3c5t

Crystal structure of the ligand-bound glucagon-like peptide-1 receptor extracellular domain

Method: X-RAY DIFFRACTION D_max: 65.0 Å Quality: GOOD

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Glucagon-like peptide 1 receptor

Homo sapiens

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2）与蛋白拷贝数一致	链 A； UniProt 24–145	片段：N-terminal extracellular domain, UNP residues 24-145	Exendin-4 × 1 （P26349） 10M decyl 4-O-alpha-D-glucopyranosyl-1-thio-beta-D-glucopyranoside × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；293 K；0.1M Tris-HCl pH 8.5, 0.1M MgCl2, 0.4M MgTartrate, 9mM n-Decyl-beta-D-thiomaltoside, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 2.10 Å R-free 0.238

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB	相对当前条目 3C5T	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
3C59 Crystal structure of the ligand-bound glucagon-like peptide-1 receptor extracellular domain 提交 2008-01-31	结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 24–145（122 aa）片段：N-terminal extracellular domain, UNP residues 24-145	未记录	10M decyl 4-O-alpha-D-glucopyranosyl-1-thio-beta-D-glucopyranoside × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；293 K；0.1M Tris-HCl pH 8.5, 0.1M MgCl2, 0.4M MgTartrate, 9mM n-Decyl-beta-D-thiomaltoside, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 2.30 Å R-free 0.241
3IOL Crystal structure of Glucagon-Like Peptide-1 in complex with the extracellular domain of the Glucagon-Like Peptide-1 Receptor 提交 2009-08-14	实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 24–145（122 aa）片段：N-terminal extracellular domain, UNP residues 24-145	未记录	10M decyl 4-O-alpha-D-glucopyranosyl-1-thio-beta-D-glucopyranoside × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.9；291 K；0.1M N-(2-Acetamido) Iminodiacetic Acid (ADA), pH 6.9, 14 vol-% (+/-)-2-Methyl-2,4-pentanediol (MPD), 9mM n-decyl-beta-D-thiomaltoside, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K	分辨率 2.10 Å R-free 0.226
4ZGM Crystal structure of Semaglutide peptide backbone in complex with the GLP-1 receptor extracellular domain 提交 2015-04-23	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 24–145（122 aa）	未记录	32M 3,6,9,12,15,18-hexaoxahexacosan-1-ol × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；0.24 M Sodium malonate pH 7.0, 20% (w/v) PEG3350 (JCSG screen QIAGEN) and 10 mM hexaethylene glycol monooctyl ether (Detergent Screen HT Hampton Research).	分辨率 1.80 Å R-free 0.193
5E94 Antibody-bound Glucagon-like Peptide-1 receptor extracellular domain 提交 2015-10-14	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 G 24–145（122 aa）片段：N-terminal extracellular domain, UNP residues 24-145	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291 K；0.2 M Sodium dihydrogen Phosphate monohydrate, 20% w/v PEG 3350	分辨率 2.00 Å R-free 0.232
5E94 Antibody-bound Glucagon-like Peptide-1 receptor extracellular domain 提交 2015-10-14	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 H 24–145（122 aa）片段：N-terminal extracellular domain, UNP residues 24-145	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291 K；0.2 M Sodium dihydrogen Phosphate monohydrate, 20% w/v PEG 3350	分辨率 2.00 Å R-free 0.232
5NX2 Crystal structure of thermostabilised full-length GLP-1R in complex with a truncated peptide agonist at 3.7 A resolution 提交 2017-05-09	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 24–432（409 aa）片段：UNP residues 24-432	突变：T207E, Q211A, D215R, L232F, G295A, T298A, C329A, P358A, G361A, H363V, V405A	NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 SOG octyl 1-thio-beta-D-glucopyranoside × 3	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；283 K；0.1M Tris-HCl pH 8.0-9.0, 32-44% (v/v) PEG 200	分辨率 3.70 Å R-free 0.334
5OTT Extracellular domain of GLP-1 receptor in complex with exendin-4 variant Gly2Hcs/Thr5Hcs 提交 2017-08-22	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 24–139（116 aa）片段：extracellular domain, UNP residues 24-139	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.1 M Imidazole pH 6.5, 1.0 M Sodium acetate trihydrate	分辨率 1.92 Å R-free 0.209
5OTU Extracellular domain of GLP-1 receptor in complex with GLP-1 variant Ala8Hcs/Thr11Hcs 提交 2017-08-22	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 24–139（116 aa）片段：extracellular domain, UNP residues 24-139	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；Morpheus from Molecular Dimensions, solution G1: 0.1 M Carboxylic acids, 0.1 Buffer system 1 pH 6.5, 20% (v/v) PEG500mme, 10% (w/v) PEG20000	分辨率 1.80 Å R-free 0.211
5OTU Extracellular domain of GLP-1 receptor in complex with GLP-1 variant Ala8Hcs/Thr11Hcs 提交 2017-08-22	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 C 24–139（116 aa）片段：extracellular domain, UNP residues 24-139	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；Morpheus from Molecular Dimensions, solution G1: 0.1 M Carboxylic acids, 0.1 Buffer system 1 pH 6.5, 20% (v/v) PEG500mme, 10% (w/v) PEG20000	分辨率 1.80 Å R-free 0.211
5OTV Extracellular domain of GLP-1 receptor in complex with GLP-1 variant Ala8Cyc/Thr11Hcs 提交 2017-08-22	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 C 24–139（116 aa）片段：extracellular domain, UNP residues 24-139	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；Morpheus from Molecular Dimensions, solution E5: 0.12 M Ethylene Glycols, 0.1 M Buffer System 2 pH 7.5, 205 (v/v) PEg500mme, 10% (w/v) PEG20000	分辨率 2.00 Å R-free 0.246
