SAXSdb — 2rhk

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Non-structural protein 1

Influenza A Virus

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 4	Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 4 × 2 （O95639） NITRATE ION × 5 ZINC ION × 4 2-AMINO-2-HYDROXYMETHYL-PROPANE-1,3-DIOL × 1 water × 4	与蛋白数一致
2	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 6	Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 4 × 3 （O95639） NITRATE ION × 9 ZINC ION × 6 2-AMINO-2-HYDROXYMETHYL-PROPANE-1,3-DIOL × 2 water × 6	与蛋白数一致
3	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 3	Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 4 × 2 （O95639） NITRATE ION × 5 ZINC ION × 4 2-AMINO-2-HYDROXYMETHYL-PROPANE-1,3-DIOL × 1 water × 3	与蛋白数一致
4	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 3	Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 4 × 1 （O95639） NITRATE ION × 4 ZINC ION × 2 2-AMINO-2-HYDROXYMETHYL-PROPANE-1,3-DIOL × 1 water × 3	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	NS1_IAUDO
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 2–132； UniProt 85–215 作者链 B； PDB构建体 2–132； UniProt 85–215

Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 4

Homo sapiens

UniProt O95639

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 4	Non-structural protein 1 × 2 （P03495） NITRATE ION × 5 ZINC ION × 4 2-AMINO-2-HYDROXYMETHYL-PROPANE-1,3-DIOL × 1 water × 4	与蛋白数一致
2	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 6	Non-structural protein 1 × 3 （P03495） NITRATE ION × 9 ZINC ION × 6 2-AMINO-2-HYDROXYMETHYL-PROPANE-1,3-DIOL × 2 water × 6	与蛋白数一致
3	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 3	Non-structural protein 1 × 1 （P03495） NITRATE ION × 5 ZINC ION × 4 2-AMINO-2-HYDROXYMETHYL-PROPANE-1,3-DIOL × 1 water × 3	与蛋白数一致
4	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 3	Non-structural protein 1 × 2 （P03495） NITRATE ION × 4 ZINC ION × 2 2-AMINO-2-HYDROXYMETHYL-PROPANE-1,3-DIOL × 1 water × 3	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	CPSF4_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	2
链与序列区间	作者链 C； PDB构建体 12–72； UniProt 61–121 作者链 D； PDB构建体 12–72； UniProt 61–121

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	2rhk
沉积日期 deposition_date	2007-10-09
结构标题 title	Crystal structure of influenza A NS1A protein in complex with F2F3 fragment of human cellular factor CPSF30, Northeast Structural Genomics Targets OR8C and HR6309A
关键词 keywords	;Influenza A, Nonstructural protein, viral protein: host complex, Zn finger, Alternative splicing, Cytoplasm, Host-virus interaction, Interferon antiviral system evasion, Nucleus, RNA-binding, Suppressor of RNA silencing, Metal-binding, mRNA processing, Zinc, Zinc-finger, METAL BINDING PROTEIN, VIRAL PROTEIN-METAL BINDING PROTEIN COMPLEX, VIRAL PROTEIN-NUCLEAR PROTEIN COMPLEX, Structural Genomics, PSI-2, Protein Structure Initiative, Northeast Structural Genomics Consortium, NESG ;; VIRAL PROTEIN/NUCLEAR PROTEIN
实验方法 method	X-RAY DIFFRACTION

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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

2rhk__assembly_4__model_1

Assembly 4 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

2rhk__assembly_4__model_1 | I(q)

100 个绘图点；横轴和纵轴均采用对数尺度。

2rhk__assembly_4__model_1 | P(r) · Pending

P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。

Rg（Guinier）	24.07 Å
Rg（电子密度）	23.81 Å
总 Rg	24.27 Å
原子数	2417
残基数	298
排除体积	43386 Å³
最大 q	0.500 Å⁻¹

Assembly	Model	结构单元	聚集说明	状态	CRYSOL	操作
1	1	`2rhk__assembly_1__model_1`	tetrameric （4）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
2	1	`2rhk__assembly_2__model_1`	hexameric （6）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
3	1	`2rhk__assembly_3__model_1`	trimeric （3）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
4	1	`2rhk__assembly_4__model_1`	trimeric （3）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载

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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (6)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	Non-structural protein 1
分子量 formula_weight	15964.4 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A,B
原子数 atom_count	3128

