2eij

Bovine heart cytochrome C oxidase in the fully reduced state

Method: X-RAY DIFFRACTION

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Cytochrome c oxidase subunit 1

物种未注明

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 26	Cytochrome c oxidase subunit 2 × 2 （P68530） Cytochrome c oxidase subunit 3 × 2 （P00415） Cytochrome c oxidase subunit 4 isoform 1 × 2 （P00423） Cytochrome c oxidase polypeptide Va × 2 （P00426） Cytochrome c oxidase polypeptide Vb × 2 （P00428） Cytochrome c oxidase polypeptide VIa-heart × 2 （P07471） Cytochrome c oxidase subunit VIb isoform 1 × 2 （P00429） Cytochrome c oxidase polypeptide VIc × 2 （P04038） Cytochrome c oxidase polypeptide VIIa-heart × 2 （P07470） Cytochrome c oxidase polypeptide VIIb × 2 （P13183） Cytochrome c oxidase polypeptide VIIc × 2 （P00430） Cytochrome c oxidase polypeptide VIII-heart × 2 （P10175） COPPER (II) ION × 2 MAGNESIUM ION × 2 SODIUM ION × 2 HEME-A × 4 TRISTEAROYLGLYCEROL × 6 (1R)-2-{[{[(2S)-2,3-DIHYDROXYPROPYL]OXY}(HYDROXY)PHOSPHORYL]OXY}-1-[(PALMITOYLOXY)METHYL]ETHYL (11E)-OCTADEC-11-ENOATE × 8 DINUCLEAR COPPER ION × 2 (7R,17E,20E)-4-HYDROXY-N,N,N-TRIMETHYL-9-OXO-7-[(PALMITOYLOXY)METHYL]-3,5,8-TRIOXA-4-PHOSPHAHEXACOSA-17,20-DIEN-1-AMINIUM 4-OXIDE × 2 CHOLIC ACID × 8 DECYL-BETA-D-MALTOPYRANOSIDE × 4 ZINC ION × 4 (1S)-2-{[(2-AMINOETHOXY)(HYDROXY)PHOSPHORYL]OXY}-1-[(STEAROYLOXY)METHYL]ETHYL (5E,8E,11E,14E)-ICOSA-5,8,11,14-TETRAENOATE × 6 CARDIOLIPIN × 4 water × 26	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	COX1_BOVIN
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 1–514； UniProt 1–514 作者链 N； PDB构建体 1–514； UniProt 1–514

Cytochrome c oxidase subunit 2

物种未注明

UniProt P68530

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 26	Cytochrome c oxidase subunit 1 × 2 （P00396） Cytochrome c oxidase subunit 3 × 2 （P00415） Cytochrome c oxidase subunit 4 isoform 1 × 2 （P00423） Cytochrome c oxidase polypeptide Va × 2 （P00426） Cytochrome c oxidase polypeptide Vb × 2 （P00428） Cytochrome c oxidase polypeptide VIa-heart × 2 （P07471） Cytochrome c oxidase subunit VIb isoform 1 × 2 （P00429） Cytochrome c oxidase polypeptide VIc × 2 （P04038） Cytochrome c oxidase polypeptide VIIa-heart × 2 （P07470） Cytochrome c oxidase polypeptide VIIb × 2 （P13183） Cytochrome c oxidase polypeptide VIIc × 2 （P00430） Cytochrome c oxidase polypeptide VIII-heart × 2 （P10175） COPPER (II) ION × 2 MAGNESIUM ION × 2 SODIUM ION × 2 HEME-A × 4 TRISTEAROYLGLYCEROL × 6 (1R)-2-{[{[(2S)-2,3-DIHYDROXYPROPYL]OXY}(HYDROXY)PHOSPHORYL]OXY}-1-[(PALMITOYLOXY)METHYL]ETHYL (11E)-OCTADEC-11-ENOATE × 8 DINUCLEAR COPPER ION × 2 (7R,17E,20E)-4-HYDROXY-N,N,N-TRIMETHYL-9-OXO-7-[(PALMITOYLOXY)METHYL]-3,5,8-TRIOXA-4-PHOSPHAHEXACOSA-17,20-DIEN-1-AMINIUM 4-OXIDE × 2 CHOLIC ACID × 8 DECYL-BETA-D-MALTOPYRANOSIDE × 4 ZINC ION × 4 (1S)-2-{[(2-AMINOETHOXY)(HYDROXY)PHOSPHORYL]OXY}-1-[(STEAROYLOXY)METHYL]ETHYL (5E,8E,11E,14E)-ICOSA-5,8,11,14-TETRAENOATE × 6 CARDIOLIPIN × 4 water × 26	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	COX2_BOVIN
Isoform	—
PDB实体	2
链与序列区间	作者链 B； PDB构建体 1–227； UniProt 1–227 作者链 O； PDB构建体 1–227； UniProt 1–227

Cytochrome c oxidase subunit 3

物种未注明

UniProt P00415

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 26	Cytochrome c oxidase subunit 1 × 2 （P00396） Cytochrome c oxidase subunit 2 × 2 （P68530） Cytochrome c oxidase subunit 4 isoform 1 × 2 （P00423） Cytochrome c oxidase polypeptide Va × 2 （P00426） Cytochrome c oxidase polypeptide Vb × 2 （P00428） Cytochrome c oxidase polypeptide VIa-heart × 2 （P07471） Cytochrome c oxidase subunit VIb isoform 1 × 2 （P00429） Cytochrome c oxidase polypeptide VIc × 2 （P04038） Cytochrome c oxidase polypeptide VIIa-heart × 2 （P07470） Cytochrome c oxidase polypeptide VIIb × 2 （P13183） Cytochrome c oxidase polypeptide VIIc × 2 （P00430） Cytochrome c oxidase polypeptide VIII-heart × 2 （P10175） COPPER (II) ION × 2 MAGNESIUM ION × 2 SODIUM ION × 2 HEME-A × 4 TRISTEAROYLGLYCEROL × 6 (1R)-2-{[{[(2S)-2,3-DIHYDROXYPROPYL]OXY}(HYDROXY)PHOSPHORYL]OXY}-1-[(PALMITOYLOXY)METHYL]ETHYL (11E)-OCTADEC-11-ENOATE × 8 DINUCLEAR COPPER ION × 2 (7R,17E,20E)-4-HYDROXY-N,N,N-TRIMETHYL-9-OXO-7-[(PALMITOYLOXY)METHYL]-3,5,8-TRIOXA-4-PHOSPHAHEXACOSA-17,20-DIEN-1-AMINIUM 4-OXIDE × 2 CHOLIC ACID × 8 DECYL-BETA-D-MALTOPYRANOSIDE × 4 ZINC ION × 4 (1S)-2-{[(2-AMINOETHOXY)(HYDROXY)PHOSPHORYL]OXY}-1-[(STEAROYLOXY)METHYL]ETHYL (5E,8E,11E,14E)-ICOSA-5,8,11,14-TETRAENOATE × 6 CARDIOLIPIN × 4 water × 26	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	COX3_BOVIN
Isoform	—
PDB实体	3
链与序列区间	作者链 C； PDB构建体 1–261； UniProt 1–261 作者链 P； PDB构建体 1–261； UniProt 1–261

