2nn6

Structure of the human RNA exosome composed of Rrp41, Rrp45, Rrp46, Rrp43, Mtr3, Rrp42, Csl4, Rrp4, and Rrp40

Method: X-RAY DIFFRACTION D_max: 121.5 Å Quality: GOOD

▼

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Polymyositis/scleroderma autoantigen 1

Homo sapiens

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 9 PDB 声明：nonameric（9）与蛋白拷贝数一致	链 A； UniProt 1–302	未记录	Exosome complex exonuclease RRP41 × 1 （Q9NPD3） Exosome complex exonuclease RRP43 × 1 （Q96B26） Exosome complex exonuclease RRP46 × 1 （Q9NQT4） Exosome complex exonuclease RRP42 × 1 （Q15024） Exosome component 6 × 1 （Q5RKV6） Exosome complex exonuclease RRP40 × 1 （Q9NQT5） Exosome complex exonuclease RRP4 × 1 （Q13868） ;3'-5' exoribonuclease CSL4 homolog ; × 1 （Q9Y3B2）	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；291 K；4.5-8% w/v PEG4000, 0.1M Sodium citrate, 1 mM TCEP, pH 5.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K	分辨率 3.35 Å R-free 0.344

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

数据库中没有找到同一 UniProt 蛋白的其他 PDB 条目。

查看构建体与数据证据

UniProt名称	Q86Y41_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 18–319； UniProt 1–302

Exosome complex exonuclease RRP41

Homo sapiens

UniProt Q9NPD3

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 9 PDB 声明：nonameric（9）与蛋白拷贝数一致	链 B； UniProt 1–244	未记录	Polymyositis/scleroderma autoantigen 1 × 1 （Q86Y41） Exosome complex exonuclease RRP43 × 1 （Q96B26） Exosome complex exonuclease RRP46 × 1 （Q9NQT4） Exosome complex exonuclease RRP42 × 1 （Q15024） Exosome component 6 × 1 （Q5RKV6） Exosome complex exonuclease RRP40 × 1 （Q9NQT5） Exosome complex exonuclease RRP4 × 1 （Q13868） ;3'-5' exoribonuclease CSL4 homolog ; × 1 （Q9Y3B2）	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；291 K；4.5-8% w/v PEG4000, 0.1M Sodium citrate, 1 mM TCEP, pH 5.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K	分辨率 3.35 Å R-free 0.344

数据库中的同蛋白其他状态

其他 PDB	相对当前条目 2NN6	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
6D6Q Human nuclear exosome-MTR4 RNA complex - overall reconstruction 提交 2018-04-22	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：pentadecameric	链 B 1–245（245 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 1 ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE；30 sec wait time, 2.5 sec blot time	分辨率 3.45 Å
6D6R Human nuclear exosome-MTR4 RNA complex - composite map after focused reconstruction 提交 2018-04-22	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：pentadecameric	链 B 1–245（245 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE；30 sec wait time, 2.5 sec blot time	分辨率 3.45 Å
6H25 Human nuclear RNA exosome EXO-10-MPP6 complex 提交 2018-07-13	构建体不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 11 PDB 声明：dodecameric	链 B 1–245（245 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 3.80 Å
9G8M human 80S ribosome bound by a SKI2-exosome complex 提交 2024-07-23	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足异源复合物；蛋白 × 87 PDB 声明：92-meric	链 L 1–245（245 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 232 ZN ZINC ION × 6	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 3.30 Å
9G8N 80S-bound human Ski2-exosome complex 提交 2024-07-23	构建体不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：13-meric	链 L 1–245（245 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 3.70 Å
9G8O human 40S ribosome bound by a SKI238-exosome complex 提交 2024-07-23	构建体不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 49 PDB 声明：51-meric	链 N 1–245（245 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 3.40 Å
9G8P 40S-bound human SKI2-exosome complex 提交 2024-07-23	构建体不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：13-meric	链 L 1–245（245 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 7.00 Å

共 7 个其他 PDB 条目、7 个 assembly。打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	EXOS4_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	2
链与序列区间	作者链 B； PDB构建体 6–249； UniProt 1–244

Exosome complex exonuclease RRP43

Homo sapiens

UniProt Q96B26

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 9 PDB 声明：nonameric（9）与蛋白拷贝数一致	链 C； UniProt 1–276	未记录	Polymyositis/scleroderma autoantigen 1 × 1 （Q86Y41） Exosome complex exonuclease RRP41 × 1 （Q9NPD3） Exosome complex exonuclease RRP46 × 1 （Q9NQT4） Exosome complex exonuclease RRP42 × 1 （Q15024） Exosome component 6 × 1 （Q5RKV6） Exosome complex exonuclease RRP40 × 1 （Q9NQT5） Exosome complex exonuclease RRP4 × 1 （Q13868） ;3'-5' exoribonuclease CSL4 homolog ; × 1 （Q9Y3B2）	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；291 K；4.5-8% w/v PEG4000, 0.1M Sodium citrate, 1 mM TCEP, pH 5.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K	分辨率 3.35 Å R-free 0.344

