METHYL-2,4-PENTANE-DIOL (MPD), AND 2% PEG 600 AT AN EQUIMOLAR 5G9:TF RATIO. THE CRYSTALS GREW EXTREMELY SLOWLY, TAKING 6-9 MONTHS TO REACH A MAXIMAL SIZE OF 0.4 X 0.4 X 0.8 MM3., pH 7.0
分辨率 3.00 Å R-free 0.285
1BOY EXTRACELLULAR REGION OF HUMAN TISSUE FACTOR 提交 1996-01-11 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 33–251（219 aa） 片段：EXTRACELLULAR DOMAIN, RESIDUES 1 - 219
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 2.20 Å
1DAN Complex of active site inhibited human blood coagulation factor VIIA with human recombinant soluble tissue factor 提交 1997-03-05 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 T 37–116（80 aa）
链 U 122–242（121 aa）
未记录 BGC beta-D-glucopyranose × 1 FUC alpha-L-fucopyranose × 1 CA CALCIUM ION × 9 0Z6 D-phenylalanyl-N-[(2S,3S)-6-{[amino(iminio)methyl]amino}-1-chloro-2-hydroxyhexan-3-yl]-L-phenylalaninamide × 1 CAC CACODYLATE ION × 1 CL CHLORIDE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 2.00 Å R-free 0.218
1FAK HUMAN TISSUE FACTOR COMPLEXED WITH COAGULATION FACTOR VIIA INHIBITED WITH A BPTI-MUTANT 提交 1998-12-28 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 T 37–242（206 aa）
未记录 GLC alpha-D-glucopyranose × 1 FUC alpha-L-fucopyranose × 1 CA CALCIUM ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 5.6；pH 5.6
分辨率 2.10 Å
1J9C Crystal Structure of tissue factor-factor VIIa complex 提交 2001-05-24 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 T 33–242（210 aa）
未记录 GLC alpha-D-glucopyranose × 1 FUL beta-L-fucopyranose × 1 0Z6 D-phenylalanyl-N-[(2S,3S)-6-{[amino(iminio)methyl]amino}-1-chloro-2-hydroxyhexan-3-yl]-L-phenylalaninamide × 1 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 CA CALCIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；295 K；2% PEG 400, 2% 2-propanol, 2% PEG 4000, 12.5mM Calcium chloride, 2.0M ammonium sulfate, 0.1M HEPES, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 295K
分辨率 2.90 Å R-free 0.299
1JPS Crystal structure of tissue factor in complex with humanized Fab D3h44 提交 2001-08-03 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 T 33–251（219 aa） 片段：extracellular domain
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；277 K；PEG 6000, sodium chloride, sodium-HEPES buffer, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
分辨率 1.85 Å R-free 0.224
1O5D Dissecting and Designing Inhibitor Selectivity Determinants at the S1 site Using an Artificial Ala190 Protease (Ala190 uPA) 提交 2003-09-09 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 T 34–251（218 aa）
突变：residues 2-219 CR9 2-{5-[AMINO(IMINIO)METHYL]-6-FLUORO-1H-BENZIMIDAZOL-2-YL}-6-[(2-METHYLCYCLOHEXYL)OXY]BENZENOLATE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 7.2；290 K；0.1 M citrate, 16-18% PEG 5K MME, pH 7.2, vapor diffusion at 290 K
分辨率 2.05 Å R-free 0.262
1TFH EXTRACELLULAR DOMAIN OF HUMAN TISSUE FACTOR 提交 1997-04-10 构建体不同 突变/修饰不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 33–251（219 aa） 片段：EXTRACELLULAR DOMAIN
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 7；278 K；CRYSTAL CAN BE GROWN FROM 20MM PHOSPHATE BUFFER, PH 6.5, AT A 40MG/ML PROTEIN CONCENTRATION. THE CRYSTALS USED FOR DIFFRACTION STUDIES WERE IN FACT CRYSTALLIZED UNEXPECTEDLY IN 2 DAYS IN AN NMR TUBE CONTAINING A SOLUTION OF APPROXIMATELY 3.5MM OF UNIFORMLY 15N-ENRICHED (~99 ATOM%) TISSUE FACTOR (AT ~85 MG/ML) IN 20MM KNA2PO4, 0.02%NAN3, 10% D2O AND 90% H2O, PH 7.0 AT 5 DEGREE., temperature 278K
分辨率 2.40 Å R-free 0.297
1TFH EXTRACELLULAR DOMAIN OF HUMAN TISSUE FACTOR 提交 1997-04-10 构建体不同 突变/修饰不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 33–251（219 aa） 片段：EXTRACELLULAR DOMAIN
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 7；278 K；CRYSTAL CAN BE GROWN FROM 20MM PHOSPHATE BUFFER, PH 6.5, AT A 40MG/ML PROTEIN CONCENTRATION. THE CRYSTALS USED FOR DIFFRACTION STUDIES WERE IN FACT CRYSTALLIZED UNEXPECTEDLY IN 2 DAYS IN AN NMR TUBE CONTAINING A SOLUTION OF APPROXIMATELY 3.5MM OF UNIFORMLY 15N-ENRICHED (~99 ATOM%) TISSUE FACTOR (AT ~85 MG/ML) IN 20MM KNA2PO4, 0.02%NAN3, 10% D2O AND 90% H2O, PH 7.0 AT 5 DEGREE., temperature 278K
