2hd0

Structure of the catalytic domain of hepatitis C virus NS2

Method: X-RAY DIFFRACTION D_max: 135.2 Å Quality: GOOD

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Protease NS2-3 (p23)

Hepatitis C virus

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	蛋白同源多聚体同源多聚体蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2）与蛋白拷贝数一致	链 A； UniProt 902–1025 链 B； UniProt 902–1025	片段：protease domain of NS2	BOG octyl beta-D-glucopyranoside × 4	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；277 K；0.1 M Tris pH 8.5 0.8 M Ammonium Acetate 0.25 M Lithium Chloride 12% PEG 3350, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277.0K	分辨率 2.28 Å R-free 0.268
2	蛋白同源多聚体同源多聚体蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2）与蛋白拷贝数一致	链 C； UniProt 902–1025 链 D； UniProt 902–1025	片段：protease domain of NS2	BOG octyl beta-D-glucopyranoside × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；277 K；0.1 M Tris pH 8.5 0.8 M Ammonium Acetate 0.25 M Lithium Chloride 12% PEG 3350, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277.0K	分辨率 2.28 Å R-free 0.268
3	蛋白同源多聚体同源多聚体蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2）与蛋白拷贝数一致	链 E； UniProt 902–1025 链 F； UniProt 902–1025	片段：protease domain of NS2	BOG octyl beta-D-glucopyranoside × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；277 K；0.1 M Tris pH 8.5 0.8 M Ammonium Acetate 0.25 M Lithium Chloride 12% PEG 3350, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277.0K	分辨率 2.28 Å R-free 0.268
4	蛋白同源多聚体同源多聚体蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2）与蛋白拷贝数一致	链 G； UniProt 902–1025 链 H； UniProt 902–1025	片段：protease domain of NS2	BOG octyl beta-D-glucopyranoside × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；277 K；0.1 M Tris pH 8.5 0.8 M Ammonium Acetate 0.25 M Lithium Chloride 12% PEG 3350, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277.0K	分辨率 2.28 Å R-free 0.268
5	蛋白同源多聚体同源多聚体蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2）与蛋白拷贝数一致	链 I； UniProt 902–1025 链 J； UniProt 902–1025	片段：protease domain of NS2	BOG octyl beta-D-glucopyranoside × 2 DMU DECYL-BETA-D-MALTOPYRANOSIDE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；277 K；0.1 M Tris pH 8.5 0.8 M Ammonium Acetate 0.25 M Lithium Chloride 12% PEG 3350, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277.0K	分辨率 2.28 Å R-free 0.268
6	蛋白同源多聚体同源多聚体蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2）与蛋白拷贝数一致	链 K； UniProt 902–1025 链 L； UniProt 902–1025	片段：protease domain of NS2	BOG octyl beta-D-glucopyranoside × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；277 K；0.1 M Tris pH 8.5 0.8 M Ammonium Acetate 0.25 M Lithium Chloride 12% PEG 3350, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277.0K	分辨率 2.28 Å R-free 0.268