数据库中的同蛋白其他状态

其他 PDB	相对当前条目 2NN6	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
6D6Q Human nuclear exosome-MTR4 RNA complex - overall reconstruction 提交 2018-04-22	聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：pentadecameric	链 C 1–276（276 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 1 ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE；30 sec wait time, 2.5 sec blot time	分辨率 3.45 Å
6D6R Human nuclear exosome-MTR4 RNA complex - composite map after focused reconstruction 提交 2018-04-22	聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：pentadecameric	链 C 1–276（276 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE；30 sec wait time, 2.5 sec blot time	分辨率 3.45 Å
6H25 Human nuclear RNA exosome EXO-10-MPP6 complex 提交 2018-07-13	聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 11 PDB 声明：dodecameric	链 C 1–276（276 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 3.80 Å
9G8M human 80S ribosome bound by a SKI2-exosome complex 提交 2024-07-23	聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足异源复合物；蛋白 × 87 PDB 声明：92-meric	链 N 1–276（276 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 232 ZN ZINC ION × 6	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 3.30 Å
9G8N 80S-bound human Ski2-exosome complex 提交 2024-07-23	聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：13-meric	链 N 1–276（276 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 3.70 Å
9G8O human 40S ribosome bound by a SKI238-exosome complex 提交 2024-07-23	聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 49 PDB 声明：51-meric	链 L 1–276（276 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 3.40 Å
9G8P 40S-bound human SKI2-exosome complex 提交 2024-07-23	聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：13-meric	链 N 1–276（276 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 7.00 Å

共 7 个其他 PDB 条目、7 个 assembly。打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	EXOS8_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	3
链与序列区间	作者链 C； PDB构建体 3–278； UniProt 1–276

Exosome complex exonuclease RRP46

Homo sapiens

UniProt Q9NQT4

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 9 PDB 声明：nonameric（9）与蛋白拷贝数一致	链 D； UniProt 1–235	未记录	Polymyositis/scleroderma autoantigen 1 × 1 （Q86Y41） Exosome complex exonuclease RRP41 × 1 （Q9NPD3） Exosome complex exonuclease RRP43 × 1 （Q96B26） Exosome complex exonuclease RRP42 × 1 （Q15024） Exosome component 6 × 1 （Q5RKV6） Exosome complex exonuclease RRP40 × 1 （Q9NQT5） Exosome complex exonuclease RRP4 × 1 （Q13868） ;3'-5' exoribonuclease CSL4 homolog ; × 1 （Q9Y3B2）	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；291 K；4.5-8% w/v PEG4000, 0.1M Sodium citrate, 1 mM TCEP, pH 5.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K	分辨率 3.35 Å R-free 0.344

数据库中的同蛋白其他状态

其他 PDB	相对当前条目 2NN6	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
6D6Q Human nuclear exosome-MTR4 RNA complex - overall reconstruction 提交 2018-04-22	聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：pentadecameric	链 D 1–235（235 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 1 ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE；30 sec wait time, 2.5 sec blot time	分辨率 3.45 Å
6D6R Human nuclear exosome-MTR4 RNA complex - composite map after focused reconstruction 提交 2018-04-22	聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：pentadecameric	链 D 1–235（235 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE；30 sec wait time, 2.5 sec blot time	分辨率 3.45 Å
6H25 Human nuclear RNA exosome EXO-10-MPP6 complex 提交 2018-07-13	聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 11 PDB 声明：dodecameric	链 D 1–235（235 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 3.80 Å
9G8M human 80S ribosome bound by a SKI2-exosome complex 提交 2024-07-23	聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足异源复合物；蛋白 × 87 PDB 声明：92-meric	链 O 1–235（235 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 232 ZN ZINC ION × 6	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 3.30 Å
9G8N 80S-bound human Ski2-exosome complex 提交 2024-07-23	聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：13-meric	链 O 1–235（235 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 3.70 Å
9G8O human 40S ribosome bound by a SKI238-exosome complex 提交 2024-07-23	聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 49 PDB 声明：51-meric	链 O 1–235（235 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 3.40 Å
9G8P 40S-bound human SKI2-exosome complex 提交 2024-07-23	聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：13-meric	链 O 1–235（235 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 7.00 Å

共 7 个其他 PDB 条目、7 个 assembly。打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	EXOS5_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	4
链与序列区间	作者链 D； PDB构建体 3–237； UniProt 1–235

Exosome complex exonuclease RRP42

Homo sapiens

UniProt Q15024

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 9 PDB 声明：nonameric（9）与蛋白拷贝数一致	链 E； UniProt 1–291	突变：L274V	Polymyositis/scleroderma autoantigen 1 × 1 （Q86Y41） Exosome complex exonuclease RRP41 × 1 （Q9NPD3） Exosome complex exonuclease RRP43 × 1 （Q96B26） Exosome complex exonuclease RRP46 × 1 （Q9NQT4） Exosome component 6 × 1 （Q5RKV6） Exosome complex exonuclease RRP40 × 1 （Q9NQT5） Exosome complex exonuclease RRP4 × 1 （Q13868） ;3'-5' exoribonuclease CSL4 homolog ; × 1 （Q9Y3B2）	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；291 K；4.5-8% w/v PEG4000, 0.1M Sodium citrate, 1 mM TCEP, pH 5.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K	分辨率 3.35 Å R-free 0.344

数据库中的同蛋白其他状态

其他 PDB	相对当前条目 2NN6	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
6D6Q Human nuclear exosome-MTR4 RNA complex - overall reconstruction 提交 2018-04-22	突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：pentadecameric	链 E 1–291（291 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 1 ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE；30 sec wait time, 2.5 sec blot time	分辨率 3.45 Å
6D6R Human nuclear exosome-MTR4 RNA complex - composite map after focused reconstruction 提交 2018-04-22	突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：pentadecameric	链 E 1–291（291 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE；30 sec wait time, 2.5 sec blot time	分辨率 3.45 Å
6H25 Human nuclear RNA exosome EXO-10-MPP6 complex 提交 2018-07-13	突变/修饰不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 11 PDB 声明：dodecameric	链 E 1–291（291 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 3.80 Å
9G8M human 80S ribosome bound by a SKI2-exosome complex 提交 2024-07-23	突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足异源复合物；蛋白 × 87 PDB 声明：92-meric	链 F 1–291（291 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 232 ZN ZINC ION × 6	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 3.30 Å
9G8N 80S-bound human Ski2-exosome complex 提交 2024-07-23	突变/修饰不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：13-meric	链 F 1–291（291 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 3.70 Å
9G8O human 40S ribosome bound by a SKI238-exosome complex 提交 2024-07-23	突变/修饰不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 49 PDB 声明：51-meric	链 F 1–291（291 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 3.40 Å
9G8P 40S-bound human SKI2-exosome complex 提交 2024-07-23	突变/修饰不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：13-meric	链 F 1–291（291 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 7.00 Å

