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3cf5

Thiopeptide antibiotic Thiostrepton bound to the large ribosomal subunit of Deinococcus radiodurans

Method: X-RAY DIFFRACTION Dmax: 229.8 Å Quality: GOOD
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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

50S RIBOSOMAL PROTEIN L33

物种未注明

UniProt Q9RSS4

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白–RNA 异源复合物 蛋白 × 29 RNA 2 PDB 声明：31-meric（31） 与全部聚合物数一致 链 1； UniProt 1–55 未记录 50S RIBOSOMAL PROTEIN L34 × 1 （Q9RSH2） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L35 × 1 （Q9RSW6） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L36 × 1 （Q9RSK0） THIOSTREPTON × 1 （P0C8P8） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L2 × 1 （Q9RXJ9） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L3 × 1 （Q9RXK2） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L4 × 1 （Q9RXK1） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L5 × 1 （Q9RXJ0） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L6 × 1 （Q9RSL3） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L11 × 1 （Q9RSS7） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L13 × 1 （Q9RXY1） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L14 × 1 （Q9RXJ2） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L15 × 1 （Q9RSK9） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L16 × 1 （Q9RXJ5） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L17 × 1 （Q9RSJ5） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L18 × 1 （Q9RSL2） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L19 × 1 （Q9RWB4） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L20 × 1 （Q9RSW7） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L21 × 1 （Q9RY64） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L22 × 1 （Q9RXJ7） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L23 × 1 （Q9RXK0） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L24 × 1 （Q9RXJ1） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L25 × 1 （Q9RX88） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L27 × 1 （Q9RY65） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L28 × 1 （Q9RRG8） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L29 × 1 （Q9RXJ4） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L30 × 1 （Q9RSL0） RRNA-23S RIBOSOMAL RNA × 1 50S RIBOSOMAL PROTEIN L32 × 1 （P49228） RRNA-5S RIBOSOMAL RNA × 1 MG MAGNESIUM ION × 36 X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP 分辨率 3.30 Å R-free 0.318

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 3CF5 Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
1NKW Crystal Structure Of The Large Ribosomal Subunit From Deinococcus Radiodurans 提交 2003-01-05 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 29 PDB 声明：31-meric
链 1 1–55（55 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；ETHANOL, DIMETHYLHEXANEDIOL, MGCL2, KCL, HEPES, NH4CL, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP
分辨率 3.10 Å R-free 0.274
1NWX COMPLEX OF THE LARGE RIBOSOMAL SUBUNIT FROM DEINOCOCCUS RADIODURANS WITH ABT-773 提交 2003-02-07 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 29 PDB 声明：31-meric
链 1 1–55（55 aa）
未记录 773 CETHROMYCIN × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；281 K；ETHANOL, DIMETHYLHEXANEDIOL, MGCL2, KCL, HEPES, NH4CL, pH 7.80, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 281K
分辨率 3.50 Å R-free 0.313
1NWY COMPLEX OF THE LARGE RIBOSOMAL SUBUNIT FROM DEINOCOCCUS RADIODURANS WITH AZITHROMYCIN 提交 2003-02-07 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 29 PDB 声明：31-meric
链 1 1–55（55 aa）
未记录 ZIT AZITHROMYCIN × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；291 K；ETHANOL, DIMETHYLHEXANEDIOL, MGCL2, KCL, HEPES, NH4CL, pH 7.80, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K
分辨率 3.30 Å R-free 0.304
1SM1 COMPLEX OF THE LARGE RIBOSOMAL SUBUNIT FROM DEINOCOCCUS RADIODURANS WITH QUINUPRISTIN AND DALFOPRISTIN 提交 2004-03-08 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 30 PDB 声明：32-meric
链 1 1–82（82 aa）
未记录 DOL 5-(2-DIETHYLAMINO-ETHANESULFONYL)-21-HYDROXY-10-ISOPROPYL-11,19-DIMETHYL-9,26-DIOXA-3,15,28-TRIAZA-TRICYCLO[23.2.1.00,255]OCTACOSA-1(27),12,17,19,25(28)-PENTAENE-2,8,14,23-TETRAONE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 7.8；ETHANOL, DIMETHYLHEXANEDIOL, MGCL2, KCL, HEPES, NH4CL , PH 7.80, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, TEMPERATURE 290K
分辨率 3.42 Å R-free 0.348
1XBP Inhibition of peptide bond formation by pleuromutilins: The structure of the 50S ribosomal subunit from Deinococcus radiodurans in complex with Tiamulin 提交 2004-08-31 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 29 PDB 声明：31-meric
链 1 1–55（55 aa）
未记录 MUL TIAMULIN × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；280 K；ETHANOL, DIMETHYLHEXANEDIOL, MGCL2,KCL, HEPES, NH4CL, pH 7.80, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 280K
分辨率 3.50 Å R-free 0.360
2ZJP Thiopeptide antibiotic Nosiheptide bound to the large ribosomal subunit of Deinococcus radiodurans 提交 2008-03-07 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 29 PDB 声明：31-meric
链 1 1–55（55 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 NO1 4-(hydroxymethyl)-3-methyl-1H-indole-2-carboxylic acid × 1 MG MAGNESIUM ION × 35 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP
分辨率 3.70 Å R-free 0.340
2ZJQ Interaction of L7 with L11 induced by Microccocin binding to the Deinococcus radiodurans 50S subunit 提交 2008-03-08 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 29 PDB 声明：31-meric
链 1 1–55（55 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP
分辨率 3.30 Å R-free 0.339
2ZJR Refined native structure of the large ribosomal subunit (50S) from Deinococcus radiodurans 提交 2008-03-08 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 28 PDB 声明：30-meric
链 1 1–55（55 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 35 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP
分辨率 2.91 Å R-free 0.311
3DLL The oxazolidinone antibiotics perturb the ribosomal peptidyl-transferase center and effect tRNA positioning 提交 2008-06-27 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 28 PDB 声明：30-meric
链 1 1–55（55 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 35 ZLD N-{[(5S)-3-(3-fluoro-4-morpholin-4-ylphenyl)-2-oxo-1,3-oxazolidin-5-yl]methyl}acetamide × 1 ZN ZINC ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；10mM MgCl2, 60mM NH4Cl, 5mM KCl, 10mM HEPES, pH7.8, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP
分辨率 3.50 Å R-free 0.280
3PIO Crystal structure of the synergistic antibiotic pair lankamycin and lankacidin in complex with the large ribosomal subunit 提交 2010-11-07 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 28 PDB 声明：30-meric
链 1 1–55（55 aa）
未记录 LMA Lankamycin × 1 MG MAGNESIUM ION × 154 NA SODIUM ION × 42 K POTASSIUM ION × 15 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP. 15% 2:1 ethanol:methylpentanediol was diffused to a hanging drop of 180 AU/ml solution of D50S.
分辨率 3.25 Å R-free 0.294
3PIP Crystal structure of the synergistic antibiotic pair lankamycin and lankacidin in complex with the large ribosomal subunit 提交 2010-11-07 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 28 PDB 声明：30-meric
链 1 1–55（55 aa）
未记录 LC2 N-[(1S,2R,3E,5E,7S,9E,11E,13S,15R,19R)-7,13-dihydroxy-1,4,10,19-tetramethyl-17,18-dioxo-16-oxabicyclo[13.2.2]nonadeca-3,5,9,11-tetraen-2-yl]-2-oxopropanamide × 1 LMA Lankamycin × 1 MG MAGNESIUM ION × 73 K POTASSIUM ION × 4 NA SODIUM ION × 5 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP. 15% 2:1 ethanol:methylpentanediol was diffused to a hanging drop of 180 AU/ml solution of D50S.
分辨率 3.45 Å R-free 0.301
4IO9 Crystal structure of compound 4d bound to large ribosomal subunit (50S) from Deinococcus radiodurans 提交 2013-01-07 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 28 PDB 声明：30-meric
链 1 1–55（55 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 35 1F2 (3aS,4R,7R,8S,9S,10R,11R,13R,15R,15aR)-4-ethyl-11-methoxy-3a,7,9,11,13,15-hexamethyl-2,6,14-trioxo-10-{[3,4,6-trideoxy-3-(dimethylamino)-beta-D-xylo-hexopyranosyl]oxy}tetradecahydro-2H-oxacyclotetradecino[4,3-d][1,3]oxazol-8-yl (2R)-2-(pyridin-3-yl)pyrrolidine-1-carboxylate × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP
分辨率 3.20 Å R-free 0.235
4IOA Crystal structure of compound 4e bound to large ribosomal subunit (50S) from Deinococcus radiodurans 提交 2013-01-07 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 28 PDB 声明：30-meric
链 1 1–55（55 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 35 1F3 (3aS,4R,7R,8S,9S,10R,11R,13R,15R,15aR)-4-ethyl-11-methoxy-3a,7,9,11,13,15-hexamethyl-2,6,14-trioxo-10-{[3,4,6-trideoxy-3-(dimethylamino)-beta-D-xylo-hexopyranosyl]oxy}tetradecahydro-2H-oxacyclotetradecino[4,3-d][1,3]oxazol-8-yl (2R)-2-[4-(acetylamino)phenyl]-2,3-dihydro-1H-pyrrole-1-carboxylate × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP
分辨率 3.20 Å R-free 0.230
4IOC Crystal structure of compound 4f bound to large ribosomal subunit (50S) from Deinococcus radiodurans 提交 2013-01-07 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 28 PDB 声明：30-meric
链 1 1–55（55 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 35 1F4 (3aS,4R,7R,8S,9S,10R,11R,13R,15S,15aR)-4-ethyl-11-methoxy-3a,7,9,11,13,15-hexamethyl-2,6,14-trioxo-10-{[3,4,6-trideoxy-3-(dimethylamino)-beta-D-xylo-hexopyranosyl]oxy}tetradecahydro-2H-oxacyclotetradecino[4,3-d][1,3]oxazol-8-yl (2R)-4,4-dimethyl-2-(pyridin-3-yl)pyrrolidine-1-carboxylate × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP
分辨率 3.60 Å R-free 0.239
4U67 Crystal structure of the large ribosomal subunit (50S) of Deinococcus radiodurans containing a three residue insertion in L22 提交 2014-07-28 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 26 PDB 声明：28-meric
链 1 1–55（55 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 51 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；293 K；Magnesium chloride, HEPES, ammonium chloride, ethanol, 2-ethyl-1,3-hexandiol
分辨率 3.65 Å R-free 0.270
4WFN Crystal structure of the large ribosomal subunit (50S) of Deinococcus radiodurans containing a three residue insertion in L22 in complex with erythromycin 提交 2014-09-16 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 26 PDB 声明：28-meric
链 1 1–55（55 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 70 ERY ERYTHROMYCIN A × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；293 K；Magnesuim chloride, Hepes, ammonium chloride, ethanol, 2-ethyl-1,3-hexadiol
分辨率 3.54 Å R-free 0.282
5DM7 Crystal structure of the 50S ribosomal subunit from Deinococcus radiodurans in complex with hygromycin A 提交 2015-09-08 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 28 PDB 声明：30-meric
链 1 2–50（49 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 186 HGR Hygromycin A × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；292 K；HEPES, sodium hydroxide, magnesium chloride, ammonium chloride, 2-mercaptoethanol, spermidine, 2-ethyl-1,3-hexanediol, ethanol
分辨率 3.00 Å R-free 0.326
5JVG The large ribosomal subunit from Deinococcus radiodurans in complex with avilamycin 提交 2016-05-11 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 27 PDB 声明：29-meric
链 1 1–55（55 aa）
未记录 6NO Avilamycin × 1 MG MAGNESIUM ION × 446 MPD (4S)-2-METHYL-2,4-PENTANEDIOL × 5 SPD SPERMIDINE × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；293.15 K；Ribosome solution containing 0.0065 mM (180 A/ml) of D50S in 10 mM Hepes pH=7.8, 15 mM MgCl2 and 75 mM NH4Cl crystallization buffer was mixed with 10 mM spermidine, 1 % ethanol and 0.5 % 2-ethyl-1,3-hexanediol precipitants. A 0.005 ml crystallization drop was hanged over 10 % ethanol and 5% 2-ethyl-1,3-hexanediol in ddw reservoir.
分辨率 3.43 Å R-free 0.253
5JVH The crystal structure large ribosomal subunit (50S) of Deinococcus radiodurans in complex with evernimicin 提交 2016-05-11 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 26 PDB 声明：28-meric
链 1 2–55（54 aa）
未记录 6O1 Evernimicin × 1 MG MAGNESIUM ION × 123 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；293 K；Magnesium chloride, HEPES, ammonium chloride, ethanol, 2-ethyl-1,3-hexandiol
分辨率 3.58 Å R-free 0.247
7A0R 50S Deinococcus radiodurans ribosome bounded with mycinamicin I 提交 2020-08-10 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 26 PDB 声明：28-meric
链 1 6–54（49 aa）
未记录 QTZ mycinamicin II × 1 MG MAGNESIUM ION × 345 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293.15 K；Ribosome solution containing 0.0065 mM (180 A/ml) of D50S in 10 mM Hepes pH=7.8, 15 mM MgCl2 and 75 mM NH4Cl crystallization buffer was mixed with 10 mM spermidine, 1 % ethanol and 0.5 % 2-ethyl-1,3-hexanediol precipitants. A 0.005 ml crystallization drop was hanged over 10 % ethanol and 5% 2-ethyl-1,3-hexanediol in ddw reservoir.
分辨率 3.30 Å R-free 0.249
7A0S 50S Deinococcus radiodurans ribosome bounded with mycinamicin I 提交 2020-08-10 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 26 PDB 声明：28-meric
链 1 6–54（49 aa）
未记录 QU2 mycinamicin I × 1 MG MAGNESIUM ION × 367 SPD SPERMIDINE × 8 MPD (4S)-2-METHYL-2,4-PENTANEDIOL × 4 NA SODIUM ION × 1 EOH ETHANOL × 1 CA CALCIUM ION × 5 K POTASSIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293.15 K；Ribosome solution containing 0.0065 mM (180 A/ml) of D50S in 10 mM Hepes pH=7.8, 15 mM MgCl2 and 75 mM NH4Cl crystallization buffer was mixed with 10 mM spermidine, 1 % ethanol and 0.5 % 2-ethyl-1,3-hexanediol precipitants. A 0.005 ml crystallization drop was hanged over 10 % ethanol and 5% 2-ethyl-1,3-hexanediol in ddw reservoir.
分辨率 3.22 Å R-free 0.253
7A18 50S Deinococcus radiodurans ribosome bounded with mycinamicin IV 提交 2020-08-12 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 26 PDB 声明：28-meric
链 1 6–54（49 aa）
未记录 MIV MYCINAMICIN IV × 1 MG MAGNESIUM ION × 277 SPD SPERMIDINE × 7 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；293.15 K；Ribosome solution containing 0.0065 mM (180 A/ml) of D50S in 10 mM Hepes pH=7.8, 15 mM MgCl2 and 75 mM NH4Cl crystallization buffer was mixed with 10 mM spermidine, 1 % ethanol and 0.5 % 2-ethyl-1,3-hexanediol precipitants. A 0.005 ml crystallization drop was hanged over 10 % ethanol and 5% 2-ethyl-1,3-hexanediol in ddw reservoir.
分辨率 3.40 Å R-free 0.318

共 22 个其他 PDB 条目、22 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 RL33_DEIRA
Isoform —
PDB实体 1
链与序列区间 作者链 1； PDB构建体 1–55； UniProt 1–55

50S RIBOSOMAL PROTEIN L34

物种未注明

UniProt Q9RSH2

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白–RNA 异源复合物 蛋白 × 29 RNA 2 PDB 声明：31-meric（31） 与全部聚合物数一致 链 2； UniProt 1–47 未记录 50S RIBOSOMAL PROTEIN L33 × 1 （Q9RSS4） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L35 × 1 （Q9RSW6） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L36 × 1 （Q9RSK0） THIOSTREPTON × 1 （P0C8P8） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L2 × 1 （Q9RXJ9） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L3 × 1 （Q9RXK2） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L4 × 1 （Q9RXK1） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L5 × 1 （Q9RXJ0） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L6 × 1 （Q9RSL3） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L11 × 1 （Q9RSS7） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L13 × 1 （Q9RXY1） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L14 × 1 （Q9RXJ2） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L15 × 1 （Q9RSK9） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L16 × 1 （Q9RXJ5） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L17 × 1 （Q9RSJ5） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L18 × 1 （Q9RSL2） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L19 × 1 （Q9RWB4） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L20 × 1 （Q9RSW7） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L21 × 1 （Q9RY64） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L22 × 1 （Q9RXJ7） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L23 × 1 （Q9RXK0） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L24 × 1 （Q9RXJ1） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L25 × 1 （Q9RX88） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L27 × 1 （Q9RY65） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L28 × 1 （Q9RRG8） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L29 × 1 （Q9RXJ4） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L30 × 1 （Q9RSL0） RRNA-23S RIBOSOMAL RNA × 1 50S RIBOSOMAL PROTEIN L32 × 1 （P49228） RRNA-5S RIBOSOMAL RNA × 1 MG MAGNESIUM ION × 36 X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP 分辨率 3.30 Å R-free 0.318

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 3CF5 Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
1NKW Crystal Structure Of The Large Ribosomal Subunit From Deinococcus Radiodurans 提交 2003-01-05 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 29 PDB 声明：31-meric
链 2 1–47（47 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；ETHANOL, DIMETHYLHEXANEDIOL, MGCL2, KCL, HEPES, NH4CL, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP
分辨率 3.10 Å R-free 0.274
1NWX COMPLEX OF THE LARGE RIBOSOMAL SUBUNIT FROM DEINOCOCCUS RADIODURANS WITH ABT-773 提交 2003-02-07 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 29 PDB 声明：31-meric
链 2 1–47（47 aa）
未记录 773 CETHROMYCIN × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；281 K；ETHANOL, DIMETHYLHEXANEDIOL, MGCL2, KCL, HEPES, NH4CL, pH 7.80, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 281K
分辨率 3.50 Å R-free 0.313
1NWY COMPLEX OF THE LARGE RIBOSOMAL SUBUNIT FROM DEINOCOCCUS RADIODURANS WITH AZITHROMYCIN 提交 2003-02-07 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 29 PDB 声明：31-meric
链 2 1–47（47 aa）
未记录 ZIT AZITHROMYCIN × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；291 K；ETHANOL, DIMETHYLHEXANEDIOL, MGCL2, KCL, HEPES, NH4CL, pH 7.80, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K
分辨率 3.30 Å R-free 0.304
1SM1 COMPLEX OF THE LARGE RIBOSOMAL SUBUNIT FROM DEINOCOCCUS RADIODURANS WITH QUINUPRISTIN AND DALFOPRISTIN 提交 2004-03-08 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 30 PDB 声明：32-meric
链 2 1–47（47 aa）
未记录 DOL 5-(2-DIETHYLAMINO-ETHANESULFONYL)-21-HYDROXY-10-ISOPROPYL-11,19-DIMETHYL-9,26-DIOXA-3,15,28-TRIAZA-TRICYCLO[23.2.1.00,255]OCTACOSA-1(27),12,17,19,25(28)-PENTAENE-2,8,14,23-TETRAONE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 7.8；ETHANOL, DIMETHYLHEXANEDIOL, MGCL2, KCL, HEPES, NH4CL , PH 7.80, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, TEMPERATURE 290K
分辨率 3.42 Å R-free 0.348
1XBP Inhibition of peptide bond formation by pleuromutilins: The structure of the 50S ribosomal subunit from Deinococcus radiodurans in complex with Tiamulin 提交 2004-08-31 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 29 PDB 声明：31-meric
链 2 1–47（47 aa）
未记录 MUL TIAMULIN × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；280 K；ETHANOL, DIMETHYLHEXANEDIOL, MGCL2,KCL, HEPES, NH4CL, pH 7.80, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 280K
分辨率 3.50 Å R-free 0.360
2ZJP Thiopeptide antibiotic Nosiheptide bound to the large ribosomal subunit of Deinococcus radiodurans 提交 2008-03-07 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 29 PDB 声明：31-meric
链 2 1–47（47 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 NO1 4-(hydroxymethyl)-3-methyl-1H-indole-2-carboxylic acid × 1 MG MAGNESIUM ION × 35 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP
分辨率 3.70 Å R-free 0.340
2ZJQ Interaction of L7 with L11 induced by Microccocin binding to the Deinococcus radiodurans 50S subunit 提交 2008-03-08 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 29 PDB 声明：31-meric
链 2 1–47（47 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP
分辨率 3.30 Å R-free 0.339
2ZJR Refined native structure of the large ribosomal subunit (50S) from Deinococcus radiodurans 提交 2008-03-08 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 28 PDB 声明：30-meric
链 2 1–47（47 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 35 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP
分辨率 2.91 Å R-free 0.311
3DLL The oxazolidinone antibiotics perturb the ribosomal peptidyl-transferase center and effect tRNA positioning 提交 2008-06-27 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 28 PDB 声明：30-meric
链 2 1–47（47 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 35 ZLD N-{[(5S)-3-(3-fluoro-4-morpholin-4-ylphenyl)-2-oxo-1,3-oxazolidin-5-yl]methyl}acetamide × 1 ZN ZINC ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；10mM MgCl2, 60mM NH4Cl, 5mM KCl, 10mM HEPES, pH7.8, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP
分辨率 3.50 Å R-free 0.280
3PIO Crystal structure of the synergistic antibiotic pair lankamycin and lankacidin in complex with the large ribosomal subunit 提交 2010-11-07 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 28 PDB 声明：30-meric
链 2 1–47（47 aa）
未记录 LMA Lankamycin × 1 MG MAGNESIUM ION × 154 NA SODIUM ION × 42 K POTASSIUM ION × 15 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP. 15% 2:1 ethanol:methylpentanediol was diffused to a hanging drop of 180 AU/ml solution of D50S.
分辨率 3.25 Å R-free 0.294
3PIP Crystal structure of the synergistic antibiotic pair lankamycin and lankacidin in complex with the large ribosomal subunit 提交 2010-11-07 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 28 PDB 声明：30-meric
链 2 1–47（47 aa）
未记录 LC2 N-[(1S,2R,3E,5E,7S,9E,11E,13S,15R,19R)-7,13-dihydroxy-1,4,10,19-tetramethyl-17,18-dioxo-16-oxabicyclo[13.2.2]nonadeca-3,5,9,11-tetraen-2-yl]-2-oxopropanamide × 1 LMA Lankamycin × 1 MG MAGNESIUM ION × 73 K POTASSIUM ION × 4 NA SODIUM ION × 5 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP. 15% 2:1 ethanol:methylpentanediol was diffused to a hanging drop of 180 AU/ml solution of D50S.
分辨率 3.45 Å R-free 0.301
4IO9 Crystal structure of compound 4d bound to large ribosomal subunit (50S) from Deinococcus radiodurans 提交 2013-01-07 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 28 PDB 声明：30-meric
链 2 1–47（47 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 35 1F2 (3aS,4R,7R,8S,9S,10R,11R,13R,15R,15aR)-4-ethyl-11-methoxy-3a,7,9,11,13,15-hexamethyl-2,6,14-trioxo-10-{[3,4,6-trideoxy-3-(dimethylamino)-beta-D-xylo-hexopyranosyl]oxy}tetradecahydro-2H-oxacyclotetradecino[4,3-d][1,3]oxazol-8-yl (2R)-2-(pyridin-3-yl)pyrrolidine-1-carboxylate × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP
分辨率 3.20 Å R-free 0.235
4IOA Crystal structure of compound 4e bound to large ribosomal subunit (50S) from Deinococcus radiodurans 提交 2013-01-07 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 28 PDB 声明：30-meric
链 2 1–47（47 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 35 1F3 (3aS,4R,7R,8S,9S,10R,11R,13R,15R,15aR)-4-ethyl-11-methoxy-3a,7,9,11,13,15-hexamethyl-2,6,14-trioxo-10-{[3,4,6-trideoxy-3-(dimethylamino)-beta-D-xylo-hexopyranosyl]oxy}tetradecahydro-2H-oxacyclotetradecino[4,3-d][1,3]oxazol-8-yl (2R)-2-[4-(acetylamino)phenyl]-2,3-dihydro-1H-pyrrole-1-carboxylate × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP
分辨率 3.20 Å R-free 0.230
4IOC Crystal structure of compound 4f bound to large ribosomal subunit (50S) from Deinococcus radiodurans 提交 2013-01-07 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 28 PDB 声明：30-meric
链 2 1–47（47 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 35 1F4 (3aS,4R,7R,8S,9S,10R,11R,13R,15S,15aR)-4-ethyl-11-methoxy-3a,7,9,11,13,15-hexamethyl-2,6,14-trioxo-10-{[3,4,6-trideoxy-3-(dimethylamino)-beta-D-xylo-hexopyranosyl]oxy}tetradecahydro-2H-oxacyclotetradecino[4,3-d][1,3]oxazol-8-yl (2R)-4,4-dimethyl-2-(pyridin-3-yl)pyrrolidine-1-carboxylate × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP
分辨率 3.60 Å R-free 0.239
4U67 Crystal structure of the large ribosomal subunit (50S) of Deinococcus radiodurans containing a three residue insertion in L22 提交 2014-07-28 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 26 PDB 声明：28-meric
链 2 1–47（47 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 51 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；293 K；Magnesium chloride, HEPES, ammonium chloride, ethanol, 2-ethyl-1,3-hexandiol
分辨率 3.65 Å R-free 0.270
4WFN Crystal structure of the large ribosomal subunit (50S) of Deinococcus radiodurans containing a three residue insertion in L22 in complex with erythromycin 提交 2014-09-16 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 26 PDB 声明：28-meric
链 2 1–47（47 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 70 ERY ERYTHROMYCIN A × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；293 K；Magnesuim chloride, Hepes, ammonium chloride, ethanol, 2-ethyl-1,3-hexadiol
分辨率 3.54 Å R-free 0.282
5DM6 Crystal structure of the 50S ribosomal subunit from Deinococcus radiodurans 提交 2015-09-08 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 28 PDB 声明：30-meric
链 2 1–47（47 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 198 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；292 K；HEPES, sodium hydroxide, magnesium chloride, ammonium chloride, 2-mercaptoethanol, spermidine, 2-ethyl-1, 3-hexanediol, ethanol
分辨率 2.90 Å R-free 0.270
5DM7 Crystal structure of the 50S ribosomal subunit from Deinococcus radiodurans in complex with hygromycin A 提交 2015-09-08 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 28 PDB 声明：30-meric
链 2 1–47（47 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 186 HGR Hygromycin A × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；292 K；HEPES, sodium hydroxide, magnesium chloride, ammonium chloride, 2-mercaptoethanol, spermidine, 2-ethyl-1,3-hexanediol, ethanol
分辨率 3.00 Å R-free 0.326
5JVG The large ribosomal subunit from Deinococcus radiodurans in complex with avilamycin 提交 2016-05-11 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 27 PDB 声明：29-meric
链 2 1–47（47 aa）
未记录 6NO Avilamycin × 1 MG MAGNESIUM ION × 446 MPD (4S)-2-METHYL-2,4-PENTANEDIOL × 5 SPD SPERMIDINE × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；293.15 K；Ribosome solution containing 0.0065 mM (180 A/ml) of D50S in 10 mM Hepes pH=7.8, 15 mM MgCl2 and 75 mM NH4Cl crystallization buffer was mixed with 10 mM spermidine, 1 % ethanol and 0.5 % 2-ethyl-1,3-hexanediol precipitants. A 0.005 ml crystallization drop was hanged over 10 % ethanol and 5% 2-ethyl-1,3-hexanediol in ddw reservoir.
分辨率 3.43 Å R-free 0.253
5JVH The crystal structure large ribosomal subunit (50S) of Deinococcus radiodurans in complex with evernimicin 提交 2016-05-11 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 26 PDB 声明：28-meric
链 2 1–47（47 aa）
未记录 6O1 Evernimicin × 1 MG MAGNESIUM ION × 123 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；293 K；Magnesium chloride, HEPES, ammonium chloride, ethanol, 2-ethyl-1,3-hexandiol
分辨率 3.58 Å R-free 0.247
7A0R 50S Deinococcus radiodurans ribosome bounded with mycinamicin I 提交 2020-08-10 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 26 PDB 声明：28-meric
链 2 1–47（47 aa）
未记录 QTZ mycinamicin II × 1 MG MAGNESIUM ION × 345 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293.15 K；Ribosome solution containing 0.0065 mM (180 A/ml) of D50S in 10 mM Hepes pH=7.8, 15 mM MgCl2 and 75 mM NH4Cl crystallization buffer was mixed with 10 mM spermidine, 1 % ethanol and 0.5 % 2-ethyl-1,3-hexanediol precipitants. A 0.005 ml crystallization drop was hanged over 10 % ethanol and 5% 2-ethyl-1,3-hexanediol in ddw reservoir.
分辨率 3.30 Å R-free 0.249
7A0S 50S Deinococcus radiodurans ribosome bounded with mycinamicin I 提交 2020-08-10 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 26 PDB 声明：28-meric
链 2 1–47（47 aa）
未记录 QU2 mycinamicin I × 1 MG MAGNESIUM ION × 367 SPD SPERMIDINE × 8 MPD (4S)-2-METHYL-2,4-PENTANEDIOL × 4 NA SODIUM ION × 1 EOH ETHANOL × 1 CA CALCIUM ION × 5 K POTASSIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293.15 K；Ribosome solution containing 0.0065 mM (180 A/ml) of D50S in 10 mM Hepes pH=7.8, 15 mM MgCl2 and 75 mM NH4Cl crystallization buffer was mixed with 10 mM spermidine, 1 % ethanol and 0.5 % 2-ethyl-1,3-hexanediol precipitants. A 0.005 ml crystallization drop was hanged over 10 % ethanol and 5% 2-ethyl-1,3-hexanediol in ddw reservoir.
分辨率 3.22 Å R-free 0.253
7A18 50S Deinococcus radiodurans ribosome bounded with mycinamicin IV 提交 2020-08-12 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 26 PDB 声明：28-meric
链 2 1–46（46 aa）
未记录 MIV MYCINAMICIN IV × 1 MG MAGNESIUM ION × 277 SPD SPERMIDINE × 7 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；293.15 K；Ribosome solution containing 0.0065 mM (180 A/ml) of D50S in 10 mM Hepes pH=7.8, 15 mM MgCl2 and 75 mM NH4Cl crystallization buffer was mixed with 10 mM spermidine, 1 % ethanol and 0.5 % 2-ethyl-1,3-hexanediol precipitants. A 0.005 ml crystallization drop was hanged over 10 % ethanol and 5% 2-ethyl-1,3-hexanediol in ddw reservoir.
分辨率 3.40 Å R-free 0.318

共 23 个其他 PDB 条目、23 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 RL34_DEIRA
Isoform —
PDB实体 2
链与序列区间 作者链 2； PDB构建体 1–47； UniProt 1–47

50S RIBOSOMAL PROTEIN L35

物种未注明

UniProt Q9RSW6

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白–RNA 异源复合物 蛋白 × 29 RNA 2 PDB 声明：31-meric（31） 与全部聚合物数一致 链 3； UniProt 1–66 未记录 50S RIBOSOMAL PROTEIN L33 × 1 （Q9RSS4） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L34 × 1 （Q9RSH2） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L36 × 1 （Q9RSK0） THIOSTREPTON × 1 （P0C8P8） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L2 × 1 （Q9RXJ9） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L3 × 1 （Q9RXK2） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L4 × 1 （Q9RXK1） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L5 × 1 （Q9RXJ0） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L6 × 1 （Q9RSL3） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L11 × 1 （Q9RSS7） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L13 × 1 （Q9RXY1） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L14 × 1 （Q9RXJ2） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L15 × 1 （Q9RSK9） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L16 × 1 （Q9RXJ5） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L17 × 1 （Q9RSJ5） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L18 × 1 （Q9RSL2） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L19 × 1 （Q9RWB4） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L20 × 1 （Q9RSW7） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L21 × 1 （Q9RY64） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L22 × 1 （Q9RXJ7） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L23 × 1 （Q9RXK0） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L24 × 1 （Q9RXJ1） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L25 × 1 （Q9RX88） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L27 × 1 （Q9RY65） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L28 × 1 （Q9RRG8） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L29 × 1 （Q9RXJ4） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L30 × 1 （Q9RSL0） RRNA-23S RIBOSOMAL RNA × 1 50S RIBOSOMAL PROTEIN L32 × 1 （P49228） RRNA-5S RIBOSOMAL RNA × 1 MG MAGNESIUM ION × 36 X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP 分辨率 3.30 Å R-free 0.318

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 3CF5 Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
1NKW Crystal Structure Of The Large Ribosomal Subunit From Deinococcus Radiodurans 提交 2003-01-05 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 29 PDB 声明：31-meric
链 3 1–63（63 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；ETHANOL, DIMETHYLHEXANEDIOL, MGCL2, KCL, HEPES, NH4CL, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP
分辨率 3.10 Å R-free 0.274
1NWX COMPLEX OF THE LARGE RIBOSOMAL SUBUNIT FROM DEINOCOCCUS RADIODURANS WITH ABT-773 提交 2003-02-07 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 29 PDB 声明：31-meric
链 3 2–66（65 aa）
未记录 773 CETHROMYCIN × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；281 K；ETHANOL, DIMETHYLHEXANEDIOL, MGCL2, KCL, HEPES, NH4CL, pH 7.80, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 281K
分辨率 3.50 Å R-free 0.313
1NWY COMPLEX OF THE LARGE RIBOSOMAL SUBUNIT FROM DEINOCOCCUS RADIODURANS WITH AZITHROMYCIN 提交 2003-02-07 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 29 PDB 声明：31-meric
链 3 2–66（65 aa）
未记录 ZIT AZITHROMYCIN × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；291 K；ETHANOL, DIMETHYLHEXANEDIOL, MGCL2, KCL, HEPES, NH4CL, pH 7.80, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K
分辨率 3.30 Å R-free 0.304
1SM1 COMPLEX OF THE LARGE RIBOSOMAL SUBUNIT FROM DEINOCOCCUS RADIODURANS WITH QUINUPRISTIN AND DALFOPRISTIN 提交 2004-03-08 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 30 PDB 声明：32-meric
链 3 1–66（66 aa）
未记录 DOL 5-(2-DIETHYLAMINO-ETHANESULFONYL)-21-HYDROXY-10-ISOPROPYL-11,19-DIMETHYL-9,26-DIOXA-3,15,28-TRIAZA-TRICYCLO[23.2.1.00,255]OCTACOSA-1(27),12,17,19,25(28)-PENTAENE-2,8,14,23-TETRAONE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 7.8；ETHANOL, DIMETHYLHEXANEDIOL, MGCL2, KCL, HEPES, NH4CL , PH 7.80, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, TEMPERATURE 290K
分辨率 3.42 Å R-free 0.348
1XBP Inhibition of peptide bond formation by pleuromutilins: The structure of the 50S ribosomal subunit from Deinococcus radiodurans in complex with Tiamulin 提交 2004-08-31 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 29 PDB 声明：31-meric
链 3 1–65（65 aa）
未记录 MUL TIAMULIN × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；280 K；ETHANOL, DIMETHYLHEXANEDIOL, MGCL2,KCL, HEPES, NH4CL, pH 7.80, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 280K
分辨率 3.50 Å R-free 0.360
2ZJP Thiopeptide antibiotic Nosiheptide bound to the large ribosomal subunit of Deinococcus radiodurans 提交 2008-03-07 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 29 PDB 声明：31-meric
链 3 1–66（66 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 NO1 4-(hydroxymethyl)-3-methyl-1H-indole-2-carboxylic acid × 1 MG MAGNESIUM ION × 35 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP
分辨率 3.70 Å R-free 0.340
2ZJQ Interaction of L7 with L11 induced by Microccocin binding to the Deinococcus radiodurans 50S subunit 提交 2008-03-08 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 29 PDB 声明：31-meric
链 3 1–66（66 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP
分辨率 3.30 Å R-free 0.339
2ZJR Refined native structure of the large ribosomal subunit (50S) from Deinococcus radiodurans 提交 2008-03-08 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 28 PDB 声明：30-meric
链 3 1–66（66 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 35 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP
分辨率 2.91 Å R-free 0.311
3DLL The oxazolidinone antibiotics perturb the ribosomal peptidyl-transferase center and effect tRNA positioning 提交 2008-06-27 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 28 PDB 声明：30-meric
链 3 1–66（66 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 35 ZLD N-{[(5S)-3-(3-fluoro-4-morpholin-4-ylphenyl)-2-oxo-1,3-oxazolidin-5-yl]methyl}acetamide × 1 ZN ZINC ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；10mM MgCl2, 60mM NH4Cl, 5mM KCl, 10mM HEPES, pH7.8, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP
分辨率 3.50 Å R-free 0.280
3PIO Crystal structure of the synergistic antibiotic pair lankamycin and lankacidin in complex with the large ribosomal subunit 提交 2010-11-07 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 28 PDB 声明：30-meric
链 3 1–66（66 aa）
未记录 LMA Lankamycin × 1 MG MAGNESIUM ION × 154 NA SODIUM ION × 42 K POTASSIUM ION × 15 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP. 15% 2:1 ethanol:methylpentanediol was diffused to a hanging drop of 180 AU/ml solution of D50S.
分辨率 3.25 Å R-free 0.294
3PIP Crystal structure of the synergistic antibiotic pair lankamycin and lankacidin in complex with the large ribosomal subunit 提交 2010-11-07 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 28 PDB 声明：30-meric
链 3 1–66（66 aa）
未记录 LC2 N-[(1S,2R,3E,5E,7S,9E,11E,13S,15R,19R)-7,13-dihydroxy-1,4,10,19-tetramethyl-17,18-dioxo-16-oxabicyclo[13.2.2]nonadeca-3,5,9,11-tetraen-2-yl]-2-oxopropanamide × 1 LMA Lankamycin × 1 MG MAGNESIUM ION × 73 K POTASSIUM ION × 4 NA SODIUM ION × 5 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP. 15% 2:1 ethanol:methylpentanediol was diffused to a hanging drop of 180 AU/ml solution of D50S.
分辨率 3.45 Å R-free 0.301
4IO9 Crystal structure of compound 4d bound to large ribosomal subunit (50S) from Deinococcus radiodurans 提交 2013-01-07 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 28 PDB 声明：30-meric
链 3 1–66（66 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 35 1F2 (3aS,4R,7R,8S,9S,10R,11R,13R,15R,15aR)-4-ethyl-11-methoxy-3a,7,9,11,13,15-hexamethyl-2,6,14-trioxo-10-{[3,4,6-trideoxy-3-(dimethylamino)-beta-D-xylo-hexopyranosyl]oxy}tetradecahydro-2H-oxacyclotetradecino[4,3-d][1,3]oxazol-8-yl (2R)-2-(pyridin-3-yl)pyrrolidine-1-carboxylate × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP
分辨率 3.20 Å R-free 0.235
4IOA Crystal structure of compound 4e bound to large ribosomal subunit (50S) from Deinococcus radiodurans 提交 2013-01-07 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 28 PDB 声明：30-meric
链 3 1–66（66 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 35 1F3 (3aS,4R,7R,8S,9S,10R,11R,13R,15R,15aR)-4-ethyl-11-methoxy-3a,7,9,11,13,15-hexamethyl-2,6,14-trioxo-10-{[3,4,6-trideoxy-3-(dimethylamino)-beta-D-xylo-hexopyranosyl]oxy}tetradecahydro-2H-oxacyclotetradecino[4,3-d][1,3]oxazol-8-yl (2R)-2-[4-(acetylamino)phenyl]-2,3-dihydro-1H-pyrrole-1-carboxylate × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP
分辨率 3.20 Å R-free 0.230
4IOC Crystal structure of compound 4f bound to large ribosomal subunit (50S) from Deinococcus radiodurans 提交 2013-01-07 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 28 PDB 声明：30-meric
链 3 1–66（66 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 35 1F4 (3aS,4R,7R,8S,9S,10R,11R,13R,15S,15aR)-4-ethyl-11-methoxy-3a,7,9,11,13,15-hexamethyl-2,6,14-trioxo-10-{[3,4,6-trideoxy-3-(dimethylamino)-beta-D-xylo-hexopyranosyl]oxy}tetradecahydro-2H-oxacyclotetradecino[4,3-d][1,3]oxazol-8-yl (2R)-4,4-dimethyl-2-(pyridin-3-yl)pyrrolidine-1-carboxylate × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP
分辨率 3.60 Å R-free 0.239
4U67 Crystal structure of the large ribosomal subunit (50S) of Deinococcus radiodurans containing a three residue insertion in L22 提交 2014-07-28 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 26 PDB 声明：28-meric
链 3 1–66（66 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 51 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；293 K；Magnesium chloride, HEPES, ammonium chloride, ethanol, 2-ethyl-1,3-hexandiol
分辨率 3.65 Å R-free 0.270
4WFN Crystal structure of the large ribosomal subunit (50S) of Deinococcus radiodurans containing a three residue insertion in L22 in complex with erythromycin 提交 2014-09-16 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 26 PDB 声明：28-meric
链 3 1–65（65 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 70 ERY ERYTHROMYCIN A × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；293 K；Magnesuim chloride, Hepes, ammonium chloride, ethanol, 2-ethyl-1,3-hexadiol
分辨率 3.54 Å R-free 0.282
5DM6 Crystal structure of the 50S ribosomal subunit from Deinococcus radiodurans 提交 2015-09-08 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 28 PDB 声明：30-meric
链 3 2–66（65 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 198 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；292 K；HEPES, sodium hydroxide, magnesium chloride, ammonium chloride, 2-mercaptoethanol, spermidine, 2-ethyl-1, 3-hexanediol, ethanol
分辨率 2.90 Å R-free 0.270
5DM7 Crystal structure of the 50S ribosomal subunit from Deinococcus radiodurans in complex with hygromycin A 提交 2015-09-08 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 28 PDB 声明：30-meric
链 3 2–66（65 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 186 HGR Hygromycin A × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；292 K；HEPES, sodium hydroxide, magnesium chloride, ammonium chloride, 2-mercaptoethanol, spermidine, 2-ethyl-1,3-hexanediol, ethanol
分辨率 3.00 Å R-free 0.326
5JVG The large ribosomal subunit from Deinococcus radiodurans in complex with avilamycin 提交 2016-05-11 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 27 PDB 声明：29-meric
链 3 1–66（66 aa）
未记录 6NO Avilamycin × 1 MG MAGNESIUM ION × 446 MPD (4S)-2-METHYL-2,4-PENTANEDIOL × 5 SPD SPERMIDINE × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；293.15 K；Ribosome solution containing 0.0065 mM (180 A/ml) of D50S in 10 mM Hepes pH=7.8, 15 mM MgCl2 and 75 mM NH4Cl crystallization buffer was mixed with 10 mM spermidine, 1 % ethanol and 0.5 % 2-ethyl-1,3-hexanediol precipitants. A 0.005 ml crystallization drop was hanged over 10 % ethanol and 5% 2-ethyl-1,3-hexanediol in ddw reservoir.
分辨率 3.43 Å R-free 0.253
5JVH The crystal structure large ribosomal subunit (50S) of Deinococcus radiodurans in complex with evernimicin 提交 2016-05-11 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 26 PDB 声明：28-meric
链 3 1–66（66 aa）
未记录 6O1 Evernimicin × 1 MG MAGNESIUM ION × 123 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；293 K；Magnesium chloride, HEPES, ammonium chloride, ethanol, 2-ethyl-1,3-hexandiol
分辨率 3.58 Å R-free 0.247
7A0R 50S Deinococcus radiodurans ribosome bounded with mycinamicin I 提交 2020-08-10 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 26 PDB 声明：28-meric
链 3 2–64（63 aa）
未记录 QTZ mycinamicin II × 1 MG MAGNESIUM ION × 345 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293.15 K；Ribosome solution containing 0.0065 mM (180 A/ml) of D50S in 10 mM Hepes pH=7.8, 15 mM MgCl2 and 75 mM NH4Cl crystallization buffer was mixed with 10 mM spermidine, 1 % ethanol and 0.5 % 2-ethyl-1,3-hexanediol precipitants. A 0.005 ml crystallization drop was hanged over 10 % ethanol and 5% 2-ethyl-1,3-hexanediol in ddw reservoir.
分辨率 3.30 Å R-free 0.249
7A0S 50S Deinococcus radiodurans ribosome bounded with mycinamicin I 提交 2020-08-10 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 26 PDB 声明：28-meric
链 3 2–64（63 aa）
未记录 QU2 mycinamicin I × 1 MG MAGNESIUM ION × 367 SPD SPERMIDINE × 8 MPD (4S)-2-METHYL-2,4-PENTANEDIOL × 4 NA SODIUM ION × 1 EOH ETHANOL × 1 CA CALCIUM ION × 5 K POTASSIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293.15 K；Ribosome solution containing 0.0065 mM (180 A/ml) of D50S in 10 mM Hepes pH=7.8, 15 mM MgCl2 and 75 mM NH4Cl crystallization buffer was mixed with 10 mM spermidine, 1 % ethanol and 0.5 % 2-ethyl-1,3-hexanediol precipitants. A 0.005 ml crystallization drop was hanged over 10 % ethanol and 5% 2-ethyl-1,3-hexanediol in ddw reservoir.
分辨率 3.22 Å R-free 0.253
7A18 50S Deinococcus radiodurans ribosome bounded with mycinamicin IV 提交 2020-08-12 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 26 PDB 声明：28-meric
链 3 2–64（63 aa）
未记录 MIV MYCINAMICIN IV × 1 MG MAGNESIUM ION × 277 SPD SPERMIDINE × 7 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；293.15 K；Ribosome solution containing 0.0065 mM (180 A/ml) of D50S in 10 mM Hepes pH=7.8, 15 mM MgCl2 and 75 mM NH4Cl crystallization buffer was mixed with 10 mM spermidine, 1 % ethanol and 0.5 % 2-ethyl-1,3-hexanediol precipitants. A 0.005 ml crystallization drop was hanged over 10 % ethanol and 5% 2-ethyl-1,3-hexanediol in ddw reservoir.
分辨率 3.40 Å R-free 0.318

共 23 个其他 PDB 条目、23 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

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UniProt名称 RL35_DEIRA
Isoform —
PDB实体 3
链与序列区间 作者链 3； PDB构建体 1–66； UniProt 1–66

50S RIBOSOMAL PROTEIN L36

物种未注明

UniProt Q9RSK0

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白–RNA 异源复合物 蛋白 × 29 RNA 2 PDB 声明：31-meric（31） 与全部聚合物数一致 链 4； UniProt 1–37 未记录 50S RIBOSOMAL PROTEIN L33 × 1 （Q9RSS4） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L34 × 1 （Q9RSH2） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L35 × 1 （Q9RSW6） THIOSTREPTON × 1 （P0C8P8） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L2 × 1 （Q9RXJ9） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L3 × 1 （Q9RXK2） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L4 × 1 （Q9RXK1） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L5 × 1 （Q9RXJ0） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L6 × 1 （Q9RSL3） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L11 × 1 （Q9RSS7） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L13 × 1 （Q9RXY1） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L14 × 1 （Q9RXJ2） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L15 × 1 （Q9RSK9） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L16 × 1 （Q9RXJ5） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L17 × 1 （Q9RSJ5） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L18 × 1 （Q9RSL2） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L19 × 1 （Q9RWB4） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L20 × 1 （Q9RSW7） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L21 × 1 （Q9RY64） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L22 × 1 （Q9RXJ7） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L23 × 1 （Q9RXK0） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L24 × 1 （Q9RXJ1） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L25 × 1 （Q9RX88） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L27 × 1 （Q9RY65） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L28 × 1 （Q9RRG8） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L29 × 1 （Q9RXJ4） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L30 × 1 （Q9RSL0） RRNA-23S RIBOSOMAL RNA × 1 50S RIBOSOMAL PROTEIN L32 × 1 （P49228） RRNA-5S RIBOSOMAL RNA × 1 MG MAGNESIUM ION × 36 X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP 分辨率 3.30 Å R-free 0.318

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 3CF5 Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
1NKW Crystal Structure Of The Large Ribosomal Subunit From Deinococcus Radiodurans 提交 2003-01-05 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 29 PDB 声明：31-meric
链 4 1–36（36 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；ETHANOL, DIMETHYLHEXANEDIOL, MGCL2, KCL, HEPES, NH4CL, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP
分辨率 3.10 Å R-free 0.274
1NWX COMPLEX OF THE LARGE RIBOSOMAL SUBUNIT FROM DEINOCOCCUS RADIODURANS WITH ABT-773 提交 2003-02-07 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 29 PDB 声明：31-meric
链 4 1–37（37 aa）
未记录 773 CETHROMYCIN × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；281 K；ETHANOL, DIMETHYLHEXANEDIOL, MGCL2, KCL, HEPES, NH4CL, pH 7.80, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 281K
分辨率 3.50 Å R-free 0.313
1NWY COMPLEX OF THE LARGE RIBOSOMAL SUBUNIT FROM DEINOCOCCUS RADIODURANS WITH AZITHROMYCIN 提交 2003-02-07 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 29 PDB 声明：31-meric
链 4 1–37（37 aa）
未记录 ZIT AZITHROMYCIN × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；291 K；ETHANOL, DIMETHYLHEXANEDIOL, MGCL2, KCL, HEPES, NH4CL, pH 7.80, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K
分辨率 3.30 Å R-free 0.304
1SM1 COMPLEX OF THE LARGE RIBOSOMAL SUBUNIT FROM DEINOCOCCUS RADIODURANS WITH QUINUPRISTIN AND DALFOPRISTIN 提交 2004-03-08 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 30 PDB 声明：32-meric
链 4 1–37（37 aa）
未记录 DOL 5-(2-DIETHYLAMINO-ETHANESULFONYL)-21-HYDROXY-10-ISOPROPYL-11,19-DIMETHYL-9,26-DIOXA-3,15,28-TRIAZA-TRICYCLO[23.2.1.00,255]OCTACOSA-1(27),12,17,19,25(28)-PENTAENE-2,8,14,23-TETRAONE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 7.8；ETHANOL, DIMETHYLHEXANEDIOL, MGCL2, KCL, HEPES, NH4CL , PH 7.80, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, TEMPERATURE 290K
分辨率 3.42 Å R-free 0.348
1XBP Inhibition of peptide bond formation by pleuromutilins: The structure of the 50S ribosomal subunit from Deinococcus radiodurans in complex with Tiamulin 提交 2004-08-31 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 29 PDB 声明：31-meric
链 4 1–37（37 aa）
未记录 MUL TIAMULIN × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；280 K；ETHANOL, DIMETHYLHEXANEDIOL, MGCL2,KCL, HEPES, NH4CL, pH 7.80, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 280K
分辨率 3.50 Å R-free 0.360
2ZJP Thiopeptide antibiotic Nosiheptide bound to the large ribosomal subunit of Deinococcus radiodurans 提交 2008-03-07 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 29 PDB 声明：31-meric
链 4 1–37（37 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 NO1 4-(hydroxymethyl)-3-methyl-1H-indole-2-carboxylic acid × 1 MG MAGNESIUM ION × 35 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP
分辨率 3.70 Å R-free 0.340
2ZJQ Interaction of L7 with L11 induced by Microccocin binding to the Deinococcus radiodurans 50S subunit 提交 2008-03-08 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 29 PDB 声明：31-meric
链 4 1–37（37 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP
分辨率 3.30 Å R-free 0.339
2ZJR Refined native structure of the large ribosomal subunit (50S) from Deinococcus radiodurans 提交 2008-03-08 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 28 PDB 声明：30-meric
链 4 1–37（37 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 35 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP
分辨率 2.91 Å R-free 0.311
3DLL The oxazolidinone antibiotics perturb the ribosomal peptidyl-transferase center and effect tRNA positioning 提交 2008-06-27 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 28 PDB 声明：30-meric
链 4 1–37（37 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 35 ZLD N-{[(5S)-3-(3-fluoro-4-morpholin-4-ylphenyl)-2-oxo-1,3-oxazolidin-5-yl]methyl}acetamide × 1 ZN ZINC ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；10mM MgCl2, 60mM NH4Cl, 5mM KCl, 10mM HEPES, pH7.8, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP
分辨率 3.50 Å R-free 0.280
3PIO Crystal structure of the synergistic antibiotic pair lankamycin and lankacidin in complex with the large ribosomal subunit 提交 2010-11-07 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 28 PDB 声明：30-meric
链 4 1–37（37 aa）
未记录 LMA Lankamycin × 1 MG MAGNESIUM ION × 154 NA SODIUM ION × 42 K POTASSIUM ION × 15 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP. 15% 2:1 ethanol:methylpentanediol was diffused to a hanging drop of 180 AU/ml solution of D50S.
分辨率 3.25 Å R-free 0.294
3PIP Crystal structure of the synergistic antibiotic pair lankamycin and lankacidin in complex with the large ribosomal subunit 提交 2010-11-07 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 28 PDB 声明：30-meric
链 4 1–37（37 aa）
未记录 LC2 N-[(1S,2R,3E,5E,7S,9E,11E,13S,15R,19R)-7,13-dihydroxy-1,4,10,19-tetramethyl-17,18-dioxo-16-oxabicyclo[13.2.2]nonadeca-3,5,9,11-tetraen-2-yl]-2-oxopropanamide × 1 LMA Lankamycin × 1 MG MAGNESIUM ION × 73 K POTASSIUM ION × 4 NA SODIUM ION × 5 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP. 15% 2:1 ethanol:methylpentanediol was diffused to a hanging drop of 180 AU/ml solution of D50S.
分辨率 3.45 Å R-free 0.301
4IO9 Crystal structure of compound 4d bound to large ribosomal subunit (50S) from Deinococcus radiodurans 提交 2013-01-07 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 28 PDB 声明：30-meric
链 4 1–37（37 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 35 1F2 (3aS,4R,7R,8S,9S,10R,11R,13R,15R,15aR)-4-ethyl-11-methoxy-3a,7,9,11,13,15-hexamethyl-2,6,14-trioxo-10-{[3,4,6-trideoxy-3-(dimethylamino)-beta-D-xylo-hexopyranosyl]oxy}tetradecahydro-2H-oxacyclotetradecino[4,3-d][1,3]oxazol-8-yl (2R)-2-(pyridin-3-yl)pyrrolidine-1-carboxylate × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP
分辨率 3.20 Å R-free 0.235
4IOA Crystal structure of compound 4e bound to large ribosomal subunit (50S) from Deinococcus radiodurans 提交 2013-01-07 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 28 PDB 声明：30-meric
链 4 1–37（37 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 35 1F3 (3aS,4R,7R,8S,9S,10R,11R,13R,15R,15aR)-4-ethyl-11-methoxy-3a,7,9,11,13,15-hexamethyl-2,6,14-trioxo-10-{[3,4,6-trideoxy-3-(dimethylamino)-beta-D-xylo-hexopyranosyl]oxy}tetradecahydro-2H-oxacyclotetradecino[4,3-d][1,3]oxazol-8-yl (2R)-2-[4-(acetylamino)phenyl]-2,3-dihydro-1H-pyrrole-1-carboxylate × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP
分辨率 3.20 Å R-free 0.230
4IOC Crystal structure of compound 4f bound to large ribosomal subunit (50S) from Deinococcus radiodurans 提交 2013-01-07 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 28 PDB 声明：30-meric
链 4 1–37（37 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 35 1F4 (3aS,4R,7R,8S,9S,10R,11R,13R,15S,15aR)-4-ethyl-11-methoxy-3a,7,9,11,13,15-hexamethyl-2,6,14-trioxo-10-{[3,4,6-trideoxy-3-(dimethylamino)-beta-D-xylo-hexopyranosyl]oxy}tetradecahydro-2H-oxacyclotetradecino[4,3-d][1,3]oxazol-8-yl (2R)-4,4-dimethyl-2-(pyridin-3-yl)pyrrolidine-1-carboxylate × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP
分辨率 3.60 Å R-free 0.239

共 14 个其他 PDB 条目、14 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 RL36_DEIRA
Isoform —
PDB实体 4
链与序列区间 作者链 4； PDB构建体 1–37； UniProt 1–37

THIOSTREPTON

物种未注明

UniProt P0C8P8

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白–RNA 异源复合物 蛋白 × 29 RNA 2 PDB 声明：31-meric（31） 与全部聚合物数一致 链 5； UniProt 1–17 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L33 × 1 （Q9RSS4） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L34 × 1 （Q9RSH2） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L35 × 1 （Q9RSW6） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L36 × 1 （Q9RSK0） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L2 × 1 （Q9RXJ9） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L3 × 1 （Q9RXK2） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L4 × 1 （Q9RXK1） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L5 × 1 （Q9RXJ0） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L6 × 1 （Q9RSL3） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L11 × 1 （Q9RSS7） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L13 × 1 （Q9RXY1） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L14 × 1 （Q9RXJ2） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L15 × 1 （Q9RSK9） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L16 × 1 （Q9RXJ5） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L17 × 1 （Q9RSJ5） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L18 × 1 （Q9RSL2） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L19 × 1 （Q9RWB4） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L20 × 1 （Q9RSW7） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L21 × 1 （Q9RY64） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L22 × 1 （Q9RXJ7） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L23 × 1 （Q9RXK0） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L24 × 1 （Q9RXJ1） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L25 × 1 （Q9RX88） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L27 × 1 （Q9RY65） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L28 × 1 （Q9RRG8） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L29 × 1 （Q9RXJ4） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L30 × 1 （Q9RSL0） RRNA-23S RIBOSOMAL RNA × 1 50S RIBOSOMAL PROTEIN L32 × 1 （P49228） RRNA-5S RIBOSOMAL RNA × 1 MG MAGNESIUM ION × 36 X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP 分辨率 3.30 Å R-free 0.318