5OTV Extracellular domain of GLP-1 receptor in complex with GLP-1 variant Ala8Cyc/Thr11Hcs 提交 2017-08-22	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 24–139（116 aa）片段：extracellular domain, UNP residues 24-139	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；Morpheus from Molecular Dimensions, solution E5: 0.12 M Ethylene Glycols, 0.1 M Buffer System 2 pH 7.5, 205 (v/v) PEg500mme, 10% (w/v) PEG20000	分辨率 2.00 Å R-free 0.246
5OTW Extracellular domain of GLP-1 receptor in complex with GLP-1 variant Ala8Hcs/Thr11Cys 提交 2017-08-22	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 C 24–139（116 aa）片段：extracellular domain, UNP residues 24-139	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；Morpheus from Molecular Dimensions, solution E12: 0.12 M ethylene Glycols, 0.1 M Buffer system 3 pH 8.5, 12.5% (v/v) MPD, 12.5% (w/v) PEG1000, 12.5% (w/v) PEG3350	分辨率 2.10 Å R-free 0.239
5OTW Extracellular domain of GLP-1 receptor in complex with GLP-1 variant Ala8Hcs/Thr11Cys 提交 2017-08-22	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 24–139（116 aa）片段：extracellular domain, UNP residues 24-139	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；Morpheus from Molecular Dimensions, solution E12: 0.12 M ethylene Glycols, 0.1 M Buffer system 3 pH 8.5, 12.5% (v/v) MPD, 12.5% (w/v) PEG1000, 12.5% (w/v) PEG3350	分辨率 2.10 Å R-free 0.239
5OTX Extracellular domain of GLP-1 receptor in complex with GLP-1 variant Ala8Cys/Thr11Cys 提交 2017-08-22	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 24–139（116 aa）片段：extracellular domain, UNP residues 24-139	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；Morpheus from Molecular Dimensions solution F2: 0.12 M Monosaccharides, 0.1 M Buffer system 1 pH 6.5, 20% (v/v) Ethylene Glycol, 10% (w/v) PEG8000	分辨率 2.00 Å R-free 0.240
5OTX Extracellular domain of GLP-1 receptor in complex with GLP-1 variant Ala8Cys/Thr11Cys 提交 2017-08-22	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 C 24–139（116 aa）片段：extracellular domain, UNP residues 24-139	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；Morpheus from Molecular Dimensions solution F2: 0.12 M Monosaccharides, 0.1 M Buffer system 1 pH 6.5, 20% (v/v) Ethylene Glycol, 10% (w/v) PEG8000	分辨率 2.00 Å R-free 0.240
5VEW Structure of the human GLP-1 receptor complex with PF-06372222 提交 2017-04-05	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 128–257（130 aa）链 A 261–431（171 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	97Y N-{4-[(R)-(3,3-dimethylcyclobutyl)({6-[4-(trifluoromethyl)-1H-imidazol-1-yl]pyridin-3-yl}amino)methyl]benzene-1-carbonyl}-beta-alanine × 1 OLC (2R)-2,3-dihydroxypropyl (9Z)-octadec-9-enoate × 2 OLA OLEIC ACID × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 LIPIDIC CUBIC PHASE；293 K；0.4-0.45 M ammonium acetate, 0.1 M sodium cacodylate, pH 6.2-6.6, 35-38% PEG400, 3% w/v aminohexanoic acid	分辨率 2.70 Å R-free 0.246
5VEW Structure of the human GLP-1 receptor complex with PF-06372222 提交 2017-04-05	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 信息不足单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 128–257（130 aa）链 B 261–431（171 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	97Y N-{4-[(R)-(3,3-dimethylcyclobutyl)({6-[4-(trifluoromethyl)-1H-imidazol-1-yl]pyridin-3-yl}amino)methyl]benzene-1-carbonyl}-beta-alanine × 1 OLC (2R)-2,3-dihydroxypropyl (9Z)-octadec-9-enoate × 4	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 LIPIDIC CUBIC PHASE；293 K；0.4-0.45 M ammonium acetate, 0.1 M sodium cacodylate, pH 6.2-6.6, 35-38% PEG400, 3% w/v aminohexanoic acid	分辨率 2.70 Å R-free 0.246
5VEX Structure of the human GLP-1 receptor complex with NNC0640 提交 2017-04-05	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 128–257（130 aa）链 A 261–431（171 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	97V 4-{[(4-cyclohexylphenyl){[3-(methylsulfonyl)phenyl]carbamoyl}amino]methyl}-N-(1H-tetrazol-5-yl)benzamide × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 LIPIDIC CUBIC PHASE；293 K；0.4-0.45 M ammonium acetate, 0.1 M sodium acetate, pH 5.0-5.8, 38-40% PEG400	分辨率 3.00 Å R-free 0.256
5VEX Structure of the human GLP-1 receptor complex with NNC0640 提交 2017-04-05	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 信息不足单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 128–257（130 aa）链 B 261–431（171 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	97V 4-{[(4-cyclohexylphenyl){[3-(methylsulfonyl)phenyl]carbamoyl}amino]methyl}-N-(1H-tetrazol-5-yl)benzamide × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 LIPIDIC CUBIC PHASE；293 K；0.4-0.45 M ammonium acetate, 0.1 M sodium acetate, pH 5.0-5.8, 38-40% PEG400	分辨率 3.00 Å R-free 0.256
6B3J 3.3 angstrom phase-plate cryo-EM structure of a biased agonist-bound human GLP-1 receptor-Gs complex 提交 2017-09-22	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric	链 R 24–463（440 aa）片段：residues 24-463	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.30 Å
