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2uwq

Solution structure of ASPP2 N-terminus

Method: SOLUTION NMR Dmax: 45.2 Å Quality: GOOD
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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

APOPTOSIS-STIMULATING OF P53 PROTEIN 2

HOMO SAPIENS

UniProt Q13625

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白单体 单体 蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白拷贝数一致 链 A； UniProt 1–83 片段：RESIDUES 1-83 无其他共同聚合物 SOLUTION NMR NMR测量条件：pH 7.2；298 K；离子强度（mmCIF原始值）213；压力 1.0 NMR测量条件：pH 7.2；298 K；离子强度（mmCIF原始值）213；压力 1.0 NMR样品组成：25MM PHOSPHATE, PH7.2, 150MM NACL, 5MM DTT, 5%D2O 分辨率未提供

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 2UWQ Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
1YCS P53-53BP2 COMPLEX 提交 1996-09-30 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 769–1003（235 aa） 片段：RESIDUES 327 - 519
未记录 ZN ZINC ION × 1 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 2.20 Å R-free 0.286
4A63 Crystal structure of the p73-ASPP2 complex at 2.6A resolution 提交 2011-10-31 构建体不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 892–1128（237 aa） 片段：ANKYRIN AND SH3 DOMAINS, RESIDUES 892-1128
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 1.00M NA/KPO4, 0.1M ACETATE PH 4.5
分辨率 2.27 Å R-free 0.244
4A63 Crystal structure of the p73-ASPP2 complex at 2.6A resolution 提交 2011-10-31 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 D 892–1128（237 aa） 片段：ANKYRIN AND SH3 DOMAINS, RESIDUES 892-1128
未记录 ZN ZINC ION × 1 ACT ACETATE ION × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 1.00M NA/KPO4, 0.1M ACETATE PH 4.5
分辨率 2.27 Å R-free 0.244
4A63 Crystal structure of the p73-ASPP2 complex at 2.6A resolution 提交 2011-10-31 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 F 892–1128（237 aa） 片段：ANKYRIN AND SH3 DOMAINS, RESIDUES 892-1128
未记录 ZN ZINC ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 1.00M NA/KPO4, 0.1M ACETATE PH 4.5
分辨率 2.27 Å R-free 0.244
4A63 Crystal structure of the p73-ASPP2 complex at 2.6A resolution 提交 2011-10-31 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 H 892–1128（237 aa） 片段：ANKYRIN AND SH3 DOMAINS, RESIDUES 892-1128
未记录 ZN ZINC ION × 1 ACT ACETATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 1.00M NA/KPO4, 0.1M ACETATE PH 4.5
分辨率 2.27 Å R-free 0.244
4A63 Crystal structure of the p73-ASPP2 complex at 2.6A resolution 提交 2011-10-31 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 5 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 J 892–1128（237 aa） 片段：ANKYRIN AND SH3 DOMAINS, RESIDUES 892-1128
未记录 ZN ZINC ION × 1 ACT ACETATE ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 1.00M NA/KPO4, 0.1M ACETATE PH 4.5
分辨率 2.27 Å R-free 0.244
4A63 Crystal structure of the p73-ASPP2 complex at 2.6A resolution 提交 2011-10-31 构建体不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 7 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 L 892–1128（237 aa） 片段：ANKYRIN AND SH3 DOMAINS, RESIDUES 892-1128
未记录 ACT ACETATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 1.00M NA/KPO4, 0.1M ACETATE PH 4.5
分辨率 2.27 Å R-free 0.244
4IRV Structure of the Helicobacter pylori CagA Oncogene Bound to the Human Tumor Suppressor Apoptosis-stimulating Protein of p53-2 提交 2013-01-15 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 E 726–782（57 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；Crystals were grown by vapor diffusion at 25 degrees C using hanging drops formed from mixing a 2ul of the protein complex with 2ul of an equilibration buffer (21% polyethylene glycol (PEG) molecular weight 4 kDa, 200 mM Li2 SO4 , and 100 mM Tris pH 8.5) and 0.6ul of the Silver Bullets additive 43 (Hampton Research HR2-996-43). Significantly higher quality crystals were obtained from selenomethionine-substituted protein complexes and they were used for the final refinement, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP
分辨率 2.04 Å R-free 0.234
4IRV Structure of the Helicobacter pylori CagA Oncogene Bound to the Human Tumor Suppressor Apoptosis-stimulating Protein of p53-2 提交 2013-01-15 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 F 726–782（57 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；Crystals were grown by vapor diffusion at 25 degrees C using hanging drops formed from mixing a 2ul of the protein complex with 2ul of an equilibration buffer (21% polyethylene glycol (PEG) molecular weight 4 kDa, 200 mM Li2 SO4 , and 100 mM Tris pH 8.5) and 0.6ul of the Silver Bullets additive 43 (Hampton Research HR2-996-43). Significantly higher quality crystals were obtained from selenomethionine-substituted protein complexes and they were used for the final refinement, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP
分辨率 2.04 Å R-free 0.234
4IRV Structure of the Helicobacter pylori CagA Oncogene Bound to the Human Tumor Suppressor Apoptosis-stimulating Protein of p53-2 提交 2013-01-15 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 G 726–782（57 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；Crystals were grown by vapor diffusion at 25 degrees C using hanging drops formed from mixing a 2ul of the protein complex with 2ul of an equilibration buffer (21% polyethylene glycol (PEG) molecular weight 4 kDa, 200 mM Li2 SO4 , and 100 mM Tris pH 8.5) and 0.6ul of the Silver Bullets additive 43 (Hampton Research HR2-996-43). Significantly higher quality crystals were obtained from selenomethionine-substituted protein complexes and they were used for the final refinement, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP
分辨率 2.04 Å R-free 0.234
4IRV Structure of the Helicobacter pylori CagA Oncogene Bound to the Human Tumor Suppressor Apoptosis-stimulating Protein of p53-2 提交 2013-01-15 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 H 726–782（57 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；Crystals were grown by vapor diffusion at 25 degrees C using hanging drops formed from mixing a 2ul of the protein complex with 2ul of an equilibration buffer (21% polyethylene glycol (PEG) molecular weight 4 kDa, 200 mM Li2 SO4 , and 100 mM Tris pH 8.5) and 0.6ul of the Silver Bullets additive 43 (Hampton Research HR2-996-43). Significantly higher quality crystals were obtained from selenomethionine-substituted protein complexes and they were used for the final refinement, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP
分辨率 2.04 Å R-free 0.234
6GHM Structure of PP1 alpha phosphatase bound to ASPP2 提交 2018-05-08 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 D 926–1134（209 aa）
未记录 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 8 GOL GLYCEROL × 3 NHE 2-[N-CYCLOHEXYLAMINO]ETHANE SULFONIC ACID × 3 MN MANGANESE (II) ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.1 M TRIS pH 8.5 16 % PEG 8000
分辨率 2.15 Å R-free 0.214
6GHM Structure of PP1 alpha phosphatase bound to ASPP2 提交 2018-05-08 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 C 926–1134（209 aa）
未记录 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 4 GOL GLYCEROL × 1 NHE 2-[N-CYCLOHEXYLAMINO]ETHANE SULFONIC ACID × 3 MN MANGANESE (II) ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.1 M TRIS pH 8.5 16 % PEG 8000
分辨率 2.15 Å R-free 0.214
6HKP Factor Inhibiting HIF (FIH) in complex with zinc, NOG and ASPP2 (970-992) 提交 2018-09-07 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 S 976–998（23 aa）
未记录 SO4 SULFATE ION × 12 GOL GLYCEROL × 10 OGA N-OXALYLGLYCINE × 2 ZN ZINC ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；0.1 M Hepes pH = 7.5, 2.0 M ammonium sulfate, 5.5% PEG400
分辨率 1.90 Å R-free 0.195

