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2ga3

Structure of S102T E. coli Alkaline Phosphatase-phosphate intermediate at 2.20A resolution

Method: X-RAY DIFFRACTION Dmax: 99.3 Å Quality: GOOD
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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Alkaline phosphatase

Escherichia coli

UniProt P00634

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白同源多聚体 同源多聚体 蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白拷贝数一致 链 A； UniProt 23–471 链 B； UniProt 23–471 突变：S102(TPO) 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） ZN ZINC ION × 4 MG MAGNESIUM ION × 2 SO4 SULFATE ION × 2 X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；293 K；2.0M ammonium sulfate, 100mM Tris, 10mM magnesium chloride, 0.01mM zinc chloride, pH 9.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K 分辨率 2.20 Å R-free 0.229

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 2GA3 Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
1AJA THREE-DIMENSIONAL STRUCTURE OF THE D153G MUTANT OF E. COLI ALKALINE PHOSPHATASE: A MUTANT WITH WEAKER MAGNESIUM BINDING AND INCREASED CATALYTIC ACTIVITY 提交 1995-08-19 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 23–471（449 aa）
链 B 23–471（449 aa）
突变：D153G 突变：D153G 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 2.50 Å
1AJB THREE-DIMENSIONAL STRUCTURE OF THE D153G MUTANT OF E. COLI ALKALINE PHOSPHATASE: A MUTANT WITH WEAKER MAGNESIUM BINDING AND INCREASED CATALYTIC ACTIVITY 提交 1995-08-19 突变/修饰不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 23–471（449 aa）
链 B 23–471（449 aa）
突变：D153G 突变：D153G ZN ZINC ION × 4 MG MAGNESIUM ION × 2 SO4 SULFATE ION × 2 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 2.50 Å
1AJC THREE-DIMENSIONAL STRUCTURE OF THE D153G MUTANT OF E. COLI ALKALINE PHOSPHATASE: A MUTANT WITH WEAKER MAGNESIUM BINDING AND INCREASED CATALYTIC ACTIVITY 提交 1995-07-18 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 23–471（449 aa）
链 B 23–471（449 aa）
突变：D153G 突变：D153G ZN ZINC ION × 4 MG MAGNESIUM ION × 2 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 2.50 Å
1AJD THREE-DIMENSIONAL STRUCTURE OF THE D153G MUTANT OF E. COLI ALKALINE PHOSPHATASE: A MUTANT WITH WEAKER MAGNESIUM BINDING AND INCREASED CATALYTIC ACTIVITY 提交 1995-08-18 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 23–471（449 aa）
链 B 23–471（449 aa）
突变：D153G 突变：D153G ZN ZINC ION × 4 MG MAGNESIUM ION × 2 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 2.50 Å
1ALH KINETICS AND CRYSTAL STRUCTURE OF A MUTANT E. COLI ALKALINE PHOSPHATASE (ASP-369-->ASN): A MECHANISM INVOLVING ONE ZINC PER ACTIVE SITE 提交 1994-08-23 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 26–471（446 aa）
链 B 26–471（446 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 PO4 PHOSPHATE ION × 2 SO4 SULFATE ION × 2 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 2.50 Å
1ALI ALKALINE PHOSPHATASE MUTANT (H412N) 提交 1995-06-02 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 23–471（449 aa）
链 B 23–471（449 aa）
突变：H412N 突变：H412N ZN ZINC ION × 4 MG MAGNESIUM ION × 2 PO4 PHOSPHATE ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 THE STRUCTURE IS OF A MUTANT ALKALINE PHOSPHATE (H412N) IN WHICH HIS 412 IS REPLACED BY ASN, DETERMINED WITH CRYSTALS SOAKED IN STABILIZATION BUFFER CONTAINING 10 MM ZINC CHLORIDE. THERE ARE TWO ZINCS AND ONE MAGNESIUM COMPLEXED WITH AN INORGANIC PHOSPHATE BOUND IN EACH OF THE TWO ACTIVE SITES.
分辨率 2.20 Å
1ALJ ALKALINE PHOSPHATASE MUTANT (H412N) 提交 1995-06-02 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 23–471（449 aa）
链 B 23–471（449 aa）
突变：H412N 突变：H412N ZN ZINC ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 2 PO4 PHOSPHATE ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 THIS ENTRY IS A MUTANT ALKALINE PHOSPHATE (H412N) IN WHICH HIS 412 IS REPLACED BY ASN, DETERMINED WITH CRYSTALS SOAKED IN STABILIZATION BUFFER CONTAINING NO ADDED ZINC. THERE IS ONE ZINC AND ONE MAGNESIUM COMPLEXED WITH INORGANIC PHOSPHATE BOUND IN EACH OF THE TWO ACTIVE SITES.
分辨率 2.60 Å
1ALK REACTION MECHANISM OF ALKALINE PHOSPHATASE BASED ON CRYSTAL STRUCTURES. TWO METAL ION CATALYSIS 提交 1993-03-03 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 23–471（449 aa）
链 B 23–471（449 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 4 MG MAGNESIUM ION × 2 PO4 PHOSPHATE ION × 2 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 2.00 Å
