2nyl

Crystal structure of Protein Phosphatase 2A (PP2A) holoenzyme with the catalytic subunit carboxyl terminus truncated

Method: X-RAY DIFFRACTION D_max: 170.1 Å Quality: GOOD

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Protein phosphatase 2, regulatory subunit A (PR 65), alpha isoform

Homo sapiens

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4）与蛋白拷贝数一致	链 A； UniProt 8–589	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	Serine/threonine-protein phosphatase 2A 56 kDa regulatory subunit gamma isoform × 1 （Q13362） Serine/threonine-protein phosphatase 2A catalytic subunit alpha isoform × 1 （P67775） microcystin LR × 1 MN MANGANESE (II) ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；277 K；10-15% PEG8000, 0.1 M Tris-Cl, 0.2 M magnesium sulfate, pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K	分辨率 3.80 Å R-free 0.335
2	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4）与蛋白拷贝数一致	链 D； UniProt 8–589	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	Serine/threonine-protein phosphatase 2A 56 kDa regulatory subunit gamma isoform × 1 （Q13362） Serine/threonine-protein phosphatase 2A catalytic subunit alpha isoform × 1 （P67775） microcystin LR × 1 MN MANGANESE (II) ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；277 K；10-15% PEG8000, 0.1 M Tris-Cl, 0.2 M magnesium sulfate, pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K	分辨率 3.80 Å R-free 0.335

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB	相对当前条目 2NYL	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
2IE3 Structure of the Protein Phosphatase 2A Core Enzyme Bound to Tumor-inducing Toxins 提交 2006-09-17	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 A 1–589（589 aa）片段：scaffolding subunit	未记录	MN MANGANESE (II) ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；293 K；0.2 mM lithium sulfate, 1.5 M ammonium sulfate, 0.1 M Tris-Cl pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 2.80 Å R-free 0.264
2IE4 Structure of the Protein Phosphatase 2A Core Enzyme Bound to okadaic acid 提交 2006-09-17	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1–589（589 aa）片段：scaffolding subunit	未记录	MN MANGANESE (II) ION × 2 OKA OKADAIC ACID × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；293 K；0.2 mM lithium sulfate, 1.5 M ammonium sulfate, 0.1 M Tris-Cl pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 2.60 Å R-free 0.230
2NPP Structure of the Protein Phosphatase 2A Holoenzyme 提交 2006-10-28	构建体不同突变/修饰不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 D 1–589（589 aa）片段：scaffolding subunit	未记录	MN MANGANESE (II) ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；277.5 K；15% PEG 8000, 0.1 M Tris-Cl pH 8.5, and 0.2 M magnesium sulfate, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277.5K	分辨率 3.30 Å R-free 0.299
2NPP Structure of the Protein Phosphatase 2A Holoenzyme 提交 2006-10-28	构建体不同突变/修饰不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 1–589（589 aa）片段：scaffolding subunit	未记录	MN MANGANESE (II) ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；277.5 K；15% PEG 8000, 0.1 M Tris-Cl pH 8.5, and 0.2 M magnesium sulfate, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277.5K	分辨率 3.30 Å R-free 0.299
2NYM Crystal Structure of Protein Phosphatase 2A (PP2A) with C-terminus truncated catalytic subunit 提交 2006-11-21	结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 8–589（582 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	MN MANGANESE (II) ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；277 K；10-15% PEG8000, 0.1 M Tris-Cl, 0.2 M magnesium sulfate, pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K	分辨率 3.60 Å R-free 0.331
2NYM Crystal Structure of Protein Phosphatase 2A (PP2A) with C-terminus truncated catalytic subunit 提交 2006-11-21	结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 D 8–589（582 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	MN MANGANESE (II) ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；277 K；10-15% PEG8000, 0.1 M Tris-Cl, 0.2 M magnesium sulfate, pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K	分辨率 3.60 Å R-free 0.331

共 4 个其他 PDB 条目、6 个 assembly。打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	Q96DH3_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 1–582； UniProt 8–589 作者链 D； PDB构建体 1–582； UniProt 8–589

Serine/threonine-protein phosphatase 2A 56 kDa regulatory subunit gamma isoform

Homo sapiens

UniProt Q13362

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4）与蛋白拷贝数一致	链 B； UniProt 38–425	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	Protein phosphatase 2, regulatory subunit A (PR 65), alpha isoform × 1 （Q96DH3） Serine/threonine-protein phosphatase 2A catalytic subunit alpha isoform × 1 （P67775） microcystin LR × 1 MN MANGANESE (II) ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；277 K；10-15% PEG8000, 0.1 M Tris-Cl, 0.2 M magnesium sulfate, pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K	分辨率 3.80 Å R-free 0.335
2	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4）与蛋白拷贝数一致	链 E； UniProt 38–425	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	Protein phosphatase 2, regulatory subunit A (PR 65), alpha isoform × 1 （Q96DH3） Serine/threonine-protein phosphatase 2A catalytic subunit alpha isoform × 1 （P67775） microcystin LR × 1 MN MANGANESE (II) ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；277 K；10-15% PEG8000, 0.1 M Tris-Cl, 0.2 M magnesium sulfate, pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K	分辨率 3.80 Å R-free 0.335

