2xhm

Crystal structure of AnCE-K26 complex

Method: X-RAY DIFFRACTION Dmax: 82.8 Å Quality: REASONABLE

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

ANGIOTENSIN CONVERTING ENZYME

DROSOPHILA MELANOGASTER

UniProt Q10714

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 其他组合 单体 蛋白 × 1 其他聚合物 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白拷贝数一致 链 A; UniProt 17–614 片段:RESIDUES 17-614 ;beta-D-mannopyranose-(1-6)-alpha-D-mannopyranose-(1-3)-[alpha-D-mannopyranose-(1-6)]beta-D-mannopyranose-(1-4)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose-(1-4)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose ; × 1 K26 N-ACETYL-L-ILE-L-TYR-(R)-1-AMINO-2-(4-HYDROXYPHENYL)ETHYLPHOSPHONIC ACID × 1 ZN ZINC ION × 1 EPE 4-(2-HYDROXYETHYL)-1-PIPERAZINE ETHANESULFONIC ACID × 1 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2 X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件:pH 7.5;pH 7.5 分辨率 1.96 Å R-free 0.215

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly, “相对当前条目”直接指出证据层面的不同;没有差异标签表示当前已读取字段一致。

共 26 个其他 PDB 条目、29 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 ACE_DROME
Isoform
PDB实体 1
链与序列区间 作者链 A; PDB构建体 1–598; UniProt 17–614

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中;数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护,因此不在读者页面展示。

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

SAXS profile for 2xhm

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

P(r) distribution for 2xhm
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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id2xhm
沉积日期 deposition_date2010-06-18
结构标题 titleCrystal structure of AnCE-K26 complex
关键词 keywordsHYDROLASE, ACE INHIBITOR, ZINC METALLOPEPTIDASE; HYDROLASE
实验方法 methodX-RAY DIFFRACTION

3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

回转半径 Rg (Guinier) rg_guinier25.49
回转半径 Rg (电子) rg_electron24.35
零角强度 I(0) i081694300.00
分子量 molecular_weight71274.0 kDa
排除体积 excluded_volume89132 ų
包络体积 envelope_volume104480 ų
水化壳体积 shell_volume34415 ų
包络直径 envelope_diameter85.5
壳层 Rg shell_rg32.91
包络 Rg envelope_rg24.69
形状 Rg shape_rg24.32
总 Rg total_rg25.35
总原子数 total_atoms5026
残基数 n_residues598
球谐函数阶数 n_harmonics20
q 范围 q_range— – 0.5000 −1
数据点数 n_points101
壳层类型 shell_typedirectional
溶剂电子密度 solvent_density0.3340 e/ų
壳层衬度 contrast_shell0.0300 e/ų
CRYSOL 版本 crysol_version4.1.3

4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

最大尺寸 Dmax dmax82.8
Rg (实空间) rg_real25.37
Rg 误差 (实空间) rg_real_error0.51
I(0) (实空间) i0_real8.1690e+07
I(0) 误差 (实空间) i0_real_error1.2750e+06
Rg (倒空间) rg_reciprocal25.41
I(0) (倒空间) i0_reciprocal81700000.0000
解质量估计 total_estimate0.7228
解质量评级 solution_quality REASONABLE a REASONABLE solution
P(r) 峰数 n_peaks2
主峰位置 r_peak_primary32.1
偏度 Skewness skewness0.236
峰度 Kurtosis kurtosis-0.272
角度范围 angular_range— – 0.3100 −1
当前正则化参数 α current_alpha0.0000
最高正则化参数 α highest_alpha19760000.0000
实空间数据点数 n_real_points63
GNOM 版本 gnom_version4.1.3
质量判据 quality_criteria AN1: 0.000; Oscil: 0.826; Stabil: 1.000; Sysdev: 0.315; Positv: 1.000; Valcen: 0.989; Smooth: 0.982

5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (7)

7. 折叠分类 (SCOP + CATH) 1 domains

SCOP 2.08 (1 domains)

结构域编号 domain_idd2xhma_
类 Class classd — Alpha and beta proteins (a+b)
折叠类型 Fold foldd.92 — Zincin-like
超家族 Superfamily superfamilyd.92.1 — Metalloproteases ('zincins'), catalytic domain
家族 Family familyd.92.1.5 — Neurolysin-like

8. 引用文献 (1)

9. 文件与曲线 (10)