2ku2

Dynamic Regulation of Archaeal Proteasome Gate Opening as Studied by TROSY-NMR

Method: SOLUTION NMR
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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Proteasome subunit alpha

Thermoplasma acidophilum

UniProt P25156

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白同源多聚体 同源多聚体 蛋白 7 无其他共同聚合物 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 PSMA_THEAC
Isoform —
PDB实体 1
链与序列区间 作者链 A; PDB构建体 5–237; UniProt 1–233 作者链 B; PDB构建体 5–237; UniProt 1–233 作者链 C; PDB构建体 5–237; UniProt 1–233 作者链 D; PDB构建体 5–237; UniProt 1–233 作者链 E; PDB构建体 5–237; UniProt 1–233 作者链 F; PDB构建体 5–237; UniProt 1–233 作者链 G; PDB构建体 5–237; UniProt 1–233

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中;数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护,因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id2ku2
沉积日期 deposition_date2010-02-11
结构标题 titleDynamic Regulation of Archaeal Proteasome Gate Opening as Studied by TROSY-NMR
关键词 keywordsproteasome, proteolysis, gating residues, Cytoplasm, Hydrolase, Protease, Threonine protease; HYDROLASE
实验方法 methodSOLUTION NMR
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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

2ku2__assembly_1__model_33

Assembly 1 · Model 33 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

2ku2__assembly_1__model_33 | I(q)

10-2 10-1 106 107 108 q (1/Angstrom) I(q)
100 个绘图点;横轴和纵轴均采用对数尺度。

2ku2__assembly_1__model_33 | P(r) · Pending

新版 assembly/model P(r) 尚未计算 此处仅保留位置,不展示旧数据 r (Angstrom) P(r)
P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。
Rg(Guinier)39.98 Å
Rg(电子密度)39.93 Å
总 Rg40.30 Å
原子数25802
残基数1659
排除体积228820 ų
最大 q0.500 Å⁻¹
Assembly Model 结构单元 聚集说明 状态 CRYSOL 操作
1 1 2ku2__assembly_1__model_1 heptameric (7) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 2 2ku2__assembly_1__model_2 heptameric (7) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 3 2ku2__assembly_1__model_3 heptameric (7) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 4 2ku2__assembly_1__model_4 heptameric (7) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 5 2ku2__assembly_1__model_5 heptameric (7) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 6 2ku2__assembly_1__model_6 heptameric (7) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 7 2ku2__assembly_1__model_7 heptameric (7) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 8 2ku2__assembly_1__model_8 heptameric (7) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 9 2ku2__assembly_1__model_9 heptameric (7) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 10 2ku2__assembly_1__model_10 heptameric (7) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 11 2ku2__assembly_1__model_11 heptameric (7) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 12 2ku2__assembly_1__model_12 heptameric (7) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 13 2ku2__assembly_1__model_13 heptameric (7) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 14 2ku2__assembly_1__model_14 heptameric (7) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 15 2ku2__assembly_1__model_15 heptameric (7) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 16 2ku2__assembly_1__model_16 heptameric (7) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 17 2ku2__assembly_1__model_17 heptameric (7) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 18 2ku2__assembly_1__model_18 heptameric (7) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 19 2ku2__assembly_1__model_19 heptameric (7) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 20 2ku2__assembly_1__model_20 heptameric (7) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 21 2ku2__assembly_1__model_21 heptameric (7) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 22 2ku2__assembly_1__model_22 heptameric (7) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 23 2ku2__assembly_1__model_23 heptameric (7) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 24 2ku2__assembly_1__model_24 heptameric (7) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 25 2ku2__assembly_1__model_25 heptameric (7) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 26 2ku2__assembly_1__model_26 heptameric (7) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 27 2ku2__assembly_1__model_27 heptameric (7) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 28 2ku2__assembly_1__model_28 heptameric (7) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 29 2ku2__assembly_1__model_29 heptameric (7) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 30 2ku2__assembly_1__model_30 heptameric (7) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 31 2ku2__assembly_1__model_31 heptameric (7) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 32 2ku2__assembly_1__model_32 heptameric (7) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 33 2ku2__assembly_1__model_33 heptameric (7) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 34 2ku2__assembly_1__model_34 heptameric (7) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 35 2ku2__assembly_1__model_35 heptameric (7) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 36 2ku2__assembly_1__model_36 heptameric (7) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 37 2ku2__assembly_1__model_37 heptameric (7) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 38 2ku2__assembly_1__model_38 heptameric (7) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 39 2ku2__assembly_1__model_39 heptameric (7) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 40 2ku2__assembly_1__model_40 heptameric (7) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 41 2ku2__assembly_1__model_41 heptameric (7) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 42 2ku2__assembly_1__model_42 heptameric (7) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 43 2ku2__assembly_1__model_43 heptameric (7) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 44 2ku2__assembly_1__model_44 heptameric (7) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 45 2ku2__assembly_1__model_45 heptameric (7) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 46 2ku2__assembly_1__model_46 heptameric (7) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 47 2ku2__assembly_1__model_47 heptameric (7) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 48 2ku2__assembly_1__model_48 heptameric (7) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 49 2ku2__assembly_1__model_49 heptameric (7) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 50 2ku2__assembly_1__model_50 heptameric (7) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (1)

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6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 21 domains

SCOP 2.08 (14 domains)

