3dpp

Crystal structure of the substrate binding domain of E. coli DnaK in complex with a long pyrrhocoricin-derived inhibitor peptide (form A)

Method: X-RAY DIFFRACTION D_max: 83.2 Å Quality: GOOD

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Chaperone protein dnaK

Escherichia coli

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2）与蛋白拷贝数一致	链 A； UniProt 389–607	片段：substrate binding domain (UNP residues 389 to 607)	inhibitor peptide × 1 SO4 SULFATE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5；293 K；2.4 M ammonium sulfate, 100 mM citric acid , pH 5.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K	分辨率 2.50 Å R-free 0.316
2	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2）与蛋白拷贝数一致	链 B； UniProt 389–607	片段：substrate binding domain (UNP residues 389 to 607)	inhibitor peptide × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5；293 K；2.4 M ammonium sulfate, 100 mM citric acid , pH 5.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K	分辨率 2.50 Å R-free 0.316

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB	相对当前条目 3DPP	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
1BPR NMR STRUCTURE OF THE SUBSTRATE BINDING DOMAIN OF DNAK, MINIMIZED AVERAGE STRUCTURE 提交 1998-08-11	构建体不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 379–560（182 aa）片段：SUBSTRATE BINDING DOMAIN	未记录	未记录非水小分子	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 7；298 K；离子强度（mmCIF原始值）50 mM INORGANIC PHOSPHATE；压力 1 NMR样品组成 H2O AND D2O	分辨率未提供
1DG4 NMR STRUCTURE OF THE SUBSTRATE BINDING DOMAIN OF DNAK IN THE APO FORM 提交 1999-11-23	构建体不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 393–507（115 aa）片段：SUBSTRATE BINDING DOMAIN	未记录	未记录非水小分子	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 6.8；303 K；离子强度（mmCIF原始值）10mM NA PHOSPHATE；压力 AMBIENT NMR测量条件 pH 6.8；303 K；离子强度（mmCIF原始值）10mM NA PHOSPHATE；压力 AMBIENT NMR测量条件 pH 6.8；303 K；离子强度（mmCIF原始值）10mM NA PHOSPHATE；压力 AMBIENT NMR测量条件 pH 6.8；303 K；离子强度（mmCIF原始值）10mM NA PHOSPHATE；压力 AMBIENT NMR样品组成 1MM U15N; 10MM PHOSPHATE BUFFER NA NMR样品组成 1MM U15N,13C; 10MM PHOSPHATE BUFFER NA NMR样品组成 1MM U15N,13C; 10MM PHOSPHATE BUFFER NA NMR样品组成 1MM 10% 13C; 10MM PHOSPHATE BUFFER NA	分辨率未提供
1DKX THE SUBSTRATE BINDING DOMAIN OF DNAK IN COMPLEX WITH A SUBSTRATE PEPTIDE, DETERMINED FROM TYPE 1 SELENOMETHIONYL CRYSTALS 提交 1996-06-03	构建体不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 388–606（219 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 2.00 Å R-free 0.288
1DKX THE SUBSTRATE BINDING DOMAIN OF DNAK IN COMPLEX WITH A SUBSTRATE PEPTIDE, DETERMINED FROM TYPE 1 SELENOMETHIONYL CRYSTALS 提交 1996-06-03	构建体不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric	链 A 388–606（219 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 2.00 Å R-free 0.288
1DKY THE SUBSTRATE BINDING DOMAIN OF DNAK IN COMPLEX WITH A SUBSTRATE PEPTIDE, DETERMINED FROM TYPE 2 NATIVE CRYSTALS 提交 1996-06-03	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 388–606（219 aa）片段：SUBSTRATE BINDING DOMAIN 链 B 388–606（219 aa）片段：SUBSTRATE BINDING DOMAIN	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 2.80 Å R-free 0.309
1DKY THE SUBSTRATE BINDING DOMAIN OF DNAK IN COMPLEX WITH A SUBSTRATE PEPTIDE, DETERMINED FROM TYPE 2 NATIVE CRYSTALS 提交 1996-06-03	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric	链 A 388–606（219 aa）片段：SUBSTRATE BINDING DOMAIN 链 B 388–606（219 aa）片段：SUBSTRATE BINDING DOMAIN	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 2.80 Å R-free 0.309
1DKY THE SUBSTRATE BINDING DOMAIN OF DNAK IN COMPLEX WITH A SUBSTRATE PEPTIDE, DETERMINED FROM TYPE 2 NATIVE CRYSTALS 提交 1996-06-03	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 388–606（219 aa）片段：SUBSTRATE BINDING DOMAIN 链 B 388–606（219 aa）片段：SUBSTRATE BINDING DOMAIN	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 2.80 Å R-free 0.309
1DKZ THE SUBSTRATE BINDING DOMAIN OF DNAK IN COMPLEX WITH A SUBSTRATE PEPTIDE, DETERMINED FROM TYPE 1 NATIVE CRYSTALS 提交 1996-06-03	构建体不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 388–606（219 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 2.00 Å R-free 0.274
1DKZ THE SUBSTRATE BINDING DOMAIN OF DNAK IN COMPLEX WITH A SUBSTRATE PEPTIDE, DETERMINED FROM TYPE 1 NATIVE CRYSTALS 提交 1996-06-03	构建体不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric	链 A 388–606（219 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 2.00 Å R-free 0.274