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 3CF5 Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
1E9W Structure of the macrocycle thiostrepton solved using the anomalous dispersive contribution from sulfur 提交 2000-10-27 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–17（17 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 7；1ML 15.38MG/ML THIOSTREPTON IN CHLOROFORM_ISOAMYL ALCOHOL + 100 MICROL GLYCEROL + 200 MICROL ETHANOL. BATCH METHOD, pH 7.00
分辨率 1.02 Å R-free 0.142
1OLN Model for thiostrepton antibiotic binding to L11 substrate from 50S ribosomal RNA 提交 2003-08-08 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：trimeric
链 B 1–17（17 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 未记录非水小分子 实验方法未声明
NMR测量条件 pH 6.2；303 K；离子强度（mmCIF原始值）100 MM NACL, 5 MM MGCL2；压力 1
分辨率未提供
2JQ7 Model for thiostrepton binding to the ribosomal L11-RNA 提交 2007-05-30 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：trimeric
链 C 1–17（17 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 未记录非水小分子 SOLUTION NMR
NMR测量条件 pH 6.1；298 K；离子强度（mmCIF原始值）220；压力 1
NMR样品组成 0.3 MM [U-13C, U-15N U-2H] RIBOSOMAL PROTEIN L11, 0.3 MM RIBOSOMAL RNA, 0.3 MM THIOSTREPTON ANTIBIOTIC, 20 MM POTASSIUM PHOSPHATE, 200 MM POTASSIUM CHLORIDE, 95% H2O/5% D2O | 95% H2O/5% D2O
分辨率未提供
2L2W Thiostrepton 提交 2010-08-27 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–17（17 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 未记录非水小分子 SOLUTION NMR
NMR测量条件 298 K；压力 ambient
NMR样品组成 10 mM thiostrepton, chloroform-d/ethanol-d5 5:1 | chloroform-d/ethanol-d5 5:1
分辨率未提供
2L2X Thiostrepton, oxidized at CA-CB bond of residue 9 提交 2010-08-27 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–16（16 aa） 片段：residues 1-16
突变：(DCY)9(BB9) 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 未记录非水小分子 SOLUTION NMR
NMR测量条件 298 K；压力 ambient
NMR样品组成 10 mM thiostrepton (BB9, 9), chloroform-d/ethanol-d5 5:1 | chloroform-d/ethanol-d5 5:1
分辨率未提供
2L2Y Thiostrepton, epimer form of residue 9 提交 2010-08-27 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–16（16 aa） 片段：residues 1-16
突变：(DCY)9C 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 未记录非水小分子 SOLUTION NMR
NMR测量条件 298 K；压力 ambient
NMR样品组成 10 mM thiostrepton (epi,9), chloroform-d/ethanol-d5 5:1 | chloroform-d/ethanol-d5 5:1
分辨率未提供
2L2Z Thiostrepton, reduced at N-CA bond of residue 14 提交 2010-08-27 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–17（17 aa）
突变：(MH6)14(DSN) 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 未记录非水小分子 SOLUTION NMR
NMR测量条件 298 K；压力 ambient
NMR样品组成 10 mM thiostrepton (DSN 14), chloroform-d/ethanol-d5 5:1 | chloroform-d/ethanol-d5 5:1
分辨率未提供
4HP2 Invariom refinement of a new dimeric monoclinic 2 solvate of thiostrepton at 0.64 angstrom resolution 提交 2012-10-23 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 56–72（17 aa） 片段：UNP RESIDUES 56-72
链 B 56–72（17 aa） 片段：UNP RESIDUES 56-72
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） DMF DIMETHYLFORMAMIDE × 8 ETZ diethyl ether × 6 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 7；DIMETHYLFORMAMID, DIETHYLETHER, pH 7.00, VAPOR DIFFUSION
分辨率 0.64 Å
5D8H CRYSTAL STRUCTURE OF THE BASE OF THE RIBOSOMAL P STALK FROM METHANOCOCCUS JANNASCHII WITH ANTIBIOTIC THIOSTREPTON 提交 2015-08-17 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：tetrameric
链 D 0–18（19 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） MG MAGNESIUM ION × 11 NA SODIUM ION × 4 TRS 2-AMINO-2-HYDROXYMETHYL-PROPANE-1,3-DIOL × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；295 K；0.1 mM Tris-HCl, pH 7.5, 10% PEG 8000, 20% glycerol, 1 mM TCEP (tris(2-carboxyethyl)phosphine), 0.125 mM CTAB
分辨率 2.80 Å R-free 0.245

共 9 个其他 PDB 条目、9 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 THCL_STRAJ
Isoform —
PDB实体 5
链与序列区间 作者链 5； PDB构建体 2–18； UniProt 1–17

50S RIBOSOMAL PROTEIN L2

物种未注明

UniProt Q9RXJ9

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白–RNA 异源复合物 蛋白 × 29 RNA 2 PDB 声明：31-meric（31） 与全部聚合物数一致 链 A； UniProt 2–275 未记录 50S RIBOSOMAL PROTEIN L33 × 1 （Q9RSS4） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L34 × 1 （Q9RSH2） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L35 × 1 （Q9RSW6） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L36 × 1 （Q9RSK0） THIOSTREPTON × 1 （P0C8P8） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L3 × 1 （Q9RXK2） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L4 × 1 （Q9RXK1） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L5 × 1 （Q9RXJ0） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L6 × 1 （Q9RSL3） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L11 × 1 （Q9RSS7） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L13 × 1 （Q9RXY1） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L14 × 1 （Q9RXJ2） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L15 × 1 （Q9RSK9） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L16 × 1 （Q9RXJ5） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L17 × 1 （Q9RSJ5） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L18 × 1 （Q9RSL2） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L19 × 1 （Q9RWB4） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L20 × 1 （Q9RSW7） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L21 × 1 （Q9RY64） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L22 × 1 （Q9RXJ7） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L23 × 1 （Q9RXK0） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L24 × 1 （Q9RXJ1） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L25 × 1 （Q9RX88） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L27 × 1 （Q9RY65） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L28 × 1 （Q9RRG8） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L29 × 1 （Q9RXJ4） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L30 × 1 （Q9RSL0） RRNA-23S RIBOSOMAL RNA × 1 50S RIBOSOMAL PROTEIN L32 × 1 （P49228） RRNA-5S RIBOSOMAL RNA × 1 MG MAGNESIUM ION × 36 X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP 分辨率 3.30 Å R-free 0.318

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 3CF5 Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
1NKW Crystal Structure Of The Large Ribosomal Subunit From Deinococcus Radiodurans 提交 2003-01-05 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 29 PDB 声明：31-meric
链 A 1–274（274 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；ETHANOL, DIMETHYLHEXANEDIOL, MGCL2, KCL, HEPES, NH4CL, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP
分辨率 3.10 Å R-free 0.274
1NWX COMPLEX OF THE LARGE RIBOSOMAL SUBUNIT FROM DEINOCOCCUS RADIODURANS WITH ABT-773 提交 2003-02-07 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 29 PDB 声明：31-meric
链 A 2–275（274 aa）
未记录 773 CETHROMYCIN × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；281 K；ETHANOL, DIMETHYLHEXANEDIOL, MGCL2, KCL, HEPES, NH4CL, pH 7.80, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 281K
分辨率 3.50 Å R-free 0.313
1NWY COMPLEX OF THE LARGE RIBOSOMAL SUBUNIT FROM DEINOCOCCUS RADIODURANS WITH AZITHROMYCIN 提交 2003-02-07 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 29 PDB 声明：31-meric
链 A 2–275（274 aa）
未记录 ZIT AZITHROMYCIN × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；291 K；ETHANOL, DIMETHYLHEXANEDIOL, MGCL2, KCL, HEPES, NH4CL, pH 7.80, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K
分辨率 3.30 Å R-free 0.304
1SM1 COMPLEX OF THE LARGE RIBOSOMAL SUBUNIT FROM DEINOCOCCUS RADIODURANS WITH QUINUPRISTIN AND DALFOPRISTIN 提交 2004-03-08 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 30 PDB 声明：32-meric
链 A 1–275（275 aa）
未记录 DOL 5-(2-DIETHYLAMINO-ETHANESULFONYL)-21-HYDROXY-10-ISOPROPYL-11,19-DIMETHYL-9,26-DIOXA-3,15,28-TRIAZA-TRICYCLO[23.2.1.00,255]OCTACOSA-1(27),12,17,19,25(28)-PENTAENE-2,8,14,23-TETRAONE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 7.8；ETHANOL, DIMETHYLHEXANEDIOL, MGCL2, KCL, HEPES, NH4CL , PH 7.80, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, TEMPERATURE 290K
分辨率 3.42 Å R-free 0.348
1XBP Inhibition of peptide bond formation by pleuromutilins: The structure of the 50S ribosomal subunit from Deinococcus radiodurans in complex with Tiamulin 提交 2004-08-31 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 29 PDB 声明：31-meric
链 A 1–274（274 aa）
未记录 MUL TIAMULIN × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；280 K；ETHANOL, DIMETHYLHEXANEDIOL, MGCL2,KCL, HEPES, NH4CL, pH 7.80, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 280K
分辨率 3.50 Å R-free 0.360
2ZJP Thiopeptide antibiotic Nosiheptide bound to the large ribosomal subunit of Deinococcus radiodurans 提交 2008-03-07 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 29 PDB 声明：31-meric
链 A 2–275（274 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 NO1 4-(hydroxymethyl)-3-methyl-1H-indole-2-carboxylic acid × 1 MG MAGNESIUM ION × 35 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP
分辨率 3.70 Å R-free 0.340
2ZJQ Interaction of L7 with L11 induced by Microccocin binding to the Deinococcus radiodurans 50S subunit 提交 2008-03-08 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 29 PDB 声明：31-meric
链 A 2–275（274 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP
分辨率 3.30 Å R-free 0.339
2ZJR Refined native structure of the large ribosomal subunit (50S) from Deinococcus radiodurans 提交 2008-03-08 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 28 PDB 声明：30-meric
链 A 2–275（274 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 35 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP
分辨率 2.91 Å R-free 0.311
3DLL The oxazolidinone antibiotics perturb the ribosomal peptidyl-transferase center and effect tRNA positioning 提交 2008-06-27 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 28 PDB 声明：30-meric
链 A 2–275（274 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 35 ZLD N-{[(5S)-3-(3-fluoro-4-morpholin-4-ylphenyl)-2-oxo-1,3-oxazolidin-5-yl]methyl}acetamide × 1 ZN ZINC ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；10mM MgCl2, 60mM NH4Cl, 5mM KCl, 10mM HEPES, pH7.8, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP
分辨率 3.50 Å R-free 0.280
3PIO Crystal structure of the synergistic antibiotic pair lankamycin and lankacidin in complex with the large ribosomal subunit 提交 2010-11-07 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 28 PDB 声明：30-meric
链 A 2–275（274 aa）
未记录 LMA Lankamycin × 1 MG MAGNESIUM ION × 154 NA SODIUM ION × 42 K POTASSIUM ION × 15 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP. 15% 2:1 ethanol:methylpentanediol was diffused to a hanging drop of 180 AU/ml solution of D50S.
分辨率 3.25 Å R-free 0.294
3PIP Crystal structure of the synergistic antibiotic pair lankamycin and lankacidin in complex with the large ribosomal subunit 提交 2010-11-07 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 28 PDB 声明：30-meric
链 A 2–275（274 aa）
未记录 LC2 N-[(1S,2R,3E,5E,7S,9E,11E,13S,15R,19R)-7,13-dihydroxy-1,4,10,19-tetramethyl-17,18-dioxo-16-oxabicyclo[13.2.2]nonadeca-3,5,9,11-tetraen-2-yl]-2-oxopropanamide × 1 LMA Lankamycin × 1 MG MAGNESIUM ION × 73 K POTASSIUM ION × 4 NA SODIUM ION × 5 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP. 15% 2:1 ethanol:methylpentanediol was diffused to a hanging drop of 180 AU/ml solution of D50S.
分辨率 3.45 Å R-free 0.301
4IO9 Crystal structure of compound 4d bound to large ribosomal subunit (50S) from Deinococcus radiodurans 提交 2013-01-07 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 28 PDB 声明：30-meric
链 A 2–275（274 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 35 1F2 (3aS,4R,7R,8S,9S,10R,11R,13R,15R,15aR)-4-ethyl-11-methoxy-3a,7,9,11,13,15-hexamethyl-2,6,14-trioxo-10-{[3,4,6-trideoxy-3-(dimethylamino)-beta-D-xylo-hexopyranosyl]oxy}tetradecahydro-2H-oxacyclotetradecino[4,3-d][1,3]oxazol-8-yl (2R)-2-(pyridin-3-yl)pyrrolidine-1-carboxylate × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP
分辨率 3.20 Å R-free 0.235
4IOA Crystal structure of compound 4e bound to large ribosomal subunit (50S) from Deinococcus radiodurans 提交 2013-01-07 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 28 PDB 声明：30-meric
链 A 2–275（274 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 35 1F3 (3aS,4R,7R,8S,9S,10R,11R,13R,15R,15aR)-4-ethyl-11-methoxy-3a,7,9,11,13,15-hexamethyl-2,6,14-trioxo-10-{[3,4,6-trideoxy-3-(dimethylamino)-beta-D-xylo-hexopyranosyl]oxy}tetradecahydro-2H-oxacyclotetradecino[4,3-d][1,3]oxazol-8-yl (2R)-2-[4-(acetylamino)phenyl]-2,3-dihydro-1H-pyrrole-1-carboxylate × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP
分辨率 3.20 Å R-free 0.230
4IOC Crystal structure of compound 4f bound to large ribosomal subunit (50S) from Deinococcus radiodurans 提交 2013-01-07 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 28 PDB 声明：30-meric
链 A 2–275（274 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 35 1F4 (3aS,4R,7R,8S,9S,10R,11R,13R,15S,15aR)-4-ethyl-11-methoxy-3a,7,9,11,13,15-hexamethyl-2,6,14-trioxo-10-{[3,4,6-trideoxy-3-(dimethylamino)-beta-D-xylo-hexopyranosyl]oxy}tetradecahydro-2H-oxacyclotetradecino[4,3-d][1,3]oxazol-8-yl (2R)-4,4-dimethyl-2-(pyridin-3-yl)pyrrolidine-1-carboxylate × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP
分辨率 3.60 Å R-free 0.239
4U67 Crystal structure of the large ribosomal subunit (50S) of Deinococcus radiodurans containing a three residue insertion in L22 提交 2014-07-28 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 26 PDB 声明：28-meric
链 A 1–275（275 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 51 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；293 K；Magnesium chloride, HEPES, ammonium chloride, ethanol, 2-ethyl-1,3-hexandiol
分辨率 3.65 Å R-free 0.270
4WFN Crystal structure of the large ribosomal subunit (50S) of Deinococcus radiodurans containing a three residue insertion in L22 in complex with erythromycin 提交 2014-09-16 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 26 PDB 声明：28-meric
链 A 1–275（275 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 70 ERY ERYTHROMYCIN A × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；293 K；Magnesuim chloride, Hepes, ammonium chloride, ethanol, 2-ethyl-1,3-hexadiol
分辨率 3.54 Å R-free 0.282
5DM6 Crystal structure of the 50S ribosomal subunit from Deinococcus radiodurans 提交 2015-09-08 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 28 PDB 声明：30-meric
链 A 2–275（274 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 198 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；292 K；HEPES, sodium hydroxide, magnesium chloride, ammonium chloride, 2-mercaptoethanol, spermidine, 2-ethyl-1, 3-hexanediol, ethanol
分辨率 2.90 Å R-free 0.270
5DM7 Crystal structure of the 50S ribosomal subunit from Deinococcus radiodurans in complex with hygromycin A 提交 2015-09-08 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 28 PDB 声明：30-meric
链 A 2–275（274 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 186 HGR Hygromycin A × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；292 K；HEPES, sodium hydroxide, magnesium chloride, ammonium chloride, 2-mercaptoethanol, spermidine, 2-ethyl-1,3-hexanediol, ethanol
分辨率 3.00 Å R-free 0.326
5JVG The large ribosomal subunit from Deinococcus radiodurans in complex with avilamycin 提交 2016-05-11 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 27 PDB 声明：29-meric
链 A 1–275（275 aa）
未记录 6NO Avilamycin × 1 MG MAGNESIUM ION × 446 MPD (4S)-2-METHYL-2,4-PENTANEDIOL × 5 SPD SPERMIDINE × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；293.15 K；Ribosome solution containing 0.0065 mM (180 A/ml) of D50S in 10 mM Hepes pH=7.8, 15 mM MgCl2 and 75 mM NH4Cl crystallization buffer was mixed with 10 mM spermidine, 1 % ethanol and 0.5 % 2-ethyl-1,3-hexanediol precipitants. A 0.005 ml crystallization drop was hanged over 10 % ethanol and 5% 2-ethyl-1,3-hexanediol in ddw reservoir.
分辨率 3.43 Å R-free 0.253
5JVH The crystal structure large ribosomal subunit (50S) of Deinococcus radiodurans in complex with evernimicin 提交 2016-05-11 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 26 PDB 声明：28-meric
链 A 1–275（275 aa）
未记录 6O1 Evernimicin × 1 MG MAGNESIUM ION × 123 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；293 K；Magnesium chloride, HEPES, ammonium chloride, ethanol, 2-ethyl-1,3-hexandiol
分辨率 3.58 Å R-free 0.247
7A0R 50S Deinococcus radiodurans ribosome bounded with mycinamicin I 提交 2020-08-10 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 26 PDB 声明：28-meric
链 A 2–272（271 aa）
未记录 QTZ mycinamicin II × 1 MG MAGNESIUM ION × 345 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293.15 K；Ribosome solution containing 0.0065 mM (180 A/ml) of D50S in 10 mM Hepes pH=7.8, 15 mM MgCl2 and 75 mM NH4Cl crystallization buffer was mixed with 10 mM spermidine, 1 % ethanol and 0.5 % 2-ethyl-1,3-hexanediol precipitants. A 0.005 ml crystallization drop was hanged over 10 % ethanol and 5% 2-ethyl-1,3-hexanediol in ddw reservoir.
分辨率 3.30 Å R-free 0.249
7A0S 50S Deinococcus radiodurans ribosome bounded with mycinamicin I 提交 2020-08-10 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 26 PDB 声明：28-meric
链 A 2–275（274 aa）
未记录 QU2 mycinamicin I × 1 MG MAGNESIUM ION × 367 SPD SPERMIDINE × 8 MPD (4S)-2-METHYL-2,4-PENTANEDIOL × 4 NA SODIUM ION × 1 EOH ETHANOL × 1 CA CALCIUM ION × 5 K POTASSIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293.15 K；Ribosome solution containing 0.0065 mM (180 A/ml) of D50S in 10 mM Hepes pH=7.8, 15 mM MgCl2 and 75 mM NH4Cl crystallization buffer was mixed with 10 mM spermidine, 1 % ethanol and 0.5 % 2-ethyl-1,3-hexanediol precipitants. A 0.005 ml crystallization drop was hanged over 10 % ethanol and 5% 2-ethyl-1,3-hexanediol in ddw reservoir.
分辨率 3.22 Å R-free 0.253
7A18 50S Deinococcus radiodurans ribosome bounded with mycinamicin IV 提交 2020-08-12 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 26 PDB 声明：28-meric
链 A 2–272（271 aa）
未记录 MIV MYCINAMICIN IV × 1 MG MAGNESIUM ION × 277 SPD SPERMIDINE × 7 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；293.15 K；Ribosome solution containing 0.0065 mM (180 A/ml) of D50S in 10 mM Hepes pH=7.8, 15 mM MgCl2 and 75 mM NH4Cl crystallization buffer was mixed with 10 mM spermidine, 1 % ethanol and 0.5 % 2-ethyl-1,3-hexanediol precipitants. A 0.005 ml crystallization drop was hanged over 10 % ethanol and 5% 2-ethyl-1,3-hexanediol in ddw reservoir.
分辨率 3.40 Å R-free 0.318

共 23 个其他 PDB 条目、23 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

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UniProt名称 RL2_DEIRA
Isoform —
PDB实体 6
链与序列区间 作者链 A； PDB构建体 1–274； UniProt 2–275

50S RIBOSOMAL PROTEIN L3

物种未注明

UniProt Q9RXK2

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白–RNA 异源复合物 蛋白 × 29 RNA 2 PDB 声明：31-meric（31） 与全部聚合物数一致 链 B； UniProt 1–211 未记录 50S RIBOSOMAL PROTEIN L33 × 1 （Q9RSS4） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L34 × 1 （Q9RSH2） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L35 × 1 （Q9RSW6） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L36 × 1 （Q9RSK0） THIOSTREPTON × 1 （P0C8P8） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L2 × 1 （Q9RXJ9） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L4 × 1 （Q9RXK1） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L5 × 1 （Q9RXJ0） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L6 × 1 （Q9RSL3） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L11 × 1 （Q9RSS7） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L13 × 1 （Q9RXY1） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L14 × 1 （Q9RXJ2） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L15 × 1 （Q9RSK9） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L16 × 1 （Q9RXJ5） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L17 × 1 （Q9RSJ5） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L18 × 1 （Q9RSL2） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L19 × 1 （Q9RWB4） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L20 × 1 （Q9RSW7） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L21 × 1 （Q9RY64） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L22 × 1 （Q9RXJ7） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L23 × 1 （Q9RXK0） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L24 × 1 （Q9RXJ1） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L25 × 1 （Q9RX88） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L27 × 1 （Q9RY65） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L28 × 1 （Q9RRG8） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L29 × 1 （Q9RXJ4） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L30 × 1 （Q9RSL0） RRNA-23S RIBOSOMAL RNA × 1 50S RIBOSOMAL PROTEIN L32 × 1 （P49228） RRNA-5S RIBOSOMAL RNA × 1 MG MAGNESIUM ION × 36 X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP 分辨率 3.30 Å R-free 0.318

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 3CF5 Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
1NKW Crystal Structure Of The Large Ribosomal Subunit From Deinococcus Radiodurans 提交 2003-01-05 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 29 PDB 声明：31-meric
链 B 1–211（211 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；ETHANOL, DIMETHYLHEXANEDIOL, MGCL2, KCL, HEPES, NH4CL, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP
分辨率 3.10 Å R-free 0.274
1NWX COMPLEX OF THE LARGE RIBOSOMAL SUBUNIT FROM DEINOCOCCUS RADIODURANS WITH ABT-773 提交 2003-02-07 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 29 PDB 声明：31-meric
链 B 1–211（211 aa）
未记录 773 CETHROMYCIN × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；281 K；ETHANOL, DIMETHYLHEXANEDIOL, MGCL2, KCL, HEPES, NH4CL, pH 7.80, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 281K
分辨率 3.50 Å R-free 0.313
1NWY COMPLEX OF THE LARGE RIBOSOMAL SUBUNIT FROM DEINOCOCCUS RADIODURANS WITH AZITHROMYCIN 提交 2003-02-07 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 29 PDB 声明：31-meric
链 B 1–211（211 aa）
未记录 ZIT AZITHROMYCIN × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；291 K；ETHANOL, DIMETHYLHEXANEDIOL, MGCL2, KCL, HEPES, NH4CL, pH 7.80, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K
分辨率 3.30 Å R-free 0.304
1SM1 COMPLEX OF THE LARGE RIBOSOMAL SUBUNIT FROM DEINOCOCCUS RADIODURANS WITH QUINUPRISTIN AND DALFOPRISTIN 提交 2004-03-08 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 30 PDB 声明：32-meric
链 B 1–211（211 aa）
未记录 DOL 5-(2-DIETHYLAMINO-ETHANESULFONYL)-21-HYDROXY-10-ISOPROPYL-11,19-DIMETHYL-9,26-DIOXA-3,15,28-TRIAZA-TRICYCLO[23.2.1.00,255]OCTACOSA-1(27),12,17,19,25(28)-PENTAENE-2,8,14,23-TETRAONE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 7.8；ETHANOL, DIMETHYLHEXANEDIOL, MGCL2, KCL, HEPES, NH4CL , PH 7.80, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, TEMPERATURE 290K
分辨率 3.42 Å R-free 0.348
1XBP Inhibition of peptide bond formation by pleuromutilins: The structure of the 50S ribosomal subunit from Deinococcus radiodurans in complex with Tiamulin 提交 2004-08-31 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 29 PDB 声明：31-meric
链 B 1–211（211 aa）
未记录 MUL TIAMULIN × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；280 K；ETHANOL, DIMETHYLHEXANEDIOL, MGCL2,KCL, HEPES, NH4CL, pH 7.80, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 280K
分辨率 3.50 Å R-free 0.360
2OGM The crystal structure of the large ribosomal subunit from Deinococcus radiodurans complexed with the pleuromutilin derivative SB-571519 提交 2007-01-07 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：dimeric
链 B 1–211（211 aa）
未记录 G19 (2S,3AR,4R,5S,6S,8R,9R,9AR,10R)-2,5-DIHYDROXY-4,6,9,10-TETRAMETHYL-1-OXO-6-VINYLDECAHYDRO-3A,9-PROP[1]ENOCYCLOPENTA[8]ANNULEN-8-YL [(6-AMINOPYRIDAZIN-3-YL)CARBONYL]CARBAMATE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；291 K；Ethanol, Dimethylhexanediol, MgCl2, HEPES, NH4Cl, pH 7.8, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K
分辨率 3.50 Å R-free 0.334
2OGN The crystal structure of the large ribosomal subunit from Deinococcus radiodurans complexed with the pleuromutilin derivative SB-280080 提交 2007-01-07 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：dimeric
链 B 1–211（211 aa）
未记录 G80 (3AS,4R,5S,6S,8R,9R,9AR,10R)-5-HYDROXY-4,6,9,10-TETRAMETHYL-1-OXO-6-VINYLDECAHYDRO-3A,9-PROPANOCYCLOPENTA[8]ANNULEN-8-YL (PIPERIDIN-4-YLTHIO)ACETATE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；291 K；Ethanol, Dimethylhexanediol, MgCl2, HEPES, NH4Cl, pH 7.8, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K
分辨率 3.56 Å R-free 0.338
2OGO The crystal structure of the large ribosomal subunit from Deinococcus radiodurans complexed with the pleuromutilin derivative retapamulin (SB-275833) 提交 2007-01-07 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：dimeric
链 B 1–211（211 aa）
未记录 G34 Retapamulin × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；291 K；Ethanol, Dimethylhexanediol, MgCl2, HEPES, NH4Cl, pH 7.8, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K
分辨率 3.66 Å R-free 0.334
2ZJP Thiopeptide antibiotic Nosiheptide bound to the large ribosomal subunit of Deinococcus radiodurans 提交 2008-03-07 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 29 PDB 声明：31-meric
链 B 1–211（211 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 NO1 4-(hydroxymethyl)-3-methyl-1H-indole-2-carboxylic acid × 1 MG MAGNESIUM ION × 35 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP
分辨率 3.70 Å R-free 0.340
2ZJQ Interaction of L7 with L11 induced by Microccocin binding to the Deinococcus radiodurans 50S subunit 提交 2008-03-08 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 29 PDB 声明：31-meric
链 B 1–211（211 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP
分辨率 3.30 Å R-free 0.339
2ZJR Refined native structure of the large ribosomal subunit (50S) from Deinococcus radiodurans 提交 2008-03-08 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 28 PDB 声明：30-meric
链 B 1–211（211 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 35 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP
分辨率 2.91 Å R-free 0.311
3DLL The oxazolidinone antibiotics perturb the ribosomal peptidyl-transferase center and effect tRNA positioning 提交 2008-06-27 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 28 PDB 声明：30-meric
链 B 1–211（211 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 35 ZLD N-{[(5S)-3-(3-fluoro-4-morpholin-4-ylphenyl)-2-oxo-1,3-oxazolidin-5-yl]methyl}acetamide × 1 ZN ZINC ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；10mM MgCl2, 60mM NH4Cl, 5mM KCl, 10mM HEPES, pH7.8, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP
分辨率 3.50 Å R-free 0.280
3PIO Crystal structure of the synergistic antibiotic pair lankamycin and lankacidin in complex with the large ribosomal subunit 提交 2010-11-07 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 28 PDB 声明：30-meric
链 B 1–211（211 aa）
未记录 LMA Lankamycin × 1 MG MAGNESIUM ION × 154 NA SODIUM ION × 42 K POTASSIUM ION × 15 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP. 15% 2:1 ethanol:methylpentanediol was diffused to a hanging drop of 180 AU/ml solution of D50S.
分辨率 3.25 Å R-free 0.294
3PIP Crystal structure of the synergistic antibiotic pair lankamycin and lankacidin in complex with the large ribosomal subunit 提交 2010-11-07 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 28 PDB 声明：30-meric
链 B 1–211（211 aa）
未记录 LC2 N-[(1S,2R,3E,5E,7S,9E,11E,13S,15R,19R)-7,13-dihydroxy-1,4,10,19-tetramethyl-17,18-dioxo-16-oxabicyclo[13.2.2]nonadeca-3,5,9,11-tetraen-2-yl]-2-oxopropanamide × 1 LMA Lankamycin × 1 MG MAGNESIUM ION × 73 K POTASSIUM ION × 4 NA SODIUM ION × 5 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP. 15% 2:1 ethanol:methylpentanediol was diffused to a hanging drop of 180 AU/ml solution of D50S.
分辨率 3.45 Å R-free 0.301
4IO9 Crystal structure of compound 4d bound to large ribosomal subunit (50S) from Deinococcus radiodurans 提交 2013-01-07 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 28 PDB 声明：30-meric
链 B 1–211（211 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 35 1F2 (3aS,4R,7R,8S,9S,10R,11R,13R,15R,15aR)-4-ethyl-11-methoxy-3a,7,9,11,13,15-hexamethyl-2,6,14-trioxo-10-{[3,4,6-trideoxy-3-(dimethylamino)-beta-D-xylo-hexopyranosyl]oxy}tetradecahydro-2H-oxacyclotetradecino[4,3-d][1,3]oxazol-8-yl (2R)-2-(pyridin-3-yl)pyrrolidine-1-carboxylate × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP
分辨率 3.20 Å R-free 0.235
4IOA Crystal structure of compound 4e bound to large ribosomal subunit (50S) from Deinococcus radiodurans 提交 2013-01-07 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 28 PDB 声明：30-meric
链 B 1–211（211 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 35 1F3 (3aS,4R,7R,8S,9S,10R,11R,13R,15R,15aR)-4-ethyl-11-methoxy-3a,7,9,11,13,15-hexamethyl-2,6,14-trioxo-10-{[3,4,6-trideoxy-3-(dimethylamino)-beta-D-xylo-hexopyranosyl]oxy}tetradecahydro-2H-oxacyclotetradecino[4,3-d][1,3]oxazol-8-yl (2R)-2-[4-(acetylamino)phenyl]-2,3-dihydro-1H-pyrrole-1-carboxylate × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP
分辨率 3.20 Å R-free 0.230
4IOC Crystal structure of compound 4f bound to large ribosomal subunit (50S) from Deinococcus radiodurans 提交 2013-01-07 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 28 PDB 声明：30-meric
链 B 1–211（211 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 35 1F4 (3aS,4R,7R,8S,9S,10R,11R,13R,15S,15aR)-4-ethyl-11-methoxy-3a,7,9,11,13,15-hexamethyl-2,6,14-trioxo-10-{[3,4,6-trideoxy-3-(dimethylamino)-beta-D-xylo-hexopyranosyl]oxy}tetradecahydro-2H-oxacyclotetradecino[4,3-d][1,3]oxazol-8-yl (2R)-4,4-dimethyl-2-(pyridin-3-yl)pyrrolidine-1-carboxylate × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP
分辨率 3.60 Å R-free 0.239
4U67 Crystal structure of the large ribosomal subunit (50S) of Deinococcus radiodurans containing a three residue insertion in L22 提交 2014-07-28 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 26 PDB 声明：28-meric
链 B 1–211（211 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 51 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；293 K；Magnesium chloride, HEPES, ammonium chloride, ethanol, 2-ethyl-1,3-hexandiol
分辨率 3.65 Å R-free 0.270
4WFN Crystal structure of the large ribosomal subunit (50S) of Deinococcus radiodurans containing a three residue insertion in L22 in complex with erythromycin 提交 2014-09-16 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 26 PDB 声明：28-meric
链 B 1–211（211 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 70 ERY ERYTHROMYCIN A × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；293 K；Magnesuim chloride, Hepes, ammonium chloride, ethanol, 2-ethyl-1,3-hexadiol
分辨率 3.54 Å R-free 0.282
5DM6 Crystal structure of the 50S ribosomal subunit from Deinococcus radiodurans 提交 2015-09-08 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 28 PDB 声明：30-meric
链 B 1–205（205 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 198 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；292 K；HEPES, sodium hydroxide, magnesium chloride, ammonium chloride, 2-mercaptoethanol, spermidine, 2-ethyl-1, 3-hexanediol, ethanol
分辨率 2.90 Å R-free 0.270
5DM7 Crystal structure of the 50S ribosomal subunit from Deinococcus radiodurans in complex with hygromycin A 提交 2015-09-08 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 28 PDB 声明：30-meric
链 B 1–205（205 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 186 HGR Hygromycin A × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；292 K；HEPES, sodium hydroxide, magnesium chloride, ammonium chloride, 2-mercaptoethanol, spermidine, 2-ethyl-1,3-hexanediol, ethanol
分辨率 3.00 Å R-free 0.326
5JVG The large ribosomal subunit from Deinococcus radiodurans in complex with avilamycin 提交 2016-05-11 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 27 PDB 声明：29-meric
链 B 1–211（211 aa）
未记录 6NO Avilamycin × 1 MG MAGNESIUM ION × 446 MPD (4S)-2-METHYL-2,4-PENTANEDIOL × 5 SPD SPERMIDINE × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；293.15 K；Ribosome solution containing 0.0065 mM (180 A/ml) of D50S in 10 mM Hepes pH=7.8, 15 mM MgCl2 and 75 mM NH4Cl crystallization buffer was mixed with 10 mM spermidine, 1 % ethanol and 0.5 % 2-ethyl-1,3-hexanediol precipitants. A 0.005 ml crystallization drop was hanged over 10 % ethanol and 5% 2-ethyl-1,3-hexanediol in ddw reservoir.
分辨率 3.43 Å R-free 0.253
5JVH The crystal structure large ribosomal subunit (50S) of Deinococcus radiodurans in complex with evernimicin 提交 2016-05-11 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 26 PDB 声明：28-meric
链 B 1–211（211 aa）
未记录 6O1 Evernimicin × 1 MG MAGNESIUM ION × 123 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；293 K；Magnesium chloride, HEPES, ammonium chloride, ethanol, 2-ethyl-1,3-hexandiol
分辨率 3.58 Å R-free 0.247
7A0R 50S Deinococcus radiodurans ribosome bounded with mycinamicin I 提交 2020-08-10 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 26 PDB 声明：28-meric
链 B 1–206（206 aa）
未记录 QTZ mycinamicin II × 1 MG MAGNESIUM ION × 345 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293.15 K；Ribosome solution containing 0.0065 mM (180 A/ml) of D50S in 10 mM Hepes pH=7.8, 15 mM MgCl2 and 75 mM NH4Cl crystallization buffer was mixed with 10 mM spermidine, 1 % ethanol and 0.5 % 2-ethyl-1,3-hexanediol precipitants. A 0.005 ml crystallization drop was hanged over 10 % ethanol and 5% 2-ethyl-1,3-hexanediol in ddw reservoir.
分辨率 3.30 Å R-free 0.249
7A0S 50S Deinococcus radiodurans ribosome bounded with mycinamicin I 提交 2020-08-10 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 26 PDB 声明：28-meric
链 B 1–206（206 aa）
未记录 QU2 mycinamicin I × 1 MG MAGNESIUM ION × 367 SPD SPERMIDINE × 8 MPD (4S)-2-METHYL-2,4-PENTANEDIOL × 4 NA SODIUM ION × 1 EOH ETHANOL × 1 CA CALCIUM ION × 5 K POTASSIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293.15 K；Ribosome solution containing 0.0065 mM (180 A/ml) of D50S in 10 mM Hepes pH=7.8, 15 mM MgCl2 and 75 mM NH4Cl crystallization buffer was mixed with 10 mM spermidine, 1 % ethanol and 0.5 % 2-ethyl-1,3-hexanediol precipitants. A 0.005 ml crystallization drop was hanged over 10 % ethanol and 5% 2-ethyl-1,3-hexanediol in ddw reservoir.
分辨率 3.22 Å R-free 0.253
7A18 50S Deinococcus radiodurans ribosome bounded with mycinamicin IV 提交 2020-08-12 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 26 PDB 声明：28-meric
链 B 1–206（206 aa）
未记录 MIV MYCINAMICIN IV × 1 MG MAGNESIUM ION × 277 SPD SPERMIDINE × 7 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；293.15 K；Ribosome solution containing 0.0065 mM (180 A/ml) of D50S in 10 mM Hepes pH=7.8, 15 mM MgCl2 and 75 mM NH4Cl crystallization buffer was mixed with 10 mM spermidine, 1 % ethanol and 0.5 % 2-ethyl-1,3-hexanediol precipitants. A 0.005 ml crystallization drop was hanged over 10 % ethanol and 5% 2-ethyl-1,3-hexanediol in ddw reservoir.
分辨率 3.40 Å R-free 0.318

共 26 个其他 PDB 条目、26 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

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UniProt名称 RL3_DEIRA
Isoform —
PDB实体 7
链与序列区间 作者链 B； PDB构建体 1–211； UniProt 1–211

50S RIBOSOMAL PROTEIN L4

物种未注明

UniProt Q9RXK1

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白–RNA 异源复合物 蛋白 × 29 RNA 2 PDB 声明：31-meric（31） 与全部聚合物数一致 链 C； UniProt 1–205 未记录 50S RIBOSOMAL PROTEIN L33 × 1 （Q9RSS4） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L34 × 1 （Q9RSH2） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L35 × 1 （Q9RSW6） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L36 × 1 （Q9RSK0） THIOSTREPTON × 1 （P0C8P8） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L2 × 1 （Q9RXJ9） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L3 × 1 （Q9RXK2） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L5 × 1 （Q9RXJ0） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L6 × 1 （Q9RSL3） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L11 × 1 （Q9RSS7） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L13 × 1 （Q9RXY1） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L14 × 1 （Q9RXJ2） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L15 × 1 （Q9RSK9） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L16 × 1 （Q9RXJ5） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L17 × 1 （Q9RSJ5） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L18 × 1 （Q9RSL2） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L19 × 1 （Q9RWB4） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L20 × 1 （Q9RSW7） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L21 × 1 （Q9RY64） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L22 × 1 （Q9RXJ7） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L23 × 1 （Q9RXK0） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L24 × 1 （Q9RXJ1） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L25 × 1 （Q9RX88） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L27 × 1 （Q9RY65） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L28 × 1 （Q9RRG8） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L29 × 1 （Q9RXJ4） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L30 × 1 （Q9RSL0） RRNA-23S RIBOSOMAL RNA × 1 50S RIBOSOMAL PROTEIN L32 × 1 （P49228） RRNA-5S RIBOSOMAL RNA × 1 MG MAGNESIUM ION × 36 X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP 分辨率 3.30 Å R-free 0.318

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 3CF5 Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
1J5A STRUCTURAL BASIS FOR THE INTERACTION OF ANTIBIOTICS WITH THE PEPTIDYL TRANSFERASE CENTER IN EUBACTERIA 提交 2002-03-06 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：tetrameric
链 K 1–205（205 aa）
未记录 CTY CLARITHROMYCIN × 1 MG MAGNESIUM ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；291 K；ethanol, dimethylhexanediol, MgCl2, KCl, Hepes, NH4Cl, pH 7.8, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K
分辨率 3.50 Å R-free 0.323
1JZX Structural Basis for the Interaction of Antibiotics with the Peptidyl Transferase Center in Eubacteria 提交 2001-09-17 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：tetrameric
链 K 1–205（205 aa）
未记录 CLY CLINDAMYCIN × 1 MG MAGNESIUM ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；291 K；ethanol, dimethylhexanediol,MgCl2, KCl, Hepes, NH4Cl, pH 7.8, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K
分辨率 3.10 Å R-free 0.303
1JZY Structural Basis for the Interaction of Antibiotics with the Peptidyl Transferase Center in Eubacteria 提交 2001-09-17 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：tetrameric
链 K 1–205（205 aa）
未记录 ERY ERYTHROMYCIN A × 1 MG MAGNESIUM ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；291 K；ethanol, dimethylhexanediol, MgCl2, KCl, Hepes, NH4Cl, pH 7.8, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K
分辨率 3.50 Å R-free 0.301
1JZZ Structural Basis for the Interaction of Antibiotics with the Peptidyl Transferase Center in Eubacteria 提交 2001-09-17 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：tetrameric
链 K 1–205（205 aa）
未记录 ROX ROXITHROMYCIN × 1 MG MAGNESIUM ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；291 K；ethanol, dimethylhexanediol, MgCl2, KCl, Hepes, NH4Cl, pH 7.8, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K
分辨率 3.80 Å R-free 0.274
1K01 Structural Basis for the Interaction of Antibiotics with the Peptidyl Transferase Center in Eubacteria 提交 2001-09-17 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：tetrameric
链 K 1–205（205 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 3 CLM CHLORAMPHENICOL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；291 K；ethanol, dimethylhexanediol, MgCl2, KCl, Hepes, NH4Cl, pH 7.8, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K
分辨率 3.50 Å R-free 0.321
1NKW Crystal Structure Of The Large Ribosomal Subunit From Deinococcus Radiodurans 提交 2003-01-05 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 29 PDB 声明：31-meric
链 C 1–204（204 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；ETHANOL, DIMETHYLHEXANEDIOL, MGCL2, KCL, HEPES, NH4CL, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP
分辨率 3.10 Å R-free 0.274
1NWX COMPLEX OF THE LARGE RIBOSOMAL SUBUNIT FROM DEINOCOCCUS RADIODURANS WITH ABT-773 提交 2003-02-07 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 29 PDB 声明：31-meric
链 C 2–205（204 aa）
未记录 773 CETHROMYCIN × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；281 K；ETHANOL, DIMETHYLHEXANEDIOL, MGCL2, KCL, HEPES, NH4CL, pH 7.80, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 281K
分辨率 3.50 Å R-free 0.313
1NWY COMPLEX OF THE LARGE RIBOSOMAL SUBUNIT FROM DEINOCOCCUS RADIODURANS WITH AZITHROMYCIN 提交 2003-02-07 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 29 PDB 声明：31-meric
链 C 2–205（204 aa）
未记录 ZIT AZITHROMYCIN × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；291 K；ETHANOL, DIMETHYLHEXANEDIOL, MGCL2, KCL, HEPES, NH4CL, pH 7.80, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K
分辨率 3.30 Å R-free 0.304
1SM1 COMPLEX OF THE LARGE RIBOSOMAL SUBUNIT FROM DEINOCOCCUS RADIODURANS WITH QUINUPRISTIN AND DALFOPRISTIN 提交 2004-03-08 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 30 PDB 声明：32-meric
链 C 1–205（205 aa）
未记录 DOL 5-(2-DIETHYLAMINO-ETHANESULFONYL)-21-HYDROXY-10-ISOPROPYL-11,19-DIMETHYL-9,26-DIOXA-3,15,28-TRIAZA-TRICYCLO[23.2.1.00,255]OCTACOSA-1(27),12,17,19,25(28)-PENTAENE-2,8,14,23-TETRAONE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 7.8；ETHANOL, DIMETHYLHEXANEDIOL, MGCL2, KCL, HEPES, NH4CL , PH 7.80, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, TEMPERATURE 290K
分辨率 3.42 Å R-free 0.348
1XBP Inhibition of peptide bond formation by pleuromutilins: The structure of the 50S ribosomal subunit from Deinococcus radiodurans in complex with Tiamulin 提交 2004-08-31 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 29 PDB 声明：31-meric
链 C 1–204（204 aa）
未记录 MUL TIAMULIN × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；280 K；ETHANOL, DIMETHYLHEXANEDIOL, MGCL2,KCL, HEPES, NH4CL, pH 7.80, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 280K
分辨率 3.50 Å R-free 0.360
2ZJP Thiopeptide antibiotic Nosiheptide bound to the large ribosomal subunit of Deinococcus radiodurans 提交 2008-03-07 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 29 PDB 声明：31-meric
链 C 1–205（205 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 NO1 4-(hydroxymethyl)-3-methyl-1H-indole-2-carboxylic acid × 1 MG MAGNESIUM ION × 35 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP
分辨率 3.70 Å R-free 0.340
2ZJQ Interaction of L7 with L11 induced by Microccocin binding to the Deinococcus radiodurans 50S subunit 提交 2008-03-08 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 29 PDB 声明：31-meric
链 C 1–205（205 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP
分辨率 3.30 Å R-free 0.339
2ZJR Refined native structure of the large ribosomal subunit (50S) from Deinococcus radiodurans 提交 2008-03-08 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 28 PDB 声明：30-meric
链 C 1–205（205 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 35 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP
分辨率 2.91 Å R-free 0.311
3DLL The oxazolidinone antibiotics perturb the ribosomal peptidyl-transferase center and effect tRNA positioning 提交 2008-06-27 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 28 PDB 声明：30-meric
链 C 1–205（205 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 35 ZLD N-{[(5S)-3-(3-fluoro-4-morpholin-4-ylphenyl)-2-oxo-1,3-oxazolidin-5-yl]methyl}acetamide × 1 ZN ZINC ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；10mM MgCl2, 60mM NH4Cl, 5mM KCl, 10mM HEPES, pH7.8, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP
分辨率 3.50 Å R-free 0.280
3PIO Crystal structure of the synergistic antibiotic pair lankamycin and lankacidin in complex with the large ribosomal subunit 提交 2010-11-07 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 28 PDB 声明：30-meric
链 C 1–205（205 aa）
未记录 LMA Lankamycin × 1 MG MAGNESIUM ION × 154 NA SODIUM ION × 42 K POTASSIUM ION × 15 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP. 15% 2:1 ethanol:methylpentanediol was diffused to a hanging drop of 180 AU/ml solution of D50S.
分辨率 3.25 Å R-free 0.294
3PIP Crystal structure of the synergistic antibiotic pair lankamycin and lankacidin in complex with the large ribosomal subunit 提交 2010-11-07 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 28 PDB 声明：30-meric
链 C 1–205（205 aa）
未记录 LC2 N-[(1S,2R,3E,5E,7S,9E,11E,13S,15R,19R)-7,13-dihydroxy-1,4,10,19-tetramethyl-17,18-dioxo-16-oxabicyclo[13.2.2]nonadeca-3,5,9,11-tetraen-2-yl]-2-oxopropanamide × 1 LMA Lankamycin × 1 MG MAGNESIUM ION × 73 K POTASSIUM ION × 4 NA SODIUM ION × 5 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP. 15% 2:1 ethanol:methylpentanediol was diffused to a hanging drop of 180 AU/ml solution of D50S.
分辨率 3.45 Å R-free 0.301
4IO9 Crystal structure of compound 4d bound to large ribosomal subunit (50S) from Deinococcus radiodurans 提交 2013-01-07 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 28 PDB 声明：30-meric
链 C 1–205（205 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 35 1F2 (3aS,4R,7R,8S,9S,10R,11R,13R,15R,15aR)-4-ethyl-11-methoxy-3a,7,9,11,13,15-hexamethyl-2,6,14-trioxo-10-{[3,4,6-trideoxy-3-(dimethylamino)-beta-D-xylo-hexopyranosyl]oxy}tetradecahydro-2H-oxacyclotetradecino[4,3-d][1,3]oxazol-8-yl (2R)-2-(pyridin-3-yl)pyrrolidine-1-carboxylate × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP
分辨率 3.20 Å R-free 0.235
4IOA Crystal structure of compound 4e bound to large ribosomal subunit (50S) from Deinococcus radiodurans 提交 2013-01-07 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 28 PDB 声明：30-meric
链 C 1–205（205 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 35 1F3 (3aS,4R,7R,8S,9S,10R,11R,13R,15R,15aR)-4-ethyl-11-methoxy-3a,7,9,11,13,15-hexamethyl-2,6,14-trioxo-10-{[3,4,6-trideoxy-3-(dimethylamino)-beta-D-xylo-hexopyranosyl]oxy}tetradecahydro-2H-oxacyclotetradecino[4,3-d][1,3]oxazol-8-yl (2R)-2-[4-(acetylamino)phenyl]-2,3-dihydro-1H-pyrrole-1-carboxylate × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP
分辨率 3.20 Å R-free 0.230
4IOC Crystal structure of compound 4f bound to large ribosomal subunit (50S) from Deinococcus radiodurans 提交 2013-01-07 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 28 PDB 声明：30-meric
链 C 1–205（205 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 35 1F4 (3aS,4R,7R,8S,9S,10R,11R,13R,15S,15aR)-4-ethyl-11-methoxy-3a,7,9,11,13,15-hexamethyl-2,6,14-trioxo-10-{[3,4,6-trideoxy-3-(dimethylamino)-beta-D-xylo-hexopyranosyl]oxy}tetradecahydro-2H-oxacyclotetradecino[4,3-d][1,3]oxazol-8-yl (2R)-4,4-dimethyl-2-(pyridin-3-yl)pyrrolidine-1-carboxylate × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP
分辨率 3.60 Å R-free 0.239
4U67 Crystal structure of the large ribosomal subunit (50S) of Deinococcus radiodurans containing a three residue insertion in L22 提交 2014-07-28 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 26 PDB 声明：28-meric
链 C 1–205（205 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 51 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；293 K；Magnesium chloride, HEPES, ammonium chloride, ethanol, 2-ethyl-1,3-hexandiol
分辨率 3.65 Å R-free 0.270
4WFN Crystal structure of the large ribosomal subunit (50S) of Deinococcus radiodurans containing a three residue insertion in L22 in complex with erythromycin 提交 2014-09-16 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 26 PDB 声明：28-meric
链 C 1–205（205 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 70 ERY ERYTHROMYCIN A × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；293 K；Magnesuim chloride, Hepes, ammonium chloride, ethanol, 2-ethyl-1,3-hexadiol
分辨率 3.54 Å R-free 0.282
5DM6 Crystal structure of the 50S ribosomal subunit from Deinococcus radiodurans 提交 2015-09-08 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 28 PDB 声明：30-meric
链 C 2–198（197 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 198 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；292 K；HEPES, sodium hydroxide, magnesium chloride, ammonium chloride, 2-mercaptoethanol, spermidine, 2-ethyl-1, 3-hexanediol, ethanol
分辨率 2.90 Å R-free 0.270
5DM7 Crystal structure of the 50S ribosomal subunit from Deinococcus radiodurans in complex with hygromycin A 提交 2015-09-08 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 28 PDB 声明：30-meric
链 C 2–198（197 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 186 HGR Hygromycin A × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；292 K；HEPES, sodium hydroxide, magnesium chloride, ammonium chloride, 2-mercaptoethanol, spermidine, 2-ethyl-1,3-hexanediol, ethanol
分辨率 3.00 Å R-free 0.326
5JVG The large ribosomal subunit from Deinococcus radiodurans in complex with avilamycin 提交 2016-05-11 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 27 PDB 声明：29-meric
链 C 1–205（205 aa）
未记录 6NO Avilamycin × 1 MG MAGNESIUM ION × 446 MPD (4S)-2-METHYL-2,4-PENTANEDIOL × 5 SPD SPERMIDINE × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；293.15 K；Ribosome solution containing 0.0065 mM (180 A/ml) of D50S in 10 mM Hepes pH=7.8, 15 mM MgCl2 and 75 mM NH4Cl crystallization buffer was mixed with 10 mM spermidine, 1 % ethanol and 0.5 % 2-ethyl-1,3-hexanediol precipitants. A 0.005 ml crystallization drop was hanged over 10 % ethanol and 5% 2-ethyl-1,3-hexanediol in ddw reservoir.
分辨率 3.43 Å R-free 0.253
5JVH The crystal structure large ribosomal subunit (50S) of Deinococcus radiodurans in complex with evernimicin 提交 2016-05-11 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 26 PDB 声明：28-meric
链 C 1–205（205 aa）
未记录 6O1 Evernimicin × 1 MG MAGNESIUM ION × 123 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；293 K；Magnesium chloride, HEPES, ammonium chloride, ethanol, 2-ethyl-1,3-hexandiol
分辨率 3.58 Å R-free 0.247
7A0R 50S Deinococcus radiodurans ribosome bounded with mycinamicin I 提交 2020-08-10 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 26 PDB 声明：28-meric
链 C 2–198（197 aa）
未记录 QTZ mycinamicin II × 1 MG MAGNESIUM ION × 345 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293.15 K；Ribosome solution containing 0.0065 mM (180 A/ml) of D50S in 10 mM Hepes pH=7.8, 15 mM MgCl2 and 75 mM NH4Cl crystallization buffer was mixed with 10 mM spermidine, 1 % ethanol and 0.5 % 2-ethyl-1,3-hexanediol precipitants. A 0.005 ml crystallization drop was hanged over 10 % ethanol and 5% 2-ethyl-1,3-hexanediol in ddw reservoir.
分辨率 3.30 Å R-free 0.249
7A0S 50S Deinococcus radiodurans ribosome bounded with mycinamicin I 提交 2020-08-10 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 26 PDB 声明：28-meric
链 C 1–205（205 aa）
未记录 QU2 mycinamicin I × 1 MG MAGNESIUM ION × 367 SPD SPERMIDINE × 8 MPD (4S)-2-METHYL-2,4-PENTANEDIOL × 4 NA SODIUM ION × 1 EOH ETHANOL × 1 CA CALCIUM ION × 5 K POTASSIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293.15 K；Ribosome solution containing 0.0065 mM (180 A/ml) of D50S in 10 mM Hepes pH=7.8, 15 mM MgCl2 and 75 mM NH4Cl crystallization buffer was mixed with 10 mM spermidine, 1 % ethanol and 0.5 % 2-ethyl-1,3-hexanediol precipitants. A 0.005 ml crystallization drop was hanged over 10 % ethanol and 5% 2-ethyl-1,3-hexanediol in ddw reservoir.
分辨率 3.22 Å R-free 0.253
7A18 50S Deinococcus radiodurans ribosome bounded with mycinamicin IV 提交 2020-08-12 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 26 PDB 声明：28-meric
链 C 2–196（195 aa）
未记录 MIV MYCINAMICIN IV × 1 MG MAGNESIUM ION × 277 SPD SPERMIDINE × 7 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；293.15 K；Ribosome solution containing 0.0065 mM (180 A/ml) of D50S in 10 mM Hepes pH=7.8, 15 mM MgCl2 and 75 mM NH4Cl crystallization buffer was mixed with 10 mM spermidine, 1 % ethanol and 0.5 % 2-ethyl-1,3-hexanediol precipitants. A 0.005 ml crystallization drop was hanged over 10 % ethanol and 5% 2-ethyl-1,3-hexanediol in ddw reservoir.
分辨率 3.40 Å R-free 0.318

共 28 个其他 PDB 条目、28 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 RL4_DEIRA
Isoform —
PDB实体 8
链与序列区间 作者链 C； PDB构建体 1–205； UniProt 1–205

50S RIBOSOMAL PROTEIN L5

物种未注明

UniProt Q9RXJ0

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白–RNA 异源复合物 蛋白 × 29 RNA 2 PDB 声明：31-meric（31） 与全部聚合物数一致 链 D； UniProt 1–180 未记录 50S RIBOSOMAL PROTEIN L33 × 1 （Q9RSS4） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L34 × 1 （Q9RSH2） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L35 × 1 （Q9RSW6） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L36 × 1 （Q9RSK0） THIOSTREPTON × 1 （P0C8P8） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L2 × 1 （Q9RXJ9） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L3 × 1 （Q9RXK2） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L4 × 1 （Q9RXK1） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L6 × 1 （Q9RSL3） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L11 × 1 （Q9RSS7） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L13 × 1 （Q9RXY1） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L14 × 1 （Q9RXJ2） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L15 × 1 （Q9RSK9） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L16 × 1 （Q9RXJ5） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L17 × 1 （Q9RSJ5） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L18 × 1 （Q9RSL2） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L19 × 1 （Q9RWB4） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L20 × 1 （Q9RSW7） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L21 × 1 （Q9RY64） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L22 × 1 （Q9RXJ7） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L23 × 1 （Q9RXK0） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L24 × 1 （Q9RXJ1） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L25 × 1 （Q9RX88） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L27 × 1 （Q9RY65） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L28 × 1 （Q9RRG8） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L29 × 1 （Q9RXJ4） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L30 × 1 （Q9RSL0） RRNA-23S RIBOSOMAL RNA × 1 50S RIBOSOMAL PROTEIN L32 × 1 （P49228） RRNA-5S RIBOSOMAL RNA × 1 MG MAGNESIUM ION × 36 X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP 分辨率 3.30 Å R-free 0.318