分辨率 2.40 Å R-free 0.297
1UJ3 Crystal structure of a humanized Fab fragment of anti-tissue-factor antibody in complex with tissue factor 提交 2003-07-25 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 C 38–242（205 aa） 片段：RESIDUES 606-810
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；277 K；2-propanol, PEG4000, HEPES-Na, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
分辨率 2.10 Å R-free 0.227
1W0Y tf7a_3771 complex 提交 2004-05-27 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 T 33–242（210 aa） 片段：EXTRACELLULAR DOMAIN, RESIDUES 38-242
未记录 771 4-(4-BENZYLOXY-2-METHANESULFONYLAMINO-5-METHOXY-BENZYLAMINO)-BENZAMIDINE × 1 CA CALCIUM ION × 9 CAC CACODYLATE ION × 1 FUC alpha-L-fucopyranose × 1 BGC beta-D-glucopyranose × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 5.5；pH 5.50
分辨率 2.50 Å R-free 0.258
1W2K tf7a_4380 complex 提交 2004-07-06 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 T 33–242（210 aa） 片段：EXTRACELLULAR DOMAIN, RESIDUES 38-242
未记录 380 (2R)-2-({4-[AMINO(IMINO)METHYL]PHENYL}AMINO)-N-BENZYL-2-(3,4-DIMETHOXYPHENYL)ACETAMIDE × 1 CA CALCIUM ION × 9 CAC CACODYLATE ION × 1 FUC alpha-L-fucopyranose × 1 BGC beta-D-glucopyranose × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 5.5；pH 5.50
分辨率 3.00 Å R-free 0.257
1WQV Human Factor Viia-Tissue Factor Complexed with propylsulfonamide-D-Thr-Met-p-aminobenzamidine 提交 2004-10-02 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 T 33–250（218 aa） 片段：residues 1-218
未记录 BGC beta-D-glucopyranose × 1 FUC alpha-L-fucopyranose × 1 CA CALCIUM ION × 9 PSM N-[DIHYDROXY(PROPYL)-LAMBDA~4~-SULFANYL]THREONYL-N~1~-{4-[AMINO(IMINO)METHYL]BENZYL}METHIONINAMIDE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5；298 K；PEG 5000, sodium chloride, cacodylate, calcium chloride, pH 5.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 2.50 Å R-free 0.272
1WSS Human Factor Viia-Tissue Factor in Complex with peptide-mimetic inhibitor that has two charged groups in P2 and P4 提交 2004-11-10 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 T 33–250（218 aa） 片段：RESIDUES 1-218
未记录 BGC beta-D-glucopyranose × 1 FUC alpha-L-fucopyranose × 1 CA CALCIUM ION × 9 3CB N-[(3-CARBOXYBENZYL)SULFONYL]ISOLEUCYL-N~1~-{4-[AMINO(IMINO)METHYL]BENZYL}-5-IMINOORNITHINAMIDE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5；298 K；PEG 5000, sodium chloride, cacodylate, calcium chloride, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 2.60 Å R-free 0.282
1WTG Human Factor Viia-Tissue Factor Complexed with ethylsulfonamide-D-biphenylalanine-Gln-p-aminobenzamidine 提交 2004-11-23 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 T 33–250（218 aa） 片段：RESIDUES 1-218
未记录 BGC beta-D-glucopyranose × 1 FUC alpha-L-fucopyranose × 1 CA CALCIUM ION × 9 3BP 2-(3-BIPHENYL-4-YL-2-ETHANESULFONYLAMINO-PROPIONYLAMINO)-PENTANEDIOIC ACID 5-AMIDE 1-(4-CARBAMIMIDOYL-BENZYLAMIDE) × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5；298 K；PEG 5000, sodium chloride, cacodylate, calcium chloride, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 2.20 Å R-free 0.251
1WUN Human Factor Viia-Tissue Factor Complexed with ethylsulfonamide-D-Trp-Gln-p-aminobenzamidine 提交 2004-12-08 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 T 33–250（218 aa） 片段：RESIDUES 1-218
未记录 BGC beta-D-glucopyranose × 1 FUC alpha-L-fucopyranose × 1 CA CALCIUM ION × 9 P5B N-(ETHYLSULFONYL)TRYPTOPHYL-N~1~-{4-[AMINO(IMINO)METHYL]BENZYL}GLUTAMAMIDE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5；298 K；PEG 5000, sodium chloride, cacodylate, calcium chloride, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 2.40 Å R-free 0.264
1WV7 Human Factor Viia-Tissue Factor Complexed with ethylsulfonamide-D-5-propoxy-Trp-Gln-p-aminobenzamidine 提交 2004-12-11 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 T 33–250（218 aa） 片段：RESIDUES 1-218