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB	相对当前条目 2HD0	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
1A1R HCV NS3 PROTEASE DOMAIN:NS4A PEPTIDE COMPLEX 提交 1997-12-15	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1026–1205（180 aa）片段：PROTEASE DOMAIN 链 C 1677–1695（19 aa）片段：ACTIVATION DOMAIN	突变：INS(ASMTGGQQMG) AT N-TERMINUS, INS(GSHHHHHH) AT C-TERMINUS 突变：INS(KK) AT N-TERMINUS, C22S, INS(KK) AT C-TERMINUS	ZN ZINC ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 6.5；PROTEIN WAS CRYSTALLIZED FROM 1.8 M NACL, 100 MM NA/K PHOSPHATE, 10 MM B-MERCAPTOETHANOL, 100 MM MES, PH 6.5.	分辨率 2.50 Å R-free 0.261
1A1R HCV NS3 PROTEASE DOMAIN:NS4A PEPTIDE COMPLEX 提交 1997-12-15	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 1026–1205（180 aa）片段：PROTEASE DOMAIN 链 D 1677–1695（19 aa）片段：ACTIVATION DOMAIN	突变：INS(ASMTGGQQMG) AT N-TERMINUS, INS(GSHHHHHH) AT C-TERMINUS 突变：INS(KK) AT N-TERMINUS, C22S, INS(KK) AT C-TERMINUS	ZN ZINC ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 6.5；PROTEIN WAS CRYSTALLIZED FROM 1.8 M NACL, 100 MM NA/K PHOSPHATE, 10 MM B-MERCAPTOETHANOL, 100 MM MES, PH 6.5.	分辨率 2.50 Å R-free 0.261
1A1R HCV NS3 PROTEASE DOMAIN:NS4A PEPTIDE COMPLEX 提交 1997-12-15	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 1026–1205（180 aa）片段：PROTEASE DOMAIN 链 B 1026–1205（180 aa）片段：PROTEASE DOMAIN 链 C 1677–1695（19 aa）片段：ACTIVATION DOMAIN 链 D 1677–1695（19 aa）片段：ACTIVATION DOMAIN	突变：INS(ASMTGGQQMG) AT N-TERMINUS, INS(GSHHHHHH) AT C-TERMINUS 突变：INS(ASMTGGQQMG) AT N-TERMINUS, INS(GSHHHHHH) AT C-TERMINUS 突变：INS(KK) AT N-TERMINUS, C22S, INS(KK) AT C-TERMINUS 突变：INS(KK) AT N-TERMINUS, C22S, INS(KK) AT C-TERMINUS	ZN ZINC ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 6.5；PROTEIN WAS CRYSTALLIZED FROM 1.8 M NACL, 100 MM NA/K PHOSPHATE, 10 MM B-MERCAPTOETHANOL, 100 MM MES, PH 6.5.	分辨率 2.50 Å R-free 0.261
1A1V HEPATITIS C VIRUS NS3 HELICASE DOMAIN COMPLEXED WITH SINGLE STRANDED SDNA 提交 1997-12-17	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：dimeric	链 A 1193–1657（465 aa）片段：HELICASE DOMAIN	突变：;N-TERMINAL MET, K221Q, A277G, S301L, S332P, S410A, G530E, R582W, AND A 10 RESIDUE (GSGSHHHHHH) HISTIDINE TAG ATTACHED TO THE C-TERMINUS ; 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	SO4 SULFATE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 8；pH 8.0	分辨率 2.20 Å R-free 0.287
1CWX SOLUTION STRUCTURE OF THE HEPATITIS C VIRUS N-TERMINAL CAPSID PROTEIN 2-45 [C-HCV(2-45)] 提交 1999-08-27	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 2–45（44 aa）片段：N-TERMINAL FRAGMENT	未记录	未记录非水小分子	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 5.9；293 K；离子强度（mmCIF原始值）0.1M NACL；压力 AMBIENT NMR样品组成 40% D2-TRIFLUOROETHANOL;0.01M SODIUM PHOSPHATE;0.1M NACL	分辨率未提供
1HEI STRUCTURE OF THE HEPATITIS C VIRUS RNA HELICASE DOMAIN 提交 1997-03-31	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1206–1656（451 aa）链 B 1206–1656（451 aa）	未记录	CA CALCIUM ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 6.5；50MM CA ACETATE, 20MM NACACODYLATE PH 6.5, 8% PEG5000	分辨率 2.10 Å R-free 0.320
1JR6 Solution Structure of an Engineered Arginine-rich Subdomain 2 of the Hepatitis C Virus NS3 RNA Helicase 提交 2001-08-10	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1353–1507（155 aa）片段：arginine-rich subdomain 2	未记录	未记录非水小分子	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 6.5；298 K；离子强度（mmCIF原始值）75 mM KiPO4；压力 ambient NMR样品组成 0.6 mM, U-15N,13C; \| 75 mM PHOSPHATE BUFFER; 5 mM DTT, 90%H2O, 10%D2O, 0.015% NaN3 NMR样品组成 0.6 mM, U-15N,13C; \| 75 mM PHOSPHATE BUFFER; 5 mM DTT, 99%D2O, 0.015% NaN3 NMR样品组成 0.3 mM, U-15N \| 75 mM PHOSPHATE BUFFER; 5 mM DTT, 90%H2O, 10%D2O, 0.015% NaN3	分辨率未提供
