HEMOPHORE HASA
SERRATIA MARCESCENS
当前结构中的状态
| Assembly | 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与共同组分 | 实验方法与环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 蛋白同源多聚体 同源多聚体 蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白拷贝数一致 | 链 A; UniProt 2–174 链 B; UniProt 2–174 | 未记录 | HEM PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 2 PO4 PHOSPHATE ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件:pH 8.5;2 MICROLITERS PROTEIN (AT A CONCENTRATION OF ABOUT 4 MG/ML) WERE MIXED WITH 1 MICROLITER RESERVOIR CONSISTING OF 100 MM TRIS BUFFER AT PH 8.5, 2 M K2HPO4 AND 2 M NAH2PO4. | 分辨率 2.30 Å R-free 0.224 |
数据库中的同蛋白其他状态
以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly, “相对当前条目”直接指出证据层面的不同;没有差异标签表示当前已读取字段一致。
| 其他 PDB | 相对当前条目 2CN4 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法与环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1B2V HEME-BINDING PROTEIN A 提交 1998-12-01 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 A
1–188(188 aa)
|
未记录 | CA CALCIUM ION × 1 HEM PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 4.6;0.2M CACL, 0.1M NA ACETATE PH 4.6, 20% ISOPRPANOL
|
分辨率 1.90 Å R-free 0.218 |
| 1DK0 CRYSTAL STRUCTURE OF THE HEMOPHORE HASA FROM SERRATIA MARCESCENS CRYSTAL FORM P2(1), PH8 提交 1999-12-06 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 A
1–188(188 aa)
|
未记录 | HEM PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 8;293 K;0.1M NaHepes, pH8.0, 1.4M NaKTartrate, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 1.77 Å R-free 0.213 |
| 1DK0 CRYSTAL STRUCTURE OF THE HEMOPHORE HASA FROM SERRATIA MARCESCENS CRYSTAL FORM P2(1), PH8 提交 1999-12-06 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 B
1–188(188 aa)
|
未记录 | HEM PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 8;293 K;0.1M NaHepes, pH8.0, 1.4M NaKTartrate, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 1.77 Å R-free 0.213 |
| 1DKH CRYSTAL STRUCTURE OF THE HEMOPHORE HASA, PH 6.5 提交 1999-12-07 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 A
1–188(188 aa)
|
未记录 | ZN ZINC ION × 3 SM SAMARIUM (III) ION × 1 HEM PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6.5;293 K;Cacodylate buffer pH6.5,
Zinc Acetate 140mM,
Glycerol 2%,
PEG8000 10%,
Samarium Chloride 10mM., VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 3.20 Å R-free 0.288 |
| 1YBJ Structural and Dynamics studies of both apo and holo forms of the hemophore HasA 提交 2004-12-21 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 A
2–179(178 aa)
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
SOLUTION NMR
NMR测量条件
pH 5.6;303 K;离子强度(mmCIF原始值)20mM sodium phosphate buffer;压力 ambient
NMR样品组成
1.8mM HasA 15N | 20mM sodium phosphate buffer, pH5.6; 90% H2O/10% D20
NMR样品组成
1.9mM HasA 15N,13C | 20mM sodium phosphate buffer, pH5.6; 90% H2O/10% D20
|
分辨率未提供 |
| 2UYD Crystal structure of the SmHasA mutant H83A 提交 2007-04-04 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 X
1–188(188 aa)
|
突变:YES | HEM PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 1 ZN ZINC ION × 8 ACT ACETATE ION × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 6.5;293 K;DROPS WERE PREPARED BY MIXING 2MICROL OF THE PROTEIN SOLUTION WITH 1 MICROL OF THE RESERVOIR SOLUTION THAT CONTAINED 100 MM SODIUM CACODYLATE AT PH 6.5, 200 MM ZN(OAC)2 AND 10 % (V/V) 2-PROPANOL. THE BROWNISH CRYSTALS GREW OVER A PERIOD OF 2 MONTHS AT 20 DEGREES C.