Cytochrome c oxidase subunit 4 isoform 1

物种未注明

UniProt P00423

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 26	Cytochrome c oxidase subunit 1 × 2 （P00396） Cytochrome c oxidase subunit 2 × 2 （P68530） Cytochrome c oxidase subunit 3 × 2 （P00415） Cytochrome c oxidase polypeptide Va × 2 （P00426） Cytochrome c oxidase polypeptide Vb × 2 （P00428） Cytochrome c oxidase polypeptide VIa-heart × 2 （P07471） Cytochrome c oxidase subunit VIb isoform 1 × 2 （P00429） Cytochrome c oxidase polypeptide VIc × 2 （P04038） Cytochrome c oxidase polypeptide VIIa-heart × 2 （P07470） Cytochrome c oxidase polypeptide VIIb × 2 （P13183） Cytochrome c oxidase polypeptide VIIc × 2 （P00430） Cytochrome c oxidase polypeptide VIII-heart × 2 （P10175） COPPER (II) ION × 2 MAGNESIUM ION × 2 SODIUM ION × 2 HEME-A × 4 TRISTEAROYLGLYCEROL × 6 (1R)-2-{[{[(2S)-2,3-DIHYDROXYPROPYL]OXY}(HYDROXY)PHOSPHORYL]OXY}-1-[(PALMITOYLOXY)METHYL]ETHYL (11E)-OCTADEC-11-ENOATE × 8 DINUCLEAR COPPER ION × 2 (7R,17E,20E)-4-HYDROXY-N,N,N-TRIMETHYL-9-OXO-7-[(PALMITOYLOXY)METHYL]-3,5,8-TRIOXA-4-PHOSPHAHEXACOSA-17,20-DIEN-1-AMINIUM 4-OXIDE × 2 CHOLIC ACID × 8 DECYL-BETA-D-MALTOPYRANOSIDE × 4 ZINC ION × 4 (1S)-2-{[(2-AMINOETHOXY)(HYDROXY)PHOSPHORYL]OXY}-1-[(STEAROYLOXY)METHYL]ETHYL (5E,8E,11E,14E)-ICOSA-5,8,11,14-TETRAENOATE × 6 CARDIOLIPIN × 4 water × 26	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	COX41_BOVIN
Isoform	—
PDB实体	4
链与序列区间	作者链 D； PDB构建体 1–147； UniProt 23–169 作者链 Q； PDB构建体 1–147； UniProt 23–169

Cytochrome c oxidase polypeptide Va

物种未注明

UniProt P00426

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 26	Cytochrome c oxidase subunit 1 × 2 （P00396） Cytochrome c oxidase subunit 2 × 2 （P68530） Cytochrome c oxidase subunit 3 × 2 （P00415） Cytochrome c oxidase subunit 4 isoform 1 × 2 （P00423） Cytochrome c oxidase polypeptide Vb × 2 （P00428） Cytochrome c oxidase polypeptide VIa-heart × 2 （P07471） Cytochrome c oxidase subunit VIb isoform 1 × 2 （P00429） Cytochrome c oxidase polypeptide VIc × 2 （P04038） Cytochrome c oxidase polypeptide VIIa-heart × 2 （P07470） Cytochrome c oxidase polypeptide VIIb × 2 （P13183） Cytochrome c oxidase polypeptide VIIc × 2 （P00430） Cytochrome c oxidase polypeptide VIII-heart × 2 （P10175） COPPER (II) ION × 2 MAGNESIUM ION × 2 SODIUM ION × 2 HEME-A × 4 TRISTEAROYLGLYCEROL × 6 (1R)-2-{[{[(2S)-2,3-DIHYDROXYPROPYL]OXY}(HYDROXY)PHOSPHORYL]OXY}-1-[(PALMITOYLOXY)METHYL]ETHYL (11E)-OCTADEC-11-ENOATE × 8 DINUCLEAR COPPER ION × 2 (7R,17E,20E)-4-HYDROXY-N,N,N-TRIMETHYL-9-OXO-7-[(PALMITOYLOXY)METHYL]-3,5,8-TRIOXA-4-PHOSPHAHEXACOSA-17,20-DIEN-1-AMINIUM 4-OXIDE × 2 CHOLIC ACID × 8 DECYL-BETA-D-MALTOPYRANOSIDE × 4 ZINC ION × 4 (1S)-2-{[(2-AMINOETHOXY)(HYDROXY)PHOSPHORYL]OXY}-1-[(STEAROYLOXY)METHYL]ETHYL (5E,8E,11E,14E)-ICOSA-5,8,11,14-TETRAENOATE × 6 CARDIOLIPIN × 4 water × 26	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	COX5A_BOVIN
Isoform	—
PDB实体	5
链与序列区间	作者链 E； PDB构建体 1–109； UniProt 44–152 作者链 R； PDB构建体 1–109； UniProt 44–152

Cytochrome c oxidase polypeptide Vb

物种未注明

UniProt P00428

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 26	Cytochrome c oxidase subunit 1 × 2 （P00396） Cytochrome c oxidase subunit 2 × 2 （P68530） Cytochrome c oxidase subunit 3 × 2 （P00415） Cytochrome c oxidase subunit 4 isoform 1 × 2 （P00423） Cytochrome c oxidase polypeptide Va × 2 （P00426） Cytochrome c oxidase polypeptide VIa-heart × 2 （P07471） Cytochrome c oxidase subunit VIb isoform 1 × 2 （P00429） Cytochrome c oxidase polypeptide VIc × 2 （P04038） Cytochrome c oxidase polypeptide VIIa-heart × 2 （P07470） Cytochrome c oxidase polypeptide VIIb × 2 （P13183） Cytochrome c oxidase polypeptide VIIc × 2 （P00430） Cytochrome c oxidase polypeptide VIII-heart × 2 （P10175） COPPER (II) ION × 2 MAGNESIUM ION × 2 SODIUM ION × 2 HEME-A × 4 TRISTEAROYLGLYCEROL × 6 (1R)-2-{[{[(2S)-2,3-DIHYDROXYPROPYL]OXY}(HYDROXY)PHOSPHORYL]OXY}-1-[(PALMITOYLOXY)METHYL]ETHYL (11E)-OCTADEC-11-ENOATE × 8 DINUCLEAR COPPER ION × 2 (7R,17E,20E)-4-HYDROXY-N,N,N-TRIMETHYL-9-OXO-7-[(PALMITOYLOXY)METHYL]-3,5,8-TRIOXA-4-PHOSPHAHEXACOSA-17,20-DIEN-1-AMINIUM 4-OXIDE × 2 CHOLIC ACID × 8 DECYL-BETA-D-MALTOPYRANOSIDE × 4 ZINC ION × 4 (1S)-2-{[(2-AMINOETHOXY)(HYDROXY)PHOSPHORYL]OXY}-1-[(STEAROYLOXY)METHYL]ETHYL (5E,8E,11E,14E)-ICOSA-5,8,11,14-TETRAENOATE × 6 CARDIOLIPIN × 4 water × 26	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	COX5B_BOVIN
Isoform	—
PDB实体	6
链与序列区间	作者链 F； PDB构建体 1–98； UniProt 32–129 作者链 S； PDB构建体 1–98； UniProt 32–129