1N1L CRYSTAL STRUCTURE OF HCV NS3 PROTEASE DOMAIN:NS4A PEPTIDE COMPLEX WITH COVALENTLY BOUND INHIBITOR (GW472467X) 提交 2002-10-18	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1026–1205（180 aa）片段：Protease domain	突变：A164T	ZN ZINC ION × 1 TRL {1-[2-(1-FORMYL-PROPYL)-3-METHANESULFONYLAMINO-PYRROLIDINE-1-CARBONYL]-2-METHYL-PROPYL}-CARBAMIC ACID TERT-BUTYL ESTER × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；277 K；Inhibitor soaked into crystal generated according to Kim et al. (1996) Cell, 87, 343-355, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277.0K	分辨率 2.60 Å R-free 0.220
1N1L CRYSTAL STRUCTURE OF HCV NS3 PROTEASE DOMAIN:NS4A PEPTIDE COMPLEX WITH COVALENTLY BOUND INHIBITOR (GW472467X) 提交 2002-10-18	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 1026–1205（180 aa）片段：Protease domain	突变：A164T	ZN ZINC ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；277 K；Inhibitor soaked into crystal generated according to Kim et al. (1996) Cell, 87, 343-355, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277.0K	分辨率 2.60 Å R-free 0.220
1N1L CRYSTAL STRUCTURE OF HCV NS3 PROTEASE DOMAIN:NS4A PEPTIDE COMPLEX WITH COVALENTLY BOUND INHIBITOR (GW472467X) 提交 2002-10-18	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 1026–1205（180 aa）片段：Protease domain 链 B 1026–1205（180 aa）片段：Protease domain	突变：A164T 突变：A164T	ZN ZINC ION × 2 TRL {1-[2-(1-FORMYL-PROPYL)-3-METHANESULFONYLAMINO-PYRROLIDINE-1-CARBONYL]-2-METHYL-PROPYL}-CARBAMIC ACID TERT-BUTYL ESTER × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；277 K；Inhibitor soaked into crystal generated according to Kim et al. (1996) Cell, 87, 343-355, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277.0K	分辨率 2.60 Å R-free 0.220
1ONB Solution structure of an engineered arginine-rich subdomain 2 of the hepatitis C virus NS3 RNA helicase 提交 2003-02-27	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1353–1507（155 aa）片段：Arginine-rich subdomain 2	未记录	未记录非水小分子	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 6.5；298 K；离子强度（mmCIF原始值）75 mM KIPO4；压力 ambient NMR样品组成 0.6 mM, U-15N,13C \| 90% H2O/10% D2O NMR样品组成 0.6 mM, U-15N,13C \| 99.9%D2O	分辨率未提供
1R7C NMR structure of the membrane anchor domain (1-31) of the nonstructural protein 5A (NS5A) of hepatitis C virus (Minimized average structure, Sample in 50% tfe) 提交 2003-10-21	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1973–2003（31 aa）片段：Nonstructural protein NS5A (P56)(residues 1973-2003 OF SWISS-PROT SEQUENCE P27958)	未记录	未记录非水小分子	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 4.5；293 K；压力 ambient NMR样品组成 1.2mM NS5A[1-31], 10mM DTTd10 \| H2O/TFEd2 50/50 (v/v)	分辨率未提供
1R7D NMR structure of the membrane anchor domain (1-31) of the nonstructural protein 5A (NS5A) of hepatitis C virus (Ensemble of 51 structures, sample in 50% tfe) 提交 2003-10-21	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1973–2003（31 aa）片段：Nonstructural protein NS5A (P56)(residues 1973-2003 of Swiss-Prot sequence P27958)	未记录	未记录非水小分子	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 4.5；293 K；压力 ambient NMR样品组成 1.2mM NS5A[1-31], 10mM DTTd10 \| H2O/TFEd2 50/50 (v/v)	分辨率未提供
1R7E NMR structure of the membrane anchor domain (1-31) of the nonstructural protein 5A (NS5A) of hepatitis C virus (Minimized average structure. Sample in 100mM SDS). 提交 2003-10-21	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1973–2003（31 aa）片段：Nonstructural protein NS5A (P56)(residues 1973-2003 OF SWISS-PROT SEQUENCE P27958)	未记录	未记录非水小分子	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 6；313 K；压力 ambient NMR样品组成 1.2mM NS5A[1-31], 10mM DTTd10 \| 100mM SDS in H2O/D2O 95/5 (v/v)	分辨率未提供