共 7 个其他 PDB 条目、7 个 assembly。打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	EXOS7_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	5
链与序列区间	作者链 E； PDB构建体 15–305； UniProt 1–291

Exosome component 6

Homo sapiens

UniProt Q5RKV6

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 9 PDB 声明：nonameric（9）与蛋白拷贝数一致	链 F； UniProt 1–272	未记录	Polymyositis/scleroderma autoantigen 1 × 1 （Q86Y41） Exosome complex exonuclease RRP41 × 1 （Q9NPD3） Exosome complex exonuclease RRP43 × 1 （Q96B26） Exosome complex exonuclease RRP46 × 1 （Q9NQT4） Exosome complex exonuclease RRP42 × 1 （Q15024） Exosome complex exonuclease RRP40 × 1 （Q9NQT5） Exosome complex exonuclease RRP4 × 1 （Q13868） ;3'-5' exoribonuclease CSL4 homolog ; × 1 （Q9Y3B2）	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；291 K；4.5-8% w/v PEG4000, 0.1M Sodium citrate, 1 mM TCEP, pH 5.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K	分辨率 3.35 Å R-free 0.344

数据库中的同蛋白其他状态

其他 PDB	相对当前条目 2NN6	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
6D6Q Human nuclear exosome-MTR4 RNA complex - overall reconstruction 提交 2018-04-22	聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：pentadecameric	链 F 1–272（272 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 1 ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE；30 sec wait time, 2.5 sec blot time	分辨率 3.45 Å
6D6R Human nuclear exosome-MTR4 RNA complex - composite map after focused reconstruction 提交 2018-04-22	聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：pentadecameric	链 F 1–272（272 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE；30 sec wait time, 2.5 sec blot time	分辨率 3.45 Å
6H25 Human nuclear RNA exosome EXO-10-MPP6 complex 提交 2018-07-13	聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 11 PDB 声明：dodecameric	链 F 1–272（272 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 3.80 Å
9G8M human 80S ribosome bound by a SKI2-exosome complex 提交 2024-07-23	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足异源复合物；蛋白 × 87 PDB 声明：92-meric	链 G 1–272（272 aa）链 H 181–272（92 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 232 ZN ZINC ION × 6	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 3.30 Å
9G8N 80S-bound human Ski2-exosome complex 提交 2024-07-23	聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：13-meric	链 G 1–272（272 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 3.70 Å
9G8O human 40S ribosome bound by a SKI238-exosome complex 提交 2024-07-23	聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 49 PDB 声明：51-meric	链 G 1–272（272 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 3.40 Å
9G8P 40S-bound human SKI2-exosome complex 提交 2024-07-23	聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：13-meric	链 G 1–272（272 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 7.00 Å

共 7 个其他 PDB 条目、7 个 assembly。打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	Q5RKV6_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	6
链与序列区间	作者链 F； PDB构建体 1–272； UniProt 1–272

Exosome complex exonuclease RRP40

Homo sapiens

UniProt Q9NQT5

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 9 PDB 声明：nonameric（9）与蛋白拷贝数一致	链 G； UniProt 0–274	未记录	Polymyositis/scleroderma autoantigen 1 × 1 （Q86Y41） Exosome complex exonuclease RRP41 × 1 （Q9NPD3） Exosome complex exonuclease RRP43 × 1 （Q96B26） Exosome complex exonuclease RRP46 × 1 （Q9NQT4） Exosome complex exonuclease RRP42 × 1 （Q15024） Exosome component 6 × 1 （Q5RKV6） Exosome complex exonuclease RRP4 × 1 （Q13868） ;3'-5' exoribonuclease CSL4 homolog ; × 1 （Q9Y3B2）	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；291 K；4.5-8% w/v PEG4000, 0.1M Sodium citrate, 1 mM TCEP, pH 5.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K	分辨率 3.35 Å R-free 0.344

数据库中的同蛋白其他状态

其他 PDB	相对当前条目 2NN6	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
6D6Q Human nuclear exosome-MTR4 RNA complex - overall reconstruction 提交 2018-04-22	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：pentadecameric	链 G 1–275（275 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 1 ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE；30 sec wait time, 2.5 sec blot time	分辨率 3.45 Å
6D6R Human nuclear exosome-MTR4 RNA complex - composite map after focused reconstruction 提交 2018-04-22	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：pentadecameric	链 G 1–275（275 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE；30 sec wait time, 2.5 sec blot time	分辨率 3.45 Å
6H25 Human nuclear RNA exosome EXO-10-MPP6 complex 提交 2018-07-13	构建体不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 11 PDB 声明：dodecameric	链 G 1–275（275 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 3.80 Å
9G8M human 80S ribosome bound by a SKI2-exosome complex 提交 2024-07-23	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足异源复合物；蛋白 × 87 PDB 声明：92-meric	链 H 1–275（275 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 232 ZN ZINC ION × 6	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 3.30 Å
9G8N 80S-bound human Ski2-exosome complex 提交 2024-07-23	构建体不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：13-meric	链 H 1–275（275 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 3.70 Å
9G8O human 40S ribosome bound by a SKI238-exosome complex 提交 2024-07-23	构建体不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 49 PDB 声明：51-meric	链 H 1–275（275 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 3.40 Å
9G8P 40S-bound human SKI2-exosome complex 提交 2024-07-23	构建体不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：13-meric	链 H 1–275（275 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 7.00 Å