未记录 BGC beta-D-glucopyranose × 1 FUC alpha-L-fucopyranose × 1 CA CALCIUM ION × 9 5PI N-(ETHYLSULFONYL)-5-PROPOXY-L-TRYPTOPHYL-N~1~-{4-[AMINO(IMINO)METHYL]BENZYL}-L-GLUTAMAMIDE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5；298 K；PEG 5000, sodium chloride, cacodylate, calcium chloride, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 2.70 Å R-free 0.273
1Z6J Crystal Structure of a ternary complex of Factor VIIa/Tissue Factor/Pyrazinone Inhibitor 提交 2005-03-22 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 T 33–243（211 aa） 片段：Residues 33-243
未记录 CA CALCIUM ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 1 PY3 5-[AMINO(IMINO)METHYL]-2-[({[6-[3-AMINO-5-({[(1R)-1-METHYLPROPYL]AMINO}CARBONYL)PHENYL]-3-(ISOPROPYLAMINO)-2-OXOPYRAZIN-1(2H)-YL]ACETYL}AMINO)METHYL]-N-PYRIDIN-4-YLBENZAMIDE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 7.5；298 K；50 mM citrate, 16-24% PEG 4K, 150 mM MgCl2, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, temperature 298K
分辨率 2.00 Å R-free 0.258
2A2Q Complex of Active-site Inhibited Human Coagulation Factor VIIa with Human Soluble Tissue Factor in the Presence of Ca2+, Mg2+, Na+, and Zn2+ 提交 2005-06-22 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 T 38–242（205 aa） 片段：residues 38-242
未记录 GLC alpha-D-glucopyranose × 1 FUC alpha-L-fucopyranose × 1 MG MAGNESIUM ION × 3 CA CALCIUM ION × 6 NA SODIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2 CL CHLORIDE ION × 3 PBZ P-AMINO BENZAMIDINE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 7；298 K；PEG 4000, magnesium chloride, sodium chloride, calcium chloride, zinc chloride, Tris-HCl, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K, pH 7.00
分辨率 1.80 Å R-free 0.259
2AEI Crystal structure of a ternary complex of factor VIIa/tissue factor and 2-[[6-[3-(aminoiminomethyl)phenoxy]-3,5-difluro-4-[(1-methyl-3-phenylpropyl)amino]-2-pyridinyl]oxy]-benzoic acid 提交 2005-07-22 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 T 33–243（211 aa） 片段：RESIDUES 33-243
未记录 CA CALCIUM ION × 8 CAC CACODYLATE ION × 1 03R 2-({6-{3-[AMINO(IMINO)METHYL]PHENOXY}-3,5-DIFLUORO-4-[(1-METHYL-3-PHENYLPROPYL)AMINO]-2-PYRIDINYL}OXY)BENZOIC ACID × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5；298 K；PEG 8000,CACODYLATE, GLYCEROL, pH 5.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 2.52 Å R-free 0.297
2AER Crystal Structure of Benzamidine-Factor VIIa/Soluble Tissue Factor complex. 提交 2005-07-23 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 T 38–242（205 aa）
未记录 GLC alpha-D-glucopyranose × 1 FUC alpha-L-fucopyranose × 1 MG MAGNESIUM ION × 3 CA CALCIUM ION × 6 NA SODIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2 CL CHLORIDE ION × 3 BEN BENZAMIDINE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.2；298 K；Tris, Sodium Chloride, Calcium Chloride, PEG 4000, ADA, Magnesium Chloride, pH 6.2, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 1.87 Å R-free 0.256
2B7D Factor VIIa Inhibitors: Chemical Optimization, Preclinical Pharmacokinetics, Pharmacodynamics, and Efficacy in a Baboon Thrombosis Model 提交 2005-10-04 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 T 34–251（218 aa）
未记录 C1B (2R)-2-[5-(5-CARBAMIMIDOYL-1H-BENZOIMIDAZOL-2-YL)-6,2'-DIHYDROXY-5'-UREIDOMETHYL-BIPHENYL-3-YL]-SUCCINIC ACID × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.2；290 K；0.1 M citrate, 16-18 % PEG 5K MME, pH 7.2, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 290.0K
分辨率 2.24 Å R-free 0.289
2B8O Crystal Structure of Glu-Gly-Arg-Chloromethyl Ketone-Factor VIIa/Soluble Tissue Factor Complex 提交 2005-10-08 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 T 38–242（205 aa）
未记录 GLC alpha-D-glucopyranose × 1 FUC alpha-L-fucopyranose × 1 CA CALCIUM ION × 6 MG MAGNESIUM ION × 2 0GJ L-alpha-glutamyl-N-{(1S)-4-{[amino(iminio)methyl]amino}-1-[(1S)-2-chloro-1-hydroxyethyl]butyl}glycinamide × 1 NA SODIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2 CL CHLORIDE ION × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.2；298 K；Tris, sodium chloride, calcium chloride, PEG 4000, ADA, magnesium chloride, pH 6.2, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 2.80 Å R-free 0.285