1R7F NMR structure of the membrane anchor domain (1-31) of the nonstructural protein 5A (NS5A) of hepatitis C virus (Ensemble of 43 structures. Sample in 100mM SDS) 提交 2003-10-21	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1973–2003（31 aa）片段：Nonstructural protein NS5A (P56)(residues 1973-2003 of Swiss-Prot sequence P27958)	未记录	未记录非水小分子	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 6；313 K；压力 ambient NMR样品组成 1.2mM NS5A[1-31], 10mM DTTd10 \| 100mM SDS in H2O/D2O 95/5 (v/v)	分辨率未提供
1R7G NMR structure of the membrane anchor domain (1-31) of the nonstructural protein 5A (NS5A) of hepatitis C virus (Minimized average structure, Sample in 100mM DPC) 提交 2003-10-21	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1973–2003（31 aa）片段：Nonstructural protein NS5A (P56)(residues 1973-2003 OF SWISS-PROT SEQUENCE P27958)	未记录	未记录非水小分子	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 6；313 K；压力 ambient NMR样品组成 1.2mM NS5A[1-31], 10mM DTTd10 \| 100mM DPC in H2O/D2O 95/5 (v/v)	分辨率未提供
1RGQ M9A HCV Protease complex with pentapeptide keto-amide inhibitor 提交 2003-11-12	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 1026–1206（181 aa）片段：RESIDUES 1027-1207 链 B 1026–1206（181 aa）片段：RESIDUES 1027-1207	未记录	ZN ZINC ION × 2 AKP N-(PYRAZIN-2-YLCARBONYL)LEUCYLISOLEUCYL-N~1~-{1-[2-({1-CARBOXY-2-[4-(PHOSPHONOOXY)PHENYL]ETHYL}AMINO)-1,1-DIHYDROXY-2-OXOETHYL]BUT-3-ENYL}-3-CYCLOHEXYLALANINAMIDE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；298 K；0.2M N/KPO4, 2.0M NaCl, 10mM MES, 15% glycerol, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K	分辨率 2.90 Å R-free 0.312
2JXF The solution structure of HCV NS4B(40-69) 提交 2007-11-19	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1751–1780（30 aa）片段：Non-structural protein 4B, UNP residues 1751-1780	未记录	未记录非水小分子	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 6.5；298 K；离子强度（mmCIF原始值）0；压力 ambient NMR样品组成 1mM NS4B(40-69); 50% v/v Trifluoro Ethanol D2OH; 50% v/v H2O \| 50% v/v Trifluoro Ethanol D2OH; 50% v/v H2O	分辨率未提供
2KDR Solution structure of HCV NS4B(227-254) 提交 2009-01-15	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 X 1938–1965（28 aa）片段：UNP residues 1938-1965	未记录	未记录非水小分子	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 6；298 K；离子强度（mmCIF原始值）none；压力 ambient NMR样品组成 2mM protein-1, 50% v/v Trifluoro Ethanol D2OH; 50% v/v H2O \| 50% v/v Trifluoro Ethanol D2OH; 50% v/v H2O	分辨率未提供
2N1P Structure of the C-terminal membrane domain of HCV NS5B protein 提交 2015-04-15	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 2982–3011（30 aa）片段：C-terminal domain (UNP residues 2982-3011)	突变：C14S	未记录非水小分子	SOLUTION NMR NMR测量条件 298 K；压力 ambient NMR样品组成 1.4 mM protein, 1 M [U-2H] SDS, 95% H2O/5% D2O \| 95% H2O/5% D2O	分辨率未提供
2O8M Crystal structure of the S139A mutant of Hepatitis C Virus NS3/4A protease 提交 2006-12-12	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 C 1677–1695（19 aa）链 D 1677–1695（19 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 2 NA SODIUM ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277 K；1.25 to 1.5M NaCl, 0.1 M MES, .1M Na/K PO4, 5mM beta-mercaptoethanol, pH 5.6-6.2, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K	分辨率 2.00 Å R-free 0.228
