SAXSdb — 3csn

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

HasR protein

Serratia marcescens

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2）与蛋白拷贝数一致	链 A； UniProt 35–899	未记录	Hemophore HasA × 1 （Q54450） GOL GLYCEROL × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：pH 8；291 K；2 M NaCl, 100 mM Tris, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K	分辨率 3.00 Å R-free 0.244
2	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2）与蛋白拷贝数一致	链 B； UniProt 35–899	未记录	Hemophore HasA × 1 （Q54450） GOL GLYCEROL × 4	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：pH 8；291 K；2 M NaCl, 100 mM Tris, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K	分辨率 3.00 Å R-free 0.244

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB	相对当前条目 3CSN	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
2M5J Solution structure of the periplasmic signaling domain of HasR, a TonB-dependent outer membrane heme transporter 提交 2013-02-26	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 42–146（105 aa）片段：UNP residues 42-146	未记录	未记录非水小分子	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 7；293 K；离子强度（mmCIF原始值）0.1；压力 1 NMR样品组成 0.5 mM [U-99% 13C; U-99% 15N] HasR_N-terminal_periplasmic_signaling_domain-1, 50 mM Sodium phosphate-2, 50 mM NaCl-3, 85% H2O/15% D2O \| 85% H2O/15% D2O	分辨率未提供
3CSL Structure of the Serratia marcescens hemophore receptor HasR in complex with its hemophore HasA and heme 提交 2008-04-10	配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 35–899（865 aa）	未记录	HEM PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 1 GOL GLYCEROL × 5	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；291 K；2 M NaCl, 100 mM Tris, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K	分辨率 2.70 Å R-free 0.274
3CSL Structure of the Serratia marcescens hemophore receptor HasR in complex with its hemophore HasA and heme 提交 2008-04-10	配体/离子不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 35–899（865 aa）	未记录	HEM PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 1 GOL GLYCEROL × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；291 K；2 M NaCl, 100 mM Tris, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K	分辨率 2.70 Å R-free 0.274
3DDR Structure of the Serratia marcescens hemophore receptor HasR-Ile671Gly mutant in complex with its hemophore HasA and heme 提交 2008-06-06	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 48–899（852 aa）片段：UNP residues 48 to 899	突变：I671G	NA SODIUM ION × 1 GOL GLYCEROL × 1 HEM PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 8；291 K；2 M NaCl, 100 mM Tris, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K	分辨率 2.80 Å R-free 0.262
3DDR Structure of the Serratia marcescens hemophore receptor HasR-Ile671Gly mutant in complex with its hemophore HasA and heme 提交 2008-06-06	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 48–899（852 aa）片段：UNP residues 48 to 899	突变：I671G	NA SODIUM ION × 1 GOL GLYCEROL × 5 HEM PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 8；291 K；2 M NaCl, 100 mM Tris, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K	分辨率 2.80 Å R-free 0.262
5C58 A double mutant of serratia marcescens hemophore receptor HasR in complex with its hemophore HasA and heme 提交 2015-06-19	突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 35–899（865 aa）	突变：R297A, N800A	HEM PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291 K；100mM Tris pH 7 to 8, 1.8 to 2.2mM NaCl, 100mM K2HPO4	分辨率 2.79 Å R-free 0.296

共 4 个其他 PDB 条目、6 个 assembly。打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	Q79AD2_SERMA
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 1–865； UniProt 35–899 作者链 B； PDB构建体 1–865； UniProt 35–899

Hemophore HasA

Serratia marcescens

UniProt Q54450

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2）与蛋白拷贝数一致	链 C； UniProt 2–188	未记录	HasR protein × 1 （Q79AD2） GOL GLYCEROL × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：pH 8；291 K；2 M NaCl, 100 mM Tris, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K	分辨率 3.00 Å R-free 0.244
2	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2）与蛋白拷贝数一致	链 D； UniProt 2–188	未记录	HasR protein × 1 （Q79AD2） GOL GLYCEROL × 4	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：pH 8；291 K；2 M NaCl, 100 mM Tris, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K	分辨率 3.00 Å R-free 0.244

