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2ht0

IHF bound to doubly nicked DNA

Method: X-RAY DIFFRACTION
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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Integration host factor alpha-subunit

物种未注明

UniProt P0A6X7

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白–DNA 异源复合物 蛋白 2 DNA 4 5'-D(*CP*GP*GP*TP*GP*CP*AP*AP*CP*AP*AP*AP*T)-3' × 1 5'-D(*TP*GP*AP*TP*AP*AP*GP*CP*AP*AP*TP*GP*CP*TP*TP*TP*TP*TP*TP*GP*GP*C)-3' × 1 5'-D(*GP*GP*CP*CP*AP*AP*AP*AP*AP*AP*GP*CP*AP*TP*T)-3' × 1 5'-D(*GP*CP*TP*TP*AP*TP*CP*AP*AP*TP*TP*TP*GP*TP*TP*GP*CP*AP*CP*C)-3' × 1 Integration host factor beta-subunit × 1 （P0A6Y1） CADMIUM ION × 1 water × 6 与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

单体

暂无

同源二聚体

暂无

同源四聚体

暂无

其他同源多聚体

暂无

异源或核酸复合物
1ihf 1ouz 1owf 1owg 2ht0 2iie 2iif 9f0x 9f0y 9f0z 9f10 9f11

共 13 个 assembly，这里只显示前 12 个

查看构建体与数据证据
UniProt名称 IHFA_ECOLI
Isoform —
PDB实体 5
链与序列区间 作者链 A； PDB构建体 1–99； UniProt 1–99

Integration host factor beta-subunit

物种未注明

UniProt P0A6Y1

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白–DNA 异源复合物 蛋白 2 DNA 4 5'-D(*CP*GP*GP*TP*GP*CP*AP*AP*CP*AP*AP*AP*T)-3' × 1 5'-D(*TP*GP*AP*TP*AP*AP*GP*CP*AP*AP*TP*GP*CP*TP*TP*TP*TP*TP*TP*GP*GP*C)-3' × 1 5'-D(*GP*GP*CP*CP*AP*AP*AP*AP*AP*AP*GP*CP*AP*TP*T)-3' × 1 5'-D(*GP*CP*TP*TP*AP*TP*CP*AP*AP*TP*TP*TP*GP*TP*TP*GP*CP*AP*CP*C)-3' × 1 Integration host factor alpha-subunit × 1 （P0A6X7） CADMIUM ION × 1 water × 6 与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

单体

暂无

同源二聚体

暂无

同源四聚体

暂无

其他同源多聚体

暂无

异源或核酸复合物
1ihf 1ouz 1owf 1owg 2ht0 2iie 2iif 9f0x 9f0y 9f0z 9f10 9f11

共 13 个 assembly，这里只显示前 12 个

查看构建体与数据证据
UniProt名称 IHFB_ECOLI
Isoform —
PDB实体 6
链与序列区间 作者链 B； PDB构建体 1–94； UniProt 1–94

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id2ht0
沉积日期 deposition_date2006-07-24
结构标题 titleIHF bound to doubly nicked DNA
关键词 keywordsDNA bending, kink, nick, protein-DNA complex, TRANSCRIPTION-DNA COMPLEX; TRANSCRIPTION/DNA
实验方法 methodX-RAY DIFFRACTION
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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

2ht0__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

2ht0__assembly_1__model_1 | I(q)

10-2 10-1 106 107 q (1/Angstrom) I(q)
100 个绘图点；横轴和纵轴均采用对数尺度。

2ht0__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

新版 assembly/model P(r) 尚未计算 此处仅保留位置，不展示旧数据 r (Angstrom) P(r)
P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。
Rg（Guinier）23.80 Å
Rg（电子密度）22.34 Å
总 Rg23.13 Å
原子数2937
残基数259
排除体积47723 ų
最大 q0.500 Å⁻¹
Assembly Model 结构单元 聚集说明 状态 CRYSOL 操作
1 1 2ht0__assembly_1__model_1 hexameric （6） 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (8)

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6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 4 domains

SCOP 2.08 (2 domains)

结构域编号 domain_idd2ht0a_
类 Class classa — All alpha proteins
折叠类型 Fold folda.55 — IHF-like DNA-binding proteins
超家族 Superfamily superfamilya.55.1 — IHF-like DNA-binding proteins
家族 Family familya.55.1.1 — Prokaryotic DNA-bending protein
结构域编号 domain_idd2ht0b_
类 Class classa — All alpha proteins
折叠类型 Fold folda.55 — IHF-like DNA-binding proteins
超家族 Superfamily superfamilya.55.1 — IHF-like DNA-binding proteins
家族 Family familya.55.1.1 — Prokaryotic DNA-bending protein

CATH v4.4 (2 domains)

结构域编号 domain_id2ht0A00
类 Class class4 — Few Secondary Structures
架构 Architecture architecture10 — Irregular
拓扑 Topology topology520 — HU Protein; Chain A
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — IHF-like DNA-binding proteins
结构域编号 domain_id2ht0B00
类 Class class4 — Few Secondary Structures
架构 Architecture architecture10 — Irregular
拓扑 Topology topology520 — HU Protein; Chain A
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — IHF-like DNA-binding proteins
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7. 引用文献 (2)