数据库中的同蛋白其他状态

其他 PDB	相对当前条目 2NYL	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
2IAE Crystal structure of a protein phosphatase 2A (PP2A) holoenzyme. 提交 2006-09-07	构建体不同突变/修饰不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 B 30–436（407 aa）片段：B56gamma1 subunit, residues 30-436	未记录	MN MANGANESE (II) ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；298 K；0.1M MES, pH 7.0, 50mM NaCl, 1.4M ammonium sulfate, 0.2M LiCl, 2% 1,6-diaminohexane, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K	分辨率 3.50 Å R-free 0.316
2IAE Crystal structure of a protein phosphatase 2A (PP2A) holoenzyme. 提交 2006-09-07	构建体不同突变/修饰不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 E 30–436（407 aa）片段：B56gamma1 subunit, residues 30-436	未记录	MN MANGANESE (II) ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；298 K；0.1M MES, pH 7.0, 50mM NaCl, 1.4M ammonium sulfate, 0.2M LiCl, 2% 1,6-diaminohexane, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K	分辨率 3.50 Å R-free 0.316
2JAK Human PP2A regulatory subunit B56g 提交 2006-11-29	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 11–380（370 aa）片段：RESIDUES 11-380	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 29% MPD 0.1M TRIS, PH 8.0 20MM L-PROLINE	分辨率 2.60 Å R-free 0.260
2NPP Structure of the Protein Phosphatase 2A Holoenzyme 提交 2006-10-28	构建体不同突变/修饰不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 E 1–439（439 aa）	未记录	MN MANGANESE (II) ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；277.5 K；15% PEG 8000, 0.1 M Tris-Cl pH 8.5, and 0.2 M magnesium sulfate, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277.5K	分辨率 3.30 Å R-free 0.299
2NPP Structure of the Protein Phosphatase 2A Holoenzyme 提交 2006-10-28	构建体不同突变/修饰不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 B 1–439（439 aa）	未记录	MN MANGANESE (II) ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；277.5 K；15% PEG 8000, 0.1 M Tris-Cl pH 8.5, and 0.2 M magnesium sulfate, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277.5K	分辨率 3.30 Å R-free 0.299
2NYM Crystal Structure of Protein Phosphatase 2A (PP2A) with C-terminus truncated catalytic subunit 提交 2006-11-21	结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 B 38–425（388 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	MN MANGANESE (II) ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；277 K；10-15% PEG8000, 0.1 M Tris-Cl, 0.2 M magnesium sulfate, pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K	分辨率 3.60 Å R-free 0.331
2NYM Crystal Structure of Protein Phosphatase 2A (PP2A) with C-terminus truncated catalytic subunit 提交 2006-11-21	结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 E 38–425（388 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	MN MANGANESE (II) ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；277 K；10-15% PEG8000, 0.1 M Tris-Cl, 0.2 M magnesium sulfate, pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K	分辨率 3.60 Å R-free 0.331
3FGA Structural Basis of PP2A and Sgo interaction 提交 2008-12-05	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric	链 B 34–436（403 aa）片段：sequence database residues 34-436	未记录	MN MANGANESE (II) ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 EVAPORATION；pH 7；295 K；0.2 M SCTD, 20% w/v Polyethylene glycol 3,350, pH 7, EVAPORATION, temperature 295K	分辨率 2.70 Å R-free 0.277
5JJA Crystal structure of a PP2A B56gamma/BubR1 complex 提交 2016-04-22	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 30–380（351 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；0.1 M HEPES pH 7.5 and 20% PEG 3350	分辨率 2.35 Å R-free 0.204
5JJA Crystal structure of a PP2A B56gamma/BubR1 complex 提交 2016-04-22	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 30–380（351 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；0.1 M HEPES pH 7.5 and 20% PEG 3350	分辨率 2.35 Å R-free 0.204
5K6S The structure of the PP2A B56 subunit BubR1 complex 提交 2016-05-25	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 62–411（350 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.75；298 K；8% PEG 6K, 0.8 M HEPES, 0.8 M LiCl	分辨率 2.79 Å R-free 0.227
5SW9 The structure of the PP2A B56 subunit RepoMan complex 提交 2016-08-08	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 62–411（350 aa）片段：UNP residues 62-411	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.75；298 K；8% PEG 8K, 0.8 M HEPES, 0.8 M LiCl	分辨率 2.85 Å R-free 0.227
5SWF The structure of the PP2A B56 subunit double phosphorylated BubR1 complex 提交 2016-08-08	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 62–411（350 aa）片段：UNP residues 62-411	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.75；298 K；8% PEG 8k, 0.8 M HEPES, 0.8 M LiCl	分辨率 2.82 Å R-free 0.231
6OYL The structure of the PP2A B56 subunit KIF4A complex 提交 2019-05-14	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 62–411（350 aa）片段：UNP residues 62-411	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.75；298 K；0.1 M HEPES, pH 7.75, 0.8 M lithium chloride, 8% PEG8000	分辨率 3.15 Å R-free 0.231
6TOQ Crystal structure of a PP2A B56y/HTLV-1 integrase complex 提交 2019-12-11	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 AAA 11–380（370 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.2；293.15 K；0.1 M Na/KPO4 pH 6.2, 20-% 1,2-propanediol, 10% glycerol	分辨率 3.16 Å R-free 0.294
6VOY Cryo-EM structure of HTLV-1 instasome 提交 2020-02-01	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：dodecameric	链 E 30–372（343 aa）链 F 30–372（343 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 4 MG MAGNESIUM ION × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 NITROGEN	分辨率 3.70 Å
6VRO The structure of the PP2A B56 subunit AIM1 complex 提交 2020-02-08	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 62–411（350 aa）片段：UNP residues 62-411	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；289 K；0.1 M Tris, pH 8.0, 9% PEG8000, 0.9 M lithium chloride	分辨率 2.45 Å R-free 0.235
7OUF Structure of the STLV intasome:B56 complex bound to the strand-transfer inhibitor XZ450 提交 2021-06-11	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：decameric	链 C 11–380（370 aa）链 F 11–380（370 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 4 MG MAGNESIUM ION × 4 1L0 4-azanyl-~{N}-[[2,4-bis(fluoranyl)phenyl]methyl]-6-[3-(dimethylamino)-3-oxidanylidene-propyl]-1-oxidanyl-2-oxidanylidene-1,8-naphthyridine-3-carboxamide × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 6 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.00 Å
7OUG STLV-1 intasome:B56 in complex with the strand-transfer inhibitor raltegravir 提交 2021-06-11	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：decameric	链 C 11–380（370 aa）链 F 11–380（370 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 4 MG MAGNESIUM ION × 4 RLT N-(4-fluorobenzyl)-5-hydroxy-1-methyl-2-(1-methyl-1-{[(5-methyl-1,3,4-oxadiazol-2-yl)carbonyl]amino}ethyl)-6-oxo-1,6-di hydropyrimidine-4-carboxamide × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 6 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.10 Å
7PEL CryoEM structure of simian T-cell lymphotropic virus intasome in complex with PP2A regulatory subunit B56 gamma 提交 2021-08-10	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：decameric	链 C 11–380（370 aa）链 F 11–380（370 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 4	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 6 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.34 Å
7SOY The structure of the PP2A-B56gamma1 holoenzyme-PME-1 complex 提交 2021-11-01	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 B 1–449（449 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.40 Å
9GNJ Crystal structure of a PP2A B56gamma double phosphorylated BRCA2 complex 提交 2024-09-03	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 30–380（351 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；18% de PEG3350, 100mM Bis-Tris propane, 200 mM de Sodium Citrate	分辨率 2.85 Å R-free 0.229
9MF5 CryoEM structure of the Protein Phosphatase 2A (Abeta-B56gamma-Calpha) holoenzyme complex 提交 2024-12-09	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 B 1–524（524 aa）	未记录	MN MANGANESE (II) ION × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.20 Å
9MIP CryoEM structure of the Protein Phasphatase 2A (Aalpha-B56gamma-Calpha) holoenzyme complex 提交 2024-12-13	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 B 1–524（524 aa）	未记录	MN MANGANESE (II) ION × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.40 Å