1ANI ALKALINE PHOSPHATASE (D153H, K328H) 提交 1995-09-06 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 26–471（446 aa）
链 B 26–471（446 aa）
突变：D153H, K328H 突变：D153H, K328H ZN ZINC ION × 6 PO4 PHOSPHATE ION × 5 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 7.5；pH 7.5
分辨率 2.50 Å
1ANJ ALKALINE PHOSPHATASE (K328H) 提交 1995-09-06 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 26–471（446 aa）
链 B 26–471（446 aa）
突变：K328H 突变：K328H ZN ZINC ION × 6 PO4 PHOSPHATE ION × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 7.5；pH 7.5
分辨率 2.30 Å R-free 0.249
1B8J ALKALINE PHOSPHATASE COMPLEXED WITH VANADATE 提交 1999-02-01 突变/修饰不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 23–471（449 aa）
链 B 23–471（449 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） ZN ZINC ION × 4 SO4 SULFATE ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 7.5；CRYSTALLIZATION CONDITIONS: 65 % SATURATING (NH4)2SO4, 100 MM TRIS, 10 MM MGCL2, 1 MM ZNCL2, 0.1 MM NH4VO3, PH 7.5
分辨率 1.90 Å R-free 0.196
1ED8 STRUCTURE OF E. COLI ALKALINE PHOSPHATASE INHIBITED BY THE INORGANIC PHOSPHATE AT 1.75A RESOLUTION 提交 2000-01-27 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 23–471（449 aa）
链 B 23–471（449 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 MG MAGNESIUM ION × 2 PO4 PHOSPHATE ION × 2 SO4 SULFATE ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；298 K；Tris, ammonium sulfate, magnesium chloride, zinc chloride , pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298.0K
分辨率 1.75 Å R-free 0.228
1ED9 STRUCTURE OF E. COLI ALKALINE PHOSPHATASE WITHOUT THE INORGANIC PHOSPHATE AT 1.75A RESOLUTION 提交 2000-01-27 突变/修饰不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 23–471（449 aa）
链 B 23–471（449 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 4 MG MAGNESIUM ION × 2 SO4 SULFATE ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；298 K；Tris, ammonium sulfate, magnesium chloride, zinc chloride, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298.0K
分辨率 1.75 Å R-free 0.224
1ELX E. COLI ALKALINE PHOSPHATASE MUTANT (S102A) 提交 1998-02-10 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 23–471（449 aa）
链 B 23–471（449 aa）
突变：S102A 突变：S102A ZN ZINC ION × 4 MG MAGNESIUM ION × 2 PO4 PHOSPHATE ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 7.5；25 MG/ML PROTEIN IN 39% SATURATING (NH4)2SO4, 100 MM TRIS, 10 MM MGCL2 100 MM ZNCL2, 2 MM NAH2PO4 AT PH 7.5, EQUILIBRATED AGAINST 55% SATURATING (NH4)2SO4
分辨率 2.60 Å R-free 0.207
1ELY E. COLI ALKALINE PHOSPHATASE MUTANT (S102C) 提交 1998-02-10 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 23–471（449 aa）
链 B 23–471（449 aa）
突变：S102C 突变：S102C ZN ZINC ION × 4 MG MAGNESIUM ION × 2 PO4 PHOSPHATE ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 7.5；25 MG/ML PROTEIN IN 39% SATURATING (NH4)2SO4, 100 MM TRIS, 10 MM MGCL2 100 MM ZNCL2, 2 MM NAH2PO4 AT PH 7.5, EQUILIBRATED AGAINST 55% SATURATING (NH4)2SO4
分辨率 2.80 Å R-free 0.193
1ELZ E. COLI ALKALINE PHOSPHATASE MUTANT (S102G) 提交 1998-02-10 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 23–471（449 aa）
链 B 23–471（449 aa）
突变：S102G 突变：S102G ZN ZINC ION × 4 MG MAGNESIUM ION × 2 PO4 PHOSPHATE ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 7.5；25 MG/ML PROTEIN IN 39% SATURATING (NH4)2SO4, 100 MM TRIS, 10 MM MGCL2 100 MM ZNCL2, 2 MM NAH2PO4 AT PH 7.5, EQUILIBRATED AGAINST 55% SATURATING (NH4)2SO4
分辨率 2.80 Å R-free 0.173
1EW8 ALKALINE PHOSPHATASE (E.C. 3.1.3.1) COMPLEX WITH PHOSPHONOACETIC ACID 提交 2000-04-24 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 23–471（449 aa）
链 B 23–471（449 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 PO4 PHOSPHATE ION × 2 SO4 SULFATE ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 2 PAE PHOSPHONOACETIC ACID × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；298 K；enzyme: 30 mg/mL; buffer: 40% saturating ammonium sulfate/100 mM Tris/10 mM MgSO4, pH 9.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 2.20 Å R-free 0.257
1EW9 ALKALINE PHOSPHATASE (E.C. 3.1.3.1) COMPLEX WITH MERCAPTOMETHYL PHOSPHONATE 提交 2000-04-24 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 23–471（449 aa）