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 3CF5 Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
1NKW Crystal Structure Of The Large Ribosomal Subunit From Deinococcus Radiodurans 提交 2003-01-05 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 29 PDB 声明：31-meric
链 D 1–180（180 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；ETHANOL, DIMETHYLHEXANEDIOL, MGCL2, KCL, HEPES, NH4CL, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP
分辨率 3.10 Å R-free 0.274
1NWX COMPLEX OF THE LARGE RIBOSOMAL SUBUNIT FROM DEINOCOCCUS RADIODURANS WITH ABT-773 提交 2003-02-07 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 29 PDB 声明：31-meric
链 D 1–180（180 aa）
未记录 773 CETHROMYCIN × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；281 K；ETHANOL, DIMETHYLHEXANEDIOL, MGCL2, KCL, HEPES, NH4CL, pH 7.80, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 281K
分辨率 3.50 Å R-free 0.313
1NWY COMPLEX OF THE LARGE RIBOSOMAL SUBUNIT FROM DEINOCOCCUS RADIODURANS WITH AZITHROMYCIN 提交 2003-02-07 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 29 PDB 声明：31-meric
链 D 1–180（180 aa）
未记录 ZIT AZITHROMYCIN × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；291 K；ETHANOL, DIMETHYLHEXANEDIOL, MGCL2, KCL, HEPES, NH4CL, pH 7.80, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K
分辨率 3.30 Å R-free 0.304
1SM1 COMPLEX OF THE LARGE RIBOSOMAL SUBUNIT FROM DEINOCOCCUS RADIODURANS WITH QUINUPRISTIN AND DALFOPRISTIN 提交 2004-03-08 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 30 PDB 声明：32-meric
链 D 1–180（180 aa）
未记录 DOL 5-(2-DIETHYLAMINO-ETHANESULFONYL)-21-HYDROXY-10-ISOPROPYL-11,19-DIMETHYL-9,26-DIOXA-3,15,28-TRIAZA-TRICYCLO[23.2.1.00,255]OCTACOSA-1(27),12,17,19,25(28)-PENTAENE-2,8,14,23-TETRAONE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 7.8；ETHANOL, DIMETHYLHEXANEDIOL, MGCL2, KCL, HEPES, NH4CL , PH 7.80, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, TEMPERATURE 290K
分辨率 3.42 Å R-free 0.348
1XBP Inhibition of peptide bond formation by pleuromutilins: The structure of the 50S ribosomal subunit from Deinococcus radiodurans in complex with Tiamulin 提交 2004-08-31 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 29 PDB 声明：31-meric
链 D 1–180（180 aa）
未记录 MUL TIAMULIN × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；280 K；ETHANOL, DIMETHYLHEXANEDIOL, MGCL2,KCL, HEPES, NH4CL, pH 7.80, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 280K
分辨率 3.50 Å R-free 0.360
2ZJP Thiopeptide antibiotic Nosiheptide bound to the large ribosomal subunit of Deinococcus radiodurans 提交 2008-03-07 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 29 PDB 声明：31-meric
链 D 1–180（180 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 NO1 4-(hydroxymethyl)-3-methyl-1H-indole-2-carboxylic acid × 1 MG MAGNESIUM ION × 35 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP
分辨率 3.70 Å R-free 0.340
2ZJQ Interaction of L7 with L11 induced by Microccocin binding to the Deinococcus radiodurans 50S subunit 提交 2008-03-08 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 29 PDB 声明：31-meric
链 D 1–180（180 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP
分辨率 3.30 Å R-free 0.339
2ZJR Refined native structure of the large ribosomal subunit (50S) from Deinococcus radiodurans 提交 2008-03-08 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 28 PDB 声明：30-meric
链 D 1–180（180 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 35 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP
分辨率 2.91 Å R-free 0.311
3DLL The oxazolidinone antibiotics perturb the ribosomal peptidyl-transferase center and effect tRNA positioning 提交 2008-06-27 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 28 PDB 声明：30-meric
链 D 1–180（180 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 35 ZLD N-{[(5S)-3-(3-fluoro-4-morpholin-4-ylphenyl)-2-oxo-1,3-oxazolidin-5-yl]methyl}acetamide × 1 ZN ZINC ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；10mM MgCl2, 60mM NH4Cl, 5mM KCl, 10mM HEPES, pH7.8, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP
分辨率 3.50 Å R-free 0.280
3PIO Crystal structure of the synergistic antibiotic pair lankamycin and lankacidin in complex with the large ribosomal subunit 提交 2010-11-07 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 28 PDB 声明：30-meric
链 D 1–180（180 aa）
未记录 LMA Lankamycin × 1 MG MAGNESIUM ION × 154 NA SODIUM ION × 42 K POTASSIUM ION × 15 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP. 15% 2:1 ethanol:methylpentanediol was diffused to a hanging drop of 180 AU/ml solution of D50S.
分辨率 3.25 Å R-free 0.294
3PIP Crystal structure of the synergistic antibiotic pair lankamycin and lankacidin in complex with the large ribosomal subunit 提交 2010-11-07 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 28 PDB 声明：30-meric
链 D 1–180（180 aa）
未记录 LC2 N-[(1S,2R,3E,5E,7S,9E,11E,13S,15R,19R)-7,13-dihydroxy-1,4,10,19-tetramethyl-17,18-dioxo-16-oxabicyclo[13.2.2]nonadeca-3,5,9,11-tetraen-2-yl]-2-oxopropanamide × 1 LMA Lankamycin × 1 MG MAGNESIUM ION × 73 K POTASSIUM ION × 4 NA SODIUM ION × 5 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP. 15% 2:1 ethanol:methylpentanediol was diffused to a hanging drop of 180 AU/ml solution of D50S.
分辨率 3.45 Å R-free 0.301
4IO9 Crystal structure of compound 4d bound to large ribosomal subunit (50S) from Deinococcus radiodurans 提交 2013-01-07 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 28 PDB 声明：30-meric
链 D 1–180（180 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 35 1F2 (3aS,4R,7R,8S,9S,10R,11R,13R,15R,15aR)-4-ethyl-11-methoxy-3a,7,9,11,13,15-hexamethyl-2,6,14-trioxo-10-{[3,4,6-trideoxy-3-(dimethylamino)-beta-D-xylo-hexopyranosyl]oxy}tetradecahydro-2H-oxacyclotetradecino[4,3-d][1,3]oxazol-8-yl (2R)-2-(pyridin-3-yl)pyrrolidine-1-carboxylate × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP
分辨率 3.20 Å R-free 0.235
4IOA Crystal structure of compound 4e bound to large ribosomal subunit (50S) from Deinococcus radiodurans 提交 2013-01-07 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 28 PDB 声明：30-meric
链 D 1–180（180 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 35 1F3 (3aS,4R,7R,8S,9S,10R,11R,13R,15R,15aR)-4-ethyl-11-methoxy-3a,7,9,11,13,15-hexamethyl-2,6,14-trioxo-10-{[3,4,6-trideoxy-3-(dimethylamino)-beta-D-xylo-hexopyranosyl]oxy}tetradecahydro-2H-oxacyclotetradecino[4,3-d][1,3]oxazol-8-yl (2R)-2-[4-(acetylamino)phenyl]-2,3-dihydro-1H-pyrrole-1-carboxylate × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP
分辨率 3.20 Å R-free 0.230
4IOC Crystal structure of compound 4f bound to large ribosomal subunit (50S) from Deinococcus radiodurans 提交 2013-01-07 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 28 PDB 声明：30-meric
链 D 1–180（180 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 35 1F4 (3aS,4R,7R,8S,9S,10R,11R,13R,15S,15aR)-4-ethyl-11-methoxy-3a,7,9,11,13,15-hexamethyl-2,6,14-trioxo-10-{[3,4,6-trideoxy-3-(dimethylamino)-beta-D-xylo-hexopyranosyl]oxy}tetradecahydro-2H-oxacyclotetradecino[4,3-d][1,3]oxazol-8-yl (2R)-4,4-dimethyl-2-(pyridin-3-yl)pyrrolidine-1-carboxylate × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP
分辨率 3.60 Å R-free 0.239
4U67 Crystal structure of the large ribosomal subunit (50S) of Deinococcus radiodurans containing a three residue insertion in L22 提交 2014-07-28 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 26 PDB 声明：28-meric
链 D 1–180（180 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 51 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；293 K；Magnesium chloride, HEPES, ammonium chloride, ethanol, 2-ethyl-1,3-hexandiol
分辨率 3.65 Å R-free 0.270
4WFN Crystal structure of the large ribosomal subunit (50S) of Deinococcus radiodurans containing a three residue insertion in L22 in complex with erythromycin 提交 2014-09-16 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 26 PDB 声明：28-meric
链 D 1–180（180 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 70 ERY ERYTHROMYCIN A × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；293 K；Magnesuim chloride, Hepes, ammonium chloride, ethanol, 2-ethyl-1,3-hexadiol
分辨率 3.54 Å R-free 0.282
5DM6 Crystal structure of the 50S ribosomal subunit from Deinococcus radiodurans 提交 2015-09-08 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 28 PDB 声明：30-meric
链 D 3–179（177 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 198 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；292 K；HEPES, sodium hydroxide, magnesium chloride, ammonium chloride, 2-mercaptoethanol, spermidine, 2-ethyl-1, 3-hexanediol, ethanol
分辨率 2.90 Å R-free 0.270
5DM7 Crystal structure of the 50S ribosomal subunit from Deinococcus radiodurans in complex with hygromycin A 提交 2015-09-08 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 28 PDB 声明：30-meric
链 D 3–179（177 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 186 HGR Hygromycin A × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；292 K；HEPES, sodium hydroxide, magnesium chloride, ammonium chloride, 2-mercaptoethanol, spermidine, 2-ethyl-1,3-hexanediol, ethanol
分辨率 3.00 Å R-free 0.326
5JVG The large ribosomal subunit from Deinococcus radiodurans in complex with avilamycin 提交 2016-05-11 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 27 PDB 声明：29-meric
链 D 1–180（180 aa）
未记录 6NO Avilamycin × 1 MG MAGNESIUM ION × 446 MPD (4S)-2-METHYL-2,4-PENTANEDIOL × 5 SPD SPERMIDINE × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；293.15 K；Ribosome solution containing 0.0065 mM (180 A/ml) of D50S in 10 mM Hepes pH=7.8, 15 mM MgCl2 and 75 mM NH4Cl crystallization buffer was mixed with 10 mM spermidine, 1 % ethanol and 0.5 % 2-ethyl-1,3-hexanediol precipitants. A 0.005 ml crystallization drop was hanged over 10 % ethanol and 5% 2-ethyl-1,3-hexanediol in ddw reservoir.
分辨率 3.43 Å R-free 0.253
5JVH The crystal structure large ribosomal subunit (50S) of Deinococcus radiodurans in complex with evernimicin 提交 2016-05-11 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 26 PDB 声明：28-meric
链 D 1–180（180 aa）
未记录 6O1 Evernimicin × 1 MG MAGNESIUM ION × 123 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；293 K；Magnesium chloride, HEPES, ammonium chloride, ethanol, 2-ethyl-1,3-hexandiol
分辨率 3.58 Å R-free 0.247
7A0R 50S Deinococcus radiodurans ribosome bounded with mycinamicin I 提交 2020-08-10 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 26 PDB 声明：28-meric
链 D 3–179（177 aa）
未记录 QTZ mycinamicin II × 1 MG MAGNESIUM ION × 345 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293.15 K；Ribosome solution containing 0.0065 mM (180 A/ml) of D50S in 10 mM Hepes pH=7.8, 15 mM MgCl2 and 75 mM NH4Cl crystallization buffer was mixed with 10 mM spermidine, 1 % ethanol and 0.5 % 2-ethyl-1,3-hexanediol precipitants. A 0.005 ml crystallization drop was hanged over 10 % ethanol and 5% 2-ethyl-1,3-hexanediol in ddw reservoir.
分辨率 3.30 Å R-free 0.249
7A0S 50S Deinococcus radiodurans ribosome bounded with mycinamicin I 提交 2020-08-10 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 26 PDB 声明：28-meric
链 D 3–179（177 aa）
未记录 QU2 mycinamicin I × 1 MG MAGNESIUM ION × 367 SPD SPERMIDINE × 8 MPD (4S)-2-METHYL-2,4-PENTANEDIOL × 4 NA SODIUM ION × 1 EOH ETHANOL × 1 CA CALCIUM ION × 5 K POTASSIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293.15 K；Ribosome solution containing 0.0065 mM (180 A/ml) of D50S in 10 mM Hepes pH=7.8, 15 mM MgCl2 and 75 mM NH4Cl crystallization buffer was mixed with 10 mM spermidine, 1 % ethanol and 0.5 % 2-ethyl-1,3-hexanediol precipitants. A 0.005 ml crystallization drop was hanged over 10 % ethanol and 5% 2-ethyl-1,3-hexanediol in ddw reservoir.
分辨率 3.22 Å R-free 0.253
7A18 50S Deinococcus radiodurans ribosome bounded with mycinamicin IV 提交 2020-08-12 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 26 PDB 声明：28-meric
链 D 2–177（176 aa）
未记录 MIV MYCINAMICIN IV × 1 MG MAGNESIUM ION × 277 SPD SPERMIDINE × 7 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；293.15 K；Ribosome solution containing 0.0065 mM (180 A/ml) of D50S in 10 mM Hepes pH=7.8, 15 mM MgCl2 and 75 mM NH4Cl crystallization buffer was mixed with 10 mM spermidine, 1 % ethanol and 0.5 % 2-ethyl-1,3-hexanediol precipitants. A 0.005 ml crystallization drop was hanged over 10 % ethanol and 5% 2-ethyl-1,3-hexanediol in ddw reservoir.
分辨率 3.40 Å R-free 0.318

共 23 个其他 PDB 条目、23 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 RL5_DEIRA
Isoform —
PDB实体 9
链与序列区间 作者链 D； PDB构建体 1–180； UniProt 1–180

50S RIBOSOMAL PROTEIN L6

物种未注明

UniProt Q9RSL3

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白–RNA 异源复合物 蛋白 × 29 RNA 2 PDB 声明：31-meric（31） 与全部聚合物数一致 链 E； UniProt 1–185 未记录 50S RIBOSOMAL PROTEIN L33 × 1 （Q9RSS4） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L34 × 1 （Q9RSH2） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L35 × 1 （Q9RSW6） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L36 × 1 （Q9RSK0） THIOSTREPTON × 1 （P0C8P8） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L2 × 1 （Q9RXJ9） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L3 × 1 （Q9RXK2） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L4 × 1 （Q9RXK1） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L5 × 1 （Q9RXJ0） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L11 × 1 （Q9RSS7） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L13 × 1 （Q9RXY1） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L14 × 1 （Q9RXJ2） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L15 × 1 （Q9RSK9） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L16 × 1 （Q9RXJ5） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L17 × 1 （Q9RSJ5） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L18 × 1 （Q9RSL2） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L19 × 1 （Q9RWB4） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L20 × 1 （Q9RSW7） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L21 × 1 （Q9RY64） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L22 × 1 （Q9RXJ7） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L23 × 1 （Q9RXK0） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L24 × 1 （Q9RXJ1） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L25 × 1 （Q9RX88） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L27 × 1 （Q9RY65） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L28 × 1 （Q9RRG8） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L29 × 1 （Q9RXJ4） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L30 × 1 （Q9RSL0） RRNA-23S RIBOSOMAL RNA × 1 50S RIBOSOMAL PROTEIN L32 × 1 （P49228） RRNA-5S RIBOSOMAL RNA × 1 MG MAGNESIUM ION × 36 X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP 分辨率 3.30 Å R-free 0.318

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 3CF5 Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
1NKW Crystal Structure Of The Large Ribosomal Subunit From Deinococcus Radiodurans 提交 2003-01-05 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 29 PDB 声明：31-meric
链 E 1–185（185 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；ETHANOL, DIMETHYLHEXANEDIOL, MGCL2, KCL, HEPES, NH4CL, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP
分辨率 3.10 Å R-free 0.274
1NWX COMPLEX OF THE LARGE RIBOSOMAL SUBUNIT FROM DEINOCOCCUS RADIODURANS WITH ABT-773 提交 2003-02-07 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 29 PDB 声明：31-meric
链 E 28–212（185 aa）
未记录 773 CETHROMYCIN × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；281 K；ETHANOL, DIMETHYLHEXANEDIOL, MGCL2, KCL, HEPES, NH4CL, pH 7.80, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 281K
分辨率 3.50 Å R-free 0.313
1NWY COMPLEX OF THE LARGE RIBOSOMAL SUBUNIT FROM DEINOCOCCUS RADIODURANS WITH AZITHROMYCIN 提交 2003-02-07 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 29 PDB 声明：31-meric
链 E 28–212（185 aa）
未记录 ZIT AZITHROMYCIN × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；291 K；ETHANOL, DIMETHYLHEXANEDIOL, MGCL2, KCL, HEPES, NH4CL, pH 7.80, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K
分辨率 3.30 Å R-free 0.304
1SM1 COMPLEX OF THE LARGE RIBOSOMAL SUBUNIT FROM DEINOCOCCUS RADIODURANS WITH QUINUPRISTIN AND DALFOPRISTIN 提交 2004-03-08 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 30 PDB 声明：32-meric
链 E 1–212（212 aa）
未记录 DOL 5-(2-DIETHYLAMINO-ETHANESULFONYL)-21-HYDROXY-10-ISOPROPYL-11,19-DIMETHYL-9,26-DIOXA-3,15,28-TRIAZA-TRICYCLO[23.2.1.00,255]OCTACOSA-1(27),12,17,19,25(28)-PENTAENE-2,8,14,23-TETRAONE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 7.8；ETHANOL, DIMETHYLHEXANEDIOL, MGCL2, KCL, HEPES, NH4CL , PH 7.80, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, TEMPERATURE 290K
分辨率 3.42 Å R-free 0.348
1XBP Inhibition of peptide bond formation by pleuromutilins: The structure of the 50S ribosomal subunit from Deinococcus radiodurans in complex with Tiamulin 提交 2004-08-31 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 29 PDB 声明：31-meric
链 E 1–185（185 aa）
未记录 MUL TIAMULIN × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；280 K；ETHANOL, DIMETHYLHEXANEDIOL, MGCL2,KCL, HEPES, NH4CL, pH 7.80, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 280K
分辨率 3.50 Å R-free 0.360
2ZJP Thiopeptide antibiotic Nosiheptide bound to the large ribosomal subunit of Deinococcus radiodurans 提交 2008-03-07 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 29 PDB 声明：31-meric
链 E 1–185（185 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 NO1 4-(hydroxymethyl)-3-methyl-1H-indole-2-carboxylic acid × 1 MG MAGNESIUM ION × 35 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP
分辨率 3.70 Å R-free 0.340
2ZJQ Interaction of L7 with L11 induced by Microccocin binding to the Deinococcus radiodurans 50S subunit 提交 2008-03-08 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 29 PDB 声明：31-meric
链 E 1–185（185 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP
分辨率 3.30 Å R-free 0.339
2ZJR Refined native structure of the large ribosomal subunit (50S) from Deinococcus radiodurans 提交 2008-03-08 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 28 PDB 声明：30-meric
链 E 1–185（185 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 35 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP
分辨率 2.91 Å R-free 0.311
3DLL The oxazolidinone antibiotics perturb the ribosomal peptidyl-transferase center and effect tRNA positioning 提交 2008-06-27 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 28 PDB 声明：30-meric
链 E 1–185（185 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 35 ZLD N-{[(5S)-3-(3-fluoro-4-morpholin-4-ylphenyl)-2-oxo-1,3-oxazolidin-5-yl]methyl}acetamide × 1 ZN ZINC ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；10mM MgCl2, 60mM NH4Cl, 5mM KCl, 10mM HEPES, pH7.8, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP
分辨率 3.50 Å R-free 0.280
3PIO Crystal structure of the synergistic antibiotic pair lankamycin and lankacidin in complex with the large ribosomal subunit 提交 2010-11-07 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 28 PDB 声明：30-meric
链 E 1–185（185 aa）
未记录 LMA Lankamycin × 1 MG MAGNESIUM ION × 154 NA SODIUM ION × 42 K POTASSIUM ION × 15 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP. 15% 2:1 ethanol:methylpentanediol was diffused to a hanging drop of 180 AU/ml solution of D50S.
分辨率 3.25 Å R-free 0.294
3PIP Crystal structure of the synergistic antibiotic pair lankamycin and lankacidin in complex with the large ribosomal subunit 提交 2010-11-07 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 28 PDB 声明：30-meric
链 E 1–185（185 aa）
未记录 LC2 N-[(1S,2R,3E,5E,7S,9E,11E,13S,15R,19R)-7,13-dihydroxy-1,4,10,19-tetramethyl-17,18-dioxo-16-oxabicyclo[13.2.2]nonadeca-3,5,9,11-tetraen-2-yl]-2-oxopropanamide × 1 LMA Lankamycin × 1 MG MAGNESIUM ION × 73 K POTASSIUM ION × 4 NA SODIUM ION × 5 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP. 15% 2:1 ethanol:methylpentanediol was diffused to a hanging drop of 180 AU/ml solution of D50S.
分辨率 3.45 Å R-free 0.301
4IO9 Crystal structure of compound 4d bound to large ribosomal subunit (50S) from Deinococcus radiodurans 提交 2013-01-07 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 28 PDB 声明：30-meric
链 E 1–185（185 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 35 1F2 (3aS,4R,7R,8S,9S,10R,11R,13R,15R,15aR)-4-ethyl-11-methoxy-3a,7,9,11,13,15-hexamethyl-2,6,14-trioxo-10-{[3,4,6-trideoxy-3-(dimethylamino)-beta-D-xylo-hexopyranosyl]oxy}tetradecahydro-2H-oxacyclotetradecino[4,3-d][1,3]oxazol-8-yl (2R)-2-(pyridin-3-yl)pyrrolidine-1-carboxylate × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP
分辨率 3.20 Å R-free 0.235
4IOA Crystal structure of compound 4e bound to large ribosomal subunit (50S) from Deinococcus radiodurans 提交 2013-01-07 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 28 PDB 声明：30-meric
链 E 1–185（185 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 35 1F3 (3aS,4R,7R,8S,9S,10R,11R,13R,15R,15aR)-4-ethyl-11-methoxy-3a,7,9,11,13,15-hexamethyl-2,6,14-trioxo-10-{[3,4,6-trideoxy-3-(dimethylamino)-beta-D-xylo-hexopyranosyl]oxy}tetradecahydro-2H-oxacyclotetradecino[4,3-d][1,3]oxazol-8-yl (2R)-2-[4-(acetylamino)phenyl]-2,3-dihydro-1H-pyrrole-1-carboxylate × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP
分辨率 3.20 Å R-free 0.230
4IOC Crystal structure of compound 4f bound to large ribosomal subunit (50S) from Deinococcus radiodurans 提交 2013-01-07 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 28 PDB 声明：30-meric
链 E 1–185（185 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 35 1F4 (3aS,4R,7R,8S,9S,10R,11R,13R,15S,15aR)-4-ethyl-11-methoxy-3a,7,9,11,13,15-hexamethyl-2,6,14-trioxo-10-{[3,4,6-trideoxy-3-(dimethylamino)-beta-D-xylo-hexopyranosyl]oxy}tetradecahydro-2H-oxacyclotetradecino[4,3-d][1,3]oxazol-8-yl (2R)-4,4-dimethyl-2-(pyridin-3-yl)pyrrolidine-1-carboxylate × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP
分辨率 3.60 Å R-free 0.239
4U67 Crystal structure of the large ribosomal subunit (50S) of Deinococcus radiodurans containing a three residue insertion in L22 提交 2014-07-28 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 26 PDB 声明：28-meric
链 E 1–185（185 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 51 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；293 K；Magnesium chloride, HEPES, ammonium chloride, ethanol, 2-ethyl-1,3-hexandiol
分辨率 3.65 Å R-free 0.270
4WFN Crystal structure of the large ribosomal subunit (50S) of Deinococcus radiodurans containing a three residue insertion in L22 in complex with erythromycin 提交 2014-09-16 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 26 PDB 声明：28-meric
链 E 1–185（185 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 70 ERY ERYTHROMYCIN A × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；293 K；Magnesuim chloride, Hepes, ammonium chloride, ethanol, 2-ethyl-1,3-hexadiol
分辨率 3.54 Å R-free 0.282
5DM6 Crystal structure of the 50S ribosomal subunit from Deinococcus radiodurans 提交 2015-09-08 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 28 PDB 声明：30-meric
链 E 5–175（171 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 198 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；292 K；HEPES, sodium hydroxide, magnesium chloride, ammonium chloride, 2-mercaptoethanol, spermidine, 2-ethyl-1, 3-hexanediol, ethanol
分辨率 2.90 Å R-free 0.270
5DM7 Crystal structure of the 50S ribosomal subunit from Deinococcus radiodurans in complex with hygromycin A 提交 2015-09-08 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 28 PDB 声明：30-meric
链 E 5–175（171 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 186 HGR Hygromycin A × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；292 K；HEPES, sodium hydroxide, magnesium chloride, ammonium chloride, 2-mercaptoethanol, spermidine, 2-ethyl-1,3-hexanediol, ethanol
分辨率 3.00 Å R-free 0.326
5JVG The large ribosomal subunit from Deinococcus radiodurans in complex with avilamycin 提交 2016-05-11 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 27 PDB 声明：29-meric
链 E 1–185（185 aa）
未记录 6NO Avilamycin × 1 MG MAGNESIUM ION × 446 MPD (4S)-2-METHYL-2,4-PENTANEDIOL × 5 SPD SPERMIDINE × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；293.15 K；Ribosome solution containing 0.0065 mM (180 A/ml) of D50S in 10 mM Hepes pH=7.8, 15 mM MgCl2 and 75 mM NH4Cl crystallization buffer was mixed with 10 mM spermidine, 1 % ethanol and 0.5 % 2-ethyl-1,3-hexanediol precipitants. A 0.005 ml crystallization drop was hanged over 10 % ethanol and 5% 2-ethyl-1,3-hexanediol in ddw reservoir.
分辨率 3.43 Å R-free 0.253
5JVH The crystal structure large ribosomal subunit (50S) of Deinococcus radiodurans in complex with evernimicin 提交 2016-05-11 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 26 PDB 声明：28-meric
链 E 1–185（185 aa）
未记录 6O1 Evernimicin × 1 MG MAGNESIUM ION × 123 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；293 K；Magnesium chloride, HEPES, ammonium chloride, ethanol, 2-ethyl-1,3-hexandiol
分辨率 3.58 Å R-free 0.247
7A0R 50S Deinococcus radiodurans ribosome bounded with mycinamicin I 提交 2020-08-10 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 26 PDB 声明：28-meric
链 E 5–175（171 aa）
未记录 QTZ mycinamicin II × 1 MG MAGNESIUM ION × 345 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293.15 K；Ribosome solution containing 0.0065 mM (180 A/ml) of D50S in 10 mM Hepes pH=7.8, 15 mM MgCl2 and 75 mM NH4Cl crystallization buffer was mixed with 10 mM spermidine, 1 % ethanol and 0.5 % 2-ethyl-1,3-hexanediol precipitants. A 0.005 ml crystallization drop was hanged over 10 % ethanol and 5% 2-ethyl-1,3-hexanediol in ddw reservoir.
分辨率 3.30 Å R-free 0.249
7A0S 50S Deinococcus radiodurans ribosome bounded with mycinamicin I 提交 2020-08-10 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 26 PDB 声明：28-meric
链 E 5–175（171 aa）
未记录 QU2 mycinamicin I × 1 MG MAGNESIUM ION × 367 SPD SPERMIDINE × 8 MPD (4S)-2-METHYL-2,4-PENTANEDIOL × 4 NA SODIUM ION × 1 EOH ETHANOL × 1 CA CALCIUM ION × 5 K POTASSIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293.15 K；Ribosome solution containing 0.0065 mM (180 A/ml) of D50S in 10 mM Hepes pH=7.8, 15 mM MgCl2 and 75 mM NH4Cl crystallization buffer was mixed with 10 mM spermidine, 1 % ethanol and 0.5 % 2-ethyl-1,3-hexanediol precipitants. A 0.005 ml crystallization drop was hanged over 10 % ethanol and 5% 2-ethyl-1,3-hexanediol in ddw reservoir.
分辨率 3.22 Å R-free 0.253
7A18 50S Deinococcus radiodurans ribosome bounded with mycinamicin IV 提交 2020-08-12 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 26 PDB 声明：28-meric
链 E 5–175（171 aa）
未记录 MIV MYCINAMICIN IV × 1 MG MAGNESIUM ION × 277 SPD SPERMIDINE × 7 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；293.15 K；Ribosome solution containing 0.0065 mM (180 A/ml) of D50S in 10 mM Hepes pH=7.8, 15 mM MgCl2 and 75 mM NH4Cl crystallization buffer was mixed with 10 mM spermidine, 1 % ethanol and 0.5 % 2-ethyl-1,3-hexanediol precipitants. A 0.005 ml crystallization drop was hanged over 10 % ethanol and 5% 2-ethyl-1,3-hexanediol in ddw reservoir.
分辨率 3.40 Å R-free 0.318

共 23 个其他 PDB 条目、23 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 RL6_DEIRA
Isoform —
PDB实体 10
链与序列区间 作者链 E； PDB构建体 1–185； UniProt 1–185

50S RIBOSOMAL PROTEIN L11

物种未注明

UniProt Q9RSS7

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白–RNA 异源复合物 蛋白 × 29 RNA 2 PDB 声明：31-meric（31） 与全部聚合物数一致 链 F； UniProt 1–144 未记录 50S RIBOSOMAL PROTEIN L33 × 1 （Q9RSS4） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L34 × 1 （Q9RSH2） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L35 × 1 （Q9RSW6） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L36 × 1 （Q9RSK0） THIOSTREPTON × 1 （P0C8P8） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L2 × 1 （Q9RXJ9） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L3 × 1 （Q9RXK2） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L4 × 1 （Q9RXK1） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L5 × 1 （Q9RXJ0） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L6 × 1 （Q9RSL3） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L13 × 1 （Q9RXY1） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L14 × 1 （Q9RXJ2） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L15 × 1 （Q9RSK9） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L16 × 1 （Q9RXJ5） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L17 × 1 （Q9RSJ5） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L18 × 1 （Q9RSL2） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L19 × 1 （Q9RWB4） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L20 × 1 （Q9RSW7） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L21 × 1 （Q9RY64） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L22 × 1 （Q9RXJ7） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L23 × 1 （Q9RXK0） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L24 × 1 （Q9RXJ1） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L25 × 1 （Q9RX88） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L27 × 1 （Q9RY65） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L28 × 1 （Q9RRG8） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L29 × 1 （Q9RXJ4） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L30 × 1 （Q9RSL0） RRNA-23S RIBOSOMAL RNA × 1 50S RIBOSOMAL PROTEIN L32 × 1 （P49228） RRNA-5S RIBOSOMAL RNA × 1 MG MAGNESIUM ION × 36 X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP 分辨率 3.30 Å R-free 0.318

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 3CF5 Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
1NKW Crystal Structure Of The Large Ribosomal Subunit From Deinococcus Radiodurans 提交 2003-01-05 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 29 PDB 声明：31-meric
链 G 1–144（144 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；ETHANOL, DIMETHYLHEXANEDIOL, MGCL2, KCL, HEPES, NH4CL, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP
分辨率 3.10 Å R-free 0.274
1NWX COMPLEX OF THE LARGE RIBOSOMAL SUBUNIT FROM DEINOCOCCUS RADIODURANS WITH ABT-773 提交 2003-02-07 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 29 PDB 声明：31-meric
链 G 1–144（144 aa）
未记录 773 CETHROMYCIN × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；281 K；ETHANOL, DIMETHYLHEXANEDIOL, MGCL2, KCL, HEPES, NH4CL, pH 7.80, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 281K
分辨率 3.50 Å R-free 0.313
1NWY COMPLEX OF THE LARGE RIBOSOMAL SUBUNIT FROM DEINOCOCCUS RADIODURANS WITH AZITHROMYCIN 提交 2003-02-07 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 29 PDB 声明：31-meric
链 G 1–144（144 aa）
未记录 ZIT AZITHROMYCIN × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；291 K；ETHANOL, DIMETHYLHEXANEDIOL, MGCL2, KCL, HEPES, NH4CL, pH 7.80, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K
分辨率 3.30 Å R-free 0.304
1SM1 COMPLEX OF THE LARGE RIBOSOMAL SUBUNIT FROM DEINOCOCCUS RADIODURANS WITH QUINUPRISTIN AND DALFOPRISTIN 提交 2004-03-08 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 30 PDB 声明：32-meric
链 G 1–144（144 aa）
未记录 DOL 5-(2-DIETHYLAMINO-ETHANESULFONYL)-21-HYDROXY-10-ISOPROPYL-11,19-DIMETHYL-9,26-DIOXA-3,15,28-TRIAZA-TRICYCLO[23.2.1.00,255]OCTACOSA-1(27),12,17,19,25(28)-PENTAENE-2,8,14,23-TETRAONE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 7.8；ETHANOL, DIMETHYLHEXANEDIOL, MGCL2, KCL, HEPES, NH4CL , PH 7.80, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, TEMPERATURE 290K
分辨率 3.42 Å R-free 0.348
1XBP Inhibition of peptide bond formation by pleuromutilins: The structure of the 50S ribosomal subunit from Deinococcus radiodurans in complex with Tiamulin 提交 2004-08-31 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 29 PDB 声明：31-meric
链 G 1–144（144 aa）
未记录 MUL TIAMULIN × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；280 K；ETHANOL, DIMETHYLHEXANEDIOL, MGCL2,KCL, HEPES, NH4CL, pH 7.80, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 280K
分辨率 3.50 Å R-free 0.360
2ZJP Thiopeptide antibiotic Nosiheptide bound to the large ribosomal subunit of Deinococcus radiodurans 提交 2008-03-07 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 29 PDB 声明：31-meric
链 F 1–144（144 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 NO1 4-(hydroxymethyl)-3-methyl-1H-indole-2-carboxylic acid × 1 MG MAGNESIUM ION × 35 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP
分辨率 3.70 Å R-free 0.340
2ZJQ Interaction of L7 with L11 induced by Microccocin binding to the Deinococcus radiodurans 50S subunit 提交 2008-03-08 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 29 PDB 声明：31-meric
链 F 1–144（144 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP
分辨率 3.30 Å R-free 0.339
2ZJR Refined native structure of the large ribosomal subunit (50S) from Deinococcus radiodurans 提交 2008-03-08 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 28 PDB 声明：30-meric
链 F 1–144（144 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 35 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP
分辨率 2.91 Å R-free 0.311
3DLL The oxazolidinone antibiotics perturb the ribosomal peptidyl-transferase center and effect tRNA positioning 提交 2008-06-27 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 28 PDB 声明：30-meric
链 F 1–144（144 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 35 ZLD N-{[(5S)-3-(3-fluoro-4-morpholin-4-ylphenyl)-2-oxo-1,3-oxazolidin-5-yl]methyl}acetamide × 1 ZN ZINC ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；10mM MgCl2, 60mM NH4Cl, 5mM KCl, 10mM HEPES, pH7.8, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP
分辨率 3.50 Å R-free 0.280
3PIO Crystal structure of the synergistic antibiotic pair lankamycin and lankacidin in complex with the large ribosomal subunit 提交 2010-11-07 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 28 PDB 声明：30-meric
链 F 1–144（144 aa）
未记录 LMA Lankamycin × 1 MG MAGNESIUM ION × 154 NA SODIUM ION × 42 K POTASSIUM ION × 15 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP. 15% 2:1 ethanol:methylpentanediol was diffused to a hanging drop of 180 AU/ml solution of D50S.
分辨率 3.25 Å R-free 0.294
3PIP Crystal structure of the synergistic antibiotic pair lankamycin and lankacidin in complex with the large ribosomal subunit 提交 2010-11-07 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 28 PDB 声明：30-meric
链 F 1–144（144 aa）
未记录 LC2 N-[(1S,2R,3E,5E,7S,9E,11E,13S,15R,19R)-7,13-dihydroxy-1,4,10,19-tetramethyl-17,18-dioxo-16-oxabicyclo[13.2.2]nonadeca-3,5,9,11-tetraen-2-yl]-2-oxopropanamide × 1 LMA Lankamycin × 1 MG MAGNESIUM ION × 73 K POTASSIUM ION × 4 NA SODIUM ION × 5 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP. 15% 2:1 ethanol:methylpentanediol was diffused to a hanging drop of 180 AU/ml solution of D50S.
分辨率 3.45 Å R-free 0.301
4IO9 Crystal structure of compound 4d bound to large ribosomal subunit (50S) from Deinococcus radiodurans 提交 2013-01-07 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 28 PDB 声明：30-meric
链 F 1–144（144 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 35 1F2 (3aS,4R,7R,8S,9S,10R,11R,13R,15R,15aR)-4-ethyl-11-methoxy-3a,7,9,11,13,15-hexamethyl-2,6,14-trioxo-10-{[3,4,6-trideoxy-3-(dimethylamino)-beta-D-xylo-hexopyranosyl]oxy}tetradecahydro-2H-oxacyclotetradecino[4,3-d][1,3]oxazol-8-yl (2R)-2-(pyridin-3-yl)pyrrolidine-1-carboxylate × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP
分辨率 3.20 Å R-free 0.235
4IOA Crystal structure of compound 4e bound to large ribosomal subunit (50S) from Deinococcus radiodurans 提交 2013-01-07 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 28 PDB 声明：30-meric
链 F 1–144（144 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 35 1F3 (3aS,4R,7R,8S,9S,10R,11R,13R,15R,15aR)-4-ethyl-11-methoxy-3a,7,9,11,13,15-hexamethyl-2,6,14-trioxo-10-{[3,4,6-trideoxy-3-(dimethylamino)-beta-D-xylo-hexopyranosyl]oxy}tetradecahydro-2H-oxacyclotetradecino[4,3-d][1,3]oxazol-8-yl (2R)-2-[4-(acetylamino)phenyl]-2,3-dihydro-1H-pyrrole-1-carboxylate × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP
分辨率 3.20 Å R-free 0.230
4IOC Crystal structure of compound 4f bound to large ribosomal subunit (50S) from Deinococcus radiodurans 提交 2013-01-07 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 28 PDB 声明：30-meric
链 F 1–144（144 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 35 1F4 (3aS,4R,7R,8S,9S,10R,11R,13R,15S,15aR)-4-ethyl-11-methoxy-3a,7,9,11,13,15-hexamethyl-2,6,14-trioxo-10-{[3,4,6-trideoxy-3-(dimethylamino)-beta-D-xylo-hexopyranosyl]oxy}tetradecahydro-2H-oxacyclotetradecino[4,3-d][1,3]oxazol-8-yl (2R)-4,4-dimethyl-2-(pyridin-3-yl)pyrrolidine-1-carboxylate × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP
分辨率 3.60 Å R-free 0.239
5DM6 Crystal structure of the 50S ribosomal subunit from Deinococcus radiodurans 提交 2015-09-08 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 28 PDB 声明：30-meric
链 F 4–144（141 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 198 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；292 K；HEPES, sodium hydroxide, magnesium chloride, ammonium chloride, 2-mercaptoethanol, spermidine, 2-ethyl-1, 3-hexanediol, ethanol
分辨率 2.90 Å R-free 0.270
5DM7 Crystal structure of the 50S ribosomal subunit from Deinococcus radiodurans in complex with hygromycin A 提交 2015-09-08 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 28 PDB 声明：30-meric
链 F 1–144（144 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 186 HGR Hygromycin A × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；292 K；HEPES, sodium hydroxide, magnesium chloride, ammonium chloride, 2-mercaptoethanol, spermidine, 2-ethyl-1,3-hexanediol, ethanol
分辨率 3.00 Å R-free 0.326
5JVG The large ribosomal subunit from Deinococcus radiodurans in complex with avilamycin 提交 2016-05-11 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 27 PDB 声明：29-meric
链 F 1–144（144 aa）
未记录 6NO Avilamycin × 1 MG MAGNESIUM ION × 446 MPD (4S)-2-METHYL-2,4-PENTANEDIOL × 5 SPD SPERMIDINE × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；293.15 K；Ribosome solution containing 0.0065 mM (180 A/ml) of D50S in 10 mM Hepes pH=7.8, 15 mM MgCl2 and 75 mM NH4Cl crystallization buffer was mixed with 10 mM spermidine, 1 % ethanol and 0.5 % 2-ethyl-1,3-hexanediol precipitants. A 0.005 ml crystallization drop was hanged over 10 % ethanol and 5% 2-ethyl-1,3-hexanediol in ddw reservoir.
分辨率 3.43 Å R-free 0.253

共 17 个其他 PDB 条目、17 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 RL11_DEIRA
Isoform —
PDB实体 11
链与序列区间 作者链 F； PDB构建体 1–144； UniProt 1–144

50S RIBOSOMAL PROTEIN L13

物种未注明

UniProt Q9RXY1

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白–RNA 异源复合物 蛋白 × 29 RNA 2 PDB 声明：31-meric（31） 与全部聚合物数一致 链 G； UniProt 1–174 未记录 50S RIBOSOMAL PROTEIN L33 × 1 （Q9RSS4） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L34 × 1 （Q9RSH2） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L35 × 1 （Q9RSW6） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L36 × 1 （Q9RSK0） THIOSTREPTON × 1 （P0C8P8） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L2 × 1 （Q9RXJ9） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L3 × 1 （Q9RXK2） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L4 × 1 （Q9RXK1） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L5 × 1 （Q9RXJ0） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L6 × 1 （Q9RSL3） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L11 × 1 （Q9RSS7） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L14 × 1 （Q9RXJ2） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L15 × 1 （Q9RSK9） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L16 × 1 （Q9RXJ5） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L17 × 1 （Q9RSJ5） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L18 × 1 （Q9RSL2） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L19 × 1 （Q9RWB4） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L20 × 1 （Q9RSW7） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L21 × 1 （Q9RY64） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L22 × 1 （Q9RXJ7） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L23 × 1 （Q9RXK0） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L24 × 1 （Q9RXJ1） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L25 × 1 （Q9RX88） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L27 × 1 （Q9RY65） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L28 × 1 （Q9RRG8） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L29 × 1 （Q9RXJ4） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L30 × 1 （Q9RSL0） RRNA-23S RIBOSOMAL RNA × 1 50S RIBOSOMAL PROTEIN L32 × 1 （P49228） RRNA-5S RIBOSOMAL RNA × 1 MG MAGNESIUM ION × 36 X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP 分辨率 3.30 Å R-free 0.318

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 3CF5 Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
1NKW Crystal Structure Of The Large Ribosomal Subunit From Deinococcus Radiodurans 提交 2003-01-05 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 29 PDB 声明：31-meric
链 H 1–174（174 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；ETHANOL, DIMETHYLHEXANEDIOL, MGCL2, KCL, HEPES, NH4CL, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP
分辨率 3.10 Å R-free 0.274
1NWX COMPLEX OF THE LARGE RIBOSOMAL SUBUNIT FROM DEINOCOCCUS RADIODURANS WITH ABT-773 提交 2003-02-07 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 29 PDB 声明：31-meric
链 H 1–174（174 aa）
未记录 773 CETHROMYCIN × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；281 K；ETHANOL, DIMETHYLHEXANEDIOL, MGCL2, KCL, HEPES, NH4CL, pH 7.80, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 281K
分辨率 3.50 Å R-free 0.313
1NWY COMPLEX OF THE LARGE RIBOSOMAL SUBUNIT FROM DEINOCOCCUS RADIODURANS WITH AZITHROMYCIN 提交 2003-02-07 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 29 PDB 声明：31-meric
链 H 1–174（174 aa）
未记录 ZIT AZITHROMYCIN × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；291 K；ETHANOL, DIMETHYLHEXANEDIOL, MGCL2, KCL, HEPES, NH4CL, pH 7.80, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K
分辨率 3.30 Å R-free 0.304
1SM1 COMPLEX OF THE LARGE RIBOSOMAL SUBUNIT FROM DEINOCOCCUS RADIODURANS WITH QUINUPRISTIN AND DALFOPRISTIN 提交 2004-03-08 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 30 PDB 声明：32-meric
链 H 1–174（174 aa）
未记录 DOL 5-(2-DIETHYLAMINO-ETHANESULFONYL)-21-HYDROXY-10-ISOPROPYL-11,19-DIMETHYL-9,26-DIOXA-3,15,28-TRIAZA-TRICYCLO[23.2.1.00,255]OCTACOSA-1(27),12,17,19,25(28)-PENTAENE-2,8,14,23-TETRAONE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 7.8；ETHANOL, DIMETHYLHEXANEDIOL, MGCL2, KCL, HEPES, NH4CL , PH 7.80, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, TEMPERATURE 290K
分辨率 3.42 Å R-free 0.348
1XBP Inhibition of peptide bond formation by pleuromutilins: The structure of the 50S ribosomal subunit from Deinococcus radiodurans in complex with Tiamulin 提交 2004-08-31 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 29 PDB 声明：31-meric
链 H 1–174（174 aa）
未记录 MUL TIAMULIN × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；280 K；ETHANOL, DIMETHYLHEXANEDIOL, MGCL2,KCL, HEPES, NH4CL, pH 7.80, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 280K
分辨率 3.50 Å R-free 0.360
2ZJP Thiopeptide antibiotic Nosiheptide bound to the large ribosomal subunit of Deinococcus radiodurans 提交 2008-03-07 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 29 PDB 声明：31-meric
链 G 1–174（174 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 NO1 4-(hydroxymethyl)-3-methyl-1H-indole-2-carboxylic acid × 1 MG MAGNESIUM ION × 35 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP
分辨率 3.70 Å R-free 0.340
2ZJQ Interaction of L7 with L11 induced by Microccocin binding to the Deinococcus radiodurans 50S subunit 提交 2008-03-08 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 29 PDB 声明：31-meric
链 G 1–174（174 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP
分辨率 3.30 Å R-free 0.339
2ZJR Refined native structure of the large ribosomal subunit (50S) from Deinococcus radiodurans 提交 2008-03-08 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 28 PDB 声明：30-meric
链 G 1–174（174 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 35 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP
分辨率 2.91 Å R-free 0.311
3DLL The oxazolidinone antibiotics perturb the ribosomal peptidyl-transferase center and effect tRNA positioning 提交 2008-06-27 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 28 PDB 声明：30-meric
链 G 1–174（174 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 35 ZLD N-{[(5S)-3-(3-fluoro-4-morpholin-4-ylphenyl)-2-oxo-1,3-oxazolidin-5-yl]methyl}acetamide × 1 ZN ZINC ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；10mM MgCl2, 60mM NH4Cl, 5mM KCl, 10mM HEPES, pH7.8, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP
分辨率 3.50 Å R-free 0.280
3PIO Crystal structure of the synergistic antibiotic pair lankamycin and lankacidin in complex with the large ribosomal subunit 提交 2010-11-07 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 28 PDB 声明：30-meric
链 G 1–174（174 aa）
未记录 LMA Lankamycin × 1 MG MAGNESIUM ION × 154 NA SODIUM ION × 42 K POTASSIUM ION × 15 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP. 15% 2:1 ethanol:methylpentanediol was diffused to a hanging drop of 180 AU/ml solution of D50S.
分辨率 3.25 Å R-free 0.294
3PIP Crystal structure of the synergistic antibiotic pair lankamycin and lankacidin in complex with the large ribosomal subunit 提交 2010-11-07 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 28 PDB 声明：30-meric
链 G 1–174（174 aa）
未记录 LC2 N-[(1S,2R,3E,5E,7S,9E,11E,13S,15R,19R)-7,13-dihydroxy-1,4,10,19-tetramethyl-17,18-dioxo-16-oxabicyclo[13.2.2]nonadeca-3,5,9,11-tetraen-2-yl]-2-oxopropanamide × 1 LMA Lankamycin × 1 MG MAGNESIUM ION × 73 K POTASSIUM ION × 4 NA SODIUM ION × 5 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP. 15% 2:1 ethanol:methylpentanediol was diffused to a hanging drop of 180 AU/ml solution of D50S.
分辨率 3.45 Å R-free 0.301
4IO9 Crystal structure of compound 4d bound to large ribosomal subunit (50S) from Deinococcus radiodurans 提交 2013-01-07 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 28 PDB 声明：30-meric
链 G 1–174（174 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 35 1F2 (3aS,4R,7R,8S,9S,10R,11R,13R,15R,15aR)-4-ethyl-11-methoxy-3a,7,9,11,13,15-hexamethyl-2,6,14-trioxo-10-{[3,4,6-trideoxy-3-(dimethylamino)-beta-D-xylo-hexopyranosyl]oxy}tetradecahydro-2H-oxacyclotetradecino[4,3-d][1,3]oxazol-8-yl (2R)-2-(pyridin-3-yl)pyrrolidine-1-carboxylate × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP
分辨率 3.20 Å R-free 0.235
4IOA Crystal structure of compound 4e bound to large ribosomal subunit (50S) from Deinococcus radiodurans 提交 2013-01-07 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 28 PDB 声明：30-meric
链 G 1–174（174 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 35 1F3 (3aS,4R,7R,8S,9S,10R,11R,13R,15R,15aR)-4-ethyl-11-methoxy-3a,7,9,11,13,15-hexamethyl-2,6,14-trioxo-10-{[3,4,6-trideoxy-3-(dimethylamino)-beta-D-xylo-hexopyranosyl]oxy}tetradecahydro-2H-oxacyclotetradecino[4,3-d][1,3]oxazol-8-yl (2R)-2-[4-(acetylamino)phenyl]-2,3-dihydro-1H-pyrrole-1-carboxylate × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP
分辨率 3.20 Å R-free 0.230
4IOC Crystal structure of compound 4f bound to large ribosomal subunit (50S) from Deinococcus radiodurans 提交 2013-01-07 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 28 PDB 声明：30-meric
链 G 1–174（174 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 35 1F4 (3aS,4R,7R,8S,9S,10R,11R,13R,15S,15aR)-4-ethyl-11-methoxy-3a,7,9,11,13,15-hexamethyl-2,6,14-trioxo-10-{[3,4,6-trideoxy-3-(dimethylamino)-beta-D-xylo-hexopyranosyl]oxy}tetradecahydro-2H-oxacyclotetradecino[4,3-d][1,3]oxazol-8-yl (2R)-4,4-dimethyl-2-(pyridin-3-yl)pyrrolidine-1-carboxylate × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP
分辨率 3.60 Å R-free 0.239
4U67 Crystal structure of the large ribosomal subunit (50S) of Deinococcus radiodurans containing a three residue insertion in L22 提交 2014-07-28 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 26 PDB 声明：28-meric
链 G 1–174（174 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 51 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；293 K；Magnesium chloride, HEPES, ammonium chloride, ethanol, 2-ethyl-1,3-hexandiol
分辨率 3.65 Å R-free 0.270
4WFN Crystal structure of the large ribosomal subunit (50S) of Deinococcus radiodurans containing a three residue insertion in L22 in complex with erythromycin 提交 2014-09-16 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 26 PDB 声明：28-meric
链 G 1–174（174 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 70 ERY ERYTHROMYCIN A × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；293 K；Magnesuim chloride, Hepes, ammonium chloride, ethanol, 2-ethyl-1,3-hexadiol
分辨率 3.54 Å R-free 0.282
5DM6 Crystal structure of the 50S ribosomal subunit from Deinococcus radiodurans 提交 2015-09-08 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 28 PDB 声明：30-meric
链 G 30–171（142 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 198 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；292 K；HEPES, sodium hydroxide, magnesium chloride, ammonium chloride, 2-mercaptoethanol, spermidine, 2-ethyl-1, 3-hexanediol, ethanol
分辨率 2.90 Å R-free 0.270
5DM7 Crystal structure of the 50S ribosomal subunit from Deinococcus radiodurans in complex with hygromycin A 提交 2015-09-08 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 28 PDB 声明：30-meric
链 G 30–171（142 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 186 HGR Hygromycin A × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；292 K；HEPES, sodium hydroxide, magnesium chloride, ammonium chloride, 2-mercaptoethanol, spermidine, 2-ethyl-1,3-hexanediol, ethanol
分辨率 3.00 Å R-free 0.326
5JVG The large ribosomal subunit from Deinococcus radiodurans in complex with avilamycin 提交 2016-05-11 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 27 PDB 声明：29-meric
链 G 1–174（174 aa）
未记录 6NO Avilamycin × 1 MG MAGNESIUM ION × 446 MPD (4S)-2-METHYL-2,4-PENTANEDIOL × 5 SPD SPERMIDINE × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；293.15 K；Ribosome solution containing 0.0065 mM (180 A/ml) of D50S in 10 mM Hepes pH=7.8, 15 mM MgCl2 and 75 mM NH4Cl crystallization buffer was mixed with 10 mM spermidine, 1 % ethanol and 0.5 % 2-ethyl-1,3-hexanediol precipitants. A 0.005 ml crystallization drop was hanged over 10 % ethanol and 5% 2-ethyl-1,3-hexanediol in ddw reservoir.
分辨率 3.43 Å R-free 0.253
5JVH The crystal structure large ribosomal subunit (50S) of Deinococcus radiodurans in complex with evernimicin 提交 2016-05-11 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 26 PDB 声明：28-meric
链 G 1–174（174 aa）
未记录 6O1 Evernimicin × 1 MG MAGNESIUM ION × 123 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；293 K；Magnesium chloride, HEPES, ammonium chloride, ethanol, 2-ethyl-1,3-hexandiol
分辨率 3.58 Å R-free 0.247
7A0R 50S Deinococcus radiodurans ribosome bounded with mycinamicin I 提交 2020-08-10 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 26 PDB 声明：28-meric
链 G 30–172（143 aa）
未记录 QTZ mycinamicin II × 1 MG MAGNESIUM ION × 345 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293.15 K；Ribosome solution containing 0.0065 mM (180 A/ml) of D50S in 10 mM Hepes pH=7.8, 15 mM MgCl2 and 75 mM NH4Cl crystallization buffer was mixed with 10 mM spermidine, 1 % ethanol and 0.5 % 2-ethyl-1,3-hexanediol precipitants. A 0.005 ml crystallization drop was hanged over 10 % ethanol and 5% 2-ethyl-1,3-hexanediol in ddw reservoir.
分辨率 3.30 Å R-free 0.249
7A0S 50S Deinococcus radiodurans ribosome bounded with mycinamicin I 提交 2020-08-10 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 26 PDB 声明：28-meric
链 G 30–172（143 aa）
未记录 QU2 mycinamicin I × 1 MG MAGNESIUM ION × 367 SPD SPERMIDINE × 8 MPD (4S)-2-METHYL-2,4-PENTANEDIOL × 4 NA SODIUM ION × 1 EOH ETHANOL × 1 CA CALCIUM ION × 5 K POTASSIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293.15 K；Ribosome solution containing 0.0065 mM (180 A/ml) of D50S in 10 mM Hepes pH=7.8, 15 mM MgCl2 and 75 mM NH4Cl crystallization buffer was mixed with 10 mM spermidine, 1 % ethanol and 0.5 % 2-ethyl-1,3-hexanediol precipitants. A 0.005 ml crystallization drop was hanged over 10 % ethanol and 5% 2-ethyl-1,3-hexanediol in ddw reservoir.
分辨率 3.22 Å R-free 0.253
7A18 50S Deinococcus radiodurans ribosome bounded with mycinamicin IV 提交 2020-08-12 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 26 PDB 声明：28-meric
链 G 30–171（142 aa）
未记录 MIV MYCINAMICIN IV × 1 MG MAGNESIUM ION × 277 SPD SPERMIDINE × 7 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；293.15 K；Ribosome solution containing 0.0065 mM (180 A/ml) of D50S in 10 mM Hepes pH=7.8, 15 mM MgCl2 and 75 mM NH4Cl crystallization buffer was mixed with 10 mM spermidine, 1 % ethanol and 0.5 % 2-ethyl-1,3-hexanediol precipitants. A 0.005 ml crystallization drop was hanged over 10 % ethanol and 5% 2-ethyl-1,3-hexanediol in ddw reservoir.
分辨率 3.40 Å R-free 0.318

共 23 个其他 PDB 条目、23 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

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UniProt名称 RL13_DEIRA
Isoform —
PDB实体 12
链与序列区间 作者链 G； PDB构建体 1–174； UniProt 1–174