2C4F crystal structure of factor VII.stf complexed with pd0297121 提交 2005-10-18 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 T 38–112（75 aa） 片段：FACTOR III, RESIDUES 38-112
链 U 123–242（120 aa） 片段：FACTOR III, RESIDUES 123-242
未记录 CA CALCIUM ION × 5 GIL 2-{[6-{3-[AMINO(IMINO)METHYL]PHENOXY}-4-(DIISOPROPYLAMINO)-3,5-DIFLUOROPYRIDIN-2-YL]OXY}-5-[(ISOBUTYLAMINO)CARBONYL]BEN ZOIC ACID × 1 GLC alpha-D-glucopyranose × 1 FUC alpha-L-fucopyranose × 1 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 1.72 Å
2CEH Phosphorylation of the Cytoplasmic Tail of Tissue Factor and its Role in Modulating Structure and Binding Affinity 提交 2006-02-06 突变/修饰不同 实验环境不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 277–295（19 aa） 片段：TISSUE FACTOR CYTOPLASMIC DOMAIN, RESIDUES 277-295
未记录 未记录非水小分子 SOLUTION NMR
NMR测量条件 pH 6；285 K；离子强度（mmCIF原始值）0；压力 1.0
NMR测量条件 pH 6；285 K；离子强度（mmCIF原始值）0；压力 1.0
NMR样品组成 90% WATER 10% D2O
分辨率未提供
2CEZ Phosphorylation of the Cytoplasmic Tail of Tissue Factor and its Role in Modulating Structure and Binding Affinity 提交 2006-02-13 实验环境不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 277–295（19 aa） 片段：TISSUE FACTOR CYTOPLASMIC DOMAIN, RESIDUES 277-295
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 未记录非水小分子 SOLUTION NMR
NMR测量条件 pH 6；285 K；离子强度（mmCIF原始值）0；压力 1.0
NMR样品组成 90% WATER 10% D2O
分辨率未提供
2CFJ Phosphorylation of the Cytoplasmic Tail of Tissue Factor and its Role in Modulating Structure and Binding Affinity 提交 2006-02-21 实验环境不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 277–295（19 aa） 片段：TISSUE FACTOR CYTOPLASMIC DOMAIN, RESIDUES 277-295
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 未记录非水小分子 SOLUTION NMR
NMR测量条件 pH 6；285 K；离子强度（mmCIF原始值）0；压力 1.0
NMR样品组成 90% WATER 10% D2O
分辨率未提供
2EC9 Crystal structure analysis of human Factor VIIa , Souluble tissue factor complexed with BCX-3607 提交 2007-02-13 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 T 38–112（75 aa） 片段：residues 38-112
链 U 123–242（120 aa） 片段：residues 91-210
未记录 ASO 1,5-anhydro-D-glucitol × 1 FUC alpha-L-fucopyranose × 1 CA CALCIUM ION × 9 24X 2'-((5-CARBAMIMIDOYLPYRIDIN-2-YLAMINO)METHYL)-4-(ISOBUTYLCARBAMOYL)-4'-VINYLBIPHENYL-2-CARBOXYLIC ACID × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；293 K；14% (w/v)PEG 4K, 0.1M MgCl2, 0.1M ADA buffer, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 2.00 Å R-free 0.282
2F9B Discovery of Novel Heterocyclic Factor VIIa Inhibitors 提交 2005-12-05 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 T 34–251（218 aa） 片段：residues 34-251
未记录 N1H {5-(5-AMINO-1H-PYRROLO[3,2-B]PYRIDIN-2-YL)-6-HYDROXY-3'-NITRO-BIPHENYL-3-YL]-ACETIC ACID × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.2；290 K；0.1 M CITRATE, 16-18% PEG5000 MME, pH 7.2, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 290K
分辨率 2.54 Å R-free 0.286
2FIR Crystal structure of DFPR-VIIa/sTF 提交 2005-12-30 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 T 38–242（205 aa）
未记录 GLC alpha-D-glucopyranose × 1 FUC alpha-L-fucopyranose × 1 MG MAGNESIUM ION × 3 CA CALCIUM ION × 6 0G7 D-phenylalanyl-N-[(3S)-6-carbamimidamido-1-chloro-2-oxohexan-3-yl]-L-prolinamide × 1 NA SODIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2 CL CHLORIDE ION × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293 K；20% PEG 4000, 100 mM magnesium chloride, 200 mM sodium chloride, 10 mM calcium chloride, 20 uM zinc chloride , pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K
分辨率 2.00 Å R-free 0.281
2FLB Discovery of a Novel Hydroxy Pyrazole Based Factor IXa Inhibitor 提交 2006-01-05 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 T 34–251（218 aa） 片段：residues 34-251
未记录 6NH 2-(4-HYDROXY-5-PHENYL-1H-PYRAZOL-3-YL)-1H-BENZOIMIDAZOLE-5-CARBOXAMIDINE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.2；290 K；0.1 M CITRATE, 16-18% PEG5000 MME, pH 7.2, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 290.0K
分辨率 1.95 Å R-free 0.280
