2pys

Crystal Structure of a Five Site Mutated Cyanovirin-N with a Mannose Dimer Bound at 1.8 A Resolution

Method: X-RAY DIFFRACTION
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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Cyanovirin-N

Nostoc ellipsosporum

UniProt P81180

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 其他组合 同源多聚体 蛋白 2 其他聚合物 2 alpha-D-mannopyranose-(1-2)-alpha-D-mannopyranose × 2 water × 4 与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 CVN_NOSEL
Isoform —
PDB实体 1
链与序列区间 作者链 A; PDB构建体 1–101; UniProt 1–101 作者链 B; PDB构建体 1–101; UniProt 1–101

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中;数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护,因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id2pys
沉积日期 deposition_date2007-05-16
结构标题 titleCrystal Structure of a Five Site Mutated Cyanovirin-N with a Mannose Dimer Bound at 1.8 A Resolution
关键词 keywordsCYANOVIRIN-N, SUGAR BINDING PROTEIN, ANTI HIV; SUGAR BINDING PROTEIN
实验方法 methodX-RAY DIFFRACTION
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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

2pys__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

2pys__assembly_1__model_1 | I(q)

10-2 10-1 105 106 107 q (1/Angstrom) I(q)
100 个绘图点;横轴和纵轴均采用对数尺度。

2pys__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

新版 assembly/model P(r) 尚未计算 此处仅保留位置,不展示旧数据 r (Angstrom) P(r)
P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。
Rg(Guinier)18.54 Å
Rg(电子密度)17.40 Å
总 Rg18.29 Å
原子数1585
残基数204
排除体积27704 ų
最大 q0.500 Å⁻¹
Assembly Model 结构单元 聚集说明 状态 CRYSOL 操作
1 1 2pys__assembly_1__model_1 tetrameric (4) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (3)

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6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 6 domains

SCOP 2.08 (4 domains)

结构域编号 domain_idd2pysa1
类 Class classb — All beta proteins
折叠类型 Fold foldb.89 — Cyanovirin-N
超家族 Superfamily superfamilyb.89.1 — Cyanovirin-N
家族 Family familyb.89.1.1 — Cyanovirin-N
结构域编号 domain_idd2pysa2
类 Class classl — Artifacts
折叠类型 Fold foldl.1 — Tags
超家族 Superfamily superfamilyl.1.1 — Tags
家族 Family familyl.1.1.1 — Tags
结构域编号 domain_idd2pysb1
类 Class classb — All beta proteins
折叠类型 Fold foldb.89 — Cyanovirin-N
超家族 Superfamily superfamilyb.89.1 — Cyanovirin-N
家族 Family familyb.89.1.1 — Cyanovirin-N
结构域编号 domain_idd2pysb2
类 Class classl — Artifacts
折叠类型 Fold foldl.1 — Tags
超家族 Superfamily superfamilyl.1.1 — Tags
家族 Family familyl.1.1.1 — Tags

CATH v4.4 (2 domains)

结构域编号 domain_id2pysA00
类 Class class2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture30 — Roll
拓扑 Topology topology60 — HIV-inactivating Protein, Cyanovirin-n
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — Cyanovirin-N
结构域编号 domain_id2pysB00
类 Class class2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture30 — Roll
拓扑 Topology topology60 — HIV-inactivating Protein, Cyanovirin-n
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — Cyanovirin-N
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7. 引用文献 (1)