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2lwe

Solution structure of mutant (T170E) second CARD of human RIG-I

Method: SOLUTION NMR Dmax: 38.4 Å Quality: GOOD
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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Probable ATP-dependent RNA helicase DDX58

Homo sapiens

UniProt O95786

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白单体 单体 蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白拷贝数一致 链 A； UniProt 95–190 片段：CARD 2 domain 突变：T170E 无其他共同聚合物 SOLUTION NMR NMR测量条件：pH 7.5；298 K；离子强度（mmCIF原始值）250；压力 ambient NMR样品组成：300 uM [U-100% 15N] card2, 95% H2O/5% D2O | 95% H2O/5% D2O NMR样品组成：300 uM [U-100% 13C; U-100% 15N] card2, 95% H2O/5% D2O | 95% H2O/5% D2O NMR样品组成：300 uM [U-100% 13C; U-100% 15N] card2, 100% D2O | 100% D2O 分辨率未提供

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 2LWE Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
2LWD Solution structure of second CARD of human RIG-I 提交 2012-07-27 突变/修饰不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 95–190（96 aa） 片段：CARD 2 domain
未记录 未记录非水小分子 SOLUTION NMR
NMR测量条件 pH 7.5；298 K；离子强度（mmCIF原始值）250；压力 ambient
NMR样品组成 300 uM [U-100% 15N] card2, 95% H2O/5% D2O | 95% H2O/5% D2O
NMR样品组成 300 uM [U-100% 13C; U-100% 15N] card2, 95% H2O/5% D2O | 95% H2O/5% D2O
NMR样品组成 300 uM [U-100% 13C; U-100% 15N] card2, 100% D2O | 100% D2O
分辨率未提供
2QFB Crystal structure of the regulatory domain of human RIG-I with bound Zn 提交 2007-06-27 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 802–925（124 aa） 片段：Regulatory domain
未记录 ZN ZINC ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 10；293.15 K；0.1 M CHES, 18% w/v PEG 8000, pH 10.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293.15K
分辨率 3.00 Å R-free 0.285
2QFB Crystal structure of the regulatory domain of human RIG-I with bound Zn 提交 2007-06-27 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 10 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 J 802–925（124 aa） 片段：Regulatory domain
未记录 ZN ZINC ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 10；293.15 K；0.1 M CHES, 18% w/v PEG 8000, pH 10.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293.15K
分辨率 3.00 Å R-free 0.285
2QFB Crystal structure of the regulatory domain of human RIG-I with bound Zn 提交 2007-06-27 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 802–925（124 aa） 片段：Regulatory domain
未记录 ZN ZINC ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 10；293.15 K；0.1 M CHES, 18% w/v PEG 8000, pH 10.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293.15K
分辨率 3.00 Å R-free 0.285
2QFB Crystal structure of the regulatory domain of human RIG-I with bound Zn 提交 2007-06-27 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 C 802–925（124 aa） 片段：Regulatory domain
未记录 ZN ZINC ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 10；293.15 K；0.1 M CHES, 18% w/v PEG 8000, pH 10.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293.15K
分辨率 3.00 Å R-free 0.285
2QFB Crystal structure of the regulatory domain of human RIG-I with bound Zn 提交 2007-06-27 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 D 802–925（124 aa） 片段：Regulatory domain
未记录 ZN ZINC ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 10；293.15 K；0.1 M CHES, 18% w/v PEG 8000, pH 10.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293.15K
分辨率 3.00 Å R-free 0.285
2QFB Crystal structure of the regulatory domain of human RIG-I with bound Zn 提交 2007-06-27 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 5 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 E 802–925（124 aa） 片段：Regulatory domain
未记录 ZN ZINC ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 10；293.15 K；0.1 M CHES, 18% w/v PEG 8000, pH 10.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293.15K
分辨率 3.00 Å R-free 0.285
2QFB Crystal structure of the regulatory domain of human RIG-I with bound Zn 提交 2007-06-27 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 6 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 F 802–925（124 aa） 片段：Regulatory domain
未记录 ZN ZINC ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 10；293.15 K；0.1 M CHES, 18% w/v PEG 8000, pH 10.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293.15K
分辨率 3.00 Å R-free 0.285
2QFB Crystal structure of the regulatory domain of human RIG-I with bound Zn 提交 2007-06-27 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 7 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 G 802–925（124 aa） 片段：Regulatory domain
