Cleavage and polyadenylation specificity factor, 30 kDa subunit
Homo sapiens
当前结构中的状态
| Assembly | 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与共同组分 | 实验方法与环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 蛋白单体 单体 蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白拷贝数一致 | 链 A； UniProt 61–126 | 片段：CCCH-type zinc finger motif | ZN ZINC ION × 2 | SOLUTION NMR NMR测量条件：pH 7；298 K；离子强度（mmCIF原始值）100mM；压力 ambient NMR样品组成：20mM d-Tris-HCl(pH7.0), 100mM NaCl, 1mM d-DTT, 0.02% NaN3, 50uM ZnCl2+1mM IDA, 90% H2O, 10% D2O | 90% H2O/10% D2O | 分辨率未提供 |
数据库中的同蛋白其他状态
以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。
| 其他 PDB | 相对当前条目 2D9N | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法与环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 2RHK Crystal structure of influenza A NS1A protein in complex with F2F3 fragment of human cellular factor CPSF30, Northeast Structural Genomics Targets OR8C and HR6309A 提交 2007-10-09 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 C
61–121（61 aa）
片段：F2F3 Zinc-binding domains (UNP residues 61-121)
链 D
61–121（61 aa）
片段：F2F3 Zinc-binding domains (UNP residues 61-121)
|
突变：P94S 突变：P94S | NO3 NITRATE ION × 5 ZN ZINC ION × 4 TRS 2-AMINO-2-HYDROXYMETHYL-PROPANE-1,3-DIOL × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 5.5；293 K；0.5 M KNO3, 10% sucroes, 0.1M sodium acitate, pH 5.5, EVAPORATION, temperature 293K, pH 5.50
|
分辨率 1.95 Å R-free 0.234 |
| 2RHK Crystal structure of influenza A NS1A protein in complex with F2F3 fragment of human cellular factor CPSF30, Northeast Structural Genomics Targets OR8C and HR6309A 提交 2007-10-09 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric |
链 C
61–121（61 aa）
片段：F2F3 Zinc-binding domains (UNP residues 61-121)
链 D
61–121（61 aa）
片段：F2F3 Zinc-binding domains (UNP residues 61-121)
|
突变：P94S 突变：P94S | NO3 NITRATE ION × 9 ZN ZINC ION × 6 TRS 2-AMINO-2-HYDROXYMETHYL-PROPANE-1,3-DIOL × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 5.5；293 K；0.5 M KNO3, 10% sucroes, 0.1M sodium acitate, pH 5.5, EVAPORATION, temperature 293K, pH 5.50
|
分辨率 1.95 Å R-free 0.234 |
| 2RHK Crystal structure of influenza A NS1A protein in complex with F2F3 fragment of human cellular factor CPSF30, Northeast Structural Genomics Targets OR8C and HR6309A 提交 2007-10-09 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric |
链 C
61–121（61 aa）
片段：F2F3 Zinc-binding domains (UNP residues 61-121)
链 D
61–121（61 aa）
片段：F2F3 Zinc-binding domains (UNP residues 61-121)
|
突变：P94S 突变：P94S | NO3 NITRATE ION × 5 ZN ZINC ION × 4 TRS 2-AMINO-2-HYDROXYMETHYL-PROPANE-1,3-DIOL × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 5.5；293 K；0.5 M KNO3, 10% sucroes, 0.1M sodium acitate, pH 5.5, EVAPORATION, temperature 293K, pH 5.50
|
分辨率 1.95 Å R-free 0.234 |
| 2RHK Crystal structure of influenza A NS1A protein in complex with F2F3 fragment of human cellular factor CPSF30, Northeast Structural Genomics Targets OR8C and HR6309A 提交 2007-10-09 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric |
链 D
61–121（61 aa）
片段：F2F3 Zinc-binding domains (UNP residues 61-121)
|
突变：P94S | NO3 NITRATE ION × 4 ZN ZINC ION × 2 TRS 2-AMINO-2-HYDROXYMETHYL-PROPANE-1,3-DIOL × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 5.5；293 K；0.5 M KNO3, 10% sucroes, 0.1M sodium acitate, pH 5.5, EVAPORATION, temperature 293K, pH 5.50
|
分辨率 1.95 Å R-free 0.234 |
| 6DNH Cryo-EM structure of human CPSF-160-WDR33-CPSF-30-PAS RNA complex at 3.4 A resolution 提交 2018-06-06 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：tetrameric |
链 C
1–244（244 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 3 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.9；25 mM Tris-HCl, pH 7.9, 380 mM NaCl, 5 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.40 Å |
| 6FUW Cryo-EM structure of the human CPSF160-WDR33-CPSF30 complex bound to the PAS AAUAAA motif at 3.1 Angstrom resolution 提交 2018-02-28 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：tetrameric |