共 7 个其他 PDB 条目、7 个 assembly。打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	EXOS3_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	7
链与序列区间	作者链 G； PDB构建体 15–289； UniProt 0–274

Exosome complex exonuclease RRP4

Homo sapiens

UniProt Q13868

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 9 PDB 声明：nonameric（9）与蛋白拷贝数一致	链 H； UniProt 1–293	未记录	Polymyositis/scleroderma autoantigen 1 × 1 （Q86Y41） Exosome complex exonuclease RRP41 × 1 （Q9NPD3） Exosome complex exonuclease RRP43 × 1 （Q96B26） Exosome complex exonuclease RRP46 × 1 （Q9NQT4） Exosome complex exonuclease RRP42 × 1 （Q15024） Exosome component 6 × 1 （Q5RKV6） Exosome complex exonuclease RRP40 × 1 （Q9NQT5） ;3'-5' exoribonuclease CSL4 homolog ; × 1 （Q9Y3B2）	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；291 K；4.5-8% w/v PEG4000, 0.1M Sodium citrate, 1 mM TCEP, pH 5.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K	分辨率 3.35 Å R-free 0.344

数据库中的同蛋白其他状态

其他 PDB	相对当前条目 2NN6	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
6D6Q Human nuclear exosome-MTR4 RNA complex - overall reconstruction 提交 2018-04-22	聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：pentadecameric	链 H 1–293（293 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 1 ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE；30 sec wait time, 2.5 sec blot time	分辨率 3.45 Å
6D6R Human nuclear exosome-MTR4 RNA complex - composite map after focused reconstruction 提交 2018-04-22	聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：pentadecameric	链 H 1–293（293 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE；30 sec wait time, 2.5 sec blot time	分辨率 3.45 Å
6H25 Human nuclear RNA exosome EXO-10-MPP6 complex 提交 2018-07-13	聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 11 PDB 声明：dodecameric	链 H 1–293（293 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 3.80 Å
9G8M human 80S ribosome bound by a SKI2-exosome complex 提交 2024-07-23	聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足异源复合物；蛋白 × 87 PDB 声明：92-meric	链 I 1–293（293 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 232 ZN ZINC ION × 6	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 3.30 Å
9G8N 80S-bound human Ski2-exosome complex 提交 2024-07-23	聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：13-meric	链 I 1–293（293 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 3.70 Å
9G8O human 40S ribosome bound by a SKI238-exosome complex 提交 2024-07-23	聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 49 PDB 声明：51-meric	链 I 1–293（293 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 3.40 Å
9G8P 40S-bound human SKI2-exosome complex 提交 2024-07-23	聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：13-meric	链 I 1–293（293 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 7.00 Å

共 7 个其他 PDB 条目、7 个 assembly。打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	EXOS2_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	8
链与序列区间	作者链 H； PDB构建体 16–308； UniProt 1–293

;3'-5' exoribonuclease CSL4 homolog ;

Homo sapiens

UniProt Q9Y3B2

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 9 PDB 声明：nonameric（9）与蛋白拷贝数一致	链 I； UniProt 1–195	未记录	Polymyositis/scleroderma autoantigen 1 × 1 （Q86Y41） Exosome complex exonuclease RRP41 × 1 （Q9NPD3） Exosome complex exonuclease RRP43 × 1 （Q96B26） Exosome complex exonuclease RRP46 × 1 （Q9NQT4） Exosome complex exonuclease RRP42 × 1 （Q15024） Exosome component 6 × 1 （Q5RKV6） Exosome complex exonuclease RRP40 × 1 （Q9NQT5） Exosome complex exonuclease RRP4 × 1 （Q13868）	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；291 K；4.5-8% w/v PEG4000, 0.1M Sodium citrate, 1 mM TCEP, pH 5.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K	分辨率 3.35 Å R-free 0.344

数据库中的同蛋白其他状态

其他 PDB	相对当前条目 2NN6	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
6D6Q Human nuclear exosome-MTR4 RNA complex - overall reconstruction 提交 2018-04-22	聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：pentadecameric	链 I 1–195（195 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 1 ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE；30 sec wait time, 2.5 sec blot time	分辨率 3.45 Å
6D6R Human nuclear exosome-MTR4 RNA complex - composite map after focused reconstruction 提交 2018-04-22	聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：pentadecameric	链 I 1–195（195 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE；30 sec wait time, 2.5 sec blot time	分辨率 3.45 Å
6H25 Human nuclear RNA exosome EXO-10-MPP6 complex 提交 2018-07-13	聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 11 PDB 声明：dodecameric	链 I 1–195（195 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 3.80 Å
9G8M human 80S ribosome bound by a SKI2-exosome complex 提交 2024-07-23	聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足异源复合物；蛋白 × 87 PDB 声明：92-meric	链 J 1–195（195 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 232 ZN ZINC ION × 6	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 3.30 Å
9G8N 80S-bound human Ski2-exosome complex 提交 2024-07-23	聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：13-meric	链 J 1–195（195 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 3.70 Å
9G8O human 40S ribosome bound by a SKI238-exosome complex 提交 2024-07-23	聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 49 PDB 声明：51-meric	链 J 1–195（195 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 3.40 Å
9G8P 40S-bound human SKI2-exosome complex 提交 2024-07-23	聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：13-meric	链 J 1–195（195 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 7.00 Å