Cytochrome c oxidase polypeptide VIa-heart

物种未注明

UniProt P07471

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 26	Cytochrome c oxidase subunit 1 × 2 （P00396） Cytochrome c oxidase subunit 2 × 2 （P68530） Cytochrome c oxidase subunit 3 × 2 （P00415） Cytochrome c oxidase subunit 4 isoform 1 × 2 （P00423） Cytochrome c oxidase polypeptide Va × 2 （P00426） Cytochrome c oxidase polypeptide Vb × 2 （P00428） Cytochrome c oxidase subunit VIb isoform 1 × 2 （P00429） Cytochrome c oxidase polypeptide VIc × 2 （P04038） Cytochrome c oxidase polypeptide VIIa-heart × 2 （P07470） Cytochrome c oxidase polypeptide VIIb × 2 （P13183） Cytochrome c oxidase polypeptide VIIc × 2 （P00430） Cytochrome c oxidase polypeptide VIII-heart × 2 （P10175） COPPER (II) ION × 2 MAGNESIUM ION × 2 SODIUM ION × 2 HEME-A × 4 TRISTEAROYLGLYCEROL × 6 (1R)-2-{[{[(2S)-2,3-DIHYDROXYPROPYL]OXY}(HYDROXY)PHOSPHORYL]OXY}-1-[(PALMITOYLOXY)METHYL]ETHYL (11E)-OCTADEC-11-ENOATE × 8 DINUCLEAR COPPER ION × 2 (7R,17E,20E)-4-HYDROXY-N,N,N-TRIMETHYL-9-OXO-7-[(PALMITOYLOXY)METHYL]-3,5,8-TRIOXA-4-PHOSPHAHEXACOSA-17,20-DIEN-1-AMINIUM 4-OXIDE × 2 CHOLIC ACID × 8 DECYL-BETA-D-MALTOPYRANOSIDE × 4 ZINC ION × 4 (1S)-2-{[(2-AMINOETHOXY)(HYDROXY)PHOSPHORYL]OXY}-1-[(STEAROYLOXY)METHYL]ETHYL (5E,8E,11E,14E)-ICOSA-5,8,11,14-TETRAENOATE × 6 CARDIOLIPIN × 4 water × 26	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	CX6A2_BOVIN
Isoform	—
PDB实体	7
链与序列区间	作者链 G； PDB构建体 1–85； UniProt 13–97 作者链 T； PDB构建体 1–85； UniProt 13–97

Cytochrome c oxidase subunit VIb isoform 1

物种未注明

UniProt P00429

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 26	Cytochrome c oxidase subunit 1 × 2 （P00396） Cytochrome c oxidase subunit 2 × 2 （P68530） Cytochrome c oxidase subunit 3 × 2 （P00415） Cytochrome c oxidase subunit 4 isoform 1 × 2 （P00423） Cytochrome c oxidase polypeptide Va × 2 （P00426） Cytochrome c oxidase polypeptide Vb × 2 （P00428） Cytochrome c oxidase polypeptide VIa-heart × 2 （P07471） Cytochrome c oxidase polypeptide VIc × 2 （P04038） Cytochrome c oxidase polypeptide VIIa-heart × 2 （P07470） Cytochrome c oxidase polypeptide VIIb × 2 （P13183） Cytochrome c oxidase polypeptide VIIc × 2 （P00430） Cytochrome c oxidase polypeptide VIII-heart × 2 （P10175） COPPER (II) ION × 2 MAGNESIUM ION × 2 SODIUM ION × 2 HEME-A × 4 TRISTEAROYLGLYCEROL × 6 (1R)-2-{[{[(2S)-2,3-DIHYDROXYPROPYL]OXY}(HYDROXY)PHOSPHORYL]OXY}-1-[(PALMITOYLOXY)METHYL]ETHYL (11E)-OCTADEC-11-ENOATE × 8 DINUCLEAR COPPER ION × 2 (7R,17E,20E)-4-HYDROXY-N,N,N-TRIMETHYL-9-OXO-7-[(PALMITOYLOXY)METHYL]-3,5,8-TRIOXA-4-PHOSPHAHEXACOSA-17,20-DIEN-1-AMINIUM 4-OXIDE × 2 CHOLIC ACID × 8 DECYL-BETA-D-MALTOPYRANOSIDE × 4 ZINC ION × 4 (1S)-2-{[(2-AMINOETHOXY)(HYDROXY)PHOSPHORYL]OXY}-1-[(STEAROYLOXY)METHYL]ETHYL (5E,8E,11E,14E)-ICOSA-5,8,11,14-TETRAENOATE × 6 CARDIOLIPIN × 4 water × 26	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	CX6B1_BOVIN
Isoform	—
PDB实体	8
链与序列区间	作者链 H； PDB构建体 1–85； UniProt 2–86 作者链 U； PDB构建体 1–85； UniProt 2–86

Cytochrome c oxidase polypeptide VIc

物种未注明

UniProt P04038

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 26	Cytochrome c oxidase subunit 1 × 2 （P00396） Cytochrome c oxidase subunit 2 × 2 （P68530） Cytochrome c oxidase subunit 3 × 2 （P00415） Cytochrome c oxidase subunit 4 isoform 1 × 2 （P00423） Cytochrome c oxidase polypeptide Va × 2 （P00426） Cytochrome c oxidase polypeptide Vb × 2 （P00428） Cytochrome c oxidase polypeptide VIa-heart × 2 （P07471） Cytochrome c oxidase subunit VIb isoform 1 × 2 （P00429） Cytochrome c oxidase polypeptide VIIa-heart × 2 （P07470） Cytochrome c oxidase polypeptide VIIb × 2 （P13183） Cytochrome c oxidase polypeptide VIIc × 2 （P00430） Cytochrome c oxidase polypeptide VIII-heart × 2 （P10175） COPPER (II) ION × 2 MAGNESIUM ION × 2 SODIUM ION × 2 HEME-A × 4 TRISTEAROYLGLYCEROL × 6 (1R)-2-{[{[(2S)-2,3-DIHYDROXYPROPYL]OXY}(HYDROXY)PHOSPHORYL]OXY}-1-[(PALMITOYLOXY)METHYL]ETHYL (11E)-OCTADEC-11-ENOATE × 8 DINUCLEAR COPPER ION × 2 (7R,17E,20E)-4-HYDROXY-N,N,N-TRIMETHYL-9-OXO-7-[(PALMITOYLOXY)METHYL]-3,5,8-TRIOXA-4-PHOSPHAHEXACOSA-17,20-DIEN-1-AMINIUM 4-OXIDE × 2 CHOLIC ACID × 8 DECYL-BETA-D-MALTOPYRANOSIDE × 4 ZINC ION × 4 (1S)-2-{[(2-AMINOETHOXY)(HYDROXY)PHOSPHORYL]OXY}-1-[(STEAROYLOXY)METHYL]ETHYL (5E,8E,11E,14E)-ICOSA-5,8,11,14-TETRAENOATE × 6 CARDIOLIPIN × 4 water × 26	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	COX6C_BOVIN
Isoform	—
PDB实体	9
链与序列区间	作者链 I； PDB构建体 1–73； UniProt 1–73 作者链 V； PDB构建体 1–73； UniProt 1–73