共 20 个其他 PDB 条目、24 个 assembly。打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	2A5G_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	2
链与序列区间	作者链 B； PDB构建体 1–388； UniProt 38–425 作者链 E； PDB构建体 1–388； UniProt 38–425

Serine/threonine-protein phosphatase 2A catalytic subunit alpha isoform

Homo sapiens

UniProt P67775

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4）与蛋白拷贝数一致	链 C； UniProt 2–294	未记录	Protein phosphatase 2, regulatory subunit A (PR 65), alpha isoform × 1 （Q96DH3） Serine/threonine-protein phosphatase 2A 56 kDa regulatory subunit gamma isoform × 1 （Q13362） microcystin LR × 1 MN MANGANESE (II) ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；277 K；10-15% PEG8000, 0.1 M Tris-Cl, 0.2 M magnesium sulfate, pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K	分辨率 3.80 Å R-free 0.335
2	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4）与蛋白拷贝数一致	链 F； UniProt 2–294	未记录	Protein phosphatase 2, regulatory subunit A (PR 65), alpha isoform × 1 （Q96DH3） Serine/threonine-protein phosphatase 2A 56 kDa regulatory subunit gamma isoform × 1 （Q13362） microcystin LR × 1 MN MANGANESE (II) ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；277 K；10-15% PEG8000, 0.1 M Tris-Cl, 0.2 M magnesium sulfate, pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K	分辨率 3.80 Å R-free 0.335