共 7 个其他 PDB 条目、7 个 assembly。打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	EXOS1_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	9
链与序列区间	作者链 I； PDB构建体 15–209； UniProt 1–195

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

下载 Download SAXS (.dat) P(r) (.pr.out) CIF

▼

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	2nn6
沉积日期 deposition_date	2006-10-23
结构标题 title	Structure of the human RNA exosome composed of Rrp41, Rrp45, Rrp46, Rrp43, Mtr3, Rrp42, Csl4, Rrp4, and Rrp40
关键词 keywords	RNA, exosome, PM/Scl, exoribonuclease, phosphorolytic, ribonuclease, HYDROLASE-TRANSFERASE COMPLEX; HYDROLASE/TRANSFERASE
实验方法 method	X-RAY DIFFRACTION

▼

3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

回转半径 Rg (Guinier) rg_guinier	40.50 Å
回转半径 Rg (电子) rg_electron	39.74 Å
零角强度 I(0) i0	871386000.00
分子量 molecular_weight	240640.0 kDa
排除体积 excluded_volume	301280 Å³
包络体积 envelope_volume	421650 Å³
水化壳体积 shell_volume	83650 Å³
包络直径 envelope_diameter	127.4 Å
壳层 Rg shell_rg	49.30 Å
包络 Rg envelope_rg	38.58 Å
形状 Rg shape_rg	39.74 Å
总 Rg total_rg	40.24 Å
总原子数 total_atoms	16858
残基数 n_residues	2214
球谐函数阶数 n_harmonics	20
q 范围 q_range	— – 0.5000 Å⁻¹
数据点数 n_points	101
壳层类型 shell_type	directional
溶剂电子密度 solvent_density	0.3340 e/Å³
壳层衬度 contrast_shell	0.0300 e/Å³
CRYSOL 版本 crysol_version	4.1.3

▼

4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

最大尺寸 Dmax dmax	121.5 Å
Rg (实空间) rg_real	40.22 Å
Rg 误差 (实空间) rg_real_error	0.58 Å
I(0) (实空间) i0_real	8.7140e+08
I(0) 误差 (实空间) i0_real_error	1.2740e+07
Rg (倒空间) rg_reciprocal	40.49 Å
I(0) (倒空间) i0_reciprocal	871600000.0000
解质量估计 total_estimate	0.8976
解质量评级 solution_quality	GOOD a GOOD solution
P(r) 峰数 n_peaks	1
主峰位置 r_peak_primary	56.1 Å
偏度 Skewness skewness	-0.007
峰度 Kurtosis kurtosis	-0.563
角度范围 angular_range	— – 0.1950 Å⁻¹
当前正则化参数 α current_alpha	0.0000
最高正则化参数 α highest_alpha	151700000.0000
实空间数据点数 n_real_points	40
GNOM 版本 gnom_version	4.1.3
质量判据 quality_criteria	AN1: 0.000; Oscil: 0.922; Stabil: 1.000; Sysdev: 1.000; Positv: 1.000; Valcen: 0.958; Smooth: 0.942

▶

5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

▶

6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (9)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	Polymyositis/scleroderma autoantigen 1
分子量 formula_weight	39405.8 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A
原子数 atom_count	16858

MGSSHHHHHHSQDPNSHMKETPLSNCERRFLLRAIEEKKRLDGRQTYDYRNIRISFGTDYGCCIVELGKTRVLGQVSCELVSPKLNRATEGILFFNLELSQMAAPAFEPGRQSDLLVKLNRLMERCLRNSKCIDTESLCVVAGEKVWQIRVDLHLLNHDGNIIDAASIAAIVALCHFRRPDVSVQGDEVTLYTPEERDPVPLSIHHMPICVSFAFFQQGTYLLVDPNEREERVMDGLLVIAMNKHREICTIQSSGGIMLLKDQVLRCSKIAGVKVAEITELILKALENDQKVRKEGGKFGFAESIANQRITAFKMEKAPXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX

来源 Source

来源生物 organism	Homo sapiens
通用名 common_name	human
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9606
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

实体 2 Entity 2 polymer

描述 description	Exosome complex exonuclease RRP41
分子量 formula_weight	26831.5 kDa
EC 编号 ec_number	3.1.13.-
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	B

MADPMAGLELLSDQGYRVDGRRAGELRKIQARMGVFAQADGSAYIEQGNTKALAVVYGPHEIRGSRARALPDRALVNCQYSSATFSTGERKRRPHGDRKSCEMGLQLRQTFEAAILTQLHPRSQIDIYVQVLQADGGTYAACVNAATLAVLDAGIPMRDFVCACSAGFVDGTALADLSHVEEAAGGPQLALALLPASGQIALLEMDARLHEDHLERVLEAAAQAARDVHTLLDRVVRQHVREASILLGD

来源 Source

来源生物 organism	Homo sapiens
通用名 common_name	human
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9606
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

实体 3 Entity 3 polymer

描述 description	Exosome complex exonuclease RRP43
分子量 formula_weight	30285.8 kDa
EC 编号 ec_number	3.1.13.-
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	C

DPMAAGFKTVEPLEYYRRFLKENCRPDGRELGEFRTTTVNIGSISTADGSALVKLGNTTVICGVKAEFAAPSTDAPDKGYVVPNVDLPPLCSSRFRSGPPGEEAQVASQFIADVIENSQIIQKEDLCISPGKLVWVLYCDLICLDYDGNILDACTFALLAALKNVQLPEVTINEETALAEVNLKKKSYLNIRTHPVATSFAVFDDTLLIVDPTGEEEHLATGTLTIVMDEEGKLCCLHKPGGSGLTGAKLQDCMSRAVTRHKEVKKLMDEVIKSMKPK