结构域编号 domain_idd2ku2a1
类 Class classd — Alpha and beta proteins (a+b)
折叠类型 Fold foldd.153 — Ntn hydrolase-like
超家族 Superfamily superfamilyd.153.1 — N-terminal nucleophile aminohydrolases (Ntn hydrolases)
家族 Family familyd.153.1.4 — Proteasome subunits
结构域编号 domain_idd2ku2a2
类 Class classl — Artifacts
折叠类型 Fold foldl.1 — Tags
超家族 Superfamily superfamilyl.1.1 — Tags
家族 Family familyl.1.1.1 — Tags
结构域编号 domain_idd2ku2b1
类 Class classd — Alpha and beta proteins (a+b)
折叠类型 Fold foldd.153 — Ntn hydrolase-like
超家族 Superfamily superfamilyd.153.1 — N-terminal nucleophile aminohydrolases (Ntn hydrolases)
家族 Family familyd.153.1.4 — Proteasome subunits
结构域编号 domain_idd2ku2b2
类 Class classl — Artifacts
折叠类型 Fold foldl.1 — Tags
超家族 Superfamily superfamilyl.1.1 — Tags
家族 Family familyl.1.1.1 — Tags
结构域编号 domain_idd2ku2c1
类 Class classd — Alpha and beta proteins (a+b)
折叠类型 Fold foldd.153 — Ntn hydrolase-like
超家族 Superfamily superfamilyd.153.1 — N-terminal nucleophile aminohydrolases (Ntn hydrolases)
家族 Family familyd.153.1.4 — Proteasome subunits
结构域编号 domain_idd2ku2c2
类 Class classl — Artifacts
折叠类型 Fold foldl.1 — Tags
超家族 Superfamily superfamilyl.1.1 — Tags
家族 Family familyl.1.1.1 — Tags
结构域编号 domain_idd2ku2d1
类 Class classd — Alpha and beta proteins (a+b)
折叠类型 Fold foldd.153 — Ntn hydrolase-like
超家族 Superfamily superfamilyd.153.1 — N-terminal nucleophile aminohydrolases (Ntn hydrolases)
家族 Family familyd.153.1.4 — Proteasome subunits
结构域编号 domain_idd2ku2d2
类 Class classl — Artifacts
折叠类型 Fold foldl.1 — Tags
超家族 Superfamily superfamilyl.1.1 — Tags
家族 Family familyl.1.1.1 — Tags
结构域编号 domain_idd2ku2e1
类 Class classd — Alpha and beta proteins (a+b)
折叠类型 Fold foldd.153 — Ntn hydrolase-like
超家族 Superfamily superfamilyd.153.1 — N-terminal nucleophile aminohydrolases (Ntn hydrolases)
家族 Family familyd.153.1.4 — Proteasome subunits
结构域编号 domain_idd2ku2e2
类 Class classl — Artifacts
折叠类型 Fold foldl.1 — Tags
超家族 Superfamily superfamilyl.1.1 — Tags
家族 Family familyl.1.1.1 — Tags
结构域编号 domain_idd2ku2f1
类 Class classd — Alpha and beta proteins (a+b)
折叠类型 Fold foldd.153 — Ntn hydrolase-like
超家族 Superfamily superfamilyd.153.1 — N-terminal nucleophile aminohydrolases (Ntn hydrolases)
家族 Family familyd.153.1.4 — Proteasome subunits
结构域编号 domain_idd2ku2f2
类 Class classl — Artifacts
折叠类型 Fold foldl.1 — Tags
超家族 Superfamily superfamilyl.1.1 — Tags
家族 Family familyl.1.1.1 — Tags
结构域编号 domain_idd2ku2g1
类 Class classd — Alpha and beta proteins (a+b)
折叠类型 Fold foldd.153 — Ntn hydrolase-like
超家族 Superfamily superfamilyd.153.1 — N-terminal nucleophile aminohydrolases (Ntn hydrolases)
家族 Family familyd.153.1.4 — Proteasome subunits
结构域编号 domain_idd2ku2g2
类 Class classl — Artifacts
折叠类型 Fold foldl.1 — Tags
超家族 Superfamily superfamilyl.1.1 — Tags
家族 Family familyl.1.1.1 — Tags

CATH v4.4 (7 domains)

结构域编号 domain_id2ku2A00
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture60 — 4-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology20 — Glutamine Phosphoribosylpyrophosphate, subunit 1, domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — Aminohydrolase, N-terminal nucleophile (Ntn) domain
结构域编号 domain_id2ku2B00
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture60 — 4-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology20 — Glutamine Phosphoribosylpyrophosphate, subunit 1, domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — Aminohydrolase, N-terminal nucleophile (Ntn) domain
结构域编号 domain_id2ku2C00
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture60 — 4-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology20 — Glutamine Phosphoribosylpyrophosphate, subunit 1, domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — Aminohydrolase, N-terminal nucleophile (Ntn) domain
结构域编号 domain_id2ku2D01
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture60 — 4-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology20 — Glutamine Phosphoribosylpyrophosphate, subunit 1, domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — Aminohydrolase, N-terminal nucleophile (Ntn) domain
结构域编号 domain_id2ku2E01
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture60 — 4-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology20 — Glutamine Phosphoribosylpyrophosphate, subunit 1, domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — Aminohydrolase, N-terminal nucleophile (Ntn) domain
结构域编号 domain_id2ku2F01
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture60 — 4-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology20 — Glutamine Phosphoribosylpyrophosphate, subunit 1, domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — Aminohydrolase, N-terminal nucleophile (Ntn) domain
结构域编号 domain_id2ku2G01
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture60 — 4-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology20 — Glutamine Phosphoribosylpyrophosphate, subunit 1, domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — Aminohydrolase, N-terminal nucleophile (Ntn) domain
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7. 引用文献 (1)