9g8o

human 40S ribosome bound by a SKI238-exosome complex

Method: ELECTRON MICROSCOPY Dmax: 278.1 Å Quality: GOOD

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

SAXS profile for 9g8o

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

P(r) distribution for 9g8o
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1. 结构基本信息 1. Structure Basics

条目编号 entry_id9g8o
沉积日期 deposition_date2024-07-23
结构标题 titlehuman 40S ribosome bound by a SKI238-exosome complex
关键词 keywordsRNA-binding, RNA-degradation, cytoplasm, helicase, RIBOSOME; RIBOSOME
实验方法 methodELECTRON MICROSCOPY

2. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 2. SAXS Parameters (CRYSOL)

回转半径 Rg (Guinier) rg_guinier
回转半径 Rg (电子) rg_electron110.60
零角强度 I(0) i070660300000.00
分子量 molecular_weight1819900.0 kDa
排除体积 excluded_volume2093300 ų
包络体积 envelope_volume3934400 ų
水化壳体积 shell_volume303100 ų
包络直径 envelope_diameter408.8
壳层 Rg shell_rg98.71
包络 Rg envelope_rg109.10
形状 Rg shape_rg110.80
总 Rg total_rg110.20
总原子数 total_atoms125224
残基数 n_residues12760
球谐函数阶数 n_harmonics20
q 范围 q_range— – 0.5000 −1
数据点数 n_points101
壳层类型 shell_typedirectional
溶剂电子密度 solvent_density0.3340 e/ų
壳层衬度 contrast_shell0.0300 e/ų
CRYSOL 版本 crysol_version4.1.3

3. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 3. P(r) Analysis (GNOM)

最大尺寸 Dmax dmax278.1
Rg (实空间) rg_real101.30
Rg 误差 (实空间) rg_real_error0.90
I(0) (实空间) i0_real6.7300e+10
I(0) 误差 (实空间) i0_real_error1.2350e+09
Rg (倒空间) rg_reciprocal101.60
I(0) (倒空间) i0_reciprocal69460000000.0000
解质量估计 total_estimate0.8978
解质量评级 solution_quality GOOD a GOOD solution
P(r) 峰数 n_peaks1
主峰位置 r_peak_primary99.3
偏度 Skewness skewness0.210
峰度 Kurtosis kurtosis-0.833
角度范围 angular_range— – 0.0700 −1
当前正则化参数 α current_alpha1.0850
最高正则化参数 α highest_alpha1755000000.0000
实空间数据点数 n_real_points15
GNOM 版本 gnom_version4.1.3
质量判据 quality_criteria AN1: 0.004; Oscil: 1.000; Stabil: 0.978; Sysdev: 1.000; Positv: 1.000; Valcen: 0.749; Smooth: 0.000

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

5. 实体与聚合体信息 (50)

7. 引用文献 (1)

8. 文件与曲线 (10)