2FLR Novel 5-Azaindole Factor VIIa Inhibitors 提交 2006-01-06 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 T 34–251（218 aa） 片段：residues 34-251
未记录 7NH [2'-HYDROXY-3'-(1H-PYRROLO[3,2-C]PYRIDIN-2-YL)-BIPHENYL-3-YLMETHYL]-UREA × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.2；290 K；0.1 M CITRATE, 16-18% PEG5000 MME, pH 7.2, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 290K
分辨率 2.35 Å R-free 0.259
2HFT THE CRYSTAL STRUCTURE OF THE EXTRACELLULAR DOMAIN OF HUMAN TISSUE FACTOR AT 1.7 ANGSTROMS RESOLUTION 提交 1995-09-08 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 33–243（211 aa）
未记录 SO4 SULFATE ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 7.5；pH 7.5
分辨率 1.69 Å R-free 0.254
2PUQ Crystal structure of active site inhibited coagulation factor VIIA in complex with soluble tissue factor 提交 2007-05-09 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 T 38–241（204 aa）
未记录 BGC beta-D-glucopyranose × 1 FUC alpha-L-fucopyranose × 1 CA CALCIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.6；298 K；0.1 M sodium citrate, pH 5.6, 16.0 % (w/v) PEG 4000, 12 % (v/v) 1-propanol, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 2.05 Å R-free 0.273
2ZP0 Human factor viia-tissue factor complexed with benzylsulfonamide-D-ile-gln-P-aminobenzamidine 提交 2008-06-20 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 T 33–250（218 aa） 片段：RESIDUES 16-257
未记录 BGC beta-D-glucopyranose × 1 FUC alpha-L-fucopyranose × 1 CA CALCIUM ION × 9 PI0 (2S)-N-[(4-carbamimidoylphenyl)methyl]-2-[[(2R,3R)-3-methyl-2-(phenylmethylsulfonylamino)pentanoyl]amino]pentanediamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5；298 K；8 % PEG 5000, 0.1M sodium chloride, 0.005M calcium chloride, 0.1M cacodylate, pH 5.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 2.70 Å R-free 0.306
2ZWL Human factor viia-tissue factor complexed with highly selective peptide inhibitor 提交 2008-12-16 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 T 33–250（218 aa） 片段：UNP residues 33-250
未记录 BGC beta-D-glucopyranose × 1 FUC alpha-L-fucopyranose × 1 CA CALCIUM ION × 9 567 2-[[(2R)-1-[[(2S)-5-amino-1-[(4-carbamimidoylphenyl)methylamino]-1,5-dioxo-pentan-2-yl]amino]-3-(1H-indol-3-yl)-1-oxo-propan-2-yl]sulfamoyl]ethanoic acid × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5；298 K；8% PEG 5000, 0.1M sodium chloride, 0.005M calcium chloride, 0.1M cacodylate, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 2.20 Å R-free 0.267
2ZZU Human Factor VIIA-Tissue Factor Complexed with ethylsulfonamide-D-5-(3-carboxybenzyloxy)-Trp-Gln-p-aminobenzamidine 提交 2009-02-25 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 T 33–250（218 aa） 片段：UNP RESIDUES 33-250
未记录 BGC beta-D-glucopyranose × 1 FUC alpha-L-fucopyranose × 1 CA CALCIUM ION × 9 359 3-[[3-[(2R)-3-[[(2S)-5-amino-1-[(4-carbamimidoylphenyl)methylamino]-1,5-dioxo-pentan-2-yl]amino]-2-(ethylsulfonylamino)-3-oxo-propyl]-1H-indol-5-yl]oxymethyl]benzoic acid × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5；298 K；8% PEG5000, 0.1M sodium chloride, 0.005M calcium chloride, 0.1M cacodylate, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, TEMPERATURE 298K
分辨率 2.50 Å R-free 0.273
3ELA Crystal structure of active site inhibited coagulation factor VIIA mutant in complex with soluble tissue factor 提交 2008-09-21 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 T 33–241（209 aa） 片段：UNP residues 33-241
未记录 GLC alpha-D-glucopyranose × 1 FUC alpha-L-fucopyranose × 1 CA CALCIUM ION × 1 0Z6 D-phenylalanyl-N-[(2S,3S)-6-{[amino(iminio)methyl]amino}-1-chloro-2-hydroxyhexan-3-yl]-L-phenylalaninamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.6；298 K；100mM NaCitrate, 16%(w/v) PEG4000, 12%(v/v) 1-propanol, pH 5.6, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 2.20 Å R-free 0.294
3TH2 Mg2+ Is Required for Optimal Folding of the Gamma-Carboxyglutamic Acid (Gla) Domains of Vitamin K-Dependent Clotting Factors At Physiological Ca2+ 提交 2011-08-18 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 T 38–242（205 aa）