未记录 ZN ZINC ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 10；293.15 K；0.1 M CHES, 18% w/v PEG 8000, pH 10.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293.15K
分辨率 3.00 Å R-free 0.285
2QFB Crystal structure of the regulatory domain of human RIG-I with bound Zn 提交 2007-06-27 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 8 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 H 802–925（124 aa） 片段：Regulatory domain
未记录 ZN ZINC ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 10；293.15 K；0.1 M CHES, 18% w/v PEG 8000, pH 10.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293.15K
分辨率 3.00 Å R-free 0.285
2QFB Crystal structure of the regulatory domain of human RIG-I with bound Zn 提交 2007-06-27 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 9 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 I 802–925（124 aa） 片段：Regulatory domain
未记录 ZN ZINC ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 10；293.15 K；0.1 M CHES, 18% w/v PEG 8000, pH 10.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293.15K
分辨率 3.00 Å R-free 0.285
2QFD Crystal structure of the regulatory domain of human RIG-I with bound Hg 提交 2007-06-27 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 802–925（124 aa） 片段：Regulatory domain
未记录 HG MERCURY (II) ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 10；293.15 K；0.1 M CHES pH 10.0, 18% w/v PEG 8000, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293.15K
分辨率 2.70 Å R-free 0.276
2QFD Crystal structure of the regulatory domain of human RIG-I with bound Hg 提交 2007-06-27 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 10 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 J 802–925（124 aa） 片段：Regulatory domain
未记录 HG MERCURY (II) ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 10；293.15 K；0.1 M CHES pH 10.0, 18% w/v PEG 8000, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293.15K
分辨率 2.70 Å R-free 0.276
2QFD Crystal structure of the regulatory domain of human RIG-I with bound Hg 提交 2007-06-27 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 802–925（124 aa） 片段：Regulatory domain
未记录 HG MERCURY (II) ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 10；293.15 K；0.1 M CHES pH 10.0, 18% w/v PEG 8000, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293.15K
分辨率 2.70 Å R-free 0.276
2QFD Crystal structure of the regulatory domain of human RIG-I with bound Hg 提交 2007-06-27 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 C 802–925（124 aa） 片段：Regulatory domain
未记录 HG MERCURY (II) ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 10；293.15 K；0.1 M CHES pH 10.0, 18% w/v PEG 8000, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293.15K
分辨率 2.70 Å R-free 0.276
2QFD Crystal structure of the regulatory domain of human RIG-I with bound Hg 提交 2007-06-27 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 D 802–925（124 aa） 片段：Regulatory domain
未记录 HG MERCURY (II) ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 10；293.15 K；0.1 M CHES pH 10.0, 18% w/v PEG 8000, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293.15K
分辨率 2.70 Å R-free 0.276
2QFD Crystal structure of the regulatory domain of human RIG-I with bound Hg 提交 2007-06-27 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 5 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 E 802–925（124 aa） 片段：Regulatory domain
未记录 HG MERCURY (II) ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 10；293.15 K；0.1 M CHES pH 10.0, 18% w/v PEG 8000, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293.15K
分辨率 2.70 Å R-free 0.276
2QFD Crystal structure of the regulatory domain of human RIG-I with bound Hg 提交 2007-06-27 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 6 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 F 802–925（124 aa） 片段：Regulatory domain
未记录 HG MERCURY (II) ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 10；293.15 K；0.1 M CHES pH 10.0, 18% w/v PEG 8000, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293.15K
分辨率 2.70 Å R-free 0.276
2QFD Crystal structure of the regulatory domain of human RIG-I with bound Hg 提交 2007-06-27 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 7 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 G 802–925（124 aa） 片段：Regulatory domain
未记录 HG MERCURY (II) ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 10；293.15 K；0.1 M CHES pH 10.0, 18% w/v PEG 8000, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293.15K
分辨率 2.70 Å R-free 0.276