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB	相对当前条目 3CSN	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
1B2V HEME-BINDING PROTEIN A 提交 1998-12-01	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–188（188 aa）	未记录	CA CALCIUM ION × 1 HEM PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 4.6；0.2M CACL, 0.1M NA ACETATE PH 4.6, 20% ISOPRPANOL	分辨率 1.90 Å R-free 0.218
1DK0 CRYSTAL STRUCTURE OF THE HEMOPHORE HASA FROM SERRATIA MARCESCENS CRYSTAL FORM P2(1), PH8 提交 1999-12-06	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–188（188 aa）	未记录	HEM PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；293 K；0.1M NaHepes, pH8.0, 1.4M NaKTartrate, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 1.77 Å R-free 0.213
1DK0 CRYSTAL STRUCTURE OF THE HEMOPHORE HASA FROM SERRATIA MARCESCENS CRYSTAL FORM P2(1), PH8 提交 1999-12-06	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 1–188（188 aa）	未记录	HEM PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；293 K；0.1M NaHepes, pH8.0, 1.4M NaKTartrate, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 1.77 Å R-free 0.213
1DKH CRYSTAL STRUCTURE OF THE HEMOPHORE HASA, PH 6.5 提交 1999-12-07	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–188（188 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 3 SM SAMARIUM (III) ION × 1 HEM PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；293 K；Cacodylate buffer pH6.5, Zinc Acetate 140mM, Glycerol 2%, PEG8000 10%, Samarium Chloride 10mM., VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 3.20 Å R-free 0.288
1YBJ Structural and Dynamics studies of both apo and holo forms of the hemophore HasA 提交 2004-12-21	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 2–179（178 aa）	未记录	未记录非水小分子	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 5.6；303 K；离子强度（mmCIF原始值）20mM sodium phosphate buffer；压力 ambient NMR样品组成 1.8mM HasA 15N \| 20mM sodium phosphate buffer, pH5.6; 90% H2O/10% D20 NMR样品组成 1.9mM HasA 15N,13C \| 20mM sodium phosphate buffer, pH5.6; 90% H2O/10% D20	分辨率未提供
2CN4 The crystal structure of the secreted dimeric form of the hemophore HasA reveals a domain swapping with an exchanged heme ligand 提交 2006-05-18	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 2–174（173 aa）链 B 2–174（173 aa）	未记录	HEM PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 2 PO4 PHOSPHATE ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 8.5；2 MICROLITERS PROTEIN (AT A CONCENTRATION OF ABOUT 4 MG/ML) WERE MIXED WITH 1 MICROLITER RESERVOIR CONSISTING OF 100 MM TRIS BUFFER AT PH 8.5, 2 M K2HPO4 AND 2 M NAH2PO4.	分辨率 2.30 Å R-free 0.224
2UYD Crystal structure of the SmHasA mutant H83A 提交 2007-04-04	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 X 1–188（188 aa）	突变：YES	HEM PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 1 ZN ZINC ION × 8 ACT ACETATE ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 6.5；293 K；DROPS WERE PREPARED BY MIXING 2MICROL OF THE PROTEIN SOLUTION WITH 1 MICROL OF THE RESERVOIR SOLUTION THAT CONTAINED 100 MM SODIUM CACODYLATE AT PH 6.5, 200 MM ZN(OAC)2 AND 10 % (V/V) 2-PROPANOL. THE BROWNISH CRYSTALS GREW OVER A PERIOD OF 2 MONTHS AT 20 DEGREES C.	分辨率 2.70 Å R-free 0.274
3CSL Structure of the Serratia marcescens hemophore receptor HasR in complex with its hemophore HasA and heme 提交 2008-04-10	配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 C 2–188（187 aa）	未记录	HEM PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 1 GOL GLYCEROL × 5	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；291 K；2 M NaCl, 100 mM Tris, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K	分辨率 2.70 Å R-free 0.274
3CSL Structure of the Serratia marcescens hemophore receptor HasR in complex with its hemophore HasA and heme 提交 2008-04-10	配体/离子不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 D 2–188（187 aa）	未记录	HEM PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 1 GOL GLYCEROL × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；291 K；2 M NaCl, 100 mM Tris, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K	分辨率 2.70 Å R-free 0.274
3DDR Structure of the Serratia marcescens hemophore receptor HasR-Ile671Gly mutant in complex with its hemophore HasA and heme 提交 2008-06-06	配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 C 2–188（187 aa）	未记录	NA SODIUM ION × 1 GOL GLYCEROL × 1 HEM PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 8；291 K；2 M NaCl, 100 mM Tris, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K	分辨率 2.80 Å R-free 0.262
3DDR Structure of the Serratia marcescens hemophore receptor HasR-Ile671Gly mutant in complex with its hemophore HasA and heme 提交 2008-06-06	配体/离子不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 D 2–188（187 aa）	未记录	NA SODIUM ION × 1 GOL GLYCEROL × 5 HEM PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 8；291 K；2 M NaCl, 100 mM Tris, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K	分辨率 2.80 Å R-free 0.262