链 B 23–471（449 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 SO4 SULFATE ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 2 MMQ MERCAPTOMETHYL PHOSPHONATE × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；298 K；enzyme: 30 mg/mL; buffer: 40% saturated ammonium sulfate, 100 mM Tris/10 mM magnesium sulfate, pH 9.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 25K
分辨率 2.00 Å R-free 0.229
1HJK ALKALINE PHOSPHATASE MUTANT H331Q 提交 1997-05-30 突变/修饰不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 23–471（449 aa）
链 B 23–471（449 aa）
突变：H331Q 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：H331Q 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） ZN ZINC ION × 4 MG MAGNESIUM ION × 2 SO4 SULFATE ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 7.5；55% SATURATING (NH4)2SO4, 100 MM TRIS, 10 MM MGCL2, 10 MM ZNCL2, 2 MM NAH2PO4 AT PH 7.5
分辨率 2.30 Å R-free 0.200
1HQA ALKALINE PHOSPHATASE (H412Q) 提交 1995-11-30 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 23–471（449 aa）
链 B 23–471（449 aa）
突变：H412Q 突变：H412Q ZN ZINC ION × 6 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 7.5；pH 7.5
分辨率 2.25 Å
1KH4 E. COLI ALKALINE PHOSPHATASE MUTANT (D330N) IN COMPLEX WITH PHOSPHATE 提交 2001-11-29 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 23–471（449 aa）
链 B 23–471（449 aa）
突变：D330N 突变：D330N ZN ZINC ION × 4 MG MAGNESIUM ION × 2 PO4 PHOSPHATE ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；293 K；Ammonium sulfate, magnesium chloride, zinc sulfate, TRIS, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 2.40 Å R-free 0.245
1KH5 E. COLI ALKALINE PHOSPHATASE MUTANT (D330N) MIMIC OF THE TRANSITION STATES WITH ALUMINIUM FLUORIDE 提交 2001-11-29 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 23–471（449 aa）
链 B 23–471（449 aa）
突变：D330N 突变：D330N ZN ZINC ION × 4 MG MAGNESIUM ION × 2 AF3 ALUMINUM FLUORIDE × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；292 K；Ammonium sulfate, magnesium chloride, zinc sulfate, TRIS, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 292K
分辨率 2.00 Å R-free 0.228
1KH7 E. COLI ALKALINE PHOSPHATASE MUTANT (D153GD330N) 提交 2001-11-29 突变/修饰不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 23–471（449 aa）
链 B 23–471（449 aa）
突变：D153G, D330N 突变：D153G, D330N ZN ZINC ION × 4 MG MAGNESIUM ION × 2 SO4 SULFATE ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；292 K；ammonium sulfate, magnesium chloride, zinc sulfate, TRIS, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 292K
分辨率 2.40 Å R-free 0.249
1KH9 E. COLI ALKALINE PHOSPHATASE MUTANT (D153GD330N) COMPLEX WITH PHOSPHATE 提交 2001-11-29 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 23–471（449 aa）
链 B 23–471（449 aa）
突变：D153G, D330N 突变：D153G, D330N ZN ZINC ION × 4 MG MAGNESIUM ION × 1 PO4 PHOSPHATE ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 8；292 K；ammonium sulfate, magnesium chloride, zinc sulfate, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 292K
分辨率 2.50 Å R-free 0.250
1KHJ E. COLI ALKALINE PHOSPHATASE MUTANT (D153HD330N) MIMIC OF THE TRANSITION STATES WITH ALUMINIUM FLUORIDE 提交 2001-11-30 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 23–471（449 aa）
链 B 23–471（449 aa）
突变：D153H, D330N 突变：D153H, D330N ZN ZINC ION × 4 AF3 ALUMINUM FLUORIDE × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；292 K；ammonium sulfate, magnesium chloride, zinc sulfate, TRIS, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 292K
分辨率 2.30 Å R-free 0.223
1KHK E. COLI ALKALINE PHOSPHATASE MUTANT (D153HD330N) 提交 2001-11-30 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 23–471（449 aa）
链 B 23–471（449 aa）
突变：D153H, D330N 突变：D153H, D330N ZN ZINC ION × 4 MG MAGNESIUM ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；292 K；ammonium sulfate, magnesium chloride, zinc sulfate, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 292K
分辨率 2.50 Å R-free 0.207
1KHL E. COLI ALKALINE PHOSPHATASE MUTANT (D153HD330N) COMPLEX WITH PHOSPHATE 提交 2001-11-30 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 23–471（449 aa）
链 B 23–471（449 aa）
突变：D153H, D330N 突变：D153H, D330N ZN ZINC ION × 4 PO4 PHOSPHATE ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；292 K；ammonium sulfate, magnesium chloride, zinc sulfate, TRIS, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 292K
分辨率 2.50 Å R-free 0.227
1KHN E. COLI ALKALINE PHOSPHATASE MUTANT (D153HD330N) ZINC FORM 提交 2001-11-30 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 23–471（449 aa）
链 B 23–471（449 aa）
