SAXSdb — 3c4p

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Beta-lactamase SHV-1

Klebsiella pneumoniae

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 2	Beta-lactamase inhibitory protein × 1 （P35804） SULFATE ION × 2 water × 2	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	BLA1_KLEPN
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 1–265； UniProt 22–286

Beta-lactamase inhibitory protein

Streptomyces clavuligerus

UniProt P35804

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 2	Beta-lactamase SHV-1 × 1 （P0AD64） SULFATE ION × 2 water × 2	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	BLIP_STRCL
Isoform	—
PDB实体	2
链与序列区间	作者链 B； PDB构建体 1–165； UniProt 37–201

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	3c4p
沉积日期 deposition_date	2008-01-30
结构标题 title	Crystal Structure of the SHV-1 Beta-lactamase/Beta-lactamase inhibitor protein (BLIP) E73M complex
关键词 keywords	;Beta-lactamase, Beta-lactamase inhibitory protein, protein-protein complex, BLIP, SHV-1, Antibiotic resistance, Hydrolase, Plasmid, Secreted, HYDROLASE-HYDROLASE INHIBITOR COMPLEX ;; HYDROLASE/HYDROLASE INHIBITOR
实验方法 method	X-RAY DIFFRACTION

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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

3c4p__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

3c4p__assembly_1__model_1 | I(q)

100 个绘图点；横轴和纵轴均采用对数尺度。

3c4p__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。

Rg（Guinier）	22.84 Å
Rg（电子密度）	21.94 Å
总 Rg	22.76 Å
原子数	3268
残基数	430
排除体积	57756 Å³
最大 q	0.500 Å⁻¹

Assembly	Model	结构单元	聚集说明	状态	CRYSOL	操作
1	1	`3c4p__assembly_1__model_1`	dimeric （2）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载

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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (4)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	Beta-lactamase SHV-1
分子量 formula_weight	28907.0 kDa
EC 编号 ec_number	3.5.2.6
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A
原子数 atom_count	3758

SPQPLEQIKLSESQLSGRVGMIEMDLASGRTLTAWRADERFPMMSTFKVVLCGAVLARVDAGDEQLERKIHYRQQDLVDYSPVSEKHLADGMTVGELCAAAITMSDNSAANLLLATVGGPAGLTAFLRQIGDNVTRLDRWETELNEALPGDARDTTTPASMAATLRKLLTSQRLSARSQRQLLQWMVDDRVAGPLIRSVLPAGWFIADKTGAGERGARGIVALLGPNNKAERIVVIYLRDTPASMAERNQQIAGIGAALIEHWQR

来源 Source

来源生物 organism	Klebsiella pneumoniae
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

实体 2 Entity 2 polymer

描述 description	Beta-lactamase inhibitory protein
分子量 formula_weight	17558.6 kDa
突变 mutation	E109M
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	B

AGVMTGAKFTQIQFGMTRQQVLDIAGAENCETGGSFGDSIHCRGHAAGDYYAYATFGFTSAAADAKVDSKSQMKLLAPSAPTLTLAKFNQVTVGMTRAQVLATVGQGSCTTWSEYYPAYPSTAGVTLSLSCFDVDGYSSTGFYRGSAHLWFTDGVLQGKRQWDLV

来源 Source

来源生物 organism	Streptomyces clavuligerus
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

实体 3 Entity 3 non-polymer

描述 description	SULFATE ION
分子量 formula_weight	96.1 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	2

实体 4 Entity 4 water

描述 description	water
分子量 formula_weight	18.0 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	490

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6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 5 domains

SCOP 2.08 (2 domains)

结构域编号 domain_id	d3c4pa_
类 Class class	e — Multi-domain proteins (alpha and beta)
折叠类型 Fold fold	e.3 — beta-lactamase/transpeptidase-like
超家族 Superfamily superfamily	e.3.1 — beta-lactamase/transpeptidase-like
家族 Family family	e.3.1.1 — beta-Lactamase/D-ala carboxypeptidase

结构域编号 domain_id	d3c4pb_
类 Class class	d — Alpha and beta proteins (a+b)
折叠类型 Fold fold	d.98 — BLIP-like
超家族 Superfamily superfamily	d.98.1 — beta-lactamase-inhibitor protein, BLIP
家族 Family family	d.98.1.1 — beta-lactamase-inhibitor protein, BLIP

CATH v4.4 (3 domains)

结构域编号 domain_id	3c4pA00
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	40 — 3-Layer(aba) Sandwich
拓扑 Topology topology	710 — Beta-lactamase
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — DD-peptidase/beta-lactamase superfamily

结构域编号 domain_id	3c4pB01
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	1450 — Beta-lactamase Inhibitory Protein; Chain:B, domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 —

结构域编号 domain_id	3c4pB02
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	1450 — Beta-lactamase Inhibitory Protein; Chain:B, domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 —

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晶胞边长 a length_a	127.476 Å
晶胞边长 b length_b	127.476 Å
晶胞边长 c length_c	73.410 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	90.00 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	120.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	6

空间群 space_group	P 63
空间群编号 int_tables_number	173
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	1.750 Å
最低分辨率 resolution_low	48.128 Å
R 因子 r_factor	0.1814
R_work r_work	0.1801
R_free r_free	0.2072

Crystal Structure of the SHV-1 Beta-lactamase/Beta-lactamase inhibitor protein (BLIP) E73M complex

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Beta-lactamase SHV-1

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

Beta-lactamase inhibitory protein

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

3c4p__assembly_1__model_1

3c4p__assembly_1__model_1 | I(q)

3c4p__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (4)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 3 Entity 3 non-polymer

实体 4 Entity 4 water

6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 5 domains

SCOP 2.08 (2 domains)

CATH v4.4 (3 domains)

7. 引用文献 (1)

Crystal Structure of the SHV-1 Beta-lactamase/Beta-lactamase inhibitor protein (BLIP) E73M complex

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Beta-lactamase SHV-1

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Beta-lactamase inhibitory protein

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

3c4p__assembly_1__model_1

3c4p__assembly_1__model_1 | I(q)

3c4p__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (4)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 3 Entity 3 non-polymer

实体 4 Entity 4 water

6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 5 domains

SCOP 2.08 (2 domains)

CATH v4.4 (3 domains)

7. 引用文献 (1)