50S RIBOSOMAL PROTEIN L14

物种未注明

UniProt Q9RXJ2

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白–RNA 异源复合物 蛋白 × 29 RNA 2 PDB 声明：31-meric（31） 与全部聚合物数一致 链 H； UniProt 1–134 未记录 50S RIBOSOMAL PROTEIN L33 × 1 （Q9RSS4） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L34 × 1 （Q9RSH2） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L35 × 1 （Q9RSW6） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L36 × 1 （Q9RSK0） THIOSTREPTON × 1 （P0C8P8） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L2 × 1 （Q9RXJ9） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L3 × 1 （Q9RXK2） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L4 × 1 （Q9RXK1） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L5 × 1 （Q9RXJ0） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L6 × 1 （Q9RSL3） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L11 × 1 （Q9RSS7） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L13 × 1 （Q9RXY1） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L15 × 1 （Q9RSK9） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L16 × 1 （Q9RXJ5） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L17 × 1 （Q9RSJ5） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L18 × 1 （Q9RSL2） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L19 × 1 （Q9RWB4） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L20 × 1 （Q9RSW7） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L21 × 1 （Q9RY64） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L22 × 1 （Q9RXJ7） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L23 × 1 （Q9RXK0） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L24 × 1 （Q9RXJ1） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L25 × 1 （Q9RX88） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L27 × 1 （Q9RY65） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L28 × 1 （Q9RRG8） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L29 × 1 （Q9RXJ4） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L30 × 1 （Q9RSL0） RRNA-23S RIBOSOMAL RNA × 1 50S RIBOSOMAL PROTEIN L32 × 1 （P49228） RRNA-5S RIBOSOMAL RNA × 1 MG MAGNESIUM ION × 36 X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP 分辨率 3.30 Å R-free 0.318

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 3CF5 Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
1NKW Crystal Structure Of The Large Ribosomal Subunit From Deinococcus Radiodurans 提交 2003-01-05 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 29 PDB 声明：31-meric
链 I 1–134（134 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；ETHANOL, DIMETHYLHEXANEDIOL, MGCL2, KCL, HEPES, NH4CL, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP
分辨率 3.10 Å R-free 0.274
1NWX COMPLEX OF THE LARGE RIBOSOMAL SUBUNIT FROM DEINOCOCCUS RADIODURANS WITH ABT-773 提交 2003-02-07 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 29 PDB 声明：31-meric
链 I 1–134（134 aa）
未记录 773 CETHROMYCIN × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；281 K；ETHANOL, DIMETHYLHEXANEDIOL, MGCL2, KCL, HEPES, NH4CL, pH 7.80, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 281K
分辨率 3.50 Å R-free 0.313
1NWY COMPLEX OF THE LARGE RIBOSOMAL SUBUNIT FROM DEINOCOCCUS RADIODURANS WITH AZITHROMYCIN 提交 2003-02-07 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 29 PDB 声明：31-meric
链 I 1–134（134 aa）
未记录 ZIT AZITHROMYCIN × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；291 K；ETHANOL, DIMETHYLHEXANEDIOL, MGCL2, KCL, HEPES, NH4CL, pH 7.80, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K
分辨率 3.30 Å R-free 0.304
1SM1 COMPLEX OF THE LARGE RIBOSOMAL SUBUNIT FROM DEINOCOCCUS RADIODURANS WITH QUINUPRISTIN AND DALFOPRISTIN 提交 2004-03-08 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 30 PDB 声明：32-meric
链 I 1–134（134 aa）
未记录 DOL 5-(2-DIETHYLAMINO-ETHANESULFONYL)-21-HYDROXY-10-ISOPROPYL-11,19-DIMETHYL-9,26-DIOXA-3,15,28-TRIAZA-TRICYCLO[23.2.1.00,255]OCTACOSA-1(27),12,17,19,25(28)-PENTAENE-2,8,14,23-TETRAONE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 7.8；ETHANOL, DIMETHYLHEXANEDIOL, MGCL2, KCL, HEPES, NH4CL , PH 7.80, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, TEMPERATURE 290K
分辨率 3.42 Å R-free 0.348
1XBP Inhibition of peptide bond formation by pleuromutilins: The structure of the 50S ribosomal subunit from Deinococcus radiodurans in complex with Tiamulin 提交 2004-08-31 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 29 PDB 声明：31-meric
链 I 1–134（134 aa）
未记录 MUL TIAMULIN × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；280 K；ETHANOL, DIMETHYLHEXANEDIOL, MGCL2,KCL, HEPES, NH4CL, pH 7.80, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 280K
分辨率 3.50 Å R-free 0.360
2ZJP Thiopeptide antibiotic Nosiheptide bound to the large ribosomal subunit of Deinococcus radiodurans 提交 2008-03-07 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 29 PDB 声明：31-meric
链 H 1–134（134 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 NO1 4-(hydroxymethyl)-3-methyl-1H-indole-2-carboxylic acid × 1 MG MAGNESIUM ION × 35 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP
分辨率 3.70 Å R-free 0.340
2ZJQ Interaction of L7 with L11 induced by Microccocin binding to the Deinococcus radiodurans 50S subunit 提交 2008-03-08 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 29 PDB 声明：31-meric
链 H 1–134（134 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP
分辨率 3.30 Å R-free 0.339
2ZJR Refined native structure of the large ribosomal subunit (50S) from Deinococcus radiodurans 提交 2008-03-08 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 28 PDB 声明：30-meric
链 H 1–134（134 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 35 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP
分辨率 2.91 Å R-free 0.311
3DLL The oxazolidinone antibiotics perturb the ribosomal peptidyl-transferase center and effect tRNA positioning 提交 2008-06-27 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 28 PDB 声明：30-meric
链 H 1–134（134 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 35 ZLD N-{[(5S)-3-(3-fluoro-4-morpholin-4-ylphenyl)-2-oxo-1,3-oxazolidin-5-yl]methyl}acetamide × 1 ZN ZINC ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；10mM MgCl2, 60mM NH4Cl, 5mM KCl, 10mM HEPES, pH7.8, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP
分辨率 3.50 Å R-free 0.280
3PIO Crystal structure of the synergistic antibiotic pair lankamycin and lankacidin in complex with the large ribosomal subunit 提交 2010-11-07 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 28 PDB 声明：30-meric
链 H 1–134（134 aa）
未记录 LMA Lankamycin × 1 MG MAGNESIUM ION × 154 NA SODIUM ION × 42 K POTASSIUM ION × 15 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP. 15% 2:1 ethanol:methylpentanediol was diffused to a hanging drop of 180 AU/ml solution of D50S.
分辨率 3.25 Å R-free 0.294
3PIP Crystal structure of the synergistic antibiotic pair lankamycin and lankacidin in complex with the large ribosomal subunit 提交 2010-11-07 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 28 PDB 声明：30-meric
链 H 1–134（134 aa）
未记录 LC2 N-[(1S,2R,3E,5E,7S,9E,11E,13S,15R,19R)-7,13-dihydroxy-1,4,10,19-tetramethyl-17,18-dioxo-16-oxabicyclo[13.2.2]nonadeca-3,5,9,11-tetraen-2-yl]-2-oxopropanamide × 1 LMA Lankamycin × 1 MG MAGNESIUM ION × 73 K POTASSIUM ION × 4 NA SODIUM ION × 5 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP. 15% 2:1 ethanol:methylpentanediol was diffused to a hanging drop of 180 AU/ml solution of D50S.
分辨率 3.45 Å R-free 0.301
4IO9 Crystal structure of compound 4d bound to large ribosomal subunit (50S) from Deinococcus radiodurans 提交 2013-01-07 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 28 PDB 声明：30-meric
链 H 1–134（134 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 35 1F2 (3aS,4R,7R,8S,9S,10R,11R,13R,15R,15aR)-4-ethyl-11-methoxy-3a,7,9,11,13,15-hexamethyl-2,6,14-trioxo-10-{[3,4,6-trideoxy-3-(dimethylamino)-beta-D-xylo-hexopyranosyl]oxy}tetradecahydro-2H-oxacyclotetradecino[4,3-d][1,3]oxazol-8-yl (2R)-2-(pyridin-3-yl)pyrrolidine-1-carboxylate × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP
分辨率 3.20 Å R-free 0.235
4IOA Crystal structure of compound 4e bound to large ribosomal subunit (50S) from Deinococcus radiodurans 提交 2013-01-07 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 28 PDB 声明：30-meric
链 H 1–134（134 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 35 1F3 (3aS,4R,7R,8S,9S,10R,11R,13R,15R,15aR)-4-ethyl-11-methoxy-3a,7,9,11,13,15-hexamethyl-2,6,14-trioxo-10-{[3,4,6-trideoxy-3-(dimethylamino)-beta-D-xylo-hexopyranosyl]oxy}tetradecahydro-2H-oxacyclotetradecino[4,3-d][1,3]oxazol-8-yl (2R)-2-[4-(acetylamino)phenyl]-2,3-dihydro-1H-pyrrole-1-carboxylate × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP
分辨率 3.20 Å R-free 0.230
4IOC Crystal structure of compound 4f bound to large ribosomal subunit (50S) from Deinococcus radiodurans 提交 2013-01-07 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 28 PDB 声明：30-meric
链 H 1–134（134 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 35 1F4 (3aS,4R,7R,8S,9S,10R,11R,13R,15S,15aR)-4-ethyl-11-methoxy-3a,7,9,11,13,15-hexamethyl-2,6,14-trioxo-10-{[3,4,6-trideoxy-3-(dimethylamino)-beta-D-xylo-hexopyranosyl]oxy}tetradecahydro-2H-oxacyclotetradecino[4,3-d][1,3]oxazol-8-yl (2R)-4,4-dimethyl-2-(pyridin-3-yl)pyrrolidine-1-carboxylate × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP
分辨率 3.60 Å R-free 0.239
4U67 Crystal structure of the large ribosomal subunit (50S) of Deinococcus radiodurans containing a three residue insertion in L22 提交 2014-07-28 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 26 PDB 声明：28-meric
链 H 1–134（134 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 51 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；293 K；Magnesium chloride, HEPES, ammonium chloride, ethanol, 2-ethyl-1,3-hexandiol
分辨率 3.65 Å R-free 0.270
4WFN Crystal structure of the large ribosomal subunit (50S) of Deinococcus radiodurans containing a three residue insertion in L22 in complex with erythromycin 提交 2014-09-16 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 26 PDB 声明：28-meric
链 H 1–134（134 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 70 ERY ERYTHROMYCIN A × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；293 K；Magnesuim chloride, Hepes, ammonium chloride, ethanol, 2-ethyl-1,3-hexadiol
分辨率 3.54 Å R-free 0.282
5DM6 Crystal structure of the 50S ribosomal subunit from Deinococcus radiodurans 提交 2015-09-08 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 28 PDB 声明：30-meric
链 H 1–134（134 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 198 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；292 K；HEPES, sodium hydroxide, magnesium chloride, ammonium chloride, 2-mercaptoethanol, spermidine, 2-ethyl-1, 3-hexanediol, ethanol
分辨率 2.90 Å R-free 0.270
5DM7 Crystal structure of the 50S ribosomal subunit from Deinococcus radiodurans in complex with hygromycin A 提交 2015-09-08 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 28 PDB 声明：30-meric
链 H 1–134（134 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 186 HGR Hygromycin A × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；292 K；HEPES, sodium hydroxide, magnesium chloride, ammonium chloride, 2-mercaptoethanol, spermidine, 2-ethyl-1,3-hexanediol, ethanol
分辨率 3.00 Å R-free 0.326
5JVG The large ribosomal subunit from Deinococcus radiodurans in complex with avilamycin 提交 2016-05-11 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 27 PDB 声明：29-meric
链 H 1–134（134 aa）
未记录 6NO Avilamycin × 1 MG MAGNESIUM ION × 446 MPD (4S)-2-METHYL-2,4-PENTANEDIOL × 5 SPD SPERMIDINE × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；293.15 K；Ribosome solution containing 0.0065 mM (180 A/ml) of D50S in 10 mM Hepes pH=7.8, 15 mM MgCl2 and 75 mM NH4Cl crystallization buffer was mixed with 10 mM spermidine, 1 % ethanol and 0.5 % 2-ethyl-1,3-hexanediol precipitants. A 0.005 ml crystallization drop was hanged over 10 % ethanol and 5% 2-ethyl-1,3-hexanediol in ddw reservoir.
分辨率 3.43 Å R-free 0.253
5JVH The crystal structure large ribosomal subunit (50S) of Deinococcus radiodurans in complex with evernimicin 提交 2016-05-11 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 26 PDB 声明：28-meric
链 H 1–134（134 aa）
未记录 6O1 Evernimicin × 1 MG MAGNESIUM ION × 123 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；293 K；Magnesium chloride, HEPES, ammonium chloride, ethanol, 2-ethyl-1,3-hexandiol
分辨率 3.58 Å R-free 0.247
7A0R 50S Deinococcus radiodurans ribosome bounded with mycinamicin I 提交 2020-08-10 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 26 PDB 声明：28-meric
链 H 1–134（134 aa）
未记录 QTZ mycinamicin II × 1 MG MAGNESIUM ION × 345 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293.15 K；Ribosome solution containing 0.0065 mM (180 A/ml) of D50S in 10 mM Hepes pH=7.8, 15 mM MgCl2 and 75 mM NH4Cl crystallization buffer was mixed with 10 mM spermidine, 1 % ethanol and 0.5 % 2-ethyl-1,3-hexanediol precipitants. A 0.005 ml crystallization drop was hanged over 10 % ethanol and 5% 2-ethyl-1,3-hexanediol in ddw reservoir.
分辨率 3.30 Å R-free 0.249
7A0S 50S Deinococcus radiodurans ribosome bounded with mycinamicin I 提交 2020-08-10 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 26 PDB 声明：28-meric
链 H 1–134（134 aa）
未记录 QU2 mycinamicin I × 1 MG MAGNESIUM ION × 367 SPD SPERMIDINE × 8 MPD (4S)-2-METHYL-2,4-PENTANEDIOL × 4 NA SODIUM ION × 1 EOH ETHANOL × 1 CA CALCIUM ION × 5 K POTASSIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293.15 K；Ribosome solution containing 0.0065 mM (180 A/ml) of D50S in 10 mM Hepes pH=7.8, 15 mM MgCl2 and 75 mM NH4Cl crystallization buffer was mixed with 10 mM spermidine, 1 % ethanol and 0.5 % 2-ethyl-1,3-hexanediol precipitants. A 0.005 ml crystallization drop was hanged over 10 % ethanol and 5% 2-ethyl-1,3-hexanediol in ddw reservoir.
分辨率 3.22 Å R-free 0.253
7A18 50S Deinococcus radiodurans ribosome bounded with mycinamicin IV 提交 2020-08-12 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 26 PDB 声明：28-meric
链 H 1–134（134 aa）
未记录 MIV MYCINAMICIN IV × 1 MG MAGNESIUM ION × 277 SPD SPERMIDINE × 7 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；293.15 K；Ribosome solution containing 0.0065 mM (180 A/ml) of D50S in 10 mM Hepes pH=7.8, 15 mM MgCl2 and 75 mM NH4Cl crystallization buffer was mixed with 10 mM spermidine, 1 % ethanol and 0.5 % 2-ethyl-1,3-hexanediol precipitants. A 0.005 ml crystallization drop was hanged over 10 % ethanol and 5% 2-ethyl-1,3-hexanediol in ddw reservoir.
分辨率 3.40 Å R-free 0.318

共 23 个其他 PDB 条目、23 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 RL14_DEIRA
Isoform —
PDB实体 13
链与序列区间 作者链 H； PDB构建体 1–134； UniProt 1–134

50S RIBOSOMAL PROTEIN L15

物种未注明

UniProt Q9RSK9

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白–RNA 异源复合物 蛋白 × 29 RNA 2 PDB 声明：31-meric（31） 与全部聚合物数一致 链 I； UniProt 1–156 未记录 50S RIBOSOMAL PROTEIN L33 × 1 （Q9RSS4） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L34 × 1 （Q9RSH2） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L35 × 1 （Q9RSW6） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L36 × 1 （Q9RSK0） THIOSTREPTON × 1 （P0C8P8） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L2 × 1 （Q9RXJ9） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L3 × 1 （Q9RXK2） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L4 × 1 （Q9RXK1） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L5 × 1 （Q9RXJ0） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L6 × 1 （Q9RSL3） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L11 × 1 （Q9RSS7） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L13 × 1 （Q9RXY1） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L14 × 1 （Q9RXJ2） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L16 × 1 （Q9RXJ5） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L17 × 1 （Q9RSJ5） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L18 × 1 （Q9RSL2） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L19 × 1 （Q9RWB4） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L20 × 1 （Q9RSW7） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L21 × 1 （Q9RY64） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L22 × 1 （Q9RXJ7） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L23 × 1 （Q9RXK0） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L24 × 1 （Q9RXJ1） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L25 × 1 （Q9RX88） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L27 × 1 （Q9RY65） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L28 × 1 （Q9RRG8） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L29 × 1 （Q9RXJ4） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L30 × 1 （Q9RSL0） RRNA-23S RIBOSOMAL RNA × 1 50S RIBOSOMAL PROTEIN L32 × 1 （P49228） RRNA-5S RIBOSOMAL RNA × 1 MG MAGNESIUM ION × 36 X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP 分辨率 3.30 Å R-free 0.318

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 3CF5 Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
1NKW Crystal Structure Of The Large Ribosomal Subunit From Deinococcus Radiodurans 提交 2003-01-05 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 29 PDB 声明：31-meric
链 J 1–156（156 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；ETHANOL, DIMETHYLHEXANEDIOL, MGCL2, KCL, HEPES, NH4CL, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP
分辨率 3.10 Å R-free 0.274
1NWX COMPLEX OF THE LARGE RIBOSOMAL SUBUNIT FROM DEINOCOCCUS RADIODURANS WITH ABT-773 提交 2003-02-07 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 29 PDB 声明：31-meric
链 J 1–156（156 aa）
未记录 773 CETHROMYCIN × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；281 K；ETHANOL, DIMETHYLHEXANEDIOL, MGCL2, KCL, HEPES, NH4CL, pH 7.80, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 281K
分辨率 3.50 Å R-free 0.313
1NWY COMPLEX OF THE LARGE RIBOSOMAL SUBUNIT FROM DEINOCOCCUS RADIODURANS WITH AZITHROMYCIN 提交 2003-02-07 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 29 PDB 声明：31-meric
链 J 1–156（156 aa）
未记录 ZIT AZITHROMYCIN × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；291 K；ETHANOL, DIMETHYLHEXANEDIOL, MGCL2, KCL, HEPES, NH4CL, pH 7.80, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K
分辨率 3.30 Å R-free 0.304
1SM1 COMPLEX OF THE LARGE RIBOSOMAL SUBUNIT FROM DEINOCOCCUS RADIODURANS WITH QUINUPRISTIN AND DALFOPRISTIN 提交 2004-03-08 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 30 PDB 声明：32-meric
链 J 1–156（156 aa）
未记录 DOL 5-(2-DIETHYLAMINO-ETHANESULFONYL)-21-HYDROXY-10-ISOPROPYL-11,19-DIMETHYL-9,26-DIOXA-3,15,28-TRIAZA-TRICYCLO[23.2.1.00,255]OCTACOSA-1(27),12,17,19,25(28)-PENTAENE-2,8,14,23-TETRAONE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 7.8；ETHANOL, DIMETHYLHEXANEDIOL, MGCL2, KCL, HEPES, NH4CL , PH 7.80, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, TEMPERATURE 290K
分辨率 3.42 Å R-free 0.348
1XBP Inhibition of peptide bond formation by pleuromutilins: The structure of the 50S ribosomal subunit from Deinococcus radiodurans in complex with Tiamulin 提交 2004-08-31 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 29 PDB 声明：31-meric
链 J 1–156（156 aa）
未记录 MUL TIAMULIN × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；280 K；ETHANOL, DIMETHYLHEXANEDIOL, MGCL2,KCL, HEPES, NH4CL, pH 7.80, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 280K
分辨率 3.50 Å R-free 0.360
2ZJP Thiopeptide antibiotic Nosiheptide bound to the large ribosomal subunit of Deinococcus radiodurans 提交 2008-03-07 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 29 PDB 声明：31-meric
链 I 1–156（156 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 NO1 4-(hydroxymethyl)-3-methyl-1H-indole-2-carboxylic acid × 1 MG MAGNESIUM ION × 35 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP
分辨率 3.70 Å R-free 0.340
2ZJQ Interaction of L7 with L11 induced by Microccocin binding to the Deinococcus radiodurans 50S subunit 提交 2008-03-08 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 29 PDB 声明：31-meric
链 I 1–156（156 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP
分辨率 3.30 Å R-free 0.339
2ZJR Refined native structure of the large ribosomal subunit (50S) from Deinococcus radiodurans 提交 2008-03-08 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 28 PDB 声明：30-meric
链 I 1–156（156 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 35 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP
分辨率 2.91 Å R-free 0.311
3DLL The oxazolidinone antibiotics perturb the ribosomal peptidyl-transferase center and effect tRNA positioning 提交 2008-06-27 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 28 PDB 声明：30-meric
链 I 1–156（156 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 35 ZLD N-{[(5S)-3-(3-fluoro-4-morpholin-4-ylphenyl)-2-oxo-1,3-oxazolidin-5-yl]methyl}acetamide × 1 ZN ZINC ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；10mM MgCl2, 60mM NH4Cl, 5mM KCl, 10mM HEPES, pH7.8, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP
分辨率 3.50 Å R-free 0.280
3PIO Crystal structure of the synergistic antibiotic pair lankamycin and lankacidin in complex with the large ribosomal subunit 提交 2010-11-07 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 28 PDB 声明：30-meric
链 I 1–156（156 aa）
未记录 LMA Lankamycin × 1 MG MAGNESIUM ION × 154 NA SODIUM ION × 42 K POTASSIUM ION × 15 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP. 15% 2:1 ethanol:methylpentanediol was diffused to a hanging drop of 180 AU/ml solution of D50S.
分辨率 3.25 Å R-free 0.294
3PIP Crystal structure of the synergistic antibiotic pair lankamycin and lankacidin in complex with the large ribosomal subunit 提交 2010-11-07 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 28 PDB 声明：30-meric
链 I 1–156（156 aa）
未记录 LC2 N-[(1S,2R,3E,5E,7S,9E,11E,13S,15R,19R)-7,13-dihydroxy-1,4,10,19-tetramethyl-17,18-dioxo-16-oxabicyclo[13.2.2]nonadeca-3,5,9,11-tetraen-2-yl]-2-oxopropanamide × 1 LMA Lankamycin × 1 MG MAGNESIUM ION × 73 K POTASSIUM ION × 4 NA SODIUM ION × 5 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP. 15% 2:1 ethanol:methylpentanediol was diffused to a hanging drop of 180 AU/ml solution of D50S.
分辨率 3.45 Å R-free 0.301
4IO9 Crystal structure of compound 4d bound to large ribosomal subunit (50S) from Deinococcus radiodurans 提交 2013-01-07 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 28 PDB 声明：30-meric
链 I 1–156（156 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 35 1F2 (3aS,4R,7R,8S,9S,10R,11R,13R,15R,15aR)-4-ethyl-11-methoxy-3a,7,9,11,13,15-hexamethyl-2,6,14-trioxo-10-{[3,4,6-trideoxy-3-(dimethylamino)-beta-D-xylo-hexopyranosyl]oxy}tetradecahydro-2H-oxacyclotetradecino[4,3-d][1,3]oxazol-8-yl (2R)-2-(pyridin-3-yl)pyrrolidine-1-carboxylate × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP
分辨率 3.20 Å R-free 0.235
4IOA Crystal structure of compound 4e bound to large ribosomal subunit (50S) from Deinococcus radiodurans 提交 2013-01-07 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 28 PDB 声明：30-meric
链 I 1–156（156 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 35 1F3 (3aS,4R,7R,8S,9S,10R,11R,13R,15R,15aR)-4-ethyl-11-methoxy-3a,7,9,11,13,15-hexamethyl-2,6,14-trioxo-10-{[3,4,6-trideoxy-3-(dimethylamino)-beta-D-xylo-hexopyranosyl]oxy}tetradecahydro-2H-oxacyclotetradecino[4,3-d][1,3]oxazol-8-yl (2R)-2-[4-(acetylamino)phenyl]-2,3-dihydro-1H-pyrrole-1-carboxylate × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP
分辨率 3.20 Å R-free 0.230
4IOC Crystal structure of compound 4f bound to large ribosomal subunit (50S) from Deinococcus radiodurans 提交 2013-01-07 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 28 PDB 声明：30-meric
链 I 1–156（156 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 35 1F4 (3aS,4R,7R,8S,9S,10R,11R,13R,15S,15aR)-4-ethyl-11-methoxy-3a,7,9,11,13,15-hexamethyl-2,6,14-trioxo-10-{[3,4,6-trideoxy-3-(dimethylamino)-beta-D-xylo-hexopyranosyl]oxy}tetradecahydro-2H-oxacyclotetradecino[4,3-d][1,3]oxazol-8-yl (2R)-4,4-dimethyl-2-(pyridin-3-yl)pyrrolidine-1-carboxylate × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP
分辨率 3.60 Å R-free 0.239
4U67 Crystal structure of the large ribosomal subunit (50S) of Deinococcus radiodurans containing a three residue insertion in L22 提交 2014-07-28 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 26 PDB 声明：28-meric
链 I 1–156（156 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 51 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；293 K；Magnesium chloride, HEPES, ammonium chloride, ethanol, 2-ethyl-1,3-hexandiol
分辨率 3.65 Å R-free 0.270
4WFN Crystal structure of the large ribosomal subunit (50S) of Deinococcus radiodurans containing a three residue insertion in L22 in complex with erythromycin 提交 2014-09-16 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 26 PDB 声明：28-meric
链 I 1–156（156 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 70 ERY ERYTHROMYCIN A × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；293 K；Magnesuim chloride, Hepes, ammonium chloride, ethanol, 2-ethyl-1,3-hexadiol
分辨率 3.54 Å R-free 0.282
5DM6 Crystal structure of the 50S ribosomal subunit from Deinococcus radiodurans 提交 2015-09-08 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 28 PDB 声明：30-meric
链 I 4–144（141 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 198 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；292 K；HEPES, sodium hydroxide, magnesium chloride, ammonium chloride, 2-mercaptoethanol, spermidine, 2-ethyl-1, 3-hexanediol, ethanol
分辨率 2.90 Å R-free 0.270
5DM7 Crystal structure of the 50S ribosomal subunit from Deinococcus radiodurans in complex with hygromycin A 提交 2015-09-08 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 28 PDB 声明：30-meric
链 I 4–144（141 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 186 HGR Hygromycin A × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；292 K；HEPES, sodium hydroxide, magnesium chloride, ammonium chloride, 2-mercaptoethanol, spermidine, 2-ethyl-1,3-hexanediol, ethanol
分辨率 3.00 Å R-free 0.326
5JVG The large ribosomal subunit from Deinococcus radiodurans in complex with avilamycin 提交 2016-05-11 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 27 PDB 声明：29-meric
链 I 1–156（156 aa）
未记录 6NO Avilamycin × 1 MG MAGNESIUM ION × 446 MPD (4S)-2-METHYL-2,4-PENTANEDIOL × 5 SPD SPERMIDINE × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；293.15 K；Ribosome solution containing 0.0065 mM (180 A/ml) of D50S in 10 mM Hepes pH=7.8, 15 mM MgCl2 and 75 mM NH4Cl crystallization buffer was mixed with 10 mM spermidine, 1 % ethanol and 0.5 % 2-ethyl-1,3-hexanediol precipitants. A 0.005 ml crystallization drop was hanged over 10 % ethanol and 5% 2-ethyl-1,3-hexanediol in ddw reservoir.
分辨率 3.43 Å R-free 0.253
5JVH The crystal structure large ribosomal subunit (50S) of Deinococcus radiodurans in complex with evernimicin 提交 2016-05-11 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 26 PDB 声明：28-meric
链 I 1–156（156 aa）
未记录 6O1 Evernimicin × 1 MG MAGNESIUM ION × 123 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；293 K；Magnesium chloride, HEPES, ammonium chloride, ethanol, 2-ethyl-1,3-hexandiol
分辨率 3.58 Å R-free 0.247
7A0R 50S Deinococcus radiodurans ribosome bounded with mycinamicin I 提交 2020-08-10 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 26 PDB 声明：28-meric
链 I 1–137（137 aa）
未记录 QTZ mycinamicin II × 1 MG MAGNESIUM ION × 345 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293.15 K；Ribosome solution containing 0.0065 mM (180 A/ml) of D50S in 10 mM Hepes pH=7.8, 15 mM MgCl2 and 75 mM NH4Cl crystallization buffer was mixed with 10 mM spermidine, 1 % ethanol and 0.5 % 2-ethyl-1,3-hexanediol precipitants. A 0.005 ml crystallization drop was hanged over 10 % ethanol and 5% 2-ethyl-1,3-hexanediol in ddw reservoir.
分辨率 3.30 Å R-free 0.249
7A0S 50S Deinococcus radiodurans ribosome bounded with mycinamicin I 提交 2020-08-10 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 26 PDB 声明：28-meric
链 I 1–137（137 aa）
未记录 QU2 mycinamicin I × 1 MG MAGNESIUM ION × 367 SPD SPERMIDINE × 8 MPD (4S)-2-METHYL-2,4-PENTANEDIOL × 4 NA SODIUM ION × 1 EOH ETHANOL × 1 CA CALCIUM ION × 5 K POTASSIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293.15 K；Ribosome solution containing 0.0065 mM (180 A/ml) of D50S in 10 mM Hepes pH=7.8, 15 mM MgCl2 and 75 mM NH4Cl crystallization buffer was mixed with 10 mM spermidine, 1 % ethanol and 0.5 % 2-ethyl-1,3-hexanediol precipitants. A 0.005 ml crystallization drop was hanged over 10 % ethanol and 5% 2-ethyl-1,3-hexanediol in ddw reservoir.
分辨率 3.22 Å R-free 0.253
7A18 50S Deinococcus radiodurans ribosome bounded with mycinamicin IV 提交 2020-08-12 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 26 PDB 声明：28-meric
链 I 1–137（137 aa）
未记录 MIV MYCINAMICIN IV × 1 MG MAGNESIUM ION × 277 SPD SPERMIDINE × 7 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；293.15 K；Ribosome solution containing 0.0065 mM (180 A/ml) of D50S in 10 mM Hepes pH=7.8, 15 mM MgCl2 and 75 mM NH4Cl crystallization buffer was mixed with 10 mM spermidine, 1 % ethanol and 0.5 % 2-ethyl-1,3-hexanediol precipitants. A 0.005 ml crystallization drop was hanged over 10 % ethanol and 5% 2-ethyl-1,3-hexanediol in ddw reservoir.
分辨率 3.40 Å R-free 0.318

共 23 个其他 PDB 条目、23 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 RL15_DEIRA
Isoform —
PDB实体 14
链与序列区间 作者链 I； PDB构建体 1–156； UniProt 1–156

50S RIBOSOMAL PROTEIN L16

物种未注明

UniProt Q9RXJ5

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白–RNA 异源复合物 蛋白 × 29 RNA 2 PDB 声明：31-meric（31） 与全部聚合物数一致 链 J； UniProt 1–141 未记录 50S RIBOSOMAL PROTEIN L33 × 1 （Q9RSS4） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L34 × 1 （Q9RSH2） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L35 × 1 （Q9RSW6） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L36 × 1 （Q9RSK0） THIOSTREPTON × 1 （P0C8P8） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L2 × 1 （Q9RXJ9） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L3 × 1 （Q9RXK2） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L4 × 1 （Q9RXK1） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L5 × 1 （Q9RXJ0） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L6 × 1 （Q9RSL3） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L11 × 1 （Q9RSS7） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L13 × 1 （Q9RXY1） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L14 × 1 （Q9RXJ2） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L15 × 1 （Q9RSK9） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L17 × 1 （Q9RSJ5） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L18 × 1 （Q9RSL2） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L19 × 1 （Q9RWB4） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L20 × 1 （Q9RSW7） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L21 × 1 （Q9RY64） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L22 × 1 （Q9RXJ7） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L23 × 1 （Q9RXK0） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L24 × 1 （Q9RXJ1） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L25 × 1 （Q9RX88） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L27 × 1 （Q9RY65） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L28 × 1 （Q9RRG8） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L29 × 1 （Q9RXJ4） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L30 × 1 （Q9RSL0） RRNA-23S RIBOSOMAL RNA × 1 50S RIBOSOMAL PROTEIN L32 × 1 （P49228） RRNA-5S RIBOSOMAL RNA × 1 MG MAGNESIUM ION × 36 X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP 分辨率 3.30 Å R-free 0.318

数据库中的同蛋白其他状态

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其他 PDB 相对当前条目 3CF5 Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
1NJM The crystal structure of the 50S Large ribosomal subunit from Deinococcus radiodurans complexed with a tRNA acceptor stem mimic (ASM) and the antibiotic sparsomycin 提交 2003-01-02 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：tetrameric
链 K 2–142（141 aa）
未记录 SPS SPARSOMYCIN × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 ETHANOL, DIMETHYLHEXANEDIOL, MGCL2, KCL, HEPES, NH4CL, SPARSOMYCIN; SOAKING CRYSTALS IN: 0.025mM ASM
分辨率 3.60 Å R-free 0.308
1NJP The crystal structure of the 50S Large ribosomal subunit from Deinococcus radiodurans complexed with a tRNA acceptor stem mimic (ASM) 提交 2003-01-02 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：tetrameric
链 K 2–142（141 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 7.8；ETHANOL, DIMETHYLHEXANEDIOL, MGCL2, KCL, HEPES, NH4CL, SPARSOMYCIN; SOAKING CRYSTALS IN: 0.025mM ASM , pH 7.80
分辨率 3.50 Å R-free 0.295
1NKW Crystal Structure Of The Large Ribosomal Subunit From Deinococcus Radiodurans 提交 2003-01-05 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 29 PDB 声明：31-meric
链 K 1–140（140 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；ETHANOL, DIMETHYLHEXANEDIOL, MGCL2, KCL, HEPES, NH4CL, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP
分辨率 3.10 Å R-free 0.274
1NWX COMPLEX OF THE LARGE RIBOSOMAL SUBUNIT FROM DEINOCOCCUS RADIODURANS WITH ABT-773 提交 2003-02-07 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 29 PDB 声明：31-meric
链 K 2–142（141 aa）
未记录 773 CETHROMYCIN × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；281 K；ETHANOL, DIMETHYLHEXANEDIOL, MGCL2, KCL, HEPES, NH4CL, pH 7.80, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 281K
分辨率 3.50 Å R-free 0.313
1NWY COMPLEX OF THE LARGE RIBOSOMAL SUBUNIT FROM DEINOCOCCUS RADIODURANS WITH AZITHROMYCIN 提交 2003-02-07 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 29 PDB 声明：31-meric
链 K 2–142（141 aa）
未记录 ZIT AZITHROMYCIN × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；291 K；ETHANOL, DIMETHYLHEXANEDIOL, MGCL2, KCL, HEPES, NH4CL, pH 7.80, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K
分辨率 3.30 Å R-free 0.304
1SM1 COMPLEX OF THE LARGE RIBOSOMAL SUBUNIT FROM DEINOCOCCUS RADIODURANS WITH QUINUPRISTIN AND DALFOPRISTIN 提交 2004-03-08 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 30 PDB 声明：32-meric
链 K 1–142（142 aa）
未记录 DOL 5-(2-DIETHYLAMINO-ETHANESULFONYL)-21-HYDROXY-10-ISOPROPYL-11,19-DIMETHYL-9,26-DIOXA-3,15,28-TRIAZA-TRICYCLO[23.2.1.00,255]OCTACOSA-1(27),12,17,19,25(28)-PENTAENE-2,8,14,23-TETRAONE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 7.8；ETHANOL, DIMETHYLHEXANEDIOL, MGCL2, KCL, HEPES, NH4CL , PH 7.80, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, TEMPERATURE 290K
分辨率 3.42 Å R-free 0.348
1XBP Inhibition of peptide bond formation by pleuromutilins: The structure of the 50S ribosomal subunit from Deinococcus radiodurans in complex with Tiamulin 提交 2004-08-31 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 29 PDB 声明：31-meric
链 K 2–142（141 aa）
未记录 MUL TIAMULIN × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；280 K；ETHANOL, DIMETHYLHEXANEDIOL, MGCL2,KCL, HEPES, NH4CL, pH 7.80, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 280K
分辨率 3.50 Å R-free 0.360
1Y69 RRF domain I in complex with the 50S ribosomal subunit from Deinococcus radiodurans 提交 2004-12-04 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：pentameric
链 K 1–141（141 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；290 K；ETHANOL, DIMETHYLHEXANEDIOL, MGCL2, KCL, HEPES, NH4CL, pH 7.80, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 290K
分辨率 3.33 Å R-free 0.338
2ZJP Thiopeptide antibiotic Nosiheptide bound to the large ribosomal subunit of Deinococcus radiodurans 提交 2008-03-07 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 29 PDB 声明：31-meric
链 J 1–141（141 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 NO1 4-(hydroxymethyl)-3-methyl-1H-indole-2-carboxylic acid × 1 MG MAGNESIUM ION × 35 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP
分辨率 3.70 Å R-free 0.340
2ZJQ Interaction of L7 with L11 induced by Microccocin binding to the Deinococcus radiodurans 50S subunit 提交 2008-03-08 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 29 PDB 声明：31-meric
链 J 1–141（141 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP
分辨率 3.30 Å R-free 0.339
2ZJR Refined native structure of the large ribosomal subunit (50S) from Deinococcus radiodurans 提交 2008-03-08 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 28 PDB 声明：30-meric
链 J 1–141（141 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 35 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP
分辨率 2.91 Å R-free 0.311
3DLL The oxazolidinone antibiotics perturb the ribosomal peptidyl-transferase center and effect tRNA positioning 提交 2008-06-27 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 28 PDB 声明：30-meric
链 J 1–141（141 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 35 ZLD N-{[(5S)-3-(3-fluoro-4-morpholin-4-ylphenyl)-2-oxo-1,3-oxazolidin-5-yl]methyl}acetamide × 1 ZN ZINC ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；10mM MgCl2, 60mM NH4Cl, 5mM KCl, 10mM HEPES, pH7.8, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP
分辨率 3.50 Å R-free 0.280
3PIO Crystal structure of the synergistic antibiotic pair lankamycin and lankacidin in complex with the large ribosomal subunit 提交 2010-11-07 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 28 PDB 声明：30-meric
链 J 1–141（141 aa）
未记录 LMA Lankamycin × 1 MG MAGNESIUM ION × 154 NA SODIUM ION × 42 K POTASSIUM ION × 15 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP. 15% 2:1 ethanol:methylpentanediol was diffused to a hanging drop of 180 AU/ml solution of D50S.
分辨率 3.25 Å R-free 0.294
3PIP Crystal structure of the synergistic antibiotic pair lankamycin and lankacidin in complex with the large ribosomal subunit 提交 2010-11-07 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 28 PDB 声明：30-meric
链 J 1–141（141 aa）
未记录 LC2 N-[(1S,2R,3E,5E,7S,9E,11E,13S,15R,19R)-7,13-dihydroxy-1,4,10,19-tetramethyl-17,18-dioxo-16-oxabicyclo[13.2.2]nonadeca-3,5,9,11-tetraen-2-yl]-2-oxopropanamide × 1 LMA Lankamycin × 1 MG MAGNESIUM ION × 73 K POTASSIUM ION × 4 NA SODIUM ION × 5 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP. 15% 2:1 ethanol:methylpentanediol was diffused to a hanging drop of 180 AU/ml solution of D50S.
分辨率 3.45 Å R-free 0.301
4IO9 Crystal structure of compound 4d bound to large ribosomal subunit (50S) from Deinococcus radiodurans 提交 2013-01-07 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 28 PDB 声明：30-meric
链 J 1–141（141 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 35 1F2 (3aS,4R,7R,8S,9S,10R,11R,13R,15R,15aR)-4-ethyl-11-methoxy-3a,7,9,11,13,15-hexamethyl-2,6,14-trioxo-10-{[3,4,6-trideoxy-3-(dimethylamino)-beta-D-xylo-hexopyranosyl]oxy}tetradecahydro-2H-oxacyclotetradecino[4,3-d][1,3]oxazol-8-yl (2R)-2-(pyridin-3-yl)pyrrolidine-1-carboxylate × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP
分辨率 3.20 Å R-free 0.235
4IOA Crystal structure of compound 4e bound to large ribosomal subunit (50S) from Deinococcus radiodurans 提交 2013-01-07 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 28 PDB 声明：30-meric
链 J 1–141（141 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 35 1F3 (3aS,4R,7R,8S,9S,10R,11R,13R,15R,15aR)-4-ethyl-11-methoxy-3a,7,9,11,13,15-hexamethyl-2,6,14-trioxo-10-{[3,4,6-trideoxy-3-(dimethylamino)-beta-D-xylo-hexopyranosyl]oxy}tetradecahydro-2H-oxacyclotetradecino[4,3-d][1,3]oxazol-8-yl (2R)-2-[4-(acetylamino)phenyl]-2,3-dihydro-1H-pyrrole-1-carboxylate × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP
分辨率 3.20 Å R-free 0.230
4IOC Crystal structure of compound 4f bound to large ribosomal subunit (50S) from Deinococcus radiodurans 提交 2013-01-07 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 28 PDB 声明：30-meric
链 J 1–141（141 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 35 1F4 (3aS,4R,7R,8S,9S,10R,11R,13R,15S,15aR)-4-ethyl-11-methoxy-3a,7,9,11,13,15-hexamethyl-2,6,14-trioxo-10-{[3,4,6-trideoxy-3-(dimethylamino)-beta-D-xylo-hexopyranosyl]oxy}tetradecahydro-2H-oxacyclotetradecino[4,3-d][1,3]oxazol-8-yl (2R)-4,4-dimethyl-2-(pyridin-3-yl)pyrrolidine-1-carboxylate × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP
分辨率 3.60 Å R-free 0.239
4U67 Crystal structure of the large ribosomal subunit (50S) of Deinococcus radiodurans containing a three residue insertion in L22 提交 2014-07-28 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 26 PDB 声明：28-meric
链 J 1–141（141 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 51 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；293 K；Magnesium chloride, HEPES, ammonium chloride, ethanol, 2-ethyl-1,3-hexandiol
分辨率 3.65 Å R-free 0.270
4WFN Crystal structure of the large ribosomal subunit (50S) of Deinococcus radiodurans containing a three residue insertion in L22 in complex with erythromycin 提交 2014-09-16 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 26 PDB 声明：28-meric
链 J 1–141（141 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 70 ERY ERYTHROMYCIN A × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；293 K；Magnesuim chloride, Hepes, ammonium chloride, ethanol, 2-ethyl-1,3-hexadiol
分辨率 3.54 Å R-free 0.282
5DM6 Crystal structure of the 50S ribosomal subunit from Deinococcus radiodurans 提交 2015-09-08 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 28 PDB 声明：30-meric
链 J 5–140（136 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 198 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；292 K；HEPES, sodium hydroxide, magnesium chloride, ammonium chloride, 2-mercaptoethanol, spermidine, 2-ethyl-1, 3-hexanediol, ethanol
分辨率 2.90 Å R-free 0.270
5DM7 Crystal structure of the 50S ribosomal subunit from Deinococcus radiodurans in complex with hygromycin A 提交 2015-09-08 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 28 PDB 声明：30-meric
链 J 5–140（136 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 186 HGR Hygromycin A × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；292 K；HEPES, sodium hydroxide, magnesium chloride, ammonium chloride, 2-mercaptoethanol, spermidine, 2-ethyl-1,3-hexanediol, ethanol
分辨率 3.00 Å R-free 0.326
5JVG The large ribosomal subunit from Deinococcus radiodurans in complex with avilamycin 提交 2016-05-11 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 27 PDB 声明：29-meric
链 J 1–141（141 aa）
未记录 6NO Avilamycin × 1 MG MAGNESIUM ION × 446 MPD (4S)-2-METHYL-2,4-PENTANEDIOL × 5 SPD SPERMIDINE × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；293.15 K；Ribosome solution containing 0.0065 mM (180 A/ml) of D50S in 10 mM Hepes pH=7.8, 15 mM MgCl2 and 75 mM NH4Cl crystallization buffer was mixed with 10 mM spermidine, 1 % ethanol and 0.5 % 2-ethyl-1,3-hexanediol precipitants. A 0.005 ml crystallization drop was hanged over 10 % ethanol and 5% 2-ethyl-1,3-hexanediol in ddw reservoir.
分辨率 3.43 Å R-free 0.253
5JVH The crystal structure large ribosomal subunit (50S) of Deinococcus radiodurans in complex with evernimicin 提交 2016-05-11 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 26 PDB 声明：28-meric
链 J 1–141（141 aa）
未记录 6O1 Evernimicin × 1 MG MAGNESIUM ION × 123 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；293 K；Magnesium chloride, HEPES, ammonium chloride, ethanol, 2-ethyl-1,3-hexandiol
分辨率 3.58 Å R-free 0.247
7A0R 50S Deinococcus radiodurans ribosome bounded with mycinamicin I 提交 2020-08-10 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 26 PDB 声明：28-meric
链 J 5–140（136 aa）
未记录 QTZ mycinamicin II × 1 MG MAGNESIUM ION × 345 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293.15 K；Ribosome solution containing 0.0065 mM (180 A/ml) of D50S in 10 mM Hepes pH=7.8, 15 mM MgCl2 and 75 mM NH4Cl crystallization buffer was mixed with 10 mM spermidine, 1 % ethanol and 0.5 % 2-ethyl-1,3-hexanediol precipitants. A 0.005 ml crystallization drop was hanged over 10 % ethanol and 5% 2-ethyl-1,3-hexanediol in ddw reservoir.
分辨率 3.30 Å R-free 0.249
7A0S 50S Deinococcus radiodurans ribosome bounded with mycinamicin I 提交 2020-08-10 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 26 PDB 声明：28-meric
链 J 5–140（136 aa）
未记录 QU2 mycinamicin I × 1 MG MAGNESIUM ION × 367 SPD SPERMIDINE × 8 MPD (4S)-2-METHYL-2,4-PENTANEDIOL × 4 NA SODIUM ION × 1 EOH ETHANOL × 1 CA CALCIUM ION × 5 K POTASSIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293.15 K；Ribosome solution containing 0.0065 mM (180 A/ml) of D50S in 10 mM Hepes pH=7.8, 15 mM MgCl2 and 75 mM NH4Cl crystallization buffer was mixed with 10 mM spermidine, 1 % ethanol and 0.5 % 2-ethyl-1,3-hexanediol precipitants. A 0.005 ml crystallization drop was hanged over 10 % ethanol and 5% 2-ethyl-1,3-hexanediol in ddw reservoir.
分辨率 3.22 Å R-free 0.253
7A18 50S Deinococcus radiodurans ribosome bounded with mycinamicin IV 提交 2020-08-12 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 26 PDB 声明：28-meric
链 J 5–138（134 aa）
未记录 MIV MYCINAMICIN IV × 1 MG MAGNESIUM ION × 277 SPD SPERMIDINE × 7 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；293.15 K；Ribosome solution containing 0.0065 mM (180 A/ml) of D50S in 10 mM Hepes pH=7.8, 15 mM MgCl2 and 75 mM NH4Cl crystallization buffer was mixed with 10 mM spermidine, 1 % ethanol and 0.5 % 2-ethyl-1,3-hexanediol precipitants. A 0.005 ml crystallization drop was hanged over 10 % ethanol and 5% 2-ethyl-1,3-hexanediol in ddw reservoir.
分辨率 3.40 Å R-free 0.318

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UniProt名称 RL16_DEIRA
Isoform —
PDB实体 15
链与序列区间 作者链 J； PDB构建体 2–142； UniProt 1–141

50S RIBOSOMAL PROTEIN L17

物种未注明

UniProt Q9RSJ5

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白–RNA 异源复合物 蛋白 × 29 RNA 2 PDB 声明：31-meric（31） 与全部聚合物数一致 链 K； UniProt 1–116 未记录 50S RIBOSOMAL PROTEIN L33 × 1 （Q9RSS4） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L34 × 1 （Q9RSH2） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L35 × 1 （Q9RSW6） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L36 × 1 （Q9RSK0） THIOSTREPTON × 1 （P0C8P8） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L2 × 1 （Q9RXJ9） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L3 × 1 （Q9RXK2） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L4 × 1 （Q9RXK1） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L5 × 1 （Q9RXJ0） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L6 × 1 （Q9RSL3） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L11 × 1 （Q9RSS7） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L13 × 1 （Q9RXY1） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L14 × 1 （Q9RXJ2） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L15 × 1 （Q9RSK9） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L16 × 1 （Q9RXJ5） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L18 × 1 （Q9RSL2） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L19 × 1 （Q9RWB4） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L20 × 1 （Q9RSW7） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L21 × 1 （Q9RY64） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L22 × 1 （Q9RXJ7） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L23 × 1 （Q9RXK0） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L24 × 1 （Q9RXJ1） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L25 × 1 （Q9RX88） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L27 × 1 （Q9RY65） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L28 × 1 （Q9RRG8） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L29 × 1 （Q9RXJ4） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L30 × 1 （Q9RSL0） RRNA-23S RIBOSOMAL RNA × 1 50S RIBOSOMAL PROTEIN L32 × 1 （P49228） RRNA-5S RIBOSOMAL RNA × 1 MG MAGNESIUM ION × 36 X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP 分辨率 3.30 Å R-free 0.318

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 3CF5 Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
1NKW Crystal Structure Of The Large Ribosomal Subunit From Deinococcus Radiodurans 提交 2003-01-05 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 29 PDB 声明：31-meric
链 L 1–116（116 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；ETHANOL, DIMETHYLHEXANEDIOL, MGCL2, KCL, HEPES, NH4CL, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP
分辨率 3.10 Å R-free 0.274
1NWX COMPLEX OF THE LARGE RIBOSOMAL SUBUNIT FROM DEINOCOCCUS RADIODURANS WITH ABT-773 提交 2003-02-07 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 29 PDB 声明：31-meric
链 L 1–116（116 aa）
未记录 773 CETHROMYCIN × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；281 K；ETHANOL, DIMETHYLHEXANEDIOL, MGCL2, KCL, HEPES, NH4CL, pH 7.80, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 281K
分辨率 3.50 Å R-free 0.313
1NWY COMPLEX OF THE LARGE RIBOSOMAL SUBUNIT FROM DEINOCOCCUS RADIODURANS WITH AZITHROMYCIN 提交 2003-02-07 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 29 PDB 声明：31-meric
链 L 1–116（116 aa）
未记录 ZIT AZITHROMYCIN × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；291 K；ETHANOL, DIMETHYLHEXANEDIOL, MGCL2, KCL, HEPES, NH4CL, pH 7.80, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K
分辨率 3.30 Å R-free 0.304
1SM1 COMPLEX OF THE LARGE RIBOSOMAL SUBUNIT FROM DEINOCOCCUS RADIODURANS WITH QUINUPRISTIN AND DALFOPRISTIN 提交 2004-03-08 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 30 PDB 声明：32-meric
链 L 1–116（116 aa）
未记录 DOL 5-(2-DIETHYLAMINO-ETHANESULFONYL)-21-HYDROXY-10-ISOPROPYL-11,19-DIMETHYL-9,26-DIOXA-3,15,28-TRIAZA-TRICYCLO[23.2.1.00,255]OCTACOSA-1(27),12,17,19,25(28)-PENTAENE-2,8,14,23-TETRAONE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 7.8；ETHANOL, DIMETHYLHEXANEDIOL, MGCL2, KCL, HEPES, NH4CL , PH 7.80, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, TEMPERATURE 290K
分辨率 3.42 Å R-free 0.348
1XBP Inhibition of peptide bond formation by pleuromutilins: The structure of the 50S ribosomal subunit from Deinococcus radiodurans in complex with Tiamulin 提交 2004-08-31 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 29 PDB 声明：31-meric
链 L 1–116（116 aa）
未记录 MUL TIAMULIN × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；280 K；ETHANOL, DIMETHYLHEXANEDIOL, MGCL2,KCL, HEPES, NH4CL, pH 7.80, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 280K
分辨率 3.50 Å R-free 0.360
2ZJP Thiopeptide antibiotic Nosiheptide bound to the large ribosomal subunit of Deinococcus radiodurans 提交 2008-03-07 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 29 PDB 声明：31-meric
链 K 1–116（116 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 NO1 4-(hydroxymethyl)-3-methyl-1H-indole-2-carboxylic acid × 1 MG MAGNESIUM ION × 35 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP
分辨率 3.70 Å R-free 0.340
2ZJQ Interaction of L7 with L11 induced by Microccocin binding to the Deinococcus radiodurans 50S subunit 提交 2008-03-08 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 29 PDB 声明：31-meric
链 K 1–116（116 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP
分辨率 3.30 Å R-free 0.339
2ZJR Refined native structure of the large ribosomal subunit (50S) from Deinococcus radiodurans 提交 2008-03-08 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 28 PDB 声明：30-meric
链 K 1–116（116 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 35 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP
分辨率 2.91 Å R-free 0.311
3DLL The oxazolidinone antibiotics perturb the ribosomal peptidyl-transferase center and effect tRNA positioning 提交 2008-06-27 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 28 PDB 声明：30-meric
链 K 1–116（116 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 35 ZLD N-{[(5S)-3-(3-fluoro-4-morpholin-4-ylphenyl)-2-oxo-1,3-oxazolidin-5-yl]methyl}acetamide × 1 ZN ZINC ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；10mM MgCl2, 60mM NH4Cl, 5mM KCl, 10mM HEPES, pH7.8, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP
分辨率 3.50 Å R-free 0.280
3PIO Crystal structure of the synergistic antibiotic pair lankamycin and lankacidin in complex with the large ribosomal subunit 提交 2010-11-07 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 28 PDB 声明：30-meric
链 K 1–116（116 aa）
未记录 LMA Lankamycin × 1 MG MAGNESIUM ION × 154 NA SODIUM ION × 42 K POTASSIUM ION × 15 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP. 15% 2:1 ethanol:methylpentanediol was diffused to a hanging drop of 180 AU/ml solution of D50S.
分辨率 3.25 Å R-free 0.294
3PIP Crystal structure of the synergistic antibiotic pair lankamycin and lankacidin in complex with the large ribosomal subunit 提交 2010-11-07 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 28 PDB 声明：30-meric
链 K 1–116（116 aa）
未记录 LC2 N-[(1S,2R,3E,5E,7S,9E,11E,13S,15R,19R)-7,13-dihydroxy-1,4,10,19-tetramethyl-17,18-dioxo-16-oxabicyclo[13.2.2]nonadeca-3,5,9,11-tetraen-2-yl]-2-oxopropanamide × 1 LMA Lankamycin × 1 MG MAGNESIUM ION × 73 K POTASSIUM ION × 4 NA SODIUM ION × 5 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP. 15% 2:1 ethanol:methylpentanediol was diffused to a hanging drop of 180 AU/ml solution of D50S.
分辨率 3.45 Å R-free 0.301
4IO9 Crystal structure of compound 4d bound to large ribosomal subunit (50S) from Deinococcus radiodurans 提交 2013-01-07 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 28 PDB 声明：30-meric
链 K 1–116（116 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 35 1F2 (3aS,4R,7R,8S,9S,10R,11R,13R,15R,15aR)-4-ethyl-11-methoxy-3a,7,9,11,13,15-hexamethyl-2,6,14-trioxo-10-{[3,4,6-trideoxy-3-(dimethylamino)-beta-D-xylo-hexopyranosyl]oxy}tetradecahydro-2H-oxacyclotetradecino[4,3-d][1,3]oxazol-8-yl (2R)-2-(pyridin-3-yl)pyrrolidine-1-carboxylate × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP
分辨率 3.20 Å R-free 0.235
4IOA Crystal structure of compound 4e bound to large ribosomal subunit (50S) from Deinococcus radiodurans 提交 2013-01-07 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 28 PDB 声明：30-meric
链 K 1–116（116 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 35 1F3 (3aS,4R,7R,8S,9S,10R,11R,13R,15R,15aR)-4-ethyl-11-methoxy-3a,7,9,11,13,15-hexamethyl-2,6,14-trioxo-10-{[3,4,6-trideoxy-3-(dimethylamino)-beta-D-xylo-hexopyranosyl]oxy}tetradecahydro-2H-oxacyclotetradecino[4,3-d][1,3]oxazol-8-yl (2R)-2-[4-(acetylamino)phenyl]-2,3-dihydro-1H-pyrrole-1-carboxylate × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP
分辨率 3.20 Å R-free 0.230
4IOC Crystal structure of compound 4f bound to large ribosomal subunit (50S) from Deinococcus radiodurans 提交 2013-01-07 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 28 PDB 声明：30-meric
链 K 1–116（116 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 35 1F4 (3aS,4R,7R,8S,9S,10R,11R,13R,15S,15aR)-4-ethyl-11-methoxy-3a,7,9,11,13,15-hexamethyl-2,6,14-trioxo-10-{[3,4,6-trideoxy-3-(dimethylamino)-beta-D-xylo-hexopyranosyl]oxy}tetradecahydro-2H-oxacyclotetradecino[4,3-d][1,3]oxazol-8-yl (2R)-4,4-dimethyl-2-(pyridin-3-yl)pyrrolidine-1-carboxylate × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP
分辨率 3.60 Å R-free 0.239
4U67 Crystal structure of the large ribosomal subunit (50S) of Deinococcus radiodurans containing a three residue insertion in L22 提交 2014-07-28 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 26 PDB 声明：28-meric
链 K 1–116（116 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 51 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；293 K；Magnesium chloride, HEPES, ammonium chloride, ethanol, 2-ethyl-1,3-hexandiol
分辨率 3.65 Å R-free 0.270
4WFN Crystal structure of the large ribosomal subunit (50S) of Deinococcus radiodurans containing a three residue insertion in L22 in complex with erythromycin 提交 2014-09-16 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 26 PDB 声明：28-meric
链 K 1–116（116 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 70 ERY ERYTHROMYCIN A × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；293 K；Magnesuim chloride, Hepes, ammonium chloride, ethanol, 2-ethyl-1,3-hexadiol
分辨率 3.54 Å R-free 0.282
5DM6 Crystal structure of the 50S ribosomal subunit from Deinococcus radiodurans 提交 2015-09-08 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 28 PDB 声明：30-meric
链 K 3–115（113 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 198 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；292 K；HEPES, sodium hydroxide, magnesium chloride, ammonium chloride, 2-mercaptoethanol, spermidine, 2-ethyl-1, 3-hexanediol, ethanol
分辨率 2.90 Å R-free 0.270
5DM7 Crystal structure of the 50S ribosomal subunit from Deinococcus radiodurans in complex with hygromycin A 提交 2015-09-08 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 28 PDB 声明：30-meric
链 K 3–115（113 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 186 HGR Hygromycin A × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；292 K；HEPES, sodium hydroxide, magnesium chloride, ammonium chloride, 2-mercaptoethanol, spermidine, 2-ethyl-1,3-hexanediol, ethanol
分辨率 3.00 Å R-free 0.326
5JVG The large ribosomal subunit from Deinococcus radiodurans in complex with avilamycin 提交 2016-05-11 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 27 PDB 声明：29-meric
链 K 1–116（116 aa）
未记录 6NO Avilamycin × 1 MG MAGNESIUM ION × 446 MPD (4S)-2-METHYL-2,4-PENTANEDIOL × 5 SPD SPERMIDINE × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；293.15 K；Ribosome solution containing 0.0065 mM (180 A/ml) of D50S in 10 mM Hepes pH=7.8, 15 mM MgCl2 and 75 mM NH4Cl crystallization buffer was mixed with 10 mM spermidine, 1 % ethanol and 0.5 % 2-ethyl-1,3-hexanediol precipitants. A 0.005 ml crystallization drop was hanged over 10 % ethanol and 5% 2-ethyl-1,3-hexanediol in ddw reservoir.
分辨率 3.43 Å R-free 0.253
5JVH The crystal structure large ribosomal subunit (50S) of Deinococcus radiodurans in complex with evernimicin 提交 2016-05-11 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 26 PDB 声明：28-meric
链 K 1–116（116 aa）
未记录 6O1 Evernimicin × 1 MG MAGNESIUM ION × 123 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；293 K；Magnesium chloride, HEPES, ammonium chloride, ethanol, 2-ethyl-1,3-hexandiol
分辨率 3.58 Å R-free 0.247
7A0R 50S Deinococcus radiodurans ribosome bounded with mycinamicin I 提交 2020-08-10 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 26 PDB 声明：28-meric
链 K 1–116（116 aa）
未记录 QTZ mycinamicin II × 1 MG MAGNESIUM ION × 345 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293.15 K；Ribosome solution containing 0.0065 mM (180 A/ml) of D50S in 10 mM Hepes pH=7.8, 15 mM MgCl2 and 75 mM NH4Cl crystallization buffer was mixed with 10 mM spermidine, 1 % ethanol and 0.5 % 2-ethyl-1,3-hexanediol precipitants. A 0.005 ml crystallization drop was hanged over 10 % ethanol and 5% 2-ethyl-1,3-hexanediol in ddw reservoir.
分辨率 3.30 Å R-free 0.249
7A0S 50S Deinococcus radiodurans ribosome bounded with mycinamicin I 提交 2020-08-10 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 26 PDB 声明：28-meric
链 K 1–116（116 aa）
未记录 QU2 mycinamicin I × 1 MG MAGNESIUM ION × 367 SPD SPERMIDINE × 8 MPD (4S)-2-METHYL-2,4-PENTANEDIOL × 4 NA SODIUM ION × 1 EOH ETHANOL × 1 CA CALCIUM ION × 5 K POTASSIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293.15 K；Ribosome solution containing 0.0065 mM (180 A/ml) of D50S in 10 mM Hepes pH=7.8, 15 mM MgCl2 and 75 mM NH4Cl crystallization buffer was mixed with 10 mM spermidine, 1 % ethanol and 0.5 % 2-ethyl-1,3-hexanediol precipitants. A 0.005 ml crystallization drop was hanged over 10 % ethanol and 5% 2-ethyl-1,3-hexanediol in ddw reservoir.
分辨率 3.22 Å R-free 0.253
7A18 50S Deinococcus radiodurans ribosome bounded with mycinamicin IV 提交 2020-08-12 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 26 PDB 声明：28-meric
链 K 1–115（115 aa）
未记录 MIV MYCINAMICIN IV × 1 MG MAGNESIUM ION × 277 SPD SPERMIDINE × 7 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；293.15 K；Ribosome solution containing 0.0065 mM (180 A/ml) of D50S in 10 mM Hepes pH=7.8, 15 mM MgCl2 and 75 mM NH4Cl crystallization buffer was mixed with 10 mM spermidine, 1 % ethanol and 0.5 % 2-ethyl-1,3-hexanediol precipitants. A 0.005 ml crystallization drop was hanged over 10 % ethanol and 5% 2-ethyl-1,3-hexanediol in ddw reservoir.
分辨率 3.40 Å R-free 0.318

