SAXSdb — 2v4z

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

GUANINE NUCLEOTIDE-BINDING PROTEIN G(K) SUBUNIT ALPHA

HOMO SAPIENS

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 2	REGULATOR OF G-PROTEIN SIGNALING 2 × 1 （P41220） GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 TETRAFLUOROALUMINATE ION × 1 MAGNESIUM ION × 1 water × 2	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	GNAI3_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 3–349； UniProt 4–350

REGULATOR OF G-PROTEIN SIGNALING 2

HOMO SAPIENS

UniProt P41220

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 2	GUANINE NUCLEOTIDE-BINDING PROTEIN G(K) SUBUNIT ALPHA × 1 （P08754） GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 TETRAFLUOROALUMINATE ION × 1 MAGNESIUM ION × 1 water × 2	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	RGS2_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	2
链与序列区间	作者链 B； PDB构建体 4–142； UniProt 71–209

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	2v4z
沉积日期 deposition_date	2008-09-30
结构标题 title	The crystal structure of the human G-protein subunit alpha (GNAI3) in complex with an engineered regulator of G-protein signaling type 2 domain (RGS2)
关键词 keywords	;GTP HYDROLYSIS, ADP-RIBOSYLATION, NUCLEOTIDE-BINDING, LIPOPROTEIN, GTP-BINDING, PHOSPHOPROTEIN, SIGNAL TRANSDUCTION INHIBITOR, GUANINE NUCLEOTIDE BINDING PROTEIN, TRANSMEMBRANE SIGNALING, G-PROTEIN COUPLED RECEPTOR, PALMITATE, MYRISTATE, TRANSDUCER, CELL CYCLE ;; CELL CYCLE
实验方法 method	X-RAY DIFFRACTION

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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

2v4z__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

2v4z__assembly_1__model_1 | I(q)

100 个绘图点；横轴和纵轴均采用对数尺度。

2v4z__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。

Rg（Guinier）	23.02 Å
Rg（电子密度）	22.00 Å
总 Rg	22.79 Å
原子数	3430
残基数	438
排除体积	60575 Å³
最大 q	0.500 Å⁻¹

Assembly	Model	结构单元	聚集说明	状态	CRYSOL	操作
1	1	`2v4z__assembly_1__model_1`	dimeric （2）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载

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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (6)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	GUANINE NUCLEOTIDE-BINDING PROTEIN G(K) SUBUNIT ALPHA
分子量 formula_weight	40162.6 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A
原子数 atom_count	3448

SMTLSAEDKAAVERSKMIDRNLREDGEKAAKEVKLLLLGAGESGKSTIVKQMKIIHEDGYSEDECKQYKVVVYSNTIQSIIAIIRAMGRLKIDFGEAARADDARQLFVLAGSAEEGVMTPELAGVIKRLWRDGGVQACFSRSREYQLNDSASYYLNDLDRISQSNYIPTQQDVLRTRVKTTGIVETHFTFKDLYFKMFDVGGQRSERKKWIHCFEGVTAIIFCVALSDYDLVLAEDEEMNRMHESMKLFDSICNNKWFTETSIILFLNKKDLFEEKIKRSPLTICYPEYTGSNTYEEAAAYIQCQFEDLNRRKDTKEIYTHFTCATDTKNVQFVFDAVTDVIIKNNLKES

来源 Source

来源生物 organism	HOMO SAPIENS
通用名 common_name	HUMAN
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9606
宿主生物 host_organism	ESCHERICHIA COLI

实体 2 Entity 2 polymer

描述 description	REGULATOR OF G-PROTEIN SIGNALING 2
分子量 formula_weight	16460.5 kDa
突变 mutation	YES
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	B

SNAKPSPEEAQLWSEAFDELLASKYGLAAFRAFLKSEFSEENIEFWLACEDFKKTKSPQKLSSKARKIYTDFIEKEAPKEINIDFQTKTLIAQNIQEATSGCFTTAQKRVYSLMENDSYPRFLKSEFYQDLCKKPQITTEPH

来源 Source

来源生物 organism	HOMO SAPIENS
通用名 common_name	HUMAN
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9606
宿主生物 host_organism	ESCHERICHIA COLI

实体 3 Entity 3 non-polymer

描述 description	GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE
分子量 formula_weight	443.2 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	1

实体 4 Entity 4 non-polymer

描述 description	TETRAFLUOROALUMINATE ION
分子量 formula_weight	103.0 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	1

实体 5 Entity 5 non-polymer

描述 description	MAGNESIUM ION
分子量 formula_weight	24.3 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	1

实体 6 Entity 6 water

描述 description	water
分子量 formula_weight	18.0 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	18

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6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 5 domains

SCOP 2.08 (1 domains)

结构域编号 domain_id	d2v4zb_
类 Class class	a — All alpha proteins
折叠类型 Fold fold	a.91 — Regulator of G-protein signaling, RGS
超家族 Superfamily superfamily	a.91.1 — Regulator of G-protein signaling, RGS
家族 Family family	a.91.1.1 — Regulator of G-protein signaling, RGS

CATH v4.4 (4 domains)

结构域编号 domain_id	2v4zA01
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	40 — 3-Layer(aba) Sandwich
拓扑 Topology topology	50 — Rossmann fold
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	300 — P-loop containing nucleotide triphosphate hydrolases

结构域编号 domain_id	2v4zA02
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology	400 — GI Alpha 1, domain 2-like
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — GI Alpha 1, domain 2-like

结构域编号 domain_id	2v4zB01
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology	196 — Regulator of G-protein Signalling 4; domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 —

结构域编号 domain_id	2v4zB02
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology	167 — Regulator of G-protein Signalling 4; domain 2
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Regulator of G-protein Signalling 4, domain 2

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晶胞边长 a length_a	114.539 Å
晶胞边长 b length_b	114.539 Å
晶胞边长 c length_c	99.330 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	90.00 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	120.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	6

空间群 space_group	P 32 2 1
空间群编号 int_tables_number	154
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	2.800 Å
最低分辨率 resolution_low	33.370 Å
R 因子 r_factor	0.2100
R_work r_work	0.2080
R_free r_free	0.2540

The crystal structure of the human G-protein subunit alpha (GNAI3) in complex with an engineered regulator of G-protein signaling type 2 domain (RGS2)

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

GUANINE NUCLEOTIDE-BINDING PROTEIN G(K) SUBUNIT ALPHA

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

REGULATOR OF G-PROTEIN SIGNALING 2

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

2v4z__assembly_1__model_1

2v4z__assembly_1__model_1 | I(q)

2v4z__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (6)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 3 Entity 3 non-polymer

实体 4 Entity 4 non-polymer

实体 5 Entity 5 non-polymer

实体 6 Entity 6 water

6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 5 domains

SCOP 2.08 (1 domains)

CATH v4.4 (4 domains)

7. 引用文献 (1)

The crystal structure of the human G-protein subunit alpha (GNAI3) in complex with an engineered regulator of G-protein signaling type 2 domain (RGS2)

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

GUANINE NUCLEOTIDE-BINDING PROTEIN G(K) SUBUNIT ALPHA

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

REGULATOR OF G-PROTEIN SIGNALING 2

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

2v4z__assembly_1__model_1

2v4z__assembly_1__model_1 | I(q)

2v4z__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (6)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 3 Entity 3 non-polymer

实体 4 Entity 4 non-polymer

实体 5 Entity 5 non-polymer

实体 6 Entity 6 water

6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 5 domains

SCOP 2.08 (1 domains)

CATH v4.4 (4 domains)

7. 引用文献 (1)