Escherichia coli
| Assembly | 物理组成 | 蛋白状态 | 分子拷贝数 | 共同组分 | 数据核对 |
|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 蛋白同源多聚体 | 同源多聚体 | 蛋白 3 | MANGANESE (II) ION × 3 DEOXYURIDINE-5'-DIPHOSPHATE × 3 1,2-ETHANEDIOL × 3 water × 3 | 与蛋白数一致 |
| UniProt名称 | DUT_ECOLI |
| Isoform | — |
| PDB实体 | 1 |
| 链与序列区间 | 作者链 A； PDB构建体 2–152； UniProt 1–151 |
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| 条目编号 entry_id | 2hr6 |
| 沉积日期 deposition_date | 2006-07-19 |
| 结构标题 title | Crystal structure of dUTPase in complex with substrate analogue dUDP and manganese |
| 关键词 keywords | JELLY ROLL, ENZYME-LIGAND-metal COMPLEX, Hydrolase; HYDROLASE |
| 实验方法 method | X-RAY DIFFRACTION |
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Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)
| Rg（Guinier） | 21.84 Å |
| Rg（电子密度） | 20.67 Å |
| 总 Rg | 21.38 Å |
| 原子数 | 3126 |
| 残基数 | 411 |
| 排除体积 | 55839 ų |
| 最大 q | 0.500 Å⁻¹ |
| 结构域编号 domain_id | d2hr6a2 |
| 类 Class class | b — All beta proteins |
| 折叠类型 Fold fold | b.85 — beta-clip |
| 超家族 Superfamily superfamily | b.85.4 — dUTPase-like |
| 家族 Family family | b.85.4.1 — dUTPase-like |
| 结构域编号 domain_id | d2hr6a3 |
| 类 Class class | l — Artifacts |
| 折叠类型 Fold fold | l.1 — Tags |
| 超家族 Superfamily superfamily | l.1.1 — Tags |
| 家族 Family family | l.1.1.1 — Tags |
| 结构域编号 domain_id | 2hr6A00 |
| 类 Class class | 2 — Mainly Beta |
| 架构 Architecture architecture | 70 — Distorted Sandwich |
| 拓扑 Topology topology | 40 — Deoxyuridine 5'-Triphosphate Nucleotidohydrolase; Chain A |
| 同源超家族 H-superfamily homologous superfamily | 10 — Deoxyuridine triphosphatase (dUTPase) |