Cytochrome c oxidase polypeptide VIIa-heart

物种未注明

UniProt P07470

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 26	Cytochrome c oxidase subunit 1 × 2 （P00396） Cytochrome c oxidase subunit 2 × 2 （P68530） Cytochrome c oxidase subunit 3 × 2 （P00415） Cytochrome c oxidase subunit 4 isoform 1 × 2 （P00423） Cytochrome c oxidase polypeptide Va × 2 （P00426） Cytochrome c oxidase polypeptide Vb × 2 （P00428） Cytochrome c oxidase polypeptide VIa-heart × 2 （P07471） Cytochrome c oxidase subunit VIb isoform 1 × 2 （P00429） Cytochrome c oxidase polypeptide VIc × 2 （P04038） Cytochrome c oxidase polypeptide VIIb × 2 （P13183） Cytochrome c oxidase polypeptide VIIc × 2 （P00430） Cytochrome c oxidase polypeptide VIII-heart × 2 （P10175） COPPER (II) ION × 2 MAGNESIUM ION × 2 SODIUM ION × 2 HEME-A × 4 TRISTEAROYLGLYCEROL × 6 (1R)-2-{[{[(2S)-2,3-DIHYDROXYPROPYL]OXY}(HYDROXY)PHOSPHORYL]OXY}-1-[(PALMITOYLOXY)METHYL]ETHYL (11E)-OCTADEC-11-ENOATE × 8 DINUCLEAR COPPER ION × 2 (7R,17E,20E)-4-HYDROXY-N,N,N-TRIMETHYL-9-OXO-7-[(PALMITOYLOXY)METHYL]-3,5,8-TRIOXA-4-PHOSPHAHEXACOSA-17,20-DIEN-1-AMINIUM 4-OXIDE × 2 CHOLIC ACID × 8 DECYL-BETA-D-MALTOPYRANOSIDE × 4 ZINC ION × 4 (1S)-2-{[(2-AMINOETHOXY)(HYDROXY)PHOSPHORYL]OXY}-1-[(STEAROYLOXY)METHYL]ETHYL (5E,8E,11E,14E)-ICOSA-5,8,11,14-TETRAENOATE × 6 CARDIOLIPIN × 4 water × 26	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	CX7A1_BOVIN
Isoform	—
PDB实体	10
链与序列区间	作者链 J； PDB构建体 1–59； UniProt 22–80 作者链 W； PDB构建体 1–59； UniProt 22–80

Cytochrome c oxidase polypeptide VIIb

物种未注明

UniProt P13183

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 26	Cytochrome c oxidase subunit 1 × 2 （P00396） Cytochrome c oxidase subunit 2 × 2 （P68530） Cytochrome c oxidase subunit 3 × 2 （P00415） Cytochrome c oxidase subunit 4 isoform 1 × 2 （P00423） Cytochrome c oxidase polypeptide Va × 2 （P00426） Cytochrome c oxidase polypeptide Vb × 2 （P00428） Cytochrome c oxidase polypeptide VIa-heart × 2 （P07471） Cytochrome c oxidase subunit VIb isoform 1 × 2 （P00429） Cytochrome c oxidase polypeptide VIc × 2 （P04038） Cytochrome c oxidase polypeptide VIIa-heart × 2 （P07470） Cytochrome c oxidase polypeptide VIIc × 2 （P00430） Cytochrome c oxidase polypeptide VIII-heart × 2 （P10175） COPPER (II) ION × 2 MAGNESIUM ION × 2 SODIUM ION × 2 HEME-A × 4 TRISTEAROYLGLYCEROL × 6 (1R)-2-{[{[(2S)-2,3-DIHYDROXYPROPYL]OXY}(HYDROXY)PHOSPHORYL]OXY}-1-[(PALMITOYLOXY)METHYL]ETHYL (11E)-OCTADEC-11-ENOATE × 8 DINUCLEAR COPPER ION × 2 (7R,17E,20E)-4-HYDROXY-N,N,N-TRIMETHYL-9-OXO-7-[(PALMITOYLOXY)METHYL]-3,5,8-TRIOXA-4-PHOSPHAHEXACOSA-17,20-DIEN-1-AMINIUM 4-OXIDE × 2 CHOLIC ACID × 8 DECYL-BETA-D-MALTOPYRANOSIDE × 4 ZINC ION × 4 (1S)-2-{[(2-AMINOETHOXY)(HYDROXY)PHOSPHORYL]OXY}-1-[(STEAROYLOXY)METHYL]ETHYL (5E,8E,11E,14E)-ICOSA-5,8,11,14-TETRAENOATE × 6 CARDIOLIPIN × 4 water × 26	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	COX7B_BOVIN
Isoform	—
PDB实体	11
链与序列区间	作者链 K； PDB构建体 1–56； UniProt 25–80 作者链 X； PDB构建体 1–56； UniProt 25–80

Cytochrome c oxidase polypeptide VIIc

物种未注明

UniProt P00430

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 26	Cytochrome c oxidase subunit 1 × 2 （P00396） Cytochrome c oxidase subunit 2 × 2 （P68530） Cytochrome c oxidase subunit 3 × 2 （P00415） Cytochrome c oxidase subunit 4 isoform 1 × 2 （P00423） Cytochrome c oxidase polypeptide Va × 2 （P00426） Cytochrome c oxidase polypeptide Vb × 2 （P00428） Cytochrome c oxidase polypeptide VIa-heart × 2 （P07471） Cytochrome c oxidase subunit VIb isoform 1 × 2 （P00429） Cytochrome c oxidase polypeptide VIc × 2 （P04038） Cytochrome c oxidase polypeptide VIIa-heart × 2 （P07470） Cytochrome c oxidase polypeptide VIIb × 2 （P13183） Cytochrome c oxidase polypeptide VIII-heart × 2 （P10175） COPPER (II) ION × 2 MAGNESIUM ION × 2 SODIUM ION × 2 HEME-A × 4 TRISTEAROYLGLYCEROL × 6 (1R)-2-{[{[(2S)-2,3-DIHYDROXYPROPYL]OXY}(HYDROXY)PHOSPHORYL]OXY}-1-[(PALMITOYLOXY)METHYL]ETHYL (11E)-OCTADEC-11-ENOATE × 8 DINUCLEAR COPPER ION × 2 (7R,17E,20E)-4-HYDROXY-N,N,N-TRIMETHYL-9-OXO-7-[(PALMITOYLOXY)METHYL]-3,5,8-TRIOXA-4-PHOSPHAHEXACOSA-17,20-DIEN-1-AMINIUM 4-OXIDE × 2 CHOLIC ACID × 8 DECYL-BETA-D-MALTOPYRANOSIDE × 4 ZINC ION × 4 (1S)-2-{[(2-AMINOETHOXY)(HYDROXY)PHOSPHORYL]OXY}-1-[(STEAROYLOXY)METHYL]ETHYL (5E,8E,11E,14E)-ICOSA-5,8,11,14-TETRAENOATE × 6 CARDIOLIPIN × 4 water × 26	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	COX7C_BOVIN
Isoform	—
PDB实体	12
链与序列区间	作者链 L； PDB构建体 1–47； UniProt 17–63 作者链 Y； PDB构建体 1–47； UniProt 17–63