2QFD Crystal structure of the regulatory domain of human RIG-I with bound Hg 提交 2007-06-27 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 8 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 H 802–925（124 aa） 片段：Regulatory domain
未记录 HG MERCURY (II) ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 10；293.15 K；0.1 M CHES pH 10.0, 18% w/v PEG 8000, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293.15K
分辨率 2.70 Å R-free 0.276
2QFD Crystal structure of the regulatory domain of human RIG-I with bound Hg 提交 2007-06-27 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 9 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 I 802–925（124 aa） 片段：Regulatory domain
未记录 HG MERCURY (II) ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 10；293.15 K；0.1 M CHES pH 10.0, 18% w/v PEG 8000, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293.15K
分辨率 2.70 Å R-free 0.276
2RMJ Solution structure of RIG-I C-terminal domain 提交 2007-10-23 构建体不同 突变/修饰不同 实验环境不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 792–925（134 aa） 片段：C-terminal domain
未记录 未记录非水小分子 SOLUTION NMR
NMR测量条件 pH 7；288 K；离子强度（mmCIF原始值）0.25
NMR样品组成 0.5mM [U-100% 13C; U-100% 15N] RIG-I, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
分辨率未提供
2YKG Structural insights into RNA recognition by RIG-I 提交 2011-05-27 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：trimeric
链 A 230–925（696 aa） 片段：RESIDUES 230-925
未记录 ZN ZINC ION × 1 SO4 SULFATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 9；0.1 M BICINE, PH 9.0, 22.5 % POLYETHYLENE GLYCOL 6,000
分辨率 2.50 Å R-free 0.273
3LRN Crystal structure of human RIG-I CTD bound to a 14 bp GC 5' ppp dsRNA 提交 2010-02-11 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：tetrameric
链 A 803–923（121 aa） 片段：human RIG-I CTD
链 B 803–923（121 aa） 片段：human RIG-I CTD
突变：C829S 突变：C829S ZN ZINC ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；277 K；15% PEG 3,350, ammonium sulfate, pH 5.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
分辨率 2.60 Å R-free 0.282
3LRR Crystal structure of human RIG-I CTD bound to a 12 bp AU rich 5' ppp dsRNA 提交 2010-02-11 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：tetrameric
链 A 803–923（121 aa） 片段：RIG-I CTD (UNP residues 803 to 923)
链 B 803–923（121 aa） 片段：RIG-I CTD (UNP residues 803 to 923)
未记录 ZN ZINC ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；277 K；PEG 3,350 (15%) plus ammonium sulfate, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
分辨率 2.15 Å R-free 0.228
3NCU Structural and functional insights into pattern recognition by the innate immune receptor RIG-I 提交 2010-06-05 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：tetrameric
链 A 792–925（134 aa） 片段：residues 792-925
链 B 792–925（134 aa） 片段：residues 792-925
未记录 ZN ZINC ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；277 K；27% (v/v) polyethylene glycerol 3350 (PEG 3350), 50 mM Tris-HCl, pH 7.5, 0.1 M KCl, and 10 mM MgCl2 , VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
分辨率 2.55 Å R-free 0.229
3OG8 Crystal structure of human RIG-I CTD bound to a 14-bp blunt-ended dsRNA 提交 2010-08-16 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：tetrameric
链 A 802–925（124 aa） 片段：C-terminal domain
链 B 802–925（124 aa） 片段：C-terminal domain
突变：C829S 突变：C829S ZN ZINC ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；277 K；27% PEG MME 550, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
分辨率 2.40 Å R-free 0.278
3ZD6 Snapshot 1 of RIG-I scanning on RNA duplex 提交 2012-11-25 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：trimeric
链 A 185–880（696 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 9；pH 9
分辨率 2.80 Å R-free 0.279
3ZD7 Snapshot 3 of RIG-I scanning on RNA duplex 提交 2012-11-25 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：trimeric
链 A 185–880（696 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 9；pH 9
分辨率 2.50 Å R-free 0.288
4AY2 Capturing 5' tri-phosphorylated RNA duplex by RIG-I 提交 2012-06-17 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：dimeric
链 A 239–925（687 aa） 片段：RESIDUES 239-925
未记录 ZN ZINC ION × 1 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 2.80 Å R-free 0.286
4BPB STRUCTURAL INSIGHTS INTO RNA RECOGNITION BY RIG-I 提交 2013-05-23 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：trimeric
链 A 230–925（696 aa） 片段：RESIDUES 230-925
未记录 ZN ZINC ION × 1 SO4 SULFATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 9；0.1 M BICINE, PH 9.0, 22.5 % POLYETHYLENE GLYCOL 6,000
分辨率 2.58 Å R-free 0.255