来源 Source

来源生物 organism	Homo sapiens
通用名 common_name	human
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9606
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

实体 4 Entity 4 polymer

描述 description	Exosome complex exonuclease RRP46
分子量 formula_weight	25480.2 kDa
EC 编号 ec_number	3.1.13.-
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	D

SLMEEETHTDAKIRAENGTGSSPRGPGCSLRHFACEQNLLSRPDGSASFLQGDTSVLAGVYGPAEVKVSKEIFNKATLEVILRPKIGLPGVAEKSRERLIRNTCEAVVLGTLHPRTSITVVLQVVSDAGSLLACCLNAACMALVDAGVPMRALFCGVACALDSDGTLVLDPTSKQEKEARAVLTFALDSVERKLLMSSTKGLYSDTELQQCLAAAQAASQHVFRFYRESLQRRYSKS

来源 Source

来源生物 organism	Homo sapiens
通用名 common_name	human
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9606
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

实体 5 Entity 5 polymer

描述 description	Exosome complex exonuclease RRP42
分子量 formula_weight	33479.1 kDa
EC 编号 ec_number	3.1.13.-
突变 mutation	L274V
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	E

MGSSHHHHHHSQDPMASVTLSEAEKVYIVHGVQEDLRVDGRGCEDYRCVEVETDVVSNTSGSARVKLGHTDILVGVKAEMGTPKLEKPNEGYLEFFVDCSASATPEFEGRGGDDLGTEIANTLYRIFNNKSSVDLKTLCISPREHCWVLYVDVLLLECGGNLFDAISIAVKAALFNTRIPRVRVLEDEEGSKDIELSDDPYDCIRLSVENVPCIVTLCKIGYRHVVDATLQEEACSLASLLVSVTSKGVVTCMRKVGKGSLDPESIFEMMETGKRVGKVLHASLQSVVHKEESLGPKRQKVGFLG

来源 Source

来源生物 organism	Homo sapiens
通用名 common_name	human
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9606
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

实体 6 Entity 6 polymer

描述 description	Exosome component 6
分子量 formula_weight	28267.1 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	F

MPGDHRRIRGPEESQPPQLYAADEEEAPGTRDPTRLRPVYARAGLLSQAKGSAYLEAGGTKVLCAVSGPRQAEGGERGGGPAGAGGEAPAALRGRLLCDFRRAPFAGRRRRAPPGGCEERELALALQEALEPAVRLGRYPRAQLEVSALLLEDGGSALAAALTAAALALADAGVEMYDLVVGCGLSLAPGPAPTWLLDPTRLEEERAAAGLTVALMPVLNQVAGLLGSGEGGLTESWAEAVRLGLEGCQRLYPVLQQSLVRAARRRGAAAQP

来源 Source

来源生物 organism	Homo sapiens
通用名 common_name	human
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9606
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

实体 7 Entity 7 polymer

描述 description	Exosome complex exonuclease RRP40
分子量 formula_weight	31227.9 kDa
EC 编号 ec_number	3.1.13.-
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	G

MGSSHHHHHHSQDPMAEPASVAAESLAGSRARAARTVLGQVVLPGEELLLPEQEDAEGPGGAVERPLSLNARACSRVRVVCGPGLRRCGDRLLVTKCGRLRHKEPGSGSGGGVYWVDSQQKRYVPVKGDHVIGIVTAKSGDIFKVDVGGSEPASLSYLSFEGATKRNRPNVQVGDLIYGQFVVANKDMEPEMVCIDSCGRANGMGVIGQDGLLFKVTLGLIRKLLAPDCEIIQEVGKLYPLEIVFGMNGRIWVKAKTIQQTLILANILEACEHMTSDQRKQIFSRLAES

来源 Source

来源生物 organism	Homo sapiens
通用名 common_name	human
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9606
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

实体 8 Entity 8 polymer

描述 description	Exosome complex exonuclease RRP4
分子量 formula_weight	34590.9 kDa
EC 编号 ec_number	3.1.13.-
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	H

MGSSHHHHHHSQDPHMAMEMRLPVARKPLSERLGRDTKKHLVVPGDTITTDTGFMRGHGTYMGEEKLIASVAGSVERVNKLICVKALKTRYIGEVGDIVVGRITEVQQKRWKVETNSRLDSVLLLSSMNLPGGELRRRSAEDELAMRGFLQEGDLISAEVQAVFSDGAVSLHTRSLKYGKLGQGVLVQVSPSLVKRQKTHFHDLPCGASVILGNNGFIWIYPTPEHKEEEAGGFIANLEPVSLADREVISRLRNCIISLVTQRMMLYDTSILYCYEASLPHQIKDILKPEIMEEIVMETRQRLLEQEG

来源 Source

来源生物 organism	Homo sapiens
通用名 common_name	human
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9606
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

实体 9 Entity 9 polymer

描述 description	;3'-5' exoribonuclease CSL4 homolog ;
分子量 formula_weight	23097.5 kDa
EC 编号 ec_number	3.1.13.-
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	I

MGSSHHHHHHSQDPMAPPVRYCIPGERLCNLEEGSPGSGTYTRHGYIFSSLAGCLMKSSENGALPVVSVVRETESQLLPDVGAIVTCKVSSINSRFAKVHILYVGSMPLKNSFRGTIRKEDVRATEKDKVEIYKSFRPGDIVLAKVISLGDAQSNYLLTTAENELGVVVAHSESGIQMVPISWCEMQCPKTHTKEFRKVARVQPEFLQT

来源 Source

来源生物 organism	Homo sapiens
通用名 common_name	human
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9606
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

▼

7. 折叠分类 (SCOP + CATH) 32 domains

SCOP 2.08 (20 domains)