数据库中的同蛋白其他状态

其他 PDB	相对当前条目 2NYL	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
2IAE Crystal structure of a protein phosphatase 2A (PP2A) holoenzyme. 提交 2006-09-07	构建体不同突变/修饰不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 C 1–309（309 aa）片段：Calpha subunit	突变：D88N 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	MN MANGANESE (II) ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；298 K；0.1M MES, pH 7.0, 50mM NaCl, 1.4M ammonium sulfate, 0.2M LiCl, 2% 1,6-diaminohexane, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K	分辨率 3.50 Å R-free 0.316
2IAE Crystal structure of a protein phosphatase 2A (PP2A) holoenzyme. 提交 2006-09-07	构建体不同突变/修饰不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 F 1–309（309 aa）片段：Calpha subunit	突变：D88N 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	MN MANGANESE (II) ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；298 K；0.1M MES, pH 7.0, 50mM NaCl, 1.4M ammonium sulfate, 0.2M LiCl, 2% 1,6-diaminohexane, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K	分辨率 3.50 Å R-free 0.316
2IE3 Structure of the Protein Phosphatase 2A Core Enzyme Bound to Tumor-inducing Toxins 提交 2006-09-17	构建体不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 C 1–309（309 aa）片段：catalytic subunit	未记录	MN MANGANESE (II) ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；293 K；0.2 mM lithium sulfate, 1.5 M ammonium sulfate, 0.1 M Tris-Cl pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 2.80 Å R-free 0.264
2IE4 Structure of the Protein Phosphatase 2A Core Enzyme Bound to okadaic acid 提交 2006-09-17	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 C 1–309（309 aa）片段：catalytic subunit	未记录	MN MANGANESE (II) ION × 2 OKA OKADAIC ACID × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；293 K；0.2 mM lithium sulfate, 1.5 M ammonium sulfate, 0.1 M Tris-Cl pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 2.60 Å R-free 0.230
2NPP Structure of the Protein Phosphatase 2A Holoenzyme 提交 2006-10-28	构建体不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 F 1–309（309 aa）片段：catalytic subunit	未记录	MN MANGANESE (II) ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；277.5 K；15% PEG 8000, 0.1 M Tris-Cl pH 8.5, and 0.2 M magnesium sulfate, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277.5K	分辨率 3.30 Å R-free 0.299
2NPP Structure of the Protein Phosphatase 2A Holoenzyme 提交 2006-10-28	构建体不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 C 1–309（309 aa）片段：catalytic subunit	未记录	MN MANGANESE (II) ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；277.5 K；15% PEG 8000, 0.1 M Tris-Cl pH 8.5, and 0.2 M magnesium sulfate, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277.5K	分辨率 3.30 Å R-free 0.299
2NYM Crystal Structure of Protein Phosphatase 2A (PP2A) with C-terminus truncated catalytic subunit 提交 2006-11-21	结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 C 2–294（293 aa）	未记录	MN MANGANESE (II) ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；277 K；10-15% PEG8000, 0.1 M Tris-Cl, 0.2 M magnesium sulfate, pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K	分辨率 3.60 Å R-free 0.331
2NYM Crystal Structure of Protein Phosphatase 2A (PP2A) with C-terminus truncated catalytic subunit 提交 2006-11-21	结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 F 2–294（293 aa）	未记录	MN MANGANESE (II) ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；277 K；10-15% PEG8000, 0.1 M Tris-Cl, 0.2 M magnesium sulfate, pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K	分辨率 3.60 Å R-free 0.331
3C5W Complex between PP2A-specific methylesterase PME-1 and PP2A core enzyme 提交 2008-02-01	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 C 1–309（309 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；290 K；25% w/v PEG3350, 100 mM ammonium citrate, and 5 mM DTT, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 290K	分辨率 2.80 Å R-free 0.263
3DW8 Structure of a Protein Phosphatase 2A Holoenzyme with B55 subunit 提交 2008-07-21	构建体不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 C 1–309（309 aa）	未记录	MN MANGANESE (II) ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；290 K；7-10% PEG 35000, 0.10-0.15 M Sodium citrate pH 5.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 290K	分辨率 2.85 Å R-free 0.285
3DW8 Structure of a Protein Phosphatase 2A Holoenzyme with B55 subunit 提交 2008-07-21	构建体不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 F 1–309（309 aa）	未记录	MN MANGANESE (II) ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；290 K；7-10% PEG 35000, 0.10-0.15 M Sodium citrate pH 5.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 290K	分辨率 2.85 Å R-free 0.285
3FGA Structural Basis of PP2A and Sgo interaction 提交 2008-12-05	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric	链 C 1–309（309 aa）	突变：D88N	MN MANGANESE (II) ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 EVAPORATION；pH 7；295 K；0.2 M SCTD, 20% w/v Polyethylene glycol 3,350, pH 7, EVAPORATION, temperature 295K	分辨率 2.70 Å R-free 0.277
3K7V Protein phosphatase 2A core complex bound to dinophysistoxin-1 提交 2009-10-13	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 C 1–309（309 aa）	未记录	SO4 SULFATE ION × 3 XT1 (2R)-3-[(2S,5R,6R,8S)-8-{(1R,2E)-3-[(2R,4a'R,5R,6'S,8'R,8a'S)-6'-{(1S,3S)-3-[(2S,3R,6R,11R)-3,11-dimethyl-1,7-dioxaspiro[5.5]undec-2-yl]-1-hydroxybutyl}-8'-hydroxy-7'-methylideneoctahydro-3H,3'H-spiro[furan-2,2'-pyrano[3,2-b]pyran]-5-yl]-1-methylprop-2-en-1-yl}-5-hydroxy-10-methyl-1,7-dioxaspiro[5.5]undec-10-en-2-yl]-2-hydroxy-2-methylpropanoic acid × 1 MN MANGANESE (II) ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；293 K；0.2 M LITHIUM SULFATE, 1.5 M AMMONIUM SULFATE, 0.1 M TRIS-CL, pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 2.85 Å R-free 0.262
3K7W Protein phosphatase 2A core complex bound to dinophysistoxin-2 提交 2009-10-13	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 C 1–309（309 aa）	未记录	SO4 SULFATE ION × 3 XT2 (2R)-2-hydroxy-3-[(2S,5R,6R,8S)-5-hydroxy-8-{(1R,2E)-3-[(2R,4a'R,5R,6'S,8'R,8a'S)-8'-hydroxy-6'-{(1S,3S)-1-hydroxy-3-[( 2S,6R,11S)-11-methyl-1,7-dioxaspiro[5.5]undec-2-yl]butyl}-7'-methylideneoctahydro-3H,3'H-spiro[furan-2,2'-pyrano[3,2-b]p yran]-5-yl]-1-methylprop-2-en-1-yl}-10-methyl-1,7-dioxaspiro[5.5]undec-10-en-2-yl]-2-methylpropanoic acid × 1 MN MANGANESE (II) ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；293 K；0.2 M LITHIUM SULFATE, 1.5 M AMMONIUM SULFATE, 0.1 M TRIS-CL, pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 2.96 Å R-free 0.263
3P71 Crystal structure of the complex of LCMT-1 and PP2A 提交 2010-10-11	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 C 1–309（309 aa）片段：CATALYTIC SUBUNIT ALPHA ISOFORM	未记录	PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 1 AN6 5'-{[(3S)-3-amino-3-carboxypropyl](ethyl)amino}-5'-deoxyadenosine × 1 MN MANGANESE (II) ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.2；291 K；PROTEIN COMPLEX (~5 MG/ML), 100MM TRIS-HCL, 22-26% V/V PEG 4000, 200 MM SODIUM ACETATE, 5 MM DTT, pH 8.2, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 291K	分辨率 2.70 Å R-free 0.249
4I5L Structural mechanism of trimeric PP2A holoenzyme involving PR70: insight for Cdc6 dephosphorylation 提交 2012-11-28	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 C 1–309（309 aa）	未记录	PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 8 CA CALCIUM ION × 2 MN MANGANESE (II) ION × 2 MLI MALONATE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5；292 K；0.1M Na Malonate, 12% PEG 3350 + 6.2mg/mL protein in buffer Tris, 150mM NaCl , pH 5.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 292K	分辨率 2.43 Å R-free 0.228