6GB1 Crystal structure of the GLP1 receptor ECD with Peptide 11 提交 2018-04-13	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 21–145（125 aa）	未记录	SO4 SULFATE ION × 2 HEZ HEXANE-1,6-DIOL × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；292 K；A 6-fold excess of peptide 11 was dissolved in a solution of 12 mg/ml GLP1R-ECD in 10 mM Tris buffer pH 7.5, 100 mM NaSulfate and 2% glycerol. 100 nl of this protein solution plus 100 nl reservoir solution were equilibrated against reservoir solution consisting of 10 mM CoCl2, 9.4 % (v/v) 1,6-hexanediol and 100 mM NaAcetate, pH 4.8. Crystals appeared after about one week.	分辨率 2.73 Å R-free 0.262
6KJV Structure of thermal-stabilised(M9) human GLP-1 receptor transmembrane domain 提交 2019-07-23	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 128–257（130 aa）链 A 261–431（171 aa）	突变：S193C,I196F,S225A,S271A,I317C,G318I,K346A,C347F,G361C,205-214deletion,R1011G,C1053T,C1096A,I1136R 突变：S193C,I196F,S225A,S271A,I317C,G318I,K346A,C347F,G361C,205-214deletion,R1011G,C1053T,C1096A,I1136R	97Y N-{4-[(R)-(3,3-dimethylcyclobutyl)({6-[4-(trifluoromethyl)-1H-imidazol-1-yl]pyridin-3-yl}amino)methyl]benzene-1-carbonyl}-beta-alanine × 1 OLC (2R)-2,3-dihydroxypropyl (9Z)-octadec-9-enoate × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 LIPIDIC CUBIC PHASE；293 K；0.4-0.45 M ammonium acetate, 0.1 M sodium cacodylate, pH 6.2-6.6, 35-38% PEG400, 3% w/v aminohexanoic acid	分辨率 2.80 Å R-free 0.280
6KJV Structure of thermal-stabilised(M9) human GLP-1 receptor transmembrane domain 提交 2019-07-23	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 信息不足单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 128–257（130 aa）链 B 261–431（171 aa）	突变：S193C,I196F,S225A,S271A,I317C,G318I,K346A,C347F,G361C,205-214deletion,R1011G,C1053T,C1096A,I1136R 突变：S193C,I196F,S225A,S271A,I317C,G318I,K346A,C347F,G361C,205-214deletion,R1011G,C1053T,C1096A,I1136R	97Y N-{4-[(R)-(3,3-dimethylcyclobutyl)({6-[4-(trifluoromethyl)-1H-imidazol-1-yl]pyridin-3-yl}amino)methyl]benzene-1-carbonyl}-beta-alanine × 1 OLC (2R)-2,3-dihydroxypropyl (9Z)-octadec-9-enoate × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 LIPIDIC CUBIC PHASE；293 K；0.4-0.45 M ammonium acetate, 0.1 M sodium cacodylate, pH 6.2-6.6, 35-38% PEG400, 3% w/v aminohexanoic acid	分辨率 2.80 Å R-free 0.280
6KK1 Structure of thermal-stabilised(M8) human GLP-1 receptor transmembrane domain 提交 2019-07-23	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 128–257（130 aa）链 A 261–431（171 aa）	突变：;I196F,S225A,S271A,I317C,G318I,K346A,C347F,G361C,205-214deletion,R1011G,C1053T,C1096A,I1136R,I196F,S225A,S271A,I317C,G318I,K346A,C347F,G361C,205-214deletion ; 突变：;I196F,S225A,S271A,I317C,G318I,K346A,C347F,G361C,205-214deletion,R1011G,C1053T,C1096A,I1136R,I196F,S225A,S271A,I317C,G318I,K346A,C347F,G361C,205-214deletion ;	97Y N-{4-[(R)-(3,3-dimethylcyclobutyl)({6-[4-(trifluoromethyl)-1H-imidazol-1-yl]pyridin-3-yl}amino)methyl]benzene-1-carbonyl}-beta-alanine × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 LIPIDIC CUBIC PHASE；293 K；0.4-0.45 M ammonium acetate, 0.1 M sodium cacodylate, pH 6.2-6.6, 35-38% PEG400, 3% w/v aminohexanoic acid	分辨率 2.80 Å R-free 0.290
6KK1 Structure of thermal-stabilised(M8) human GLP-1 receptor transmembrane domain 提交 2019-07-23	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 信息不足单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 128–257（130 aa）链 B 261–431（171 aa）	突变：;I196F,S225A,S271A,I317C,G318I,K346A,C347F,G361C,205-214deletion,R1011G,C1053T,C1096A,I1136R,I196F,S225A,S271A,I317C,G318I,K346A,C347F,G361C,205-214deletion ; 突变：;I196F,S225A,S271A,I317C,G318I,K346A,C347F,G361C,205-214deletion,R1011G,C1053T,C1096A,I1136R,I196F,S225A,S271A,I317C,G318I,K346A,C347F,G361C,205-214deletion ;	97Y N-{4-[(R)-(3,3-dimethylcyclobutyl)({6-[4-(trifluoromethyl)-1H-imidazol-1-yl]pyridin-3-yl}amino)methyl]benzene-1-carbonyl}-beta-alanine × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 LIPIDIC CUBIC PHASE；293 K；0.4-0.45 M ammonium acetate, 0.1 M sodium cacodylate, pH 6.2-6.6, 35-38% PEG400, 3% w/v aminohexanoic acid	分辨率 2.80 Å R-free 0.290
6KK7 Structure of thermal-stabilised(M6) human GLP-1 receptor transmembrane domain 提交 2019-07-23	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 128–257（130 aa）链 A 261–431（171 aa）	突变：S225A,I317C,G318I,K346A,C347F,G361C,205-214deletion,R1011G,C1053T,C1096A,I1136R 突变：S225A,I317C,G318I,K346A,C347F,G361C,205-214deletion,R1011G,C1053T,C1096A,I1136R	97Y N-{4-[(R)-(3,3-dimethylcyclobutyl)({6-[4-(trifluoromethyl)-1H-imidazol-1-yl]pyridin-3-yl}amino)methyl]benzene-1-carbonyl}-beta-alanine × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 LIPIDIC CUBIC PHASE；293 K；0.4-0.45 M ammonium acetate, 0.1 M sodium cacodylate, pH 6.2-6.6, 35-38% PEG400, 3% w/v aminohexanoic acid	分辨率 3.10 Å R-free 0.303
6KK7 Structure of thermal-stabilised(M6) human GLP-1 receptor transmembrane domain 提交 2019-07-23	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 信息不足单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 128–257（130 aa）链 B 261–431（171 aa）	突变：S225A,I317C,G318I,K346A,C347F,G361C,205-214deletion,R1011G,C1053T,C1096A,I1136R 突变：S225A,I317C,G318I,K346A,C347F,G361C,205-214deletion,R1011G,C1053T,C1096A,I1136R	97Y N-{4-[(R)-(3,3-dimethylcyclobutyl)({6-[4-(trifluoromethyl)-1H-imidazol-1-yl]pyridin-3-yl}amino)methyl]benzene-1-carbonyl}-beta-alanine × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 LIPIDIC CUBIC PHASE；293 K；0.4-0.45 M ammonium acetate, 0.1 M sodium cacodylate, pH 6.2-6.6, 35-38% PEG400, 3% w/v aminohexanoic acid	分辨率 3.10 Å R-free 0.303