突变：D153H, D330N 突变：D153H, D330N ZN ZINC ION × 6 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；292 K；ammonium sulfate, magnesium chloride, zinc sulfate, TRIS, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 292K
分辨率 2.60 Å R-free 0.248
1URA ALKALINE PHOSPHATASE (D51ZN) 提交 1996-02-03 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 26–471（446 aa）
链 B 26–471（446 aa）
突变：D51N 突变：D51N ZN ZINC ION × 4 PO4 PHOSPHATE ION × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 7.5；65% SATURATING (NH4)2SO4, 100 MM TRIS, 10 MM MGCL2, 10 MM ZNCL2, 2 MM NAH2PO4 AT PH 7.5.
分辨率 2.04 Å R-free 0.234
1URB ALKALINE PHOSPHATASE (N51MG) 提交 1996-02-03 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 26–471（446 aa）
链 B 26–471（446 aa）
突变：D51N 突变：D51N ZN ZINC ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 2 PO4 PHOSPHATE ION × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 9.2；45% SATURATING (NH4)2SO4, 0.10 MM CAPS, 20 MM MGCL2, 10 UM ZNCL2, 0.1 MM NAH2PO4 AT PH 9.2.
分辨率 2.14 Å R-free 0.241
1Y6V Structure of E. coli Alkaline Phosphatase in presence of cobalt at 1.60 A resolution 提交 2004-12-07 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 23–471（449 aa）
链 B 23–471（449 aa）
未记录 CO COBALT (II) ION × 6 PO4 PHOSPHATE ION × 2 SO4 SULFATE ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；293 K；10 mM cobalt chloride, 2.1 M Ammonium sulfate, pH 9.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 1.60 Å R-free 0.212
1Y7A Structure of D153H/K328W E. coli alkaline phosphatase in presence of cobalt at 1.77 A resolution 提交 2004-12-08 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 23–471（449 aa）
链 B 23–471（449 aa）
突变：D153H, K328W 突变：D153H, K328W CO COBALT (II) ION × 6 PO4 PHOSPHATE ION × 2 SO4 SULFATE ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；293 K；10 mM cobalt chloride, 2.2 M ammonium sulfate, pH 9.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 1.77 Å R-free 0.238
2ANH ALKALINE PHOSPHATASE (D153H) 提交 1995-09-06 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 26–471（446 aa）
链 B 26–471（446 aa）
突变：D153H 突变：D153H ZN ZINC ION × 6 PO4 PHOSPHATE ION × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 7.5；pH 7.5
分辨率 2.40 Å R-free 0.239
2G9Y Structure of S102T E. coli alkaline phosphatase in presence of phosphate at 2.00 A resolution 提交 2006-03-07 突变/修饰不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 23–471（449 aa）
链 B 23–471（449 aa）
突变：S102T 突变：S102T ZN ZINC ION × 4 MG MAGNESIUM ION × 2 PO4 PHOSPHATE ION × 2 SO4 SULFATE ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；293 K；2.0M ammonium sulfate, 100mM Tris, 10mM magnesium chloride, 0.01mM zinc chloride, pH 9.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 2.00 Å R-free 0.242
2MLZ NMR structure of E. coli Trigger Factor in complex with unfolded PhoA365-471 提交 2014-03-05 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 360–471（112 aa）
未记录 未记录非水小分子 SOLUTION NMR
NMR测量条件 pH 7；295 K；离子强度（mmCIF原始值）100；压力 ambient
NMR样品组成 0.5 mM [U-100% 13C; U-100% 15N], Alkaline phosphatase, 0.5 mM [U-100% 13C; U-100% 15N], Trigger Factor, 100 mM potassium chloride, 3 mM BME, 20 mM potassium phosphate, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
分辨率未提供
3BDF Crystal structure of metal-free E. coli alkaline phosphatase (T155V) 提交 2007-11-14 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 22–471（450 aa）
链 B 22–471（450 aa）
突变：T155V 突变：T155V SO4 SULFATE ION × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；293 K；0.1 M MES, 0.2 M LiSO4, 1 mM ZnCl2, 5 mM MgCl2, 25-30% PEG 3350, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 1.40 Å R-free 0.184
3BDG Crystal structure of wild-type/T155V mixed dimer of E. coli alkaline phosphatase 提交 2007-11-14 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 22–471（450 aa）
链 B 22–471（450 aa）
突变：T155V SO4 SULFATE ION × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；293 K；0.1 M MES, 0.2 M LiSO4, 1 mM ZnCl2, 5 mM MgCl2, 25-30% PEG 3350, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 1.40 Å R-free 0.180
3BDH Crystal structure of zinc-deficient wild-type E. coli alkaline phosphatase 提交 2007-11-14 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 22–471（450 aa）
链 B 22–471（450 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；293 K；0.1 M MES, 0.2 M LiSO4, 1 mM ZnCl2, 5 mM MgCl2, 25-30% PEG 3350, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 1.85 Å R-free 0.189