结构域编号 domain_id	d2nn6a1
类 Class class	d — Alpha and beta proteins (a+b)
折叠类型 Fold fold	d.14 — Ribosomal protein S5 domain 2-like
超家族 Superfamily superfamily	d.14.1 — Ribosomal protein S5 domain 2-like
家族 Family family	d.14.1.4 — Ribonuclease PH domain 1-like

结构域编号 domain_id	d2nn6a2
类 Class class	d — Alpha and beta proteins (a+b)
折叠类型 Fold fold	d.101 — Ribonuclease PH domain 2-like
超家族 Superfamily superfamily	d.101.1 — Ribonuclease PH domain 2-like
家族 Family family	d.101.1.1 — Ribonuclease PH domain 2-like

结构域编号 domain_id	d2nn6b1
类 Class class	d — Alpha and beta proteins (a+b)
折叠类型 Fold fold	d.14 — Ribosomal protein S5 domain 2-like
超家族 Superfamily superfamily	d.14.1 — Ribosomal protein S5 domain 2-like
家族 Family family	d.14.1.4 — Ribonuclease PH domain 1-like

结构域编号 domain_id	d2nn6b2
类 Class class	d — Alpha and beta proteins (a+b)
折叠类型 Fold fold	d.101 — Ribonuclease PH domain 2-like
超家族 Superfamily superfamily	d.101.1 — Ribonuclease PH domain 2-like
家族 Family family	d.101.1.1 — Ribonuclease PH domain 2-like

结构域编号 domain_id	d2nn6c1
类 Class class	d — Alpha and beta proteins (a+b)
折叠类型 Fold fold	d.14 — Ribosomal protein S5 domain 2-like
超家族 Superfamily superfamily	d.14.1 — Ribosomal protein S5 domain 2-like
家族 Family family	d.14.1.4 — Ribonuclease PH domain 1-like

结构域编号 domain_id	d2nn6c2
类 Class class	d — Alpha and beta proteins (a+b)
折叠类型 Fold fold	d.101 — Ribonuclease PH domain 2-like
超家族 Superfamily superfamily	d.101.1 — Ribonuclease PH domain 2-like
家族 Family family	d.101.1.1 — Ribonuclease PH domain 2-like

结构域编号 domain_id	d2nn6d1
类 Class class	d — Alpha and beta proteins (a+b)
折叠类型 Fold fold	d.14 — Ribosomal protein S5 domain 2-like
超家族 Superfamily superfamily	d.14.1 — Ribosomal protein S5 domain 2-like
家族 Family family	d.14.1.4 — Ribonuclease PH domain 1-like

结构域编号 domain_id	d2nn6d2
类 Class class	d — Alpha and beta proteins (a+b)
折叠类型 Fold fold	d.101 — Ribonuclease PH domain 2-like
超家族 Superfamily superfamily	d.101.1 — Ribonuclease PH domain 2-like
家族 Family family	d.101.1.1 — Ribonuclease PH domain 2-like

结构域编号 domain_id	d2nn6e1
类 Class class	d — Alpha and beta proteins (a+b)
折叠类型 Fold fold	d.14 — Ribosomal protein S5 domain 2-like
超家族 Superfamily superfamily	d.14.1 — Ribosomal protein S5 domain 2-like
家族 Family family	d.14.1.4 — Ribonuclease PH domain 1-like

结构域编号 domain_id	d2nn6e2
类 Class class	d — Alpha and beta proteins (a+b)
折叠类型 Fold fold	d.101 — Ribonuclease PH domain 2-like
超家族 Superfamily superfamily	d.101.1 — Ribonuclease PH domain 2-like
家族 Family family	d.101.1.1 — Ribonuclease PH domain 2-like

结构域编号 domain_id	d2nn6f1
类 Class class	d — Alpha and beta proteins (a+b)
折叠类型 Fold fold	d.14 — Ribosomal protein S5 domain 2-like
超家族 Superfamily superfamily	d.14.1 — Ribosomal protein S5 domain 2-like
家族 Family family	d.14.1.4 — Ribonuclease PH domain 1-like

结构域编号 domain_id	d2nn6f2
类 Class class	d — Alpha and beta proteins (a+b)
折叠类型 Fold fold	d.101 — Ribonuclease PH domain 2-like
超家族 Superfamily superfamily	d.101.1 — Ribonuclease PH domain 2-like
家族 Family family	d.101.1.1 — Ribonuclease PH domain 2-like

结构域编号 domain_id	d2nn6g1
类 Class class	b — All beta proteins
折叠类型 Fold fold	b.40 — OB-fold
超家族 Superfamily superfamily	b.40.4 — Nucleic acid-binding proteins
家族 Family family	b.40.4.5 — Cold shock DNA-binding domain-like

结构域编号 domain_id	d2nn6g2
类 Class class	b — All beta proteins
折叠类型 Fold fold	b.84 — Barrel-sandwich hybrid
超家族 Superfamily superfamily	b.84.4 — Ribosomal L27 protein-like
家族 Family family	b.84.4.2 — ECR1 N-terminal domain-like

结构域编号 domain_id	d2nn6g3
类 Class class	d — Alpha and beta proteins (a+b)
折叠类型 Fold fold	d.51 — Eukaryotic type KH-domain (KH-domain type I)
超家族 Superfamily superfamily	d.51.1 — Eukaryotic type KH-domain (KH-domain type I)
家族 Family family	d.51.1.1 — Eukaryotic type KH-domain (KH-domain type I)

结构域编号 domain_id	d2nn6h1
类 Class class	b — All beta proteins
折叠类型 Fold fold	b.40 — OB-fold
超家族 Superfamily superfamily	b.40.4 — Nucleic acid-binding proteins
家族 Family family	b.40.4.5 — Cold shock DNA-binding domain-like

