SAXSdb — 2eex

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Endoglucanase

Clostridium thermocellum

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	其他组合	单体	蛋白 1 其他聚合物 1	beta-D-glucopyranose-(1-4)-beta-D-glucopyranose-(1-4)-beta-D-glucopyranose-(1-4)-beta-D-glucopyranose-(1-4)-beta-D-glucopyranose × 1 ZINC ION × 1 CHLORIDE ION × 1 GLYCEROL × 2 CALCIUM ION × 1 water × 1	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	P71140_CLOTM
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 5–519； UniProt 773–1287

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	2eex
沉积日期 deposition_date	2007-02-19
结构标题 title	Crystal structure of Cel44A, GH family 44 endoglucanase from Clostridium thermocellum
关键词 keywords	TIM barrel, The composite domain of GH family 5, 30, 39, 51, GH family 44, glycoside hydrolase, HYDROLASE; HYDROLASE
实验方法 method	X-RAY DIFFRACTION

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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

2eex__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

2eex__assembly_1__model_1 | I(q)

100 个绘图点；横轴和纵轴均采用对数尺度。

2eex__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。

Rg（Guinier）	24.57 Å
Rg（电子密度）	23.47 Å
总 Rg	24.37 Å
原子数	4083
残基数	509
排除体积	72124 Å³
最大 q	0.500 Å⁻¹

Assembly	Model	结构单元	聚集说明	状态	CRYSOL	操作
1	1	`2eex__assembly_1__model_1`	monomeric （1）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载

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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (7)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	Endoglucanase
分子量 formula_weight	57687.5 kDa
EC 编号 ec_number	3.2.1.4, 3.2.1.151
突变 mutation	E186Q
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A
原子数 atom_count	4542

GSRSEPAKVVDIRIDTSAERKPISPYIYGSNQELDATVTAKRFGGNRTTGYNWENNFSNAGSDWLHYSDTYLLEDGGVPKGEWSTPASVVTTFHDKALSKNVPYTLITLQAAGYVSADGNGPVSQEETAPSSRWKEVKFEKGAPFSLTPDTEDDYVYMDEFVNYLVNKYGNASTPTGIKGYSIDNQPALWSHTHPRIHPDNVTAKELIEKSVALSKAVKKVDPYAEIFGPALYGFAAYETLQSAPDWGTEGEGYRWFIDYYLDKMKKASDEEGKRLLDVLDVHWYPEARGGGERICFGADPRNIETNKARLQAPRTLWDPTYIEDSWIGQWKKDFLPILPNLLDSIEKYYPGTKLAITEYDYGGGNHITGGIAQADVLGIFGKYGVYLATFWGDASNNYTEAGINLYTNYDGKGGKFGDTSVKCETSDIEVSSAYASIVGEDDSKLHIILLNKNYDQPTTFNFSIDSSKNYTIGNVWAFDRGSSNITQRTPIVNIKDNTFTYTVPALTACHIVLEAAEP

来源 Source

来源生物 organism	Clostridium thermocellum
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	1515
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

实体 2 Entity 2 branched

描述 description	beta-D-glucopyranose-(1-4)-beta-D-glucopyranose-(1-4)-beta-D-glucopyranose-(1-4)-beta-D-glucopyranose-(1-4)-beta-D-glucopyranose
分子量 formula_weight	828.7 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

实体 3 Entity 3 non-polymer

描述 description	ZINC ION
分子量 formula_weight	65.4 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	1

实体 4 Entity 4 non-polymer

描述 description	CHLORIDE ION
分子量 formula_weight	35.5 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	1

实体 5 Entity 5 non-polymer

描述 description	GLYCEROL
分子量 formula_weight	92.1 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	2

实体 6 Entity 6 non-polymer

描述 description	CALCIUM ION
分子量 formula_weight	40.1 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	1

实体 7 Entity 7 water

描述 description	water
分子量 formula_weight	18.0 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	459

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6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 2 domains

CATH v4.4 (2 domains)

结构域编号 domain_id	2eexA01
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	60 — Sandwich
拓扑 Topology topology	40 — Immunoglobulin-like
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	1180 — Golgi alpha-mannosidase II

结构域编号 domain_id	2eexA02
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	20 — Alpha-Beta Barrel
拓扑 Topology topology	20 — TIM Barrel
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	80 — Glycosidases

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晶胞边长 a length_a	47.944 Å
晶胞边长 b length_b	59.120 Å
晶胞边长 c length_c	171.113 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	90.00 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	90.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	4

空间群 space_group	P 21 21 21
空间群编号 int_tables_number	19
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	2.000 Å
最低分辨率 resolution_low	19.720 Å
R 因子 r_factor	0.1650
R_work r_work	0.1650
R_free r_free	0.2010

Crystal structure of Cel44A, GH family 44 endoglucanase from Clostridium thermocellum

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Endoglucanase

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

2eex__assembly_1__model_1

2eex__assembly_1__model_1 | I(q)

2eex__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (7)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 branched

实体 3 Entity 3 non-polymer

实体 4 Entity 4 non-polymer

实体 5 Entity 5 non-polymer

实体 6 Entity 6 non-polymer

实体 7 Entity 7 water

6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 2 domains

CATH v4.4 (2 domains)

7. 引用文献 (1)

Crystal structure of Cel44A, GH family 44 endoglucanase from Clostridium thermocellum

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Endoglucanase

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

2eex__assembly_1__model_1

2eex__assembly_1__model_1 | I(q)

2eex__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (7)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 branched

实体 3 Entity 3 non-polymer

实体 4 Entity 4 non-polymer

实体 5 Entity 5 non-polymer

实体 6 Entity 6 non-polymer

实体 7 Entity 7 water

6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 2 domains

CATH v4.4 (2 domains)

7. 引用文献 (1)