3CMR E. coli alkaline phosphatase mutant R166S in complex with phosphate 提交 2008-03-24 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 23–471（449 aa）
链 B 23–471（449 aa）
突变：R166S 突变：R166S ZN ZINC ION × 4 PO4 PHOSPHATE ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.8；298 K；22% PEG 3350, 0.2 M sodium citrate, 1 mM magnesium chloride, 5 mM sodium phosphate, pH 5.8, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 2.05 Å R-free 0.213
3DPC Structure of E.coli Alkaline Phosphatase Mutant in Complex with a Phosphorylated Peptide 提交 2008-07-07 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 23–471（449 aa）
链 B 23–471（449 aa）
突变：S102L 突变：S102L PO4 PHOSPHATE ION × 1 TRS 2-AMINO-2-HYDROXYMETHYL-PROPANE-1,3-DIOL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；314 K；39%-43% saturation ammonium sulfate, 100mM Tris pH 9.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 314K
分辨率 2.30 Å R-free 0.271
3DYC Structure of E322Y Alkaline Phosphatase in Complex with Inorganic Phosphate 提交 2008-07-25 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 26–471（446 aa） 片段：alkaline phosphatase
链 B 26–471（446 aa） 片段：alkaline phosphatase
突变：E322Y 突变：E322Y ZN ZINC ION × 6 PO4 PHOSPHATE ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；293 K；0.2 M ammonium fluoride, 20% PEG 3350, and 0.5 mM zinc chloride, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 2.30 Å R-free 0.243
3TG0 E. coli alkaline phosphatase with bound inorganic phosphate 提交 2011-08-16 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 23–471（449 aa） 片段：unp residues 23-471
链 B 23–471（449 aa） 片段：unp residues 23-471
未记录 ZN ZINC ION × 4 MG MAGNESIUM ION × 2 PO4 PHOSPHATE ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；277 K；20% PEG 4000, 0.2 M HEPES, 1 mM ZnCl2, 0.01 mM MgCl2, pH 8, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K
分辨率 1.20 Å R-free 0.169
3TG0 E. coli alkaline phosphatase with bound inorganic phosphate 提交 2011-08-16 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 C 23–471（449 aa） 片段：unp residues 23-471
链 D 23–471（449 aa） 片段：unp residues 23-471
未记录 ZN ZINC ION × 4 MG MAGNESIUM ION × 2 PO4 PHOSPHATE ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；277 K；20% PEG 4000, 0.2 M HEPES, 1 mM ZnCl2, 0.01 mM MgCl2, pH 8, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K
分辨率 1.20 Å R-free 0.169
4KM4 E. coli alkaline phosphatase mutant S102G/R166S in complex with inorganic phosphate 提交 2013-05-08 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 26–470（445 aa）
链 B 26–470（445 aa）
突变：S102G, R166S 突变：S102G, R166S PO4 PHOSPHATE ION × 2 ZN ZINC ION × 6 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；291 K；Equal parts 23.5 mg/mL enzyme in 10 mM NaMOPS and 50 mM NaCl and 0.2 M NH4F, 17-21% PEG 3350, and 500 uM ZnCl2, pH 8, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 291K
分辨率 2.80 Å R-free 0.296
4YR1 Crystal Structure of E. Coli Alkaline Phosphatase D101A/D153A in complex with inorganic phosphate 提交 2015-03-13 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 31–471（441 aa）
链 B 31–471（441 aa）
突变：D101A D153A 突变：D101A D153A ZN ZINC ION × 4 PO4 PHOSPHATE ION × 2 GOL GLYCEROL × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5；298 K；PEG 3350, Bis-Tris, ammonium sulfate, glycerol (cryo-protectant)
分辨率 2.24 Å R-free 0.259
5C66 E. Coli Alkaline Phosphatase in complex with tungstate 提交 2015-06-22 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 23–471（449 aa）
链 B 23–471（449 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 WO4 TUNGSTATE(VI)ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；291 K；sodium MOPS, sodium chloride, zinc chloride, magnesium chloride, PEG3350, ammonium fluoride, sodium tungstate
分辨率 2.03 Å R-free 0.240
5JTL The structure of chaperone SecB in complex with unstructured proPhoA 提交 2016-05-09 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 E 1–471（471 aa）
未记录 未记录非水小分子 SOLUTION NMR
NMR测量条件 pH 7；301 K；离子强度（mmCIF原始值）150；压力 1
NMR样品组成 300 uM [U-100% 13C; U-100% 15N] E.coli Chaperone SecB, 300 uM [U-100% 13C; U-100% 15N] E. Coli Alkaline Phosphatase (PhoA), 150 mM potassium chloride, 50 mM sodium phosphate, 50 mM potassium phosphate, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
分辨率未提供
5JTM The structure of chaperone SecB in complex with unstructured PhoA binding site a 提交 2016-05-09 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 E 1–25（25 aa） 片段：residues 1-25