6LN2 Crystal structure of full length human GLP1 receptor in complex with Fab fragment (Fab7F38) 提交 2019-12-28	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 A 24–260（237 aa）链 A 262–439（178 aa）	突变：S193C,I196F,S225A,M233C,S271A,I317C,G318I,K346A,C347F,G361C,E387D 突变：S193C,I196F,S225A,M233C,S271A,I317C,G318I,K346A,C347F,G361C,E387D	NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 ZN ZINC ION × 1 97Y N-{4-[(R)-(3,3-dimethylcyclobutyl)({6-[4-(trifluoromethyl)-1H-imidazol-1-yl]pyridin-3-yl}amino)methyl]benzene-1-carbonyl}-beta-alanine × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 LIPIDIC CUBIC PHASE；293 K；200-300 mM Ammonium formate, 36% PEG 400, 5%-10% (w/v) Guanidine hydrochloride	分辨率 3.20 Å R-free 0.262
6ORV Non-peptide agonist (TT-OAD2) bound to the Glucagon-Like peptide-1 (GLP-1) Receptor 提交 2019-05-01	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric	链 RP 24–463（440 aa）	未记录	N2V N-{(3S,8S)-3-{4-[(3,4-dichlorophenyl)methoxy]phenyl}-7-[(1S)-1-phenylpropyl]-2,3,6,7,8,9-hexahydro[1,4]dioxino[2,3-g]isoquinoline-8-carbonyl}-4-(2,3-dimethylpyridin-4-yl)-L-phenylalanine × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.00 Å
6VCB Cryo-EM structure of the Glucagon-like peptide-1 receptor in complex with G protein, GLP-1 peptide and a positive allosteric modulator 提交 2019-12-20	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric	链 R 24–422（399 aa）	未记录	QW7 1-[(1R)-1-(2,6-dichloro-3-methoxyphenyl)ethyl]-6-{2-[(2R)-piperidin-2-yl]phenyl}-1H-benzimidazole × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.30 Å
6X18 GLP-1 peptide hormone bound to Glucagon-Like peptide-1 (GLP-1) Receptor 提交 2020-05-18	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric	链 R 24–463（440 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.10 Å
6X19 Non peptide agonist CHU-128, bound to Glucagon-Like peptide-1 (GLP-1) Receptor 提交 2020-05-18	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric	链 R 24–463（440 aa）	未记录	UK1 3-{(1S)-1-[5-(2,2-dimethylmorpholin-4-yl)-2-{(4S)-2-(4-fluoro-3,5-dimethylphenyl)-3-[3-(4-fluoro-1-methyl-1H-indazol-5-yl)-2-oxo-2,3-dihydro-1H-imidazol-1-yl]-4-methyl-2,4,6,7-tetrahydro-5H-pyrazolo[4,3-c]pyridine-5-carbonyl}-1H-indol-1-yl]butyl}-1,2,4-oxadiazol-5(4H)-one × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.10 Å
6X1A Non peptide agonist PF-06882961, bound to Glucagon-Like peptide-1 (GLP-1) Receptor 提交 2020-05-18	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric	链 R 24–463（440 aa）	未记录	UK4 2-[(4-{6-[(4-cyano-2-fluorophenyl)methoxy]pyridin-2-yl}piperidin-1-yl)methyl]-1-{[(2S)-oxetan-2-yl]methyl}-1H-benzimidazole-6-carboxylic acid × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.50 Å
6XOX cryo-EM of human GLP-1R bound to non-peptide agonist LY3502970 提交 2020-07-07	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric	链 R 24–422（399 aa）	未记录	V6G 3-[(1S,2S)-1-(5-[(4S)-2,2-dimethyloxan-4-yl]-2-{(4S)-2-(4-fluoro-3,5-dimethylphenyl)-3-[3-(4-fluoro-1-methyl-1H-indazol-5-yl)-2-oxo-2,3-dihydro-1H-imidazol-1-yl]-4-methyl-2,4,6,7-tetrahydro-5H-pyrazolo[4,3-c]pyridine-5-carbonyl}-1H-indol-1-yl)-2-methylcyclopropyl]-1,2,4-oxadiazol-5(4H)-one × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.10 Å
7C2E GLP-1R-Gs complex structure with a small molecule full agonist 提交 2020-05-07	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric	链 R 24–463（440 aa）	突变：L260F	FFR 2-[[4-[6-[(4-cyano-2-fluoranyl-phenyl)methoxy]pyridin-2-yl]-3,6-dihydro-2~{H}-pyridin-1-yl]methyl]-3-[[(2~{S})-oxetan-2-yl]methyl]imidazo[4,5-b]pyridine-5-carboxylic acid × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.20 Å
7DUQ Cryo-EM structure of the compound 2 and GLP-1-bound human GLP-1 receptor-Gs complex 提交 2021-01-11	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric	链 R 24–463（440 aa）	未记录	HNO N-tert-butyl-6,7-bis(chloranyl)quinoxalin-2-amine × 1 CLR CHOLESTEROL × 7	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.50 Å
7DUR Cryo-EM structure of the compound 2-bound human GLP-1 receptor-Gs complex 提交 2021-01-11	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric	链 R 24–463（440 aa）	未记录	HNO N-tert-butyl-6,7-bis(chloranyl)quinoxalin-2-amine × 1 CLR CHOLESTEROL × 6	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.30 Å
7E14 Compound2_GLP-1R_OWL833_Gs complex structure 提交 2021-01-30	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric	链 R 24–463（440 aa）	未记录	V6G 3-[(1S,2S)-1-(5-[(4S)-2,2-dimethyloxan-4-yl]-2-{(4S)-2-(4-fluoro-3,5-dimethylphenyl)-3-[3-(4-fluoro-1-methyl-1H-indazol-5-yl)-2-oxo-2,3-dihydro-1H-imidazol-1-yl]-4-methyl-2,4,6,7-tetrahydro-5H-pyrazolo[4,3-c]pyridine-5-carbonyl}-1H-indol-1-yl)-2-methylcyclopropyl]-1,2,4-oxadiazol-5(4H)-one × 1 CLR CHOLESTEROL × 5 HNO N-tert-butyl-6,7-bis(chloranyl)quinoxalin-2-amine × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.90 Å
7EVM Cryo-EM structure of the compound 2-bound human GLP-1 receptor-Gs complex 提交 2021-05-21	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric	链 R 24–463（440 aa）	未记录	HNO N-tert-butyl-6,7-bis(chloranyl)quinoxalin-2-amine × 1 CLR CHOLESTEROL × 6	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.50 Å
