3csn

Structure of the Serratia marcescens hemophore receptor HasR in complex with its hemophore HasA

Method: X-RAY DIFFRACTION
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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

HasR protein

Serratia marcescens

UniProt Q79AD2

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 2 Hemophore HasA × 1 (Q54450) GLYCEROL × 1 water × 2 与蛋白数一致
2 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 2 Hemophore HasA × 1 (Q54450) GLYCEROL × 4 water × 2 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 Q79AD2_SERMA
Isoform —
PDB实体 1
链与序列区间 作者链 A; PDB构建体 1–865; UniProt 35–899 作者链 B; PDB构建体 1–865; UniProt 35–899

Hemophore HasA

Serratia marcescens

UniProt Q54450

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 2 HasR protein × 1 (Q79AD2) GLYCEROL × 1 water × 2 与蛋白数一致
2 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 2 HasR protein × 1 (Q79AD2) GLYCEROL × 4 water × 2 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 HASA_SERMA
Isoform —
PDB实体 2
链与序列区间 作者链 C; PDB构建体 20–206; UniProt 2–188 作者链 D; PDB构建体 20–206; UniProt 2–188

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中;数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护,因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id3csn
沉积日期 deposition_date2008-04-10
结构标题 titleStructure of the Serratia marcescens hemophore receptor HasR in complex with its hemophore HasA
关键词 keywords;outer membrane protein, beta-barrel, hemophore receptor, TonB box, Heme, Iron, Metal-binding, Secreted, MEMBRANE PROTEIN-HEME BINDING PROTEIN COMPLEX ;; MEMBRANE PROTEIN/HEME BINDING PROTEIN
实验方法 methodX-RAY DIFFRACTION
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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

3csn__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

3csn__assembly_1__model_1 | I(q)

10-2 10-1 106 107 108 q (1/Angstrom) I(q)
100 个绘图点;横轴和纵轴均采用对数尺度。

3csn__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

新版 assembly/model P(r) 尚未计算 此处仅保留位置,不展示旧数据 r (Angstrom) P(r)
P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。
Rg(Guinier)31.09 Å
Rg(电子密度)31.00 Å
总 Rg31.42 Å
原子数7079
残基数916
排除体积123480 ų
最大 q0.500 Å⁻¹
Assembly Model 结构单元 聚集说明 状态 CRYSOL 操作
1 1 3csn__assembly_1__model_1 dimeric (2) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
2 1 3csn__assembly_2__model_1 dimeric (2) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (4)

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6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 10 domains

SCOP 2.08 (4 domains)

结构域编号 domain_idd3csnc1
类 Class classd — Alpha and beta proteins (a+b)
折叠类型 Fold foldd.35 — Heme-binding protein A (HasA)
超家族 Superfamily superfamilyd.35.1 — Heme-binding protein A (HasA)
家族 Family familyd.35.1.0 — automated matches
结构域编号 domain_idd3csnc2
类 Class classl — Artifacts
折叠类型 Fold foldl.1 — Tags
超家族 Superfamily superfamilyl.1.1 — Tags
家族 Family familyl.1.1.1 — Tags
结构域编号 domain_idd3csnd1
类 Class classd — Alpha and beta proteins (a+b)
折叠类型 Fold foldd.35 — Heme-binding protein A (HasA)
超家族 Superfamily superfamilyd.35.1 — Heme-binding protein A (HasA)
家族 Family familyd.35.1.0 — automated matches
结构域编号 domain_idd3csnd2
类 Class classl — Artifacts
折叠类型 Fold foldl.1 — Tags
超家族 Superfamily superfamilyl.1.1 — Tags
家族 Family familyl.1.1.1 — Tags

CATH v4.4 (6 domains)

结构域编号 domain_id3csnA01
类 Class class2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture170 — Beta Complex
拓扑 Topology topology130 — Ferric Hydroxamate Uptake Protein; Chain A, domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — TonB-dependent receptor, plug domain
结构域编号 domain_id3csnA02
类 Class class2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture40 — Beta Barrel
拓扑 Topology topology170 — Maltoporin; Chain A
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily20 — TonB-dependent receptor, beta-barrel domain
结构域编号 domain_id3csnB01
类 Class class2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture170 — Beta Complex
拓扑 Topology topology130 — Ferric Hydroxamate Uptake Protein; Chain A, domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — TonB-dependent receptor, plug domain
结构域编号 domain_id3csnB02
类 Class class2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture40 — Beta Barrel
拓扑 Topology topology170 — Maltoporin; Chain A
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily20 — TonB-dependent receptor, beta-barrel domain
结构域编号 domain_id3csnC00
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology1500 — Heme-binding Protein A; Chain: A;
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — Haem-binding HasA
结构域编号 domain_id3csnD00
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology1500 — Heme-binding Protein A; Chain: A;
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — Haem-binding HasA
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7. 引用文献 (1)