链 F 1–25（25 aa） 片段：residues 1-25
链 G 1–25（25 aa） 片段：residues 1-25
链 H 1–25（25 aa） 片段：residues 1-25
未记录 未记录非水小分子 SOLUTION NMR
NMR测量条件 pH 7；301 K；离子强度（mmCIF原始值）150；压力 1
NMR样品组成 300 uM [U-100% 13C; U-100% 15N] SecB, 300 uM [U-100% 13C; U-100% 15N] PhoA binding site a, 150 uM potassium chloride, 50 uM sodium phosphate, 50 uM potassium phosphate, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
分辨率未提供
5JTN The structure of chaperone SecB in complex with unstructured proPhoA binding site c 提交 2016-05-09 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 E 91–145（55 aa） 片段：residues 91-145
链 F 91–145（55 aa） 片段：residues 91-145
未记录 未记录非水小分子 SOLUTION NMR
NMR测量条件 pH 7；301 K；离子强度（mmCIF原始值）150；压力 1
NMR样品组成 300 uM [U-100% 13C; U-100% 15N] E.coli Chaperone SecB, 300 uM [U-100% 13C; U-100% 15N] E.coli Alkaline Phosphatase (PhoA) binding site c, 150 mM potassium chloride, 50 mM sodium phosphate, 50 mM potassium phosphate, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
分辨率未提供
5JTO The structure of chaperone SecB in complex with unstructured proPhoA binding site d 提交 2016-05-09 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 E 271–310（40 aa） 片段：residues 271-310
链 F 271–310（40 aa） 片段：residues 271-310
链 G 271–310（40 aa） 片段：residues 271-310
链 H 271–310（40 aa） 片段：residues 271-310
未记录 未记录非水小分子 SOLUTION NMR
NMR测量条件 pH 7；301 K；离子强度（mmCIF原始值）150；压力 1
NMR样品组成 300 uM [U-100% 13C; U-100% 15N] E.coli chaperone SecB, 300 uM [U-100% 13C; U-100% 15N] E.coli Alkaline Phosphatase (PhoA) binding site d, 150 mM potassium chloride, 50 mM sodium phosphate, 50 mM potassium phosphate, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
分辨率未提供
5JTP The structure of chaperone SecB in complex with unstructured proPhoA binding site e 提交 2016-05-09 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 E 450–471（22 aa） 片段：residues 450-471
链 F 450–471（22 aa） 片段：residues 450-471
链 G 450–471（22 aa） 片段：residues 450-471
链 H 450–471（22 aa） 片段：residues 450-471
未记录 未记录非水小分子 SOLUTION NMR
NMR测量条件 pH 7；301 K；离子强度（mmCIF原始值）150；压力 1
NMR样品组成 300 uM [U-100% 13C; U-100% 15N] E.coli Chaperone SecB, 300 uM [U-100% 13C; U-100% 15N] E. Coli Alkaline Phosphatase (PhoA) binding site e, 150 mM potassium chloride, 50 mM sodium phosphate, 50 mM potassium phosphate, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
分辨率未提供
5TPQ E. coli alkaline phosphatase D101A, D153A, R166S, E322A, K328A mutant 提交 2016-10-20 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 30–471（442 aa） 片段：UNP residues 30-471
链 B 30–471（442 aa） 片段：UNP residues 30-471
突变：D101A, D153A, R166S, E322A, K328A 突变：D101A, D153A, R166S, E322A, K328A ZN ZINC ION × 7 PO4 PHOSPHATE ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；298 K；5 mg/mL protein in 10 mM MOPS pH 7.0, 50 mM NaCl, 100 mM ZnCl2. Protein solution mixed with equal volume of precipitant solution: 23% PEG 3350, 0.2 M NH3F, 0.2 M HEPES pH=8.0
分辨率 2.45 Å R-free 0.219
6PPT Structural Basis for Client Recognition and Activity of Hsp40 Chaperones 提交 2019-07-08 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 4–13（10 aa）
未记录 未记录非水小分子 SOLUTION NMR
NMR测量条件 pH 7；298 K；离子强度（mmCIF原始值）120；压力 1
NMR样品组成 1 mM [U-13C; U-15N] PhoA-CBD1, 20 mM potassium phosphate, 75 mM potassium chloride, 0.04 % sodium azide, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
分辨率未提供
6PQ2 Structural Basis for Client Recognition and Activity of Hsp40 Chaperones 提交 2019-07-08 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 11–20（10 aa）
未记录 未记录非水小分子 SOLUTION NMR
NMR测量条件 pH 7；298 K；离子强度（mmCIF原始值）100；压力 1
NMR样品组成 1 mM [U-100% 13C; U-100% 15N] L11-K20_CBD1, 20 mM potassium phosphate, 75 mM potassium chloride, 0.04 % sodium azide, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
分辨率未提供
6PQE Structural Basis for Client Recognition and Activity of Hsp40 Chaperones 提交 2019-07-09 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 235–245（11 aa）
未记录 未记录非水小分子 SOLUTION NMR
NMR测量条件 pH 7；298 K；离子强度（mmCIF原始值）100；压力 1
NMR样品组成 1 mM [U-13C; U-15N] PhoA_235-245_DnaJ_191-256, 20 mM potassium phosphate, 75 mM potassium chloride, 0.04 % sodium azide, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
分辨率未提供
6PQM Structural Basis for Client Recognition and Activity of Hsp40 Chaperones 提交 2019-07-09 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 415–430（16 aa）
未记录 未记录非水小分子 SOLUTION NMR
NMR测量条件 pH 7；298 K；离子强度（mmCIF原始值）100；压力 1