7FIM Cryo-EM structure of the tirzepatide (LY3298176)-bound human GLP-1R-Gs complex 提交 2021-07-31	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric	链 R 24–463（440 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.40 Å
7KI0 Semaglutide-bound Glucagon-Like Peptide-1 (GLP-1) Receptor in Complex with Gs protein 提交 2020-10-22	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric	链 R 24–463（440 aa）	未记录	WF1 17-amino-10-oxo-3,6,12,15-tetraoxa-9-azaheptadecan-1-oic acid × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.50 Å
7KI1 Taspoglutide-bound Glucagon-Like Peptide-1 (GLP-1) Receptor in Complex with Gs Protein 提交 2020-10-22	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric	链 R 24–463（440 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.50 Å
7LCI PF 06882961 bound to the glucagon-like peptide-1 receptor (GLP-1R):Gs complex 提交 2021-01-11	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 R 24–463（440 aa）	未记录	UK4 2-[(4-{6-[(4-cyano-2-fluorophenyl)methoxy]pyridin-2-yl}piperidin-1-yl)methyl]-1-{[(2S)-oxetan-2-yl]methyl}-1H-benzimidazole-6-carboxylic acid × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.90 Å
7LCJ PF 06882961 bound to the glucagon-like peptide-1 receptor (GLP-1R):Gs complex 提交 2021-01-11	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 R 24–463（440 aa）	未记录	UK4 2-[(4-{6-[(4-cyano-2-fluorophenyl)methoxy]pyridin-2-yl}piperidin-1-yl)methyl]-1-{[(2S)-oxetan-2-yl]methyl}-1H-benzimidazole-6-carboxylic acid × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.82 Å
7LCK PF 06882961 bound to the glucagon-like peptide-1 receptor (GLP-1R) 提交 2021-01-11	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 R 24–463（440 aa）	未记录	UK4 2-[(4-{6-[(4-cyano-2-fluorophenyl)methoxy]pyridin-2-yl}piperidin-1-yl)methyl]-1-{[(2S)-oxetan-2-yl]methyl}-1H-benzimidazole-6-carboxylic acid × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.24 Å
7LLL Exendin-4-bound Glucagon-Like Peptide-1 (GLP-1) Receptor in complex with Gs protein 提交 2021-02-04	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric	链 R 24–463（440 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.70 Å
7LLY Oxyntomodulin-bound Glucagon-Like Peptide-1 (GLP-1) Receptor in complex with Gs protein 提交 2021-02-04	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric	链 R 24–463（440 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.30 Å
7RG9 cryo-EM of human Glucagon-like peptide 1 receptor GLP-1R in apo form 提交 2021-07-14	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric	链 R 24–422（399 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.20 Å
7RGP cryo-EM of human Glucagon-like peptide 1 receptor GLP-1R bound to tirzepatide 提交 2021-07-15	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric	链 R 24–422（399 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.90 Å
7RTB Peptide-19 bound to the Glucagon-Like Peptide-1 Receptor (GLP-1R) 提交 2021-08-12	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric	链 R 22–463（442 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.14 Å
7S15 GLP-1 receptor bound with Pfizer small molecule agonist 提交 2021-09-01	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 R 24–422（399 aa）	突变：I146Y, A208R, Q213E, S219R, L260A, Y291A, L339E, K346Q	82L 2-[(4-{6-[(2,4-difluorophenyl)methoxy]pyridin-2-yl}piperidin-1-yl)methyl]-1-[(1-ethyl-1H-imidazol-5-yl)methyl]-1H-benzimidazole-6-carboxylic acid × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE；-2 blotting force 4S blotting time	分辨率 3.80 Å
7S1M Ex4-D-Ala bound to the glucagon-like peptide-1 receptor/g protein complex (conformer 1) 提交 2021-09-02	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric	链 R 24–463（440 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.41 Å
7S3I Ex4-D-Ala bound to the glucagon-like peptide-1 receptor/g protein complex (conformer 2) 提交 2021-09-07	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric	链 R 24–463（440 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.51 Å
7VBH Cryo-EM structure of the GIPR/GLP-1R/GCGR triagonist peptide 20-bound human GLP-1R-Gs complex 提交 2021-08-31	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric	链 R 24–463（440 aa）	未记录	D6M N-hexadecanoyl-L-glutamic acid × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.00 Å
7VBI Cryo-EM structure of the non-acylated tirzepatide (LY3298176)-bound human GLP-1R-Gs complex 提交 2021-08-31	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric	链 R 24–463（440 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.00 Å
7X8R Cryo-EM structure of the Boc5-bound hGLP-1R-Gs complex 提交 2022-03-14	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric	链 R 24–463（440 aa）	未记录	BYI 2,4-bis(3-methoxy-4-thiophen-2-ylcarbonyloxy-phenyl)-1,3-bis[[4-[(2-methylpropan-2-yl)oxycarbonylamino]phenyl]carbonylamino]cyclobutane-1,3-dicarboxylic acid × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.61 Å
7X8S Cryo-EM structure of the WB4-24-bound hGLP-1R-Gs complex 提交 2022-03-14	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric	链 R 24–463（440 aa）	未记录	WB2 2,4-bis(3-methoxy-4-thiophen-2-ylcarbonyloxy-phenyl)-1,3-bis[[4-(2-methylpropanoylamino)phenyl]carbonylamino]cyclobutane-1,3-dicarboxylic acid × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.09 Å