Cytochrome c oxidase polypeptide VIII-heart

物种未注明

UniProt P10175

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 26	Cytochrome c oxidase subunit 1 × 2 （P00396） Cytochrome c oxidase subunit 2 × 2 （P68530） Cytochrome c oxidase subunit 3 × 2 （P00415） Cytochrome c oxidase subunit 4 isoform 1 × 2 （P00423） Cytochrome c oxidase polypeptide Va × 2 （P00426） Cytochrome c oxidase polypeptide Vb × 2 （P00428） Cytochrome c oxidase polypeptide VIa-heart × 2 （P07471） Cytochrome c oxidase subunit VIb isoform 1 × 2 （P00429） Cytochrome c oxidase polypeptide VIc × 2 （P04038） Cytochrome c oxidase polypeptide VIIa-heart × 2 （P07470） Cytochrome c oxidase polypeptide VIIb × 2 （P13183） Cytochrome c oxidase polypeptide VIIc × 2 （P00430） COPPER (II) ION × 2 MAGNESIUM ION × 2 SODIUM ION × 2 HEME-A × 4 TRISTEAROYLGLYCEROL × 6 (1R)-2-{[{[(2S)-2,3-DIHYDROXYPROPYL]OXY}(HYDROXY)PHOSPHORYL]OXY}-1-[(PALMITOYLOXY)METHYL]ETHYL (11E)-OCTADEC-11-ENOATE × 8 DINUCLEAR COPPER ION × 2 (7R,17E,20E)-4-HYDROXY-N,N,N-TRIMETHYL-9-OXO-7-[(PALMITOYLOXY)METHYL]-3,5,8-TRIOXA-4-PHOSPHAHEXACOSA-17,20-DIEN-1-AMINIUM 4-OXIDE × 2 CHOLIC ACID × 8 DECYL-BETA-D-MALTOPYRANOSIDE × 4 ZINC ION × 4 (1S)-2-{[(2-AMINOETHOXY)(HYDROXY)PHOSPHORYL]OXY}-1-[(STEAROYLOXY)METHYL]ETHYL (5E,8E,11E,14E)-ICOSA-5,8,11,14-TETRAENOATE × 6 CARDIOLIPIN × 4 water × 26	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	COX81_BOVIN
Isoform	—
PDB实体	13
链与序列区间	作者链 M； PDB构建体 1–46； UniProt 25–70 作者链 Z； PDB构建体 1–46； UniProt 25–70

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	2eij
沉积日期 deposition_date	2007-03-13
结构标题 title	Bovine heart cytochrome C oxidase in the fully reduced state
关键词 keywords	OXIDOREDUCTASE; OXIDOREDUCTASE
实验方法 method	X-RAY DIFFRACTION

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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

2eij__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

2eij__assembly_1__model_1 | I(q)

100 个绘图点；横轴和纵轴均采用对数尺度。

2eij__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。

Rg（Guinier）	50.68 Å
Rg（电子密度）	49.81 Å
总 Rg	50.02 Å
原子数	30732
残基数	3550
排除体积	563570 Å³
最大 q	0.500 Å⁻¹

Assembly	Model	结构单元	聚集说明	状态	CRYSOL	操作
1	1	`2eij__assembly_1__model_1`	26-meric （26）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载

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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (27)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	Cytochrome c oxidase subunit 1
分子量 formula_weight	57093.9 kDa
EC 编号 ec_number	1.9.3.1
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A,N
原子数 atom_count	32488

MFINRWLFSTNHKDIGTLYLLFGAWAGMVGTALSLLIRAELGQPGTLLGDDQIYNVVVTAHAFVMIFFMVMPIMIGGFGNWLVPLMIGAPDMAFPRMNNMSFWLLPPSFLLLLASSMVEAGAGTGWTVYPPLAGNLAHAGASVDLTIFSLHLAGVSSILGAINFITTIINMKPPAMSQYQTPLFVWSVMITAVLLLLSLPVLAAGITMLLTDRNLNTTFFDPAGGGDPILYQHLFWFFGHPEVYILILPGFGMISHIVTYYSGKKEPFGYMGMVWAMMSIGFLGFIVWAHHMFTVGMDVDTRAYFTSATMIIAIPTGVKVFSWLATLHGGNIKWSPAMMWALGFIFLFTVGGLTGIVLANSSLDIVLHDTYYVVAHFHYVLSMGAVFAIMGGFVHWFPLFSGYTLNDTWAKIHFAIMFVGVNMTFFPQHFLGLSGMPRRYSDYPDAYTMWNTISSMGSFISLTAVMLMVFIIWEAFASKREVLTVDLTTTNLEWLNGCPPPYHTFEEPTYVNLK

实体 2 Entity 2 polymer

描述 description	Cytochrome c oxidase subunit 2
分子量 formula_weight	26068.4 kDa
EC 编号 ec_number	1.9.3.1
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	B,O

MAYPMQLGFQDATSPIMEELLHFHDHTLMIVFLISSLVLYIISLMLTTKLTHTSTMDAQEVETIWTILPAIILILIALPSLRILYMMDEINNPSLTVKTMGHQWYWSYEYTDYEDLSFDSYMIPTSELKPGELRLLEVDNRVVLPMEMTIRMLVSSEDVLHSWAVPSLGLKTDAIPGRLNQTTLMSSRPGLYYGQCSEICGSNHSFMPIVLELVPLKYFEKWSASML

实体 3 Entity 3 polymer

描述 description	Cytochrome c oxidase subunit 3
分子量 formula_weight	29957.6 kDa
EC 编号 ec_number	1.9.3.1
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	C,P

MTHQTHAYHMVNPSPWPLTGALSALLMTSGLTMWFHFNSMTLLMIGLTTNMLTMYQWWRDVIRESTFQGHHTPAVQKGLRYGMILFIISEVLFFTGFFWAFYHSSLAPTPELGGCWPPTGIHPLNPLEVPLLNTSVLLASGVSITWAHHSLMEGDRKHMLQALFITITLGVYFTLLQASEYYEAPFTISDGVYGSTFFVATGFHGLHVIIGSTFLIVCFFRQLKFHFTSNHHFGFEAAAWYWHFVDVVWLFLYVSIYWWGS

实体 4 Entity 4 polymer

描述 description	Cytochrome c oxidase subunit 4 isoform 1
分子量 formula_weight	17179.6 kDa
EC 编号 ec_number	1.9.3.1
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	D,Q

AHGSVVKSEDYALPSYVDRRDYPLPDVAHVKNLSASQKALKEKEKASWSSLSIDEKVELYRLKFKESFAEMNRSTNEWKTVVGAAMFFIGFTALLLIWEKHYVYGPIPHTFEEEWVAKQTKRMLDMKVAPIQGFSAKWDYDKNEWKK

实体 5 Entity 5 polymer

描述 description	Cytochrome c oxidase polypeptide Va
分子量 formula_weight	12453.1 kDa
EC 编号 ec_number	1.9.3.1
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	E,R

SHGSHETDEEFDARWVTYFNKPDIDAWELRKGMNTLVGYDLVPEPKIIDAALRACRRLNDFASAVRILEVVKDKAGPHKEIYPYVIQELRPTLNELGISTPEELGLDKV

实体 6 Entity 6 polymer

描述 description	Cytochrome c oxidase polypeptide Vb
分子量 formula_weight	10684.0 kDa
EC 编号 ec_number	1.9.3.1
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	F,S

ASGGGVPTDEEQATGLEREVMLAARKGQDPYNILAPKATSGTKEDPNLVPSITNKRIVGCICEEDNSTVIWFWLHKGEAQRCPSCGTHYKLVPHQLAH

实体 7 Entity 7 polymer

描述 description	Cytochrome c oxidase polypeptide VIa-heart
分子量 formula_weight	9629.8 kDa
EC 编号 ec_number	1.9.3.1
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	G,T

ASAAKGDHGGTGARTWRFLTFGLALPSVALCTLNSWLHSGHRERPAFIPYHHLRIRTKPFSWGDGNHTFFHNPRVNPLPTGYEKP

实体 8 Entity 8 polymer

描述 description	Cytochrome c oxidase subunit VIb isoform 1
分子量 formula_weight	10039.2 kDa
EC 编号 ec_number	1.9.3.1
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	H,U