|
分辨率 2.70 Å R-free 0.274 |
| 3CSL Structure of the Serratia marcescens hemophore receptor HasR in complex with its hemophore HasA and heme 提交 2008-04-10 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric |
链 C
2–188(187 aa)
|
未记录 | HEM PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 1 GOL GLYCEROL × 5 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 8;291 K;2 M NaCl, 100 mM Tris, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K
|
分辨率 2.70 Å R-free 0.274 |
| 3CSL Structure of the Serratia marcescens hemophore receptor HasR in complex with its hemophore HasA and heme 提交 2008-04-10 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric |
链 D
2–188(187 aa)
|
未记录 | HEM PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 1 GOL GLYCEROL × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 8;291 K;2 M NaCl, 100 mM Tris, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K
|
分辨率 2.70 Å R-free 0.274 |
| 3CSN Structure of the Serratia marcescens hemophore receptor HasR in complex with its hemophore HasA 提交 2008-04-10 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric |
链 C
2–188(187 aa)
|
未记录 | GOL GLYCEROL × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 8;291 K;2 M NaCl, 100 mM Tris, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K
|
分辨率 3.00 Å R-free 0.244 |
| 3CSN Structure of the Serratia marcescens hemophore receptor HasR in complex with its hemophore HasA 提交 2008-04-10 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric |
链 D
2–188(187 aa)
|
未记录 | GOL GLYCEROL × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 8;291 K;2 M NaCl, 100 mM Tris, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K
|
分辨率 3.00 Å R-free 0.244 |
| 3DDR Structure of the Serratia marcescens hemophore receptor HasR-Ile671Gly mutant in complex with its hemophore HasA and heme 提交 2008-06-06 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric |
链 C
2–188(187 aa)
|
未记录 | NA SODIUM ION × 1 GOL GLYCEROL × 1 HEM PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 8;291 K;2 M NaCl, 100 mM Tris, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K
|
分辨率 2.80 Å R-free 0.262 |
| 3DDR Structure of the Serratia marcescens hemophore receptor HasR-Ile671Gly mutant in complex with its hemophore HasA and heme 提交 2008-06-06 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric |
链 D
2–188(187 aa)
|
未记录 | NA SODIUM ION × 1 GOL GLYCEROL × 5 HEM PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 8;291 K;2 M NaCl, 100 mM Tris, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K
|
分辨率 2.80 Å R-free 0.262 |
| 5C58 A double mutant of serratia marcescens hemophore receptor HasR in complex with its hemophore HasA and heme 提交 2015-06-19 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric |
链 B
2–188(187 aa)
片段:UNP residues 2-188
|
未记录 | HEM PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;291 K;100mM Tris pH 7 to 8, 1.8 to 2.2mM NaCl, 100mM K2HPO4
|
分辨率 2.79 Å R-free 0.296 |
| 9XOH Crystal Structure of Redesigned HasAsm Variant (14-mutation) with Iron Tetraphenylporphyrin 提交 2025-11-13 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 A
1–176(176 aa)
|
突变:A2S, G13A, H17A, G21T, S42T, Q63N, N79S, D102T, V110N, D112E, A125S, V131E, G145S, D156K | MQP [5,10,15,20-tetraphenylporphyrinato(2-)-kappa~4~N~21~,N~22~,N~23~,N~24~]iron × 1 GOL GLYCEROL × 3 NA SODIUM ION × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293 K;0.1M sodium cacodylate-HCl, 1M sodium citrate tribasic
|
分辨率 1.51 Å R-free 0.234 |
| 9XOH Crystal Structure of Redesigned HasAsm Variant (14-mutation) with Iron Tetraphenylporphyrin 提交 2025-11-13 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 B
1–176(176 aa)
|
突变:A2S, G13A, H17A, G21T, S42T, Q63N, N79S, D102T, V110N, D112E, A125S, V131E, G145S, D156K | MQP [5,10,15,20-tetraphenylporphyrinato(2-)-kappa~4~N~21~,N~22~,N~23~,N~24~]iron × 1 GOL GLYCEROL × 2 NA SODIUM ION × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293 K;0.1M sodium cacodylate-HCl, 1M sodium citrate tribasic