8JIP Cryo-EM structure of the GLP-1R/GCGR dual agonist MEDI0382-bound human GLP-1R-Gs complex 提交 2023-05-27	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric	链 R 24–463（440 aa）	未记录	D6M N-hexadecanoyl-L-glutamic acid × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.85 Å
8JIR Cryo-EM structure of the GLP-1R/GCGR dual agonist SAR425899-bound human GLP-1R-Gs complex 提交 2023-05-27	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric	链 R 24–463（440 aa）	未记录	D6M N-hexadecanoyl-L-glutamic acid × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.57 Å
8JIS Cryo-EM structure of the GLP-1R/GCGR dual agonist peptide15-bound human GLP-1R-Gs complex 提交 2023-05-27	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric	链 R 30–423（394 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.46 Å
8WG7 Cryo-EM structures of peptide free and Gs-coupled GLP-1R 提交 2023-09-20	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric	链 R 24–463（440 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.54 Å
8YW3 Cryo-EM structure of the retatrutide-bound human GLP-1R-Gs complex 提交 2024-03-29	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric	链 R 24–463（440 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.68 Å
8YWF Cryo-EM structure of GLP1 complex bound with Retatrutide 提交 2024-03-31	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric	链 R 24–463（440 aa）	未记录	A1D7Q 20-[[(2~{S})-1-oxidanyl-1,5-bis(oxidanylidene)-5-[2-[2-(2-oxidanylideneethoxy)ethoxy]ethylamino]pentan-2-yl]amino]-20-oxidanylidene-icosanoic acid × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.04 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.74 Å
9BYO Cryo-EM structure of glucagon-like peptide-1 receptor (GLP-1R)-Gs complex with Exendin-asp3 提交 2024-05-24	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric	链 R 24–463（440 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.31 Å
9C0K Cryo-EM structure of glucagon-like peptide-1 receptor (GLP-1R)-Gs complex with Exendin-phe1 提交 2024-05-25	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric	链 R 24–463（440 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.72 Å
9E2A Glucagon Like Peptide Receptor-1 (GLP1R) A316T mutant with GLP-1 peptide. Dominant negative Gs complex. 提交 2024-10-22	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric	链 R 24–463（440 aa）	突变：A316T	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.30 Å
9EBN Peptide 1 (GLP-1 (Aib16, ACPC18)) bound to GLP-1R/Gs complex 提交 2024-11-12	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric	链 R 24–463（440 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.44 Å
9EBO Peptide 2 (GLP-1 (ACPC18)) bound to GLP-1R/Gs complex (conformer 1) 提交 2024-11-12	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric	链 R 24–463（440 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.13 Å
9EBQ Peptide 2 (GLP-1 (ACPC18)) bound to GLP-1R/Gs complex (conformer 2) 提交 2024-11-12	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric	链 R 24–463（440 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.16 Å
9IVG Cryo-EM structure of the GLP-1(9-36)-bound human GLP-1R-Gs complex 提交 2024-07-23	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric	链 R 24–463（440 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.00 Å
9IVM Cryo-EM structure of the GLP-1(9-36)-bound human GLP-1R-Gs complex in the presence of LSN3318839 提交 2024-07-24	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric	链 R 24–463（440 aa）	未记录	A1EEC (2~{R})-2-[2-[1-[(1~{R})-1-[2,6-bis(chloranyl)-3-cyclopropyl-phenyl]ethyl]imidazo[4,5-c]pyridin-6-yl]phenyl]propanoic acid × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.22 Å
9J1P Cryo-EM structure of the g1:Ox-bound human GLP-1R-Gs complex 提交 2024-08-05	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric	链 R 24–463（440 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.99 Å
9MXU cryo-EM structure of GLP-1R-Gs complex with glucagon 提交 2025-01-20	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric	链 R 24–463（440 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.50 Å
9MZE Cryo-EM structure of GLP-1R-Gs complex with oxyntomodulin 提交 2025-01-22	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric	链 R 24–463（440 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.20 Å
9MZF Cryo-EM structure of GLP-1R-Gs complex with peptide 15 提交 2025-01-22	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric	链 R 24–463（440 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.50 Å
9N05 Cryo-EM structure of GLP-1R-Gs complex with SRB103Q 提交 2025-01-23	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric	链 R 24–463（440 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.20 Å
9N1P cryo-EM structure of GLP-1R-Gs complex with SRB103H 提交 2025-01-26	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric	链 R 24–463（440 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.90 Å
9X20 Cryo-EM structure of the GLP-1-bound human GLP-1R-Gi complex 提交 2025-10-03	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric	链 R 24–463（440 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.18 Å
9X22 Cryo-EM structure of the GLP-1-bound human GLP-1R-Gq complex 提交 2025-10-03	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric	链 R 24–463（440 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.92 Å