结构域编号 domain_id	d2nn6h2
类 Class class	b — All beta proteins
折叠类型 Fold fold	b.84 — Barrel-sandwich hybrid
超家族 Superfamily superfamily	b.84.4 — Ribosomal L27 protein-like
家族 Family family	b.84.4.2 — ECR1 N-terminal domain-like

结构域编号 domain_id	d2nn6h3
类 Class class	d — Alpha and beta proteins (a+b)
折叠类型 Fold fold	d.51 — Eukaryotic type KH-domain (KH-domain type I)
超家族 Superfamily superfamily	d.51.1 — Eukaryotic type KH-domain (KH-domain type I)
家族 Family family	d.51.1.1 — Eukaryotic type KH-domain (KH-domain type I)

结构域编号 domain_id	d2nn6i1
类 Class class	b — All beta proteins
折叠类型 Fold fold	b.40 — OB-fold
超家族 Superfamily superfamily	b.40.4 — Nucleic acid-binding proteins
家族 Family family	b.40.4.5 — Cold shock DNA-binding domain-like

结构域编号 domain_id	d2nn6i2
类 Class class	b — All beta proteins
折叠类型 Fold fold	b.84 — Barrel-sandwich hybrid
超家族 Superfamily superfamily	b.84.4 — Ribosomal L27 protein-like
家族 Family family	b.84.4.2 — ECR1 N-terminal domain-like

CATH v4.4 (12 domains)

结构域编号 domain_id	2nn6A01
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	230 — Ribosomal Protein S5; domain 2
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	70 — GHMP Kinase, N-terminal domain

结构域编号 domain_id	2nn6B01
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	230 — Ribosomal Protein S5; domain 2
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	70 — GHMP Kinase, N-terminal domain

结构域编号 domain_id	2nn6C00
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	230 — Ribosomal Protein S5; domain 2
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	70 — GHMP Kinase, N-terminal domain

结构域编号 domain_id	2nn6D00
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	230 — Ribosomal Protein S5; domain 2
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	70 — GHMP Kinase, N-terminal domain

结构域编号 domain_id	2nn6E00
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	230 — Ribosomal Protein S5; domain 2
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	70 — GHMP Kinase, N-terminal domain

结构域编号 domain_id	2nn6F00
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	230 — Ribosomal Protein S5; domain 2
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	70 — GHMP Kinase, N-terminal domain

结构域编号 domain_id	2nn6G01
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	40 — Beta Barrel
拓扑 Topology topology	50 — OB fold (Dihydrolipoamide Acetyltransferase, E2P)
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	100 — RNA polymerase II/Efflux pump adaptor protein, barrel-sandwich hybrid domain

结构域编号 domain_id	2nn6G02
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	40 — Beta Barrel
拓扑 Topology topology	50 — OB fold (Dihydrolipoamide Acetyltransferase, E2P)
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	140 — Nucleic acid-binding proteins

结构域编号 domain_id	2nn6G03
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	1370 — Ribosomal Protein S8; Chain: A, domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — K Homology domain, type 1

结构域编号 domain_id	2nn6H01
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	40 — Beta Barrel
拓扑 Topology topology	50 — OB fold (Dihydrolipoamide Acetyltransferase, E2P)
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	100 — RNA polymerase II/Efflux pump adaptor protein, barrel-sandwich hybrid domain

结构域编号 domain_id	2nn6I01
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	40 — Beta Barrel
拓扑 Topology topology	50 — OB fold (Dihydrolipoamide Acetyltransferase, E2P)
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	100 — RNA polymerase II/Efflux pump adaptor protein, barrel-sandwich hybrid domain

结构域编号 domain_id	2nn6I02
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	40 — Beta Barrel
拓扑 Topology topology	50 — OB fold (Dihydrolipoamide Acetyltransferase, E2P)
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	140 — Nucleic acid-binding proteins

▶

8. 引用文献 (1)

▶

晶胞边长 a length_a	307.800 Å
晶胞边长 b length_b	307.800 Å
晶胞边长 c length_c	307.800 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	90.00 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	90.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	24

空间群 space_group	P 4 3 2
空间群编号 int_tables_number	207
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	3.350 Å
最低分辨率 resolution_low	14.980 Å
R 因子 r_factor	0.2910
R_work r_work	0.2910
R_free r_free	0.3440

fit	/app/data/saxs_computation/nn/2nn6/2nn6.fit
pddf	/app/data/pr_computation/nn/2nn6/2nn6.pr.out
profile	/app/data/saxs_computation/nn/2nn6/2nn6.dat

Structure of the human RNA exosome composed of Rrp41, Rrp45, Rrp46, Rrp43, Mtr3, Rrp42, Csl4, Rrp4, and Rrp40

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Polymyositis/scleroderma autoantigen 1

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

Exosome complex exonuclease RRP41

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

Exosome complex exonuclease RRP43

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

Exosome complex exonuclease RRP46

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

Exosome complex exonuclease RRP42

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

Exosome component 6

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

Exosome complex exonuclease RRP40

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

Exosome complex exonuclease RRP4

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

;3'-5' exoribonuclease CSL4 homolog ;

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (9)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 3 Entity 3 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 4 Entity 4 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 5 Entity 5 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 6 Entity 6 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 7 Entity 7 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 8 Entity 8 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 9 Entity 9 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

7. 折叠分类 (SCOP + CATH) 32 domains

SCOP 2.08 (20 domains)

CATH v4.4 (12 domains)

8. 引用文献 (1)

9. 文件与曲线 (10)

Files (7)

Curves (3)