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2kox

NMR residual dipolar couplings identify long range correlated motions in the backbone of the protein ubiquitin

Method: SOLUTION NMR
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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Ubiquitin

Homo sapiens

UniProt P62988

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白单体 单体 蛋白 1 无其他共同聚合物 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

单体
1c3t 1d3z 1g6j 1sif 1ubi 1ubq 2gbj 2gbj 2gbk 2gbk 2gbk 2gbk

共 48 个 assembly，这里只显示前 12 个

同源二聚体
1tbe 2bgf 2gbk 2gbk 2gbr 2jf5 2pe9 2pea 2xk5 3h7p 3h7s 3nob

共 16 个 assembly，这里只显示前 12 个

同源四聚体
1f9j 2o6v 2o6v 2o6v 2xew 2xew 2xew

共 7 个 assembly

其他同源多聚体
2gbr 2zcb 3eec 3eec

共 4 个 assembly

异源或核酸复合物
1fxt 1nbf 1nbf 1q5w 1s1q 1s1q 1xd3 1xd3 1yx5 1yx6 2ayo 2ayo

共 64 个 assembly，这里只显示前 12 个

查看构建体与数据证据
UniProt名称 UBIQ_HUMAN
Isoform —
PDB实体 1
链与序列区间 作者链 A； PDB构建体 1–76； UniProt 1–76

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id2kox
沉积日期 deposition_date2009-10-02
结构标题 titleNMR residual dipolar couplings identify long range correlated motions in the backbone of the protein ubiquitin
关键词 keywordsubiquitin, residual dipolar coupling, simulated annealing, Isopeptide bond, Nucleus, Phosphoprotein, SIGNALING PROTEIN; SIGNALING PROTEIN
实验方法 methodSOLUTION NMR
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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

2kox__assembly_1__model_309

Assembly 1 · Model 309 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

2kox__assembly_1__model_309 | I(q)