4NQK Structure of an Ubiquitin complex 提交 2013-11-25 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：decameric
链 A 1–200（200 aa） 片段：N-terminal tandem CARD domain, UNP residues 1-200
链 B 1–200（200 aa） 片段：N-terminal tandem CARD domain, UNP residues 1-200
链 C 1–200（200 aa） 片段：N-terminal tandem CARD domain, UNP residues 1-200
链 D 1–200（200 aa） 片段：N-terminal tandem CARD domain, UNP residues 1-200
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；293 K；22% PEG3350, 0.2 M Tri-Li Citrate, 3% ethylene glycol, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 3.70 Å R-free 0.285
4ON9 DECH box helicase domain 提交 2014-01-28 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 230–793（564 aa） 片段：UNP residues 230-793
未记录 SO4 SULFATE ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.8；288 K；1:1 RIG-I SF2 (60mg/ml) : reservoir solution (100mM HEPES pH=6.8, 100mM ammonium sulfate, 6.7%(v/v) Isopropanol, 9%(v/v) PEG4000), 4days, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 288K
分辨率 2.71 Å R-free 0.258
4ON9 DECH box helicase domain 提交 2014-01-28 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 230–793（564 aa） 片段：UNP residues 230-793
未记录 SO4 SULFATE ION × 2 CL CHLORIDE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.8；288 K；1:1 RIG-I SF2 (60mg/ml) : reservoir solution (100mM HEPES pH=6.8, 100mM ammonium sulfate, 6.7%(v/v) Isopropanol, 9%(v/v) PEG4000), 4days, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 288K
分辨率 2.71 Å R-free 0.258
4ON9 DECH box helicase domain 提交 2014-01-28 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 230–793（564 aa） 片段：UNP residues 230-793
链 B 230–793（564 aa） 片段：UNP residues 230-793
未记录 SO4 SULFATE ION × 4 CL CHLORIDE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.8；288 K；1:1 RIG-I SF2 (60mg/ml) : reservoir solution (100mM HEPES pH=6.8, 100mM ammonium sulfate, 6.7%(v/v) Isopropanol, 9%(v/v) PEG4000), 4days, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 288K
分辨率 2.71 Å R-free 0.258
4P4H Caught-in-action signaling complex of RIG-I 2CARD domain and MAVS CARD domain 提交 2014-03-12 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 21 PDB 声明：21-meric
链 A 1–201（201 aa）
链 B 1–201（201 aa）
链 C 1–201（201 aa）
链 D 1–201（201 aa）
链 E 1–201（201 aa）
链 F 1–201（201 aa）
链 G 1–201（201 aa）
链 H 1–201（201 aa）
突变：E52A 突变：E52A 突变：E52A 突变：E52A 突变：E52A 突变：E52A 突变：E52A 突变：E52A 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；291 K；Tri-Li Citrate, PEG 3350, Cr(III) Cl3
分辨率 3.40 Å R-free 0.240
5E3H Structural Basis for RNA Recognition and Activation of RIG-I 提交 2015-10-02 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：trimeric
链 A 232–925（694 aa） 片段：UNP residues 232-925
未记录 ZN ZINC ION × 1 MG MAGNESIUM ION × 3 GOL GLYCEROL × 1 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 BEF BERYLLIUM TRIFLUORIDE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；293 K；25% w/v PEG3350, 0.25 M sodium thiocyanate, 100 mM MOPS, pH 7.8, 3% v/v 2,2,2-trifluoroethanol
分辨率 2.70 Å R-free 0.268
5F98 Crystal structure of RIG-I in complex with Cap-0 RNA 提交 2015-12-09 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 同源多聚体；蛋白 × 6 PDB 声明：dodecameric
链 A 232–925（694 aa）
链 C 232–925（694 aa）
链 E 232–925（694 aa）
链 G 232–925（694 aa）
链 I 232–925（694 aa）
链 K 232–925（694 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 MG MAGNESIUM ION × 6 M7G 7N-METHYL-8-HYDROGUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 6 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；293 K；20% (w/v) PEG 3350, 0.2 M NaSCN, 100 mM MOPS (pH 7.8), 3.5% (v/v) 2,2,2-trifluoroethanol
分辨率 3.28 Å R-free 0.277
5F9F Crystal structure of RIG-I helicase-RD in complex with 24-mer blunt-end hairpin RNA 提交 2015-12-09 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 同源多聚体；蛋白 × 6 PDB 声明：dodecameric
链 A 187–880（694 aa）
链 C 187–880（694 aa）
链 E 187–880（694 aa）
链 G 187–880（694 aa）
链 I 187–880（694 aa）
链 K 187–880（694 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 MG MAGNESIUM ION × 6 ETF TRIFLUOROETHANOL × 4 BU3 (R,R)-2,3-BUTANEDIOL × 13 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；23% (w/v) PEG 3350, 0.3 M NaSCN, 100 mM MOPS (pH 7.8)
分辨率 2.60 Å R-free 0.259
5F9H Crystal structure of RIG-I helicase-RD in complex with 24-mer 5' triphosphate hairpin RNA 提交 2015-12-09 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 同源多聚体；蛋白 × 6 PDB 声明：dodecameric
链 A 232–925（694 aa）
链 C 232–925（694 aa）
链 E 232–925（694 aa）
链 G 232–925（694 aa）
链 I 232–925（694 aa）