2OBQ Discovery of the HCV NS3/4A Protease Inhibitor SCH503034. Key Steps in Structure-Based Optimization 提交 2006-12-19	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 B 1677–1695（19 aa）链 D 1677–1695（19 aa）	突变：C22S 突变：C22S	ZN ZINC ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277 K；The protein (NS3 complexed with KK-NS4a(21-39)-KK peptide) was at 12-15 mg/ml in 15 mM MES, pH 6.5 1 M NaCl 20 mM b-mercaptoethanol. Hanging Drops were formed by mixing 4:l protein solution with 4:l {0.75-1.0 M NaCl, 0.1M Na/K phosphate 0.1 M Mes, pH 5.8-6.1 20 mM b-mercaptoethanol} The drop was equilibrated the drops over 1 ml {(1.25-1.50 M) NaCl - 0.1M Na/K phosphate 0.1 M Mes, pH 5.6-5.8, 20 mM b-mercaptoethanol} , VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K	分辨率 2.50 Å R-free 0.264
2XI2 HCV-H77 NS5B Apo Polymerase 提交 2010-06-25	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 2421–2990（570 aa）片段：CATALYTIC DOMAIN, RESIDUES 2421-2990	突变：YES	SO4 SULFATE ION × 7	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 6.5；MES 0.1M PH 6.5, AMMONIUM SULFATE 0.2M, PEG 5000 MONOMETHYL ETHER	分辨率 1.80 Å R-free 0.207
2XI2 HCV-H77 NS5B Apo Polymerase 提交 2010-06-25	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 2421–2990（570 aa）片段：CATALYTIC DOMAIN, RESIDUES 2421-2990	突变：YES	SO4 SULFATE ION × 7	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 6.5；MES 0.1M PH 6.5, AMMONIUM SULFATE 0.2M, PEG 5000 MONOMETHYL ETHER	分辨率 1.80 Å R-free 0.207
2XI2 HCV-H77 NS5B Apo Polymerase 提交 2010-06-25	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 C 2421–2990（570 aa）片段：CATALYTIC DOMAIN, RESIDUES 2421-2990	突变：YES	SO4 SULFATE ION × 6	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 6.5；MES 0.1M PH 6.5, AMMONIUM SULFATE 0.2M, PEG 5000 MONOMETHYL ETHER	分辨率 1.80 Å R-free 0.207
2XI3 HCV-H77 NS5B Polymerase Complexed With GTP 提交 2010-06-25	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 2421–2990（570 aa）片段：CATALYTIC DOMAIN, RESIDUES 2421-2990	突变：YES	GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 3 MG MAGNESIUM ION × 3	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 6.5；MES 50MM PH 6.5, AMMONIUM SULFATE 0.2M, AMMONIUM ACETATE 0.25M, PEG 1000 25%-30%	分辨率 1.70 Å R-free 0.198
2XI3 HCV-H77 NS5B Polymerase Complexed With GTP 提交 2010-06-25	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 2421–2990（570 aa）片段：CATALYTIC DOMAIN, RESIDUES 2421-2990	突变：YES	GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 6.5；MES 50MM PH 6.5, AMMONIUM SULFATE 0.2M, AMMONIUM ACETATE 0.25M, PEG 1000 25%-30%	分辨率 1.70 Å R-free 0.198
4JZN Three dimensional structure of broadly neutralizing human anti - Hepatitis C virus (HCV) glycoprotein E2 Fab fragment HC84-1 提交 2013-04-03	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 K 434–446（13 aa）片段：Residues 434-446 of HCV strain H77 polyprotein	未记录	SO4 SULFATE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；293 K；100mM TRIS pH 8.0 19% PEG4000 170mM Lithium Sulfate 15% Glycerol, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 2.05 Å R-free 0.235
4JZO Three dimensional structure of broadly neutralizing human anti - Hepatitis C virus (HCV) glycoprotein E2 Fab fragment HC84-27 提交 2013-04-03	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 J 434–446（13 aa）片段：Residues 434-446 of HCV strain H77 polyprotein	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；293 K；23% PEG 3350 250mM Sodium Thiocyanate, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 2.22 Å R-free 0.236
4JZO Three dimensional structure of broadly neutralizing human anti - Hepatitis C virus (HCV) glycoprotein E2 Fab fragment HC84-27 提交 2013-04-03	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 K 434–446（13 aa）片段：Residues 434-446 of HCV strain H77 polyprotein	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；293 K；23% PEG 3350 250mM Sodium Thiocyanate, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 2.22 Å R-free 0.236