未记录 BGC beta-D-glucopyranose × 1 FUC alpha-L-fucopyranose × 1 MG MAGNESIUM ION × 3 CA CALCIUM ION × 6 BEN BENZAMIDINE × 1 NA SODIUM ION × 1 CL CHLORIDE ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 7；298 K；20% PEG 4000, 50 mM Tris-HCL, 50 mM N-(2-Acetamido)iminodiacetic acid, 150 mM NaCl, 5 mM Calcium Chloride, 2.5 mM Magnesium Chloride, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298.0K
分辨率 1.72 Å R-free 0.233
3TH3 Mg2+ Is Required for Optimal Folding of the Gamma-Carboxyglutamic Acid (Gla) Domains of Vitamin K-Dependent Clotting Factors At Physiological Ca2+ 提交 2011-08-18 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 T 38–242（205 aa）
未记录 FUC alpha-L-fucopyranose × 1 CA CALCIUM ION × 2 BGC beta-D-glucopyranose × 1 0GE N-{[5-(dimethylamino)naphthalen-1-yl]sulfonyl}-L-alpha-glutamyl-N-[(2S,3S)-6-carbamimidamido-1-chloro-2-hydroxyhexan-3-yl]glycinamide × 1 CL CHLORIDE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 7；298 K；20% PEG 4000, 50 mM Tris-HCL, 50 mM N-(2-Acetamido)iminodiacetic acid, 150 mM NaCl, 2.5 mM Calcium Chloride, 1.25 mM Magnesium Chloride, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298.0K
分辨率 2.70 Å R-free 0.298
3TH4 Mg2+ Is Required for Optimal Folding of the Gamma-Carboxyglutamic Acid (Gla) Domains of Vitamin K-Dependent Clotting Factors At Physiological Ca2+ 提交 2011-08-18 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 T 38–242（205 aa）
未记录 BGC beta-D-glucopyranose × 1 FUC alpha-L-fucopyranose × 1 MG MAGNESIUM ION × 2 CA CALCIUM ION × 7 0GE N-{[5-(dimethylamino)naphthalen-1-yl]sulfonyl}-L-alpha-glutamyl-N-[(2S,3S)-6-carbamimidamido-1-chloro-2-hydroxyhexan-3-yl]glycinamide × 1 CL CHLORIDE ION × 3 NA SODIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 7；298 K；20% PEG 4000, 50 mM Tris-HCL, 50 mM N-(2-Acetamido)iminodiacetic acid, 150 mM NaCl, 45 mM Calcium Chloride, 5 mM Magnesium Chloride, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, temperature 298K
分辨率 1.80 Å R-free 0.235
4IBL Rubidium Sites in Blood Coagulation Factor VIIa 提交 2012-12-08 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 T 33–251（219 aa）
未记录 BGC beta-D-glucopyranose × 1 FUC alpha-L-fucopyranose × 1 MG MAGNESIUM ION × 3 CA CALCIUM ION × 4 RB RUBIDIUM ION × 6 BEN BENZAMIDINE × 1 CL CHLORIDE ION × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；298 K；20 mM Tris-HCL, 200mM RbCl, 5 mM Calcium Chloride, 45 mM Magnesium Chloride , pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 1.80 Å R-free 0.215
4M7L Crystal structure of the complex between human tissue factor extracellular domain and antibody 10H10 FAB fragment 提交 2013-08-12 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 T 37–245（209 aa） 片段：extracellular domain (UNP residues 37-245)
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 10.5；293 K；0.1 M CAPS, pH 10.5, 24% PEG8000, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K
分辨率 3.40 Å R-free 0.289
4YLQ Crystal Structure of a FVIIa-Trypsin Chimera (FT) in Complex with Soluble Tissue Factor 提交 2015-03-05 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 T 33–251（219 aa） 片段：UNP residues 33-251
未记录 CA CALCIUM ION × 9 FUC alpha-L-fucopyranose × 1 TMA TETRAMETHYLAMMONIUM ION × 22 0Z7 N-acetyl-D-phenylalanyl-N-[(2S,3S)-6-carbamimidamido-1-chloro-2-hydroxyhexan-3-yl]-L-phenylalaninamide × 1 POL N-PROPANOL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.6；295 K；0.1M NaCitrate, 16.6% PEG 3350, 12.5% 1-Propanol, with seeding
分辨率 1.40 Å R-free 0.174
4Z6A Crystal Structure of a FVIIa-Trypsin Chimera (YT) in Complex with Soluble Tissue Factor 提交 2015-04-04 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 T 36–242（207 aa） 片段：unp residues 36-242
未记录 BGC beta-D-glucopyranose × 1 FUC alpha-L-fucopyranose × 1 0Z6 D-phenylalanyl-N-[(2S,3S)-6-{[amino(iminio)methyl]amino}-1-chloro-2-hydroxyhexan-3-yl]-L-phenylalaninamide × 1 CA CALCIUM ION × 1 CIT CITRIC ACID × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.6；295 K；0.1M NaCitrate, 16.6% PEG 3350, 12.5% 1-Propanol, with seeding
