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1Q3E
HCN2J 443-645 in the presence of cGMP
提交 2003-07-29
|
构建体不同
突变/修饰不同
实验环境不同
结构质量不同
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Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 4
PDB 声明:tetrameric
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链 A
443–645(203 aa)
片段:Residues 443-645 (Reference sequence numbering)
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未记录
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PCG CYCLIC GUANOSINE MONOPHOSPHATE × 4
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 4.6;277 K;PEG 400, sodium citrate, sodium chloride, DTT, HEPES, pH 4.6, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
|
分辨率 1.90 Å
R-free 0.239
|
|
1Q3E
HCN2J 443-645 in the presence of cGMP
提交 2003-07-29
|
构建体不同
突变/修饰不同
实验环境不同
结构质量不同
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Assembly 2
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 4
PDB 声明:tetrameric
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链 B
443–645(203 aa)
片段:Residues 443-645 (Reference sequence numbering)
|
未记录
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PCG CYCLIC GUANOSINE MONOPHOSPHATE × 4
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 4.6;277 K;PEG 400, sodium citrate, sodium chloride, DTT, HEPES, pH 4.6, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
|
分辨率 1.90 Å
R-free 0.239
|
|
1Q3E
HCN2J 443-645 in the presence of cGMP
提交 2003-07-29
|
构建体不同
突变/修饰不同
实验环境不同
结构质量不同
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Assembly 3
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 8
PDB 声明:octameric
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链 A
443–645(203 aa)
片段:Residues 443-645 (Reference sequence numbering)
链 B
443–645(203 aa)
片段:Residues 443-645 (Reference sequence numbering)
|
未记录
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PCG CYCLIC GUANOSINE MONOPHOSPHATE × 8
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 4.6;277 K;PEG 400, sodium citrate, sodium chloride, DTT, HEPES, pH 4.6, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
|
分辨率 1.90 Å
R-free 0.239
|
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1Q43
HCN2I 443-640 in the presence of cAMP, selenomethionine derivative
提交 2003-08-01
|
构建体不同
突变/修饰不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 4
PDB 声明:tetrameric
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链 A
443–645(203 aa)
片段:residues 443-645
|
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点)
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CMP ADENOSINE-3',5'-CYCLIC-MONOPHOSPHATE × 4
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 4.6;277 K;PEG 400, sodium citrate, sodium chloride, DTT, HEPES, cAMP, pH 4.6, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
|
分辨率 2.00 Å
R-free 0.242
|
|
1Q43
HCN2I 443-640 in the presence of cAMP, selenomethionine derivative
提交 2003-08-01
|
构建体不同
突变/修饰不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
443–645(203 aa)
片段:residues 443-645
|
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点)
|
CMP ADENOSINE-3',5'-CYCLIC-MONOPHOSPHATE × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 4.6;277 K;PEG 400, sodium citrate, sodium chloride, DTT, HEPES, cAMP, pH 4.6, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
|
分辨率 2.00 Å
R-free 0.242
|
|
1Q43
HCN2I 443-640 in the presence of cAMP, selenomethionine derivative
提交 2003-08-01
|
构建体不同
突变/修饰不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 3
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 8
PDB 声明:octameric
|
链 A
443–645(203 aa)
片段:residues 443-645
链 B
443–645(203 aa)
片段:residues 443-645
|
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点)
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点)
|
CMP ADENOSINE-3',5'-CYCLIC-MONOPHOSPHATE × 8
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 4.6;277 K;PEG 400, sodium citrate, sodium chloride, DTT, HEPES, cAMP, pH 4.6, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
|
分辨率 2.00 Å
R-free 0.242
|
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1Q43
HCN2I 443-640 in the presence of cAMP, selenomethionine derivative
提交 2003-08-01
|
构建体不同
突变/修饰不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 4
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 4
PDB 声明:tetrameric
|
链 B
443–645(203 aa)
片段:residues 443-645
|
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点)
|