|
分辨率 1.51 Å R-free 0.234 |
| 9XOH Crystal Structure of Redesigned HasAsm Variant (14-mutation) with Iron Tetraphenylporphyrin 提交 2025-11-13 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 3 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 C
1–176(176 aa)
|
突变:A2S, G13A, H17A, G21T, S42T, Q63N, N79S, D102T, V110N, D112E, A125S, V131E, G145S, D156K | MQP [5,10,15,20-tetraphenylporphyrinato(2-)-kappa~4~N~21~,N~22~,N~23~,N~24~]iron × 1 NA SODIUM ION × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293 K;0.1M sodium cacodylate-HCl, 1M sodium citrate tribasic
|
分辨率 1.51 Å R-free 0.234 |
| 9XOH Crystal Structure of Redesigned HasAsm Variant (14-mutation) with Iron Tetraphenylporphyrin 提交 2025-11-13 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 4 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 D
1–176(176 aa)
|
突变:A2S, G13A, H17A, G21T, S42T, Q63N, N79S, D102T, V110N, D112E, A125S, V131E, G145S, D156K | MQP [5,10,15,20-tetraphenylporphyrinato(2-)-kappa~4~N~21~,N~22~,N~23~,N~24~]iron × 1 GOL GLYCEROL × 2 NA SODIUM ION × 3 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293 K;0.1M sodium cacodylate-HCl, 1M sodium citrate tribasic
|
分辨率 1.51 Å R-free 0.234 |
| 9XOK Crystal Structure of Redesigned HasAsm Variant (51-mutation) with Iron Tetraphenylporphyrin 提交 2025-11-13 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 A
3–173(171 aa)
|
突变:;F11L, G12D, G13N, Y14L, S15T, I16L, H17Q, D18E, Y19F, L20F, G21N, Q22E, S25A, T26S, S58T, A61K, N62D, Q63G, Q88T, S93A, D96N, D102S, T103S, S104T, Q109T, V110E, D112Q, V113F, S114R, F115L, N119G, L120W, S121T, L123E, Q124I, A125S, Q126E, T144S, G145T, A146P, E148L, T149Q, G153N, I154Q, D156Q, D157Q, V162T, D167M, Q168E, V169I, A170R ; | MQP [5,10,15,20-tetraphenylporphyrinato(2-)-kappa~4~N~21~,N~22~,N~23~,N~24~]iron × 1 SO4 SULFATE ION × 1 GOL GLYCEROL × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293 K;0.1M sodium cacodylate-HCl, 2M ammonium sulfate, 0.2M NaCl
|
分辨率 1.80 Å R-free 0.330 |
| 9XPD Crystal Structure of Redesigned HasAsm Variant (51-mutation) with Heme 提交 2025-11-16 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 A
1–176(176 aa)
|
突变:;F11L, G12D, G13N, Y14L, S15T, I16L, H17Q, D18E, Y19F, L20F, G21N, Q22E, S25A, T26S, S58T, A61K, N62D, Q63G, Q88T, S93A, D96N, D102S, T103S, S104T, Q109T, V110E, D112Q, V113F, S114R, F115L, N119G, L120W, S121T, L123E, Q124I, A125S, Q126E, T144S, G145T, A146P, E148L, T149Q, G153N, I154Q, D156Q, D157Q, V162T, D167M, Q168E, V169I, A170R ; | IMD IMIDAZOLE × 1 CIT CITRIC ACID × 1 GOL GLYCEROL × 1 HEM PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 1 NA SODIUM ION × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 8;293 K;0.1M imidazole-HCl, 1M sodium citrate tribasic
|
分辨率 1.22 Å R-free 0.177 |
| 9XPI Crystal Structure of Redesigned HasAsm Variant (48-mutation) with Heme 提交 2025-11-16 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 A
1–176(176 aa)
|
突变:;F11L, G12A, G13N, Y14L, S15T, I16L, H17A, D18E, Y19F, L20F, G21N, Q22E, T26Y, N41S, S58T, A61K, N62D, Q63G, N79S, E80P, Q88T, S91A, S93T, D96N, T103S, S104T, Q109V, V110N, D112E, S114T, G116S, L120W, S121T, L123E, A125E, Q126E, Q134K, V136I, G145T, E148L, T149Q, G153S, I154L, D156K, D157Q, V162I, Q168E, V169I ; | HEM PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 1 ACT ACETATE ION × 3 ZN ZINC ION × 6 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 8;293 K;0.1M imidazole-HCl, 2.5M NaCl, 0.2M Zinc acetate
|
分辨率 2.16 Å R-free 0.255 |
共 13 个其他 PDB 条目、20 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态
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| UniProt名称 | HASA_SERMA |
| Isoform | — |
| PDB实体 | 1 |
| 链与序列区间 | 作者链 A; PDB构建体 1–173; UniProt 2–174 作者链 B; PDB构建体 1–173; UniProt 2–174 |