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查看构建体与数据证据

UniProt名称	GLP1R_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 1–122； UniProt 24–145

Exendin-4

物种未注明

UniProt P26349

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2）与蛋白拷贝数一致	链 B； UniProt 56–86	片段：UNP residues 56-86	Glucagon-like peptide 1 receptor × 1 （P43220） 10M decyl 4-O-alpha-D-glucopyranosyl-1-thio-beta-D-glucopyranoside × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；293 K；0.1M Tris-HCl pH 8.5, 0.1M MgCl2, 0.4M MgTartrate, 9mM n-Decyl-beta-D-thiomaltoside, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 2.10 Å R-free 0.238

数据库中的同蛋白其他状态

其他 PDB	相对当前条目 3C5T	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
1JRJ Solution structure of exendin-4 in 30-vol% trifluoroethanol 提交 2001-08-13	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–39（39 aa）	未记录	未记录非水小分子	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 5.9；280 K；离子强度（mmCIF原始值）15mM potassium phosphate；压力 ambient NMR样品组成 Natural abundance \| 2mg/ml in pH 5.9 15mM phosphate buffer with 30 vol-% trifluoroethanol added	分辨率未提供
3C59 Crystal structure of the ligand-bound glucagon-like peptide-1 receptor extracellular domain 提交 2008-01-31	突变/修饰不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 56–86（31 aa）片段：UNP residues 56-86	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	10M decyl 4-O-alpha-D-glucopyranosyl-1-thio-beta-D-glucopyranoside × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；293 K；0.1M Tris-HCl pH 8.5, 0.1M MgCl2, 0.4M MgTartrate, 9mM n-Decyl-beta-D-thiomaltoside, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 2.30 Å R-free 0.241
5OTT Extracellular domain of GLP-1 receptor in complex with exendin-4 variant Gly2Hcs/Thr5Hcs 提交 2017-08-22	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 48–86（39 aa）	突变：G2HCS, T5HCS 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.1 M Imidazole pH 6.5, 1.0 M Sodium acetate trihydrate	分辨率 1.92 Å R-free 0.209
6GDZ exendin-4 based dual GLP-1/glucagon receptor agonist 提交 2018-04-25	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 48–86（39 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	EVT (2~{S})-2-[[(4~{S})-4-(hexadecanoylamino)-5-oxidanyl-5-oxidanylidene-pentanoyl]amino]pentanedioic acid × 1	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 5；310 K；离子强度（mmCIF原始值）35mM sodium phosphate；压力 1 NMR样品组成 5 mg/mL Peptide 5, trifluoroethanol/water \| trifluoroethanol/water	分辨率未提供
6GE2 exendin-4 based dual GLP-1/glucagon receptor agonist 提交 2018-04-25	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 48–86（39 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	EVT (2~{S})-2-[[(4~{S})-4-(hexadecanoylamino)-5-oxidanyl-5-oxidanylidene-pentanoyl]amino]pentanedioic acid × 1	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 5；310 K；离子强度（mmCIF原始值）35mM sodium phosphate；压力 1 NMR样品组成 5 mg/mL Peptide 12, trifluoroethanol/water \| trifluoroethanol/water	分辨率未提供
7LLL Exendin-4-bound Glucagon-Like Peptide-1 (GLP-1) Receptor in complex with Gs protein 提交 2021-02-04	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric	链 P 48–86（39 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.70 Å
7MLL Solution structure of Exenatide (exendin-4) in 30-vol% trifluoroethanol using CS-Rosetta 提交 2021-04-28	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 48–86（39 aa）片段：UNP Residue 48-86	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	未记录非水小分子	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 5.35；315 K；离子强度（mmCIF原始值）20；压力 1 NMR样品组成 13 mM 'NA-' Exenatide (exendin-4), 20 mM 'NA-' sodium phosphate, 30 % v/v [U-99% 2H] TFE, 10 % v/v [U-99% 2H] D2O, 0.01 mg/mL 'NA-' DSS, 60 % H2O/30%Trifluoroethanol/10 % D2O \| 60 % H2O/30%Trifluoroethanol/10 % D2O	分辨率未提供
9G0M Trp-cage fortified Tc5b-Exenatide chimera (Ex4-Tc5bER) at 288K 提交 2024-07-08	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 62–86（25 aa）	未记录	未记录非水小分子	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 7；288 K；离子强度（mmCIF原始值）n.d.；压力 1 NMR样品组成 0.8 mM polypeptide, 1 % sodium-azide, 1 % DSS, 90% H2O/10% D2O \| 90% H2O/10% D2O	分辨率未提供
9G0N Trp-cage fortified Tc5b-Exenatide chimera (Ex4-Tc5bER) at 299K 提交 2024-07-08	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 62–86（25 aa）	未记录	未记录非水小分子	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 7；299 K；离子强度（mmCIF原始值）n.d.；压力 1 NMR样品组成 0.8 mM non-labelled polypeptide, 1 % non-labelled sodium-azide, 1 % non-labelled DSS, 90% H2O/10% D2O \| 90% H2O/10% D2O	分辨率未提供
9G20 Trp-cage fortified Tc5b-Exenatide chimera (Ex4-Tc5bER) at 310K 提交 2024-07-10	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 62–86（25 aa）	未记录	未记录非水小分子	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 7；310 K；离子强度（mmCIF原始值）n.d.；压力 1 NMR样品组成 0.8 mM non-labeled polypeptide, 1 % non-labeled sodium azide, 1 % non-labeled DSS, 90% H2O/10% D2O \| 90% H2O/10% D2O	分辨率未提供
9G21 Trp-cage fortified Tc5b-Exenatide chimera (Ex4-Tc5bER) at 321K 提交 2024-07-10	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 62–86（25 aa）	未记录	未记录非水小分子	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 7；321 K；离子强度（mmCIF原始值）n.d.；压力 1 NMR样品组成 0.8 mM non-labeled polypeptide, 1 % non-labeled sodium azide, 1 % non-labeled DSS, 90% H2O/10% D2O \| 90% H2O/10% D2O	分辨率未提供
9G22 Trp-cage fortified Tc5b-Exenatide chimera (Ex4-Tc5bDR) at 277K 提交 2024-07-10	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 62–86（25 aa）	未记录	未记录非水小分子	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 7.1；277 K；离子强度（mmCIF原始值）n.d.；压力 1 NMR样品组成 0.85 mM non-labeled polypeptide, 1 % non-labeled sodium azide, 1 % non-labeled DSS, 90% H2O/10% D2O \| 90% H2O/10% D2O	分辨率未提供
9G2N Trp-cage fortified Tc5b-Exenatide chimera ( Ex-4-Tc5bDR) at 288K 提交 2024-07-11	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 62–86（25 aa）	未记录	未记录非水小分子	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 7.1；288 K；离子强度（mmCIF原始值）n.d.；压力 1 NMR样品组成 0.85 mM non-labeled polypeptide, 1 % non-labeled sodium azide, 1 % non-labeled DSS, 90% H2O/10% D2O \| 90% H2O/10% D2O	分辨率未提供
9G2O Trp-cage fortified Tc5b-Exenatide chimera (Ex-4-Tc5bDR) at 299K 提交 2024-07-11	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 62–86（25 aa）	未记录	未记录非水小分子	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 7.1；299 K；离子强度（mmCIF原始值）n.d.；压力 1 NMR样品组成 0.85 mM non-labeled polypeptide, 1 % non-labeled sodium azide, 1 % non-labeled DSS, 90% H2O/10% D2O \| 90% H2O/10% D2O	分辨率未提供
9G31 Trp-cage fortified Tc5b-Exenatide chimera (Ex-4-Tc5bDR) at 310K 提交 2024-07-11	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 62–86（25 aa）	未记录	未记录非水小分子	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 7.1；310 K；离子强度（mmCIF原始值）n.d.；压力 1 NMR样品组成 0.85 mM non-labeled polypeptide, 1 % non-labeled sodium azide, 1 % non-labeled DSS, 90% H2O/10% D2O \| 90% H2O/10% D2O	分辨率未提供
9G32 Trp-cage fortified Tc5b-Exenatide chimera (Ex-4-Tc5bDR) at 321K 提交 2024-07-11	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 62–86（25 aa）	未记录	未记录非水小分子	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 7.1；321 K；离子强度（mmCIF原始值）n.d.；压力 1 NMR样品组成 0.85 mM non-labeld polypeptide, 1 mM non-labeld sodium azide, 1 % non-labeld DSS, 90% H2O/10% D2O \| 90% H2O/10% D2O	分辨率未提供
9G5P Trp-cage fortified Tc5b-Exenatide chimera (Ex4-Tc5bER) at 277K 提交 2024-07-17	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 62–86（25 aa）	未记录	未记录非水小分子	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 7；277 K；离子强度（mmCIF原始值）n.d.；压力 1 NMR样品组成 0.8 mM non-labeled polypeptide, 1 % non-labeled sodium azide, 1 % non-labeled DSS, 90% H2O/10% D2O \| 90% H2O/10% D2O	分辨率未提供