CMP ADENOSINE-3',5'-CYCLIC-MONOPHOSPHATE × 4
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 4.6;277 K;PEG 400, sodium citrate, sodium chloride, DTT, HEPES, cAMP, pH 4.6, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
|
分辨率 2.00 Å
R-free 0.242
|
|
1Q5O
HCN2J 443-645 in the presence of cAMP, selenomethionine derivative
提交 2003-08-08
|
构建体不同
突变/修饰不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 4
PDB 声明:tetrameric
|
链 A
443–645(203 aa)
片段:Residues 443-645
|
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点)
|
CMP ADENOSINE-3',5'-CYCLIC-MONOPHOSPHATE × 4
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 4.6;277 K;PEG 400, sodium citrate, sodium chloride, DTT, HEPES, cAMP, pH 4.6, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
|
分辨率 2.30 Å
R-free 0.261
|
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3BPZ
HCN2-I 443-460 E502K in the presence of cAMP
提交 2007-12-19
|
构建体不同
突变/修饰不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 4
PDB 声明:tetrameric
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链 A
443–640(198 aa)
片段:ligand biding domain (residues 443-640)
链 B
443–640(198 aa)
片段:ligand biding domain (residues 443-640)
链 C
443–640(198 aa)
片段:ligand biding domain (residues 443-640)
链 D
443–640(198 aa)
片段:ligand biding domain (residues 443-640)
|
突变:E502K
突变:E502K
突变:E502K
突变:E502K
|
CMP ADENOSINE-3',5'-CYCLIC-MONOPHOSPHATE × 4
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION;pH 4.6;279 K;PEG 400, SODIUM CITRATE, SODIUM CHLORIDE, DTT, HEPES, 5 mM CAMP, pH 4.6, VAPOR DIFFUSION, temperature 279K
|
分辨率 1.65 Å
R-free 0.216
|
|
3ETQ
X-ray structure of cysteine-free fragment of mHCN2 C-terminal region from amino acids 443-630 including C508N, C584S, and C601S mutations
提交 2008-10-08
|
构建体不同
突变/修饰不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 8
PDB 声明:octameric
|
链 A
443–640(198 aa)
片段:C-terminal fragment
链 B
443–640(198 aa)
片段:C-terminal fragment
|
突变:C508N, C584S, C601S
突变:C508N, C584S, C601S
|
CMP ADENOSINE-3',5'-CYCLIC-MONOPHOSPHATE × 8
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 5;277 K;16% w/v PEG 6000, 500 mM NaCl, 10% glycerol, 100 mM citrate, pH 5.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
|
分辨率 1.90 Å
R-free 0.216
|
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3FFQ
HCN2I 443-640 apo-state
提交 2008-12-04
|
构建体不同
突变/修饰不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 4
PDB 声明:tetrameric
|
链 A
443–640(198 aa)
|
未记录
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BR BROMIDE ION × 20
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;277 K;Two uL protein (5-7 mg/mL) mixed with one uL reservoir solution composed of 0.4 M NaCl, 0.1 NaBr, 0.1 M MES, pH 6.0, 20% glycerol (v/v), and 20% PEG 8000 (w/v). Crystals grew within eight weeks and harvested an additional eight weeks after initial growth, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
|
分辨率 2.40 Å
R-free 0.283
|
|
3FFQ
HCN2I 443-640 apo-state
提交 2008-12-04
|
构建体不同
突变/修饰不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 4
PDB 声明:tetrameric
|
链 B
443–640(198 aa)
|
未记录
|
BR BROMIDE ION × 16
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;277 K;Two uL protein (5-7 mg/mL) mixed with one uL reservoir solution composed of 0.4 M NaCl, 0.1 NaBr, 0.1 M MES, pH 6.0, 20% glycerol (v/v), and 20% PEG 8000 (w/v). Crystals grew within eight weeks and harvested an additional eight weeks after initial growth, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
|
分辨率 2.40 Å
R-free 0.283
|
|
4EQF
Trip8b-1a#206-567 interacting with the carboxy-terminal seven residues of HCN2
提交 2012-04-18
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
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Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
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链 B
857–863(7 aa)
片段:UNP residues 857-863
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未记录
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未记录非水小分子
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6;298 K;91mM MES, 91mM triSodium citrate, 3.63M NaCL, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K
|
分辨率 3.00 Å
R-free 0.281
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5JON
Crystal structure of the unliganded form of HCN2 CNBD
提交 2016-05-02
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
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Assembly 1
信息不足