共 5 个其他 PDB 条目、14 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 ASPP2_HUMAN
Isoform —
PDB实体 1
链与序列区间 作者链 A； PDB构建体 4–86； UniProt 1–83

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

SAXS profile for 2uwq

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

P(r) distribution for 2uwq
下载 Download
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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id2uwq
沉积日期 deposition_date2007-03-22
结构标题 titleSolution structure of ASPP2 N-terminus
关键词 keywordsASPP2, UBIQUITIN-LIKE, SH3-DOMAIN, APOPTOSIS, CELL CYCLE, ANK REPEAT, SH3-BINDING; APOPTOSIS
实验方法 methodSOLUTION NMR
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3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

回转半径 Rg (Guinier) rg_guinier13.03 Å
回转半径 Rg (电子) rg_electron12.47 Å
零角强度 I(0) i0628104000.00
分子量 molecular_weight199160.0 kDa
排除体积 excluded_volume243400 ų
包络体积 envelope_volume23655 ų
水化壳体积 shell_volume13338 ų
包络直径 envelope_diameter52.3 Å
壳层 Rg shell_rg20.93 Å
包络 Rg envelope_rg15.87 Å
形状 Rg shape_rg12.42 Å
总 Rg total_rg12.80 Å
总原子数 total_atoms27080
残基数 n_residues1720
球谐函数阶数 n_harmonics20
q 范围 q_range— – 0.5000 Å−1
数据点数 n_points101
壳层类型 shell_typedirectional
溶剂电子密度 solvent_density0.3340 e/ų
壳层衬度 contrast_shell0.0300 e/ų
CRYSOL 版本 crysol_version4.1.3
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4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

最大尺寸 Dmax dmax45.2 Å
Rg (实空间) rg_real13.00 Å
Rg 误差 (实空间) rg_real_error0.39 Å
I(0) (实空间) i0_real6.2810e+08
I(0) 误差 (实空间) i0_real_error7.4380e+06
Rg (倒空间) rg_reciprocal13.00 Å
I(0) (倒空间) i0_reciprocal628100000.0000
解质量估计 total_estimate0.7557
解质量评级 solution_quality GOOD a GOOD solution
P(r) 峰数 n_peaks3
主峰位置 r_peak_primary15.5 Å
偏度 Skewness skewness0.342
峰度 Kurtosis kurtosis0.041
角度范围 angular_range— – 0.5000 Å−1
当前正则化参数 α current_alpha0.0000
最高正则化参数 α highest_alpha305700.0000
实空间数据点数 n_real_points80
GNOM 版本 gnom_version4.1.3
质量判据 quality_criteria AN1: 0.000; Oscil: 0.612; Stabil: 0.999; Sysdev: 1.000; Positv: 1.000; Valcen: 0.987; Smooth: 0.000
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5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

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6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (1)

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7. 折叠分类 (SCOP + CATH) 1 domains

CATH v4.4 (1 domains)

结构域编号 domain_id2uwqA00
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture10 — Roll
拓扑 Topology topology20 — Ubiquitin-like (UB roll)
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily90 — Phosphatidylinositol 3-kinase Catalytic Subunit; Chain A, domain 1
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8. 引用文献 (1)

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9. 文件与曲线 (10)