1Q5L NMR structure of the substrate binding domain of DnaK bound to the peptide NRLLLTG 提交 2003-08-08	构建体不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 392–506（115 aa）片段：substrate binding domain	未记录	未记录非水小分子	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 7.4；303 K；离子强度（mmCIF原始值）10 mM sodium phosphate；压力 ambient NMR样品组成 0.66 mM DnaK(393-507); 3.3 mM NRLLLTG; 10 mM sodium phosphate buffer, pH 7.4 \| 90% H2O/10% D2O	分辨率未提供
2BPR NMR STRUCTURE OF THE SUBSTRATE BINDING DOMAIN OF DNAK, 25 STRUCTURES 提交 1998-08-11	构建体不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 379–560（182 aa）片段：SUBSTRATE BINDING DOMAIN	未记录	未记录非水小分子	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 7；298 K；离子强度（mmCIF原始值）50 mM INORGANIC PHOSPHATE；压力 1 NMR样品组成 H2O AND D2O	分辨率未提供
2KHO NMR-RDC / XRAY structure of E. coli HSP70 (DNAK) chaperone (1-605) complexed with ADP and substrate 提交 2009-04-10	构建体不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–605（605 aa）	未记录	未记录非水小分子	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 7.2；300 K；离子强度（mmCIF原始值）0.05；压力 AMBIENT NMR样品组成 0.2 MM [U-100% 13C U-100% 15N U-80% 2H] HSP70, 10 MM POTASSIUM CHLORIDE, 25 MM TRIS, 10 MM DTT, 5 MM MGCL2, 5 MM ADP, 10 MM POTASSIUM PHOSPHATE, 0.2 MM SODIUM AZIDE, 2 MM NRLLLTG, 90% H2O/ 10% D2O \| 90% H2O/10% D2O	分辨率未提供
3DPO Crystal structure of the substrate binding domain of E. coli DnaK in complex with a short pyrrhocoricin-derived inhibitor peptide 提交 2008-07-09	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 389–607（219 aa）片段：Substrate binding domain (UNP residues 389 to 607) 链 B 389–607（219 aa）片段：Substrate binding domain (UNP residues 389 to 607)	未记录	SO4 SULFATE ION × 6	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5；293 K；2.4 M ammonium sulfate, 100 mM citric acid, pH 5.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K	分辨率 2.10 Å R-free 0.241
3DPO Crystal structure of the substrate binding domain of E. coli DnaK in complex with a short pyrrhocoricin-derived inhibitor peptide 提交 2008-07-09	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 389–607（219 aa）片段：Substrate binding domain (UNP residues 389 to 607)	未记录	SO4 SULFATE ION × 3	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5；293 K；2.4 M ammonium sulfate, 100 mM citric acid, pH 5.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K	分辨率 2.10 Å R-free 0.241
3DPO Crystal structure of the substrate binding domain of E. coli DnaK in complex with a short pyrrhocoricin-derived inhibitor peptide 提交 2008-07-09	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 389–607（219 aa）片段：Substrate binding domain (UNP residues 389 to 607)	未记录	SO4 SULFATE ION × 3	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5；293 K；2.4 M ammonium sulfate, 100 mM citric acid, pH 5.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K	分辨率 2.10 Å R-free 0.241
3DPQ Crystal structure of the substrate binding domain of E. coli DnaK in complex with a long pyrrhocoricin-derived inhibitor peptide (form B) 提交 2008-07-09	构建体不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 E 389–601（213 aa）片段：Substrate binding domain (UNP residues 389 to 607)	未记录	SO4 SULFATE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5；293 K；2.4 M ammonium sulfate, 100 mM citric acid , pH 5.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K	分辨率 2.60 Å R-free 0.319
3DPQ Crystal structure of the substrate binding domain of E. coli DnaK in complex with a long pyrrhocoricin-derived inhibitor peptide (form B) 提交 2008-07-09	构建体不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 F 389–601（213 aa）片段：Substrate binding domain (UNP residues 389 to 607)	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5；293 K；2.4 M ammonium sulfate, 100 mM citric acid , pH 5.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K	分辨率 2.60 Å R-free 0.319
3DPQ Crystal structure of the substrate binding domain of E. coli DnaK in complex with a long pyrrhocoricin-derived inhibitor peptide (form B) 提交 2008-07-09	构建体不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 389–601（213 aa）片段：Substrate binding domain (UNP residues 389 to 607)	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5；293 K；2.4 M ammonium sulfate, 100 mM citric acid , pH 5.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K	分辨率 2.60 Å R-free 0.319
3DPQ Crystal structure of the substrate binding domain of E. coli DnaK in complex with a long pyrrhocoricin-derived inhibitor peptide (form B) 提交 2008-07-09	构建体不同结构质量不同	Assembly 4 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 389–601（213 aa）片段：Substrate binding domain (UNP residues 389 to 607)	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5；293 K；2.4 M ammonium sulfate, 100 mM citric acid , pH 5.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K	分辨率 2.60 Å R-free 0.319