链 K 232–925（694 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 MG MAGNESIUM ION × 8 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 6 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；23% (w/v) PEG 3350, 0.25 M KSCN, 100 mM MOPS (pH 7.8)
分辨率 3.10 Å R-free 0.266
6GPG Structure of the RIG-I Singleton-Merten syndrome variant C268F 提交 2018-06-05 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：trimeric
链 A 232–925（694 aa）
突变：C268F ZN ZINC ION × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；293 K；0.1 M MOPS pH 7.5, 17.5 % (w/v) PEG 3350, 0.25 M NaSCN, 3 % (v/v) 2,2,2 trifluoroethanol
分辨率 2.89 Å R-free 0.260
6KYV Crystal Structure of RIG-I and hairpin RNA with G-U wobble base pairs 提交 2019-09-20 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：dimeric
链 B 242–922（681 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；293 K；15% PEG 3350 (w/v), 100mM MES pH 6.5, 100mM NaSCN, 20mM Na Citrate tribasic
分辨率 3.00 Å R-free 0.274
6KYV Crystal Structure of RIG-I and hairpin RNA with G-U wobble base pairs 提交 2019-09-20 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白–RNA 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：dimeric
链 D 242–922（681 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；293 K；15% PEG 3350 (w/v), 100mM MES pH 6.5, 100mM NaSCN, 20mM Na Citrate tribasic
分辨率 3.00 Å R-free 0.274
6KYV Crystal Structure of RIG-I and hairpin RNA with G-U wobble base pairs 提交 2019-09-20 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白–RNA 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：dimeric
链 F 242–922（681 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；293 K；15% PEG 3350 (w/v), 100mM MES pH 6.5, 100mM NaSCN, 20mM Na Citrate tribasic
分辨率 3.00 Å R-free 0.274
6KYV Crystal Structure of RIG-I and hairpin RNA with G-U wobble base pairs 提交 2019-09-20 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白–RNA 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：dimeric
链 H 242–922（681 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；293 K；15% PEG 3350 (w/v), 100mM MES pH 6.5, 100mM NaSCN, 20mM Na Citrate tribasic
分辨率 3.00 Å R-free 0.274
6KYV Crystal Structure of RIG-I and hairpin RNA with G-U wobble base pairs 提交 2019-09-20 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 5 蛋白–RNA 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：dimeric
链 J 242–922（681 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；293 K；15% PEG 3350 (w/v), 100mM MES pH 6.5, 100mM NaSCN, 20mM Na Citrate tribasic
分辨率 3.00 Å R-free 0.274
6KYV Crystal Structure of RIG-I and hairpin RNA with G-U wobble base pairs 提交 2019-09-20 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 6 蛋白–RNA 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：dimeric
链 L 242–922（681 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；293 K；15% PEG 3350 (w/v), 100mM MES pH 6.5, 100mM NaSCN, 20mM Na Citrate tribasic
分辨率 3.00 Å R-free 0.274
7BAH Structure of RIG-I CTD bound to OH-RNA 提交 2020-12-15 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：tetrameric
链 A 802–925（124 aa）
链 B 802–925（124 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；283.15 K；0.1 M Tris-HCl pH 8.0 0.2 M NaCl 18% PEG 3350
分辨率 1.89 Å R-free 0.224
7BAI Structure of RIG-I CTD (I875A) bound to p-RNA 提交 2020-12-15 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：tetrameric
链 A 802–925（124 aa）
链 B 802–925（124 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；293.15 K；0.2 M thiocyanate pH 8.4 20% PEG 3350 10% ethylene glycol 10% MPD
分辨率 3.40 Å R-free 0.273
7BAI Structure of RIG-I CTD (I875A) bound to p-RNA 提交 2020-12-15 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白–RNA 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：tetrameric
链 E 802–925（124 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；293.15 K；0.2 M thiocyanate pH 8.4 20% PEG 3350 10% ethylene glycol 10% MPD
分辨率 3.40 Å R-free 0.273
7JL1 Cryo-EM structure of RIG-I:dsRNA in complex with RIPLET PrySpry domain (monomer) 提交 2020-07-29 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：tetrameric
链 A 159–880（722 aa） 片段：UNP residues 159-880
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ALF TETRAFLUOROALUMINATE ION × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.90 Å
7JL3 Cryo-EM structure of RIG-I:dsRNA filament in complex with RIPLET PrySpry domain (trimer) 提交 2020-07-29 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：octameric
链 A 159–880（722 aa） 片段：UNP residues 159-880
链 C 159–880（722 aa） 片段：UNP residues 159-880