5C58 A double mutant of serratia marcescens hemophore receptor HasR in complex with its hemophore HasA and heme 提交 2015-06-19	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 2–188（187 aa）片段：UNP residues 2-188	未记录	HEM PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291 K；100mM Tris pH 7 to 8, 1.8 to 2.2mM NaCl, 100mM K2HPO4	分辨率 2.79 Å R-free 0.296
9XOH Crystal Structure of Redesigned HasAsm Variant (14-mutation) with Iron Tetraphenylporphyrin 提交 2025-11-13	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–176（176 aa）	突变：A2S, G13A, H17A, G21T, S42T, Q63N, N79S, D102T, V110N, D112E, A125S, V131E, G145S, D156K	MQP [5,10,15,20-tetraphenylporphyrinato(2-)-kappa~4~N~21~,N~22~,N~23~,N~24~]iron × 1 GOL GLYCEROL × 3 NA SODIUM ION × 4	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293 K；0.1M sodium cacodylate-HCl, 1M sodium citrate tribasic	分辨率 1.51 Å R-free 0.234
9XOH Crystal Structure of Redesigned HasAsm Variant (14-mutation) with Iron Tetraphenylporphyrin 提交 2025-11-13	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 1–176（176 aa）	突变：A2S, G13A, H17A, G21T, S42T, Q63N, N79S, D102T, V110N, D112E, A125S, V131E, G145S, D156K	MQP [5,10,15,20-tetraphenylporphyrinato(2-)-kappa~4~N~21~,N~22~,N~23~,N~24~]iron × 1 GOL GLYCEROL × 2 NA SODIUM ION × 4	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293 K；0.1M sodium cacodylate-HCl, 1M sodium citrate tribasic	分辨率 1.51 Å R-free 0.234
9XOH Crystal Structure of Redesigned HasAsm Variant (14-mutation) with Iron Tetraphenylporphyrin 提交 2025-11-13	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 C 1–176（176 aa）	突变：A2S, G13A, H17A, G21T, S42T, Q63N, N79S, D102T, V110N, D112E, A125S, V131E, G145S, D156K	MQP [5,10,15,20-tetraphenylporphyrinato(2-)-kappa~4~N~21~,N~22~,N~23~,N~24~]iron × 1 NA SODIUM ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293 K；0.1M sodium cacodylate-HCl, 1M sodium citrate tribasic	分辨率 1.51 Å R-free 0.234
9XOH Crystal Structure of Redesigned HasAsm Variant (14-mutation) with Iron Tetraphenylporphyrin 提交 2025-11-13	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 4 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 D 1–176（176 aa）	突变：A2S, G13A, H17A, G21T, S42T, Q63N, N79S, D102T, V110N, D112E, A125S, V131E, G145S, D156K	MQP [5,10,15,20-tetraphenylporphyrinato(2-)-kappa~4~N~21~,N~22~,N~23~,N~24~]iron × 1 GOL GLYCEROL × 2 NA SODIUM ION × 3	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293 K；0.1M sodium cacodylate-HCl, 1M sodium citrate tribasic	分辨率 1.51 Å R-free 0.234
9XOK Crystal Structure of Redesigned HasAsm Variant (51-mutation) with Iron Tetraphenylporphyrin 提交 2025-11-13	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 3–173（171 aa）	突变：;F11L, G12D, G13N, Y14L, S15T, I16L, H17Q, D18E, Y19F, L20F, G21N, Q22E, S25A, T26S, S58T, A61K, N62D, Q63G, Q88T, S93A, D96N, D102S, T103S, S104T, Q109T, V110E, D112Q, V113F, S114R, F115L, N119G, L120W, S121T, L123E, Q124I, A125S, Q126E, T144S, G145T, A146P, E148L, T149Q, G153N, I154Q, D156Q, D157Q, V162T, D167M, Q168E, V169I, A170R ;	MQP [5,10,15,20-tetraphenylporphyrinato(2-)-kappa~4~N~21~,N~22~,N~23~,N~24~]iron × 1 SO4 SULFATE ION × 1 GOL GLYCEROL × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293 K；0.1M sodium cacodylate-HCl, 2M ammonium sulfate, 0.2M NaCl	分辨率 1.80 Å R-free 0.330
9XPD Crystal Structure of Redesigned HasAsm Variant (51-mutation) with Heme 提交 2025-11-16	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–176（176 aa）	突变：;F11L, G12D, G13N, Y14L, S15T, I16L, H17Q, D18E, Y19F, L20F, G21N, Q22E, S25A, T26S, S58T, A61K, N62D, Q63G, Q88T, S93A, D96N, D102S, T103S, S104T, Q109T, V110E, D112Q, V113F, S114R, F115L, N119G, L120W, S121T, L123E, Q124I, A125S, Q126E, T144S, G145T, A146P, E148L, T149Q, G153N, I154Q, D156Q, D157Q, V162T, D167M, Q168E, V169I, A170R ;	IMD IMIDAZOLE × 1 CIT CITRIC ACID × 1 GOL GLYCEROL × 1 HEM PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 1 NA SODIUM ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；293 K；0.1M imidazole-HCl, 1M sodium citrate tribasic	分辨率 1.22 Å R-free 0.177
9XPI Crystal Structure of Redesigned HasAsm Variant (48-mutation) with Heme 提交 2025-11-16	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–176（176 aa）	突变：;F11L, G12A, G13N, Y14L, S15T, I16L, H17A, D18E, Y19F, L20F, G21N, Q22E, T26Y, N41S, S58T, A61K, N62D, Q63G, N79S, E80P, Q88T, S91A, S93T, D96N, T103S, S104T, Q109V, V110N, D112E, S114T, G116S, L120W, S121T, L123E, A125E, Q126E, Q134K, V136I, G145T, E148L, T149Q, G153S, I154L, D156K, D157Q, V162I, Q168E, V169I ;	HEM PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 1 ACT ACETATE ION × 3 ZN ZINC ION × 6	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；293 K；0.1M imidazole-HCl, 2.5M NaCl, 0.2M Zinc acetate	分辨率 2.16 Å R-free 0.255