4I5L Structural mechanism of trimeric PP2A holoenzyme involving PR70: insight for Cdc6 dephosphorylation 提交 2012-11-28	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 信息不足异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 F 1–309（309 aa）	未记录	PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 3 CA CALCIUM ION × 2 MN MANGANESE (II) ION × 2 MLI MALONATE ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5；292 K；0.1M Na Malonate, 12% PEG 3350 + 6.2mg/mL protein in buffer Tris, 150mM NaCl , pH 5.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 292K	分辨率 2.43 Å R-free 0.228
4I5N Structural mechanism of trimeric PP2A holoenzyme involving PR70: insight for Cdc6 dephosphorylation 提交 2012-11-28	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 C 1–309（309 aa）	未记录	CA CALCIUM ION × 2 MN MANGANESE (II) ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.75；296 K；0.03M Succinic acid with 7% PEG 3350. Protein (6.2mg/mL) in 10mM tris pH 8.0, 150mM NaCl, 5mM DTT, 1mM CaCl2, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 296K	分辨率 2.80 Å R-free 0.250
4I5N Structural mechanism of trimeric PP2A holoenzyme involving PR70: insight for Cdc6 dephosphorylation 提交 2012-11-28	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 信息不足异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 F 1–309（309 aa）	未记录	CA CALCIUM ION × 2 MN MANGANESE (II) ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.75；296 K；0.03M Succinic acid with 7% PEG 3350. Protein (6.2mg/mL) in 10mM tris pH 8.0, 150mM NaCl, 5mM DTT, 1mM CaCl2, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 296K	分辨率 2.80 Å R-free 0.250
4IYP structure of the nPP2Ac-alpha4 complex 提交 2013-01-29	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 C 6–153（148 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；291 K；12-15% PEG3350 (v/v), 0.3 M Na/K tartrate, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 291K	分辨率 2.80 Å R-free 0.222
4LAC Crystal Structure of Protein Phosphatase 2A (PP2A) and PP2A phosphatase activator (PTPA) complex with ATPgammaS 提交 2013-06-19	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 C 1–309（309 aa）	未记录	PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 1 MN MANGANESE (II) ION × 2 AGS PHOSPHOTHIOPHOSPHORIC ACID-ADENYLATE ESTER × 1 MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；298 K；0.1M MES at pH6.5 and 10-12% PEG20,000, 1mM ATPgammaS, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K	分辨率 2.82 Å R-free 0.242
4NY3 Human PTPA in complex with peptide 提交 2013-12-10	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 C 304–309（6 aa）片段：UNP Residues 304-309	未记录	SO4 SULFATE ION × 5 GOL GLYCEROL × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；277 K；2 M (NH4)2SO4 and 0.1 M HEPES pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K	分辨率 1.80 Å R-free 0.185
4NY3 Human PTPA in complex with peptide 提交 2013-12-10	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 D 304–309（6 aa）片段：UNP Residues 304-309	未记录	SO4 SULFATE ION × 5 GOL GLYCEROL × 3	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；277 K；2 M (NH4)2SO4 and 0.1 M HEPES pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K	分辨率 1.80 Å R-free 0.185
5W0W Crystal structure of Protein Phosphatase 2A bound to TIPRL 提交 2017-06-01	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 C 1–309（309 aa）	未记录	MN MANGANESE (II) ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.2；292 K；0.1M citric acid pH 5.2, 9% PEG4000, 0.2M sodium acetate	分辨率 3.80 Å R-free 0.246
5W0W Crystal structure of Protein Phosphatase 2A bound to TIPRL 提交 2017-06-01	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 F 1–309（309 aa）	未记录	MN MANGANESE (II) ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.2；292 K；0.1M citric acid pH 5.2, 9% PEG4000, 0.2M sodium acetate	分辨率 3.80 Å R-free 0.246
5W0W Crystal structure of Protein Phosphatase 2A bound to TIPRL 提交 2017-06-01	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 I 1–309（309 aa）	未记录	MN MANGANESE (II) ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.2；292 K；0.1M citric acid pH 5.2, 9% PEG4000, 0.2M sodium acetate	分辨率 3.80 Å R-free 0.246
5W0W Crystal structure of Protein Phosphatase 2A bound to TIPRL 提交 2017-06-01	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 4 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 L 1–309（309 aa）	未记录	MN MANGANESE (II) ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.2；292 K；0.1M citric acid pH 5.2, 9% PEG4000, 0.2M sodium acetate	分辨率 3.80 Å R-free 0.246
6NTS Protein Phosphatase 2A (Aalpha-B56alpha-Calpha) holoenzyme in complex with a Small Molecule Activator of PP2A (SMAP) 提交 2019-01-30	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 C 1–301（301 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	L2J N-[(1R,2R,3S)-2-hydroxy-3-(10H-phenoxazin-10-yl)cyclohexyl]-4-(trifluoromethoxy)benzene-1-sulfonamide × 1 MN MANGANESE (II) ION × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.02 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.63 Å
7CUN The structure of human Integrator-PP2A complex 提交 2020-08-23	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric	链 Q 1–309（309 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 2 MN MANGANESE (II) ION × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.50 Å
7K36 Cryo-EM structure of STRIPAK complex 提交 2020-09-10	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：nonameric	链 C 1–309（309 aa）	未记录	MN MANGANESE (II) ION × 2 ZN ZINC ION × 2 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.30 Å
7PKS Structural basis of Integrator-mediated transcription regulation 提交 2021-08-26	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合异源复合物；蛋白 × 30 PDB 声明：31-meric	链 q 1–309（309 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 10 MN MANGANESE (II) ION × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.60 Å
7SOY The structure of the PP2A-B56gamma1 holoenzyme-PME-1 complex 提交 2021-11-01	构建体不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 C 1–309（309 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.40 Å
7YCX The structure of INTAC-PEC complex 提交 2022-07-02	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合异源复合物；蛋白 × 31 PDB 声明：34-meric	链 Q 1–309（309 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 10 MN MANGANESE (II) ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.18 Å
8RBX Structure of Integrator-PP2A bound to a paused RNA polymerase II-DSIF-NELF-nucleosome complex 提交 2023-12-05	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合异源复合物；蛋白 × 43 PDB 声明：46-meric	链 q 1–309（309 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1 MN MANGANESE (II) ION × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.10 Å
8RBZ Structure of Integrator-PP2A-SOSS-CTD post-termination complex 提交 2023-12-05	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 21 PDB 声明：21-meric	链 q 1–309（309 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 2 MN MANGANESE (II) ION × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.70 Å