链 E 159–880（722 aa） 片段：UNP residues 159-880
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 3 ALF TETRAFLUOROALUMINATE ION × 3 MG MAGNESIUM ION × 3 ZN ZINC ION × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.20 Å
7MK1 Structure of a protein-modified aptamer complex 提交 2021-04-21 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：dimeric
链 A 801–925（125 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；285.15 K；30% PEG3350, 0.01 M Na acetate pH 4.8
分辨率 1.90 Å R-free 0.220
7MK1 Structure of a protein-modified aptamer complex 提交 2021-04-21 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白–DNA 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：dimeric
链 B 801–925（125 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；285.15 K；30% PEG3350, 0.01 M Na acetate pH 4.8
分辨率 1.90 Å R-free 0.220
7TNX Cryo-EM structure of RIG-I in complex with p3dsRNA 提交 2022-01-22 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：trimeric
链 A 1–925（925 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.54 Å
7TNY Cryo-EM structure of RIG-I in complex with p2dsRNA 提交 2022-01-22 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：trimeric
链 A 1–925（925 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.20 Å
7TNZ Cryo-EM structure of RIG-I in complex with p1dsRNA 提交 2022-01-22 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：trimeric
链 A 1–925（925 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.54 Å
7TO0 Cryo-EM structure of RIG-I in complex with OHdsRNA 提交 2022-01-22 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：trimeric
链 A 1–925（925 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.50 Å
7TO1 Cryo-EM structure of RIG-I bound to the end of p3SLR30 (+ATP) 提交 2022-01-22 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：dimeric
链 A 1–925（925 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.66 Å
7TO2 Cryo-EM structure of RIG-I bound to the internal sites of p3SLR30 (+ATP) 提交 2022-01-22 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：dimeric
链 A 1–925（925 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.20 Å
8DVR Cryo-EM structure of RIG-I bound to the end of p3SLR30 (+AMPPNP) 提交 2022-07-29 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：dimeric
链 A 1–925（925 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.30 Å
8DVS Cryo-EM structure of RIG-I bound to the end of OHSLR30 (+ATP) 提交 2022-07-29 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：dimeric
链 A 1–925（925 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
8DVU Cryo-EM structure of RIG-I bound to the internal sites of OHSLR30 (+ATP) 提交 2022-07-29 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：dimeric
链 A 1–925（925 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
8G7T Cryo-EM structure of Riplet:RIG-I:dsRNA complex (end-end) 提交 2023-02-17 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：hexameric
链 A 1–925（925 aa）
链 C 1–925（925 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.20 Å
8G7U Cryo-EM structure of Riplet:RIG-I:dsRNA complex (end-semi-closed end) 提交 2023-02-17 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：hexameric
链 A 1–925（925 aa）
链 C 1–925（925 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.00 Å
8G7V Cryo-EM structure of Riplet:RIG-I:dsRNA complex (end-inter) 提交 2023-02-17 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：hexameric
链 A 1–925（925 aa）
链 C 1–925（925 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.90 Å
8SCZ Cryo-EM structure of 14aa-GS RIG-I in complex with p3SLR30 提交 2023-04-06 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：dimeric
链 A 1–925（925 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.40 Å
8SD0 Cryo-EM structure of RIG-I in complex with p3SLR14 提交 2023-04-06 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：dimeric
链 A 1–925（925 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.80 Å
9KTW Cryo-EM structure of wild type RIG-I with 5'p-RNA 提交 2024-12-03 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：dimeric
链 B 1–925（925 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4；25mM HEPES, 150mM NaCl
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.60 Å
9KU4 Cryo-EM structure of E373A mutant RIG-I with 5'p-RNA 提交 2024-12-03 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：dimeric
链 B 1–925（925 aa）
突变：E373A ZN ZINC ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4；25mM HEPES, 150mM NaCl
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.40 Å