共 13 个其他 PDB 条目、19 个 assembly。打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	HASA_SERMA
Isoform	—
PDB实体	2
链与序列区间	作者链 C； PDB构建体 20–206； UniProt 2–188 作者链 D； PDB构建体 20–206； UniProt 2–188

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	3csn
沉积日期 deposition_date	2008-04-10
结构标题 title	Structure of the Serratia marcescens hemophore receptor HasR in complex with its hemophore HasA
关键词 keywords	;outer membrane protein, beta-barrel, hemophore receptor, TonB box, Heme, Iron, Metal-binding, Secreted, MEMBRANE PROTEIN-HEME BINDING PROTEIN COMPLEX ;; MEMBRANE PROTEIN/HEME BINDING PROTEIN
实验方法 method	X-RAY DIFFRACTION

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3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

回转半径 Rg (Guinier) rg_guinier	52.85 Å
回转半径 Rg (电子) rg_electron	53.13 Å
零角强度 I(0) i0	624969000.00
分子量 molecular_weight	200560.0 kDa
排除体积 excluded_volume	247310 Å³
包络体积 envelope_volume	347510 Å³
水化壳体积 shell_volume	56274 Å³
包络直径 envelope_diameter	189.2 Å
壳层 Rg shell_rg	53.79 Å
包络 Rg envelope_rg	52.33 Å
形状 Rg shape_rg	53.13 Å
总 Rg total_rg	53.15 Å
总原子数 total_atoms	14176
残基数 n_residues	1832
球谐函数阶数 n_harmonics	20
q 范围 q_range	— – 0.5000 Å⁻¹
数据点数 n_points	101
壳层类型 shell_type	directional
溶剂电子密度 solvent_density	0.3340 e/Å³
壳层衬度 contrast_shell	0.0300 e/Å³
CRYSOL 版本 crysol_version	4.1.3