8RC4 Structure of Integrator-PP2A complex 提交 2023-12-06	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：16-meric	链 q 1–309（309 aa）	未记录	MN MANGANESE (II) ION × 2 ZN ZINC ION × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.10 Å
8SO0 Cryo-EM structure of the PP2A:B55-FAM122A complex 提交 2023-04-28	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 C 1–309（309 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	FE FE (III) ION × 1 ZN ZINC ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8；CHAPSO was added only immediately prior to vitrification cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.80 Å
8TTB Cryo-EM structure of the PP2A:B55-ARPP19 complex 提交 2023-08-13	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 C 1–309（309 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	FE FE (III) ION × 1 ZN ZINC ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8；CHAPSO was added only immediately prior to vitrification cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.77 Å
8TWE Cryo-EM structure of the PP2A:B55-FAM122A complex, B55 body 提交 2023-08-21	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 C 1–309（309 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8；CHAPSO was added only immediately prior to vitrification cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.55 Å
8TWI Cryo-EM structure of the PP2A:B55-FAM122A complex, PP2Ac body 提交 2023-08-21	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 C 1–309（309 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	FE FE (III) ION × 1 ZN ZINC ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8；CHAPSO was added only immediately prior to vitrification cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.69 Å
8U1X The structure of the PP2A-B56Delta holoenzyme mutant - E197K 提交 2023-09-04	构建体不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 C 1–309（309 aa）	未记录	MN MANGANESE (II) ION × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.70 Å
8U89 The structure of the PP2A-B56Delta holoenzyme mutant - E197K 提交 2023-09-16	构建体不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 C 1–309（309 aa）	未记录	MN MANGANESE (II) ION × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.30 Å
8UO5 Protein Phosphatase 2A B55 subunit in complex with IER5 提交 2023-10-19	构建体不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 C 1–309（309 aa）	未记录	FE FE (III) ION × 1 ZN ZINC ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.6 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.27 Å
8UWB Crystal structure of PP2A PPP2R1A-PPP2CA-PPP2R5E phosphatase. 提交 2023-11-06	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 C 1–309（309 aa）链 F 1–309（309 aa）	未记录	MN MANGANESE (II) ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.77；297 K；23% (w/v) PEG 20k, 0.1 M BIS-TRIS pH 5.77	分辨率 3.15 Å R-free 0.263
8UWB Crystal structure of PP2A PPP2R1A-PPP2CA-PPP2R5E phosphatase. 提交 2023-11-06	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 C 1–309（309 aa）链 F 1–309（309 aa）	未记录	MN MANGANESE (II) ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.77；297 K；23% (w/v) PEG 20k, 0.1 M BIS-TRIS pH 5.77	分辨率 3.15 Å R-free 0.263
8YJB Cryo-EM structure of the human DSS1-INTAC complex 提交 2024-03-01	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric	链 Q 1–309（309 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 2 MN MANGANESE (II) ION × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.10 Å
9C6B PP2A:B55-p107 substrate complex 提交 2024-06-07	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 C 1–309（309 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	FE2 FE (II) ION × 1 ZN ZINC ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.60 Å
9C7T PP2A:B55-Eya3 substrate complex 提交 2024-06-11	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 C 1–309（309 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	FE2 FE (II) ION × 1 ZN ZINC ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.70 Å
9J5I Pathogen effector forms a phosphatase holoenzyme complex with host core enzyme to promote disease 提交 2024-08-12	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric	链 C 1–309（309 aa）链 F 1–309（309 aa）	未记录	MN MANGANESE (II) ION × 4	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.38 Å
9J5K Pathogen effector forms a phosphatase holoenzyme complex with host core enzyme to promote disease 提交 2024-08-12	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric	链 C 1–309（309 aa）链 F 1–309（309 aa）	未记录	MN MANGANESE (II) ION × 4	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.39 Å
9J5N Pathogen effector forms a phosphatase holoenzyme complex with host core enzyme to promote disease 提交 2024-08-13	构建体不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 C 1–309（309 aa）	未记录	MN MANGANESE (II) ION × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.30 Å
9J5R Pathogen effector forms a phosphatase holoenzyme complex with host core enzyme to promote disease 提交 2024-08-13	构建体不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 C 1–309（309 aa）	未记录	MN MANGANESE (II) ION × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.30 Å
9MF5 CryoEM structure of the Protein Phosphatase 2A (Abeta-B56gamma-Calpha) holoenzyme complex 提交 2024-12-09	构建体不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 C 1–309（309 aa）	未记录	MN MANGANESE (II) ION × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.20 Å
9MIP CryoEM structure of the Protein Phasphatase 2A (Aalpha-B56gamma-Calpha) holoenzyme complex 提交 2024-12-13	构建体不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 C 1–309（309 aa）	未记录	MN MANGANESE (II) ION × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.40 Å
9MZW PP2A-B55 holoenzyme 提交 2025-01-23	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 C 1–309（309 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.16 Å
9N0Y PP2A-B55 Holoenzyme with Eya3 提交 2025-01-24	构建体不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 C 1–309（309 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.71 Å
9N0Z PP2A-B55 Holoenzyme with B55i 提交 2025-01-24	构建体不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 C 1–309（309 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.50 Å
9O04 CryoEM structure of the FBXO42-CCDC6-PP2Ac degradasome 提交 2025-04-02	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：14-meric	链 D 1–309（309 aa）链 E 1–309（309 aa）链 I 1–309（309 aa）链 J 1–309（309 aa）链 K 1–309（309 aa）链 L 1–309（309 aa）链 M 1–309（309 aa）链 N 1–309（309 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	MN MANGANESE (II) ION × 16	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM HEPES pH 7.5, 200 mM NaCl, 1 mM TCEP pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.20 Å
9O0L CryoEM structure of the CCDC6-PP2Ac multimer 提交 2025-04-02	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：decameric	链 D 1–309（309 aa）链 E 1–309（309 aa）链 F 1–309（309 aa）链 G 1–309（309 aa）链 I 1–309（309 aa）链 J 1–309（309 aa）链 K 1–309（309 aa）链 L 1–309（309 aa）	未记录	MN MANGANESE (II) ION × 16	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM HEPES pH 7.5, 200 mM NaCl, 1 mM TCEP pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.50 Å
9VD9 Cryo-EM structure of the human DSS1-INTAC-PEC complex 提交 2025-06-07	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足异源复合物；蛋白 × 35 PDB 声明：38-meric	链 Q 1–309（309 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 10 MN MANGANESE (II) ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.60 Å