共 23 个其他 PDB 条目、23 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 RL17_DEIRA
Isoform —
PDB实体 16
链与序列区间 作者链 K； PDB构建体 1–116； UniProt 1–116

50S RIBOSOMAL PROTEIN L18

物种未注明

UniProt Q9RSL2

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白–RNA 异源复合物 蛋白 × 29 RNA 2 PDB 声明：31-meric（31） 与全部聚合物数一致 链 L； UniProt 1–114 未记录 50S RIBOSOMAL PROTEIN L33 × 1 （Q9RSS4） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L34 × 1 （Q9RSH2） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L35 × 1 （Q9RSW6） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L36 × 1 （Q9RSK0） THIOSTREPTON × 1 （P0C8P8） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L2 × 1 （Q9RXJ9） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L3 × 1 （Q9RXK2） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L4 × 1 （Q9RXK1） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L5 × 1 （Q9RXJ0） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L6 × 1 （Q9RSL3） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L11 × 1 （Q9RSS7） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L13 × 1 （Q9RXY1） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L14 × 1 （Q9RXJ2） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L15 × 1 （Q9RSK9） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L16 × 1 （Q9RXJ5） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L17 × 1 （Q9RSJ5） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L19 × 1 （Q9RWB4） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L20 × 1 （Q9RSW7） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L21 × 1 （Q9RY64） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L22 × 1 （Q9RXJ7） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L23 × 1 （Q9RXK0） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L24 × 1 （Q9RXJ1） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L25 × 1 （Q9RX88） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L27 × 1 （Q9RY65） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L28 × 1 （Q9RRG8） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L29 × 1 （Q9RXJ4） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L30 × 1 （Q9RSL0） RRNA-23S RIBOSOMAL RNA × 1 50S RIBOSOMAL PROTEIN L32 × 1 （P49228） RRNA-5S RIBOSOMAL RNA × 1 MG MAGNESIUM ION × 36 X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP 分辨率 3.30 Å R-free 0.318

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 3CF5 Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
1NKW Crystal Structure Of The Large Ribosomal Subunit From Deinococcus Radiodurans 提交 2003-01-05 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 29 PDB 声明：31-meric
链 M 1–113（113 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；ETHANOL, DIMETHYLHEXANEDIOL, MGCL2, KCL, HEPES, NH4CL, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP
分辨率 3.10 Å R-free 0.274
1NWX COMPLEX OF THE LARGE RIBOSOMAL SUBUNIT FROM DEINOCOCCUS RADIODURANS WITH ABT-773 提交 2003-02-07 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 29 PDB 声明：31-meric
链 M 2–114（113 aa）
未记录 773 CETHROMYCIN × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；281 K；ETHANOL, DIMETHYLHEXANEDIOL, MGCL2, KCL, HEPES, NH4CL, pH 7.80, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 281K
分辨率 3.50 Å R-free 0.313
1NWY COMPLEX OF THE LARGE RIBOSOMAL SUBUNIT FROM DEINOCOCCUS RADIODURANS WITH AZITHROMYCIN 提交 2003-02-07 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 29 PDB 声明：31-meric
链 M 2–114（113 aa）
未记录 ZIT AZITHROMYCIN × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；291 K；ETHANOL, DIMETHYLHEXANEDIOL, MGCL2, KCL, HEPES, NH4CL, pH 7.80, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K
分辨率 3.30 Å R-free 0.304
1SM1 COMPLEX OF THE LARGE RIBOSOMAL SUBUNIT FROM DEINOCOCCUS RADIODURANS WITH QUINUPRISTIN AND DALFOPRISTIN 提交 2004-03-08 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 30 PDB 声明：32-meric
链 M 1–114（114 aa）
未记录 DOL 5-(2-DIETHYLAMINO-ETHANESULFONYL)-21-HYDROXY-10-ISOPROPYL-11,19-DIMETHYL-9,26-DIOXA-3,15,28-TRIAZA-TRICYCLO[23.2.1.00,255]OCTACOSA-1(27),12,17,19,25(28)-PENTAENE-2,8,14,23-TETRAONE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 7.8；ETHANOL, DIMETHYLHEXANEDIOL, MGCL2, KCL, HEPES, NH4CL , PH 7.80, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, TEMPERATURE 290K
分辨率 3.42 Å R-free 0.348
1XBP Inhibition of peptide bond formation by pleuromutilins: The structure of the 50S ribosomal subunit from Deinococcus radiodurans in complex with Tiamulin 提交 2004-08-31 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 29 PDB 声明：31-meric
链 M 1–113（113 aa）
未记录 MUL TIAMULIN × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；280 K；ETHANOL, DIMETHYLHEXANEDIOL, MGCL2,KCL, HEPES, NH4CL, pH 7.80, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 280K
分辨率 3.50 Å R-free 0.360
2ZJP Thiopeptide antibiotic Nosiheptide bound to the large ribosomal subunit of Deinococcus radiodurans 提交 2008-03-07 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 29 PDB 声明：31-meric
链 L 1–114（114 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 NO1 4-(hydroxymethyl)-3-methyl-1H-indole-2-carboxylic acid × 1 MG MAGNESIUM ION × 35 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP
分辨率 3.70 Å R-free 0.340
2ZJQ Interaction of L7 with L11 induced by Microccocin binding to the Deinococcus radiodurans 50S subunit 提交 2008-03-08 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 29 PDB 声明：31-meric
链 L 1–114（114 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP
分辨率 3.30 Å R-free 0.339
2ZJR Refined native structure of the large ribosomal subunit (50S) from Deinococcus radiodurans 提交 2008-03-08 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 28 PDB 声明：30-meric
链 L 1–114（114 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 35 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP
分辨率 2.91 Å R-free 0.311
3DLL The oxazolidinone antibiotics perturb the ribosomal peptidyl-transferase center and effect tRNA positioning 提交 2008-06-27 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 28 PDB 声明：30-meric
链 L 1–114（114 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 35 ZLD N-{[(5S)-3-(3-fluoro-4-morpholin-4-ylphenyl)-2-oxo-1,3-oxazolidin-5-yl]methyl}acetamide × 1 ZN ZINC ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；10mM MgCl2, 60mM NH4Cl, 5mM KCl, 10mM HEPES, pH7.8, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP
分辨率 3.50 Å R-free 0.280
3PIO Crystal structure of the synergistic antibiotic pair lankamycin and lankacidin in complex with the large ribosomal subunit 提交 2010-11-07 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 28 PDB 声明：30-meric
链 L 1–114（114 aa）
未记录 LMA Lankamycin × 1 MG MAGNESIUM ION × 154 NA SODIUM ION × 42 K POTASSIUM ION × 15 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP. 15% 2:1 ethanol:methylpentanediol was diffused to a hanging drop of 180 AU/ml solution of D50S.
分辨率 3.25 Å R-free 0.294
3PIP Crystal structure of the synergistic antibiotic pair lankamycin and lankacidin in complex with the large ribosomal subunit 提交 2010-11-07 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 28 PDB 声明：30-meric
链 L 1–114（114 aa）
未记录 LC2 N-[(1S,2R,3E,5E,7S,9E,11E,13S,15R,19R)-7,13-dihydroxy-1,4,10,19-tetramethyl-17,18-dioxo-16-oxabicyclo[13.2.2]nonadeca-3,5,9,11-tetraen-2-yl]-2-oxopropanamide × 1 LMA Lankamycin × 1 MG MAGNESIUM ION × 73 K POTASSIUM ION × 4 NA SODIUM ION × 5 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP. 15% 2:1 ethanol:methylpentanediol was diffused to a hanging drop of 180 AU/ml solution of D50S.
分辨率 3.45 Å R-free 0.301
4IO9 Crystal structure of compound 4d bound to large ribosomal subunit (50S) from Deinococcus radiodurans 提交 2013-01-07 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 28 PDB 声明：30-meric
链 L 1–114（114 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 35 1F2 (3aS,4R,7R,8S,9S,10R,11R,13R,15R,15aR)-4-ethyl-11-methoxy-3a,7,9,11,13,15-hexamethyl-2,6,14-trioxo-10-{[3,4,6-trideoxy-3-(dimethylamino)-beta-D-xylo-hexopyranosyl]oxy}tetradecahydro-2H-oxacyclotetradecino[4,3-d][1,3]oxazol-8-yl (2R)-2-(pyridin-3-yl)pyrrolidine-1-carboxylate × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP
分辨率 3.20 Å R-free 0.235
4IOA Crystal structure of compound 4e bound to large ribosomal subunit (50S) from Deinococcus radiodurans 提交 2013-01-07 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 28 PDB 声明：30-meric
链 L 1–114（114 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 35 1F3 (3aS,4R,7R,8S,9S,10R,11R,13R,15R,15aR)-4-ethyl-11-methoxy-3a,7,9,11,13,15-hexamethyl-2,6,14-trioxo-10-{[3,4,6-trideoxy-3-(dimethylamino)-beta-D-xylo-hexopyranosyl]oxy}tetradecahydro-2H-oxacyclotetradecino[4,3-d][1,3]oxazol-8-yl (2R)-2-[4-(acetylamino)phenyl]-2,3-dihydro-1H-pyrrole-1-carboxylate × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP
分辨率 3.20 Å R-free 0.230
4IOC Crystal structure of compound 4f bound to large ribosomal subunit (50S) from Deinococcus radiodurans 提交 2013-01-07 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 28 PDB 声明：30-meric
链 L 1–114（114 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 35 1F4 (3aS,4R,7R,8S,9S,10R,11R,13R,15S,15aR)-4-ethyl-11-methoxy-3a,7,9,11,13,15-hexamethyl-2,6,14-trioxo-10-{[3,4,6-trideoxy-3-(dimethylamino)-beta-D-xylo-hexopyranosyl]oxy}tetradecahydro-2H-oxacyclotetradecino[4,3-d][1,3]oxazol-8-yl (2R)-4,4-dimethyl-2-(pyridin-3-yl)pyrrolidine-1-carboxylate × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP
分辨率 3.60 Å R-free 0.239
4U67 Crystal structure of the large ribosomal subunit (50S) of Deinococcus radiodurans containing a three residue insertion in L22 提交 2014-07-28 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 26 PDB 声明：28-meric
链 L 1–114（114 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 51 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；293 K；Magnesium chloride, HEPES, ammonium chloride, ethanol, 2-ethyl-1,3-hexandiol
分辨率 3.65 Å R-free 0.270
4WFN Crystal structure of the large ribosomal subunit (50S) of Deinococcus radiodurans containing a three residue insertion in L22 in complex with erythromycin 提交 2014-09-16 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 26 PDB 声明：28-meric
链 L 1–114（114 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 70 ERY ERYTHROMYCIN A × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；293 K；Magnesuim chloride, Hepes, ammonium chloride, ethanol, 2-ethyl-1,3-hexadiol
分辨率 3.54 Å R-free 0.282
5DM6 Crystal structure of the 50S ribosomal subunit from Deinococcus radiodurans 提交 2015-09-08 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 28 PDB 声明：30-meric
链 L 8–111（104 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 198 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；292 K；HEPES, sodium hydroxide, magnesium chloride, ammonium chloride, 2-mercaptoethanol, spermidine, 2-ethyl-1, 3-hexanediol, ethanol
分辨率 2.90 Å R-free 0.270
5DM7 Crystal structure of the 50S ribosomal subunit from Deinococcus radiodurans in complex with hygromycin A 提交 2015-09-08 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 28 PDB 声明：30-meric
链 L 8–111（104 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 186 HGR Hygromycin A × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；292 K；HEPES, sodium hydroxide, magnesium chloride, ammonium chloride, 2-mercaptoethanol, spermidine, 2-ethyl-1,3-hexanediol, ethanol
分辨率 3.00 Å R-free 0.326
5JVG The large ribosomal subunit from Deinococcus radiodurans in complex with avilamycin 提交 2016-05-11 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 27 PDB 声明：29-meric
链 L 1–114（114 aa）
未记录 6NO Avilamycin × 1 MG MAGNESIUM ION × 446 MPD (4S)-2-METHYL-2,4-PENTANEDIOL × 5 SPD SPERMIDINE × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；293.15 K；Ribosome solution containing 0.0065 mM (180 A/ml) of D50S in 10 mM Hepes pH=7.8, 15 mM MgCl2 and 75 mM NH4Cl crystallization buffer was mixed with 10 mM spermidine, 1 % ethanol and 0.5 % 2-ethyl-1,3-hexanediol precipitants. A 0.005 ml crystallization drop was hanged over 10 % ethanol and 5% 2-ethyl-1,3-hexanediol in ddw reservoir.
分辨率 3.43 Å R-free 0.253
5JVH The crystal structure large ribosomal subunit (50S) of Deinococcus radiodurans in complex with evernimicin 提交 2016-05-11 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 26 PDB 声明：28-meric
链 L 1–114（114 aa）
未记录 6O1 Evernimicin × 1 MG MAGNESIUM ION × 123 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；293 K；Magnesium chloride, HEPES, ammonium chloride, ethanol, 2-ethyl-1,3-hexandiol
分辨率 3.58 Å R-free 0.247
7A0R 50S Deinococcus radiodurans ribosome bounded with mycinamicin I 提交 2020-08-10 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 26 PDB 声明：28-meric
链 L 8–111（104 aa）
未记录 QTZ mycinamicin II × 1 MG MAGNESIUM ION × 345 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293.15 K；Ribosome solution containing 0.0065 mM (180 A/ml) of D50S in 10 mM Hepes pH=7.8, 15 mM MgCl2 and 75 mM NH4Cl crystallization buffer was mixed with 10 mM spermidine, 1 % ethanol and 0.5 % 2-ethyl-1,3-hexanediol precipitants. A 0.005 ml crystallization drop was hanged over 10 % ethanol and 5% 2-ethyl-1,3-hexanediol in ddw reservoir.
分辨率 3.30 Å R-free 0.249
7A0S 50S Deinococcus radiodurans ribosome bounded with mycinamicin I 提交 2020-08-10 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 26 PDB 声明：28-meric
链 L 8–111（104 aa）
未记录 QU2 mycinamicin I × 1 MG MAGNESIUM ION × 367 SPD SPERMIDINE × 8 MPD (4S)-2-METHYL-2,4-PENTANEDIOL × 4 NA SODIUM ION × 1 EOH ETHANOL × 1 CA CALCIUM ION × 5 K POTASSIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293.15 K；Ribosome solution containing 0.0065 mM (180 A/ml) of D50S in 10 mM Hepes pH=7.8, 15 mM MgCl2 and 75 mM NH4Cl crystallization buffer was mixed with 10 mM spermidine, 1 % ethanol and 0.5 % 2-ethyl-1,3-hexanediol precipitants. A 0.005 ml crystallization drop was hanged over 10 % ethanol and 5% 2-ethyl-1,3-hexanediol in ddw reservoir.
分辨率 3.22 Å R-free 0.253
7A18 50S Deinococcus radiodurans ribosome bounded with mycinamicin IV 提交 2020-08-12 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 26 PDB 声明：28-meric
链 L 8–111（104 aa）
未记录 MIV MYCINAMICIN IV × 1 MG MAGNESIUM ION × 277 SPD SPERMIDINE × 7 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；293.15 K；Ribosome solution containing 0.0065 mM (180 A/ml) of D50S in 10 mM Hepes pH=7.8, 15 mM MgCl2 and 75 mM NH4Cl crystallization buffer was mixed with 10 mM spermidine, 1 % ethanol and 0.5 % 2-ethyl-1,3-hexanediol precipitants. A 0.005 ml crystallization drop was hanged over 10 % ethanol and 5% 2-ethyl-1,3-hexanediol in ddw reservoir.
分辨率 3.40 Å R-free 0.318

共 23 个其他 PDB 条目、23 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 RL18_DEIRA
Isoform —
PDB实体 17
链与序列区间 作者链 L； PDB构建体 1–114； UniProt 1–114

50S RIBOSOMAL PROTEIN L19

物种未注明

UniProt Q9RWB4

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白–RNA 异源复合物 蛋白 × 29 RNA 2 PDB 声明：31-meric（31） 与全部聚合物数一致 链 M； UniProt 1–166 未记录 50S RIBOSOMAL PROTEIN L33 × 1 （Q9RSS4） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L34 × 1 （Q9RSH2） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L35 × 1 （Q9RSW6） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L36 × 1 （Q9RSK0） THIOSTREPTON × 1 （P0C8P8） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L2 × 1 （Q9RXJ9） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L3 × 1 （Q9RXK2） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L4 × 1 （Q9RXK1） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L5 × 1 （Q9RXJ0） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L6 × 1 （Q9RSL3） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L11 × 1 （Q9RSS7） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L13 × 1 （Q9RXY1） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L14 × 1 （Q9RXJ2） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L15 × 1 （Q9RSK9） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L16 × 1 （Q9RXJ5） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L17 × 1 （Q9RSJ5） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L18 × 1 （Q9RSL2） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L20 × 1 （Q9RSW7） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L21 × 1 （Q9RY64） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L22 × 1 （Q9RXJ7） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L23 × 1 （Q9RXK0） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L24 × 1 （Q9RXJ1） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L25 × 1 （Q9RX88） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L27 × 1 （Q9RY65） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L28 × 1 （Q9RRG8） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L29 × 1 （Q9RXJ4） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L30 × 1 （Q9RSL0） RRNA-23S RIBOSOMAL RNA × 1 50S RIBOSOMAL PROTEIN L32 × 1 （P49228） RRNA-5S RIBOSOMAL RNA × 1 MG MAGNESIUM ION × 36 X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP 分辨率 3.30 Å R-free 0.318

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 3CF5 Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
1NKW Crystal Structure Of The Large Ribosomal Subunit From Deinococcus Radiodurans 提交 2003-01-05 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 29 PDB 声明：31-meric
链 N 1–166（166 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；ETHANOL, DIMETHYLHEXANEDIOL, MGCL2, KCL, HEPES, NH4CL, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP
分辨率 3.10 Å R-free 0.274
1NWX COMPLEX OF THE LARGE RIBOSOMAL SUBUNIT FROM DEINOCOCCUS RADIODURANS WITH ABT-773 提交 2003-02-07 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 29 PDB 声明：31-meric
链 N 1–166（166 aa）
未记录 773 CETHROMYCIN × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；281 K；ETHANOL, DIMETHYLHEXANEDIOL, MGCL2, KCL, HEPES, NH4CL, pH 7.80, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 281K
分辨率 3.50 Å R-free 0.313
1NWY COMPLEX OF THE LARGE RIBOSOMAL SUBUNIT FROM DEINOCOCCUS RADIODURANS WITH AZITHROMYCIN 提交 2003-02-07 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 29 PDB 声明：31-meric
链 N 1–166（166 aa）
未记录 ZIT AZITHROMYCIN × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；291 K；ETHANOL, DIMETHYLHEXANEDIOL, MGCL2, KCL, HEPES, NH4CL, pH 7.80, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K
分辨率 3.30 Å R-free 0.304
1SM1 COMPLEX OF THE LARGE RIBOSOMAL SUBUNIT FROM DEINOCOCCUS RADIODURANS WITH QUINUPRISTIN AND DALFOPRISTIN 提交 2004-03-08 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 30 PDB 声明：32-meric
链 N 1–166（166 aa）
未记录 DOL 5-(2-DIETHYLAMINO-ETHANESULFONYL)-21-HYDROXY-10-ISOPROPYL-11,19-DIMETHYL-9,26-DIOXA-3,15,28-TRIAZA-TRICYCLO[23.2.1.00,255]OCTACOSA-1(27),12,17,19,25(28)-PENTAENE-2,8,14,23-TETRAONE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 7.8；ETHANOL, DIMETHYLHEXANEDIOL, MGCL2, KCL, HEPES, NH4CL , PH 7.80, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, TEMPERATURE 290K
分辨率 3.42 Å R-free 0.348
1XBP Inhibition of peptide bond formation by pleuromutilins: The structure of the 50S ribosomal subunit from Deinococcus radiodurans in complex with Tiamulin 提交 2004-08-31 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 29 PDB 声明：31-meric
链 N 1–166（166 aa）
未记录 MUL TIAMULIN × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；280 K；ETHANOL, DIMETHYLHEXANEDIOL, MGCL2,KCL, HEPES, NH4CL, pH 7.80, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 280K
分辨率 3.50 Å R-free 0.360
2ZJP Thiopeptide antibiotic Nosiheptide bound to the large ribosomal subunit of Deinococcus radiodurans 提交 2008-03-07 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 29 PDB 声明：31-meric
链 M 1–166（166 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 NO1 4-(hydroxymethyl)-3-methyl-1H-indole-2-carboxylic acid × 1 MG MAGNESIUM ION × 35 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP
分辨率 3.70 Å R-free 0.340
2ZJQ Interaction of L7 with L11 induced by Microccocin binding to the Deinococcus radiodurans 50S subunit 提交 2008-03-08 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 29 PDB 声明：31-meric
链 M 1–166（166 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP
分辨率 3.30 Å R-free 0.339
2ZJR Refined native structure of the large ribosomal subunit (50S) from Deinococcus radiodurans 提交 2008-03-08 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 28 PDB 声明：30-meric
链 M 1–166（166 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 35 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP
分辨率 2.91 Å R-free 0.311
3DLL The oxazolidinone antibiotics perturb the ribosomal peptidyl-transferase center and effect tRNA positioning 提交 2008-06-27 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 28 PDB 声明：30-meric
链 M 1–166（166 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 35 ZLD N-{[(5S)-3-(3-fluoro-4-morpholin-4-ylphenyl)-2-oxo-1,3-oxazolidin-5-yl]methyl}acetamide × 1 ZN ZINC ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；10mM MgCl2, 60mM NH4Cl, 5mM KCl, 10mM HEPES, pH7.8, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP
分辨率 3.50 Å R-free 0.280
3PIO Crystal structure of the synergistic antibiotic pair lankamycin and lankacidin in complex with the large ribosomal subunit 提交 2010-11-07 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 28 PDB 声明：30-meric
链 M 1–166（166 aa）
未记录 LMA Lankamycin × 1 MG MAGNESIUM ION × 154 NA SODIUM ION × 42 K POTASSIUM ION × 15 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP. 15% 2:1 ethanol:methylpentanediol was diffused to a hanging drop of 180 AU/ml solution of D50S.
分辨率 3.25 Å R-free 0.294
3PIP Crystal structure of the synergistic antibiotic pair lankamycin and lankacidin in complex with the large ribosomal subunit 提交 2010-11-07 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 28 PDB 声明：30-meric
链 M 1–166（166 aa）
未记录 LC2 N-[(1S,2R,3E,5E,7S,9E,11E,13S,15R,19R)-7,13-dihydroxy-1,4,10,19-tetramethyl-17,18-dioxo-16-oxabicyclo[13.2.2]nonadeca-3,5,9,11-tetraen-2-yl]-2-oxopropanamide × 1 LMA Lankamycin × 1 MG MAGNESIUM ION × 73 K POTASSIUM ION × 4 NA SODIUM ION × 5 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP. 15% 2:1 ethanol:methylpentanediol was diffused to a hanging drop of 180 AU/ml solution of D50S.
分辨率 3.45 Å R-free 0.301
4IO9 Crystal structure of compound 4d bound to large ribosomal subunit (50S) from Deinococcus radiodurans 提交 2013-01-07 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 28 PDB 声明：30-meric
链 M 1–166（166 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 35 1F2 (3aS,4R,7R,8S,9S,10R,11R,13R,15R,15aR)-4-ethyl-11-methoxy-3a,7,9,11,13,15-hexamethyl-2,6,14-trioxo-10-{[3,4,6-trideoxy-3-(dimethylamino)-beta-D-xylo-hexopyranosyl]oxy}tetradecahydro-2H-oxacyclotetradecino[4,3-d][1,3]oxazol-8-yl (2R)-2-(pyridin-3-yl)pyrrolidine-1-carboxylate × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP
分辨率 3.20 Å R-free 0.235
4IOA Crystal structure of compound 4e bound to large ribosomal subunit (50S) from Deinococcus radiodurans 提交 2013-01-07 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 28 PDB 声明：30-meric
链 M 1–166（166 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 35 1F3 (3aS,4R,7R,8S,9S,10R,11R,13R,15R,15aR)-4-ethyl-11-methoxy-3a,7,9,11,13,15-hexamethyl-2,6,14-trioxo-10-{[3,4,6-trideoxy-3-(dimethylamino)-beta-D-xylo-hexopyranosyl]oxy}tetradecahydro-2H-oxacyclotetradecino[4,3-d][1,3]oxazol-8-yl (2R)-2-[4-(acetylamino)phenyl]-2,3-dihydro-1H-pyrrole-1-carboxylate × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP
分辨率 3.20 Å R-free 0.230
4IOC Crystal structure of compound 4f bound to large ribosomal subunit (50S) from Deinococcus radiodurans 提交 2013-01-07 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 28 PDB 声明：30-meric
链 M 1–166（166 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 35 1F4 (3aS,4R,7R,8S,9S,10R,11R,13R,15S,15aR)-4-ethyl-11-methoxy-3a,7,9,11,13,15-hexamethyl-2,6,14-trioxo-10-{[3,4,6-trideoxy-3-(dimethylamino)-beta-D-xylo-hexopyranosyl]oxy}tetradecahydro-2H-oxacyclotetradecino[4,3-d][1,3]oxazol-8-yl (2R)-4,4-dimethyl-2-(pyridin-3-yl)pyrrolidine-1-carboxylate × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP
分辨率 3.60 Å R-free 0.239
4U67 Crystal structure of the large ribosomal subunit (50S) of Deinococcus radiodurans containing a three residue insertion in L22 提交 2014-07-28 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 26 PDB 声明：28-meric
链 M 1–166（166 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 51 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；293 K；Magnesium chloride, HEPES, ammonium chloride, ethanol, 2-ethyl-1,3-hexandiol
分辨率 3.65 Å R-free 0.270
4WFN Crystal structure of the large ribosomal subunit (50S) of Deinococcus radiodurans containing a three residue insertion in L22 in complex with erythromycin 提交 2014-09-16 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 26 PDB 声明：28-meric
链 M 2–166（165 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 70 ERY ERYTHROMYCIN A × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；293 K；Magnesuim chloride, Hepes, ammonium chloride, ethanol, 2-ethyl-1,3-hexadiol
分辨率 3.54 Å R-free 0.282
5DM6 Crystal structure of the 50S ribosomal subunit from Deinococcus radiodurans 提交 2015-09-08 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 28 PDB 声明：30-meric
链 M 2–106（105 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 198 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；292 K；HEPES, sodium hydroxide, magnesium chloride, ammonium chloride, 2-mercaptoethanol, spermidine, 2-ethyl-1, 3-hexanediol, ethanol
分辨率 2.90 Å R-free 0.270
5DM7 Crystal structure of the 50S ribosomal subunit from Deinococcus radiodurans in complex with hygromycin A 提交 2015-09-08 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 28 PDB 声明：30-meric
链 M 2–115（114 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 186 HGR Hygromycin A × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；292 K；HEPES, sodium hydroxide, magnesium chloride, ammonium chloride, 2-mercaptoethanol, spermidine, 2-ethyl-1,3-hexanediol, ethanol
分辨率 3.00 Å R-free 0.326
5JVG The large ribosomal subunit from Deinococcus radiodurans in complex with avilamycin 提交 2016-05-11 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 27 PDB 声明：29-meric
链 M 1–166（166 aa）
未记录 6NO Avilamycin × 1 MG MAGNESIUM ION × 446 MPD (4S)-2-METHYL-2,4-PENTANEDIOL × 5 SPD SPERMIDINE × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；293.15 K；Ribosome solution containing 0.0065 mM (180 A/ml) of D50S in 10 mM Hepes pH=7.8, 15 mM MgCl2 and 75 mM NH4Cl crystallization buffer was mixed with 10 mM spermidine, 1 % ethanol and 0.5 % 2-ethyl-1,3-hexanediol precipitants. A 0.005 ml crystallization drop was hanged over 10 % ethanol and 5% 2-ethyl-1,3-hexanediol in ddw reservoir.
分辨率 3.43 Å R-free 0.253
5JVH The crystal structure large ribosomal subunit (50S) of Deinococcus radiodurans in complex with evernimicin 提交 2016-05-11 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 26 PDB 声明：28-meric
链 M 1–166（166 aa）
未记录 6O1 Evernimicin × 1 MG MAGNESIUM ION × 123 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；293 K；Magnesium chloride, HEPES, ammonium chloride, ethanol, 2-ethyl-1,3-hexandiol
分辨率 3.58 Å R-free 0.247
7A0R 50S Deinococcus radiodurans ribosome bounded with mycinamicin I 提交 2020-08-10 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 26 PDB 声明：28-meric
链 M 1–113（113 aa）
未记录 QTZ mycinamicin II × 1 MG MAGNESIUM ION × 345 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293.15 K；Ribosome solution containing 0.0065 mM (180 A/ml) of D50S in 10 mM Hepes pH=7.8, 15 mM MgCl2 and 75 mM NH4Cl crystallization buffer was mixed with 10 mM spermidine, 1 % ethanol and 0.5 % 2-ethyl-1,3-hexanediol precipitants. A 0.005 ml crystallization drop was hanged over 10 % ethanol and 5% 2-ethyl-1,3-hexanediol in ddw reservoir.
分辨率 3.30 Å R-free 0.249
7A0S 50S Deinococcus radiodurans ribosome bounded with mycinamicin I 提交 2020-08-10 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 26 PDB 声明：28-meric
链 M 1–166（166 aa）
未记录 QU2 mycinamicin I × 1 MG MAGNESIUM ION × 367 SPD SPERMIDINE × 8 MPD (4S)-2-METHYL-2,4-PENTANEDIOL × 4 NA SODIUM ION × 1 EOH ETHANOL × 1 CA CALCIUM ION × 5 K POTASSIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293.15 K；Ribosome solution containing 0.0065 mM (180 A/ml) of D50S in 10 mM Hepes pH=7.8, 15 mM MgCl2 and 75 mM NH4Cl crystallization buffer was mixed with 10 mM spermidine, 1 % ethanol and 0.5 % 2-ethyl-1,3-hexanediol precipitants. A 0.005 ml crystallization drop was hanged over 10 % ethanol and 5% 2-ethyl-1,3-hexanediol in ddw reservoir.
分辨率 3.22 Å R-free 0.253
7A18 50S Deinococcus radiodurans ribosome bounded with mycinamicin IV 提交 2020-08-12 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 26 PDB 声明：28-meric
链 M 2–119（118 aa）
未记录 MIV MYCINAMICIN IV × 1 MG MAGNESIUM ION × 277 SPD SPERMIDINE × 7 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；293.15 K；Ribosome solution containing 0.0065 mM (180 A/ml) of D50S in 10 mM Hepes pH=7.8, 15 mM MgCl2 and 75 mM NH4Cl crystallization buffer was mixed with 10 mM spermidine, 1 % ethanol and 0.5 % 2-ethyl-1,3-hexanediol precipitants. A 0.005 ml crystallization drop was hanged over 10 % ethanol and 5% 2-ethyl-1,3-hexanediol in ddw reservoir.
分辨率 3.40 Å R-free 0.318

共 23 个其他 PDB 条目、23 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

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UniProt名称 RL19_DEIRA
Isoform —
PDB实体 18
链与序列区间 作者链 M； PDB构建体 1–166； UniProt 1–166

50S RIBOSOMAL PROTEIN L20

物种未注明

UniProt Q9RSW7

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白–RNA 异源复合物 蛋白 × 29 RNA 2 PDB 声明：31-meric（31） 与全部聚合物数一致 链 N； UniProt 1–118 未记录 50S RIBOSOMAL PROTEIN L33 × 1 （Q9RSS4） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L34 × 1 （Q9RSH2） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L35 × 1 （Q9RSW6） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L36 × 1 （Q9RSK0） THIOSTREPTON × 1 （P0C8P8） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L2 × 1 （Q9RXJ9） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L3 × 1 （Q9RXK2） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L4 × 1 （Q9RXK1） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L5 × 1 （Q9RXJ0） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L6 × 1 （Q9RSL3） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L11 × 1 （Q9RSS7） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L13 × 1 （Q9RXY1） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L14 × 1 （Q9RXJ2） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L15 × 1 （Q9RSK9） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L16 × 1 （Q9RXJ5） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L17 × 1 （Q9RSJ5） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L18 × 1 （Q9RSL2） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L19 × 1 （Q9RWB4） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L21 × 1 （Q9RY64） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L22 × 1 （Q9RXJ7） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L23 × 1 （Q9RXK0） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L24 × 1 （Q9RXJ1） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L25 × 1 （Q9RX88） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L27 × 1 （Q9RY65） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L28 × 1 （Q9RRG8） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L29 × 1 （Q9RXJ4） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L30 × 1 （Q9RSL0） RRNA-23S RIBOSOMAL RNA × 1 50S RIBOSOMAL PROTEIN L32 × 1 （P49228） RRNA-5S RIBOSOMAL RNA × 1 MG MAGNESIUM ION × 36 X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP 分辨率 3.30 Å R-free 0.318

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 3CF5 Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
1NKW Crystal Structure Of The Large Ribosomal Subunit From Deinococcus Radiodurans 提交 2003-01-05 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 29 PDB 声明：31-meric
链 O 1–118（118 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；ETHANOL, DIMETHYLHEXANEDIOL, MGCL2, KCL, HEPES, NH4CL, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP
分辨率 3.10 Å R-free 0.274
1NWX COMPLEX OF THE LARGE RIBOSOMAL SUBUNIT FROM DEINOCOCCUS RADIODURANS WITH ABT-773 提交 2003-02-07 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 29 PDB 声明：31-meric
链 O 1–118（118 aa）
未记录 773 CETHROMYCIN × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；281 K；ETHANOL, DIMETHYLHEXANEDIOL, MGCL2, KCL, HEPES, NH4CL, pH 7.80, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 281K
分辨率 3.50 Å R-free 0.313
1NWY COMPLEX OF THE LARGE RIBOSOMAL SUBUNIT FROM DEINOCOCCUS RADIODURANS WITH AZITHROMYCIN 提交 2003-02-07 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 29 PDB 声明：31-meric
链 O 1–118（118 aa）
未记录 ZIT AZITHROMYCIN × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；291 K；ETHANOL, DIMETHYLHEXANEDIOL, MGCL2, KCL, HEPES, NH4CL, pH 7.80, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K
分辨率 3.30 Å R-free 0.304
1SM1 COMPLEX OF THE LARGE RIBOSOMAL SUBUNIT FROM DEINOCOCCUS RADIODURANS WITH QUINUPRISTIN AND DALFOPRISTIN 提交 2004-03-08 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 30 PDB 声明：32-meric
链 O 1–118（118 aa）
未记录 DOL 5-(2-DIETHYLAMINO-ETHANESULFONYL)-21-HYDROXY-10-ISOPROPYL-11,19-DIMETHYL-9,26-DIOXA-3,15,28-TRIAZA-TRICYCLO[23.2.1.00,255]OCTACOSA-1(27),12,17,19,25(28)-PENTAENE-2,8,14,23-TETRAONE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 7.8；ETHANOL, DIMETHYLHEXANEDIOL, MGCL2, KCL, HEPES, NH4CL , PH 7.80, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, TEMPERATURE 290K
分辨率 3.42 Å R-free 0.348
1XBP Inhibition of peptide bond formation by pleuromutilins: The structure of the 50S ribosomal subunit from Deinococcus radiodurans in complex with Tiamulin 提交 2004-08-31 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 29 PDB 声明：31-meric
链 O 1–118（118 aa）
未记录 MUL TIAMULIN × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；280 K；ETHANOL, DIMETHYLHEXANEDIOL, MGCL2,KCL, HEPES, NH4CL, pH 7.80, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 280K
分辨率 3.50 Å R-free 0.360
2ZJP Thiopeptide antibiotic Nosiheptide bound to the large ribosomal subunit of Deinococcus radiodurans 提交 2008-03-07 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 29 PDB 声明：31-meric
链 N 1–118（118 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 NO1 4-(hydroxymethyl)-3-methyl-1H-indole-2-carboxylic acid × 1 MG MAGNESIUM ION × 35 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP
分辨率 3.70 Å R-free 0.340
2ZJQ Interaction of L7 with L11 induced by Microccocin binding to the Deinococcus radiodurans 50S subunit 提交 2008-03-08 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 29 PDB 声明：31-meric
链 N 1–118（118 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP
分辨率 3.30 Å R-free 0.339
2ZJR Refined native structure of the large ribosomal subunit (50S) from Deinococcus radiodurans 提交 2008-03-08 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 28 PDB 声明：30-meric
链 N 1–118（118 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 35 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP
分辨率 2.91 Å R-free 0.311
3DLL The oxazolidinone antibiotics perturb the ribosomal peptidyl-transferase center and effect tRNA positioning 提交 2008-06-27 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 28 PDB 声明：30-meric
链 N 1–118（118 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 35 ZLD N-{[(5S)-3-(3-fluoro-4-morpholin-4-ylphenyl)-2-oxo-1,3-oxazolidin-5-yl]methyl}acetamide × 1 ZN ZINC ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；10mM MgCl2, 60mM NH4Cl, 5mM KCl, 10mM HEPES, pH7.8, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP
分辨率 3.50 Å R-free 0.280
3PIO Crystal structure of the synergistic antibiotic pair lankamycin and lankacidin in complex with the large ribosomal subunit 提交 2010-11-07 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 28 PDB 声明：30-meric
链 N 1–118（118 aa）
未记录 LMA Lankamycin × 1 MG MAGNESIUM ION × 154 NA SODIUM ION × 42 K POTASSIUM ION × 15 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP. 15% 2:1 ethanol:methylpentanediol was diffused to a hanging drop of 180 AU/ml solution of D50S.
分辨率 3.25 Å R-free 0.294
3PIP Crystal structure of the synergistic antibiotic pair lankamycin and lankacidin in complex with the large ribosomal subunit 提交 2010-11-07 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 28 PDB 声明：30-meric
链 N 1–118（118 aa）
未记录 LC2 N-[(1S,2R,3E,5E,7S,9E,11E,13S,15R,19R)-7,13-dihydroxy-1,4,10,19-tetramethyl-17,18-dioxo-16-oxabicyclo[13.2.2]nonadeca-3,5,9,11-tetraen-2-yl]-2-oxopropanamide × 1 LMA Lankamycin × 1 MG MAGNESIUM ION × 73 K POTASSIUM ION × 4 NA SODIUM ION × 5 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP. 15% 2:1 ethanol:methylpentanediol was diffused to a hanging drop of 180 AU/ml solution of D50S.
分辨率 3.45 Å R-free 0.301
4IO9 Crystal structure of compound 4d bound to large ribosomal subunit (50S) from Deinococcus radiodurans 提交 2013-01-07 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 28 PDB 声明：30-meric
链 N 1–118（118 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 35 1F2 (3aS,4R,7R,8S,9S,10R,11R,13R,15R,15aR)-4-ethyl-11-methoxy-3a,7,9,11,13,15-hexamethyl-2,6,14-trioxo-10-{[3,4,6-trideoxy-3-(dimethylamino)-beta-D-xylo-hexopyranosyl]oxy}tetradecahydro-2H-oxacyclotetradecino[4,3-d][1,3]oxazol-8-yl (2R)-2-(pyridin-3-yl)pyrrolidine-1-carboxylate × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP
分辨率 3.20 Å R-free 0.235
4IOA Crystal structure of compound 4e bound to large ribosomal subunit (50S) from Deinococcus radiodurans 提交 2013-01-07 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 28 PDB 声明：30-meric
链 N 1–118（118 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 35 1F3 (3aS,4R,7R,8S,9S,10R,11R,13R,15R,15aR)-4-ethyl-11-methoxy-3a,7,9,11,13,15-hexamethyl-2,6,14-trioxo-10-{[3,4,6-trideoxy-3-(dimethylamino)-beta-D-xylo-hexopyranosyl]oxy}tetradecahydro-2H-oxacyclotetradecino[4,3-d][1,3]oxazol-8-yl (2R)-2-[4-(acetylamino)phenyl]-2,3-dihydro-1H-pyrrole-1-carboxylate × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP
分辨率 3.20 Å R-free 0.230
4IOC Crystal structure of compound 4f bound to large ribosomal subunit (50S) from Deinococcus radiodurans 提交 2013-01-07 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 28 PDB 声明：30-meric
链 N 1–118（118 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 35 1F4 (3aS,4R,7R,8S,9S,10R,11R,13R,15S,15aR)-4-ethyl-11-methoxy-3a,7,9,11,13,15-hexamethyl-2,6,14-trioxo-10-{[3,4,6-trideoxy-3-(dimethylamino)-beta-D-xylo-hexopyranosyl]oxy}tetradecahydro-2H-oxacyclotetradecino[4,3-d][1,3]oxazol-8-yl (2R)-4,4-dimethyl-2-(pyridin-3-yl)pyrrolidine-1-carboxylate × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP
分辨率 3.60 Å R-free 0.239
4U67 Crystal structure of the large ribosomal subunit (50S) of Deinococcus radiodurans containing a three residue insertion in L22 提交 2014-07-28 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 26 PDB 声明：28-meric
链 N 1–118（118 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 51 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；293 K；Magnesium chloride, HEPES, ammonium chloride, ethanol, 2-ethyl-1,3-hexandiol
分辨率 3.65 Å R-free 0.270
4WFN Crystal structure of the large ribosomal subunit (50S) of Deinococcus radiodurans containing a three residue insertion in L22 in complex with erythromycin 提交 2014-09-16 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 26 PDB 声明：28-meric
链 N 1–118（118 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 70 ERY ERYTHROMYCIN A × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；293 K；Magnesuim chloride, Hepes, ammonium chloride, ethanol, 2-ethyl-1,3-hexadiol
分辨率 3.54 Å R-free 0.282
5DM6 Crystal structure of the 50S ribosomal subunit from Deinococcus radiodurans 提交 2015-09-08 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 28 PDB 声明：30-meric
链 N 2–118（117 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 198 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；292 K；HEPES, sodium hydroxide, magnesium chloride, ammonium chloride, 2-mercaptoethanol, spermidine, 2-ethyl-1, 3-hexanediol, ethanol
分辨率 2.90 Å R-free 0.270
5DM7 Crystal structure of the 50S ribosomal subunit from Deinococcus radiodurans in complex with hygromycin A 提交 2015-09-08 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 28 PDB 声明：30-meric
链 N 2–118（117 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 186 HGR Hygromycin A × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；292 K；HEPES, sodium hydroxide, magnesium chloride, ammonium chloride, 2-mercaptoethanol, spermidine, 2-ethyl-1,3-hexanediol, ethanol
分辨率 3.00 Å R-free 0.326
5JVG The large ribosomal subunit from Deinococcus radiodurans in complex with avilamycin 提交 2016-05-11 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 27 PDB 声明：29-meric
链 N 1–118（118 aa）
未记录 6NO Avilamycin × 1 MG MAGNESIUM ION × 446 MPD (4S)-2-METHYL-2,4-PENTANEDIOL × 5 SPD SPERMIDINE × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；293.15 K；Ribosome solution containing 0.0065 mM (180 A/ml) of D50S in 10 mM Hepes pH=7.8, 15 mM MgCl2 and 75 mM NH4Cl crystallization buffer was mixed with 10 mM spermidine, 1 % ethanol and 0.5 % 2-ethyl-1,3-hexanediol precipitants. A 0.005 ml crystallization drop was hanged over 10 % ethanol and 5% 2-ethyl-1,3-hexanediol in ddw reservoir.
分辨率 3.43 Å R-free 0.253
5JVH The crystal structure large ribosomal subunit (50S) of Deinococcus radiodurans in complex with evernimicin 提交 2016-05-11 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 26 PDB 声明：28-meric
链 N 1–118（118 aa）
未记录 6O1 Evernimicin × 1 MG MAGNESIUM ION × 123 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；293 K；Magnesium chloride, HEPES, ammonium chloride, ethanol, 2-ethyl-1,3-hexandiol
分辨率 3.58 Å R-free 0.247
7A0R 50S Deinococcus radiodurans ribosome bounded with mycinamicin I 提交 2020-08-10 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 26 PDB 声明：28-meric
链 N 2–118（117 aa）
未记录 QTZ mycinamicin II × 1 MG MAGNESIUM ION × 345 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293.15 K；Ribosome solution containing 0.0065 mM (180 A/ml) of D50S in 10 mM Hepes pH=7.8, 15 mM MgCl2 and 75 mM NH4Cl crystallization buffer was mixed with 10 mM spermidine, 1 % ethanol and 0.5 % 2-ethyl-1,3-hexanediol precipitants. A 0.005 ml crystallization drop was hanged over 10 % ethanol and 5% 2-ethyl-1,3-hexanediol in ddw reservoir.
分辨率 3.30 Å R-free 0.249
7A0S 50S Deinococcus radiodurans ribosome bounded with mycinamicin I 提交 2020-08-10 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 26 PDB 声明：28-meric
链 N 2–118（117 aa）
未记录 QU2 mycinamicin I × 1 MG MAGNESIUM ION × 367 SPD SPERMIDINE × 8 MPD (4S)-2-METHYL-2,4-PENTANEDIOL × 4 NA SODIUM ION × 1 EOH ETHANOL × 1 CA CALCIUM ION × 5 K POTASSIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293.15 K；Ribosome solution containing 0.0065 mM (180 A/ml) of D50S in 10 mM Hepes pH=7.8, 15 mM MgCl2 and 75 mM NH4Cl crystallization buffer was mixed with 10 mM spermidine, 1 % ethanol and 0.5 % 2-ethyl-1,3-hexanediol precipitants. A 0.005 ml crystallization drop was hanged over 10 % ethanol and 5% 2-ethyl-1,3-hexanediol in ddw reservoir.
分辨率 3.22 Å R-free 0.253
7A18 50S Deinococcus radiodurans ribosome bounded with mycinamicin IV 提交 2020-08-12 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 26 PDB 声明：28-meric
链 N 2–118（117 aa）
未记录 MIV MYCINAMICIN IV × 1 MG MAGNESIUM ION × 277 SPD SPERMIDINE × 7 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；293.15 K；Ribosome solution containing 0.0065 mM (180 A/ml) of D50S in 10 mM Hepes pH=7.8, 15 mM MgCl2 and 75 mM NH4Cl crystallization buffer was mixed with 10 mM spermidine, 1 % ethanol and 0.5 % 2-ethyl-1,3-hexanediol precipitants. A 0.005 ml crystallization drop was hanged over 10 % ethanol and 5% 2-ethyl-1,3-hexanediol in ddw reservoir.
分辨率 3.40 Å R-free 0.318

共 23 个其他 PDB 条目、23 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

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UniProt名称 RL20_DEIRA
Isoform —
PDB实体 19
链与序列区间 作者链 N； PDB构建体 1–118； UniProt 1–118

50S RIBOSOMAL PROTEIN L21

物种未注明

UniProt Q9RY64

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白–RNA 异源复合物 蛋白 × 29 RNA 2 PDB 声明：31-meric（31） 与全部聚合物数一致 链 O； UniProt 1–100 未记录 50S RIBOSOMAL PROTEIN L33 × 1 （Q9RSS4） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L34 × 1 （Q9RSH2） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L35 × 1 （Q9RSW6） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L36 × 1 （Q9RSK0） THIOSTREPTON × 1 （P0C8P8） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L2 × 1 （Q9RXJ9） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L3 × 1 （Q9RXK2） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L4 × 1 （Q9RXK1） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L5 × 1 （Q9RXJ0） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L6 × 1 （Q9RSL3） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L11 × 1 （Q9RSS7） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L13 × 1 （Q9RXY1） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L14 × 1 （Q9RXJ2） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L15 × 1 （Q9RSK9） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L16 × 1 （Q9RXJ5） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L17 × 1 （Q9RSJ5） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L18 × 1 （Q9RSL2） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L19 × 1 （Q9RWB4） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L20 × 1 （Q9RSW7） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L22 × 1 （Q9RXJ7） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L23 × 1 （Q9RXK0） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L24 × 1 （Q9RXJ1） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L25 × 1 （Q9RX88） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L27 × 1 （Q9RY65） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L28 × 1 （Q9RRG8） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L29 × 1 （Q9RXJ4） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L30 × 1 （Q9RSL0） RRNA-23S RIBOSOMAL RNA × 1 50S RIBOSOMAL PROTEIN L32 × 1 （P49228） RRNA-5S RIBOSOMAL RNA × 1 MG MAGNESIUM ION × 36 X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP 分辨率 3.30 Å R-free 0.318