10-2 10-1 105 106 q (1/Angstrom) I(q)
100 个绘图点；横轴和纵轴均采用对数尺度。

2kox__assembly_1__model_309 | P(r) · Pending

新版 assembly/model P(r) 尚未计算 此处仅保留位置，不展示旧数据 r (Angstrom) P(r)
P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。
Rg（Guinier）13.42 Å
Rg（电子密度）11.77 Å
总 Rg13.22 Å
原子数1231
残基数76
排除体积10817 ų
最大 q0.500 Å⁻¹
Assembly Model 结构单元 聚集说明 状态 CRYSOL 操作
1 1 2kox__assembly_1__model_1 monomeric （1） 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 2 2kox__assembly_1__model_2 monomeric （1） 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 3 2kox__assembly_1__model_3 monomeric （1） 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 4 2kox__assembly_1__model_4 monomeric （1） 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 5 2kox__assembly_1__model_5 monomeric （1） 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 6 2kox__assembly_1__model_6 monomeric （1） 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 7 2kox__assembly_1__model_7 monomeric （1） 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 8 2kox__assembly_1__model_8 monomeric （1） 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 9 2kox__assembly_1__model_9 monomeric （1） 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 10 2kox__assembly_1__model_10 monomeric （1） 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 11 2kox__assembly_1__model_11 monomeric （1） 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 12 2kox__assembly_1__model_12 monomeric （1） 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 13 2kox__assembly_1__model_13 monomeric （1） 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 14 2kox__assembly_1__model_14 monomeric （1） 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 15 2kox__assembly_1__model_15 monomeric （1） 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 16 2kox__assembly_1__model_16 monomeric （1） 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 17 2kox__assembly_1__model_17 monomeric （1） 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 18 2kox__assembly_1__model_18 monomeric （1） 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 19 2kox__assembly_1__model_19 monomeric （1） 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 20 2kox__assembly_1__model_20 monomeric （1） 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 21 2kox__assembly_1__model_21 monomeric （1） 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
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1 29 2kox__assembly_1__model_29 monomeric （1） 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 30 2kox__assembly_1__model_30 monomeric （1） 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 31 2kox__assembly_1__model_31 monomeric （1） 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 32 2kox__assembly_1__model_32 monomeric （1） 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 33 2kox__assembly_1__model_33 monomeric （1） 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
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1 40 2kox__assembly_1__model_40 monomeric （1） 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 41 2kox__assembly_1__model_41 monomeric （1） 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
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1 50 2kox__assembly_1__model_50 monomeric （1） 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 51 2kox__assembly_1__model_51 monomeric （1） 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 52 2kox__assembly_1__model_52 monomeric （1） 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 53 2kox__assembly_1__model_53 monomeric （1） 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
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1 55 2kox__assembly_1__model_55 monomeric （1） 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
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1 60 2kox__assembly_1__model_60 monomeric （1） 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 61 2kox__assembly_1__model_61 monomeric （1） 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 62 2kox__assembly_1__model_62 monomeric （1） 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 63 2kox__assembly_1__model_63 monomeric （1） 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 64 2kox__assembly_1__model_64 monomeric （1） 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 65 2kox__assembly_1__model_65 monomeric （1） 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 66 2kox__assembly_1__model_66 monomeric （1） 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
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1 68 2kox__assembly_1__model_68 monomeric （1） 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 69 2kox__assembly_1__model_69 monomeric （1） 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 70 2kox__assembly_1__model_70 monomeric （1） 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 71 2kox__assembly_1__model_71 monomeric （1） 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 72 2kox__assembly_1__model_72 monomeric （1） 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 73 2kox__assembly_1__model_73 monomeric （1） 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 74 2kox__assembly_1__model_74 monomeric （1） 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 75 2kox__assembly_1__model_75 monomeric （1） 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 76 2kox__assembly_1__model_76 monomeric （1） 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 77 2kox__assembly_1__model_77 monomeric （1） 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 78 2kox__assembly_1__model_78 monomeric （1） 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 79 2kox__assembly_1__model_79 monomeric （1） 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 80 2kox__assembly_1__model_80 monomeric （1） 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 81 2kox__assembly_1__model_81 monomeric （1） 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 82 2kox__assembly_1__model_82 monomeric （1） 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 83 2kox__assembly_1__model_83 monomeric （1） 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 84 2kox__assembly_1__model_84 monomeric （1） 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 85 2kox__assembly_1__model_85 monomeric （1） 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 86 2kox__assembly_1__model_86 monomeric （1） 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 87 2kox__assembly_1__model_87 monomeric （1） 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
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1 89 2kox__assembly_1__model_89 monomeric （1） 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 90 2kox__assembly_1__model_90 monomeric （1） 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 91 2kox__assembly_1__model_91 monomeric （1） 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 92 2kox__assembly_1__model_92 monomeric （1） 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 93 2kox__assembly_1__model_93 monomeric （1） 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 94 2kox__assembly_1__model_94 monomeric （1） 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 95 2kox__assembly_1__model_95 monomeric （1） 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 96 2kox__assembly_1__model_96 monomeric （1） 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 97 2kox__assembly_1__model_97 monomeric （1） 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 98 2kox__assembly_1__model_98 monomeric （1） 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 99 2kox__assembly_1__model_99 monomeric （1） 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 100 2kox__assembly_1__model_100 monomeric （1） 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 101 2kox__assembly_1__model_101 monomeric （1） 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 102 2kox__assembly_1__model_102 monomeric （1） 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 103 2kox__assembly_1__model_103 monomeric （1） 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 104 2kox__assembly_1__model_104 monomeric （1） 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 105 2kox__assembly_1__model_105 monomeric （1） 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 106 2kox__assembly_1__model_106 monomeric （1） 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 107 2kox__assembly_1__model_107 monomeric （1） 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 108 2kox__assembly_1__model_108 monomeric （1） 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
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1 110 2kox__assembly_1__model_110 monomeric （1） 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
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1 113 2kox__assembly_1__model_113 monomeric （1） 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 114 2kox__assembly_1__model_114 monomeric （1） 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
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1 126 2kox__assembly_1__model_126 monomeric （1） 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 127 2kox__assembly_1__model_127 monomeric （1） 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
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1 640 2kox__assembly_1__model_640 monomeric （1） 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (1)

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6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 1 domains

CATH v4.4 (1 domains)

结构域编号 domain_id2koxA00
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture10 — Roll
拓扑 Topology topology20 — Ubiquitin-like (UB roll)
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily90 — Phosphatidylinositol 3-kinase Catalytic Subunit; Chain A, domain 1
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7. 引用文献 (1)