共 49 个其他 PDB 条目、60 个 assembly。打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	PP2AA_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	3
链与序列区间	作者链 C； PDB构建体 1–293； UniProt 2–294 作者链 F； PDB构建体 1–293； UniProt 2–294

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

下载 Download SAXS (.dat) P(r) (.pr.out) CIF

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	2nyl
沉积日期 deposition_date	2006-11-20
结构标题 title	Crystal structure of Protein Phosphatase 2A (PP2A) holoenzyme with the catalytic subunit carboxyl terminus truncated
关键词 keywords	HEAT repeat, HYDROLASE-HYDROLASE INHIBITOR COMPLEX; HYDROLASE/HYDROLASE INHIBITOR
实验方法 method	X-RAY DIFFRACTION

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3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

回转半径 Rg (Guinier) rg_guinier	50.75 Å
回转半径 Rg (电子) rg_electron	50.89 Å
零角强度 I(0) i0	1180440000.00
分子量 molecular_weight	289650.0 kDa
排除体积 excluded_volume	363010 Å³
包络体积 envelope_volume	535230 Å³
水化壳体积 shell_volume	86769 Å³
包络直径 envelope_diameter	175.8 Å
壳层 Rg shell_rg	55.66 Å
包络 Rg envelope_rg	49.44 Å
形状 Rg shape_rg	50.86 Å
总 Rg total_rg	51.14 Å
总原子数 total_atoms	20212
残基数 n_residues	2482
球谐函数阶数 n_harmonics	20
q 范围 q_range	— – 0.5000 Å⁻¹
数据点数 n_points	101
壳层类型 shell_type	directional
溶剂电子密度 solvent_density	0.3340 e/Å³
壳层衬度 contrast_shell	0.0300 e/Å³
CRYSOL 版本 crysol_version	4.1.3

▼

4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

最大尺寸 Dmax dmax	170.1 Å
Rg (实空间) rg_real	50.71 Å
Rg 误差 (实空间) rg_real_error	1.51 Å
I(0) (实空间) i0_real	1.1800e+09
I(0) 误差 (实空间) i0_real_error	2.0630e+07
Rg (倒空间) rg_reciprocal	50.77 Å
I(0) (倒空间) i0_reciprocal	1181000000.0000
解质量估计 total_estimate	0.8025
解质量评级 solution_quality	GOOD a GOOD solution
P(r) 峰数 n_peaks	1
主峰位置 r_peak_primary	60.4 Å
偏度 Skewness skewness	0.322
峰度 Kurtosis kurtosis	-0.267
角度范围 angular_range	— – 0.1550 Å⁻¹
当前正则化参数 α current_alpha	0.0000
最高正则化参数 α highest_alpha	51600000.0000
实空间数据点数 n_real_points	32
GNOM 版本 gnom_version	4.1.3
质量判据 quality_criteria	AN1: 0.000; Oscil: 0.810; Stabil: 1.000; Sysdev: 1.000; Positv: 1.000; Valcen: 0.998; Smooth: 0.000

▶

5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

▶

6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (5)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	Protein phosphatase 2, regulatory subunit A (PR 65), alpha isoform
分子量 formula_weight	65356.3 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A,D
原子数 atom_count	20212

DSLYPIAVLIDELRNEDVQLRLNSIKKLSTIALALGVERTRSELLPFLTDTIYDEDEVLLALAEQLGTFTTLVGGPEYVHCLLPPLESLATVEETVVRDKAVESLRAISHEHSPSDLEAHFVPLVKRLAGGDWFTSRTSACGLFSVCYPRVSSAVKAELRQYFRNLCSDDTPMVRRAAASKLGEFAKVLELDNVKSEIIPMFSNLASDEQDSVRLLAVEACVNIAQLLPQEDLEALVMPTLRQAAEDKSWRVRYMVADKFTELQKAVGPEITKTDLVPAFQNLMKDCEAEVRAAASHKVKEFCENLSADCRENVIMSQILPCIKELVSDANQHVKSALASVIMGLSPILGKDNTIEHLLPLFLAQLKDECPEVRLNIISNLDCVNEVIGIRQLSQSLLPAIVELAEDAKWRVRLAIIEYMPLLAGQLGVEFFDEKLNSLCMAWLVDHVYAIREAATSNLKKLVEKFGKEWAHATIIPKVLAMSGDPNYLHRMTTLFCINVLSEVCGQDITTKHMLPTVLRMAGDPVANVRFNVAKSLQKIGPILDNSTLQSEVKPILEKLTQDQDVDVKYFAQEALTVLSLA

来源 Source

来源生物 organism	Homo sapiens
通用名 common_name	human
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9606
宿主生物 host_organism	Escherichia coli BL21(DE3)

实体 2 Entity 2 polymer

描述 description	Serine/threonine-protein phosphatase 2A 56 kDa regulatory subunit gamma isoform
分子量 formula_weight	46467.3 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	B,E

QEKLFIQKLRQCCVLFDFVSDPLSDLKWKEVKRAALSEMVEYITHNRNVITEPIYPEVVHMFAVNMFRTLPPSSNPTGAEFDPEEDEPTLEAAWPHLQLVYEFFLRFLESPDFQPNIAKKYIDQKFVLQLLELFDSEDPRERDFLKTTLHRIYGKFLGLRAYIRKQINNIFYRFIYETEHHNGIAELLEILGSIINGFALPLKEEHKIFLLKVLLPLHKVKSLSVYHPQLAYCVVQFLEKDSTLTEPVVMALLKYWPKTHSPKEVMFLNELEEILDVIEPSEFVKIMEPLFRQLAKCVSSPHFQVAERALYYWNNEYIMSLISDNAAKILPIMFPSLYRNSKTHWNKTIHGLIYNALKLFMEMNQKLFDDCTQQFKAEKLKEKLKMKE