MPASRYITDMTIEELSRDWFMLMPKQKVEGPLCIRIDQAIMDKNIMLKANFSVIFDRLETLILLRAFTEEGAIVGEISPLPSFPGHTIEDVKNAIGVLIGGLEWNDNTVRVSKTLQRFAWGSSNENGRPPLTLEHHHHHH

来源 Source

来源生物 organism	Influenza A Virus
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	11320
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

实体 2 Entity 2 polymer

描述 description	Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 4
分子量 formula_weight	8570.8 kDa
突变 mutation	P94S
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	C,D

MGHHHHHHSHMSGEKTVVCKHWLRGLCKKGDQCEFLHEYDMTKMSECYFYSKFGECSNKECPFLHIDPESKI

来源 Source

来源生物 organism	Homo sapiens
通用名 common_name	Human
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9606
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

实体 3 Entity 3 non-polymer

描述 description	NITRATE ION
分子量 formula_weight	62.0 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	5

实体 4 Entity 4 non-polymer

描述 description	ZINC ION
分子量 formula_weight	65.4 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	4

实体 5 Entity 5 non-polymer

描述 description	2-AMINO-2-HYDROXYMETHYL-PROPANE-1,3-DIOL
分子量 formula_weight	122.1 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	1

实体 6 Entity 6 water

描述 description	water
分子量 formula_weight	18.0 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	185

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6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 6 domains

SCOP 2.08 (2 domains)

结构域编号 domain_id	d2rhka_
类 Class class	d — Alpha and beta proteins (a+b)
折叠类型 Fold fold	d.299 — Ns1 effector domain-like
超家族 Superfamily superfamily	d.299.1 — Ns1 effector domain-like
家族 Family family	d.299.1.1 — Ns1 effector domain-like

结构域编号 domain_id	d2rhkb_
类 Class class	d — Alpha and beta proteins (a+b)
折叠类型 Fold fold	d.299 — Ns1 effector domain-like
超家族 Superfamily superfamily	d.299.1 — Ns1 effector domain-like
家族 Family family	d.299.1.1 — Ns1 effector domain-like

CATH v4.4 (4 domains)

结构域编号 domain_id	2rhkA00
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	420 — Nucleotidyltransferase; domain 5
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	330 — Influenza virus non-structural protein, effector domain

结构域编号 domain_id	2rhkB00
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	420 — Nucleotidyltransferase; domain 5
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	330 — Influenza virus non-structural protein, effector domain

结构域编号 domain_id	2rhkC00
类 Class class	4 — Few Secondary Structures
架构 Architecture architecture	10 — Irregular
拓扑 Topology topology	1000 — CCCH zinc finger
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Zinc finger, CCCH-type

结构域编号 domain_id	2rhkD00
类 Class class	4 — Few Secondary Structures
架构 Architecture architecture	10 — Irregular
拓扑 Topology topology	1000 — CCCH zinc finger
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Zinc finger, CCCH-type

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晶胞边长 a length_a	50.960 Å
晶胞边长 b length_b	50.960 Å
晶胞边长 c length_c	205.390 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	90.00 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	90.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	8

空间群 space_group	P 41
空间群编号 int_tables_number	76
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	1.950 Å
最低分辨率 resolution_low	50.000 Å
R 因子 r_factor	0.2100
R_work r_work	0.2100
R_free r_free	0.2340

Crystal structure of influenza A NS1A protein in complex with F2F3 fragment of human cellular factor CPSF30, Northeast Structural Genomics Targets OR8C and HR6309A

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Non-structural protein 1

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 4

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

2rhk__assembly_4__model_1

2rhk__assembly_4__model_1 | I(q)

2rhk__assembly_4__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (6)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 3 Entity 3 non-polymer

实体 4 Entity 4 non-polymer

实体 5 Entity 5 non-polymer

实体 6 Entity 6 water

6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 6 domains

SCOP 2.08 (2 domains)

CATH v4.4 (4 domains)

7. 引用文献 (1)

Crystal structure of influenza A NS1A protein in complex with F2F3 fragment of human cellular factor CPSF30, Northeast Structural Genomics Targets OR8C and HR6309A

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Non-structural protein 1

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 4

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

2rhk__assembly_4__model_1

2rhk__assembly_4__model_1 | I(q)

2rhk__assembly_4__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (6)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 3 Entity 3 non-polymer

实体 4 Entity 4 non-polymer

实体 5 Entity 5 non-polymer

实体 6 Entity 6 water

6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 6 domains

SCOP 2.08 (2 domains)

CATH v4.4 (4 domains)

7. 引用文献 (1)