2mym

Cullin3 - BTB interface: a novel target for stapled peptides

Method: SOLUTION NMR Dmax: 37.1 Å Quality: REASONABLE

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Cullin-3

物种未注明

UniProt Q13618

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白单体 单体 蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白拷贝数一致 链 A; UniProt 49–68 片段:UNP residues 49-68 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 无其他共同聚合物 SOLUTION NMR NMR测量条件:pH 3;298 K;压力 ambient NMR样品组成:1 mM Cul349-68LA, trifluoroethanol/water | trifluoroethanol/water 分辨率未提供

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly, “相对当前条目”直接指出证据层面的不同;没有差异标签表示当前已读取字段一致。

共 29 个其他 PDB 条目、31 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 CUL3_HUMAN
Isoform
PDB实体 1
链与序列区间 作者链 A; PDB构建体 1–20; UniProt 49–68

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中;数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护,因此不在读者页面展示。

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

SAXS profile for 2mym

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

P(r) distribution for 2mym
下载 Download

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id2mym
沉积日期 deposition_date2015-01-27
结构标题 titleCullin3 - BTB interface: a novel target for stapled peptides
关键词 keywordsProtein, PROTEIN BINDING; PROTEIN BINDING
实验方法 methodSOLUTION NMR

3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

回转半径 Rg (Guinier) rg_guinier9.19
回转半径 Rg (电子) rg_electron9.29
零角强度 I(0) i030652800.00
分子量 molecular_weight48557.0 kDa
排除体积 excluded_volume61800 ų
包络体积 envelope_volume7155 ų
水化壳体积 shell_volume6164 ų
包络直径 envelope_diameter39.4
壳层 Rg shell_rg15.55
包络 Rg envelope_rg11.90
形状 Rg shape_rg9.23
总 Rg total_rg9.79
总原子数 total_atoms6740
残基数 n_residues360
球谐函数阶数 n_harmonics20
q 范围 q_range— – 0.5000 −1
数据点数 n_points101
壳层类型 shell_typedirectional
溶剂电子密度 solvent_density0.3340 e/ų
壳层衬度 contrast_shell0.0300 e/ų
CRYSOL 版本 crysol_version4.1.3

4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

最大尺寸 Dmax dmax37.1
Rg (实空间) rg_real9.46
Rg 误差 (实空间) rg_real_error0.45
I(0) (实空间) i0_real3.0650e+07
I(0) 误差 (实空间) i0_real_error3.2690e+05
Rg (倒空间) rg_reciprocal9.45
I(0) (倒空间) i0_reciprocal30650000.0000
解质量估计 total_estimate0.5436
解质量评级 solution_quality REASONABLE a REASONABLE solution
P(r) 峰数 n_peaks2
主峰位置 r_peak_primary7.0
偏度 Skewness skewness0.754
峰度 Kurtosis kurtosis0.069
角度范围 angular_range— – 0.5000 −1
当前正则化参数 α current_alpha0.0000
最高正则化参数 α highest_alpha2560.0000
实空间数据点数 n_real_points80
GNOM 版本 gnom_version4.1.3
质量判据 quality_criteria AN1: 0.000; Oscil: 0.329; Stabil: 0.999; Sysdev: 0.368; Positv: 1.000; Valcen: 0.017; Smooth: 0.960

5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (1)

8. 引用文献 (1)

9. 文件与曲线 (10)