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
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链 A
494–640(147 aa)
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未记录
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NO3 NITRATE ION × 1
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6;293 K;34-36% dimethyl PEG 500, 240 mM potassium nitrate, 20 mM magnesium chloride, 100 mM BIS-TRIS, pH 6.0
|
分辨率 2.04 Å
R-free 0.221
|
|
5JON
Crystal structure of the unliganded form of HCN2 CNBD
提交 2016-05-02
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
信息不足
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
494–640(147 aa)
|
未记录
|
NO3 NITRATE ION × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6;293 K;34-36% dimethyl PEG 500, 240 mM potassium nitrate, 20 mM magnesium chloride, 100 mM BIS-TRIS, pH 6.0
|
分辨率 2.04 Å
R-free 0.221
|
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5KHG
HCN2 CNBD in complex with cytidine-3', 5'-cyclic monophosphate (cCMP)
提交 2016-06-14
|
构建体不同
突变/修饰不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 4
PDB 声明:tetrameric
|
链 A
443–643(201 aa)
片段:UNP residues 443-643
|
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点)
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CC7 4-amino-1-[(2S,4aR,6R,7R,7aS)-2,7-dihydroxy-2-oxidotetrahydro-4H-furo[3,2-d][1,3,2]dioxaphosphinin-6-yl]pyrimidin-2(1H)-one × 4
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 5;277 K;200 mM NaCl, 0.1 mM sodium citrate pH 5.0, 16% PEG 400
|
分辨率 2.24 Å
R-free 0.264
|
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5KHH
HCN2 CNBD in complex with inosine-3', 5'-cyclic monophosphate (cIMP)
提交 2016-06-14
|
构建体不同
突变/修饰不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 4
PDB 声明:tetrameric
|
链 A
443–643(201 aa)
片段:UNP residues 443-643
|
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点)
|
6SW Inosine-3',5'-cyclic monophosphate × 4
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 5.5;277 K;200 mM NaCl, 0.1 mM sodium citrate pH 5.5, 14.5% PEG 400
|
分辨率 1.77 Å
R-free 0.263
|
|
5KHI
HCN2 CNBD in complex with purine riboside-3', 5'-cyclic monophosphate (cPuMP)
提交 2016-06-14
|
构建体不同
突变/修饰不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 4
PDB 声明:tetrameric
|
链 A
443–643(201 aa)
片段:UNP residues 443-643
|
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点)
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6SX Purine riboside-3',5'-cyclic monophosphate × 4
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 5.5;277 K;200 mM NaCl, 0.1 mM sodium citrate pH 5.5, 18% PEG 400
|
分辨率 2.10 Å
R-free 0.249
|
|
5KHJ
HCN2 CNBD in complex with uridine-3', 5'-cyclic monophosphate (cUMP)
提交 2016-06-14
|
构建体不同
突变/修饰不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 4
PDB 声明:tetrameric
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链 A
443–643(201 aa)
片段:UNP residues 443-643
链 B
443–643(201 aa)
片段:UNP residues 443-643
|
未记录
|
6SY Uridine-3',5'-cyclic monophosphate × 4
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 4.6;277 K;200 mM NaCl, 0.1 mM sodium citrate pH 4.6, 13% PEG 400
|
分辨率 2.01 Å
R-free 0.252
|
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5KHK
HCN2 CNBD in complex with 2-aminopurine riboside-3', 5'-cyclic monophosphate (2-NH2-cPuMP)
提交 2016-06-14
|
构建体不同
突变/修饰不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 4
PDB 声明:tetrameric
|
链 A
443–643(201 aa)
片段:UNP residues 443-643
|
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点)
|
6SZ 2-Aminopurine riboside-3',5'-cyclic monophosphate × 4
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 4.6;277 K;200 mM NaCl, 0.1 mM sodium citrate pH 4.6, 12% PEG 400
|
分辨率 2.07 Å
R-free 0.261
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9R1T
Structure of the human chimera HCN112 hyperpolarization-activated cyclic nucleotide-gated ion channel in complex with cAMP.
提交 2025-04-28
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构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
信息不足
同源多聚体;蛋白 × 4
PDB 声明:tetrameric
|
链 A
444–647(204 aa)
链 B
444–647(204 aa)
链 C
444–647(204 aa)
链 D
444–647(204 aa)
|
未记录
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CMP ADENOSINE-3',5'-CYCLIC-MONOPHOSPHATE × 4
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ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
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分辨率 3.34 Å
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