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 3CF5 Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
1NKW Crystal Structure Of The Large Ribosomal Subunit From Deinococcus Radiodurans 提交 2003-01-05 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 29 PDB 声明：31-meric
链 P 1–100（100 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；ETHANOL, DIMETHYLHEXANEDIOL, MGCL2, KCL, HEPES, NH4CL, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP
分辨率 3.10 Å R-free 0.274
1NWX COMPLEX OF THE LARGE RIBOSOMAL SUBUNIT FROM DEINOCOCCUS RADIODURANS WITH ABT-773 提交 2003-02-07 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 29 PDB 声明：31-meric
链 P 70–169（100 aa）
未记录 773 CETHROMYCIN × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；281 K；ETHANOL, DIMETHYLHEXANEDIOL, MGCL2, KCL, HEPES, NH4CL, pH 7.80, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 281K
分辨率 3.50 Å R-free 0.313
1NWY COMPLEX OF THE LARGE RIBOSOMAL SUBUNIT FROM DEINOCOCCUS RADIODURANS WITH AZITHROMYCIN 提交 2003-02-07 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 29 PDB 声明：31-meric
链 P 70–169（100 aa）
未记录 ZIT AZITHROMYCIN × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；291 K；ETHANOL, DIMETHYLHEXANEDIOL, MGCL2, KCL, HEPES, NH4CL, pH 7.80, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K
分辨率 3.30 Å R-free 0.304
1SM1 COMPLEX OF THE LARGE RIBOSOMAL SUBUNIT FROM DEINOCOCCUS RADIODURANS WITH QUINUPRISTIN AND DALFOPRISTIN 提交 2004-03-08 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 30 PDB 声明：32-meric
链 P 70–169（100 aa）
未记录 DOL 5-(2-DIETHYLAMINO-ETHANESULFONYL)-21-HYDROXY-10-ISOPROPYL-11,19-DIMETHYL-9,26-DIOXA-3,15,28-TRIAZA-TRICYCLO[23.2.1.00,255]OCTACOSA-1(27),12,17,19,25(28)-PENTAENE-2,8,14,23-TETRAONE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 7.8；ETHANOL, DIMETHYLHEXANEDIOL, MGCL2, KCL, HEPES, NH4CL , PH 7.80, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, TEMPERATURE 290K
分辨率 3.42 Å R-free 0.348
1XBP Inhibition of peptide bond formation by pleuromutilins: The structure of the 50S ribosomal subunit from Deinococcus radiodurans in complex with Tiamulin 提交 2004-08-31 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 29 PDB 声明：31-meric
链 P 1–100（100 aa）
未记录 MUL TIAMULIN × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；280 K；ETHANOL, DIMETHYLHEXANEDIOL, MGCL2,KCL, HEPES, NH4CL, pH 7.80, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 280K
分辨率 3.50 Å R-free 0.360
2ZJP Thiopeptide antibiotic Nosiheptide bound to the large ribosomal subunit of Deinococcus radiodurans 提交 2008-03-07 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 29 PDB 声明：31-meric
链 O 1–100（100 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 NO1 4-(hydroxymethyl)-3-methyl-1H-indole-2-carboxylic acid × 1 MG MAGNESIUM ION × 35 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP
分辨率 3.70 Å R-free 0.340
2ZJQ Interaction of L7 with L11 induced by Microccocin binding to the Deinococcus radiodurans 50S subunit 提交 2008-03-08 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 29 PDB 声明：31-meric
链 O 1–100（100 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP
分辨率 3.30 Å R-free 0.339
2ZJR Refined native structure of the large ribosomal subunit (50S) from Deinococcus radiodurans 提交 2008-03-08 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 28 PDB 声明：30-meric
链 O 1–100（100 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 35 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP
分辨率 2.91 Å R-free 0.311
3DLL The oxazolidinone antibiotics perturb the ribosomal peptidyl-transferase center and effect tRNA positioning 提交 2008-06-27 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 28 PDB 声明：30-meric
链 O 1–100（100 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 35 ZLD N-{[(5S)-3-(3-fluoro-4-morpholin-4-ylphenyl)-2-oxo-1,3-oxazolidin-5-yl]methyl}acetamide × 1 ZN ZINC ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；10mM MgCl2, 60mM NH4Cl, 5mM KCl, 10mM HEPES, pH7.8, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP
分辨率 3.50 Å R-free 0.280
3PIO Crystal structure of the synergistic antibiotic pair lankamycin and lankacidin in complex with the large ribosomal subunit 提交 2010-11-07 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 28 PDB 声明：30-meric
链 O 1–100（100 aa）
未记录 LMA Lankamycin × 1 MG MAGNESIUM ION × 154 NA SODIUM ION × 42 K POTASSIUM ION × 15 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP. 15% 2:1 ethanol:methylpentanediol was diffused to a hanging drop of 180 AU/ml solution of D50S.
分辨率 3.25 Å R-free 0.294
3PIP Crystal structure of the synergistic antibiotic pair lankamycin and lankacidin in complex with the large ribosomal subunit 提交 2010-11-07 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 28 PDB 声明：30-meric
链 O 1–100（100 aa）
未记录 LC2 N-[(1S,2R,3E,5E,7S,9E,11E,13S,15R,19R)-7,13-dihydroxy-1,4,10,19-tetramethyl-17,18-dioxo-16-oxabicyclo[13.2.2]nonadeca-3,5,9,11-tetraen-2-yl]-2-oxopropanamide × 1 LMA Lankamycin × 1 MG MAGNESIUM ION × 73 K POTASSIUM ION × 4 NA SODIUM ION × 5 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP. 15% 2:1 ethanol:methylpentanediol was diffused to a hanging drop of 180 AU/ml solution of D50S.
分辨率 3.45 Å R-free 0.301
4IO9 Crystal structure of compound 4d bound to large ribosomal subunit (50S) from Deinococcus radiodurans 提交 2013-01-07 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 28 PDB 声明：30-meric
链 O 1–100（100 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 35 1F2 (3aS,4R,7R,8S,9S,10R,11R,13R,15R,15aR)-4-ethyl-11-methoxy-3a,7,9,11,13,15-hexamethyl-2,6,14-trioxo-10-{[3,4,6-trideoxy-3-(dimethylamino)-beta-D-xylo-hexopyranosyl]oxy}tetradecahydro-2H-oxacyclotetradecino[4,3-d][1,3]oxazol-8-yl (2R)-2-(pyridin-3-yl)pyrrolidine-1-carboxylate × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP
分辨率 3.20 Å R-free 0.235
4IOA Crystal structure of compound 4e bound to large ribosomal subunit (50S) from Deinococcus radiodurans 提交 2013-01-07 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 28 PDB 声明：30-meric
链 O 1–100（100 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 35 1F3 (3aS,4R,7R,8S,9S,10R,11R,13R,15R,15aR)-4-ethyl-11-methoxy-3a,7,9,11,13,15-hexamethyl-2,6,14-trioxo-10-{[3,4,6-trideoxy-3-(dimethylamino)-beta-D-xylo-hexopyranosyl]oxy}tetradecahydro-2H-oxacyclotetradecino[4,3-d][1,3]oxazol-8-yl (2R)-2-[4-(acetylamino)phenyl]-2,3-dihydro-1H-pyrrole-1-carboxylate × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP
分辨率 3.20 Å R-free 0.230
4IOC Crystal structure of compound 4f bound to large ribosomal subunit (50S) from Deinococcus radiodurans 提交 2013-01-07 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 28 PDB 声明：30-meric
链 O 1–100（100 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 35 1F4 (3aS,4R,7R,8S,9S,10R,11R,13R,15S,15aR)-4-ethyl-11-methoxy-3a,7,9,11,13,15-hexamethyl-2,6,14-trioxo-10-{[3,4,6-trideoxy-3-(dimethylamino)-beta-D-xylo-hexopyranosyl]oxy}tetradecahydro-2H-oxacyclotetradecino[4,3-d][1,3]oxazol-8-yl (2R)-4,4-dimethyl-2-(pyridin-3-yl)pyrrolidine-1-carboxylate × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP
分辨率 3.60 Å R-free 0.239
4U67 Crystal structure of the large ribosomal subunit (50S) of Deinococcus radiodurans containing a three residue insertion in L22 提交 2014-07-28 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 26 PDB 声明：28-meric
链 O 1–100（100 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 51 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；293 K；Magnesium chloride, HEPES, ammonium chloride, ethanol, 2-ethyl-1,3-hexandiol
分辨率 3.65 Å R-free 0.270
4WFN Crystal structure of the large ribosomal subunit (50S) of Deinococcus radiodurans containing a three residue insertion in L22 in complex with erythromycin 提交 2014-09-16 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 26 PDB 声明：28-meric
链 O 1–100（100 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 70 ERY ERYTHROMYCIN A × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；293 K；Magnesuim chloride, Hepes, ammonium chloride, ethanol, 2-ethyl-1,3-hexadiol
分辨率 3.54 Å R-free 0.282
5DM6 Crystal structure of the 50S ribosomal subunit from Deinococcus radiodurans 提交 2015-09-08 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 28 PDB 声明：30-meric
链 O 5–98（94 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 198 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；292 K；HEPES, sodium hydroxide, magnesium chloride, ammonium chloride, 2-mercaptoethanol, spermidine, 2-ethyl-1, 3-hexanediol, ethanol
分辨率 2.90 Å R-free 0.270
5DM7 Crystal structure of the 50S ribosomal subunit from Deinococcus radiodurans in complex with hygromycin A 提交 2015-09-08 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 28 PDB 声明：30-meric
链 O 5–98（94 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 186 HGR Hygromycin A × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；292 K；HEPES, sodium hydroxide, magnesium chloride, ammonium chloride, 2-mercaptoethanol, spermidine, 2-ethyl-1,3-hexanediol, ethanol
分辨率 3.00 Å R-free 0.326
5JVG The large ribosomal subunit from Deinococcus radiodurans in complex with avilamycin 提交 2016-05-11 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 27 PDB 声明：29-meric
链 O 1–100（100 aa）
未记录 6NO Avilamycin × 1 MG MAGNESIUM ION × 446 MPD (4S)-2-METHYL-2,4-PENTANEDIOL × 5 SPD SPERMIDINE × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；293.15 K；Ribosome solution containing 0.0065 mM (180 A/ml) of D50S in 10 mM Hepes pH=7.8, 15 mM MgCl2 and 75 mM NH4Cl crystallization buffer was mixed with 10 mM spermidine, 1 % ethanol and 0.5 % 2-ethyl-1,3-hexanediol precipitants. A 0.005 ml crystallization drop was hanged over 10 % ethanol and 5% 2-ethyl-1,3-hexanediol in ddw reservoir.
分辨率 3.43 Å R-free 0.253
5JVH The crystal structure large ribosomal subunit (50S) of Deinococcus radiodurans in complex with evernimicin 提交 2016-05-11 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 26 PDB 声明：28-meric
链 O 1–100（100 aa）
未记录 6O1 Evernimicin × 1 MG MAGNESIUM ION × 123 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；293 K；Magnesium chloride, HEPES, ammonium chloride, ethanol, 2-ethyl-1,3-hexandiol
分辨率 3.58 Å R-free 0.247
7A0R 50S Deinococcus radiodurans ribosome bounded with mycinamicin I 提交 2020-08-10 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 26 PDB 声明：28-meric
链 O 1–98（98 aa）
未记录 QTZ mycinamicin II × 1 MG MAGNESIUM ION × 345 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293.15 K；Ribosome solution containing 0.0065 mM (180 A/ml) of D50S in 10 mM Hepes pH=7.8, 15 mM MgCl2 and 75 mM NH4Cl crystallization buffer was mixed with 10 mM spermidine, 1 % ethanol and 0.5 % 2-ethyl-1,3-hexanediol precipitants. A 0.005 ml crystallization drop was hanged over 10 % ethanol and 5% 2-ethyl-1,3-hexanediol in ddw reservoir.
分辨率 3.30 Å R-free 0.249
7A0S 50S Deinococcus radiodurans ribosome bounded with mycinamicin I 提交 2020-08-10 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 26 PDB 声明：28-meric
链 O 1–98（98 aa）
未记录 QU2 mycinamicin I × 1 MG MAGNESIUM ION × 367 SPD SPERMIDINE × 8 MPD (4S)-2-METHYL-2,4-PENTANEDIOL × 4 NA SODIUM ION × 1 EOH ETHANOL × 1 CA CALCIUM ION × 5 K POTASSIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293.15 K；Ribosome solution containing 0.0065 mM (180 A/ml) of D50S in 10 mM Hepes pH=7.8, 15 mM MgCl2 and 75 mM NH4Cl crystallization buffer was mixed with 10 mM spermidine, 1 % ethanol and 0.5 % 2-ethyl-1,3-hexanediol precipitants. A 0.005 ml crystallization drop was hanged over 10 % ethanol and 5% 2-ethyl-1,3-hexanediol in ddw reservoir.
分辨率 3.22 Å R-free 0.253
7A18 50S Deinococcus radiodurans ribosome bounded with mycinamicin IV 提交 2020-08-12 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 26 PDB 声明：28-meric
链 O 1–98（98 aa）
未记录 MIV MYCINAMICIN IV × 1 MG MAGNESIUM ION × 277 SPD SPERMIDINE × 7 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；293.15 K；Ribosome solution containing 0.0065 mM (180 A/ml) of D50S in 10 mM Hepes pH=7.8, 15 mM MgCl2 and 75 mM NH4Cl crystallization buffer was mixed with 10 mM spermidine, 1 % ethanol and 0.5 % 2-ethyl-1,3-hexanediol precipitants. A 0.005 ml crystallization drop was hanged over 10 % ethanol and 5% 2-ethyl-1,3-hexanediol in ddw reservoir.
分辨率 3.40 Å R-free 0.318

共 23 个其他 PDB 条目、23 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

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UniProt名称 RL21_DEIRA
Isoform —
PDB实体 20
链与序列区间 作者链 O； PDB构建体 1–100； UniProt 1–100

50S RIBOSOMAL PROTEIN L22

物种未注明

UniProt Q9RXJ7

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白–RNA 异源复合物 蛋白 × 29 RNA 2 PDB 声明：31-meric（31） 与全部聚合物数一致 链 P； UniProt 1–134 未记录 50S RIBOSOMAL PROTEIN L33 × 1 （Q9RSS4） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L34 × 1 （Q9RSH2） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L35 × 1 （Q9RSW6） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L36 × 1 （Q9RSK0） THIOSTREPTON × 1 （P0C8P8） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L2 × 1 （Q9RXJ9） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L3 × 1 （Q9RXK2） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L4 × 1 （Q9RXK1） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L5 × 1 （Q9RXJ0） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L6 × 1 （Q9RSL3） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L11 × 1 （Q9RSS7） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L13 × 1 （Q9RXY1） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L14 × 1 （Q9RXJ2） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L15 × 1 （Q9RSK9） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L16 × 1 （Q9RXJ5） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L17 × 1 （Q9RSJ5） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L18 × 1 （Q9RSL2） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L19 × 1 （Q9RWB4） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L20 × 1 （Q9RSW7） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L21 × 1 （Q9RY64） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L23 × 1 （Q9RXK0） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L24 × 1 （Q9RXJ1） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L25 × 1 （Q9RX88） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L27 × 1 （Q9RY65） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L28 × 1 （Q9RRG8） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L29 × 1 （Q9RXJ4） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L30 × 1 （Q9RSL0） RRNA-23S RIBOSOMAL RNA × 1 50S RIBOSOMAL PROTEIN L32 × 1 （P49228） RRNA-5S RIBOSOMAL RNA × 1 MG MAGNESIUM ION × 36 X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP 分辨率 3.30 Å R-free 0.318

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 3CF5 Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
1J5A STRUCTURAL BASIS FOR THE INTERACTION OF ANTIBIOTICS WITH THE PEPTIDYL TRANSFERASE CENTER IN EUBACTERIA 提交 2002-03-06 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：tetrameric
链 L 1–134（134 aa）
未记录 CTY CLARITHROMYCIN × 1 MG MAGNESIUM ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；291 K；ethanol, dimethylhexanediol, MgCl2, KCl, Hepes, NH4Cl, pH 7.8, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K
分辨率 3.50 Å R-free 0.323
1JZX Structural Basis for the Interaction of Antibiotics with the Peptidyl Transferase Center in Eubacteria 提交 2001-09-17 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：tetrameric
链 L 1–134（134 aa）
未记录 CLY CLINDAMYCIN × 1 MG MAGNESIUM ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；291 K；ethanol, dimethylhexanediol,MgCl2, KCl, Hepes, NH4Cl, pH 7.8, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K
分辨率 3.10 Å R-free 0.303
1JZY Structural Basis for the Interaction of Antibiotics with the Peptidyl Transferase Center in Eubacteria 提交 2001-09-17 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：tetrameric
链 L 1–134（134 aa）
未记录 ERY ERYTHROMYCIN A × 1 MG MAGNESIUM ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；291 K；ethanol, dimethylhexanediol, MgCl2, KCl, Hepes, NH4Cl, pH 7.8, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K
分辨率 3.50 Å R-free 0.301
1JZZ Structural Basis for the Interaction of Antibiotics with the Peptidyl Transferase Center in Eubacteria 提交 2001-09-17 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：tetrameric
链 L 1–134（134 aa）
未记录 ROX ROXITHROMYCIN × 1 MG MAGNESIUM ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；291 K；ethanol, dimethylhexanediol, MgCl2, KCl, Hepes, NH4Cl, pH 7.8, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K
分辨率 3.80 Å R-free 0.274
1K01 Structural Basis for the Interaction of Antibiotics with the Peptidyl Transferase Center in Eubacteria 提交 2001-09-17 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：tetrameric
链 L 1–134（134 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 3 CLM CHLORAMPHENICOL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；291 K；ethanol, dimethylhexanediol, MgCl2, KCl, Hepes, NH4Cl, pH 7.8, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K
分辨率 3.50 Å R-free 0.321
1NKW Crystal Structure Of The Large Ribosomal Subunit From Deinococcus Radiodurans 提交 2003-01-05 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 29 PDB 声明：31-meric
链 Q 1–134（134 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；ETHANOL, DIMETHYLHEXANEDIOL, MGCL2, KCL, HEPES, NH4CL, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP
分辨率 3.10 Å R-free 0.274
1NWX COMPLEX OF THE LARGE RIBOSOMAL SUBUNIT FROM DEINOCOCCUS RADIODURANS WITH ABT-773 提交 2003-02-07 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 29 PDB 声明：31-meric
链 Q 1–134（134 aa）
未记录 773 CETHROMYCIN × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；281 K；ETHANOL, DIMETHYLHEXANEDIOL, MGCL2, KCL, HEPES, NH4CL, pH 7.80, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 281K
分辨率 3.50 Å R-free 0.313
1NWY COMPLEX OF THE LARGE RIBOSOMAL SUBUNIT FROM DEINOCOCCUS RADIODURANS WITH AZITHROMYCIN 提交 2003-02-07 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 29 PDB 声明：31-meric
链 Q 1–134（134 aa）
未记录 ZIT AZITHROMYCIN × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；291 K；ETHANOL, DIMETHYLHEXANEDIOL, MGCL2, KCL, HEPES, NH4CL, pH 7.80, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K
分辨率 3.30 Å R-free 0.304
1OND THE CRYSTAL STRUCTURE OF THE 50S LARGE RIBOSOMAL SUBUNIT FROM DEINOCOCCUS RADIODURANS COMPLEXED WITH TROLEANDOMYCIN MACROLIDE ANTIBIOTIC 提交 2003-02-27 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：trimeric
链 Q 1–134（134 aa）
未记录 TAO TROLEANDOMYCIN × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 EVAPORATION；EVAPORATION
分辨率 3.40 Å R-free 0.310
1SM1 COMPLEX OF THE LARGE RIBOSOMAL SUBUNIT FROM DEINOCOCCUS RADIODURANS WITH QUINUPRISTIN AND DALFOPRISTIN 提交 2004-03-08 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 30 PDB 声明：32-meric
链 Q 1–134（134 aa）
未记录 DOL 5-(2-DIETHYLAMINO-ETHANESULFONYL)-21-HYDROXY-10-ISOPROPYL-11,19-DIMETHYL-9,26-DIOXA-3,15,28-TRIAZA-TRICYCLO[23.2.1.00,255]OCTACOSA-1(27),12,17,19,25(28)-PENTAENE-2,8,14,23-TETRAONE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 7.8；ETHANOL, DIMETHYLHEXANEDIOL, MGCL2, KCL, HEPES, NH4CL , PH 7.80, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, TEMPERATURE 290K
分辨率 3.42 Å R-free 0.348
1XBP Inhibition of peptide bond formation by pleuromutilins: The structure of the 50S ribosomal subunit from Deinococcus radiodurans in complex with Tiamulin 提交 2004-08-31 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 29 PDB 声明：31-meric
链 Q 1–134（134 aa）
未记录 MUL TIAMULIN × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；280 K；ETHANOL, DIMETHYLHEXANEDIOL, MGCL2,KCL, HEPES, NH4CL, pH 7.80, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 280K
分辨率 3.50 Å R-free 0.360
2ZJP Thiopeptide antibiotic Nosiheptide bound to the large ribosomal subunit of Deinococcus radiodurans 提交 2008-03-07 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 29 PDB 声明：31-meric
链 P 1–134（134 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 NO1 4-(hydroxymethyl)-3-methyl-1H-indole-2-carboxylic acid × 1 MG MAGNESIUM ION × 35 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP
分辨率 3.70 Å R-free 0.340
2ZJQ Interaction of L7 with L11 induced by Microccocin binding to the Deinococcus radiodurans 50S subunit 提交 2008-03-08 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 29 PDB 声明：31-meric
链 P 1–134（134 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP
分辨率 3.30 Å R-free 0.339
2ZJR Refined native structure of the large ribosomal subunit (50S) from Deinococcus radiodurans 提交 2008-03-08 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 28 PDB 声明：30-meric
链 P 1–134（134 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 35 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP
分辨率 2.91 Å R-free 0.311
3DLL The oxazolidinone antibiotics perturb the ribosomal peptidyl-transferase center and effect tRNA positioning 提交 2008-06-27 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 28 PDB 声明：30-meric
链 P 1–134（134 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 35 ZLD N-{[(5S)-3-(3-fluoro-4-morpholin-4-ylphenyl)-2-oxo-1,3-oxazolidin-5-yl]methyl}acetamide × 1 ZN ZINC ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；10mM MgCl2, 60mM NH4Cl, 5mM KCl, 10mM HEPES, pH7.8, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP
分辨率 3.50 Å R-free 0.280
3PIO Crystal structure of the synergistic antibiotic pair lankamycin and lankacidin in complex with the large ribosomal subunit 提交 2010-11-07 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 28 PDB 声明：30-meric
链 P 1–134（134 aa）
未记录 LMA Lankamycin × 1 MG MAGNESIUM ION × 154 NA SODIUM ION × 42 K POTASSIUM ION × 15 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP. 15% 2:1 ethanol:methylpentanediol was diffused to a hanging drop of 180 AU/ml solution of D50S.
分辨率 3.25 Å R-free 0.294
3PIP Crystal structure of the synergistic antibiotic pair lankamycin and lankacidin in complex with the large ribosomal subunit 提交 2010-11-07 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 28 PDB 声明：30-meric
链 P 1–134（134 aa）
未记录 LC2 N-[(1S,2R,3E,5E,7S,9E,11E,13S,15R,19R)-7,13-dihydroxy-1,4,10,19-tetramethyl-17,18-dioxo-16-oxabicyclo[13.2.2]nonadeca-3,5,9,11-tetraen-2-yl]-2-oxopropanamide × 1 LMA Lankamycin × 1 MG MAGNESIUM ION × 73 K POTASSIUM ION × 4 NA SODIUM ION × 5 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP. 15% 2:1 ethanol:methylpentanediol was diffused to a hanging drop of 180 AU/ml solution of D50S.
分辨率 3.45 Å R-free 0.301
4IO9 Crystal structure of compound 4d bound to large ribosomal subunit (50S) from Deinococcus radiodurans 提交 2013-01-07 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 28 PDB 声明：30-meric
链 P 1–134（134 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 35 1F2 (3aS,4R,7R,8S,9S,10R,11R,13R,15R,15aR)-4-ethyl-11-methoxy-3a,7,9,11,13,15-hexamethyl-2,6,14-trioxo-10-{[3,4,6-trideoxy-3-(dimethylamino)-beta-D-xylo-hexopyranosyl]oxy}tetradecahydro-2H-oxacyclotetradecino[4,3-d][1,3]oxazol-8-yl (2R)-2-(pyridin-3-yl)pyrrolidine-1-carboxylate × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP
分辨率 3.20 Å R-free 0.235
4IOA Crystal structure of compound 4e bound to large ribosomal subunit (50S) from Deinococcus radiodurans 提交 2013-01-07 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 28 PDB 声明：30-meric
链 P 1–134（134 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 35 1F3 (3aS,4R,7R,8S,9S,10R,11R,13R,15R,15aR)-4-ethyl-11-methoxy-3a,7,9,11,13,15-hexamethyl-2,6,14-trioxo-10-{[3,4,6-trideoxy-3-(dimethylamino)-beta-D-xylo-hexopyranosyl]oxy}tetradecahydro-2H-oxacyclotetradecino[4,3-d][1,3]oxazol-8-yl (2R)-2-[4-(acetylamino)phenyl]-2,3-dihydro-1H-pyrrole-1-carboxylate × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP
分辨率 3.20 Å R-free 0.230
4IOC Crystal structure of compound 4f bound to large ribosomal subunit (50S) from Deinococcus radiodurans 提交 2013-01-07 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 28 PDB 声明：30-meric
链 P 1–134（134 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 35 1F4 (3aS,4R,7R,8S,9S,10R,11R,13R,15S,15aR)-4-ethyl-11-methoxy-3a,7,9,11,13,15-hexamethyl-2,6,14-trioxo-10-{[3,4,6-trideoxy-3-(dimethylamino)-beta-D-xylo-hexopyranosyl]oxy}tetradecahydro-2H-oxacyclotetradecino[4,3-d][1,3]oxazol-8-yl (2R)-4,4-dimethyl-2-(pyridin-3-yl)pyrrolidine-1-carboxylate × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP
分辨率 3.60 Å R-free 0.239
4U67 Crystal structure of the large ribosomal subunit (50S) of Deinococcus radiodurans containing a three residue insertion in L22 提交 2014-07-28 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 26 PDB 声明：28-meric
链 P 1–134（134 aa）
突变：Insertion of VPR after R109 MG MAGNESIUM ION × 51 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；293 K；Magnesium chloride, HEPES, ammonium chloride, ethanol, 2-ethyl-1,3-hexandiol
分辨率 3.65 Å R-free 0.270
4WFN Crystal structure of the large ribosomal subunit (50S) of Deinococcus radiodurans containing a three residue insertion in L22 in complex with erythromycin 提交 2014-09-16 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 26 PDB 声明：28-meric
链 P 1–109（109 aa）
链 P 110–134（25 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 70 ERY ERYTHROMYCIN A × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；293 K；Magnesuim chloride, Hepes, ammonium chloride, ethanol, 2-ethyl-1,3-hexadiol
分辨率 3.54 Å R-free 0.282
5DM6 Crystal structure of the 50S ribosomal subunit from Deinococcus radiodurans 提交 2015-09-08 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 28 PDB 声明：30-meric
链 P 8–134（127 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 198 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；292 K；HEPES, sodium hydroxide, magnesium chloride, ammonium chloride, 2-mercaptoethanol, spermidine, 2-ethyl-1, 3-hexanediol, ethanol
分辨率 2.90 Å R-free 0.270
5DM7 Crystal structure of the 50S ribosomal subunit from Deinococcus radiodurans in complex with hygromycin A 提交 2015-09-08 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 28 PDB 声明：30-meric
链 P 8–134（127 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 186 HGR Hygromycin A × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；292 K；HEPES, sodium hydroxide, magnesium chloride, ammonium chloride, 2-mercaptoethanol, spermidine, 2-ethyl-1,3-hexanediol, ethanol
分辨率 3.00 Å R-free 0.326
5JVG The large ribosomal subunit from Deinococcus radiodurans in complex with avilamycin 提交 2016-05-11 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 27 PDB 声明：29-meric
链 P 1–134（134 aa）
未记录 6NO Avilamycin × 1 MG MAGNESIUM ION × 446 MPD (4S)-2-METHYL-2,4-PENTANEDIOL × 5 SPD SPERMIDINE × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；293.15 K；Ribosome solution containing 0.0065 mM (180 A/ml) of D50S in 10 mM Hepes pH=7.8, 15 mM MgCl2 and 75 mM NH4Cl crystallization buffer was mixed with 10 mM spermidine, 1 % ethanol and 0.5 % 2-ethyl-1,3-hexanediol precipitants. A 0.005 ml crystallization drop was hanged over 10 % ethanol and 5% 2-ethyl-1,3-hexanediol in ddw reservoir.
分辨率 3.43 Å R-free 0.253
5JVH The crystal structure large ribosomal subunit (50S) of Deinococcus radiodurans in complex with evernimicin 提交 2016-05-11 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 26 PDB 声明：28-meric
链 P 1–134（134 aa）
未记录 6O1 Evernimicin × 1 MG MAGNESIUM ION × 123 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；293 K；Magnesium chloride, HEPES, ammonium chloride, ethanol, 2-ethyl-1,3-hexandiol
分辨率 3.58 Å R-free 0.247
7A0R 50S Deinococcus radiodurans ribosome bounded with mycinamicin I 提交 2020-08-10 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 26 PDB 声明：28-meric
链 P 6–133（128 aa）
未记录 QTZ mycinamicin II × 1 MG MAGNESIUM ION × 345 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293.15 K；Ribosome solution containing 0.0065 mM (180 A/ml) of D50S in 10 mM Hepes pH=7.8, 15 mM MgCl2 and 75 mM NH4Cl crystallization buffer was mixed with 10 mM spermidine, 1 % ethanol and 0.5 % 2-ethyl-1,3-hexanediol precipitants. A 0.005 ml crystallization drop was hanged over 10 % ethanol and 5% 2-ethyl-1,3-hexanediol in ddw reservoir.
分辨率 3.30 Å R-free 0.249
7A0S 50S Deinococcus radiodurans ribosome bounded with mycinamicin I 提交 2020-08-10 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 26 PDB 声明：28-meric
链 P 1–134（134 aa）
未记录 QU2 mycinamicin I × 1 MG MAGNESIUM ION × 367 SPD SPERMIDINE × 8 MPD (4S)-2-METHYL-2,4-PENTANEDIOL × 4 NA SODIUM ION × 1 EOH ETHANOL × 1 CA CALCIUM ION × 5 K POTASSIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293.15 K；Ribosome solution containing 0.0065 mM (180 A/ml) of D50S in 10 mM Hepes pH=7.8, 15 mM MgCl2 and 75 mM NH4Cl crystallization buffer was mixed with 10 mM spermidine, 1 % ethanol and 0.5 % 2-ethyl-1,3-hexanediol precipitants. A 0.005 ml crystallization drop was hanged over 10 % ethanol and 5% 2-ethyl-1,3-hexanediol in ddw reservoir.
分辨率 3.22 Å R-free 0.253
7A18 50S Deinococcus radiodurans ribosome bounded with mycinamicin IV 提交 2020-08-12 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 26 PDB 声明：28-meric
链 P 6–134（129 aa）
未记录 MIV MYCINAMICIN IV × 1 MG MAGNESIUM ION × 277 SPD SPERMIDINE × 7 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；293.15 K；Ribosome solution containing 0.0065 mM (180 A/ml) of D50S in 10 mM Hepes pH=7.8, 15 mM MgCl2 and 75 mM NH4Cl crystallization buffer was mixed with 10 mM spermidine, 1 % ethanol and 0.5 % 2-ethyl-1,3-hexanediol precipitants. A 0.005 ml crystallization drop was hanged over 10 % ethanol and 5% 2-ethyl-1,3-hexanediol in ddw reservoir.
分辨率 3.40 Å R-free 0.318

共 29 个其他 PDB 条目、29 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

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UniProt名称 RL22_DEIRA
Isoform —
PDB实体 21
链与序列区间 作者链 P； PDB构建体 1–134； UniProt 1–134

50S RIBOSOMAL PROTEIN L23

物种未注明

UniProt Q9RXK0

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白–RNA 异源复合物 蛋白 × 29 RNA 2 PDB 声明：31-meric（31） 与全部聚合物数一致 链 Q； UniProt 1–95 未记录 50S RIBOSOMAL PROTEIN L33 × 1 （Q9RSS4） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L34 × 1 （Q9RSH2） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L35 × 1 （Q9RSW6） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L36 × 1 （Q9RSK0） THIOSTREPTON × 1 （P0C8P8） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L2 × 1 （Q9RXJ9） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L3 × 1 （Q9RXK2） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L4 × 1 （Q9RXK1） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L5 × 1 （Q9RXJ0） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L6 × 1 （Q9RSL3） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L11 × 1 （Q9RSS7） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L13 × 1 （Q9RXY1） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L14 × 1 （Q9RXJ2） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L15 × 1 （Q9RSK9） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L16 × 1 （Q9RXJ5） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L17 × 1 （Q9RSJ5） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L18 × 1 （Q9RSL2） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L19 × 1 （Q9RWB4） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L20 × 1 （Q9RSW7） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L21 × 1 （Q9RY64） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L22 × 1 （Q9RXJ7） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L24 × 1 （Q9RXJ1） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L25 × 1 （Q9RX88） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L27 × 1 （Q9RY65） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L28 × 1 （Q9RRG8） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L29 × 1 （Q9RXJ4） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L30 × 1 （Q9RSL0） RRNA-23S RIBOSOMAL RNA × 1 50S RIBOSOMAL PROTEIN L32 × 1 （P49228） RRNA-5S RIBOSOMAL RNA × 1 MG MAGNESIUM ION × 36 X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP 分辨率 3.30 Å R-free 0.318

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 3CF5 Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
1NKW Crystal Structure Of The Large Ribosomal Subunit From Deinococcus Radiodurans 提交 2003-01-05 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 29 PDB 声明：31-meric
链 R 1–94（94 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；ETHANOL, DIMETHYLHEXANEDIOL, MGCL2, KCL, HEPES, NH4CL, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP
分辨率 3.10 Å R-free 0.274
1NWX COMPLEX OF THE LARGE RIBOSOMAL SUBUNIT FROM DEINOCOCCUS RADIODURANS WITH ABT-773 提交 2003-02-07 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 29 PDB 声明：31-meric
链 R 2–95（94 aa）
未记录 773 CETHROMYCIN × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；281 K；ETHANOL, DIMETHYLHEXANEDIOL, MGCL2, KCL, HEPES, NH4CL, pH 7.80, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 281K
分辨率 3.50 Å R-free 0.313
1NWY COMPLEX OF THE LARGE RIBOSOMAL SUBUNIT FROM DEINOCOCCUS RADIODURANS WITH AZITHROMYCIN 提交 2003-02-07 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 29 PDB 声明：31-meric
链 R 2–95（94 aa）
未记录 ZIT AZITHROMYCIN × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；291 K；ETHANOL, DIMETHYLHEXANEDIOL, MGCL2, KCL, HEPES, NH4CL, pH 7.80, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K
分辨率 3.30 Å R-free 0.304
1SM1 COMPLEX OF THE LARGE RIBOSOMAL SUBUNIT FROM DEINOCOCCUS RADIODURANS WITH QUINUPRISTIN AND DALFOPRISTIN 提交 2004-03-08 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 30 PDB 声明：32-meric
链 R 1–95（95 aa）
未记录 DOL 5-(2-DIETHYLAMINO-ETHANESULFONYL)-21-HYDROXY-10-ISOPROPYL-11,19-DIMETHYL-9,26-DIOXA-3,15,28-TRIAZA-TRICYCLO[23.2.1.00,255]OCTACOSA-1(27),12,17,19,25(28)-PENTAENE-2,8,14,23-TETRAONE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 7.8；ETHANOL, DIMETHYLHEXANEDIOL, MGCL2, KCL, HEPES, NH4CL , PH 7.80, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, TEMPERATURE 290K
分辨率 3.42 Å R-free 0.348
1XBP Inhibition of peptide bond formation by pleuromutilins: The structure of the 50S ribosomal subunit from Deinococcus radiodurans in complex with Tiamulin 提交 2004-08-31 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 29 PDB 声明：31-meric
链 R 1–94（94 aa）
未记录 MUL TIAMULIN × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；280 K；ETHANOL, DIMETHYLHEXANEDIOL, MGCL2,KCL, HEPES, NH4CL, pH 7.80, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 280K
分辨率 3.50 Å R-free 0.360
2AAR Structure of trigger factor binding domain in biologically homologous complex with eubacterial ribosome. 提交 2005-07-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：tetrameric
链 R 1–95（95 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；293 K；pH 7.8, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 20K
分辨率 3.50 Å R-free 0.320
2D3O Structure of Ribosome Binding Domain of the Trigger Factor on the 50S ribosomal subunit from D. radiodurans 提交 2005-09-30 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：pentameric
链 R 0–94（95 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.8；290 K；ETHANOL, DIMETHYLHEXANEDIOL, MGCL2, KCL, HEPES, NH4CL, pH 7.8, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 290K
分辨率 3.35 Å R-free 0.322
2ZJP Thiopeptide antibiotic Nosiheptide bound to the large ribosomal subunit of Deinococcus radiodurans 提交 2008-03-07 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 29 PDB 声明：31-meric
链 Q 1–95（95 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 NO1 4-(hydroxymethyl)-3-methyl-1H-indole-2-carboxylic acid × 1 MG MAGNESIUM ION × 35 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP
分辨率 3.70 Å R-free 0.340
2ZJQ Interaction of L7 with L11 induced by Microccocin binding to the Deinococcus radiodurans 50S subunit 提交 2008-03-08 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 29 PDB 声明：31-meric
链 Q 1–95（95 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP
分辨率 3.30 Å R-free 0.339
2ZJR Refined native structure of the large ribosomal subunit (50S) from Deinococcus radiodurans 提交 2008-03-08 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 28 PDB 声明：30-meric
链 Q 1–95（95 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 35 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP
分辨率 2.91 Å R-free 0.311
3DLL The oxazolidinone antibiotics perturb the ribosomal peptidyl-transferase center and effect tRNA positioning 提交 2008-06-27 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 28 PDB 声明：30-meric
链 Q 1–95（95 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 35 ZLD N-{[(5S)-3-(3-fluoro-4-morpholin-4-ylphenyl)-2-oxo-1,3-oxazolidin-5-yl]methyl}acetamide × 1 ZN ZINC ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；10mM MgCl2, 60mM NH4Cl, 5mM KCl, 10mM HEPES, pH7.8, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP
分辨率 3.50 Å R-free 0.280
3PIO Crystal structure of the synergistic antibiotic pair lankamycin and lankacidin in complex with the large ribosomal subunit 提交 2010-11-07 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 28 PDB 声明：30-meric
链 Q 1–95（95 aa）
未记录 LMA Lankamycin × 1 MG MAGNESIUM ION × 154 NA SODIUM ION × 42 K POTASSIUM ION × 15 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP. 15% 2:1 ethanol:methylpentanediol was diffused to a hanging drop of 180 AU/ml solution of D50S.
分辨率 3.25 Å R-free 0.294
3PIP Crystal structure of the synergistic antibiotic pair lankamycin and lankacidin in complex with the large ribosomal subunit 提交 2010-11-07 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 28 PDB 声明：30-meric
链 Q 1–95（95 aa）
未记录 LC2 N-[(1S,2R,3E,5E,7S,9E,11E,13S,15R,19R)-7,13-dihydroxy-1,4,10,19-tetramethyl-17,18-dioxo-16-oxabicyclo[13.2.2]nonadeca-3,5,9,11-tetraen-2-yl]-2-oxopropanamide × 1 LMA Lankamycin × 1 MG MAGNESIUM ION × 73 K POTASSIUM ION × 4 NA SODIUM ION × 5 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP. 15% 2:1 ethanol:methylpentanediol was diffused to a hanging drop of 180 AU/ml solution of D50S.
分辨率 3.45 Å R-free 0.301
4IO9 Crystal structure of compound 4d bound to large ribosomal subunit (50S) from Deinococcus radiodurans 提交 2013-01-07 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 28 PDB 声明：30-meric
链 Q 1–95（95 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 35 1F2 (3aS,4R,7R,8S,9S,10R,11R,13R,15R,15aR)-4-ethyl-11-methoxy-3a,7,9,11,13,15-hexamethyl-2,6,14-trioxo-10-{[3,4,6-trideoxy-3-(dimethylamino)-beta-D-xylo-hexopyranosyl]oxy}tetradecahydro-2H-oxacyclotetradecino[4,3-d][1,3]oxazol-8-yl (2R)-2-(pyridin-3-yl)pyrrolidine-1-carboxylate × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP
分辨率 3.20 Å R-free 0.235
4IOA Crystal structure of compound 4e bound to large ribosomal subunit (50S) from Deinococcus radiodurans 提交 2013-01-07 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 28 PDB 声明：30-meric
链 Q 1–95（95 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 35 1F3 (3aS,4R,7R,8S,9S,10R,11R,13R,15R,15aR)-4-ethyl-11-methoxy-3a,7,9,11,13,15-hexamethyl-2,6,14-trioxo-10-{[3,4,6-trideoxy-3-(dimethylamino)-beta-D-xylo-hexopyranosyl]oxy}tetradecahydro-2H-oxacyclotetradecino[4,3-d][1,3]oxazol-8-yl (2R)-2-[4-(acetylamino)phenyl]-2,3-dihydro-1H-pyrrole-1-carboxylate × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP
分辨率 3.20 Å R-free 0.230
4IOC Crystal structure of compound 4f bound to large ribosomal subunit (50S) from Deinococcus radiodurans 提交 2013-01-07 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 28 PDB 声明：30-meric
链 Q 1–95（95 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 35 1F4 (3aS,4R,7R,8S,9S,10R,11R,13R,15S,15aR)-4-ethyl-11-methoxy-3a,7,9,11,13,15-hexamethyl-2,6,14-trioxo-10-{[3,4,6-trideoxy-3-(dimethylamino)-beta-D-xylo-hexopyranosyl]oxy}tetradecahydro-2H-oxacyclotetradecino[4,3-d][1,3]oxazol-8-yl (2R)-4,4-dimethyl-2-(pyridin-3-yl)pyrrolidine-1-carboxylate × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP
分辨率 3.60 Å R-free 0.239
4U67 Crystal structure of the large ribosomal subunit (50S) of Deinococcus radiodurans containing a three residue insertion in L22 提交 2014-07-28 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 26 PDB 声明：28-meric
链 Q 1–95（95 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 51 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；293 K；Magnesium chloride, HEPES, ammonium chloride, ethanol, 2-ethyl-1,3-hexandiol
分辨率 3.65 Å R-free 0.270
4WFN Crystal structure of the large ribosomal subunit (50S) of Deinococcus radiodurans containing a three residue insertion in L22 in complex with erythromycin 提交 2014-09-16 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 26 PDB 声明：28-meric
链 Q 1–95（95 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 70 ERY ERYTHROMYCIN A × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；293 K；Magnesuim chloride, Hepes, ammonium chloride, ethanol, 2-ethyl-1,3-hexadiol
分辨率 3.54 Å R-free 0.282
5DM6 Crystal structure of the 50S ribosomal subunit from Deinococcus radiodurans 提交 2015-09-08 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 28 PDB 声明：30-meric
链 Q 2–94（93 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 198 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；292 K；HEPES, sodium hydroxide, magnesium chloride, ammonium chloride, 2-mercaptoethanol, spermidine, 2-ethyl-1, 3-hexanediol, ethanol
分辨率 2.90 Å R-free 0.270
5DM7 Crystal structure of the 50S ribosomal subunit from Deinococcus radiodurans in complex with hygromycin A 提交 2015-09-08 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 28 PDB 声明：30-meric
链 Q 2–94（93 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 186 HGR Hygromycin A × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；292 K；HEPES, sodium hydroxide, magnesium chloride, ammonium chloride, 2-mercaptoethanol, spermidine, 2-ethyl-1,3-hexanediol, ethanol
分辨率 3.00 Å R-free 0.326
5JVG The large ribosomal subunit from Deinococcus radiodurans in complex with avilamycin 提交 2016-05-11 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 27 PDB 声明：29-meric
链 Q 1–95（95 aa）
未记录 6NO Avilamycin × 1 MG MAGNESIUM ION × 446 MPD (4S)-2-METHYL-2,4-PENTANEDIOL × 5 SPD SPERMIDINE × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；293.15 K；Ribosome solution containing 0.0065 mM (180 A/ml) of D50S in 10 mM Hepes pH=7.8, 15 mM MgCl2 and 75 mM NH4Cl crystallization buffer was mixed with 10 mM spermidine, 1 % ethanol and 0.5 % 2-ethyl-1,3-hexanediol precipitants. A 0.005 ml crystallization drop was hanged over 10 % ethanol and 5% 2-ethyl-1,3-hexanediol in ddw reservoir.
分辨率 3.43 Å R-free 0.253
5JVH The crystal structure large ribosomal subunit (50S) of Deinococcus radiodurans in complex with evernimicin 提交 2016-05-11 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 26 PDB 声明：28-meric
链 Q 1–95（95 aa）
未记录 6O1 Evernimicin × 1 MG MAGNESIUM ION × 123 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；293 K；Magnesium chloride, HEPES, ammonium chloride, ethanol, 2-ethyl-1,3-hexandiol
分辨率 3.58 Å R-free 0.247
7A0R 50S Deinococcus radiodurans ribosome bounded with mycinamicin I 提交 2020-08-10 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 26 PDB 声明：28-meric
链 Q 2–94（93 aa）
未记录 QTZ mycinamicin II × 1 MG MAGNESIUM ION × 345 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293.15 K；Ribosome solution containing 0.0065 mM (180 A/ml) of D50S in 10 mM Hepes pH=7.8, 15 mM MgCl2 and 75 mM NH4Cl crystallization buffer was mixed with 10 mM spermidine, 1 % ethanol and 0.5 % 2-ethyl-1,3-hexanediol precipitants. A 0.005 ml crystallization drop was hanged over 10 % ethanol and 5% 2-ethyl-1,3-hexanediol in ddw reservoir.
分辨率 3.30 Å R-free 0.249
7A0S 50S Deinococcus radiodurans ribosome bounded with mycinamicin I 提交 2020-08-10 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 26 PDB 声明：28-meric
链 Q 2–94（93 aa）
未记录 QU2 mycinamicin I × 1 MG MAGNESIUM ION × 367 SPD SPERMIDINE × 8 MPD (4S)-2-METHYL-2,4-PENTANEDIOL × 4 NA SODIUM ION × 1 EOH ETHANOL × 1 CA CALCIUM ION × 5 K POTASSIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293.15 K；Ribosome solution containing 0.0065 mM (180 A/ml) of D50S in 10 mM Hepes pH=7.8, 15 mM MgCl2 and 75 mM NH4Cl crystallization buffer was mixed with 10 mM spermidine, 1 % ethanol and 0.5 % 2-ethyl-1,3-hexanediol precipitants. A 0.005 ml crystallization drop was hanged over 10 % ethanol and 5% 2-ethyl-1,3-hexanediol in ddw reservoir.
分辨率 3.22 Å R-free 0.253
7A18 50S Deinococcus radiodurans ribosome bounded with mycinamicin IV 提交 2020-08-12 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 26 PDB 声明：28-meric
链 Q 2–94（93 aa）
未记录 MIV MYCINAMICIN IV × 1 MG MAGNESIUM ION × 277 SPD SPERMIDINE × 7 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；293.15 K；Ribosome solution containing 0.0065 mM (180 A/ml) of D50S in 10 mM Hepes pH=7.8, 15 mM MgCl2 and 75 mM NH4Cl crystallization buffer was mixed with 10 mM spermidine, 1 % ethanol and 0.5 % 2-ethyl-1,3-hexanediol precipitants. A 0.005 ml crystallization drop was hanged over 10 % ethanol and 5% 2-ethyl-1,3-hexanediol in ddw reservoir.
分辨率 3.40 Å R-free 0.318

共 25 个其他 PDB 条目、25 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

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UniProt名称 RL23_DEIRA
Isoform —
PDB实体 22
链与序列区间 作者链 Q； PDB构建体 1–95； UniProt 1–95

50S RIBOSOMAL PROTEIN L24

物种未注明

UniProt Q9RXJ1

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白–RNA 异源复合物 蛋白 × 29 RNA 2 PDB 声明：31-meric（31） 与全部聚合物数一致 链 R； UniProt 1–115 未记录 50S RIBOSOMAL PROTEIN L33 × 1 （Q9RSS4） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L34 × 1 （Q9RSH2） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L35 × 1 （Q9RSW6） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L36 × 1 （Q9RSK0） THIOSTREPTON × 1 （P0C8P8） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L2 × 1 （Q9RXJ9） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L3 × 1 （Q9RXK2） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L4 × 1 （Q9RXK1） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L5 × 1 （Q9RXJ0） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L6 × 1 （Q9RSL3） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L11 × 1 （Q9RSS7） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L13 × 1 （Q9RXY1） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L14 × 1 （Q9RXJ2） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L15 × 1 （Q9RSK9） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L16 × 1 （Q9RXJ5） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L17 × 1 （Q9RSJ5） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L18 × 1 （Q9RSL2） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L19 × 1 （Q9RWB4） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L20 × 1 （Q9RSW7） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L21 × 1 （Q9RY64） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L22 × 1 （Q9RXJ7） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L23 × 1 （Q9RXK0） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L25 × 1 （Q9RX88） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L27 × 1 （Q9RY65） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L28 × 1 （Q9RRG8） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L29 × 1 （Q9RXJ4） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L30 × 1 （Q9RSL0） RRNA-23S RIBOSOMAL RNA × 1 50S RIBOSOMAL PROTEIN L32 × 1 （P49228） RRNA-5S RIBOSOMAL RNA × 1 MG MAGNESIUM ION × 36 X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP 分辨率 3.30 Å R-free 0.318

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 3CF5 Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
1NKW Crystal Structure Of The Large Ribosomal Subunit From Deinococcus Radiodurans 提交 2003-01-05 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 29 PDB 声明：31-meric
链 S 1–115（115 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；ETHANOL, DIMETHYLHEXANEDIOL, MGCL2, KCL, HEPES, NH4CL, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP
分辨率 3.10 Å R-free 0.274
1NWX COMPLEX OF THE LARGE RIBOSOMAL SUBUNIT FROM DEINOCOCCUS RADIODURANS WITH ABT-773 提交 2003-02-07 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 29 PDB 声明：31-meric
链 S 1–115（115 aa）
未记录 773 CETHROMYCIN × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；281 K；ETHANOL, DIMETHYLHEXANEDIOL, MGCL2, KCL, HEPES, NH4CL, pH 7.80, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 281K
分辨率 3.50 Å R-free 0.313
1NWY COMPLEX OF THE LARGE RIBOSOMAL SUBUNIT FROM DEINOCOCCUS RADIODURANS WITH AZITHROMYCIN 提交 2003-02-07 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 29 PDB 声明：31-meric
链 S 1–115（115 aa）
未记录 ZIT AZITHROMYCIN × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；291 K；ETHANOL, DIMETHYLHEXANEDIOL, MGCL2, KCL, HEPES, NH4CL, pH 7.80, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K
分辨率 3.30 Å R-free 0.304
1SM1 COMPLEX OF THE LARGE RIBOSOMAL SUBUNIT FROM DEINOCOCCUS RADIODURANS WITH QUINUPRISTIN AND DALFOPRISTIN 提交 2004-03-08 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 30 PDB 声明：32-meric
链 S 1–115（115 aa）
未记录 DOL 5-(2-DIETHYLAMINO-ETHANESULFONYL)-21-HYDROXY-10-ISOPROPYL-11,19-DIMETHYL-9,26-DIOXA-3,15,28-TRIAZA-TRICYCLO[23.2.1.00,255]OCTACOSA-1(27),12,17,19,25(28)-PENTAENE-2,8,14,23-TETRAONE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 7.8；ETHANOL, DIMETHYLHEXANEDIOL, MGCL2, KCL, HEPES, NH4CL , PH 7.80, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, TEMPERATURE 290K
分辨率 3.42 Å R-free 0.348
1XBP Inhibition of peptide bond formation by pleuromutilins: The structure of the 50S ribosomal subunit from Deinococcus radiodurans in complex with Tiamulin 提交 2004-08-31 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 29 PDB 声明：31-meric
链 S 1–115（115 aa）
未记录 MUL TIAMULIN × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；280 K；ETHANOL, DIMETHYLHEXANEDIOL, MGCL2,KCL, HEPES, NH4CL, pH 7.80, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 280K
分辨率 3.50 Å R-free 0.360
2D3O Structure of Ribosome Binding Domain of the Trigger Factor on the 50S ribosomal subunit from D. radiodurans 提交 2005-09-30 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：pentameric
链 S 1–115（115 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.8；290 K；ETHANOL, DIMETHYLHEXANEDIOL, MGCL2, KCL, HEPES, NH4CL, pH 7.8, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 290K
分辨率 3.35 Å R-free 0.322
2ZJP Thiopeptide antibiotic Nosiheptide bound to the large ribosomal subunit of Deinococcus radiodurans 提交 2008-03-07 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 29 PDB 声明：31-meric
链 R 1–115（115 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 NO1 4-(hydroxymethyl)-3-methyl-1H-indole-2-carboxylic acid × 1 MG MAGNESIUM ION × 35 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP
分辨率 3.70 Å R-free 0.340
2ZJQ Interaction of L7 with L11 induced by Microccocin binding to the Deinococcus radiodurans 50S subunit 提交 2008-03-08 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 29 PDB 声明：31-meric
链 R 1–115（115 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP
分辨率 3.30 Å R-free 0.339
2ZJR Refined native structure of the large ribosomal subunit (50S) from Deinococcus radiodurans 提交 2008-03-08 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 28 PDB 声明：30-meric
链 R 1–115（115 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 35 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP
分辨率 2.91 Å R-free 0.311
3DLL The oxazolidinone antibiotics perturb the ribosomal peptidyl-transferase center and effect tRNA positioning 提交 2008-06-27 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 28 PDB 声明：30-meric
链 R 1–115（115 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 35 ZLD N-{[(5S)-3-(3-fluoro-4-morpholin-4-ylphenyl)-2-oxo-1,3-oxazolidin-5-yl]methyl}acetamide × 1 ZN ZINC ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；10mM MgCl2, 60mM NH4Cl, 5mM KCl, 10mM HEPES, pH7.8, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP
分辨率 3.50 Å R-free 0.280
3PIO Crystal structure of the synergistic antibiotic pair lankamycin and lankacidin in complex with the large ribosomal subunit 提交 2010-11-07 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 28 PDB 声明：30-meric
链 R 1–115（115 aa）
未记录 LMA Lankamycin × 1 MG MAGNESIUM ION × 154 NA SODIUM ION × 42 K POTASSIUM ION × 15 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP. 15% 2:1 ethanol:methylpentanediol was diffused to a hanging drop of 180 AU/ml solution of D50S.
分辨率 3.25 Å R-free 0.294
3PIP Crystal structure of the synergistic antibiotic pair lankamycin and lankacidin in complex with the large ribosomal subunit 提交 2010-11-07 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 28 PDB 声明：30-meric
链 R 1–115（115 aa）
未记录 LC2 N-[(1S,2R,3E,5E,7S,9E,11E,13S,15R,19R)-7,13-dihydroxy-1,4,10,19-tetramethyl-17,18-dioxo-16-oxabicyclo[13.2.2]nonadeca-3,5,9,11-tetraen-2-yl]-2-oxopropanamide × 1 LMA Lankamycin × 1 MG MAGNESIUM ION × 73 K POTASSIUM ION × 4 NA SODIUM ION × 5 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP. 15% 2:1 ethanol:methylpentanediol was diffused to a hanging drop of 180 AU/ml solution of D50S.
分辨率 3.45 Å R-free 0.301
4IO9 Crystal structure of compound 4d bound to large ribosomal subunit (50S) from Deinococcus radiodurans 提交 2013-01-07 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 28 PDB 声明：30-meric
链 R 1–115（115 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 35 1F2 (3aS,4R,7R,8S,9S,10R,11R,13R,15R,15aR)-4-ethyl-11-methoxy-3a,7,9,11,13,15-hexamethyl-2,6,14-trioxo-10-{[3,4,6-trideoxy-3-(dimethylamino)-beta-D-xylo-hexopyranosyl]oxy}tetradecahydro-2H-oxacyclotetradecino[4,3-d][1,3]oxazol-8-yl (2R)-2-(pyridin-3-yl)pyrrolidine-1-carboxylate × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP
分辨率 3.20 Å R-free 0.235
4IOA Crystal structure of compound 4e bound to large ribosomal subunit (50S) from Deinococcus radiodurans 提交 2013-01-07 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 28 PDB 声明：30-meric
链 R 1–115（115 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 35 1F3 (3aS,4R,7R,8S,9S,10R,11R,13R,15R,15aR)-4-ethyl-11-methoxy-3a,7,9,11,13,15-hexamethyl-2,6,14-trioxo-10-{[3,4,6-trideoxy-3-(dimethylamino)-beta-D-xylo-hexopyranosyl]oxy}tetradecahydro-2H-oxacyclotetradecino[4,3-d][1,3]oxazol-8-yl (2R)-2-[4-(acetylamino)phenyl]-2,3-dihydro-1H-pyrrole-1-carboxylate × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP
分辨率 3.20 Å R-free 0.230
4IOC Crystal structure of compound 4f bound to large ribosomal subunit (50S) from Deinococcus radiodurans 提交 2013-01-07 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 28 PDB 声明：30-meric
链 R 1–115（115 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 35 1F4 (3aS,4R,7R,8S,9S,10R,11R,13R,15S,15aR)-4-ethyl-11-methoxy-3a,7,9,11,13,15-hexamethyl-2,6,14-trioxo-10-{[3,4,6-trideoxy-3-(dimethylamino)-beta-D-xylo-hexopyranosyl]oxy}tetradecahydro-2H-oxacyclotetradecino[4,3-d][1,3]oxazol-8-yl (2R)-4,4-dimethyl-2-(pyridin-3-yl)pyrrolidine-1-carboxylate × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP
分辨率 3.60 Å R-free 0.239
4U67 Crystal structure of the large ribosomal subunit (50S) of Deinococcus radiodurans containing a three residue insertion in L22 提交 2014-07-28 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 26 PDB 声明：28-meric
链 R 2–115（114 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 51 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；293 K；Magnesium chloride, HEPES, ammonium chloride, ethanol, 2-ethyl-1,3-hexandiol
分辨率 3.65 Å R-free 0.270
4WFN Crystal structure of the large ribosomal subunit (50S) of Deinococcus radiodurans containing a three residue insertion in L22 in complex with erythromycin 提交 2014-09-16 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 26 PDB 声明：28-meric
链 R 1–115（115 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 70 ERY ERYTHROMYCIN A × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；293 K；Magnesuim chloride, Hepes, ammonium chloride, ethanol, 2-ethyl-1,3-hexadiol
分辨率 3.54 Å R-free 0.282
5DM6 Crystal structure of the 50S ribosomal subunit from Deinococcus radiodurans 提交 2015-09-08 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 28 PDB 声明：30-meric
链 R 4–113（110 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 198 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；292 K；HEPES, sodium hydroxide, magnesium chloride, ammonium chloride, 2-mercaptoethanol, spermidine, 2-ethyl-1, 3-hexanediol, ethanol
分辨率 2.90 Å R-free 0.270
5DM7 Crystal structure of the 50S ribosomal subunit from Deinococcus radiodurans in complex with hygromycin A 提交 2015-09-08 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 28 PDB 声明：30-meric
链 R 4–113（110 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 186 HGR Hygromycin A × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；292 K；HEPES, sodium hydroxide, magnesium chloride, ammonium chloride, 2-mercaptoethanol, spermidine, 2-ethyl-1,3-hexanediol, ethanol
分辨率 3.00 Å R-free 0.326
5JVG The large ribosomal subunit from Deinococcus radiodurans in complex with avilamycin 提交 2016-05-11 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 27 PDB 声明：29-meric
链 R 1–115（115 aa）
未记录 6NO Avilamycin × 1 MG MAGNESIUM ION × 446 MPD (4S)-2-METHYL-2,4-PENTANEDIOL × 5 SPD SPERMIDINE × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；293.15 K；Ribosome solution containing 0.0065 mM (180 A/ml) of D50S in 10 mM Hepes pH=7.8, 15 mM MgCl2 and 75 mM NH4Cl crystallization buffer was mixed with 10 mM spermidine, 1 % ethanol and 0.5 % 2-ethyl-1,3-hexanediol precipitants. A 0.005 ml crystallization drop was hanged over 10 % ethanol and 5% 2-ethyl-1,3-hexanediol in ddw reservoir.
分辨率 3.43 Å R-free 0.253
5JVH The crystal structure large ribosomal subunit (50S) of Deinococcus radiodurans in complex with evernimicin 提交 2016-05-11 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 26 PDB 声明：28-meric
链 R 1–115（115 aa）
未记录 6O1 Evernimicin × 1 MG MAGNESIUM ION × 123 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；293 K；Magnesium chloride, HEPES, ammonium chloride, ethanol, 2-ethyl-1,3-hexandiol
分辨率 3.58 Å R-free 0.247
7A0R 50S Deinococcus radiodurans ribosome bounded with mycinamicin I 提交 2020-08-10 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 26 PDB 声明：28-meric
链 R 4–113（110 aa）
未记录 QTZ mycinamicin II × 1 MG MAGNESIUM ION × 345 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293.15 K；Ribosome solution containing 0.0065 mM (180 A/ml) of D50S in 10 mM Hepes pH=7.8, 15 mM MgCl2 and 75 mM NH4Cl crystallization buffer was mixed with 10 mM spermidine, 1 % ethanol and 0.5 % 2-ethyl-1,3-hexanediol precipitants. A 0.005 ml crystallization drop was hanged over 10 % ethanol and 5% 2-ethyl-1,3-hexanediol in ddw reservoir.
分辨率 3.30 Å R-free 0.249
7A0S 50S Deinococcus radiodurans ribosome bounded with mycinamicin I 提交 2020-08-10 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 26 PDB 声明：28-meric
链 R 4–113（110 aa）
未记录 QU2 mycinamicin I × 1 MG MAGNESIUM ION × 367 SPD SPERMIDINE × 8 MPD (4S)-2-METHYL-2,4-PENTANEDIOL × 4 NA SODIUM ION × 1 EOH ETHANOL × 1 CA CALCIUM ION × 5 K POTASSIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293.15 K；Ribosome solution containing 0.0065 mM (180 A/ml) of D50S in 10 mM Hepes pH=7.8, 15 mM MgCl2 and 75 mM NH4Cl crystallization buffer was mixed with 10 mM spermidine, 1 % ethanol and 0.5 % 2-ethyl-1,3-hexanediol precipitants. A 0.005 ml crystallization drop was hanged over 10 % ethanol and 5% 2-ethyl-1,3-hexanediol in ddw reservoir.
分辨率 3.22 Å R-free 0.253
7A18 50S Deinococcus radiodurans ribosome bounded with mycinamicin IV 提交 2020-08-12 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 26 PDB 声明：28-meric
链 R 4–113（110 aa）
未记录 MIV MYCINAMICIN IV × 1 MG MAGNESIUM ION × 277 SPD SPERMIDINE × 7 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；293.15 K；Ribosome solution containing 0.0065 mM (180 A/ml) of D50S in 10 mM Hepes pH=7.8, 15 mM MgCl2 and 75 mM NH4Cl crystallization buffer was mixed with 10 mM spermidine, 1 % ethanol and 0.5 % 2-ethyl-1,3-hexanediol precipitants. A 0.005 ml crystallization drop was hanged over 10 % ethanol and 5% 2-ethyl-1,3-hexanediol in ddw reservoir.
分辨率 3.40 Å R-free 0.318

