Melittin
物种未注明
当前结构中的状态
| Assembly | 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与共同组分 | 实验方法与环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 蛋白单体 单体 蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白拷贝数一致 | 链 A； UniProt 44–69 | 片段：residues 44-69 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 3UQ [(1,2,3,4,5-eta)-cyclopentadienyl][(1,2,3,4,4a,8a-eta)-naphthalene]ruthenium(1+) × 1 | SOLUTION NMR NMR测量条件：pH 7；298 K；压力 1 NMR样品组成：6 mM Ru-melittin-1, CD3OH | CD3OH | 分辨率未提供 |
数据库中的同蛋白其他状态
以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。
| 其他 PDB | 相对当前条目 2MW6 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法与环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1BH1 STRUCTURAL STUDIES OF D-PRO MELITTIN, NMR, 20 STRUCTURES 提交 1998-06-11 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
44–69（26 aa）
|
突变：PRO 14 REPLACED WITH D-PRO 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 |
SOLUTION NMR
NMR测量条件
pH 5.2；277 K；离子强度（mmCIF原始值）2mM；压力 1
NMR样品组成
METHANOL
|
分辨率未提供 |
| 2MLT MELITTIN 提交 1990-10-04 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
44–69（26 aa）
链 B
44–69（26 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | SO4 SULFATE ION × 4 | X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 2.00 Å |
| 3QRX Chlamydomonas reinhardtii centrin bound to melittin 提交 2011-02-18 | 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 B
44–69（26 aa）
片段：residues 44-69
|
未记录 | CA CALCIUM ION × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；293 K；2 L of the Crcen-MLT (1:1.5 molar ratio, 10mg/mL total) solution with 2 L of a precipitant solution containing 50 mM HEPES, pH 7.5, 0.2 M KCl, and 40% v/v pentaerythritol propoxylate (5/4 PO/OH), VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.20 Å R-free 0.341 |
| 3QRX Chlamydomonas reinhardtii centrin bound to melittin 提交 2011-02-18 | 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 B
44–69（26 aa）
片段：residues 44-69
|
未记录 | CA CALCIUM ION × 8 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；293 K；2 L of the Crcen-MLT (1:1.5 molar ratio, 10mg/mL total) solution with 2 L of a precipitant solution containing 50 mM HEPES, pH 7.5, 0.2 M KCl, and 40% v/v pentaerythritol propoxylate (5/4 PO/OH), VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.20 Å R-free 0.341 |
| 6DST Recombinant melittin 提交 2018-06-14 | 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
44–69（26 aa）
片段：residues 44-69
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
SOLUTION NMR
NMR测量条件
pH 7；298 K；离子强度（mmCIF原始值）10；压力 1
NMR测量条件
pH 7；285 K；离子强度（mmCIF原始值）10；压力 1
NMR样品组成
0.05 mM [U-95% 13C; U-95% 15N] melittin, 10 % v/v [U-2H] glycerol, 10 mM potassium phosphate buffer, trifluoroethanol/water | trifluoroethanol/water
NMR样品组成
0.050 mM [U-95% 13C; U-95% 15N] Melittin, 10 mM potassium phosphate buffer, trifluoroethanol/water | trifluoroethanol/water
|
分辨率未提供 |
| 6O4M Racemic melittin 提交 2019-02-28 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 C
44–69（26 aa）
片段：residues 44-69
链 D
44–69（26 aa）
片段：residues 44-69
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | SO4 SULFATE ION × 8 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；298 K；0.05 M ammonium sulfate, 0.1 M BIS-TRIS pH = 6.5, 30% v/v pentaerythritol ethoxylate (15/4 EO/OH)
|
分辨率 1.27 Å R-free 0.235 |
| 6O4M Racemic melittin 提交 2019-02-28 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
44–69（26 aa）
片段：residues 44-69
链 B
44–69（26 aa）
片段：residues 44-69
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | SO4 SULFATE ION × 10 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；298 K；0.05 M ammonium sulfate, 0.1 M BIS-TRIS pH = 6.5, 30% v/v pentaerythritol ethoxylate (15/4 EO/OH)
|
分辨率 1.27 Å R-free 0.235 |
| 8AHS Crystal structure of human Ca2+/Calmodulin in complex with melittin 提交 2022-07-22 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 C
44–69（26 aa）
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未记录 | CA CALCIUM ION × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.4；293 K；0.2M NaCl, 22w/v% PEG3350, 0.1M Bis-Tris, pH 5.4
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分辨率 2.48 Å R-free 0.270 |
| 8AHT Crystal structure of Plasmodium falciparum Ca2+/Calmodulin in complex with melittin 提交 2022-07-22 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：dimeric |
链 F
44–69（26 aa）
链 G
44–69（26 aa）
链 H
44–69（26 aa）
链 I
44–69（26 aa）
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未记录 | CA CALCIUM ION × 8 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；293 K；0.25M NaCl, 30w/v% PEG3350, 0.1M Bis-Tris buffer, pH 6.0
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分辨率 2.20 Å R-free 0.266 |
共 7 个其他 PDB 条目、9 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态
查看构建体与数据证据
| UniProt名称 | MEL_APIME |
| Isoform | — |
| PDB实体 | 1 |
| 链与序列区间 | 作者链 A； PDB构建体 1–26； UniProt 44–69 |
