Protein YBL047C
Saccharomyces cerevisiae
当前结构中的状态
| Assembly | 物理组成 | 蛋白状态 | 分子拷贝数 | 共同组分 | 数据核对 |
|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 蛋白异源复合物 | 异源复合物 | 蛋白 2 | Ubiquitin × 1 （P61864） | 与蛋白数一致 |
数据库中的同蛋白其他状态
查看构建体与数据证据
| UniProt名称 | YBE7_YEAST |
| Isoform | — |
| PDB实体 | 1 |
| 链与序列区间 | 作者链 A； PDB构建体 1–43； UniProt 1339–1381 |
2g3q
Solution Structure of Ede1 UBA-ubiquitin complex
1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures
Ubiquitin
Saccharomyces cerevisiae
当前结构中的状态
| Assembly | 物理组成 | 蛋白状态 | 分子拷贝数 | 共同组分 | 数据核对 |
|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 蛋白异源复合物 | 异源复合物 | 蛋白 2 | Protein YBL047C × 1 （P34216） | 与蛋白数一致 |
数据库中的同蛋白其他状态
查看构建体与数据证据
| UniProt名称 | UBIQ_YEAST |
| Isoform | — |
| PDB实体 | 2 |
| 链与序列区间 | 作者链 B； PDB构建体 1–76； UniProt 1–76 |
页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。
2. 结构基本信息 2. Structure Basics
| 条目编号 entry_id | 2g3q |
| 沉积日期 deposition_date | 2006-02-20 |
| 结构标题 title | Solution Structure of Ede1 UBA-ubiquitin complex |
| 关键词 keywords | ;endocytosis, monoubiquitin signaling, solution structure, UBA domain, ubiquitin-binding motif, ENDOCYTOSIS-SIGNALING PROTEIN COMPLEX ;; ENDOCYTOSIS/SIGNALING PROTEIN |
| 实验方法 method | SOLUTION NMR |
3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles
页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。
2g3q__assembly_1__model_6
Assembly 1 · Model 6 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)
2g3q__assembly_1__model_6 | I(q)
2g3q__assembly_1__model_6 | P(r) · Pending
| Rg（Guinier） | 15.90 Å |
| Rg（电子密度） | 14.48 Å |
| 总 Rg | 15.59 Å |
| 原子数 | 1862 |
| 残基数 | 119 |
| 排除体积 | 16508 ų |
| 最大 q | 0.500 Å⁻¹ |
| Assembly | Model | 结构单元 | 聚集说明 | 状态 | CRYSOL | 操作 |
|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 1 | 2g3q__assembly_1__model_1 |
dimeric （2） | 成功 | 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) | 查看 下载 |
| 1 | 2 | 2g3q__assembly_1__model_2 |
dimeric （2） | 成功 | 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) | 查看 下载 |
| 1 | 3 | 2g3q__assembly_1__model_3 |
dimeric （2） | 成功 | 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) | 查看 下载 |
| 1 | 4 | 2g3q__assembly_1__model_4 |
dimeric （2） | 成功 | 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) | 查看 下载 |
| 1 | 5 | 2g3q__assembly_1__model_5 |
dimeric （2） | 成功 | 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) | 查看 下载 |
| 1 | 6 | 2g3q__assembly_1__model_6 |
dimeric （2） | 成功 | 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) | 查看 下载 |
| 1 | 7 | 2g3q__assembly_1__model_7 |
dimeric （2） | 成功 | 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) | 查看 下载 |
| 1 | 8 | 2g3q__assembly_1__model_8 |
dimeric （2） | 成功 | 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) | 查看 下载 |
| 1 | 9 | 2g3q__assembly_1__model_9 |
dimeric （2） | 成功 | 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) | 查看 下载 |
| 1 | 10 | 2g3q__assembly_1__model_10 |
dimeric （2） | 成功 | 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) | 查看 下载 |
| 1 | 11 | 2g3q__assembly_1__model_11 |
dimeric （2） | 成功 | 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) | 查看 下载 |
| 1 | 12 | 2g3q__assembly_1__model_12 |
dimeric （2） | 成功 | 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) | 查看 下载 |
| 1 | 13 | 2g3q__assembly_1__model_13 |
dimeric （2） | 成功 | 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) | 查看 下载 |
| 1 | 14 | 2g3q__assembly_1__model_14 |
dimeric （2） | 成功 | 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) | 查看 下载 |
| 1 | 15 | 2g3q__assembly_1__model_15 |
dimeric （2） | 成功 | 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) | 查看 下载 |
| 1 | 16 | 2g3q__assembly_1__model_16 |
dimeric （2） | 成功 | 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) | 查看 下载 |
| 1 | 17 | 2g3q__assembly_1__model_17 |
dimeric （2） | 成功 | 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) | 查看 下载 |
| 1 | 18 | 2g3q__assembly_1__model_18 |
dimeric （2） | 成功 | 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) | 查看 下载 |
| 1 | 19 | 2g3q__assembly_1__model_19 |
dimeric （2） | 成功 | 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) | 查看 下载 |
| 1 | 20 | 2g3q__assembly_1__model_20 |
dimeric （2） | 成功 | 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) | 查看 下载 |
4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment
5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (2)
6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 4 domains
SCOP 2.08 (2 domains)
| 结构域编号 domain_id | d2g3qa1 |
| 类 Class class | a — All alpha proteins |
| 折叠类型 Fold fold | a.5 — RuvA C-terminal domain-like |
| 超家族 Superfamily superfamily | a.5.2 — UBA-like |
| 家族 Family family | a.5.2.1 — UBA domain |
| 结构域编号 domain_id | d2g3qb_ |
| 类 Class class | d — Alpha and beta proteins (a+b) |
| 折叠类型 Fold fold | d.15 — beta-Grasp (ubiquitin-like) |
| 超家族 Superfamily superfamily | d.15.1 — Ubiquitin-like |
| 家族 Family family | d.15.1.1 — Ubiquitin-related |
CATH v4.4 (2 domains)
| 结构域编号 domain_id | 2g3qA00 |
| 类 Class class | 1 — Mainly Alpha |
| 架构 Architecture architecture | 10 — Orthogonal Bundle |
| 拓扑 Topology topology | 8 — Helicase, Ruva Protein; domain 3 |
| 同源超家族 H-superfamily homologous superfamily | 10 — Ubiquitin-associated (UBA) domain |
| 结构域编号 domain_id | 2g3qB00 |
| 类 Class class | 3 — Alpha Beta |
| 架构 Architecture architecture | 10 — Roll |
| 拓扑 Topology topology | 20 — Ubiquitin-like (UB roll) |
| 同源超家族 H-superfamily homologous superfamily | 90 — Phosphatidylinositol 3-kinase Catalytic Subunit; Chain A, domain 1 |