共 24 个其他 PDB 条目、24 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 RL24_DEIRA
Isoform —
PDB实体 23
链与序列区间 作者链 R； PDB构建体 1–115； UniProt 1–115

50S RIBOSOMAL PROTEIN L25

物种未注明

UniProt Q9RX88

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白–RNA 异源复合物 蛋白 × 29 RNA 2 PDB 声明：31-meric（31） 与全部聚合物数一致 链 S； UniProt 1–237 未记录 50S RIBOSOMAL PROTEIN L33 × 1 （Q9RSS4） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L34 × 1 （Q9RSH2） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L35 × 1 （Q9RSW6） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L36 × 1 （Q9RSK0） THIOSTREPTON × 1 （P0C8P8） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L2 × 1 （Q9RXJ9） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L3 × 1 （Q9RXK2） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L4 × 1 （Q9RXK1） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L5 × 1 （Q9RXJ0） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L6 × 1 （Q9RSL3） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L11 × 1 （Q9RSS7） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L13 × 1 （Q9RXY1） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L14 × 1 （Q9RXJ2） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L15 × 1 （Q9RSK9） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L16 × 1 （Q9RXJ5） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L17 × 1 （Q9RSJ5） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L18 × 1 （Q9RSL2） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L19 × 1 （Q9RWB4） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L20 × 1 （Q9RSW7） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L21 × 1 （Q9RY64） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L22 × 1 （Q9RXJ7） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L23 × 1 （Q9RXK0） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L24 × 1 （Q9RXJ1） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L27 × 1 （Q9RY65） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L28 × 1 （Q9RRG8） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L29 × 1 （Q9RXJ4） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L30 × 1 （Q9RSL0） RRNA-23S RIBOSOMAL RNA × 1 50S RIBOSOMAL PROTEIN L32 × 1 （P49228） RRNA-5S RIBOSOMAL RNA × 1 MG MAGNESIUM ION × 36 X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP 分辨率 3.30 Å R-free 0.318

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 3CF5 Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
1NJM The crystal structure of the 50S Large ribosomal subunit from Deinococcus radiodurans complexed with a tRNA acceptor stem mimic (ASM) and the antibiotic sparsomycin 提交 2003-01-02 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：tetrameric
链 T 17–253（237 aa）
未记录 SPS SPARSOMYCIN × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 ETHANOL, DIMETHYLHEXANEDIOL, MGCL2, KCL, HEPES, NH4CL, SPARSOMYCIN; SOAKING CRYSTALS IN: 0.025mM ASM
分辨率 3.60 Å R-free 0.308
1NJP The crystal structure of the 50S Large ribosomal subunit from Deinococcus radiodurans complexed with a tRNA acceptor stem mimic (ASM) 提交 2003-01-02 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：tetrameric
链 T 17–253（237 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 7.8；ETHANOL, DIMETHYLHEXANEDIOL, MGCL2, KCL, HEPES, NH4CL, SPARSOMYCIN; SOAKING CRYSTALS IN: 0.025mM ASM , pH 7.80
分辨率 3.50 Å R-free 0.295
1NKW Crystal Structure Of The Large Ribosomal Subunit From Deinococcus Radiodurans 提交 2003-01-05 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 29 PDB 声明：31-meric
链 T 1–237（237 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；ETHANOL, DIMETHYLHEXANEDIOL, MGCL2, KCL, HEPES, NH4CL, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP
分辨率 3.10 Å R-free 0.274
1NWX COMPLEX OF THE LARGE RIBOSOMAL SUBUNIT FROM DEINOCOCCUS RADIODURANS WITH ABT-773 提交 2003-02-07 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 29 PDB 声明：31-meric
链 T 17–253（237 aa）
未记录 773 CETHROMYCIN × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；281 K；ETHANOL, DIMETHYLHEXANEDIOL, MGCL2, KCL, HEPES, NH4CL, pH 7.80, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 281K
分辨率 3.50 Å R-free 0.313
1NWY COMPLEX OF THE LARGE RIBOSOMAL SUBUNIT FROM DEINOCOCCUS RADIODURANS WITH AZITHROMYCIN 提交 2003-02-07 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 29 PDB 声明：31-meric
链 T 17–253（237 aa）
未记录 ZIT AZITHROMYCIN × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；291 K；ETHANOL, DIMETHYLHEXANEDIOL, MGCL2, KCL, HEPES, NH4CL, pH 7.80, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K
分辨率 3.30 Å R-free 0.304
1SM1 COMPLEX OF THE LARGE RIBOSOMAL SUBUNIT FROM DEINOCOCCUS RADIODURANS WITH QUINUPRISTIN AND DALFOPRISTIN 提交 2004-03-08 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 30 PDB 声明：32-meric
链 T 1–253（253 aa）
未记录 DOL 5-(2-DIETHYLAMINO-ETHANESULFONYL)-21-HYDROXY-10-ISOPROPYL-11,19-DIMETHYL-9,26-DIOXA-3,15,28-TRIAZA-TRICYCLO[23.2.1.00,255]OCTACOSA-1(27),12,17,19,25(28)-PENTAENE-2,8,14,23-TETRAONE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 7.8；ETHANOL, DIMETHYLHEXANEDIOL, MGCL2, KCL, HEPES, NH4CL , PH 7.80, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, TEMPERATURE 290K
分辨率 3.42 Å R-free 0.348
1XBP Inhibition of peptide bond formation by pleuromutilins: The structure of the 50S ribosomal subunit from Deinococcus radiodurans in complex with Tiamulin 提交 2004-08-31 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 29 PDB 声明：31-meric
链 T 1–237（237 aa）
未记录 MUL TIAMULIN × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；280 K；ETHANOL, DIMETHYLHEXANEDIOL, MGCL2,KCL, HEPES, NH4CL, pH 7.80, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 280K
分辨率 3.50 Å R-free 0.360
2ZJP Thiopeptide antibiotic Nosiheptide bound to the large ribosomal subunit of Deinococcus radiodurans 提交 2008-03-07 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 29 PDB 声明：31-meric
链 S 1–237（237 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 NO1 4-(hydroxymethyl)-3-methyl-1H-indole-2-carboxylic acid × 1 MG MAGNESIUM ION × 35 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP
分辨率 3.70 Å R-free 0.340
2ZJQ Interaction of L7 with L11 induced by Microccocin binding to the Deinococcus radiodurans 50S subunit 提交 2008-03-08 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 29 PDB 声明：31-meric
链 S 1–237（237 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP
分辨率 3.30 Å R-free 0.339
2ZJR Refined native structure of the large ribosomal subunit (50S) from Deinococcus radiodurans 提交 2008-03-08 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 28 PDB 声明：30-meric
链 S 1–237（237 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 35 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP
分辨率 2.91 Å R-free 0.311
3DLL The oxazolidinone antibiotics perturb the ribosomal peptidyl-transferase center and effect tRNA positioning 提交 2008-06-27 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 28 PDB 声明：30-meric
链 S 1–237（237 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 35 ZLD N-{[(5S)-3-(3-fluoro-4-morpholin-4-ylphenyl)-2-oxo-1,3-oxazolidin-5-yl]methyl}acetamide × 1 ZN ZINC ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；10mM MgCl2, 60mM NH4Cl, 5mM KCl, 10mM HEPES, pH7.8, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP
分辨率 3.50 Å R-free 0.280
3PIO Crystal structure of the synergistic antibiotic pair lankamycin and lankacidin in complex with the large ribosomal subunit 提交 2010-11-07 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 28 PDB 声明：30-meric
链 S 1–237（237 aa）
未记录 LMA Lankamycin × 1 MG MAGNESIUM ION × 154 NA SODIUM ION × 42 K POTASSIUM ION × 15 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP. 15% 2:1 ethanol:methylpentanediol was diffused to a hanging drop of 180 AU/ml solution of D50S.
分辨率 3.25 Å R-free 0.294
3PIP Crystal structure of the synergistic antibiotic pair lankamycin and lankacidin in complex with the large ribosomal subunit 提交 2010-11-07 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 28 PDB 声明：30-meric
链 S 1–237（237 aa）
未记录 LC2 N-[(1S,2R,3E,5E,7S,9E,11E,13S,15R,19R)-7,13-dihydroxy-1,4,10,19-tetramethyl-17,18-dioxo-16-oxabicyclo[13.2.2]nonadeca-3,5,9,11-tetraen-2-yl]-2-oxopropanamide × 1 LMA Lankamycin × 1 MG MAGNESIUM ION × 73 K POTASSIUM ION × 4 NA SODIUM ION × 5 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP. 15% 2:1 ethanol:methylpentanediol was diffused to a hanging drop of 180 AU/ml solution of D50S.
分辨率 3.45 Å R-free 0.301
4IO9 Crystal structure of compound 4d bound to large ribosomal subunit (50S) from Deinococcus radiodurans 提交 2013-01-07 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 28 PDB 声明：30-meric
链 S 1–237（237 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 35 1F2 (3aS,4R,7R,8S,9S,10R,11R,13R,15R,15aR)-4-ethyl-11-methoxy-3a,7,9,11,13,15-hexamethyl-2,6,14-trioxo-10-{[3,4,6-trideoxy-3-(dimethylamino)-beta-D-xylo-hexopyranosyl]oxy}tetradecahydro-2H-oxacyclotetradecino[4,3-d][1,3]oxazol-8-yl (2R)-2-(pyridin-3-yl)pyrrolidine-1-carboxylate × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP
分辨率 3.20 Å R-free 0.235
4IOA Crystal structure of compound 4e bound to large ribosomal subunit (50S) from Deinococcus radiodurans 提交 2013-01-07 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 28 PDB 声明：30-meric
链 S 1–237（237 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 35 1F3 (3aS,4R,7R,8S,9S,10R,11R,13R,15R,15aR)-4-ethyl-11-methoxy-3a,7,9,11,13,15-hexamethyl-2,6,14-trioxo-10-{[3,4,6-trideoxy-3-(dimethylamino)-beta-D-xylo-hexopyranosyl]oxy}tetradecahydro-2H-oxacyclotetradecino[4,3-d][1,3]oxazol-8-yl (2R)-2-[4-(acetylamino)phenyl]-2,3-dihydro-1H-pyrrole-1-carboxylate × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP
分辨率 3.20 Å R-free 0.230
4IOC Crystal structure of compound 4f bound to large ribosomal subunit (50S) from Deinococcus radiodurans 提交 2013-01-07 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 28 PDB 声明：30-meric
链 S 1–237（237 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 35 1F4 (3aS,4R,7R,8S,9S,10R,11R,13R,15S,15aR)-4-ethyl-11-methoxy-3a,7,9,11,13,15-hexamethyl-2,6,14-trioxo-10-{[3,4,6-trideoxy-3-(dimethylamino)-beta-D-xylo-hexopyranosyl]oxy}tetradecahydro-2H-oxacyclotetradecino[4,3-d][1,3]oxazol-8-yl (2R)-4,4-dimethyl-2-(pyridin-3-yl)pyrrolidine-1-carboxylate × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP
分辨率 3.60 Å R-free 0.239
4U67 Crystal structure of the large ribosomal subunit (50S) of Deinococcus radiodurans containing a three residue insertion in L22 提交 2014-07-28 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 26 PDB 声明：28-meric
链 S 1–237（237 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 51 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；293 K；Magnesium chloride, HEPES, ammonium chloride, ethanol, 2-ethyl-1,3-hexandiol
分辨率 3.65 Å R-free 0.270
4WFN Crystal structure of the large ribosomal subunit (50S) of Deinococcus radiodurans containing a three residue insertion in L22 in complex with erythromycin 提交 2014-09-16 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 26 PDB 声明：28-meric
链 S 1–237（237 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 70 ERY ERYTHROMYCIN A × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；293 K；Magnesuim chloride, Hepes, ammonium chloride, ethanol, 2-ethyl-1,3-hexadiol
分辨率 3.54 Å R-free 0.282
5DM6 Crystal structure of the 50S ribosomal subunit from Deinococcus radiodurans 提交 2015-09-08 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 28 PDB 声明：30-meric
链 S 1–175（175 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 198 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；292 K；HEPES, sodium hydroxide, magnesium chloride, ammonium chloride, 2-mercaptoethanol, spermidine, 2-ethyl-1, 3-hexanediol, ethanol
分辨率 2.90 Å R-free 0.270
5DM7 Crystal structure of the 50S ribosomal subunit from Deinococcus radiodurans in complex with hygromycin A 提交 2015-09-08 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 28 PDB 声明：30-meric
链 S 1–175（175 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 186 HGR Hygromycin A × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；292 K；HEPES, sodium hydroxide, magnesium chloride, ammonium chloride, 2-mercaptoethanol, spermidine, 2-ethyl-1,3-hexanediol, ethanol
分辨率 3.00 Å R-free 0.326
5JVG The large ribosomal subunit from Deinococcus radiodurans in complex with avilamycin 提交 2016-05-11 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 27 PDB 声明：29-meric
链 S 1–237（237 aa）
未记录 6NO Avilamycin × 1 MG MAGNESIUM ION × 446 MPD (4S)-2-METHYL-2,4-PENTANEDIOL × 5 SPD SPERMIDINE × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；293.15 K；Ribosome solution containing 0.0065 mM (180 A/ml) of D50S in 10 mM Hepes pH=7.8, 15 mM MgCl2 and 75 mM NH4Cl crystallization buffer was mixed with 10 mM spermidine, 1 % ethanol and 0.5 % 2-ethyl-1,3-hexanediol precipitants. A 0.005 ml crystallization drop was hanged over 10 % ethanol and 5% 2-ethyl-1,3-hexanediol in ddw reservoir.
分辨率 3.43 Å R-free 0.253
5JVH The crystal structure large ribosomal subunit (50S) of Deinococcus radiodurans in complex with evernimicin 提交 2016-05-11 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 26 PDB 声明：28-meric
链 S 1–237（237 aa）
未记录 6O1 Evernimicin × 1 MG MAGNESIUM ION × 123 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；293 K；Magnesium chloride, HEPES, ammonium chloride, ethanol, 2-ethyl-1,3-hexandiol
分辨率 3.58 Å R-free 0.247
7A0R 50S Deinococcus radiodurans ribosome bounded with mycinamicin I 提交 2020-08-10 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 26 PDB 声明：28-meric
链 S 1–175（175 aa）
未记录 QTZ mycinamicin II × 1 MG MAGNESIUM ION × 345 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293.15 K；Ribosome solution containing 0.0065 mM (180 A/ml) of D50S in 10 mM Hepes pH=7.8, 15 mM MgCl2 and 75 mM NH4Cl crystallization buffer was mixed with 10 mM spermidine, 1 % ethanol and 0.5 % 2-ethyl-1,3-hexanediol precipitants. A 0.005 ml crystallization drop was hanged over 10 % ethanol and 5% 2-ethyl-1,3-hexanediol in ddw reservoir.
分辨率 3.30 Å R-free 0.249
7A0S 50S Deinococcus radiodurans ribosome bounded with mycinamicin I 提交 2020-08-10 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 26 PDB 声明：28-meric
链 S 1–175（175 aa）
未记录 QU2 mycinamicin I × 1 MG MAGNESIUM ION × 367 SPD SPERMIDINE × 8 MPD (4S)-2-METHYL-2,4-PENTANEDIOL × 4 NA SODIUM ION × 1 EOH ETHANOL × 1 CA CALCIUM ION × 5 K POTASSIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293.15 K；Ribosome solution containing 0.0065 mM (180 A/ml) of D50S in 10 mM Hepes pH=7.8, 15 mM MgCl2 and 75 mM NH4Cl crystallization buffer was mixed with 10 mM spermidine, 1 % ethanol and 0.5 % 2-ethyl-1,3-hexanediol precipitants. A 0.005 ml crystallization drop was hanged over 10 % ethanol and 5% 2-ethyl-1,3-hexanediol in ddw reservoir.
分辨率 3.22 Å R-free 0.253
7A18 50S Deinococcus radiodurans ribosome bounded with mycinamicin IV 提交 2020-08-12 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 26 PDB 声明：28-meric
链 S 1–175（175 aa）
未记录 MIV MYCINAMICIN IV × 1 MG MAGNESIUM ION × 277 SPD SPERMIDINE × 7 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；293.15 K；Ribosome solution containing 0.0065 mM (180 A/ml) of D50S in 10 mM Hepes pH=7.8, 15 mM MgCl2 and 75 mM NH4Cl crystallization buffer was mixed with 10 mM spermidine, 1 % ethanol and 0.5 % 2-ethyl-1,3-hexanediol precipitants. A 0.005 ml crystallization drop was hanged over 10 % ethanol and 5% 2-ethyl-1,3-hexanediol in ddw reservoir.
分辨率 3.40 Å R-free 0.318

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UniProt名称 RL25_DEIRA
Isoform —
PDB实体 24
链与序列区间 作者链 S； PDB构建体 1–237； UniProt 1–237

50S RIBOSOMAL PROTEIN L27

物种未注明

UniProt Q9RY65

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白–RNA 异源复合物 蛋白 × 29 RNA 2 PDB 声明：31-meric（31） 与全部聚合物数一致 链 T； UniProt 1–91 未记录 50S RIBOSOMAL PROTEIN L33 × 1 （Q9RSS4） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L34 × 1 （Q9RSH2） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L35 × 1 （Q9RSW6） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L36 × 1 （Q9RSK0） THIOSTREPTON × 1 （P0C8P8） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L2 × 1 （Q9RXJ9） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L3 × 1 （Q9RXK2） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L4 × 1 （Q9RXK1） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L5 × 1 （Q9RXJ0） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L6 × 1 （Q9RSL3） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L11 × 1 （Q9RSS7） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L13 × 1 （Q9RXY1） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L14 × 1 （Q9RXJ2） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L15 × 1 （Q9RSK9） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L16 × 1 （Q9RXJ5） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L17 × 1 （Q9RSJ5） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L18 × 1 （Q9RSL2） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L19 × 1 （Q9RWB4） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L20 × 1 （Q9RSW7） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L21 × 1 （Q9RY64） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L22 × 1 （Q9RXJ7） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L23 × 1 （Q9RXK0） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L24 × 1 （Q9RXJ1） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L25 × 1 （Q9RX88） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L28 × 1 （Q9RRG8） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L29 × 1 （Q9RXJ4） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L30 × 1 （Q9RSL0） RRNA-23S RIBOSOMAL RNA × 1 50S RIBOSOMAL PROTEIN L32 × 1 （P49228） RRNA-5S RIBOSOMAL RNA × 1 MG MAGNESIUM ION × 36 X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP 分辨率 3.30 Å R-free 0.318

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 3CF5 Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
1NKW Crystal Structure Of The Large Ribosomal Subunit From Deinococcus Radiodurans 提交 2003-01-05 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 29 PDB 声明：31-meric
链 U 1–91（91 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；ETHANOL, DIMETHYLHEXANEDIOL, MGCL2, KCL, HEPES, NH4CL, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP
分辨率 3.10 Å R-free 0.274
1NWX COMPLEX OF THE LARGE RIBOSOMAL SUBUNIT FROM DEINOCOCCUS RADIODURANS WITH ABT-773 提交 2003-02-07 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 29 PDB 声明：31-meric
链 U 1–91（91 aa）
未记录 773 CETHROMYCIN × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；281 K；ETHANOL, DIMETHYLHEXANEDIOL, MGCL2, KCL, HEPES, NH4CL, pH 7.80, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 281K
分辨率 3.50 Å R-free 0.313
1NWY COMPLEX OF THE LARGE RIBOSOMAL SUBUNIT FROM DEINOCOCCUS RADIODURANS WITH AZITHROMYCIN 提交 2003-02-07 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 29 PDB 声明：31-meric
链 U 1–91（91 aa）
未记录 ZIT AZITHROMYCIN × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；291 K；ETHANOL, DIMETHYLHEXANEDIOL, MGCL2, KCL, HEPES, NH4CL, pH 7.80, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K
分辨率 3.30 Å R-free 0.304
1SM1 COMPLEX OF THE LARGE RIBOSOMAL SUBUNIT FROM DEINOCOCCUS RADIODURANS WITH QUINUPRISTIN AND DALFOPRISTIN 提交 2004-03-08 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 30 PDB 声明：32-meric
链 U 1–91（91 aa）
未记录 DOL 5-(2-DIETHYLAMINO-ETHANESULFONYL)-21-HYDROXY-10-ISOPROPYL-11,19-DIMETHYL-9,26-DIOXA-3,15,28-TRIAZA-TRICYCLO[23.2.1.00,255]OCTACOSA-1(27),12,17,19,25(28)-PENTAENE-2,8,14,23-TETRAONE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 7.8；ETHANOL, DIMETHYLHEXANEDIOL, MGCL2, KCL, HEPES, NH4CL , PH 7.80, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, TEMPERATURE 290K
分辨率 3.42 Å R-free 0.348
1XBP Inhibition of peptide bond formation by pleuromutilins: The structure of the 50S ribosomal subunit from Deinococcus radiodurans in complex with Tiamulin 提交 2004-08-31 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 29 PDB 声明：31-meric
链 U 1–91（91 aa）
未记录 MUL TIAMULIN × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；280 K；ETHANOL, DIMETHYLHEXANEDIOL, MGCL2,KCL, HEPES, NH4CL, pH 7.80, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 280K
分辨率 3.50 Å R-free 0.360
1Y69 RRF domain I in complex with the 50S ribosomal subunit from Deinococcus radiodurans 提交 2004-12-04 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：pentameric
链 U 1–91（91 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；290 K；ETHANOL, DIMETHYLHEXANEDIOL, MGCL2, KCL, HEPES, NH4CL, pH 7.80, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 290K
分辨率 3.33 Å R-free 0.338
2ZJP Thiopeptide antibiotic Nosiheptide bound to the large ribosomal subunit of Deinococcus radiodurans 提交 2008-03-07 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 29 PDB 声明：31-meric
链 T 1–91（91 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 NO1 4-(hydroxymethyl)-3-methyl-1H-indole-2-carboxylic acid × 1 MG MAGNESIUM ION × 35 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP
分辨率 3.70 Å R-free 0.340
2ZJQ Interaction of L7 with L11 induced by Microccocin binding to the Deinococcus radiodurans 50S subunit 提交 2008-03-08 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 29 PDB 声明：31-meric
链 T 1–91（91 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP
分辨率 3.30 Å R-free 0.339
2ZJR Refined native structure of the large ribosomal subunit (50S) from Deinococcus radiodurans 提交 2008-03-08 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 28 PDB 声明：30-meric
链 T 1–91（91 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 35 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP
分辨率 2.91 Å R-free 0.311
3DLL The oxazolidinone antibiotics perturb the ribosomal peptidyl-transferase center and effect tRNA positioning 提交 2008-06-27 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 28 PDB 声明：30-meric
链 T 1–91（91 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 35 ZLD N-{[(5S)-3-(3-fluoro-4-morpholin-4-ylphenyl)-2-oxo-1,3-oxazolidin-5-yl]methyl}acetamide × 1 ZN ZINC ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；10mM MgCl2, 60mM NH4Cl, 5mM KCl, 10mM HEPES, pH7.8, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP
分辨率 3.50 Å R-free 0.280
3PIO Crystal structure of the synergistic antibiotic pair lankamycin and lankacidin in complex with the large ribosomal subunit 提交 2010-11-07 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 28 PDB 声明：30-meric
链 T 1–91（91 aa）
未记录 LMA Lankamycin × 1 MG MAGNESIUM ION × 154 NA SODIUM ION × 42 K POTASSIUM ION × 15 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP. 15% 2:1 ethanol:methylpentanediol was diffused to a hanging drop of 180 AU/ml solution of D50S.
分辨率 3.25 Å R-free 0.294
3PIP Crystal structure of the synergistic antibiotic pair lankamycin and lankacidin in complex with the large ribosomal subunit 提交 2010-11-07 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 28 PDB 声明：30-meric
链 T 1–91（91 aa）
未记录 LC2 N-[(1S,2R,3E,5E,7S,9E,11E,13S,15R,19R)-7,13-dihydroxy-1,4,10,19-tetramethyl-17,18-dioxo-16-oxabicyclo[13.2.2]nonadeca-3,5,9,11-tetraen-2-yl]-2-oxopropanamide × 1 LMA Lankamycin × 1 MG MAGNESIUM ION × 73 K POTASSIUM ION × 4 NA SODIUM ION × 5 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP. 15% 2:1 ethanol:methylpentanediol was diffused to a hanging drop of 180 AU/ml solution of D50S.
分辨率 3.45 Å R-free 0.301
4IO9 Crystal structure of compound 4d bound to large ribosomal subunit (50S) from Deinococcus radiodurans 提交 2013-01-07 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 28 PDB 声明：30-meric
链 T 1–91（91 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 35 1F2 (3aS,4R,7R,8S,9S,10R,11R,13R,15R,15aR)-4-ethyl-11-methoxy-3a,7,9,11,13,15-hexamethyl-2,6,14-trioxo-10-{[3,4,6-trideoxy-3-(dimethylamino)-beta-D-xylo-hexopyranosyl]oxy}tetradecahydro-2H-oxacyclotetradecino[4,3-d][1,3]oxazol-8-yl (2R)-2-(pyridin-3-yl)pyrrolidine-1-carboxylate × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP
分辨率 3.20 Å R-free 0.235
4IOA Crystal structure of compound 4e bound to large ribosomal subunit (50S) from Deinococcus radiodurans 提交 2013-01-07 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 28 PDB 声明：30-meric
链 T 1–91（91 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 35 1F3 (3aS,4R,7R,8S,9S,10R,11R,13R,15R,15aR)-4-ethyl-11-methoxy-3a,7,9,11,13,15-hexamethyl-2,6,14-trioxo-10-{[3,4,6-trideoxy-3-(dimethylamino)-beta-D-xylo-hexopyranosyl]oxy}tetradecahydro-2H-oxacyclotetradecino[4,3-d][1,3]oxazol-8-yl (2R)-2-[4-(acetylamino)phenyl]-2,3-dihydro-1H-pyrrole-1-carboxylate × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP
分辨率 3.20 Å R-free 0.230
4IOC Crystal structure of compound 4f bound to large ribosomal subunit (50S) from Deinococcus radiodurans 提交 2013-01-07 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 28 PDB 声明：30-meric
链 T 1–91（91 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 35 1F4 (3aS,4R,7R,8S,9S,10R,11R,13R,15S,15aR)-4-ethyl-11-methoxy-3a,7,9,11,13,15-hexamethyl-2,6,14-trioxo-10-{[3,4,6-trideoxy-3-(dimethylamino)-beta-D-xylo-hexopyranosyl]oxy}tetradecahydro-2H-oxacyclotetradecino[4,3-d][1,3]oxazol-8-yl (2R)-4,4-dimethyl-2-(pyridin-3-yl)pyrrolidine-1-carboxylate × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP
分辨率 3.60 Å R-free 0.239
4U67 Crystal structure of the large ribosomal subunit (50S) of Deinococcus radiodurans containing a three residue insertion in L22 提交 2014-07-28 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 26 PDB 声明：28-meric
链 T 1–91（91 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 51 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；293 K；Magnesium chloride, HEPES, ammonium chloride, ethanol, 2-ethyl-1,3-hexandiol
分辨率 3.65 Å R-free 0.270
4WFN Crystal structure of the large ribosomal subunit (50S) of Deinococcus radiodurans containing a three residue insertion in L22 in complex with erythromycin 提交 2014-09-16 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 26 PDB 声明：28-meric
链 T 1–91（91 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 70 ERY ERYTHROMYCIN A × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；293 K；Magnesuim chloride, Hepes, ammonium chloride, ethanol, 2-ethyl-1,3-hexadiol
分辨率 3.54 Å R-free 0.282
5DM6 Crystal structure of the 50S ribosomal subunit from Deinococcus radiodurans 提交 2015-09-08 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 28 PDB 声明：30-meric
链 T 2–85（84 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 198 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；292 K；HEPES, sodium hydroxide, magnesium chloride, ammonium chloride, 2-mercaptoethanol, spermidine, 2-ethyl-1, 3-hexanediol, ethanol
分辨率 2.90 Å R-free 0.270
5DM7 Crystal structure of the 50S ribosomal subunit from Deinococcus radiodurans in complex with hygromycin A 提交 2015-09-08 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 28 PDB 声明：30-meric
链 T 2–85（84 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 186 HGR Hygromycin A × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；292 K；HEPES, sodium hydroxide, magnesium chloride, ammonium chloride, 2-mercaptoethanol, spermidine, 2-ethyl-1,3-hexanediol, ethanol
分辨率 3.00 Å R-free 0.326
5JVG The large ribosomal subunit from Deinococcus radiodurans in complex with avilamycin 提交 2016-05-11 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 27 PDB 声明：29-meric
链 T 1–91（91 aa）
未记录 6NO Avilamycin × 1 MG MAGNESIUM ION × 446 MPD (4S)-2-METHYL-2,4-PENTANEDIOL × 5 SPD SPERMIDINE × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；293.15 K；Ribosome solution containing 0.0065 mM (180 A/ml) of D50S in 10 mM Hepes pH=7.8, 15 mM MgCl2 and 75 mM NH4Cl crystallization buffer was mixed with 10 mM spermidine, 1 % ethanol and 0.5 % 2-ethyl-1,3-hexanediol precipitants. A 0.005 ml crystallization drop was hanged over 10 % ethanol and 5% 2-ethyl-1,3-hexanediol in ddw reservoir.
分辨率 3.43 Å R-free 0.253
5JVH The crystal structure large ribosomal subunit (50S) of Deinococcus radiodurans in complex with evernimicin 提交 2016-05-11 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 26 PDB 声明：28-meric
链 T 1–91（91 aa）
未记录 6O1 Evernimicin × 1 MG MAGNESIUM ION × 123 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；293 K；Magnesium chloride, HEPES, ammonium chloride, ethanol, 2-ethyl-1,3-hexandiol
分辨率 3.58 Å R-free 0.247
7A0R 50S Deinococcus radiodurans ribosome bounded with mycinamicin I 提交 2020-08-10 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 26 PDB 声明：28-meric
链 T 12–85（74 aa）
未记录 QTZ mycinamicin II × 1 MG MAGNESIUM ION × 345 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293.15 K；Ribosome solution containing 0.0065 mM (180 A/ml) of D50S in 10 mM Hepes pH=7.8, 15 mM MgCl2 and 75 mM NH4Cl crystallization buffer was mixed with 10 mM spermidine, 1 % ethanol and 0.5 % 2-ethyl-1,3-hexanediol precipitants. A 0.005 ml crystallization drop was hanged over 10 % ethanol and 5% 2-ethyl-1,3-hexanediol in ddw reservoir.
分辨率 3.30 Å R-free 0.249
7A0S 50S Deinococcus radiodurans ribosome bounded with mycinamicin I 提交 2020-08-10 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 26 PDB 声明：28-meric
链 T 1–91（91 aa）
未记录 QU2 mycinamicin I × 1 MG MAGNESIUM ION × 367 SPD SPERMIDINE × 8 MPD (4S)-2-METHYL-2,4-PENTANEDIOL × 4 NA SODIUM ION × 1 EOH ETHANOL × 1 CA CALCIUM ION × 5 K POTASSIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293.15 K；Ribosome solution containing 0.0065 mM (180 A/ml) of D50S in 10 mM Hepes pH=7.8, 15 mM MgCl2 and 75 mM NH4Cl crystallization buffer was mixed with 10 mM spermidine, 1 % ethanol and 0.5 % 2-ethyl-1,3-hexanediol precipitants. A 0.005 ml crystallization drop was hanged over 10 % ethanol and 5% 2-ethyl-1,3-hexanediol in ddw reservoir.
分辨率 3.22 Å R-free 0.253
7A18 50S Deinococcus radiodurans ribosome bounded with mycinamicin IV 提交 2020-08-12 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 26 PDB 声明：28-meric
链 T 12–83（72 aa）
未记录 MIV MYCINAMICIN IV × 1 MG MAGNESIUM ION × 277 SPD SPERMIDINE × 7 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；293.15 K；Ribosome solution containing 0.0065 mM (180 A/ml) of D50S in 10 mM Hepes pH=7.8, 15 mM MgCl2 and 75 mM NH4Cl crystallization buffer was mixed with 10 mM spermidine, 1 % ethanol and 0.5 % 2-ethyl-1,3-hexanediol precipitants. A 0.005 ml crystallization drop was hanged over 10 % ethanol and 5% 2-ethyl-1,3-hexanediol in ddw reservoir.
分辨率 3.40 Å R-free 0.318

共 24 个其他 PDB 条目、24 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 RL27_DEIRA
Isoform —
PDB实体 25
链与序列区间 作者链 T； PDB构建体 1–91； UniProt 1–91

50S RIBOSOMAL PROTEIN L28

物种未注明

UniProt Q9RRG8

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白–RNA 异源复合物 蛋白 × 29 RNA 2 PDB 声明：31-meric（31） 与全部聚合物数一致 链 U； UniProt 1–81 未记录 50S RIBOSOMAL PROTEIN L33 × 1 （Q9RSS4） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L34 × 1 （Q9RSH2） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L35 × 1 （Q9RSW6） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L36 × 1 （Q9RSK0） THIOSTREPTON × 1 （P0C8P8） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L2 × 1 （Q9RXJ9） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L3 × 1 （Q9RXK2） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L4 × 1 （Q9RXK1） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L5 × 1 （Q9RXJ0） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L6 × 1 （Q9RSL3） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L11 × 1 （Q9RSS7） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L13 × 1 （Q9RXY1） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L14 × 1 （Q9RXJ2） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L15 × 1 （Q9RSK9） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L16 × 1 （Q9RXJ5） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L17 × 1 （Q9RSJ5） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L18 × 1 （Q9RSL2） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L19 × 1 （Q9RWB4） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L20 × 1 （Q9RSW7） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L21 × 1 （Q9RY64） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L22 × 1 （Q9RXJ7） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L23 × 1 （Q9RXK0） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L24 × 1 （Q9RXJ1） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L25 × 1 （Q9RX88） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L27 × 1 （Q9RY65） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L29 × 1 （Q9RXJ4） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L30 × 1 （Q9RSL0） RRNA-23S RIBOSOMAL RNA × 1 50S RIBOSOMAL PROTEIN L32 × 1 （P49228） RRNA-5S RIBOSOMAL RNA × 1 MG MAGNESIUM ION × 36 X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP 分辨率 3.30 Å R-free 0.318

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 3CF5 Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
2ZJP Thiopeptide antibiotic Nosiheptide bound to the large ribosomal subunit of Deinococcus radiodurans 提交 2008-03-07 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 29 PDB 声明：31-meric
链 U 1–81（81 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 NO1 4-(hydroxymethyl)-3-methyl-1H-indole-2-carboxylic acid × 1 MG MAGNESIUM ION × 35 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP
分辨率 3.70 Å R-free 0.340
2ZJQ Interaction of L7 with L11 induced by Microccocin binding to the Deinococcus radiodurans 50S subunit 提交 2008-03-08 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 29 PDB 声明：31-meric
链 U 1–81（81 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP
分辨率 3.30 Å R-free 0.339
2ZJR Refined native structure of the large ribosomal subunit (50S) from Deinococcus radiodurans 提交 2008-03-08 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 28 PDB 声明：30-meric
链 U 1–81（81 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 35 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP
分辨率 2.91 Å R-free 0.311
3DLL The oxazolidinone antibiotics perturb the ribosomal peptidyl-transferase center and effect tRNA positioning 提交 2008-06-27 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 28 PDB 声明：30-meric
链 U 1–81（81 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 35 ZLD N-{[(5S)-3-(3-fluoro-4-morpholin-4-ylphenyl)-2-oxo-1,3-oxazolidin-5-yl]methyl}acetamide × 1 ZN ZINC ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；10mM MgCl2, 60mM NH4Cl, 5mM KCl, 10mM HEPES, pH7.8, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP
分辨率 3.50 Å R-free 0.280
3PIO Crystal structure of the synergistic antibiotic pair lankamycin and lankacidin in complex with the large ribosomal subunit 提交 2010-11-07 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 28 PDB 声明：30-meric
链 U 1–81（81 aa）
未记录 LMA Lankamycin × 1 MG MAGNESIUM ION × 154 NA SODIUM ION × 42 K POTASSIUM ION × 15 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP. 15% 2:1 ethanol:methylpentanediol was diffused to a hanging drop of 180 AU/ml solution of D50S.
分辨率 3.25 Å R-free 0.294
3PIP Crystal structure of the synergistic antibiotic pair lankamycin and lankacidin in complex with the large ribosomal subunit 提交 2010-11-07 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 28 PDB 声明：30-meric
链 U 1–81（81 aa）
未记录 LC2 N-[(1S,2R,3E,5E,7S,9E,11E,13S,15R,19R)-7,13-dihydroxy-1,4,10,19-tetramethyl-17,18-dioxo-16-oxabicyclo[13.2.2]nonadeca-3,5,9,11-tetraen-2-yl]-2-oxopropanamide × 1 LMA Lankamycin × 1 MG MAGNESIUM ION × 73 K POTASSIUM ION × 4 NA SODIUM ION × 5 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP. 15% 2:1 ethanol:methylpentanediol was diffused to a hanging drop of 180 AU/ml solution of D50S.
分辨率 3.45 Å R-free 0.301
4IO9 Crystal structure of compound 4d bound to large ribosomal subunit (50S) from Deinococcus radiodurans 提交 2013-01-07 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 28 PDB 声明：30-meric
链 U 1–81（81 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 35 1F2 (3aS,4R,7R,8S,9S,10R,11R,13R,15R,15aR)-4-ethyl-11-methoxy-3a,7,9,11,13,15-hexamethyl-2,6,14-trioxo-10-{[3,4,6-trideoxy-3-(dimethylamino)-beta-D-xylo-hexopyranosyl]oxy}tetradecahydro-2H-oxacyclotetradecino[4,3-d][1,3]oxazol-8-yl (2R)-2-(pyridin-3-yl)pyrrolidine-1-carboxylate × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP
分辨率 3.20 Å R-free 0.235
4IOA Crystal structure of compound 4e bound to large ribosomal subunit (50S) from Deinococcus radiodurans 提交 2013-01-07 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 28 PDB 声明：30-meric
链 U 1–81（81 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 35 1F3 (3aS,4R,7R,8S,9S,10R,11R,13R,15R,15aR)-4-ethyl-11-methoxy-3a,7,9,11,13,15-hexamethyl-2,6,14-trioxo-10-{[3,4,6-trideoxy-3-(dimethylamino)-beta-D-xylo-hexopyranosyl]oxy}tetradecahydro-2H-oxacyclotetradecino[4,3-d][1,3]oxazol-8-yl (2R)-2-[4-(acetylamino)phenyl]-2,3-dihydro-1H-pyrrole-1-carboxylate × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP
分辨率 3.20 Å R-free 0.230
4IOC Crystal structure of compound 4f bound to large ribosomal subunit (50S) from Deinococcus radiodurans 提交 2013-01-07 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 28 PDB 声明：30-meric
链 U 1–81（81 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 35 1F4 (3aS,4R,7R,8S,9S,10R,11R,13R,15S,15aR)-4-ethyl-11-methoxy-3a,7,9,11,13,15-hexamethyl-2,6,14-trioxo-10-{[3,4,6-trideoxy-3-(dimethylamino)-beta-D-xylo-hexopyranosyl]oxy}tetradecahydro-2H-oxacyclotetradecino[4,3-d][1,3]oxazol-8-yl (2R)-4,4-dimethyl-2-(pyridin-3-yl)pyrrolidine-1-carboxylate × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP
分辨率 3.60 Å R-free 0.239
4U67 Crystal structure of the large ribosomal subunit (50S) of Deinococcus radiodurans containing a three residue insertion in L22 提交 2014-07-28 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 26 PDB 声明：28-meric
链 U 1–81（81 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 51 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；293 K；Magnesium chloride, HEPES, ammonium chloride, ethanol, 2-ethyl-1,3-hexandiol
分辨率 3.65 Å R-free 0.270
4WFN Crystal structure of the large ribosomal subunit (50S) of Deinococcus radiodurans containing a three residue insertion in L22 in complex with erythromycin 提交 2014-09-16 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 26 PDB 声明：28-meric
链 U 1–81（81 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 70 ERY ERYTHROMYCIN A × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；293 K；Magnesuim chloride, Hepes, ammonium chloride, ethanol, 2-ethyl-1,3-hexadiol
分辨率 3.54 Å R-free 0.282
5DM6 Crystal structure of the 50S ribosomal subunit from Deinococcus radiodurans 提交 2015-09-08 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 28 PDB 声明：30-meric
链 U 8–79（72 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 198 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；292 K；HEPES, sodium hydroxide, magnesium chloride, ammonium chloride, 2-mercaptoethanol, spermidine, 2-ethyl-1, 3-hexanediol, ethanol
分辨率 2.90 Å R-free 0.270
5DM7 Crystal structure of the 50S ribosomal subunit from Deinococcus radiodurans in complex with hygromycin A 提交 2015-09-08 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 28 PDB 声明：30-meric
链 U 8–79（72 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 186 HGR Hygromycin A × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；292 K；HEPES, sodium hydroxide, magnesium chloride, ammonium chloride, 2-mercaptoethanol, spermidine, 2-ethyl-1,3-hexanediol, ethanol
分辨率 3.00 Å R-free 0.326
5JVG The large ribosomal subunit from Deinococcus radiodurans in complex with avilamycin 提交 2016-05-11 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 27 PDB 声明：29-meric
链 U 1–81（81 aa）
未记录 6NO Avilamycin × 1 MG MAGNESIUM ION × 446 MPD (4S)-2-METHYL-2,4-PENTANEDIOL × 5 SPD SPERMIDINE × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；293.15 K；Ribosome solution containing 0.0065 mM (180 A/ml) of D50S in 10 mM Hepes pH=7.8, 15 mM MgCl2 and 75 mM NH4Cl crystallization buffer was mixed with 10 mM spermidine, 1 % ethanol and 0.5 % 2-ethyl-1,3-hexanediol precipitants. A 0.005 ml crystallization drop was hanged over 10 % ethanol and 5% 2-ethyl-1,3-hexanediol in ddw reservoir.
分辨率 3.43 Å R-free 0.253
5JVH The crystal structure large ribosomal subunit (50S) of Deinococcus radiodurans in complex with evernimicin 提交 2016-05-11 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 26 PDB 声明：28-meric
链 U 1–81（81 aa）
未记录 6O1 Evernimicin × 1 MG MAGNESIUM ION × 123 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；293 K；Magnesium chloride, HEPES, ammonium chloride, ethanol, 2-ethyl-1,3-hexandiol
分辨率 3.58 Å R-free 0.247
7A0R 50S Deinococcus radiodurans ribosome bounded with mycinamicin I 提交 2020-08-10 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 26 PDB 声明：28-meric
链 U 6–79（74 aa）
未记录 QTZ mycinamicin II × 1 MG MAGNESIUM ION × 345 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293.15 K；Ribosome solution containing 0.0065 mM (180 A/ml) of D50S in 10 mM Hepes pH=7.8, 15 mM MgCl2 and 75 mM NH4Cl crystallization buffer was mixed with 10 mM spermidine, 1 % ethanol and 0.5 % 2-ethyl-1,3-hexanediol precipitants. A 0.005 ml crystallization drop was hanged over 10 % ethanol and 5% 2-ethyl-1,3-hexanediol in ddw reservoir.
分辨率 3.30 Å R-free 0.249
7A0S 50S Deinococcus radiodurans ribosome bounded with mycinamicin I 提交 2020-08-10 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 26 PDB 声明：28-meric
链 U 6–79（74 aa）
未记录 QU2 mycinamicin I × 1 MG MAGNESIUM ION × 367 SPD SPERMIDINE × 8 MPD (4S)-2-METHYL-2,4-PENTANEDIOL × 4 NA SODIUM ION × 1 EOH ETHANOL × 1 CA CALCIUM ION × 5 K POTASSIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293.15 K；Ribosome solution containing 0.0065 mM (180 A/ml) of D50S in 10 mM Hepes pH=7.8, 15 mM MgCl2 and 75 mM NH4Cl crystallization buffer was mixed with 10 mM spermidine, 1 % ethanol and 0.5 % 2-ethyl-1,3-hexanediol precipitants. A 0.005 ml crystallization drop was hanged over 10 % ethanol and 5% 2-ethyl-1,3-hexanediol in ddw reservoir.
分辨率 3.22 Å R-free 0.253
7A18 50S Deinococcus radiodurans ribosome bounded with mycinamicin IV 提交 2020-08-12 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 26 PDB 声明：28-meric
链 U 6–79（74 aa）
未记录 MIV MYCINAMICIN IV × 1 MG MAGNESIUM ION × 277 SPD SPERMIDINE × 7 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；293.15 K；Ribosome solution containing 0.0065 mM (180 A/ml) of D50S in 10 mM Hepes pH=7.8, 15 mM MgCl2 and 75 mM NH4Cl crystallization buffer was mixed with 10 mM spermidine, 1 % ethanol and 0.5 % 2-ethyl-1,3-hexanediol precipitants. A 0.005 ml crystallization drop was hanged over 10 % ethanol and 5% 2-ethyl-1,3-hexanediol in ddw reservoir.
分辨率 3.40 Å R-free 0.318

共 18 个其他 PDB 条目、18 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

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UniProt名称 RL28_DEIRA
Isoform —
PDB实体 26
链与序列区间 作者链 U； PDB构建体 1–81； UniProt 1–81

50S RIBOSOMAL PROTEIN L29

物种未注明

UniProt Q9RXJ4

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白–RNA 异源复合物 蛋白 × 29 RNA 2 PDB 声明：31-meric（31） 与全部聚合物数一致 链 V； UniProt 1–67 未记录 50S RIBOSOMAL PROTEIN L33 × 1 （Q9RSS4） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L34 × 1 （Q9RSH2） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L35 × 1 （Q9RSW6） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L36 × 1 （Q9RSK0） THIOSTREPTON × 1 （P0C8P8） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L2 × 1 （Q9RXJ9） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L3 × 1 （Q9RXK2） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L4 × 1 （Q9RXK1） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L5 × 1 （Q9RXJ0） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L6 × 1 （Q9RSL3） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L11 × 1 （Q9RSS7） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L13 × 1 （Q9RXY1） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L14 × 1 （Q9RXJ2） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L15 × 1 （Q9RSK9） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L16 × 1 （Q9RXJ5） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L17 × 1 （Q9RSJ5） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L18 × 1 （Q9RSL2） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L19 × 1 （Q9RWB4） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L20 × 1 （Q9RSW7） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L21 × 1 （Q9RY64） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L22 × 1 （Q9RXJ7） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L23 × 1 （Q9RXK0） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L24 × 1 （Q9RXJ1） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L25 × 1 （Q9RX88） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L27 × 1 （Q9RY65） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L28 × 1 （Q9RRG8） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L30 × 1 （Q9RSL0） RRNA-23S RIBOSOMAL RNA × 1 50S RIBOSOMAL PROTEIN L32 × 1 （P49228） RRNA-5S RIBOSOMAL RNA × 1 MG MAGNESIUM ION × 36 X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP 分辨率 3.30 Å R-free 0.318