共 43 个其他 PDB 条目、70 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 DDX58_HUMAN
Isoform —
PDB实体 1
链与序列区间 作者链 A； PDB构建体 5–100； UniProt 95–190

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

SAXS profile for 2lwe

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

P(r) distribution for 2lwe
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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id2lwe
沉积日期 deposition_date2012-07-27
结构标题 titleSolution structure of mutant (T170E) second CARD of human RIG-I
关键词 keywordsRIG-I, CARD, SENSOR, VIRAL RNA, HELICASE, PHOSPHOMEMETIC MUTANT, SIGNALING PROTEIN; SIGNALING PROTEIN
实验方法 methodSOLUTION NMR
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3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

回转半径 Rg (Guinier) rg_guinier12.83 Å
回转半径 Rg (电子) rg_electron12.65 Å
零角强度 I(0) i0657188000.00
分子量 molecular_weight227570.0 kDa
排除体积 excluded_volume289680 ų
包络体积 envelope_volume20991 ų
水化壳体积 shell_volume12660 ų
包络直径 envelope_diameter48.5 Å
壳层 Rg shell_rg20.02 Å
包络 Rg envelope_rg14.49 Å
形状 Rg shape_rg12.59 Å
总 Rg total_rg13.02 Å
总原子数 total_atoms29440
残基数 n_residues1920
球谐函数阶数 n_harmonics20
q 范围 q_range— – 0.5000 Å−1
数据点数 n_points101
壳层类型 shell_typedirectional
溶剂电子密度 solvent_density0.3340 e/ų
壳层衬度 contrast_shell0.0300 e/ų
CRYSOL 版本 crysol_version4.1.3
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4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

最大尺寸 Dmax dmax38.4 Å
Rg (实空间) rg_real12.75 Å
Rg 误差 (实空间) rg_real_error0.23 Å
I(0) (实空间) i0_real6.5720e+08
I(0) 误差 (实空间) i0_real_error6.9990e+06
Rg (倒空间) rg_reciprocal12.76 Å
I(0) (倒空间) i0_reciprocal657200000.0000
解质量估计 total_estimate0.8211
解质量评级 solution_quality GOOD a GOOD solution
P(r) 峰数 n_peaks2
主峰位置 r_peak_primary16.5 Å
偏度 Skewness skewness0.132
峰度 Kurtosis kurtosis-0.192
角度范围 angular_range— – 0.5000 Å−1
当前正则化参数 α current_alpha0.0000
最高正则化参数 α highest_alpha144200.0000
实空间数据点数 n_real_points80
GNOM 版本 gnom_version4.1.3
质量判据 quality_criteria AN1: 0.000; Oscil: 0.877; Stabil: 0.998; Sysdev: 1.000; Positv: 1.000; Valcen: 0.985; Smooth: 0.061
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5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

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6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (1)

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7. 折叠分类 (SCOP + CATH) 1 domains

CATH v4.4 (1 domains)

结构域编号 domain_id2lweA00
类 Class class1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology533 — Death Domain, Fas
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — Death Domain, Fas
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8. 引用文献 (1)

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9. 文件与曲线 (10)