SAXSdb — 2hgw

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Branched-chain-amino-acid aminotransferase, mitochondrial

Homo sapiens

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白同源多聚体	同源多聚体	蛋白 2	PYRIDOXAL-5'-PHOSPHATE × 2 4-(2-HYDROXYETHYL)-1-PIPERAZINE ETHANESULFONIC ACID × 1 ACETIC ACID × 10 GLYCEROL × 1 SULFATE ION × 1 water × 2	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	BCAT2_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 1–365； UniProt 28–392 作者链 B； PDB构建体 1–365； UniProt 28–392

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	2hgw
沉积日期 deposition_date	2006-06-27
结构标题 title	Crystal structure of Cys318Ala mutant of human mitochondrial branched chain aminotransferase
关键词 keywords	D-aminoacid aminotransferase-like PLP-dependent enzymes, TRANSFERASE; TRANSFERASE
实验方法 method	X-RAY DIFFRACTION

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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

2hgw__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

2hgw__assembly_1__model_1 | I(q)

100 个绘图点；横轴和纵轴均采用对数尺度。

2hgw__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。

Rg（Guinier）	28.61 Å
Rg（电子密度）	27.48 Å
总 Rg	28.30 Å
原子数	5811
残基数	717
排除体积	104320 Å³
最大 q	0.500 Å⁻¹

Assembly	Model	结构单元	聚集说明	状态	CRYSOL	操作
1	1	`2hgw__assembly_1__model_1`	dimeric （2）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载

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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (7)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	Branched-chain-amino-acid aminotransferase, mitochondrial
分子量 formula_weight	41336.0 kDa
EC 编号 ec_number	2.6.1.42
突变 mutation	C318A
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A,B
原子数 atom_count	5983

ASSSFKAADLQLEMTQKPHKKPGPGEPLVFGKTFTDHMLMVEWNDKGWGQPRIQPFQNLTLHPASSSLHYSLQLFEGMKAFKGKDQQVRLFRPWLNMDRMLRSAMRLCLPSFDKLELLECIRRLIEVDKDWVPDAAGTSLYVRPVLIGNEPSLGVSQPRRALLFVILCPVGAYFPGGSVTPVSLLADPAFIRAWVGGVGNYKLGGNYGPTVLVQQEALKRGCEQVLWLYGPDHQLTEVGTMNIFVYWTHEDGVLELVTPPLNGVILPGVVRQSLLDMAQTWGEFRVVERTITMKQLLRALEEGRVREVFGSGTACQVAPVHRILYKDRNLHIPTMENGPELILRFQKELKEIQYGIRAHEWMFPV

来源 Source

来源生物 organism	Homo sapiens
通用名 common_name	human
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9606
宿主生物 host_organism	Escherichia coli BL21(DE3)

实体 2 Entity 2 non-polymer

描述 description	PYRIDOXAL-5'-PHOSPHATE
分子量 formula_weight	247.1 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	2

实体 3 Entity 3 non-polymer

描述 description	4-(2-HYDROXYETHYL)-1-PIPERAZINE ETHANESULFONIC ACID
分子量 formula_weight	238.3 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	1

实体 4 Entity 4 non-polymer

描述 description	ACETIC ACID
分子量 formula_weight	60.1 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	10

实体 5 Entity 5 non-polymer

描述 description	GLYCEROL
分子量 formula_weight	92.1 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	1

实体 6 Entity 6 non-polymer

描述 description	SULFATE ION
分子量 formula_weight	96.1 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	1

实体 7 Entity 7 water

描述 description	water
分子量 formula_weight	18.0 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	172

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6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 6 domains

SCOP 2.08 (2 domains)

结构域编号 domain_id	d2hgwa_
类 Class class	e — Multi-domain proteins (alpha and beta)
折叠类型 Fold fold	e.17 — D-aminoacid aminotransferase-like PLP-dependent enzymes
超家族 Superfamily superfamily	e.17.1 — D-aminoacid aminotransferase-like PLP-dependent enzymes
家族 Family family	e.17.1.1 — D-aminoacid aminotransferase-like PLP-dependent enzymes

结构域编号 domain_id	d2hgwb_
类 Class class	e — Multi-domain proteins (alpha and beta)
折叠类型 Fold fold	e.17 — D-aminoacid aminotransferase-like PLP-dependent enzymes
超家族 Superfamily superfamily	e.17.1 — D-aminoacid aminotransferase-like PLP-dependent enzymes
家族 Family family	e.17.1.1 — D-aminoacid aminotransferase-like PLP-dependent enzymes

CATH v4.4 (4 domains)

结构域编号 domain_id	2hgwA01
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	470 — D-amino Acid Aminotransferase; Chain A, domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Aminotransferase class 4, branched-chain amino acid transferase, N-terminal domain

结构域编号 domain_id	2hgwA02
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	20 — Alpha-Beta Barrel
拓扑 Topology topology	10 — D-amino Acid Aminotransferase; Chain A, domain 2
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — D-amino Acid Aminotransferase, subunit A, domain 2

结构域编号 domain_id	2hgwB01
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	470 — D-amino Acid Aminotransferase; Chain A, domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Aminotransferase class 4, branched-chain amino acid transferase, N-terminal domain

结构域编号 domain_id	2hgwB02
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	20 — Alpha-Beta Barrel
拓扑 Topology topology	10 — D-amino Acid Aminotransferase; Chain A, domain 2
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — D-amino Acid Aminotransferase, subunit A, domain 2

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晶胞边长 a length_a	69.668 Å
晶胞边长 b length_b	105.585 Å
晶胞边长 c length_c	106.599 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	90.00 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	90.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	8

空间群 space_group	P 21 21 21
空间群编号 int_tables_number	19
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	1.980 Å
最低分辨率 resolution_low	25.000 Å
R 因子 r_factor	0.2270
R_work r_work	0.2270
R_free r_free	0.2540

Crystal structure of Cys318Ala mutant of human mitochondrial branched chain aminotransferase

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Branched-chain-amino-acid aminotransferase, mitochondrial

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

2hgw__assembly_1__model_1

2hgw__assembly_1__model_1 | I(q)

2hgw__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (7)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 non-polymer

实体 3 Entity 3 non-polymer

实体 4 Entity 4 non-polymer

实体 5 Entity 5 non-polymer

实体 6 Entity 6 non-polymer

实体 7 Entity 7 water

6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 6 domains

SCOP 2.08 (2 domains)

CATH v4.4 (4 domains)

7. 引用文献 (1)

Crystal structure of Cys318Ala mutant of human mitochondrial branched chain aminotransferase

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Branched-chain-amino-acid aminotransferase, mitochondrial

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

2hgw__assembly_1__model_1

2hgw__assembly_1__model_1 | I(q)

2hgw__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (7)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 non-polymer

实体 3 Entity 3 non-polymer

实体 4 Entity 4 non-polymer

实体 5 Entity 5 non-polymer

实体 6 Entity 6 non-polymer

实体 7 Entity 7 water

6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 6 domains

SCOP 2.08 (2 domains)

CATH v4.4 (4 domains)

7. 引用文献 (1)