2hs3

T. maritima PurL complexed with FGAR

Method: X-RAY DIFFRACTION
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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Phosphoribosylformylglycinamidine synthase II

Thermotoga maritima

UniProt Q9X0X3

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白单体 单体 蛋白 1 PHOSPHATE ION × 1 N-(N-FORMYLGLYCYL)-5-O-PHOSPHONO-BETA-D-RIBOFURANOSYLAMINE × 1 water × 1 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 PURL_THEMA
Isoform —
PDB实体 1
链与序列区间 作者链 A; PDB构建体 1–603; UniProt 1–603

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中;数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护,因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id2hs3
沉积日期 deposition_date2006-07-21
结构标题 titleT. maritima PurL complexed with FGAR
关键词 keywordsbeta barrel; alpha-beta structure, ligase; LIGASE
实验方法 methodX-RAY DIFFRACTION
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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

2hs3__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

2hs3__assembly_1__model_1 | I(q)

10-2 10-1 105 106 107 q (1/Angstrom) I(q)
100 个绘图点;横轴和纵轴均采用对数尺度。

2hs3__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

新版 assembly/model P(r) 尚未计算 此处仅保留位置,不展示旧数据 r (Angstrom) P(r)
P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。
Rg(Guinier)25.16 Å
Rg(电子密度)24.50 Å
总 Rg25.34 Å
原子数4643
残基数602
排除体积82971 ų
最大 q0.500 Å⁻¹
Assembly Model 结构单元 聚集说明 状态 CRYSOL 操作
1 1 2hs3__assembly_1__model_1 monomeric (1) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (4)

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6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 8 domains

SCOP 2.08 (4 domains)

结构域编号 domain_idd2hs3a1
类 Class classd — Alpha and beta proteins (a+b)
折叠类型 Fold foldd.79 — Bacillus chorismate mutase-like
超家族 Superfamily superfamilyd.79.4 — PurM N-terminal domain-like
家族 Family familyd.79.4.1 — PurM N-terminal domain-like
结构域编号 domain_idd2hs3a2
类 Class classd — Alpha and beta proteins (a+b)
折叠类型 Fold foldd.79 — Bacillus chorismate mutase-like
超家族 Superfamily superfamilyd.79.4 — PurM N-terminal domain-like
家族 Family familyd.79.4.1 — PurM N-terminal domain-like
结构域编号 domain_idd2hs3a3
类 Class classd — Alpha and beta proteins (a+b)
折叠类型 Fold foldd.139 — PurM C-terminal domain-like
超家族 Superfamily superfamilyd.139.1 — PurM C-terminal domain-like
家族 Family familyd.139.1.1 — PurM C-terminal domain-like
结构域编号 domain_idd2hs3a4
类 Class classd — Alpha and beta proteins (a+b)
折叠类型 Fold foldd.139 — PurM C-terminal domain-like
超家族 Superfamily superfamilyd.139.1 — PurM C-terminal domain-like
家族 Family familyd.139.1.1 — PurM C-terminal domain-like

CATH v4.4 (4 domains)

结构域编号 domain_id2hs3A01
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture90 — Alpha-Beta Complex
拓扑 Topology topology650 — Phosphoribosyl-aminoimidazole Synthetase; Chain A, domain 2
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — PurM-like C-terminal domain
结构域编号 domain_id2hs3A02
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology1330 — 60s Ribosomal Protein L30; Chain: A;
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — PurM-like, N-terminal domain
结构域编号 domain_id2hs3A03
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology1330 — 60s Ribosomal Protein L30; Chain: A;
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — PurM-like, N-terminal domain
结构域编号 domain_id2hs3A04
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology70 — Alpha-Beta Plaits
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily1670 — Formylglycinamide ribonucleotide amidotransferase, C-terminal domain
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7. 引用文献 (1)