分辨率 2.25 Å R-free 0.240
4ZMA Crystal Structure of a FVIIa-Trypsin Chimera (ST) in Complex with Soluble Tissue Factor 提交 2015-05-02 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 T 33–251（219 aa）
未记录 CA CALCIUM ION × 8 BGC beta-D-glucopyranose × 1 FUC alpha-L-fucopyranose × 1 0Z6 D-phenylalanyl-N-[(2S,3S)-6-{[amino(iminio)methyl]amino}-1-chloro-2-hydroxyhexan-3-yl]-L-phenylalaninamide × 1 CAC CACODYLATE ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.1；295 K；0.1M Cacodylate,11% PEG 8000 , with seeding
分辨率 2.30 Å R-free 0.295
5W06 HUMAN TISSUE FACTOR IN COMPLEX WITH ANTIBODY M1587 提交 2017-05-30 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 T 37–245（209 aa） 片段：EXTRACELLULAR DOMAIN (UNP residues 37-245)
未记录 GOL GLYCEROL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 4.5；293 K；0.1 M SODIUM ACETATE PH 4.5, 18% PEG 3K, 0.2 M AMMONIUM ACETATE
分辨率 2.60 Å R-free 0.235
6R2W Crystal structure of the super-active FVIIa variant VYT in complex with tissue factor 提交 2019-03-19 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 T 33–242（210 aa）
未记录 CA CALCIUM ION × 9 FUC alpha-L-fucopyranose × 1 TMA TETRAMETHYLAMMONIUM ION × 10 0Z7 N-acetyl-D-phenylalanyl-N-[(2S,3S)-6-carbamimidamido-1-chloro-2-hydroxyhexan-3-yl]-L-phenylalaninamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.6；295 K；0.1 M sodium citrate, pH 5.6, 15.6 % (w/v) PEG 3350, 12 % (v/v) 1-Propanol
分辨率 1.25 Å R-free 0.194
8CN9 Factor VII binding Fab of the bispecific antibody HMB-001 in complex with Factor VII 提交 2023-02-22 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 E 33–251（219 aa）
未记录 CA CALCIUM ION × 2 BGC beta-D-glucopyranose × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.3；293 K；0.15 M Cesium chloride 15% w/v Polyethylene glycol 3,350
分辨率 3.40 Å R-free 0.356
8CN9 Factor VII binding Fab of the bispecific antibody HMB-001 in complex with Factor VII 提交 2023-02-22 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 J 33–251（219 aa）
未记录 CA CALCIUM ION × 3 BGC beta-D-glucopyranose × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.3；293 K；0.15 M Cesium chloride 15% w/v Polyethylene glycol 3,350
分辨率 3.40 Å R-free 0.356
8CN9 Factor VII binding Fab of the bispecific antibody HMB-001 in complex with Factor VII 提交 2023-02-22 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 O 33–251（219 aa）
未记录 CA CALCIUM ION × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.3；293 K；0.15 M Cesium chloride 15% w/v Polyethylene glycol 3,350
分辨率 3.40 Å R-free 0.356
8CN9 Factor VII binding Fab of the bispecific antibody HMB-001 in complex with Factor VII 提交 2023-02-22 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 T 33–251（219 aa）
未记录 CA CALCIUM ION × 2 BGC beta-D-glucopyranose × 1 CS CESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.3；293 K；0.15 M Cesium chloride 15% w/v Polyethylene glycol 3,350
分辨率 3.40 Å R-free 0.356
8QOD CRYSTAL STRUCTURE OF FVIIA IN COMPLEX WITH A BENZAMIDINE-BASED INHIBITOR 提交 2023-09-28 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 C 1–243（243 aa）
未记录 CA CALCIUM ION × 4 MG MAGNESIUM ION × 1 GLC alpha-D-glucopyranose × 1 FUC alpha-L-fucopyranose × 1 WIZ 3-[2-bromanyl-4-[(1~{S})-1-[[3-[(4-carbamimidoylphenyl)amino]-3-oxidanylidene-propanoyl]amino]ethyl]phenoxy]benzoic acid × 1 CL CHLORIDE ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；293 K；The VIIa/sTF complex was crystallized using the sitting drop or the hanging drop vapor diffusion method. Specifically, the protein drop contained 4 mg/ml VIIa/sTF complex, 20 mm Tris-HCl, pH 7.5, 200 mm NaCl, 10 mm CaCl2, and 10 mm pAB or 10 mm benzamidine, whereas the reservoir solution contained 16-22% PEG 4000, 100 mm MgCl2, and 20 mm BisTris, pH 6.5. Drops were prepared by mixing 2 ul of protein solution with 2 ul of reservoir solution at 20 C. Crystals appeared within 7 days and were allowed to grow up to 14-20 days before being flash-frozen without additional cryoprotectant.