AEDIQAKIKNYQTAPFDSRFPNQNQTRNCWQNYLDFHRCEKAMTAKGGDVSVCEWYRRVYKSLCPISWVSTWDDRRAEGTFPGKI

实体 9 Entity 9 polymer

描述 description	Cytochrome c oxidase polypeptide VIc
分子量 formula_weight	8537.0 kDa
EC 编号 ec_number	1.9.3.1
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	I,V

STALAKPQMRGLLARRLRFHIVGAFMVSLGFATFYKFAVAEKRKKAYADFYRNYDSMKDFEEMRKAGIFQSAK

实体 10 Entity 10 polymer

描述 description	Cytochrome c oxidase polypeptide VIIa-heart
分子量 formula_weight	6682.7 kDa
EC 编号 ec_number	1.9.3.1
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	J,W

FENRVAEKQKLFQEDNGLPVHLKGGATDNILYRVTMTLCLGGTLYSLYCLGWASFPHKK

实体 11 Entity 11 polymer

描述 description	Cytochrome c oxidase polypeptide VIIb
分子量 formula_weight	6365.2 kDa
EC 编号 ec_number	1.9.3.1
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	K,X

IHQKRAPDFHDKYGNAVLASGATFCVAVWVYMATQIGIEWNPSPVGRVTPKEWREQ

实体 12 Entity 12 polymer

描述 description	Cytochrome c oxidase polypeptide VIIc
分子量 formula_weight	5449.4 kDa
EC 编号 ec_number	1.9.3.1
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	L,Y

SHYEEGPGKNIPFSVENKWRLLAMMTLFFGSGFAAPFFIVRHQLLKK

实体 13 Entity 13 polymer

描述 description	Cytochrome c oxidase polypeptide VIII-heart
分子量 formula_weight	4967.8 kDa
EC 编号 ec_number	1.9.3.1
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	M,Z

ITAKPAKTPTSPKEQAIGLSVTFLSFLLPAGWVLYHLDNYKKSSAA

实体 14 Entity 14 non-polymer

描述 description	COPPER (II) ION
分子量 formula_weight	63.5 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	2

实体 15 Entity 15 non-polymer

描述 description	MAGNESIUM ION
分子量 formula_weight	24.3 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	2

实体 16 Entity 16 non-polymer

描述 description	SODIUM ION
分子量 formula_weight	23.0 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	2

实体 17 Entity 17 non-polymer

描述 description	HEME-A
分子量 formula_weight	852.8 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	4

实体 18 Entity 18 non-polymer

描述 description	TRISTEAROYLGLYCEROL
分子量 formula_weight	891.5 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	6

实体 19 Entity 19 non-polymer

描述 description	(1R)-2-{[{[(2S)-2,3-DIHYDROXYPROPYL]OXY}(HYDROXY)PHOSPHORYL]OXY}-1-[(PALMITOYLOXY)METHYL]ETHYL (11E)-OCTADEC-11-ENOATE
分子量 formula_weight	749.0 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	8

实体 20 Entity 20 non-polymer

描述 description	DINUCLEAR COPPER ION
分子量 formula_weight	127.1 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	2

实体 21 Entity 21 non-polymer

描述 description	(7R,17E,20E)-4-HYDROXY-N,N,N-TRIMETHYL-9-OXO-7-[(PALMITOYLOXY)METHYL]-3,5,8-TRIOXA-4-PHOSPHAHEXACOSA-17,20-DIEN-1-AMINIUM 4-OXIDE
分子量 formula_weight	759.1 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	2

实体 22 Entity 22 non-polymer

描述 description	CHOLIC ACID
分子量 formula_weight	408.6 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	8

实体 23 Entity 23 non-polymer

描述 description	DECYL-BETA-D-MALTOPYRANOSIDE
分子量 formula_weight	482.6 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	4

实体 24 Entity 24 non-polymer

描述 description	ZINC ION
分子量 formula_weight	65.4 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	4

实体 25 Entity 25 non-polymer

描述 description	(1S)-2-{[(2-AMINOETHOXY)(HYDROXY)PHOSPHORYL]OXY}-1-[(STEAROYLOXY)METHYL]ETHYL (5E,8E,11E,14E)-ICOSA-5,8,11,14-TETRAENOATE
分子量 formula_weight	768.1 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	6

实体 26 Entity 26 non-polymer

描述 description	CARDIOLIPIN
分子量 formula_weight	1464.0 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	4

实体 27 Entity 27 water

描述 description	water
分子量 formula_weight	18.0 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1756

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6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 58 domains

SCOP 2.08 (28 domains)

结构域编号 domain_id	d2eija_
类 Class class	f — Membrane and cell surface proteins and peptides
折叠类型 Fold fold	f.24 — Cytochrome c oxidase subunit I-like
超家族 Superfamily superfamily	f.24.1 — Cytochrome c oxidase subunit I-like
家族 Family family	f.24.1.1 — Cytochrome c oxidase subunit I-like

结构域编号 domain_id	d2eijb1
类 Class class	b — All beta proteins
折叠类型 Fold fold	b.6 — Cupredoxin-like
超家族 Superfamily superfamily	b.6.1 — Cupredoxins
家族 Family family	b.6.1.2 — Periplasmic domain of cytochrome c oxidase subunit II

结构域编号 domain_id	d2eijb2
类 Class class	f — Membrane and cell surface proteins and peptides
折叠类型 Fold fold	f.17 — Transmembrane helix hairpin
超家族 Superfamily superfamily	f.17.2 — Cytochrome c oxidase subunit II-like, transmembrane region
家族 Family family	f.17.2.1 — Cytochrome c oxidase subunit II-like, transmembrane region

结构域编号 domain_id	d2eijc_
类 Class class	f — Membrane and cell surface proteins and peptides
折叠类型 Fold fold	f.25 — Cytochrome c oxidase subunit III-like
超家族 Superfamily superfamily	f.25.1 — Cytochrome c oxidase subunit III-like
家族 Family family	f.25.1.1 — Cytochrome c oxidase subunit III-like

结构域编号 domain_id	d2eijd_
类 Class class	f — Membrane and cell surface proteins and peptides
折叠类型 Fold fold	f.23 — Single transmembrane helix
超家族 Superfamily superfamily	f.23.1 — Mitochondrial cytochrome c oxidase subunit IV
家族 Family family	f.23.1.1 — Mitochondrial cytochrome c oxidase subunit IV

结构域编号 domain_id	d2eije_
类 Class class	a — All alpha proteins
折叠类型 Fold fold	a.118 — alpha-alpha superhelix
超家族 Superfamily superfamily	a.118.11 — Cytochrome c oxidase subunit E
家族 Family family	a.118.11.1 — Cytochrome c oxidase subunit E

结构域编号 domain_id	d2eijf_
类 Class class	g — Small proteins
折叠类型 Fold fold	g.41 — Rubredoxin-like
超家族 Superfamily superfamily	g.41.5 — Rubredoxin-like
家族 Family family	g.41.5.3 — Cytochrome c oxidase Subunit F

结构域编号 domain_id	d2eijg_
类 Class class	f — Membrane and cell surface proteins and peptides
折叠类型 Fold fold	f.23 — Single transmembrane helix
超家族 Superfamily superfamily	f.23.2 — Mitochondrial cytochrome c oxidase subunit VIa
家族 Family family	f.23.2.1 — Mitochondrial cytochrome c oxidase subunit VIa

结构域编号 domain_id	d2eijh_
类 Class class	a — All alpha proteins
折叠类型 Fold fold	a.51 — Cytochrome c oxidase subunit h
超家族 Superfamily superfamily	a.51.1 — Cytochrome c oxidase subunit h
家族 Family family	a.51.1.1 — Cytochrome c oxidase subunit h