NMR样品组成 1 mM [U-100% 13C; U-100% 15N] PhoA-Hsp40/DnaJ CBD2 fusion, 75 mM potassium chloride, 20 mM potassium phosphate, 0.04 % sodium azide, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
分辨率未提供
6PRI Structural Basis for Client Recognition and Activity of Hsp40 Chaperones 提交 2019-07-10 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 437–447（11 aa）
未记录 未记录非水小分子 SOLUTION NMR
NMR测量条件 pH 7；298 K；离子强度（mmCIF原始值）100；压力 1
NMR样品组成 1 mM [U-100% 13C; U-100% 15N] F-CBD2, 75 mM potassium chloride, 20 mM potassium phosphate, 0.04 % sodium azide, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
分辨率未提供
6PRJ Structural Basis for Client Recognition and Activity of Hsp40 Chaperones 提交 2019-07-10 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 457–467（11 aa）
未记录 未记录非水小分子 SOLUTION NMR
NMR测量条件 pH 7；298 K；离子强度（mmCIF原始值）100；压力 1
NMR样品组成 1 mM [U-100% 13C; U-100% 15N] G-CBD2, 75 mM potassium chloride, 20 mM potassium phosphate, 0.04 % sodium azide, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
分辨率未提供
6PRQ Structural Basis for Client Recognition and Activity of Hsp40 Chaperones 提交 2019-07-10 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 179–187（9 aa）
未记录 未记录非水小分子 SOLUTION NMR
NMR测量条件 pH 7；298 K；离子强度（mmCIF原始值）100；压力 1
NMR样品组成 1 mM [ILVMAT-sel-1H-13C_methyls; U-15N; U-2H] C-CBD1-CBD2, 75 mM potassium chloride, 20 mM potassium phosphate, 0.04 % sodium azide, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成 1 mM [U-100% 13C; U-100% 15N] C-CBD1-CBD2, 75 mM potassium chloride, 20 mM potassium phosphate, 0.04 % sodium azide, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
分辨率未提供
7JMM Crystal structure of the substrate-binding domain of E. coli DnaK in complex with the peptide RAKNIILLSR 提交 2020-08-02 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 63–72（10 aa）
突变：P63R, I71S, G72R SO4 SULFATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；293 K；2.4 M (NH4)2SO4, 0.1 M K3PO4
分辨率 2.56 Å R-free 0.327
7JN8 Crystal structure of the substrate-binding domain of E. coli DnaK in complex with the peptide RGNTLVIVSR 提交 2020-08-04 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 381–390（10 aa）
突变：E381R, T389S, A390R SO4 SULFATE ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；293 K；2.8 M (NH4)2SO4, 0.1 M K3PO4
分辨率 3.09 Å R-free 0.319
7JN9 Crystal structure of the substrate-binding domain of E. coli DnaK in complex with the peptide QEHTGSQLRIAAYGP 提交 2020-08-04 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 432–446（15 aa）
未记录 SO4 SULFATE ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；293 K；2.4 M (NH4)2SO4, 0.1 M K3PO4
分辨率 2.40 Å R-free 0.286
7JNE Crystal structure of the substrate-binding domain of E. coli DnaK in complex with the peptide RGSQLRIASR 提交 2020-08-04 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 435–444（10 aa）
突变：T435R, A443S, Y444R SO4 SULFATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；293 K；2.4 M (NH4)2SO4, 0.1 M K3PO4
分辨率 2.54 Å R-free 0.334
7N6J Crystal structure of the substrate-binding domain of E. coli DnaK in complex with the peptide RKQSTIALALLPLLFTPRR 提交 2021-06-08 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 1–19（19 aa）
突变：M1R, V18R, T19R SO4 SULFATE ION × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；293 K；2.4 M (NH4)2SO4, 0.1 M K3PO4 pH 7.0
分辨率 2.00 Å R-free 0.265
7N6K Crystal structure of the substrate-binding domain of E. coli DnaK in complex with the peptide RALALLPLSR 提交 2021-06-08 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 6–15（10 aa）
突变：I6R, L14S, F15R SO4 SULFATE ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.9；293 K；2.6 M (NH4)2SO4, 0.1 M K3PO4
分辨率 2.55 Å R-free 0.306
7N6L Crystal structure of the substrate-binding domain of E. coli DnaK in complex with the peptide EANQQKPLLGLFADG 提交 2021-06-08 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 270–284（15 aa）
未记录 GOL GLYCEROL × 2 SO4 SULFATE ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；293 K；2.8 M (NH4)2SO4, 0.1 M K3PO4
分辨率 2.40 Å R-free 0.332
7N6M Crystal structure of the substrate-binding domain of E. coli DnaK in complex with the peptide RQKPLLGLSR 提交 2021-06-08 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 273–282（10 aa）
突变：Q273R, F281S, A282R SO4 SULFATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；293 K；2.6 M (NH4)2SO4, 0.1 M K3PO4
分辨率 1.82 Å R-free 0.287