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4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

最大尺寸 Dmax dmax	181.1 Å
Rg (实空间) rg_real	53.31 Å
Rg 误差 (实空间) rg_real_error	1.99 Å
I(0) (实空间) i0_real	6.2500e+08
I(0) 误差 (实空间) i0_real_error	1.1120e+07
Rg (倒空间) rg_reciprocal	52.45 Å
I(0) (倒空间) i0_reciprocal	624200000.0000
解质量估计 total_estimate	0.7492
解质量评级 solution_quality	REASONABLE a REASONABLE solution
P(r) 峰数 n_peaks	2
主峰位置 r_peak_primary	36.2 Å
偏度 Skewness skewness	0.462
峰度 Kurtosis kurtosis	-0.530
角度范围 angular_range	— – 0.1500 Å⁻¹
当前正则化参数 α current_alpha	0.0000
最高正则化参数 α highest_alpha	126700000.0000
实空间数据点数 n_real_points	31
GNOM 版本 gnom_version	4.1.3
质量判据 quality_criteria	AN1: 0.000; Oscil: 0.489; Stabil: 1.000; Sysdev: 1.000; Positv: 1.000; Valcen: 0.716; Smooth: 0.551

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5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

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6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (4)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	HasR protein
分子量 formula_weight	94954.7 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A,B
原子数 atom_count	14195

AQAEASSAQAAQQKNFNIAAQPLQSAMLRFAEQAGMQVFFDEVKLDGMQAAALNGSMSVEQGLRRLIGGNPVAFRLQPQGQIVLSRLPTANGDGGALALDSLTVLGAGGNNANDWVYDEPRSVSVISREQMDNRPARHAADILEQTTGAYSSVSQQDPALSVNIRGIQDYGRVNMNIDGMRQNFQKSGHGQRNGTMYIDSELLSGVTIDKGTTGGMGSAGTLGGIATFNTVSASDFLAPGKELGGKLHASTGDNGTHFIGSGILALGNETGDILLAASERHLGDYWPGNKGDIGNIRINNDTGNYDRYAESIKNNKIPDTHYRMHSRLAKVGWNLPANQRLQLSYLQTQTASPIAGTLTNLGTRPPYELGWKRTGYTDVMARNAAFDYSLAPEDVDWLDFQAKLYYVDTQDDSDTYSTSSLLDNGYATRTRLRTYGAQAQNTSRFSLAPGHDFRANYGLEFYYDKATSDSSRQGMEGVTPAGNRSVASLFANLTYDYDGWLTLEGGLRYDRYRLRGQTGLSYPDLAKDGQRYTIDNPCKALRLTGCSTTTREDWDVDRDQGKLSPTLAVAVRPGVEWLELYTTYGKSWRPPAITETLTNGSAHSSSTQYPNPFLQPERSRAWEVGFNVQQPDLWFEGDRLVAKVAYFDTKVDNYINLAIDRNKPGLVQPSIGNAAYVNNLSKTRFRGLEYQLNYDAGVFYADLTYTHMIGKNEFCSNKAWLGGRLRYGDGSRRGNFYVEPDAASNDFVTCDGGTQFGSAAYLPGDRGSVTLGGRAFDRKLDAGVTVRFAPGYQDSSVPSNYPYLADWPKYTLFDLYASYKLTDSLTLRGSVENLTNRAYVVSYGETLANTLGRGRTVQGGVEYRF

来源 Source

来源生物 organism	Serratia marcescens
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

实体 2 Entity 2 polymer

描述 description	Hemophore HasA
分子量 formula_weight	21523.2 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	C,D