4JZO Three dimensional structure of broadly neutralizing human anti - Hepatitis C virus (HCV) glycoprotein E2 Fab fragment HC84-27 提交 2013-04-03	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 I 434–446（13 aa）片段：Residues 434-446 of HCV strain H77 polyprotein	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；293 K；23% PEG 3350 250mM Sodium Thiocyanate, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 2.22 Å R-free 0.236
4JZO Three dimensional structure of broadly neutralizing human anti - Hepatitis C virus (HCV) glycoprotein E2 Fab fragment HC84-27 提交 2013-04-03	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 4 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 L 434–446（13 aa）片段：Residues 434-446 of HCV strain H77 polyprotein	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；293 K；23% PEG 3350 250mM Sodium Thiocyanate, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 2.22 Å R-free 0.236
4MWF Structure of Hepatitis C Virus Envelope Glycoprotein E2 core bound to broadly neutralizing antibody AR3C 提交 2013-09-24	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 D 412–459（48 aa）链 D 486–645（160 aa）	突变：N448D, N576D 突变：N448D, N576D	NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 4	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；20% (w/v) PEG 4000, 10% (v/v) isopropanol, and 0.1 M HEPES pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K	分辨率 2.65 Å R-free 0.270
4MWF Structure of Hepatitis C Virus Envelope Glycoprotein E2 core bound to broadly neutralizing antibody AR3C 提交 2013-09-24	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 其他组合异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 C 412–459（48 aa）链 C 486–645（160 aa）	突变：N448D, N576D 突变：N448D, N576D	NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 3	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；20% (w/v) PEG 4000, 10% (v/v) isopropanol, and 0.1 M HEPES pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K	分辨率 2.65 Å R-free 0.270
4Q0X Crystal structure of non-neutralizing antibody in complex with Epitope II of HCV E2 提交 2014-04-02	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 E 421–446（26 aa）片段：epitope II (UNP residues 421-446)	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；293 K；0.1 M imidazole, 14% w/v PEG550 MME, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 2.90 Å R-free 0.285
5FGB Three dimensional structure of broadly neutralizing human anti - Hepatitis C virus (HCV) glycoprotein E2 Fab fragment HC33.4 提交 2015-12-20	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 F 405–425（21 aa）	未记录	GOL GLYCEROL × 2 SO4 SULFATE ION × 5	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.2；293 K；100 mM sodium citrate pH 5.2 300 mM ammonium sulfate 100 mM potassium phosphate 1 M lithium chloride	分辨率 1.65 Å R-free 0.190
5FGB Three dimensional structure of broadly neutralizing human anti - Hepatitis C virus (HCV) glycoprotein E2 Fab fragment HC33.4 提交 2015-12-20	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 G 405–425（21 aa）	未记录	GOL GLYCEROL × 2 SO4 SULFATE ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.2；293 K；100 mM sodium citrate pH 5.2 300 mM ammonium sulfate 100 mM potassium phosphate 1 M lithium chloride	分辨率 1.65 Å R-free 0.190
5FGC Three dimensional structure of broadly neutralizing human anti - Hepatitis C virus (HCV) glycoprotein E2 Fab fragment HC33.8 提交 2015-12-20	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 A 405–425（21 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；293 K；32% PEG 4000 100 mM Tris-HCl pH 8.5 800 mM lithium chloride Crystals obtained using heterologous microseeding.	分辨率 1.90 Å R-free 0.236