共 66 个其他 PDB 条目、67 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 PPB_ECOLI
Isoform —
PDB实体 1
链与序列区间 作者链 A； PDB构建体 1–449； UniProt 23–471 作者链 B； PDB构建体 1–449； UniProt 23–471

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

SAXS profile for 2ga3

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

P(r) distribution for 2ga3
下载 Download
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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id2ga3
沉积日期 deposition_date2006-03-07
结构标题 titleStructure of S102T E. coli Alkaline Phosphatase-phosphate intermediate at 2.20A resolution
关键词 keywordsmutagenesis, side chain conformation, covalent intermediate, rate-determining step, HYDROLASE; HYDROLASE
实验方法 methodX-RAY DIFFRACTION
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3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

回转半径 Rg (Guinier) rg_guinier28.25 Å
回转半径 Rg (电子) rg_electron27.68 Å
零角强度 I(0) i0154929000.00
分子量 molecular_weight94757.0 kDa
排除体积 excluded_volume116770 ų
包络体积 envelope_volume132260 ų
水化壳体积 shell_volume39124 ų
包络直径 envelope_diameter105.6 Å
壳层 Rg shell_rg35.70 Å
包络 Rg envelope_rg28.08 Å
形状 Rg shape_rg27.69 Å
总 Rg total_rg28.30 Å
总原子数 total_atoms6634
残基数 n_residues896
球谐函数阶数 n_harmonics20
q 范围 q_range— – 0.5000 Å−1
数据点数 n_points101
壳层类型 shell_typedirectional
溶剂电子密度 solvent_density0.3340 e/ų
壳层衬度 contrast_shell0.0300 e/ų
CRYSOL 版本 crysol_version4.1.3
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4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

最大尺寸 Dmax dmax99.3 Å
Rg (实空间) rg_real28.29 Å
Rg 误差 (实空间) rg_real_error0.61 Å
I(0) (实空间) i0_real1.5490e+08
I(0) 误差 (实空间) i0_real_error2.0700e+06
Rg (倒空间) rg_reciprocal28.27 Å
I(0) (倒空间) i0_reciprocal154900000.0000
解质量估计 total_estimate0.8450
解质量评级 solution_quality GOOD a GOOD solution
P(r) 峰数 n_peaks2
主峰位置 r_peak_primary33.7 Å
偏度 Skewness skewness0.500
峰度 Kurtosis kurtosis0.076
角度范围 angular_range— – 0.2800 Å−1
当前正则化参数 α current_alpha0.0000
最高正则化参数 α highest_alpha38200000.0000
实空间数据点数 n_real_points57
GNOM 版本 gnom_version4.1.3
质量判据 quality_criteria AN1: 0.000; Oscil: 0.677; Stabil: 1.000; Sysdev: 1.000; Positv: 1.000; Valcen: 0.973; Smooth: 0.976
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5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

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6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (5)

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7. 折叠分类 (SCOP + CATH) 4 domains

SCOP 2.08 (2 domains)

结构域编号 domain_idd2ga3a_
类 Class classc — Alpha and beta proteins (a/b)
折叠类型 Fold foldc.76 — Alkaline phosphatase-like
超家族 Superfamily superfamilyc.76.1 — Alkaline phosphatase-like
家族 Family familyc.76.1.1 — Alkaline phosphatase
结构域编号 domain_idd2ga3b_
类 Class classc — Alpha and beta proteins (a/b)
折叠类型 Fold foldc.76 — Alkaline phosphatase-like
超家族 Superfamily superfamilyc.76.1 — Alkaline phosphatase-like
家族 Family familyc.76.1.1 — Alkaline phosphatase

CATH v4.4 (2 domains)

结构域编号 domain_id2ga3A00
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture40 — 3-Layer(aba) Sandwich
拓扑 Topology topology720 — Alkaline Phosphatase, subunit A
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — Alkaline Phosphatase, subunit A
结构域编号 domain_id2ga3B00
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture40 — 3-Layer(aba) Sandwich
拓扑 Topology topology720 — Alkaline Phosphatase, subunit A
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — Alkaline Phosphatase, subunit A
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8. 引用文献 (1)

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9. 文件与曲线 (10)