3QNJ Crystal structure of the substrate binding domain of E.coli DnaK in complex with the antimicrobial peptide oncocin 提交 2011-02-08	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 389–607（219 aa）片段：UNP residues 389-607	未记录	SO4 SULFATE ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 4；292 K；2.4 M ammonium sulfate, 0.1 M citric acid, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 292K	分辨率 2.28 Å R-free 0.284
3QNJ Crystal structure of the substrate binding domain of E.coli DnaK in complex with the antimicrobial peptide oncocin 提交 2011-02-08	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 389–607（219 aa）片段：UNP residues 389-607	未记录	SO4 SULFATE ION × 4	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 4；292 K；2.4 M ammonium sulfate, 0.1 M citric acid, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 292K	分辨率 2.28 Å R-free 0.284
3QNJ Crystal structure of the substrate binding domain of E.coli DnaK in complex with the antimicrobial peptide oncocin 提交 2011-02-08	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 389–607（219 aa）片段：UNP residues 389-607 链 B 389–607（219 aa）片段：UNP residues 389-607	未记录	SO4 SULFATE ION × 6	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 4；292 K；2.4 M ammonium sulfate, 0.1 M citric acid, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 292K	分辨率 2.28 Å R-free 0.284
4B9Q Open conformation of ATP-bound Hsp70 homolog DnaK 提交 2012-09-06	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–605（605 aa）	突变：YES 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 7.6；291 K；28% PEG4000, 5% GLYCEROL, 0.1 M AMMONIUM ACETATE, 0.085 M SODIUM CITRATE PH 5.6, 5 MM ATP, 10 MM MGCL2, 291 K	分辨率 2.40 Å R-free 0.239
4B9Q Open conformation of ATP-bound Hsp70 homolog DnaK 提交 2012-09-06	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 1–605（605 aa）	突变：YES 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 7.6；291 K；28% PEG4000, 5% GLYCEROL, 0.1 M AMMONIUM ACETATE, 0.085 M SODIUM CITRATE PH 5.6, 5 MM ATP, 10 MM MGCL2, 291 K	分辨率 2.40 Å R-free 0.239
4B9Q Open conformation of ATP-bound Hsp70 homolog DnaK 提交 2012-09-06	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 C 1–605（605 aa）	突变：YES 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 7.6；291 K；28% PEG4000, 5% GLYCEROL, 0.1 M AMMONIUM ACETATE, 0.085 M SODIUM CITRATE PH 5.6, 5 MM ATP, 10 MM MGCL2, 291 K	分辨率 2.40 Å R-free 0.239
4B9Q Open conformation of ATP-bound Hsp70 homolog DnaK 提交 2012-09-06	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 4 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 D 1–605（605 aa）	突变：YES 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 7.6；291 K；28% PEG4000, 5% GLYCEROL, 0.1 M AMMONIUM ACETATE, 0.085 M SODIUM CITRATE PH 5.6, 5 MM ATP, 10 MM MGCL2, 291 K	分辨率 2.40 Å R-free 0.239
4E81 Crystal structure of the substrate binding domain of E.coli DnaK in complex with a short apidaecin peptide 提交 2012-03-19	构建体不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 389–607（219 aa）片段：UNP residues 389-607	未记录	SO4 SULFATE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；292 K；2.7 M ammonium sulfate, 0.1 M MES, pH 6, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 292K	分辨率 1.90 Å R-free 0.259
4E81 Crystal structure of the substrate binding domain of E.coli DnaK in complex with a short apidaecin peptide 提交 2012-03-19	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 389–607（219 aa）片段：UNP residues 389-607	未记录	SO4 SULFATE ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；292 K；2.7 M ammonium sulfate, 0.1 M MES, pH 6, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 292K	分辨率 1.90 Å R-free 0.259
4EZN Crystal structure of the substrate binding domain of E.coli DnaK in complex with pyrrhocoricin 提交 2012-05-03	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 389–607（219 aa）片段：UNP residues 389-607 链 B 389–607（219 aa）片段：UNP residues 389-607	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5；292 K；2.4 M ammonium sulfate, 0.1 M sodium acetate pH 5.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 292K	分辨率 1.80 Å R-free 0.238
4EZN Crystal structure of the substrate binding domain of E.coli DnaK in complex with pyrrhocoricin 提交 2012-05-03	构建体不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 389–607（219 aa）片段：UNP residues 389-607	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5；292 K；2.4 M ammonium sulfate, 0.1 M sodium acetate pH 5.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 292K	分辨率 1.80 Å R-free 0.238