来源 Source

来源生物 organism	Homo sapiens
通用名 common_name	human
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9606
宿主生物 host_organism	Escherichia coli BL21(DE3)

实体 3 Entity 3 polymer

描述 description	Serine/threonine-protein phosphatase 2A catalytic subunit alpha isoform
分子量 formula_weight	33674.9 kDa
EC 编号 ec_number	3.1.3.16
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	C,F

DEKVFTKELDQWIEQLNECKQLSESQVKSLCEKAKEILTKESNVQEVRCPVTVCGDVHGQFHDLMELFRIGGKSPDTNYLFMGDYVDRGYYSVETVTLLVALKVRYRERITILRGNHESRQITQVYGFYDECLRKYGNANVWKYFTDLFDYLPLTALVDGQIFCLHGGLSPSIDTLDHIRALDRLQEVPHEGPMCDLLWSDPDDRGGWGISPRGAGYTFGQDISETFNHANGLTLVSRAHQLVMEGYNWCHDRNVVTIFSAPNYCYRCGNQAAIMELDDTLKYSFLQFDPAPR

来源 Source

来源生物 organism	Homo sapiens
通用名 common_name	human
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9606
宿主生物 host_organism	Spodoptera frugiperda

实体 4 Entity 4 polymer

描述 description	microcystin LR
分子量 formula_weight	1014.2 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	G,H

ALDRXEX

实体 5 Entity 5 non-polymer

描述 description	MANGANESE (II) ION
分子量 formula_weight	54.9 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	4

▼

7. 折叠分类 (SCOP + CATH) 12 domains

SCOP 2.08 (6 domains)

结构域编号 domain_id	d2nyla1
类 Class class	a — All alpha proteins
折叠类型 Fold fold	a.118 — alpha-alpha superhelix
超家族 Superfamily superfamily	a.118.1 — ARM repeat
家族 Family family	a.118.1.2 — HEAT repeat

结构域编号 domain_id	d2nylb1
类 Class class	a — All alpha proteins
折叠类型 Fold fold	a.118 — alpha-alpha superhelix
超家族 Superfamily superfamily	a.118.1 — ARM repeat
家族 Family family	a.118.1.20 — B56-like

结构域编号 domain_id	d2nylc1
类 Class class	d — Alpha and beta proteins (a+b)
折叠类型 Fold fold	d.159 — Metallo-dependent phosphatases
超家族 Superfamily superfamily	d.159.1 — Metallo-dependent phosphatases
家族 Family family	d.159.1.3 — Protein serine/threonine phosphatase

结构域编号 domain_id	d2nyld1
类 Class class	a — All alpha proteins
折叠类型 Fold fold	a.118 — alpha-alpha superhelix
超家族 Superfamily superfamily	a.118.1 — ARM repeat
家族 Family family	a.118.1.2 — HEAT repeat

结构域编号 domain_id	d2nyle1
类 Class class	a — All alpha proteins
折叠类型 Fold fold	a.118 — alpha-alpha superhelix
超家族 Superfamily superfamily	a.118.1 — ARM repeat
家族 Family family	a.118.1.20 — B56-like

结构域编号 domain_id	d2nylf1
类 Class class	d — Alpha and beta proteins (a+b)
折叠类型 Fold fold	d.159 — Metallo-dependent phosphatases
超家族 Superfamily superfamily	d.159.1 — Metallo-dependent phosphatases
家族 Family family	d.159.1.3 — Protein serine/threonine phosphatase

CATH v4.4 (6 domains)

结构域编号 domain_id	2nylA00
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	25 — Alpha Horseshoe
拓扑 Topology topology	10 — Leucine-rich Repeat Variant
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Leucine-rich Repeat Variant

结构域编号 domain_id	2nylB00
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	25 — Alpha Horseshoe
拓扑 Topology topology	10 — Leucine-rich Repeat Variant
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Leucine-rich Repeat Variant

结构域编号 domain_id	2nylC00
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	60 — 4-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	21 — Purple Acid Phosphatase; chain A, domain 2
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Metallo-dependent phosphatases

结构域编号 domain_id	2nylD00
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	25 — Alpha Horseshoe
拓扑 Topology topology	10 — Leucine-rich Repeat Variant
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Leucine-rich Repeat Variant

结构域编号 domain_id	2nylE00
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	25 — Alpha Horseshoe
拓扑 Topology topology	10 — Leucine-rich Repeat Variant
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Leucine-rich Repeat Variant

结构域编号 domain_id	2nylF00
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	60 — 4-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	21 — Purple Acid Phosphatase; chain A, domain 2
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Metallo-dependent phosphatases

▶

8. 引用文献 (1)

▶

晶胞边长 a length_a	108.480 Å
晶胞边长 b length_b	159.850 Å
晶胞边长 c length_c	270.370 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	90.00 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	90.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	8

空间群 space_group	P 21 21 21
空间群编号 int_tables_number	19
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	3.800 Å
最低分辨率 resolution_low	100.000 Å
R 因子 r_factor	0.3000
R_work r_work	0.2820
R_free r_free	0.3350

fit	/app/data/saxs_computation/ny/2nyl/2nyl.fit
pddf	/app/data/pr_computation/ny/2nyl/2nyl.pr.out
profile	/app/data/saxs_computation/ny/2nyl/2nyl.dat

Crystal structure of Protein Phosphatase 2A (PP2A) holoenzyme with the catalytic subunit carboxyl terminus truncated

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Protein phosphatase 2, regulatory subunit A (PR 65), alpha isoform

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

Serine/threonine-protein phosphatase 2A 56 kDa regulatory subunit gamma isoform

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

Serine/threonine-protein phosphatase 2A catalytic subunit alpha isoform

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (5)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 3 Entity 3 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 4 Entity 4 polymer

聚合物 Polymer

实体 5 Entity 5 non-polymer

7. 折叠分类 (SCOP + CATH) 12 domains

SCOP 2.08 (6 domains)

CATH v4.4 (6 domains)

8. 引用文献 (1)

9. 文件与曲线 (10)

Files (7)

Curves (3)