共 17 个其他 PDB 条目、17 个 assembly。打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	EXE4_HELSU
Isoform	—
PDB实体	2
链与序列区间	作者链 B； PDB构建体 1–31； UniProt 56–86

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

下载 Download SAXS (.dat) P(r) (.pr.out) CIF

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	3c5t
沉积日期 deposition_date	2008-02-01
结构标题 title	Crystal structure of the ligand-bound glucagon-like peptide-1 receptor extracellular domain
关键词 keywords	;ligand-bound G protein-coupled receptor extracellular domain, G-protein coupled receptor, Glycoprotein, Membrane, Transducer, Transmembrane, Amidation, Cleavage on pair of basic residues, Secreted, Signaling protein-Signaling protein COMPLEX ;; Signaling protein/Signaling protein
实验方法 method	X-RAY DIFFRACTION

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3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

回转半径 Rg (Guinier) rg_guinier	16.91 Å
回转半径 Rg (电子) rg_electron	16.06 Å
零角强度 I(0) i0	4868860.00
分子量 molecular_weight	15459.0 kDa
排除体积 excluded_volume	19152 Å³
包络体积 envelope_volume	23035 Å³
水化壳体积 shell_volume	12681 Å³
包络直径 envelope_diameter	63.2 Å
壳层 Rg shell_rg	21.33 Å
包络 Rg envelope_rg	16.54 Å
形状 Rg shape_rg	16.01 Å
总 Rg total_rg	17.21 Å
总原子数 total_atoms	1088
残基数 n_residues	129
球谐函数阶数 n_harmonics	20
q 范围 q_range	— – 0.5000 Å⁻¹
数据点数 n_points	101
壳层类型 shell_type	directional
溶剂电子密度 solvent_density	0.3340 e/Å³
壳层衬度 contrast_shell	0.0300 e/Å³
CRYSOL 版本 crysol_version	4.1.3

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4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

最大尺寸 Dmax dmax	65.0 Å
Rg (实空间) rg_real	16.92 Å
Rg 误差 (实空间) rg_real_error	0.48 Å
I(0) (实空间) i0_real	4.8690e+06
I(0) 误差 (实空间) i0_real_error	5.8540e+04
Rg (倒空间) rg_reciprocal	16.92 Å
I(0) (倒空间) i0_reciprocal	4869000.0000
解质量估计 total_estimate	0.8040
解质量评级 solution_quality	GOOD a GOOD solution
P(r) 峰数 n_peaks	2
主峰位置 r_peak_primary	20.5 Å
偏度 Skewness skewness	0.420
峰度 Kurtosis kurtosis	0.074
角度范围 angular_range	— – 0.4700 Å⁻¹
当前正则化参数 α current_alpha	0.0000
最高正则化参数 α highest_alpha	688100.0000
实空间数据点数 n_real_points	77
GNOM 版本 gnom_version	4.1.3
质量判据 quality_criteria	AN1: 0.000; Oscil: 0.536; Stabil: 1.000; Sysdev: 1.000; Positv: 1.000; Valcen: 0.839; Smooth: 1.000

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5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

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6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (4)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	Glucagon-like peptide 1 receptor
分子量 formula_weight	14325.8 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A
原子数 atom_count	1214

RPQGATVSLWETVQKWREYRRQCQRSLTEDPPPATDLFCNRTFDEYACWPDGEPGSFVNVSCPWYLPWASSVPQGHVYRFCTAEGLWLQKDNSSLPWRDLSECEESKRGERSSPEEQLLFLY

来源 Source

来源生物 organism	Homo sapiens
通用名 common_name	human
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9606
宿主生物 host_organism	Escherichia coli BL21(DE3)

实体 2 Entity 2 polymer

描述 description	Exendin-4
分子量 formula_weight	3373.8 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	B

DLSKQMEEEAVRLFIEWLKNGGPSSGAPPPS

实体 3 Entity 3 non-polymer

描述 description	decyl 4-O-alpha-D-glucopyranosyl-1-thio-beta-D-glucopyranoside
分子量 formula_weight	498.6 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

实体 4 Entity 4 water

描述 description	water
分子量 formula_weight	18.0 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	126

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7. 折叠分类 (SCOP + CATH) 2 domains

SCOP 2.08 (1 domains)

结构域编号 domain_id	d3c5tb1
类 Class class	j — Peptides
折叠类型 Fold fold	j.6 — Peptide hormones
超家族 Superfamily superfamily	j.6.1 — Peptide hormones
家族 Family family	j.6.1.1 — Peptide hormones

CATH v4.4 (1 domains)

结构域编号 domain_id	3c5tA00
类 Class class	4 — Few Secondary Structures
架构 Architecture architecture	10 — Irregular
拓扑 Topology topology	1240 — Hormone receptor fold
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — GPCR, family 2, extracellular hormone receptor domain

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8. 引用文献 (1)

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晶胞边长 a length_a	75.910 Å
晶胞边长 b length_b	75.910 Å
晶胞边长 c length_c	87.770 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	90.00 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	120.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	6

空间群 space_group	P 31 2 1
空间群编号 int_tables_number	152
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	2.100 Å
最低分辨率 resolution_low	36.500 Å
R 因子 r_factor	0.2050
R_work r_work	0.2033
R_free r_free	0.2381

fit	/app/data/saxs_computation/c5/3c5t/3c5t.fit
pddf	/app/data/pr_computation/c5/3c5t/3c5t.pr.out
profile	/app/data/saxs_computation/c5/3c5t/3c5t.dat

Crystal structure of the ligand-bound glucagon-like peptide-1 receptor extracellular domain

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Glucagon-like peptide 1 receptor

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

Exendin-4

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (4)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

实体 3 Entity 3 non-polymer

实体 4 Entity 4 water

7. 折叠分类 (SCOP + CATH) 2 domains

SCOP 2.08 (1 domains)

CATH v4.4 (1 domains)

8. 引用文献 (1)

9. 文件与曲线 (10)

Files (7)

Curves (3)