结构域编号 domain_id	d2eiji_
类 Class class	f — Membrane and cell surface proteins and peptides
折叠类型 Fold fold	f.23 — Single transmembrane helix
超家族 Superfamily superfamily	f.23.3 — Mitochondrial cytochrome c oxidase subunit VIc
家族 Family family	f.23.3.1 — Mitochondrial cytochrome c oxidase subunit VIc

结构域编号 domain_id	d2eijj_
类 Class class	f — Membrane and cell surface proteins and peptides
折叠类型 Fold fold	f.23 — Single transmembrane helix
超家族 Superfamily superfamily	f.23.4 — Mitochondrial cytochrome c oxidase subunit VIIa
家族 Family family	f.23.4.1 — Mitochondrial cytochrome c oxidase subunit VIIa

结构域编号 domain_id	d2eijk_
类 Class class	f — Membrane and cell surface proteins and peptides
折叠类型 Fold fold	f.23 — Single transmembrane helix
超家族 Superfamily superfamily	f.23.5 — Mitochondrial cytochrome c oxidase subunit VIIb
家族 Family family	f.23.5.1 — Mitochondrial cytochrome c oxidase subunit VIIb

结构域编号 domain_id	d2eijl_
类 Class class	f — Membrane and cell surface proteins and peptides
折叠类型 Fold fold	f.23 — Single transmembrane helix
超家族 Superfamily superfamily	f.23.6 — Mitochondrial cytochrome c oxidase subunit VIIc (aka VIIIa)
家族 Family family	f.23.6.1 — Mitochondrial cytochrome c oxidase subunit VIIc (aka VIIIa)

结构域编号 domain_id	d2eijm_
类 Class class	f — Membrane and cell surface proteins and peptides
折叠类型 Fold fold	f.23 — Single transmembrane helix
超家族 Superfamily superfamily	f.23.7 — Mitochondrial cytochrome c oxidase subunit VIIIb (aka IX)
家族 Family family	f.23.7.1 — Mitochondrial cytochrome c oxidase subunit VIIIb (aka IX)

结构域编号 domain_id	d2eijn_
类 Class class	f — Membrane and cell surface proteins and peptides
折叠类型 Fold fold	f.24 — Cytochrome c oxidase subunit I-like
超家族 Superfamily superfamily	f.24.1 — Cytochrome c oxidase subunit I-like
家族 Family family	f.24.1.1 — Cytochrome c oxidase subunit I-like

结构域编号 domain_id	d2eijo1
类 Class class	b — All beta proteins
折叠类型 Fold fold	b.6 — Cupredoxin-like
超家族 Superfamily superfamily	b.6.1 — Cupredoxins
家族 Family family	b.6.1.2 — Periplasmic domain of cytochrome c oxidase subunit II

结构域编号 domain_id	d2eijo2
类 Class class	f — Membrane and cell surface proteins and peptides
折叠类型 Fold fold	f.17 — Transmembrane helix hairpin
超家族 Superfamily superfamily	f.17.2 — Cytochrome c oxidase subunit II-like, transmembrane region
家族 Family family	f.17.2.1 — Cytochrome c oxidase subunit II-like, transmembrane region

结构域编号 domain_id	d2eijp_
类 Class class	f — Membrane and cell surface proteins and peptides
折叠类型 Fold fold	f.25 — Cytochrome c oxidase subunit III-like
超家族 Superfamily superfamily	f.25.1 — Cytochrome c oxidase subunit III-like
家族 Family family	f.25.1.1 — Cytochrome c oxidase subunit III-like

结构域编号 domain_id	d2eijq_
类 Class class	f — Membrane and cell surface proteins and peptides
折叠类型 Fold fold	f.23 — Single transmembrane helix
超家族 Superfamily superfamily	f.23.1 — Mitochondrial cytochrome c oxidase subunit IV
家族 Family family	f.23.1.1 — Mitochondrial cytochrome c oxidase subunit IV

结构域编号 domain_id	d2eijr_
类 Class class	a — All alpha proteins
折叠类型 Fold fold	a.118 — alpha-alpha superhelix
超家族 Superfamily superfamily	a.118.11 — Cytochrome c oxidase subunit E
家族 Family family	a.118.11.1 — Cytochrome c oxidase subunit E

结构域编号 domain_id	d2eijs_
类 Class class	g — Small proteins
折叠类型 Fold fold	g.41 — Rubredoxin-like
超家族 Superfamily superfamily	g.41.5 — Rubredoxin-like
家族 Family family	g.41.5.3 — Cytochrome c oxidase Subunit F

结构域编号 domain_id	d2eijt_
类 Class class	f — Membrane and cell surface proteins and peptides
折叠类型 Fold fold	f.23 — Single transmembrane helix
超家族 Superfamily superfamily	f.23.2 — Mitochondrial cytochrome c oxidase subunit VIa
家族 Family family	f.23.2.1 — Mitochondrial cytochrome c oxidase subunit VIa

结构域编号 domain_id	d2eiju_
类 Class class	a — All alpha proteins
折叠类型 Fold fold	a.51 — Cytochrome c oxidase subunit h
超家族 Superfamily superfamily	a.51.1 — Cytochrome c oxidase subunit h
家族 Family family	a.51.1.1 — Cytochrome c oxidase subunit h

结构域编号 domain_id	d2eijv_
类 Class class	f — Membrane and cell surface proteins and peptides
折叠类型 Fold fold	f.23 — Single transmembrane helix
超家族 Superfamily superfamily	f.23.3 — Mitochondrial cytochrome c oxidase subunit VIc
家族 Family family	f.23.3.1 — Mitochondrial cytochrome c oxidase subunit VIc

结构域编号 domain_id	d2eijw_
类 Class class	f — Membrane and cell surface proteins and peptides
折叠类型 Fold fold	f.23 — Single transmembrane helix
超家族 Superfamily superfamily	f.23.4 — Mitochondrial cytochrome c oxidase subunit VIIa
家族 Family family	f.23.4.1 — Mitochondrial cytochrome c oxidase subunit VIIa

结构域编号 domain_id	d2eijx_
类 Class class	f — Membrane and cell surface proteins and peptides
折叠类型 Fold fold	f.23 — Single transmembrane helix
超家族 Superfamily superfamily	f.23.5 — Mitochondrial cytochrome c oxidase subunit VIIb
家族 Family family	f.23.5.1 — Mitochondrial cytochrome c oxidase subunit VIIb

结构域编号 domain_id	d2eijy_
类 Class class	f — Membrane and cell surface proteins and peptides
折叠类型 Fold fold	f.23 — Single transmembrane helix
超家族 Superfamily superfamily	f.23.6 — Mitochondrial cytochrome c oxidase subunit VIIc (aka VIIIa)
家族 Family family	f.23.6.1 — Mitochondrial cytochrome c oxidase subunit VIIc (aka VIIIa)

结构域编号 domain_id	d2eijz_
类 Class class	f — Membrane and cell surface proteins and peptides
折叠类型 Fold fold	f.23 — Single transmembrane helix
超家族 Superfamily superfamily	f.23.7 — Mitochondrial cytochrome c oxidase subunit VIIIb (aka IX)
家族 Family family	f.23.7.1 — Mitochondrial cytochrome c oxidase subunit VIIIb (aka IX)

CATH v4.4 (30 domains)

