2uzx

Structure of the human receptor tyrosine kinase Met in complex with the Listeria monocytogenes invasion protein InlB: Crystal form I

Method: X-RAY DIFFRACTION
▼

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

INTERNALIN B

LISTERIA MONOCYTOGENES

UniProt P25147

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 2 HEPATOCYTE GROWTH FACTOR RECEPTOR × 1 (P08581) 与蛋白数一致
2 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 2 HEPATOCYTE GROWTH FACTOR RECEPTOR × 1 (P08581) 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 INLB_LISMO
Isoform —
PDB实体 1
链与序列区间 作者链 A; PDB构建体 4–289; UniProt 36–321 作者链 C; PDB构建体 4–289; UniProt 36–321

HEPATOCYTE GROWTH FACTOR RECEPTOR

HOMO SAPIENS

UniProt P08581

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 2 INTERNALIN B × 1 (P25147) 与蛋白数一致
2 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 2 INTERNALIN B × 1 (P25147) 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 MET_HUMAN
Isoform —
PDB实体 2
链与序列区间 作者链 B; PDB构建体 4–719; UniProt 25–740 作者链 D; PDB构建体 4–719; UniProt 25–740

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中;数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护,因此不在读者页面展示。

▼

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id2uzx
沉积日期 deposition_date2007-05-02
结构标题 titleStructure of the human receptor tyrosine kinase Met in complex with the Listeria monocytogenes invasion protein InlB: Crystal form I
关键词 keywords;SIGNALING PROTEIN/RECEPTOR, LEUCINE RICH REPEAT, RECEPTOR ECTODOMAIN, HEPATOCYTE GROWTH FACTOR RECEPTOR, SIGNALING PROTEIN, ATP-BINDING, TRANSFERASE, POLYMORPHISM, GLYCOPROTEIN, VIRULENCE FACTOR, DISEASE MUTATION, NUCLEOTIDE-BINDING, TRANSMEMBRANE, PROTO-ONCOGENE, PHOSPHORYLATION, LEUCINE-RICH REPEAT, ALTERNATIVE SPLICING, TYROSINE-PROTEIN KINASE, CHROMOSOMAL REARRANGEMENT, LRR, HGFR, KINASE, MEMBRANE, RECEPTOR, INTERNALIN, SIGNALING PROTEIN-RECEPTOR COMPLEX ;; SIGNALING PROTEIN/RECEPTOR
实验方法 methodX-RAY DIFFRACTION
▼

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

2uzx__assembly_2__model_1

Assembly 2 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

2uzx__assembly_2__model_1 | I(q)

10-2 10-1 106 107 108 q (1/Angstrom) I(q)
100 个绘图点;横轴和纵轴均采用对数尺度。

2uzx__assembly_2__model_1 | P(r) · Pending

新版 assembly/model P(r) 尚未计算 此处仅保留位置,不展示旧数据 r (Angstrom) P(r)
P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。
Rg(Guinier)32.92 Å
Rg(电子密度)32.55 Å
总 Rg33.07 Å
原子数6585
残基数834
排除体积117670 ų
最大 q0.500 Å⁻¹
Assembly Model 结构单元 聚集说明 状态 CRYSOL 操作
1 1 2uzx__assembly_1__model_1 dimeric (2) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
2 1 2uzx__assembly_2__model_1 dimeric (2) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
▶

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

▶

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (2)

▼

6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 14 domains

SCOP 2.08 (6 domains)

结构域编号 domain_idd2uzxa1
类 Class classc — Alpha and beta proteins (a/b)
折叠类型 Fold foldc.10 — Leucine-rich repeat, LRR (right-handed beta-alpha superhelix)
超家族 Superfamily superfamilyc.10.2 — L domain-like
家族 Family familyc.10.2.1 — Internalin LRR domain
结构域编号 domain_idd2uzxa2
类 Class classb — All beta proteins
折叠类型 Fold foldb.1 — Immunoglobulin-like beta-sandwich
超家族 Superfamily superfamilyb.1.18 — E set domains
家族 Family familyb.1.18.0 — automated matches
结构域编号 domain_idd2uzxa3
类 Class classl — Artifacts
折叠类型 Fold foldl.1 — Tags
超家族 Superfamily superfamilyl.1.1 — Tags
家族 Family familyl.1.1.1 — Tags
结构域编号 domain_idd2uzxc1
类 Class classc — Alpha and beta proteins (a/b)
折叠类型 Fold foldc.10 — Leucine-rich repeat, LRR (right-handed beta-alpha superhelix)
超家族 Superfamily superfamilyc.10.2 — L domain-like
家族 Family familyc.10.2.1 — Internalin LRR domain
结构域编号 domain_idd2uzxc2
类 Class classb — All beta proteins
折叠类型 Fold foldb.1 — Immunoglobulin-like beta-sandwich
超家族 Superfamily superfamilyb.1.18 — E set domains
家族 Family familyb.1.18.0 — automated matches
结构域编号 domain_idd2uzxc3
类 Class classl — Artifacts
折叠类型 Fold foldl.1 — Tags
超家族 Superfamily superfamilyl.1.1 — Tags
家族 Family familyl.1.1.1 — Tags

CATH v4.4 (8 domains)

结构域编号 domain_id2uzxA01
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture80 — Alpha-Beta Horseshoe
拓扑 Topology topology10 — Leucine-rich repeat, LRR (right-handed beta-alpha superhelix)
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — Ribonuclease Inhibitor
结构域编号 domain_id2uzxA02
类 Class class2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture60 — Sandwich
拓扑 Topology topology40 — Immunoglobulin-like
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily1220 —
结构域编号 domain_id2uzxB01
类 Class class2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture130 — 7 Propeller
拓扑 Topology topology10 — Methylamine Dehydrogenase; Chain H
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — YVTN repeat-like/Quinoprotein amine dehydrogenase
结构域编号 domain_id2uzxB02
类 Class class2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture60 — Sandwich
拓扑 Topology topology40 — Immunoglobulin-like
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — Immunoglobulins
结构域编号 domain_id2uzxC01
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture80 — Alpha-Beta Horseshoe
拓扑 Topology topology10 — Leucine-rich repeat, LRR (right-handed beta-alpha superhelix)
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — Ribonuclease Inhibitor
结构域编号 domain_id2uzxC02
类 Class class2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture60 — Sandwich
拓扑 Topology topology40 — Immunoglobulin-like
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily1220 —
结构域编号 domain_id2uzxD01
类 Class class2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture130 — 7 Propeller
拓扑 Topology topology10 — Methylamine Dehydrogenase; Chain H
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — YVTN repeat-like/Quinoprotein amine dehydrogenase
结构域编号 domain_id2uzxD02
类 Class class2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture60 — Sandwich
拓扑 Topology topology40 — Immunoglobulin-like
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — Immunoglobulins
▶

7. 引用文献 (1)