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 3CF5 Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
1NKW Crystal Structure Of The Large Ribosomal Subunit From Deinococcus Radiodurans 提交 2003-01-05 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 29 PDB 声明：31-meric
链 W 1–67（67 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；ETHANOL, DIMETHYLHEXANEDIOL, MGCL2, KCL, HEPES, NH4CL, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP
分辨率 3.10 Å R-free 0.274
1NWX COMPLEX OF THE LARGE RIBOSOMAL SUBUNIT FROM DEINOCOCCUS RADIODURANS WITH ABT-773 提交 2003-02-07 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 29 PDB 声明：31-meric
链 W 1–67（67 aa）
未记录 773 CETHROMYCIN × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；281 K；ETHANOL, DIMETHYLHEXANEDIOL, MGCL2, KCL, HEPES, NH4CL, pH 7.80, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 281K
分辨率 3.50 Å R-free 0.313
1NWY COMPLEX OF THE LARGE RIBOSOMAL SUBUNIT FROM DEINOCOCCUS RADIODURANS WITH AZITHROMYCIN 提交 2003-02-07 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 29 PDB 声明：31-meric
链 W 1–67（67 aa）
未记录 ZIT AZITHROMYCIN × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；291 K；ETHANOL, DIMETHYLHEXANEDIOL, MGCL2, KCL, HEPES, NH4CL, pH 7.80, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K
分辨率 3.30 Å R-free 0.304
1SM1 COMPLEX OF THE LARGE RIBOSOMAL SUBUNIT FROM DEINOCOCCUS RADIODURANS WITH QUINUPRISTIN AND DALFOPRISTIN 提交 2004-03-08 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 30 PDB 声明：32-meric
链 W 1–67（67 aa）
未记录 DOL 5-(2-DIETHYLAMINO-ETHANESULFONYL)-21-HYDROXY-10-ISOPROPYL-11,19-DIMETHYL-9,26-DIOXA-3,15,28-TRIAZA-TRICYCLO[23.2.1.00,255]OCTACOSA-1(27),12,17,19,25(28)-PENTAENE-2,8,14,23-TETRAONE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 7.8；ETHANOL, DIMETHYLHEXANEDIOL, MGCL2, KCL, HEPES, NH4CL , PH 7.80, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, TEMPERATURE 290K
分辨率 3.42 Å R-free 0.348
1XBP Inhibition of peptide bond formation by pleuromutilins: The structure of the 50S ribosomal subunit from Deinococcus radiodurans in complex with Tiamulin 提交 2004-08-31 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 29 PDB 声明：31-meric
链 W 1–67（67 aa）
未记录 MUL TIAMULIN × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；280 K；ETHANOL, DIMETHYLHEXANEDIOL, MGCL2,KCL, HEPES, NH4CL, pH 7.80, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 280K
分辨率 3.50 Å R-free 0.360
2AAR Structure of trigger factor binding domain in biologically homologous complex with eubacterial ribosome. 提交 2005-07-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：tetrameric
链 W 1–67（67 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；293 K；pH 7.8, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 20K
分辨率 3.50 Å R-free 0.320
2D3O Structure of Ribosome Binding Domain of the Trigger Factor on the 50S ribosomal subunit from D. radiodurans 提交 2005-09-30 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：pentameric
链 W 1–67（67 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.8；290 K；ETHANOL, DIMETHYLHEXANEDIOL, MGCL2, KCL, HEPES, NH4CL, pH 7.8, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 290K
分辨率 3.35 Å R-free 0.322
2ZJP Thiopeptide antibiotic Nosiheptide bound to the large ribosomal subunit of Deinococcus radiodurans 提交 2008-03-07 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 29 PDB 声明：31-meric
链 V 1–67（67 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 NO1 4-(hydroxymethyl)-3-methyl-1H-indole-2-carboxylic acid × 1 MG MAGNESIUM ION × 35 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP
分辨率 3.70 Å R-free 0.340
2ZJQ Interaction of L7 with L11 induced by Microccocin binding to the Deinococcus radiodurans 50S subunit 提交 2008-03-08 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 29 PDB 声明：31-meric
链 V 1–67（67 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP
分辨率 3.30 Å R-free 0.339
2ZJR Refined native structure of the large ribosomal subunit (50S) from Deinococcus radiodurans 提交 2008-03-08 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 28 PDB 声明：30-meric
链 V 1–67（67 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 35 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP
分辨率 2.91 Å R-free 0.311
3DLL The oxazolidinone antibiotics perturb the ribosomal peptidyl-transferase center and effect tRNA positioning 提交 2008-06-27 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 28 PDB 声明：30-meric
链 V 1–67（67 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 35 ZLD N-{[(5S)-3-(3-fluoro-4-morpholin-4-ylphenyl)-2-oxo-1,3-oxazolidin-5-yl]methyl}acetamide × 1 ZN ZINC ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；10mM MgCl2, 60mM NH4Cl, 5mM KCl, 10mM HEPES, pH7.8, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP
分辨率 3.50 Å R-free 0.280
3PIO Crystal structure of the synergistic antibiotic pair lankamycin and lankacidin in complex with the large ribosomal subunit 提交 2010-11-07 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 28 PDB 声明：30-meric
链 V 1–67（67 aa）
未记录 LMA Lankamycin × 1 MG MAGNESIUM ION × 154 NA SODIUM ION × 42 K POTASSIUM ION × 15 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP. 15% 2:1 ethanol:methylpentanediol was diffused to a hanging drop of 180 AU/ml solution of D50S.
分辨率 3.25 Å R-free 0.294
3PIP Crystal structure of the synergistic antibiotic pair lankamycin and lankacidin in complex with the large ribosomal subunit 提交 2010-11-07 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 28 PDB 声明：30-meric
链 V 1–67（67 aa）
未记录 LC2 N-[(1S,2R,3E,5E,7S,9E,11E,13S,15R,19R)-7,13-dihydroxy-1,4,10,19-tetramethyl-17,18-dioxo-16-oxabicyclo[13.2.2]nonadeca-3,5,9,11-tetraen-2-yl]-2-oxopropanamide × 1 LMA Lankamycin × 1 MG MAGNESIUM ION × 73 K POTASSIUM ION × 4 NA SODIUM ION × 5 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP. 15% 2:1 ethanol:methylpentanediol was diffused to a hanging drop of 180 AU/ml solution of D50S.
分辨率 3.45 Å R-free 0.301
4IO9 Crystal structure of compound 4d bound to large ribosomal subunit (50S) from Deinococcus radiodurans 提交 2013-01-07 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 28 PDB 声明：30-meric
链 V 1–67（67 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 35 1F2 (3aS,4R,7R,8S,9S,10R,11R,13R,15R,15aR)-4-ethyl-11-methoxy-3a,7,9,11,13,15-hexamethyl-2,6,14-trioxo-10-{[3,4,6-trideoxy-3-(dimethylamino)-beta-D-xylo-hexopyranosyl]oxy}tetradecahydro-2H-oxacyclotetradecino[4,3-d][1,3]oxazol-8-yl (2R)-2-(pyridin-3-yl)pyrrolidine-1-carboxylate × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP
分辨率 3.20 Å R-free 0.235
4IOA Crystal structure of compound 4e bound to large ribosomal subunit (50S) from Deinococcus radiodurans 提交 2013-01-07 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 28 PDB 声明：30-meric
链 V 1–67（67 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 35 1F3 (3aS,4R,7R,8S,9S,10R,11R,13R,15R,15aR)-4-ethyl-11-methoxy-3a,7,9,11,13,15-hexamethyl-2,6,14-trioxo-10-{[3,4,6-trideoxy-3-(dimethylamino)-beta-D-xylo-hexopyranosyl]oxy}tetradecahydro-2H-oxacyclotetradecino[4,3-d][1,3]oxazol-8-yl (2R)-2-[4-(acetylamino)phenyl]-2,3-dihydro-1H-pyrrole-1-carboxylate × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP
分辨率 3.20 Å R-free 0.230
4IOC Crystal structure of compound 4f bound to large ribosomal subunit (50S) from Deinococcus radiodurans 提交 2013-01-07 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 28 PDB 声明：30-meric
链 V 1–67（67 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 35 1F4 (3aS,4R,7R,8S,9S,10R,11R,13R,15S,15aR)-4-ethyl-11-methoxy-3a,7,9,11,13,15-hexamethyl-2,6,14-trioxo-10-{[3,4,6-trideoxy-3-(dimethylamino)-beta-D-xylo-hexopyranosyl]oxy}tetradecahydro-2H-oxacyclotetradecino[4,3-d][1,3]oxazol-8-yl (2R)-4,4-dimethyl-2-(pyridin-3-yl)pyrrolidine-1-carboxylate × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP
分辨率 3.60 Å R-free 0.239
4U67 Crystal structure of the large ribosomal subunit (50S) of Deinococcus radiodurans containing a three residue insertion in L22 提交 2014-07-28 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 26 PDB 声明：28-meric
链 V 1–67（67 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 51 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；293 K；Magnesium chloride, HEPES, ammonium chloride, ethanol, 2-ethyl-1,3-hexandiol
分辨率 3.65 Å R-free 0.270
4WFN Crystal structure of the large ribosomal subunit (50S) of Deinococcus radiodurans containing a three residue insertion in L22 in complex with erythromycin 提交 2014-09-16 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 26 PDB 声明：28-meric
链 V 1–67（67 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 70 ERY ERYTHROMYCIN A × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；293 K；Magnesuim chloride, Hepes, ammonium chloride, ethanol, 2-ethyl-1,3-hexadiol
分辨率 3.54 Å R-free 0.282
5DM6 Crystal structure of the 50S ribosomal subunit from Deinococcus radiodurans 提交 2015-09-08 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 28 PDB 声明：30-meric
链 V 1–66（66 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 198 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；292 K；HEPES, sodium hydroxide, magnesium chloride, ammonium chloride, 2-mercaptoethanol, spermidine, 2-ethyl-1, 3-hexanediol, ethanol
分辨率 2.90 Å R-free 0.270
5DM7 Crystal structure of the 50S ribosomal subunit from Deinococcus radiodurans in complex with hygromycin A 提交 2015-09-08 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 28 PDB 声明：30-meric
链 V 1–66（66 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 186 HGR Hygromycin A × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；292 K；HEPES, sodium hydroxide, magnesium chloride, ammonium chloride, 2-mercaptoethanol, spermidine, 2-ethyl-1,3-hexanediol, ethanol
分辨率 3.00 Å R-free 0.326
5JVG The large ribosomal subunit from Deinococcus radiodurans in complex with avilamycin 提交 2016-05-11 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 27 PDB 声明：29-meric
链 V 1–67（67 aa）
未记录 6NO Avilamycin × 1 MG MAGNESIUM ION × 446 MPD (4S)-2-METHYL-2,4-PENTANEDIOL × 5 SPD SPERMIDINE × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；293.15 K；Ribosome solution containing 0.0065 mM (180 A/ml) of D50S in 10 mM Hepes pH=7.8, 15 mM MgCl2 and 75 mM NH4Cl crystallization buffer was mixed with 10 mM spermidine, 1 % ethanol and 0.5 % 2-ethyl-1,3-hexanediol precipitants. A 0.005 ml crystallization drop was hanged over 10 % ethanol and 5% 2-ethyl-1,3-hexanediol in ddw reservoir.
分辨率 3.43 Å R-free 0.253
5JVH The crystal structure large ribosomal subunit (50S) of Deinococcus radiodurans in complex with evernimicin 提交 2016-05-11 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 26 PDB 声明：28-meric
链 V 1–67（67 aa）
未记录 6O1 Evernimicin × 1 MG MAGNESIUM ION × 123 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；293 K；Magnesium chloride, HEPES, ammonium chloride, ethanol, 2-ethyl-1,3-hexandiol
分辨率 3.58 Å R-free 0.247
7A0R 50S Deinococcus radiodurans ribosome bounded with mycinamicin I 提交 2020-08-10 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 26 PDB 声明：28-meric
链 V 6–66（61 aa）
未记录 QTZ mycinamicin II × 1 MG MAGNESIUM ION × 345 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293.15 K；Ribosome solution containing 0.0065 mM (180 A/ml) of D50S in 10 mM Hepes pH=7.8, 15 mM MgCl2 and 75 mM NH4Cl crystallization buffer was mixed with 10 mM spermidine, 1 % ethanol and 0.5 % 2-ethyl-1,3-hexanediol precipitants. A 0.005 ml crystallization drop was hanged over 10 % ethanol and 5% 2-ethyl-1,3-hexanediol in ddw reservoir.
分辨率 3.30 Å R-free 0.249
7A0S 50S Deinococcus radiodurans ribosome bounded with mycinamicin I 提交 2020-08-10 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 26 PDB 声明：28-meric
链 V 6–66（61 aa）
未记录 QU2 mycinamicin I × 1 MG MAGNESIUM ION × 367 SPD SPERMIDINE × 8 MPD (4S)-2-METHYL-2,4-PENTANEDIOL × 4 NA SODIUM ION × 1 EOH ETHANOL × 1 CA CALCIUM ION × 5 K POTASSIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293.15 K；Ribosome solution containing 0.0065 mM (180 A/ml) of D50S in 10 mM Hepes pH=7.8, 15 mM MgCl2 and 75 mM NH4Cl crystallization buffer was mixed with 10 mM spermidine, 1 % ethanol and 0.5 % 2-ethyl-1,3-hexanediol precipitants. A 0.005 ml crystallization drop was hanged over 10 % ethanol and 5% 2-ethyl-1,3-hexanediol in ddw reservoir.
分辨率 3.22 Å R-free 0.253
7A18 50S Deinococcus radiodurans ribosome bounded with mycinamicin IV 提交 2020-08-12 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 26 PDB 声明：28-meric
链 V 13–66（54 aa）
未记录 MIV MYCINAMICIN IV × 1 MG MAGNESIUM ION × 277 SPD SPERMIDINE × 7 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；293.15 K；Ribosome solution containing 0.0065 mM (180 A/ml) of D50S in 10 mM Hepes pH=7.8, 15 mM MgCl2 and 75 mM NH4Cl crystallization buffer was mixed with 10 mM spermidine, 1 % ethanol and 0.5 % 2-ethyl-1,3-hexanediol precipitants. A 0.005 ml crystallization drop was hanged over 10 % ethanol and 5% 2-ethyl-1,3-hexanediol in ddw reservoir.
分辨率 3.40 Å R-free 0.318

共 25 个其他 PDB 条目、25 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

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UniProt名称 RL29_DEIRA
Isoform —
PDB实体 27
链与序列区间 作者链 V； PDB构建体 1–67； UniProt 1–67

50S RIBOSOMAL PROTEIN L30

物种未注明

UniProt Q9RSL0

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白–RNA 异源复合物 蛋白 × 29 RNA 2 PDB 声明：31-meric（31） 与全部聚合物数一致 链 W； UniProt 1–55 未记录 50S RIBOSOMAL PROTEIN L33 × 1 （Q9RSS4） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L34 × 1 （Q9RSH2） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L35 × 1 （Q9RSW6） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L36 × 1 （Q9RSK0） THIOSTREPTON × 1 （P0C8P8） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L2 × 1 （Q9RXJ9） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L3 × 1 （Q9RXK2） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L4 × 1 （Q9RXK1） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L5 × 1 （Q9RXJ0） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L6 × 1 （Q9RSL3） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L11 × 1 （Q9RSS7） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L13 × 1 （Q9RXY1） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L14 × 1 （Q9RXJ2） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L15 × 1 （Q9RSK9） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L16 × 1 （Q9RXJ5） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L17 × 1 （Q9RSJ5） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L18 × 1 （Q9RSL2） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L19 × 1 （Q9RWB4） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L20 × 1 （Q9RSW7） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L21 × 1 （Q9RY64） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L22 × 1 （Q9RXJ7） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L23 × 1 （Q9RXK0） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L24 × 1 （Q9RXJ1） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L25 × 1 （Q9RX88） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L27 × 1 （Q9RY65） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L28 × 1 （Q9RRG8） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L29 × 1 （Q9RXJ4） RRNA-23S RIBOSOMAL RNA × 1 50S RIBOSOMAL PROTEIN L32 × 1 （P49228） RRNA-5S RIBOSOMAL RNA × 1 MG MAGNESIUM ION × 36 X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP 分辨率 3.30 Å R-free 0.318

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 3CF5 Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
1NKW Crystal Structure Of The Large Ribosomal Subunit From Deinococcus Radiodurans 提交 2003-01-05 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 29 PDB 声明：31-meric
链 X 1–55（55 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；ETHANOL, DIMETHYLHEXANEDIOL, MGCL2, KCL, HEPES, NH4CL, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP
分辨率 3.10 Å R-free 0.274
1NWX COMPLEX OF THE LARGE RIBOSOMAL SUBUNIT FROM DEINOCOCCUS RADIODURANS WITH ABT-773 提交 2003-02-07 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 29 PDB 声明：31-meric
链 X 1–55（55 aa）
未记录 773 CETHROMYCIN × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；281 K；ETHANOL, DIMETHYLHEXANEDIOL, MGCL2, KCL, HEPES, NH4CL, pH 7.80, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 281K
分辨率 3.50 Å R-free 0.313
1NWY COMPLEX OF THE LARGE RIBOSOMAL SUBUNIT FROM DEINOCOCCUS RADIODURANS WITH AZITHROMYCIN 提交 2003-02-07 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 29 PDB 声明：31-meric
链 X 1–55（55 aa）
未记录 ZIT AZITHROMYCIN × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；291 K；ETHANOL, DIMETHYLHEXANEDIOL, MGCL2, KCL, HEPES, NH4CL, pH 7.80, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K
分辨率 3.30 Å R-free 0.304
1SM1 COMPLEX OF THE LARGE RIBOSOMAL SUBUNIT FROM DEINOCOCCUS RADIODURANS WITH QUINUPRISTIN AND DALFOPRISTIN 提交 2004-03-08 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 30 PDB 声明：32-meric
链 X 1–55（55 aa）
未记录 DOL 5-(2-DIETHYLAMINO-ETHANESULFONYL)-21-HYDROXY-10-ISOPROPYL-11,19-DIMETHYL-9,26-DIOXA-3,15,28-TRIAZA-TRICYCLO[23.2.1.00,255]OCTACOSA-1(27),12,17,19,25(28)-PENTAENE-2,8,14,23-TETRAONE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 7.8；ETHANOL, DIMETHYLHEXANEDIOL, MGCL2, KCL, HEPES, NH4CL , PH 7.80, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, TEMPERATURE 290K
分辨率 3.42 Å R-free 0.348
1XBP Inhibition of peptide bond formation by pleuromutilins: The structure of the 50S ribosomal subunit from Deinococcus radiodurans in complex with Tiamulin 提交 2004-08-31 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 29 PDB 声明：31-meric
链 X 1–55（55 aa）
未记录 MUL TIAMULIN × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；280 K；ETHANOL, DIMETHYLHEXANEDIOL, MGCL2,KCL, HEPES, NH4CL, pH 7.80, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 280K
分辨率 3.50 Å R-free 0.360
2ZJP Thiopeptide antibiotic Nosiheptide bound to the large ribosomal subunit of Deinococcus radiodurans 提交 2008-03-07 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 29 PDB 声明：31-meric
链 W 1–55（55 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 NO1 4-(hydroxymethyl)-3-methyl-1H-indole-2-carboxylic acid × 1 MG MAGNESIUM ION × 35 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP
分辨率 3.70 Å R-free 0.340
2ZJQ Interaction of L7 with L11 induced by Microccocin binding to the Deinococcus radiodurans 50S subunit 提交 2008-03-08 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 29 PDB 声明：31-meric
链 W 1–55（55 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP
分辨率 3.30 Å R-free 0.339
2ZJR Refined native structure of the large ribosomal subunit (50S) from Deinococcus radiodurans 提交 2008-03-08 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 28 PDB 声明：30-meric
链 W 1–55（55 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 35 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP
分辨率 2.91 Å R-free 0.311
3DLL The oxazolidinone antibiotics perturb the ribosomal peptidyl-transferase center and effect tRNA positioning 提交 2008-06-27 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 28 PDB 声明：30-meric
链 W 1–55（55 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 35 ZLD N-{[(5S)-3-(3-fluoro-4-morpholin-4-ylphenyl)-2-oxo-1,3-oxazolidin-5-yl]methyl}acetamide × 1 ZN ZINC ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；10mM MgCl2, 60mM NH4Cl, 5mM KCl, 10mM HEPES, pH7.8, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP
分辨率 3.50 Å R-free 0.280
3PIO Crystal structure of the synergistic antibiotic pair lankamycin and lankacidin in complex with the large ribosomal subunit 提交 2010-11-07 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 28 PDB 声明：30-meric
链 W 1–55（55 aa）
未记录 LMA Lankamycin × 1 MG MAGNESIUM ION × 154 NA SODIUM ION × 42 K POTASSIUM ION × 15 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP. 15% 2:1 ethanol:methylpentanediol was diffused to a hanging drop of 180 AU/ml solution of D50S.
分辨率 3.25 Å R-free 0.294
3PIP Crystal structure of the synergistic antibiotic pair lankamycin and lankacidin in complex with the large ribosomal subunit 提交 2010-11-07 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 28 PDB 声明：30-meric
链 W 1–55（55 aa）
未记录 LC2 N-[(1S,2R,3E,5E,7S,9E,11E,13S,15R,19R)-7,13-dihydroxy-1,4,10,19-tetramethyl-17,18-dioxo-16-oxabicyclo[13.2.2]nonadeca-3,5,9,11-tetraen-2-yl]-2-oxopropanamide × 1 LMA Lankamycin × 1 MG MAGNESIUM ION × 73 K POTASSIUM ION × 4 NA SODIUM ION × 5 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP. 15% 2:1 ethanol:methylpentanediol was diffused to a hanging drop of 180 AU/ml solution of D50S.
分辨率 3.45 Å R-free 0.301
4IO9 Crystal structure of compound 4d bound to large ribosomal subunit (50S) from Deinococcus radiodurans 提交 2013-01-07 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 28 PDB 声明：30-meric
链 W 1–55（55 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 35 1F2 (3aS,4R,7R,8S,9S,10R,11R,13R,15R,15aR)-4-ethyl-11-methoxy-3a,7,9,11,13,15-hexamethyl-2,6,14-trioxo-10-{[3,4,6-trideoxy-3-(dimethylamino)-beta-D-xylo-hexopyranosyl]oxy}tetradecahydro-2H-oxacyclotetradecino[4,3-d][1,3]oxazol-8-yl (2R)-2-(pyridin-3-yl)pyrrolidine-1-carboxylate × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP
分辨率 3.20 Å R-free 0.235
4IOA Crystal structure of compound 4e bound to large ribosomal subunit (50S) from Deinococcus radiodurans 提交 2013-01-07 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 28 PDB 声明：30-meric
链 W 1–55（55 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 35 1F3 (3aS,4R,7R,8S,9S,10R,11R,13R,15R,15aR)-4-ethyl-11-methoxy-3a,7,9,11,13,15-hexamethyl-2,6,14-trioxo-10-{[3,4,6-trideoxy-3-(dimethylamino)-beta-D-xylo-hexopyranosyl]oxy}tetradecahydro-2H-oxacyclotetradecino[4,3-d][1,3]oxazol-8-yl (2R)-2-[4-(acetylamino)phenyl]-2,3-dihydro-1H-pyrrole-1-carboxylate × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP
分辨率 3.20 Å R-free 0.230
4IOC Crystal structure of compound 4f bound to large ribosomal subunit (50S) from Deinococcus radiodurans 提交 2013-01-07 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 28 PDB 声明：30-meric
链 W 1–55（55 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 35 1F4 (3aS,4R,7R,8S,9S,10R,11R,13R,15S,15aR)-4-ethyl-11-methoxy-3a,7,9,11,13,15-hexamethyl-2,6,14-trioxo-10-{[3,4,6-trideoxy-3-(dimethylamino)-beta-D-xylo-hexopyranosyl]oxy}tetradecahydro-2H-oxacyclotetradecino[4,3-d][1,3]oxazol-8-yl (2R)-4,4-dimethyl-2-(pyridin-3-yl)pyrrolidine-1-carboxylate × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP
分辨率 3.60 Å R-free 0.239
4U67 Crystal structure of the large ribosomal subunit (50S) of Deinococcus radiodurans containing a three residue insertion in L22 提交 2014-07-28 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 26 PDB 声明：28-meric
链 W 1–55（55 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 51 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；293 K；Magnesium chloride, HEPES, ammonium chloride, ethanol, 2-ethyl-1,3-hexandiol
分辨率 3.65 Å R-free 0.270
4WFN Crystal structure of the large ribosomal subunit (50S) of Deinococcus radiodurans containing a three residue insertion in L22 in complex with erythromycin 提交 2014-09-16 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 26 PDB 声明：28-meric
链 W 1–55（55 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 70 ERY ERYTHROMYCIN A × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；293 K；Magnesuim chloride, Hepes, ammonium chloride, ethanol, 2-ethyl-1,3-hexadiol
分辨率 3.54 Å R-free 0.282
5DM6 Crystal structure of the 50S ribosomal subunit from Deinococcus radiodurans 提交 2015-09-08 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 28 PDB 声明：30-meric
链 W 1–55（55 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 198 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；292 K；HEPES, sodium hydroxide, magnesium chloride, ammonium chloride, 2-mercaptoethanol, spermidine, 2-ethyl-1, 3-hexanediol, ethanol
分辨率 2.90 Å R-free 0.270
5DM7 Crystal structure of the 50S ribosomal subunit from Deinococcus radiodurans in complex with hygromycin A 提交 2015-09-08 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 28 PDB 声明：30-meric
链 W 1–55（55 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 186 HGR Hygromycin A × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；292 K；HEPES, sodium hydroxide, magnesium chloride, ammonium chloride, 2-mercaptoethanol, spermidine, 2-ethyl-1,3-hexanediol, ethanol
分辨率 3.00 Å R-free 0.326
5JVG The large ribosomal subunit from Deinococcus radiodurans in complex with avilamycin 提交 2016-05-11 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 27 PDB 声明：29-meric
链 W 1–55（55 aa）
未记录 6NO Avilamycin × 1 MG MAGNESIUM ION × 446 MPD (4S)-2-METHYL-2,4-PENTANEDIOL × 5 SPD SPERMIDINE × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；293.15 K；Ribosome solution containing 0.0065 mM (180 A/ml) of D50S in 10 mM Hepes pH=7.8, 15 mM MgCl2 and 75 mM NH4Cl crystallization buffer was mixed with 10 mM spermidine, 1 % ethanol and 0.5 % 2-ethyl-1,3-hexanediol precipitants. A 0.005 ml crystallization drop was hanged over 10 % ethanol and 5% 2-ethyl-1,3-hexanediol in ddw reservoir.
分辨率 3.43 Å R-free 0.253
5JVH The crystal structure large ribosomal subunit (50S) of Deinococcus radiodurans in complex with evernimicin 提交 2016-05-11 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 26 PDB 声明：28-meric
链 W 1–55（55 aa）
未记录 6O1 Evernimicin × 1 MG MAGNESIUM ION × 123 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；293 K；Magnesium chloride, HEPES, ammonium chloride, ethanol, 2-ethyl-1,3-hexandiol
分辨率 3.58 Å R-free 0.247
7A0R 50S Deinococcus radiodurans ribosome bounded with mycinamicin I 提交 2020-08-10 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 26 PDB 声明：28-meric
链 W 1–55（55 aa）
未记录 QTZ mycinamicin II × 1 MG MAGNESIUM ION × 345 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293.15 K；Ribosome solution containing 0.0065 mM (180 A/ml) of D50S in 10 mM Hepes pH=7.8, 15 mM MgCl2 and 75 mM NH4Cl crystallization buffer was mixed with 10 mM spermidine, 1 % ethanol and 0.5 % 2-ethyl-1,3-hexanediol precipitants. A 0.005 ml crystallization drop was hanged over 10 % ethanol and 5% 2-ethyl-1,3-hexanediol in ddw reservoir.
分辨率 3.30 Å R-free 0.249
7A0S 50S Deinococcus radiodurans ribosome bounded with mycinamicin I 提交 2020-08-10 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 26 PDB 声明：28-meric
链 W 1–55（55 aa）
未记录 QU2 mycinamicin I × 1 MG MAGNESIUM ION × 367 SPD SPERMIDINE × 8 MPD (4S)-2-METHYL-2,4-PENTANEDIOL × 4 NA SODIUM ION × 1 EOH ETHANOL × 1 CA CALCIUM ION × 5 K POTASSIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293.15 K；Ribosome solution containing 0.0065 mM (180 A/ml) of D50S in 10 mM Hepes pH=7.8, 15 mM MgCl2 and 75 mM NH4Cl crystallization buffer was mixed with 10 mM spermidine, 1 % ethanol and 0.5 % 2-ethyl-1,3-hexanediol precipitants. A 0.005 ml crystallization drop was hanged over 10 % ethanol and 5% 2-ethyl-1,3-hexanediol in ddw reservoir.
分辨率 3.22 Å R-free 0.253
7A18 50S Deinococcus radiodurans ribosome bounded with mycinamicin IV 提交 2020-08-12 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 26 PDB 声明：28-meric
链 W 1–55（55 aa）
未记录 MIV MYCINAMICIN IV × 1 MG MAGNESIUM ION × 277 SPD SPERMIDINE × 7 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；293.15 K；Ribosome solution containing 0.0065 mM (180 A/ml) of D50S in 10 mM Hepes pH=7.8, 15 mM MgCl2 and 75 mM NH4Cl crystallization buffer was mixed with 10 mM spermidine, 1 % ethanol and 0.5 % 2-ethyl-1,3-hexanediol precipitants. A 0.005 ml crystallization drop was hanged over 10 % ethanol and 5% 2-ethyl-1,3-hexanediol in ddw reservoir.
分辨率 3.40 Å R-free 0.318

共 23 个其他 PDB 条目、23 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

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UniProt名称 RL30_DEIRA
Isoform —
PDB实体 28
链与序列区间 作者链 W； PDB构建体 1–55； UniProt 1–55

50S RIBOSOMAL PROTEIN L32

物种未注明

UniProt P49228

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白–RNA 异源复合物 蛋白 × 29 RNA 2 PDB 声明：31-meric（31） 与全部聚合物数一致 链 Y； UniProt 1–60 未记录 50S RIBOSOMAL PROTEIN L33 × 1 （Q9RSS4） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L34 × 1 （Q9RSH2） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L35 × 1 （Q9RSW6） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L36 × 1 （Q9RSK0） THIOSTREPTON × 1 （P0C8P8） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L2 × 1 （Q9RXJ9） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L3 × 1 （Q9RXK2） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L4 × 1 （Q9RXK1） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L5 × 1 （Q9RXJ0） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L6 × 1 （Q9RSL3） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L11 × 1 （Q9RSS7） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L13 × 1 （Q9RXY1） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L14 × 1 （Q9RXJ2） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L15 × 1 （Q9RSK9） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L16 × 1 （Q9RXJ5） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L17 × 1 （Q9RSJ5） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L18 × 1 （Q9RSL2） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L19 × 1 （Q9RWB4） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L20 × 1 （Q9RSW7） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L21 × 1 （Q9RY64） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L22 × 1 （Q9RXJ7） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L23 × 1 （Q9RXK0） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L24 × 1 （Q9RXJ1） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L25 × 1 （Q9RX88） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L27 × 1 （Q9RY65） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L28 × 1 （Q9RRG8） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L29 × 1 （Q9RXJ4） 50S RIBOSOMAL PROTEIN L30 × 1 （Q9RSL0） RRNA-23S RIBOSOMAL RNA × 1 RRNA-5S RIBOSOMAL RNA × 1 MG MAGNESIUM ION × 36 X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP 分辨率 3.30 Å R-free 0.318

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 3CF5 Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
1J5A STRUCTURAL BASIS FOR THE INTERACTION OF ANTIBIOTICS WITH THE PEPTIDYL TRANSFERASE CENTER IN EUBACTERIA 提交 2002-03-06 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：tetrameric
链 M 1–60（60 aa）
未记录 CTY CLARITHROMYCIN × 1 MG MAGNESIUM ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；291 K；ethanol, dimethylhexanediol, MgCl2, KCl, Hepes, NH4Cl, pH 7.8, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K
分辨率 3.50 Å R-free 0.323
1JZX Structural Basis for the Interaction of Antibiotics with the Peptidyl Transferase Center in Eubacteria 提交 2001-09-17 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：tetrameric
链 M 1–60（60 aa）
未记录 CLY CLINDAMYCIN × 1 MG MAGNESIUM ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；291 K；ethanol, dimethylhexanediol,MgCl2, KCl, Hepes, NH4Cl, pH 7.8, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K
分辨率 3.10 Å R-free 0.303
1JZY Structural Basis for the Interaction of Antibiotics with the Peptidyl Transferase Center in Eubacteria 提交 2001-09-17 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：tetrameric
链 M 1–60（60 aa）
未记录 ERY ERYTHROMYCIN A × 1 MG MAGNESIUM ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；291 K；ethanol, dimethylhexanediol, MgCl2, KCl, Hepes, NH4Cl, pH 7.8, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K
分辨率 3.50 Å R-free 0.301
1JZZ Structural Basis for the Interaction of Antibiotics with the Peptidyl Transferase Center in Eubacteria 提交 2001-09-17 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：tetrameric
链 M 1–60（60 aa）
未记录 ROX ROXITHROMYCIN × 1 MG MAGNESIUM ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；291 K；ethanol, dimethylhexanediol, MgCl2, KCl, Hepes, NH4Cl, pH 7.8, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K
分辨率 3.80 Å R-free 0.274
1K01 Structural Basis for the Interaction of Antibiotics with the Peptidyl Transferase Center in Eubacteria 提交 2001-09-17 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：tetrameric
链 M 1–60（60 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 3 CLM CHLORAMPHENICOL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；291 K；ethanol, dimethylhexanediol, MgCl2, KCl, Hepes, NH4Cl, pH 7.8, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K
分辨率 3.50 Å R-free 0.321
1NKW Crystal Structure Of The Large Ribosomal Subunit From Deinococcus Radiodurans 提交 2003-01-05 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 29 PDB 声明：31-meric
链 Z 1–59（59 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；ETHANOL, DIMETHYLHEXANEDIOL, MGCL2, KCL, HEPES, NH4CL, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP
分辨率 3.10 Å R-free 0.274
1NWX COMPLEX OF THE LARGE RIBOSOMAL SUBUNIT FROM DEINOCOCCUS RADIODURANS WITH ABT-773 提交 2003-02-07 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 29 PDB 声明：31-meric
链 Z 2–60（59 aa）
未记录 773 CETHROMYCIN × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；281 K；ETHANOL, DIMETHYLHEXANEDIOL, MGCL2, KCL, HEPES, NH4CL, pH 7.80, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 281K
分辨率 3.50 Å R-free 0.313
1NWY COMPLEX OF THE LARGE RIBOSOMAL SUBUNIT FROM DEINOCOCCUS RADIODURANS WITH AZITHROMYCIN 提交 2003-02-07 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 29 PDB 声明：31-meric
链 Z 2–60（59 aa）
未记录 ZIT AZITHROMYCIN × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；291 K；ETHANOL, DIMETHYLHEXANEDIOL, MGCL2, KCL, HEPES, NH4CL, pH 7.80, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K
分辨率 3.30 Å R-free 0.304
1OND THE CRYSTAL STRUCTURE OF THE 50S LARGE RIBOSOMAL SUBUNIT FROM DEINOCOCCUS RADIODURANS COMPLEXED WITH TROLEANDOMYCIN MACROLIDE ANTIBIOTIC 提交 2003-02-27 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：trimeric
链 Z 1–60（60 aa）
未记录 TAO TROLEANDOMYCIN × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 EVAPORATION；EVAPORATION
分辨率 3.40 Å R-free 0.310
1SM1 COMPLEX OF THE LARGE RIBOSOMAL SUBUNIT FROM DEINOCOCCUS RADIODURANS WITH QUINUPRISTIN AND DALFOPRISTIN 提交 2004-03-08 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 30 PDB 声明：32-meric
链 Z 1–60（60 aa）
未记录 DOL 5-(2-DIETHYLAMINO-ETHANESULFONYL)-21-HYDROXY-10-ISOPROPYL-11,19-DIMETHYL-9,26-DIOXA-3,15,28-TRIAZA-TRICYCLO[23.2.1.00,255]OCTACOSA-1(27),12,17,19,25(28)-PENTAENE-2,8,14,23-TETRAONE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 7.8；ETHANOL, DIMETHYLHEXANEDIOL, MGCL2, KCL, HEPES, NH4CL , PH 7.80, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, TEMPERATURE 290K
分辨率 3.42 Å R-free 0.348
1XBP Inhibition of peptide bond formation by pleuromutilins: The structure of the 50S ribosomal subunit from Deinococcus radiodurans in complex with Tiamulin 提交 2004-08-31 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 29 PDB 声明：31-meric
链 Z 1–59（59 aa）
未记录 MUL TIAMULIN × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；280 K；ETHANOL, DIMETHYLHEXANEDIOL, MGCL2,KCL, HEPES, NH4CL, pH 7.80, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 280K
分辨率 3.50 Å R-free 0.360
2ZJP Thiopeptide antibiotic Nosiheptide bound to the large ribosomal subunit of Deinococcus radiodurans 提交 2008-03-07 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 29 PDB 声明：31-meric
链 Y 1–60（60 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 NO1 4-(hydroxymethyl)-3-methyl-1H-indole-2-carboxylic acid × 1 MG MAGNESIUM ION × 35 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP
分辨率 3.70 Å R-free 0.340
2ZJQ Interaction of L7 with L11 induced by Microccocin binding to the Deinococcus radiodurans 50S subunit 提交 2008-03-08 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 29 PDB 声明：31-meric
链 Z 1–60（60 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP
分辨率 3.30 Å R-free 0.339
2ZJR Refined native structure of the large ribosomal subunit (50S) from Deinococcus radiodurans 提交 2008-03-08 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 28 PDB 声明：30-meric
链 Z 1–60（60 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 35 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP
分辨率 2.91 Å R-free 0.311
3DLL The oxazolidinone antibiotics perturb the ribosomal peptidyl-transferase center and effect tRNA positioning 提交 2008-06-27 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 28 PDB 声明：30-meric
链 Y 1–60（60 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 35 ZLD N-{[(5S)-3-(3-fluoro-4-morpholin-4-ylphenyl)-2-oxo-1,3-oxazolidin-5-yl]methyl}acetamide × 1 ZN ZINC ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；10mM MgCl2, 60mM NH4Cl, 5mM KCl, 10mM HEPES, pH7.8, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP
分辨率 3.50 Å R-free 0.280
3PIO Crystal structure of the synergistic antibiotic pair lankamycin and lankacidin in complex with the large ribosomal subunit 提交 2010-11-07 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 28 PDB 声明：30-meric
链 Z 1–60（60 aa）
未记录 LMA Lankamycin × 1 MG MAGNESIUM ION × 154 NA SODIUM ION × 42 K POTASSIUM ION × 15 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP. 15% 2:1 ethanol:methylpentanediol was diffused to a hanging drop of 180 AU/ml solution of D50S.
分辨率 3.25 Å R-free 0.294
3PIP Crystal structure of the synergistic antibiotic pair lankamycin and lankacidin in complex with the large ribosomal subunit 提交 2010-11-07 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 28 PDB 声明：30-meric
链 Z 1–60（60 aa）
未记录 LC2 N-[(1S,2R,3E,5E,7S,9E,11E,13S,15R,19R)-7,13-dihydroxy-1,4,10,19-tetramethyl-17,18-dioxo-16-oxabicyclo[13.2.2]nonadeca-3,5,9,11-tetraen-2-yl]-2-oxopropanamide × 1 LMA Lankamycin × 1 MG MAGNESIUM ION × 73 K POTASSIUM ION × 4 NA SODIUM ION × 5 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP. 15% 2:1 ethanol:methylpentanediol was diffused to a hanging drop of 180 AU/ml solution of D50S.
分辨率 3.45 Å R-free 0.301
4IO9 Crystal structure of compound 4d bound to large ribosomal subunit (50S) from Deinococcus radiodurans 提交 2013-01-07 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 28 PDB 声明：30-meric
链 Z 1–60（60 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 35 1F2 (3aS,4R,7R,8S,9S,10R,11R,13R,15R,15aR)-4-ethyl-11-methoxy-3a,7,9,11,13,15-hexamethyl-2,6,14-trioxo-10-{[3,4,6-trideoxy-3-(dimethylamino)-beta-D-xylo-hexopyranosyl]oxy}tetradecahydro-2H-oxacyclotetradecino[4,3-d][1,3]oxazol-8-yl (2R)-2-(pyridin-3-yl)pyrrolidine-1-carboxylate × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP
分辨率 3.20 Å R-free 0.235
4IOA Crystal structure of compound 4e bound to large ribosomal subunit (50S) from Deinococcus radiodurans 提交 2013-01-07 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 28 PDB 声明：30-meric
链 Z 1–60（60 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 35 1F3 (3aS,4R,7R,8S,9S,10R,11R,13R,15R,15aR)-4-ethyl-11-methoxy-3a,7,9,11,13,15-hexamethyl-2,6,14-trioxo-10-{[3,4,6-trideoxy-3-(dimethylamino)-beta-D-xylo-hexopyranosyl]oxy}tetradecahydro-2H-oxacyclotetradecino[4,3-d][1,3]oxazol-8-yl (2R)-2-[4-(acetylamino)phenyl]-2,3-dihydro-1H-pyrrole-1-carboxylate × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP
分辨率 3.20 Å R-free 0.230
4IOC Crystal structure of compound 4f bound to large ribosomal subunit (50S) from Deinococcus radiodurans 提交 2013-01-07 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 28 PDB 声明：30-meric
链 Z 1–60（60 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 35 1F4 (3aS,4R,7R,8S,9S,10R,11R,13R,15S,15aR)-4-ethyl-11-methoxy-3a,7,9,11,13,15-hexamethyl-2,6,14-trioxo-10-{[3,4,6-trideoxy-3-(dimethylamino)-beta-D-xylo-hexopyranosyl]oxy}tetradecahydro-2H-oxacyclotetradecino[4,3-d][1,3]oxazol-8-yl (2R)-4,4-dimethyl-2-(pyridin-3-yl)pyrrolidine-1-carboxylate × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP
分辨率 3.60 Å R-free 0.239
4U67 Crystal structure of the large ribosomal subunit (50S) of Deinococcus radiodurans containing a three residue insertion in L22 提交 2014-07-28 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 26 PDB 声明：28-meric
链 Z 1–60（60 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 51 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；293 K；Magnesium chloride, HEPES, ammonium chloride, ethanol, 2-ethyl-1,3-hexandiol
分辨率 3.65 Å R-free 0.270
4WFN Crystal structure of the large ribosomal subunit (50S) of Deinococcus radiodurans containing a three residue insertion in L22 in complex with erythromycin 提交 2014-09-16 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 26 PDB 声明：28-meric
链 Z 1–60（60 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 70 ERY ERYTHROMYCIN A × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；293 K；Magnesuim chloride, Hepes, ammonium chloride, ethanol, 2-ethyl-1,3-hexadiol
分辨率 3.54 Å R-free 0.282
5DM6 Crystal structure of the 50S ribosomal subunit from Deinococcus radiodurans 提交 2015-09-08 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 28 PDB 声明：30-meric
链 Z 3–59（57 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 198 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；292 K；HEPES, sodium hydroxide, magnesium chloride, ammonium chloride, 2-mercaptoethanol, spermidine, 2-ethyl-1, 3-hexanediol, ethanol
分辨率 2.90 Å R-free 0.270
5DM7 Crystal structure of the 50S ribosomal subunit from Deinococcus radiodurans in complex with hygromycin A 提交 2015-09-08 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 28 PDB 声明：30-meric
链 Z 3–59（57 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 186 HGR Hygromycin A × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；292 K；HEPES, sodium hydroxide, magnesium chloride, ammonium chloride, 2-mercaptoethanol, spermidine, 2-ethyl-1,3-hexanediol, ethanol
分辨率 3.00 Å R-free 0.326
5JVG The large ribosomal subunit from Deinococcus radiodurans in complex with avilamycin 提交 2016-05-11 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 27 PDB 声明：29-meric
链 Z 1–60（60 aa）
未记录 6NO Avilamycin × 1 MG MAGNESIUM ION × 446 MPD (4S)-2-METHYL-2,4-PENTANEDIOL × 5 SPD SPERMIDINE × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；293.15 K；Ribosome solution containing 0.0065 mM (180 A/ml) of D50S in 10 mM Hepes pH=7.8, 15 mM MgCl2 and 75 mM NH4Cl crystallization buffer was mixed with 10 mM spermidine, 1 % ethanol and 0.5 % 2-ethyl-1,3-hexanediol precipitants. A 0.005 ml crystallization drop was hanged over 10 % ethanol and 5% 2-ethyl-1,3-hexanediol in ddw reservoir.
分辨率 3.43 Å R-free 0.253
5JVH The crystal structure large ribosomal subunit (50S) of Deinococcus radiodurans in complex with evernimicin 提交 2016-05-11 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 26 PDB 声明：28-meric
链 Z 1–60（60 aa）
未记录 6O1 Evernimicin × 1 MG MAGNESIUM ION × 123 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；293 K；Magnesium chloride, HEPES, ammonium chloride, ethanol, 2-ethyl-1,3-hexandiol
分辨率 3.58 Å R-free 0.247
7A0R 50S Deinococcus radiodurans ribosome bounded with mycinamicin I 提交 2020-08-10 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 26 PDB 声明：28-meric
链 Z 2–59（58 aa）
未记录 QTZ mycinamicin II × 1 MG MAGNESIUM ION × 345 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293.15 K；Ribosome solution containing 0.0065 mM (180 A/ml) of D50S in 10 mM Hepes pH=7.8, 15 mM MgCl2 and 75 mM NH4Cl crystallization buffer was mixed with 10 mM spermidine, 1 % ethanol and 0.5 % 2-ethyl-1,3-hexanediol precipitants. A 0.005 ml crystallization drop was hanged over 10 % ethanol and 5% 2-ethyl-1,3-hexanediol in ddw reservoir.
分辨率 3.30 Å R-free 0.249
7A0S 50S Deinococcus radiodurans ribosome bounded with mycinamicin I 提交 2020-08-10 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 26 PDB 声明：28-meric
链 Z 2–59（58 aa）
未记录 QU2 mycinamicin I × 1 MG MAGNESIUM ION × 367 SPD SPERMIDINE × 8 MPD (4S)-2-METHYL-2,4-PENTANEDIOL × 4 NA SODIUM ION × 1 EOH ETHANOL × 1 CA CALCIUM ION × 5 K POTASSIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293.15 K；Ribosome solution containing 0.0065 mM (180 A/ml) of D50S in 10 mM Hepes pH=7.8, 15 mM MgCl2 and 75 mM NH4Cl crystallization buffer was mixed with 10 mM spermidine, 1 % ethanol and 0.5 % 2-ethyl-1,3-hexanediol precipitants. A 0.005 ml crystallization drop was hanged over 10 % ethanol and 5% 2-ethyl-1,3-hexanediol in ddw reservoir.
分辨率 3.22 Å R-free 0.253
7A18 50S Deinococcus radiodurans ribosome bounded with mycinamicin IV 提交 2020-08-12 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 26 PDB 声明：28-meric
链 Z 3–59（57 aa）
未记录 MIV MYCINAMICIN IV × 1 MG MAGNESIUM ION × 277 SPD SPERMIDINE × 7 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；293.15 K；Ribosome solution containing 0.0065 mM (180 A/ml) of D50S in 10 mM Hepes pH=7.8, 15 mM MgCl2 and 75 mM NH4Cl crystallization buffer was mixed with 10 mM spermidine, 1 % ethanol and 0.5 % 2-ethyl-1,3-hexanediol precipitants. A 0.005 ml crystallization drop was hanged over 10 % ethanol and 5% 2-ethyl-1,3-hexanediol in ddw reservoir.
分辨率 3.40 Å R-free 0.318

共 29 个其他 PDB 条目、29 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 RL32_DEIRA
Isoform —
PDB实体 30
链与序列区间 作者链 Y； PDB构建体 1–60； UniProt 1–60

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

SAXS profile for 3cf5

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

P(r) distribution for 3cf5
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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id3cf5
沉积日期 deposition_date2008-03-02
结构标题 titleThiopeptide antibiotic Thiostrepton bound to the large ribosomal subunit of Deinococcus radiodurans
关键词 keywords;RIBOSOME-ANTIBIOTIC COMPLEX, ANTIBIOTIC, RIBOSOME, THIOSTREPTON, RNA, L11, THIOPEPTIDE, THIAZOLE, THIAZOLINE, PYRIDINE, TRANSLATION INHIBITION ;; RIBOSOME/ANTIBIOTIC
实验方法 methodX-RAY DIFFRACTION
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3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

回转半径 Rg (Guinier) rg_guinier67.98 Å
回转半径 Rg (电子) rg_electron68.98 Å
零角强度 I(0) i054180200000.00
分子量 molecular_weight1274200.0 kDa
排除体积 excluded_volume1301900 ų
包络体积 envelope_volume2162200 ų
水化壳体积 shell_volume239130 ų
包络直径 envelope_diameter231.7 Å
壳层 Rg shell_rg81.46 Å
包络 Rg envelope_rg68.93 Å
形状 Rg shape_rg69.14 Å
总 Rg total_rg68.75 Å
总原子数 total_atoms84313
残基数 n_residues5914
球谐函数阶数 n_harmonics20
q 范围 q_range— – 0.5000 Å−1
数据点数 n_points101
壳层类型 shell_typedirectional
溶剂电子密度 solvent_density0.3340 e/ų
壳层衬度 contrast_shell0.0300 e/ų
CRYSOL 版本 crysol_version4.1.3
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4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

最大尺寸 Dmax dmax229.8 Å
Rg (实空间) rg_real67.79 Å
Rg 误差 (实空间) rg_real_error1.80 Å
I(0) (实空间) i0_real5.4180e+10
I(0) 误差 (实空间) i0_real_error1.1680e+09
Rg (倒空间) rg_reciprocal68.55 Å
I(0) (倒空间) i0_reciprocal54250000000.0000
解质量估计 total_estimate0.8556
解质量评级 solution_quality GOOD a GOOD solution
P(r) 峰数 n_peaks2
主峰位置 r_peak_primary89.9 Å
偏度 Skewness skewness0.229
峰度 Kurtosis kurtosis-0.371
角度范围 angular_range— – 0.1150 Å−1
当前正则化参数 α current_alpha0.0000
最高正则化参数 α highest_alpha9497000000.0000
实空间数据点数 n_real_points24
GNOM 版本 gnom_version4.1.3
质量判据 quality_criteria AN1: 0.000; Oscil: 0.788; Stabil: 1.000; Sysdev: 1.000; Positv: 1.000; Valcen: 0.969; Smooth: 0.785
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5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

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6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (32)

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7. 折叠分类 (SCOP + CATH) 47 domains

SCOP 2.08 (31 domains)

结构域编号 domain_idd3cf511
类 Class classg — Small proteins
折叠类型 Fold foldg.41 — Rubredoxin-like
超家族 Superfamily superfamilyg.41.8 — Zn-binding ribosomal proteins
家族 Family familyg.41.8.6 — Ribosomal protein L33p
结构域编号 domain_idd3cf521
类 Class classj — Peptides
折叠类型 Fold foldj.118 — Ribosomal protein L34p
超家族 Superfamily superfamilyj.118.1 — Ribosomal protein L34p
家族 Family familyj.118.1.1 — Ribosomal protein L34p
结构域编号 domain_idd3cf531
类 Class classd — Alpha and beta proteins (a+b)
折叠类型 Fold foldd.301 — L35p-like
超家族 Superfamily superfamilyd.301.1 — L35p-like
家族 Family familyd.301.1.1 — Ribosomal protein L35p
结构域编号 domain_idd3cf541
类 Class classg — Small proteins
折叠类型 Fold foldg.42 — Ribosomal protein L36
超家族 Superfamily superfamilyg.42.1 — Ribosomal protein L36
家族 Family familyg.42.1.1 — Ribosomal protein L36
结构域编号 domain_idd3cf5a1
类 Class classb — All beta proteins
折叠类型 Fold foldb.34 — SH3-like barrel
超家族 Superfamily superfamilyb.34.5 — Translation proteins SH3-like domain
家族 Family familyb.34.5.3 — C-terminal domain of ribosomal protein L2
结构域编号 domain_idd3cf5a2
类 Class classb — All beta proteins
折叠类型 Fold foldb.40 — OB-fold
超家族 Superfamily superfamilyb.40.4 — Nucleic acid-binding proteins
家族 Family familyb.40.4.5 — Cold shock DNA-binding domain-like
结构域编号 domain_idd3cf5b1
类 Class classb — All beta proteins
折叠类型 Fold foldb.43 — Reductase/isomerase/elongation factor common domain
超家族 Superfamily superfamilyb.43.3 — Translation proteins
家族 Family familyb.43.3.2 — Ribosomal protein L3
结构域编号 domain_idd3cf5c1
类 Class classc — Alpha and beta proteins (a/b)
折叠类型 Fold foldc.22 — Ribosomal protein L4
超家族 Superfamily superfamilyc.22.1 — Ribosomal protein L4
家族 Family familyc.22.1.1 — Ribosomal protein L4
结构域编号 domain_idd3cf5d1
类 Class classd — Alpha and beta proteins (a+b)
折叠类型 Fold foldd.77 — RL5-like
超家族 Superfamily superfamilyd.77.1 — RL5-like
家族 Family familyd.77.1.1 — Ribosomal protein L5
结构域编号 domain_idd3cf5e1
类 Class classd — Alpha and beta proteins (a+b)
折叠类型 Fold foldd.141 — Ribosomal protein L6
超家族 Superfamily superfamilyd.141.1 — Ribosomal protein L6
家族 Family familyd.141.1.1 — Ribosomal protein L6
结构域编号 domain_idd3cf5e2
类 Class classd — Alpha and beta proteins (a+b)
折叠类型 Fold foldd.141 — Ribosomal protein L6
超家族 Superfamily superfamilyd.141.1 — Ribosomal protein L6
家族 Family familyd.141.1.1 — Ribosomal protein L6
结构域编号 domain_idd3cf5f1
类 Class classa — All alpha proteins
折叠类型 Fold folda.4 — DNA/RNA-binding 3-helical bundle
超家族 Superfamily superfamilya.4.7 — Ribosomal protein L11, C-terminal domain
家族 Family familya.4.7.1 — Ribosomal protein L11, C-terminal domain
结构域编号 domain_idd3cf5f2
类 Class classd — Alpha and beta proteins (a+b)
折叠类型 Fold foldd.47 — Ribosomal L11/L12e N-terminal domain
超家族 Superfamily superfamilyd.47.1 — Ribosomal L11/L12e N-terminal domain
家族 Family familyd.47.1.1 — Ribosomal L11/L12e N-terminal domain
结构域编号 domain_idd3cf5g1
类 Class classc — Alpha and beta proteins (a/b)
折叠类型 Fold foldc.21 — Ribosomal protein L13
超家族 Superfamily superfamilyc.21.1 — Ribosomal protein L13
家族 Family familyc.21.1.1 — Ribosomal protein L13
结构域编号 domain_idd3cf5h1
类 Class classb — All beta proteins
折叠类型 Fold foldb.39 — Ribosomal protein L14
超家族 Superfamily superfamilyb.39.1 — Ribosomal protein L14
家族 Family familyb.39.1.1 — Ribosomal protein L14
结构域编号 domain_idd3cf5i1
类 Class classc — Alpha and beta proteins (a/b)
折叠类型 Fold foldc.12 — Ribosomal proteins L15p and L18e
超家族 Superfamily superfamilyc.12.1 — Ribosomal proteins L15p and L18e
家族 Family familyc.12.1.1 — Ribosomal proteins L15p and L18e
结构域编号 domain_idd3cf5j1
类 Class classd — Alpha and beta proteins (a+b)
折叠类型 Fold foldd.41 — alpha/beta-Hammerhead
超家族 Superfamily superfamilyd.41.4 — Ribosomal protein L16p/L10e
家族 Family familyd.41.4.2 — Ribosomal protein L16p
结构域编号 domain_idd3cf5k1
类 Class classd — Alpha and beta proteins (a+b)
折叠类型 Fold foldd.188 — Prokaryotic ribosomal protein L17
超家族 Superfamily superfamilyd.188.1 — Prokaryotic ribosomal protein L17
家族 Family familyd.188.1.1 — Prokaryotic ribosomal protein L17
结构域编号 domain_idd3cf5l1
类 Class classc — Alpha and beta proteins (a/b)
折叠类型 Fold foldc.55 — Ribonuclease H-like motif
超家族 Superfamily superfamilyc.55.4 — Translational machinery components
家族 Family familyc.55.4.1 — Ribosomal protein L18 and S11
结构域编号 domain_idd3cf5m1
类 Class classb — All beta proteins
折叠类型 Fold foldb.34 — SH3-like barrel
超家族 Superfamily superfamilyb.34.5 — Translation proteins SH3-like domain
家族 Family familyb.34.5.6 — Ribosomal protein L19
结构域编号 domain_idd3cf5n1
类 Class classa — All alpha proteins
折叠类型 Fold folda.144 — PABP domain-like
超家族 Superfamily superfamilya.144.2 — Ribosomal protein L20
家族 Family familya.144.2.1 — Ribosomal protein L20
结构域编号 domain_idd3cf5o1
类 Class classb — All beta proteins
折叠类型 Fold foldb.155 — L21p-like
超家族 Superfamily superfamilyb.155.1 — L21p-like
家族 Family familyb.155.1.1 — Ribosomal protein L21p
结构域编号 domain_idd3cf5p1
类 Class classd — Alpha and beta proteins (a+b)
折叠类型 Fold foldd.55 — Ribosomal protein L22
超家族 Superfamily superfamilyd.55.1 — Ribosomal protein L22
家族 Family familyd.55.1.1 — Ribosomal protein L22
结构域编号 domain_idd3cf5q1
类 Class classd — Alpha and beta proteins (a+b)
折叠类型 Fold foldd.12 — Ribosomal proteins S24e, L23 and L15e
超家族 Superfamily superfamilyd.12.1 — Ribosomal proteins S24e, L23 and L15e
家族 Family familyd.12.1.1 — L23p
结构域编号 domain_idd3cf5r1
类 Class classb — All beta proteins
折叠类型 Fold foldb.34 — SH3-like barrel
超家族 Superfamily superfamilyb.34.5 — Translation proteins SH3-like domain
家族 Family familyb.34.5.1 — Ribosomal proteins L24p and L21e
结构域编号 domain_idd3cf5s1
类 Class classb — All beta proteins
折叠类型 Fold foldb.53 — Ribosomal protein L25-like
超家族 Superfamily superfamilyb.53.1 — Ribosomal protein L25-like
家族 Family familyb.53.1.1 — Ribosomal protein L25-like
结构域编号 domain_idd3cf5t1
类 Class classb — All beta proteins
折叠类型 Fold foldb.84 — Barrel-sandwich hybrid
超家族 Superfamily superfamilyb.84.4 — Ribosomal L27 protein-like
家族 Family familyb.84.4.1 — Ribosomal L27 protein
结构域编号 domain_idd3cf5u1
类 Class classd — Alpha and beta proteins (a+b)
折叠类型 Fold foldd.325 — L28p-like
超家族 Superfamily superfamilyd.325.1 — L28p-like
家族 Family familyd.325.1.1 — Ribosomal protein L28
结构域编号 domain_idd3cf5v1
类 Class classa — All alpha proteins
折叠类型 Fold folda.2 — Long alpha-hairpin
超家族 Superfamily superfamilya.2.2 — Ribosomal protein L29 (L29p)
家族 Family familya.2.2.1 — Ribosomal protein L29 (L29p)
结构域编号 domain_idd3cf5w1
类 Class classd — Alpha and beta proteins (a+b)
折叠类型 Fold foldd.59 — Ribosomal protein L30p/L7e
超家族 Superfamily superfamilyd.59.1 — Ribosomal protein L30p/L7e
家族 Family familyd.59.1.1 — Ribosomal protein L30p/L7e
结构域编号 domain_idd3cf5y1
类 Class classg — Small proteins
折叠类型 Fold foldg.41 — Rubredoxin-like
超家族 Superfamily superfamilyg.41.8 — Zn-binding ribosomal proteins
家族 Family familyg.41.8.5 — Ribosomal protein L32p

CATH v4.4 (16 domains)

结构域编号 domain_id3cf5A01
类 Class class2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture40 — Beta Barrel
拓扑 Topology topology50 — OB fold (Dihydrolipoamide Acetyltransferase, E2P)
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily140 — Nucleic acid-binding proteins
结构域编号 domain_id3cf5D00
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology1440 — 50s Ribosomal Protein L5; Chain: A,
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — Ribosomal protein L5
结构域编号 domain_id3cf5E01
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture90 — Alpha-Beta Complex
拓扑 Topology topology930 — Outer Surface Protein A; domain 3
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily12 — Ribosomal protein L6
结构域编号 domain_id3cf5E02
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture90 — Alpha-Beta Complex
拓扑 Topology topology930 — Outer Surface Protein A; domain 3
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily12 — Ribosomal protein L6
结构域编号 domain_id3cf5F01
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology1550 — Ribosomal protein L11, N-terminal domain
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — Ribosomal protein L11/L12, N-terminal domain
结构域编号 domain_id3cf5F02
类 Class class1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology10 — Arc Repressor Mutant, subunit A
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily250 — Ribosomal protein L11/L12, C-terminal domain
结构域编号 domain_id3cf5G00
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture90 — Alpha-Beta Complex
拓扑 Topology topology1180 — Ribosomal Protein L13p; Chain: A;
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — Ribosomal protein L13
结构域编号 domain_id3cf5H00
类 Class class2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture40 — Beta Barrel
拓扑 Topology topology150 — Ribosomal Protein L14
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily20 — Ribosomal protein L14/L23
结构域编号 domain_id3cf5J01
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture90 — Alpha-Beta Complex
拓扑 Topology topology1170 — Aldehyde Oxidoreductase; domain 3
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — Ribosomal protein L16/L10
结构域编号 domain_id3cf5K00
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture90 — Alpha-Beta Complex
拓扑 Topology topology1030 — 50s Ribosomal Protein L17; Chain: A,
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — Ribosomal protein L17
结构域编号 domain_id3cf5L01
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology420 — Nucleotidyltransferase; domain 5
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily100 —
结构域编号 domain_id3cf5P00
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture90 — Alpha-Beta Complex
拓扑 Topology topology470 — Ribosomal Protein L22; Chain A
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — Ribosomal protein L22/L17
结构域编号 domain_id3cf5Q00
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology70 — Alpha-Beta Plaits
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily330 — RRM (RNA recognition motif) domain
结构域编号 domain_id3cf5S01
类 Class class2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture40 — Beta Barrel
拓扑 Topology topology240 — Ribosomal Protein L25; Chain P
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — Ribosomal Protein L25; Chain P
结构域编号 domain_id3cf5S02
类 Class class2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture170 — Beta Complex
拓扑 Topology topology120 — RNA Polymerase Alpha Subunit; Chain A, domain 2
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily20 — Ribosomal protein L25, C-terminal domain
结构域编号 domain_id3cf5W00
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology1390 — Ribosomal Protein L30; Chain: A,
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily20 — Ribosomal protein L30/L7
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8. 引用文献 (1)

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9. 文件与曲线 (10)