结构域编号 domain_id	2eijA00
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	20 — Up-down Bundle
拓扑 Topology topology	210 — Cytochrome C Oxidase; Chain A
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Cytochrome c oxidase-like, subunit I domain

结构域编号 domain_id	2eijB01
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology	287 — Helix Hairpins
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	90 —

结构域编号 domain_id	2eijB02
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	60 — Sandwich
拓扑 Topology topology	40 — Immunoglobulin-like
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	420 — Cupredoxins - blue copper proteins

结构域编号 domain_id	2eijC01
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology	287 — Helix Hairpins
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	70 —

结构域编号 domain_id	2eijC02
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	20 — Up-down Bundle
拓扑 Topology topology	120 — Four Helix Bundle (Hemerythrin (Met), subunit A)
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	80 — Cytochrome c oxidase, subunit III, four-helix bundle

结构域编号 domain_id	2eijD00
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology	442 — Cytochrome C Oxidase; Chain D
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Cytochrome c oxidase subunit IV

结构域编号 domain_id	2eijE00
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	25 — Alpha Horseshoe
拓扑 Topology topology	40 — Serine Threonine Protein Phosphatase 5, Tetratricopeptide repeat
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	40 — Cytochrome c oxidase, subunit Va/VI

结构域编号 domain_id	2eijF00
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	60 — Sandwich
拓扑 Topology topology	11 — Cytochrome C Oxidase; Chain F
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Cytochrome c oxidase, subunit Vb

结构域编号 domain_id	2eijG00
类 Class class	4 — Few Secondary Structures
架构 Architecture architecture	10 — Irregular
拓扑 Topology topology	95 — Cytochrome C Oxidase; Chain G
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Cytochrome c oxidase, subunit VIa

结构域编号 domain_id	2eijH00
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology	10 — Arc Repressor Mutant, subunit A
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	140 — Cytochrome c oxidase, subunit VIb

结构域编号 domain_id	2eijI00
类 Class class	4 — Few Secondary Structures
架构 Architecture architecture	10 — Irregular
拓扑 Topology topology	93 — Cytochrome C Oxidase; Chain I
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Mitochondrial cytochrome c oxidase subunit VIc/VIIs

结构域编号 domain_id	2eijJ00
类 Class class	4 — Few Secondary Structures
架构 Architecture architecture	10 — Irregular
拓扑 Topology topology	91 — Cytochrome C Oxidase; Chain J
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Cytochrome c oxidase, subunit VIIa

结构域编号 domain_id	2eijK00
类 Class class	4 — Few Secondary Structures
架构 Architecture architecture	10 — Irregular
拓扑 Topology topology	51 — Cytochrome C Oxidase; Chain K
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Cytochrome C Oxidase, chain K

结构域编号 domain_id	2eijL00
类 Class class	4 — Few Secondary Structures
架构 Architecture architecture	10 — Irregular
拓扑 Topology topology	49 — Cytochrome C Oxidase; Chain L
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Cytochrome c oxidase subunit VIIc

结构域编号 domain_id	2eijM00
类 Class class	4 — Few Secondary Structures
架构 Architecture architecture	10 — Irregular
拓扑 Topology topology	81 — Cytochrome C Oxidase; Chain M
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Cytochrome c oxidase, subunit 8

结构域编号 domain_id	2eijN00
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	20 — Up-down Bundle
拓扑 Topology topology	210 — Cytochrome C Oxidase; Chain A
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Cytochrome c oxidase-like, subunit I domain

结构域编号 domain_id	2eijO01
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology	287 — Helix Hairpins
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	90 —

结构域编号 domain_id	2eijO02
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	60 — Sandwich
拓扑 Topology topology	40 — Immunoglobulin-like
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	420 — Cupredoxins - blue copper proteins

结构域编号 domain_id	2eijP01
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology	287 — Helix Hairpins
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	70 —

结构域编号 domain_id	2eijP02
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	20 — Up-down Bundle
拓扑 Topology topology	120 — Four Helix Bundle (Hemerythrin (Met), subunit A)
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	80 — Cytochrome c oxidase, subunit III, four-helix bundle

结构域编号 domain_id	2eijQ00
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology	442 — Cytochrome C Oxidase; Chain D
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Cytochrome c oxidase subunit IV

结构域编号 domain_id	2eijR00
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	25 — Alpha Horseshoe
拓扑 Topology topology	40 — Serine Threonine Protein Phosphatase 5, Tetratricopeptide repeat
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	40 — Cytochrome c oxidase, subunit Va/VI

结构域编号 domain_id	2eijS00
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	60 — Sandwich
拓扑 Topology topology	11 — Cytochrome C Oxidase; Chain F
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Cytochrome c oxidase, subunit Vb

结构域编号 domain_id	2eijT00
类 Class class	4 — Few Secondary Structures
架构 Architecture architecture	10 — Irregular
拓扑 Topology topology	95 — Cytochrome C Oxidase; Chain G
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Cytochrome c oxidase, subunit VIa

结构域编号 domain_id	2eijU00
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology	10 — Arc Repressor Mutant, subunit A
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	140 — Cytochrome c oxidase, subunit VIb

结构域编号 domain_id	2eijV00
类 Class class	4 — Few Secondary Structures
架构 Architecture architecture	10 — Irregular
拓扑 Topology topology	93 — Cytochrome C Oxidase; Chain I
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Mitochondrial cytochrome c oxidase subunit VIc/VIIs

结构域编号 domain_id	2eijW00
类 Class class	4 — Few Secondary Structures
架构 Architecture architecture	10 — Irregular
拓扑 Topology topology	91 — Cytochrome C Oxidase; Chain J
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Cytochrome c oxidase, subunit VIIa

结构域编号 domain_id	2eijX00
类 Class class	4 — Few Secondary Structures
架构 Architecture architecture	10 — Irregular
拓扑 Topology topology	51 — Cytochrome C Oxidase; Chain K
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Cytochrome C Oxidase, chain K

结构域编号 domain_id	2eijY00
类 Class class	4 — Few Secondary Structures
架构 Architecture architecture	10 — Irregular
拓扑 Topology topology	49 — Cytochrome C Oxidase; Chain L
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Cytochrome c oxidase subunit VIIc

结构域编号 domain_id	2eijZ00
类 Class class	4 — Few Secondary Structures
架构 Architecture architecture	10 — Irregular
拓扑 Topology topology	81 — Cytochrome C Oxidase; Chain M
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Cytochrome c oxidase, subunit 8

▶

晶胞边长 a length_a	183.060 Å
晶胞边长 b length_b	206.584 Å
晶胞边长 c length_c	178.298 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	90.00 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	90.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	8

空间群 space_group	P 21 21 21
空间群编号 int_tables_number	19
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	1.900 Å
最低分辨率 resolution_low	40.000 Å
R 因子 r_factor	—
R_work r_work	0.2060
R_free r_free	0.2340

Bovine heart cytochrome C oxidase in the fully reduced state

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Cytochrome c oxidase subunit 1

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Cytochrome c oxidase subunit 2

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Cytochrome c oxidase subunit 3

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Cytochrome c oxidase subunit 4 isoform 1

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Cytochrome c oxidase polypeptide Va

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Cytochrome c oxidase polypeptide Vb

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Cytochrome c oxidase polypeptide VIa-heart

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Cytochrome c oxidase subunit VIb isoform 1

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Cytochrome c oxidase polypeptide VIc

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Cytochrome c oxidase polypeptide VIIa-heart

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体