分辨率 1.57 Å R-free 0.214
8QQ6 CRYSTAL STRUCTURE OF FVIIA IN COMPLEX WITH A BENZAMIDINE-BASED INHIBITOR 提交 2023-10-03 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 C 1–243（243 aa）
未记录 CA CALCIUM ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 1 GLC alpha-D-glucopyranose × 1 FUC alpha-L-fucopyranose × 1 CL CHLORIDE ION × 2 WSV 2-azanyl-~{N}-[[2-[2-[[3-methoxy-4-(1,3-oxazol-5-yl)phenyl]amino]-1,3-oxazol-5-yl]phenyl]methyl]-~{N}-methyl-ethanamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；293 K；The VIIa/sTF complex was crystallized using the sitting drop or the hanging drop vapor diffusion method. Specifically, the protein drop contained 4 mg/ml VIIa/sTF complex, 20 mm Tris-HCl, pH 7.5, 200 mm NaCl, 10 mm CaCl2, and 10 mm pAB or 10 mm benzamidine, whereas the reservoir solution contained 16-22% PEG 4000, 100 mm MgCl2, and 20 mm BisTris, pH 6.5. Drops were prepared by mixing 2 ul of protein solution with 2 ul of reservoir solution at 20 C. Crystals appeared within 7 days and were allowed to grow up to 14-20 days before being flash-frozen without additional cryoprotectant.
分辨率 1.87 Å R-free 0.259
8UUD BCX2627 complexed with human FVIIa and soluble Tissue Factor. 提交 2023-11-01 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 T 38–112（75 aa）
链 U 123–242（120 aa）
未记录 BGC beta-D-glucopyranose × 1 FUC alpha-L-fucopyranose × 1 CA CALCIUM ION × 9 XGX (1P)-2'-[(4-carbamimidoylphenyl)carbamoyl]-4'-ethenyl-4-[(2-methylpropyl)carbamoyl][1,1'-biphenyl]-2-carboxylic acid × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；293 K；14% (w/v)PEG 4K, 0.1M MgCl2, 0.1M ADA buffer, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION,
分辨率 2.40 Å R-free 0.265
9P0X Nanodisc-embedded human TF/FVIIa/XK1 in complex with 10H10 Fab (nanodisc-subtracted) 提交 2025-06-07 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric
链 T 38–276（239 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 4 CA CALCIUM ION × 12 BGC beta-D-glucopyranose × 1 FUC alpha-L-fucopyranose × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.70 Å

共 52 个其他 PDB 条目、56 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 TF_HUMAN
Isoform —
PDB实体 1
链与序列区间 作者链 A； PDB构建体 1–19； UniProt 277–295

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

SAXS profile for 2cef

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

P(r) distribution for 2cef
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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id2cef
沉积日期 deposition_date2006-02-06
结构标题 titlePhosphorylation of the Cytoplasmic Tail of Tissue Factor and its Role in Modulating Structure and Binding Affinity.
关键词 keywordsCOAGULATION PROTEIN, PIN1, WW DOMAIN, BLOOD COAGULATION PROTEIN, LIPOPROTEIN, PALMITATE, TRANSMEMBRANE, BLOOD CLOTTING; BLOOD CLOTTING
实验方法 methodSOLUTION NMR
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3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

回转半径 Rg (Guinier) rg_guinier9.15 Å
回转半径 Rg (电子) rg_electron8.49 Å
零角强度 I(0) i011165200.00
分子量 molecular_weight22243.0 kDa
排除体积 excluded_volume26034 ų
包络体积 envelope_volume6870 ų
水化壳体积 shell_volume6382 ų
包络直径 envelope_diameter33.1 Å
壳层 Rg shell_rg14.75 Å
包络 Rg envelope_rg10.16 Å
形状 Rg shape_rg8.36 Å
总 Rg total_rg9.31 Å
总原子数 total_atoms2700
残基数 n_residues170
球谐函数阶数 n_harmonics20
q 范围 q_range— – 0.5000 Å−1
数据点数 n_points101
壳层类型 shell_typedirectional
溶剂电子密度 solvent_density0.3340 e/ų
壳层衬度 contrast_shell0.0300 e/ų
CRYSOL 版本 crysol_version4.1.3
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4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

最大尺寸 Dmax dmax33.3 Å
Rg (实空间) rg_real9.17 Å
Rg 误差 (实空间) rg_real_error0.30 Å
I(0) (实空间) i0_real1.1170e+07
I(0) 误差 (实空间) i0_real_error1.1580e+05
Rg (倒空间) rg_reciprocal9.17 Å
I(0) (倒空间) i0_reciprocal11170000.0000
解质量估计 total_estimate0.7100
解质量评级 solution_quality REASONABLE a REASONABLE solution
P(r) 峰数 n_peaks2
主峰位置 r_peak_primary11.0 Å
偏度 Skewness skewness0.279
峰度 Kurtosis kurtosis-0.306
角度范围 angular_range— – 0.5000 Å−1
当前正则化参数 α current_alpha0.0000
最高正则化参数 α highest_alpha9127.0000
实空间数据点数 n_real_points80
GNOM 版本 gnom_version4.1.3
质量判据 quality_criteria AN1: 0.000; Oscil: 0.812; Stabil: 1.000; Sysdev: 0.368; Positv: 1.000; Valcen: 0.777; Smooth: 0.907
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5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

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6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (1)

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8. 引用文献 (1)

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9. 文件与曲线 (10)