共 26 个其他 PDB 条目、38 个 assembly。打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	POLG_HCVH
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 2–128； UniProt 902–1025 作者链 B； PDB构建体 2–128； UniProt 902–1025 作者链 C； PDB构建体 2–128； UniProt 902–1025 作者链 D； PDB构建体 2–128； UniProt 902–1025 作者链 E； PDB构建体 2–128； UniProt 902–1025 作者链 F； PDB构建体 2–128； UniProt 902–1025 作者链 G； PDB构建体 2–128； UniProt 902–1025 作者链 H； PDB构建体 2–128； UniProt 902–1025 作者链 I； PDB构建体 2–128； UniProt 902–1025 作者链 J； PDB构建体 2–128； UniProt 902–1025 作者链 K； PDB构建体 2–128； UniProt 902–1025 作者链 L； PDB构建体 2–128； UniProt 902–1025

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

下载 Download SAXS (.dat) P(r) (.pr.out) CIF

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	2hd0
沉积日期 deposition_date	2006-06-19
结构标题 title	Structure of the catalytic domain of hepatitis C virus NS2
关键词 keywords	Cysteine Protease, Dimer, Composite Active Site, Hydrolase; HYDROLASE
实验方法 method	X-RAY DIFFRACTION

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3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

回转半径 Rg (Guinier) rg_guinier	42.43 Å
回转半径 Rg (电子) rg_electron	42.01 Å
零角强度 I(0) i0	380631000.00
分子量 molecular_weight	167260.0 kDa
排除体积 excluded_volume	213160 Å³
包络体积 envelope_volume	298580 Å³
水化壳体积 shell_volume	60927 Å³
包络直径 envelope_diameter	139.3 Å
壳层 Rg shell_rg	45.86 Å
包络 Rg envelope_rg	40.72 Å
形状 Rg shape_rg	42.02 Å
总 Rg total_rg	42.18 Å
总原子数 total_atoms	11754
残基数 n_residues	1525
球谐函数阶数 n_harmonics	20
q 范围 q_range	— – 0.5000 Å⁻¹
数据点数 n_points	101
壳层类型 shell_type	directional
溶剂电子密度 solvent_density	0.3340 e/Å³
壳层衬度 contrast_shell	0.0300 e/Å³
CRYSOL 版本 crysol_version	4.1.3

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4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

最大尺寸 Dmax dmax	135.2 Å
Rg (实空间) rg_real	42.52 Å
Rg 误差 (实空间) rg_real_error	1.07 Å
I(0) (实空间) i0_real	3.8060e+08
I(0) 误差 (实空间) i0_real_error	6.7200e+06
Rg (倒空间) rg_reciprocal	42.43 Å
I(0) (倒空间) i0_reciprocal	380600000.0000
解质量估计 total_estimate	0.8333
解质量评级 solution_quality	GOOD a GOOD solution
P(r) 峰数 n_peaks	1
主峰位置 r_peak_primary	47.5 Å
偏度 Skewness skewness	0.415
峰度 Kurtosis kurtosis	-0.427
角度范围 angular_range	— – 0.1850 Å⁻¹
当前正则化参数 α current_alpha	0.0000
最高正则化参数 α highest_alpha	116000000.0000
实空间数据点数 n_real_points	38
GNOM 版本 gnom_version	4.1.3
质量判据 quality_criteria	AN1: 0.000; Oscil: 0.782; Stabil: 1.000; Sysdev: 1.000; Positv: 1.000; Valcen: 1.000; Smooth: 0.483

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5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

▶

6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (4)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	Protease NS2-3 (p23)
分子量 formula_weight	13926.4 kDa
EC 编号 ec_number	3.4.22.-
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	12

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A,B,C,D,E,F,G,H,I,J,K,L
原子数 atom_count	11930

GSHMQASLLKVPYFVRVQGLLRICALARKIAGGHYVQMAIIKLGALTGTYVYNHLTPLRDWAHNGLRDLAVAVEPVVFSRMETKLITWGADTAACGDIINGLPVSARRGQEILLGPADGMVSKGWRLL

来源 Source

来源生物 organism	Hepatitis C virus
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	11103
宿主生物 host_organism	Escherichia coli BL21(DE3)

实体 2 Entity 2 non-polymer

描述 description	octyl beta-D-glucopyranoside
分子量 formula_weight	292.4 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	11

实体 3 Entity 3 non-polymer

描述 description	DECYL-BETA-D-MALTOPYRANOSIDE
分子量 formula_weight	482.6 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

实体 4 Entity 4 water

描述 description	water
分子量 formula_weight	18.0 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	176

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7. 折叠分类 (SCOP + CATH) 24 domains

CATH v4.4 (24 domains)

结构域编号 domain_id	2hd0A01
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	20 — Up-down Bundle
拓扑 Topology topology	1280 — Monooxygenase
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	150 — Hepatitis C virus non-structural protein NS2, N-terminal domain

结构域编号 domain_id	2hd0A02
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	30 — Roll
拓扑 Topology topology	30 — SH3 type barrels.
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	710 — Hepatitis C virus non-structural protein NS2, C-terminal domain

结构域编号 domain_id	2hd0B01
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	20 — Up-down Bundle
拓扑 Topology topology	1280 — Monooxygenase
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	150 — Hepatitis C virus non-structural protein NS2, N-terminal domain

结构域编号 domain_id	2hd0B02
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	30 — Roll
拓扑 Topology topology	30 — SH3 type barrels.
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	710 — Hepatitis C virus non-structural protein NS2, C-terminal domain

结构域编号 domain_id	2hd0C01
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	20 — Up-down Bundle
拓扑 Topology topology	1280 — Monooxygenase
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	150 — Hepatitis C virus non-structural protein NS2, N-terminal domain

结构域编号 domain_id	2hd0C02
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	30 — Roll
拓扑 Topology topology	30 — SH3 type barrels.
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	710 — Hepatitis C virus non-structural protein NS2, C-terminal domain

结构域编号 domain_id	2hd0D01
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	20 — Up-down Bundle
拓扑 Topology topology	1280 — Monooxygenase
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	150 — Hepatitis C virus non-structural protein NS2, N-terminal domain