4EZN Crystal structure of the substrate binding domain of E.coli DnaK in complex with pyrrhocoricin 提交 2012-05-03	构建体不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 389–607（219 aa）片段：UNP residues 389-607	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5；292 K；2.4 M ammonium sulfate, 0.1 M sodium acetate pH 5.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 292K	分辨率 1.80 Å R-free 0.238
4EZO Crystal structure of the substrate binding domain of E.coli DnaK in complex with PR-39 (residues 1 to 15) 提交 2012-05-03	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 389–607（219 aa）片段：UNP residues 389-607	未记录	SO4 SULFATE ION × 4	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4；292 K；2.4 M ammonium sulfate, 0.1 M citric acid pH 4.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 292K	分辨率 1.90 Å R-free 0.240
4EZO Crystal structure of the substrate binding domain of E.coli DnaK in complex with PR-39 (residues 1 to 15) 提交 2012-05-03	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 389–607（219 aa）片段：UNP residues 389-607	未记录	SO4 SULFATE ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4；292 K；2.4 M ammonium sulfate, 0.1 M citric acid pH 4.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 292K	分辨率 1.90 Å R-free 0.240
4EZO Crystal structure of the substrate binding domain of E.coli DnaK in complex with PR-39 (residues 1 to 15) 提交 2012-05-03	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 389–607（219 aa）片段：UNP residues 389-607 链 B 389–607（219 aa）片段：UNP residues 389-607	未记录	SO4 SULFATE ION × 6	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4；292 K；2.4 M ammonium sulfate, 0.1 M citric acid pH 4.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 292K	分辨率 1.90 Å R-free 0.240
4EZP Crystal structure of the substrate binding domain of E.coli DnaK in complex with A3-APO(residues 1 to 20) 提交 2012-05-03	构建体不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 389–607（219 aa）片段：UNP residues 389-607	未记录	SO4 SULFATE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5；292 K；2.4 M ammonium sulfate, 0.1 M sodium acetate pH 5.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 292K	分辨率 1.65 Å R-free 0.242
4EZP Crystal structure of the substrate binding domain of E.coli DnaK in complex with A3-APO(residues 1 to 20) 提交 2012-05-03	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 389–607（219 aa）片段：UNP residues 389-607	未记录	SO4 SULFATE ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5；292 K；2.4 M ammonium sulfate, 0.1 M sodium acetate pH 5.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 292K	分辨率 1.65 Å R-free 0.242
4EZP Crystal structure of the substrate binding domain of E.coli DnaK in complex with A3-APO(residues 1 to 20) 提交 2012-05-03	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 389–607（219 aa）片段：UNP residues 389-607 链 B 389–607（219 aa）片段：UNP residues 389-607	未记录	SO4 SULFATE ION × 3	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5；292 K；2.4 M ammonium sulfate, 0.1 M sodium acetate pH 5.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 292K	分辨率 1.65 Å R-free 0.242
4EZP Crystal structure of the substrate binding domain of E.coli DnaK in complex with A3-APO(residues 1 to 20) 提交 2012-05-03	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 4 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 389–607（219 aa）片段：UNP residues 389-607 链 B 389–607（219 aa）片段：UNP residues 389-607	未记录	SO4 SULFATE ION × 3	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5；292 K；2.4 M ammonium sulfate, 0.1 M sodium acetate pH 5.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 292K	分辨率 1.65 Å R-free 0.242
4EZQ Crystal structure of the substrate binding domain of E.coli DnaK in complex with the C-terminal part of pyrrhocoricin (residues 12 to 20) 提交 2012-05-03	构建体不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric	链 A 389–607（219 aa）片段：UNP residues 389-607	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9；292 K；3.2 M ammonium sulfate, 0.1 M bicine pH 9.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 292K	分辨率 2.00 Å R-free 0.321
4EZQ Crystal structure of the substrate binding domain of E.coli DnaK in complex with the C-terminal part of pyrrhocoricin (residues 12 to 20) 提交 2012-05-03	构建体不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 389–607（219 aa）片段：UNP residues 389-607	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9；292 K；3.2 M ammonium sulfate, 0.1 M bicine pH 9.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 292K	分辨率 2.00 Å R-free 0.321