MRGSHHHHHHGIRMRARYPAFSVNYDSSFGGYSIHDYLGQWASTFGDVNHTNGNVTDANSGGFYGGSLSGSQYAISSTANQVTAFVAGGNLTYTLFNEPAHTLYGQLDSLSFGDGLSGGDTSPYSIQVPDVSFGGLNLSSLQAQGHDGVVHQVVYGLMSGDTGALETALNGILDDYGLSVNSTFDQVAAATAVGVQHADSPELLAA

来源 Source

来源生物 organism	Serratia marcescens
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

实体 3 Entity 3 non-polymer

描述 description	GLYCEROL
分子量 formula_weight	92.1 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	5

实体 4 Entity 4 water

描述 description	water
分子量 formula_weight	18.0 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	19

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7. 折叠分类 (SCOP + CATH) 10 domains

SCOP 2.08 (4 domains)

结构域编号 domain_id	d3csnc1
类 Class class	d — Alpha and beta proteins (a+b)
折叠类型 Fold fold	d.35 — Heme-binding protein A (HasA)
超家族 Superfamily superfamily	d.35.1 — Heme-binding protein A (HasA)
家族 Family family	d.35.1.0 — automated matches

结构域编号 domain_id	d3csnc2
类 Class class	l — Artifacts
折叠类型 Fold fold	l.1 — Tags
超家族 Superfamily superfamily	l.1.1 — Tags
家族 Family family	l.1.1.1 — Tags

结构域编号 domain_id	d3csnd1
类 Class class	d — Alpha and beta proteins (a+b)
折叠类型 Fold fold	d.35 — Heme-binding protein A (HasA)
超家族 Superfamily superfamily	d.35.1 — Heme-binding protein A (HasA)
家族 Family family	d.35.1.0 — automated matches

结构域编号 domain_id	d3csnd2
类 Class class	l — Artifacts
折叠类型 Fold fold	l.1 — Tags
超家族 Superfamily superfamily	l.1.1 — Tags
家族 Family family	l.1.1.1 — Tags

CATH v4.4 (6 domains)

结构域编号 domain_id	3csnA01
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	170 — Beta Complex
拓扑 Topology topology	130 — Ferric Hydroxamate Uptake Protein; Chain A, domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — TonB-dependent receptor, plug domain

结构域编号 domain_id	3csnA02
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	40 — Beta Barrel
拓扑 Topology topology	170 — Maltoporin; Chain A
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	20 — TonB-dependent receptor, beta-barrel domain

结构域编号 domain_id	3csnB01
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	170 — Beta Complex
拓扑 Topology topology	130 — Ferric Hydroxamate Uptake Protein; Chain A, domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — TonB-dependent receptor, plug domain

结构域编号 domain_id	3csnB02
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	40 — Beta Barrel
拓扑 Topology topology	170 — Maltoporin; Chain A
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	20 — TonB-dependent receptor, beta-barrel domain

结构域编号 domain_id	3csnC00
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	1500 — Heme-binding Protein A; Chain: A;
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Haem-binding HasA

结构域编号 domain_id	3csnD00
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	1500 — Heme-binding Protein A; Chain: A;
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Haem-binding HasA

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8. 引用文献 (1)

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晶胞边长 a length_a	157.650 Å
晶胞边长 b length_b	164.740 Å
晶胞边长 c length_c	597.300 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	90.00 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	90.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	32

空间群 space_group	F 2 2 2
空间群编号 int_tables_number	22
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	3.000 Å
最低分辨率 resolution_low	49.430 Å
R 因子 r_factor	0.2190
R_work r_work	0.2170
R_free r_free	0.2440

fit	/app/data/saxs_computation/cs/3csn/3csn.fit
pddf	/app/data/pr_computation/cs/3csn/3csn.pr.out
profile	/app/data/saxs_computation/cs/3csn/3csn.dat

Structure of the Serratia marcescens hemophore receptor HasR in complex with its hemophore HasA

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

HasR protein

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

Hemophore HasA

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (4)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 3 Entity 3 non-polymer

实体 4 Entity 4 water

7. 折叠分类 (SCOP + CATH) 10 domains

SCOP 2.08 (4 domains)

CATH v4.4 (6 domains)

8. 引用文献 (1)

9. 文件与曲线 (10)

Files (7)

Curves (3)