结构域编号 domain_id	2hd0D02
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	30 — Roll
拓扑 Topology topology	30 — SH3 type barrels.
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	710 — Hepatitis C virus non-structural protein NS2, C-terminal domain

结构域编号 domain_id	2hd0E01
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	20 — Up-down Bundle
拓扑 Topology topology	1280 — Monooxygenase
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	150 — Hepatitis C virus non-structural protein NS2, N-terminal domain

结构域编号 domain_id	2hd0E02
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	30 — Roll
拓扑 Topology topology	30 — SH3 type barrels.
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	710 — Hepatitis C virus non-structural protein NS2, C-terminal domain

结构域编号 domain_id	2hd0F01
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	20 — Up-down Bundle
拓扑 Topology topology	1280 — Monooxygenase
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	150 — Hepatitis C virus non-structural protein NS2, N-terminal domain

结构域编号 domain_id	2hd0F02
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	30 — Roll
拓扑 Topology topology	30 — SH3 type barrels.
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	710 — Hepatitis C virus non-structural protein NS2, C-terminal domain

结构域编号 domain_id	2hd0G01
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	20 — Up-down Bundle
拓扑 Topology topology	1280 — Monooxygenase
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	150 — Hepatitis C virus non-structural protein NS2, N-terminal domain

结构域编号 domain_id	2hd0G02
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	30 — Roll
拓扑 Topology topology	30 — SH3 type barrels.
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	710 — Hepatitis C virus non-structural protein NS2, C-terminal domain

结构域编号 domain_id	2hd0H01
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	20 — Up-down Bundle
拓扑 Topology topology	1280 — Monooxygenase
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	150 — Hepatitis C virus non-structural protein NS2, N-terminal domain

结构域编号 domain_id	2hd0H02
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	30 — Roll
拓扑 Topology topology	30 — SH3 type barrels.
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	710 — Hepatitis C virus non-structural protein NS2, C-terminal domain

结构域编号 domain_id	2hd0I01
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	20 — Up-down Bundle
拓扑 Topology topology	1280 — Monooxygenase
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	150 — Hepatitis C virus non-structural protein NS2, N-terminal domain

结构域编号 domain_id	2hd0I02
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	30 — Roll
拓扑 Topology topology	30 — SH3 type barrels.
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	710 — Hepatitis C virus non-structural protein NS2, C-terminal domain

结构域编号 domain_id	2hd0J01
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	20 — Up-down Bundle
拓扑 Topology topology	1280 — Monooxygenase
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	150 — Hepatitis C virus non-structural protein NS2, N-terminal domain

结构域编号 domain_id	2hd0J02
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	30 — Roll
拓扑 Topology topology	30 — SH3 type barrels.
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	710 — Hepatitis C virus non-structural protein NS2, C-terminal domain

结构域编号 domain_id	2hd0K01
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	20 — Up-down Bundle
拓扑 Topology topology	1280 — Monooxygenase
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	150 — Hepatitis C virus non-structural protein NS2, N-terminal domain

结构域编号 domain_id	2hd0K02
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	30 — Roll
拓扑 Topology topology	30 — SH3 type barrels.
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	710 — Hepatitis C virus non-structural protein NS2, C-terminal domain

结构域编号 domain_id	2hd0L01
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	20 — Up-down Bundle
拓扑 Topology topology	1280 — Monooxygenase
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	150 — Hepatitis C virus non-structural protein NS2, N-terminal domain

结构域编号 domain_id	2hd0L02
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	30 — Roll
拓扑 Topology topology	30 — SH3 type barrels.
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	710 — Hepatitis C virus non-structural protein NS2, C-terminal domain

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8. 引用文献 (1)

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晶胞边长 a length_a	109.812 Å
晶胞边长 b length_b	68.819 Å
晶胞边长 c length_c	125.162 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	105.88 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	90.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	24

空间群 space_group	P 1 21 1
空间群编号 int_tables_number	4
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	2.280 Å
最低分辨率 resolution_low	30.000 Å
R 因子 r_factor	—
R_work r_work	0.2260
R_free r_free	0.2680

fit	/app/data/saxs_computation/hd/2hd0/2hd0.fit
pddf	/app/data/pr_computation/hd/2hd0/2hd0.pr.out
profile	/app/data/saxs_computation/hd/2hd0/2hd0.dat