链 C
1–178（178 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 3 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE-PROPANE；15 seconds wait time prior to blotting
|
分辨率 3.07 Å |
| 6URG Cryo-EM structure of human CPSF160-WDR33-CPSF30-CPSF100 PIM complex 提交 2019-10-23 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 C
1–244（244 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 8；25 mM Tris-HCl, pH 8.0, 150 mM NaCl, 5 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.00 Å |
| 6URO Cryo-EM structure of human CPSF160-WDR33-CPSF30-PAS RNA-CstF77 complex 提交 2019-10-23 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：hexameric |
链 C
1–244（244 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 3 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 8；25 mM Tris-HCl, pH 8.0, 150 mM NaCl, 5 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.60 Å |
| 7ZYH Crystal structure of human CPSF30 in complex with hFip1 提交 2022-05-24 | 构建体不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric |
链 A
118–178（61 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；292.15 K；1.626 M (NH4)SO4, 0.1 M Bis-Tris pH 6.5
|
分辨率 2.20 Å R-free 0.264 |
| 7ZYH Crystal structure of human CPSF30 in complex with hFip1 提交 2022-05-24 | 构建体不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric |
链 D
118–178（61 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；292.15 K；1.626 M (NH4)SO4, 0.1 M Bis-Tris pH 6.5
|
分辨率 2.20 Å R-free 0.264 |
| 7ZYH Crystal structure of human CPSF30 in complex with hFip1 提交 2022-05-24 | 构建体不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric |
链 G
118–178（61 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；292.15 K；1.626 M (NH4)SO4, 0.1 M Bis-Tris pH 6.5
|
分辨率 2.20 Å R-free 0.264 |
| 7ZYH Crystal structure of human CPSF30 in complex with hFip1 提交 2022-05-24 | 构建体不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric |
链 J
118–178（61 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；292.15 K；1.626 M (NH4)SO4, 0.1 M Bis-Tris pH 6.5
|
分辨率 2.20 Å R-free 0.264 |
| 8E3I CRYO-EM STRUCTURE OF the human MPSF IN COMPLEX WITH THE AUUAAA poly(A) signal 提交 2022-08-17 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：tetrameric |
链 C
1–244（244 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 3 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 8；25 mM Tris (pH 8.0), 150 mM NaCl, and 5 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.53 Å |
| 8E3Q CRYO-EM STRUCTURE OF the human MPSF 提交 2022-08-17 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric |
链 C
1–244（244 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 8；25 mM Tris (pH 8.0), 150 mM NaCl, and 5 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.68 Å |
| 8R8R Cryo-EM structure of the human mPSF with PAPOA C-terminus peptide (PAPOAc) 提交 2023-11-29 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：pentameric |
链 C
2–244（243 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 3 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE-PROPANE
|
分辨率 2.79 Å |
| 9OXE CRYO-EM STRUCTURE OF the human mPSF IN COMPLEX WITH THE AGUAAA poly(A) signal 提交 2025-06-03 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：tetrameric |
链 C
1–244（244 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 3 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.53 Å |
| 9OXS CRYO-EM STRUCTURE OF the human mPSF IN COMPLEX WITH THE AAUAAU poly(A) signal 提交 2025-06-04 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：tetrameric |
链 C
1–244（244 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 3 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.07 Å |
共 11 个其他 PDB 条目、17 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态
查看构建体与数据证据
| UniProt名称 | CPSF4_HUMAN |
| Isoform | — |
| PDB实体 | 1 |
| 链与序列区间 | 作者链 A； PDB构建体 6–71； UniProt 61–126 |
