SAXSdb — 3cki

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

ADAM 17

Homo sapiens

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 2	Metalloproteinase inhibitor 3 × 1 （P35625） ZINC ION × 1 SODIUM ION × 1 water × 2	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	ADA17_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 1–256； UniProt 219–474

Metalloproteinase inhibitor 3

Homo sapiens

UniProt P35625

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 2	ADAM 17 × 1 （P78536） ZINC ION × 1 SODIUM ION × 1 water × 2	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	TIMP3_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	2
链与序列区间	作者链 B； PDB构建体 1–121； UniProt 24–144

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	3cki
沉积日期 deposition_date	2008-03-15
结构标题 title	Crystal structure of the TACE-N-TIMP-3 complex
关键词 keywords	;extra-cellular matrix, catalytic zinc, sA-sB loop, Alternative splicing, Cleavage on pair of basic residues, Glycoprotein, Membrane, Metal-binding, Metalloprotease, Notch signaling pathway, Phosphoprotein, Protease, SH3-binding, Transmembrane, Zymogen, Disease mutation, Extracellular matrix, Metalloenzyme inhibitor, Metalloprotease inhibitor, Secreted, Sensory transduction, Vision, Hydrolase, hydrolase inhibitor ;; Hydrolase, hydrolase inhibitor
实验方法 method	X-RAY DIFFRACTION

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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

3cki__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

3cki__assembly_1__model_1 | I(q)

100 个绘图点；横轴和纵轴均采用对数尺度。

3cki__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。

Rg（Guinier）	22.00 Å
Rg（电子密度）	21.07 Å
总 Rg	21.94 Å
原子数	3011
残基数	377
排除体积	53431 Å³
最大 q	0.500 Å⁻¹

Assembly	Model	结构单元	聚集说明	状态	CRYSOL	操作
1	1	`3cki__assembly_1__model_1`	dimeric （2）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载

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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (5)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	ADAM 17
分子量 formula_weight	28954.5 kDa
EC 编号 ec_number	3.4.24.86
突变 mutation	S266A, N452Q
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A
原子数 atom_count	3201

DPMKNTCKLLVVADHRFYRYMGRGEESTTTNYLIELIDRVDDIYRNTAWDNAGFKGYGIQIEQIRILKSPQEVKPGEKHYNMAKSYPNEEKDAWDVKMLLEQFSFDIAEEASKVCLAHLFTYQDFDMGTLGLAYVGSPRANSHGGVCPKAYYSPVGKKNIYLNSGLTSTKNYGKTILTKEADLVTTHELGHNFGAEHDPDGLAECAPNEDQGGKYVMYPIAVSGDHENNKMFSQCSKQSIYKTIESKAQECFQERS

来源 Source

来源生物 organism	Homo sapiens
通用名 common_name	human
宿主生物 host_organism	Cricetulus griseus

实体 2 Entity 2 polymer

描述 description	Metalloproteinase inhibitor 3
分子量 formula_weight	13973.3 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	B

CTCSPSHPQDAFCNSDIVIRAKVVGKKLVKEGPFGTLVYTIKQMKMYRGFTKMPHVQYIHTEASESLCGLKLEVNKYQYLLTGRVYDGKMYTGLCNFVERWDQLTLSQRKGLNYRYHLGCN

来源 Source

来源生物 organism	Homo sapiens
通用名 common_name	human
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

实体 3 Entity 3 non-polymer

描述 description	ZINC ION
分子量 formula_weight	65.4 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	1

实体 4 Entity 4 non-polymer

描述 description	SODIUM ION
分子量 formula_weight	23.0 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	1

实体 5 Entity 5 water

描述 description	water
分子量 formula_weight	18.0 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	190

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6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 4 domains

SCOP 2.08 (2 domains)

结构域编号 domain_id	d3ckia_
类 Class class	d — Alpha and beta proteins (a+b)
折叠类型 Fold fold	d.92 — Zincin-like
超家族 Superfamily superfamily	d.92.1 — Metalloproteases ('zincins'), catalytic domain
家族 Family family	d.92.1.10 — TNF-alpha converting enzyme, TACE, catalytic domain

结构域编号 domain_id	d3ckib_
类 Class class	b — All beta proteins
折叠类型 Fold fold	b.40 — OB-fold
超家族 Superfamily superfamily	b.40.3 — TIMP-like
家族 Family family	b.40.3.0 — automated matches

CATH v4.4 (2 domains)

结构域编号 domain_id	3ckiA00
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	40 — 3-Layer(aba) Sandwich
拓扑 Topology topology	390 — Collagenase (Catalytic Domain)
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Collagenase (Catalytic Domain)

结构域编号 domain_id	3ckiB00
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	40 — Beta Barrel
拓扑 Topology topology	50 — OB fold (Dihydrolipoamide Acetyltransferase, E2P)
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	120 —

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晶胞边长 a length_a	70.447 Å
晶胞边长 b length_b	70.447 Å
晶胞边长 c length_c	156.728 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	90.00 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	90.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	8

空间群 space_group	P 43 21 2
空间群编号 int_tables_number	96
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	2.300 Å
最低分辨率 resolution_low	19.590 Å
R 因子 r_factor	0.2340
R_work r_work	0.2340
R_free r_free	0.2840

Crystal structure of the TACE-N-TIMP-3 complex

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

ADAM 17

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

Metalloproteinase inhibitor 3

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

3cki__assembly_1__model_1

3cki__assembly_1__model_1 | I(q)

3cki__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (5)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 3 Entity 3 non-polymer

实体 4 Entity 4 non-polymer

实体 5 Entity 5 water

6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 4 domains

SCOP 2.08 (2 domains)

CATH v4.4 (2 domains)

7. 引用文献 (1)

Crystal structure of the TACE-N-TIMP-3 complex

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

ADAM 17

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Metalloproteinase inhibitor 3

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

3cki__assembly_1__model_1

3cki__assembly_1__model_1 | I(q)

3cki__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (5)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 3 Entity 3 non-polymer

实体 4 Entity 4 non-polymer

实体 5 Entity 5 water

6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 4 domains

SCOP 2.08 (2 domains)

CATH v4.4 (2 domains)

7. 引用文献 (1)