4EZQ Crystal structure of the substrate binding domain of E.coli DnaK in complex with the C-terminal part of pyrrhocoricin (residues 12 to 20) 提交 2012-05-03	构建体不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 389–607（219 aa）片段：UNP residues 389-607	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9；292 K；3.2 M ammonium sulfate, 0.1 M bicine pH 9.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 292K	分辨率 2.00 Å R-free 0.321
4EZQ Crystal structure of the substrate binding domain of E.coli DnaK in complex with the C-terminal part of pyrrhocoricin (residues 12 to 20) 提交 2012-05-03	构建体不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 4 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 389–607（219 aa）片段：UNP residues 389-607	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9；292 K；3.2 M ammonium sulfate, 0.1 M bicine pH 9.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 292K	分辨率 2.00 Å R-free 0.321
4EZR Crystal structure of the substrate binding domain of E.coli DnaK in complex with the C-terminal part of drosocin (residues 12 to 19) 提交 2012-05-03	构建体不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric	链 A 389–607（219 aa）片段：UNP residues 389-607	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9；292 K；3.0 M ammonium sulfate, 0.1 M bicine pH 9.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 292K	分辨率 1.90 Å R-free 0.290
4EZR Crystal structure of the substrate binding domain of E.coli DnaK in complex with the C-terminal part of drosocin (residues 12 to 19) 提交 2012-05-03	构建体不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 389–607（219 aa）片段：UNP residues 389-607	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9；292 K；3.0 M ammonium sulfate, 0.1 M bicine pH 9.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 292K	分辨率 1.90 Å R-free 0.290
4EZR Crystal structure of the substrate binding domain of E.coli DnaK in complex with the C-terminal part of drosocin (residues 12 to 19) 提交 2012-05-03	构建体不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 389–607（219 aa）片段：UNP residues 389-607	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9；292 K；3.0 M ammonium sulfate, 0.1 M bicine pH 9.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 292K	分辨率 1.90 Å R-free 0.290
4EZR Crystal structure of the substrate binding domain of E.coli DnaK in complex with the C-terminal part of drosocin (residues 12 to 19) 提交 2012-05-03	构建体不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 4 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 389–607（219 aa）片段：UNP residues 389-607	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9；292 K；3.0 M ammonium sulfate, 0.1 M bicine pH 9.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 292K	分辨率 1.90 Å R-free 0.290
4EZS Crystal structure of the substrate binding domain of E.coli DnaK in complex with metchnikowin (residues 20 to 26) 提交 2012-05-03	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric	链 A 389–607（219 aa）片段：UNP residues 389-607	未记录	SO4 SULFATE ION × 4	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；292 K；3.2 M ammonium sulfate 0.1 M tris, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 292K	分辨率 1.90 Å R-free 0.256
4EZS Crystal structure of the substrate binding domain of E.coli DnaK in complex with metchnikowin (residues 20 to 26) 提交 2012-05-03	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 389–607（219 aa）片段：UNP residues 389-607	未记录	SO4 SULFATE ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；292 K；3.2 M ammonium sulfate 0.1 M tris, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 292K	分辨率 1.90 Å R-free 0.256
4EZS Crystal structure of the substrate binding domain of E.coli DnaK in complex with metchnikowin (residues 20 to 26) 提交 2012-05-03	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 389–607（219 aa）片段：UNP residues 389-607	未记录	SO4 SULFATE ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；292 K；3.2 M ammonium sulfate 0.1 M tris, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 292K	分辨率 1.90 Å R-free 0.256
4EZS Crystal structure of the substrate binding domain of E.coli DnaK in complex with metchnikowin (residues 20 to 26) 提交 2012-05-03	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 4 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 389–607（219 aa）片段：UNP residues 389-607	未记录	SO4 SULFATE ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；292 K；3.2 M ammonium sulfate 0.1 M tris, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 292K	分辨率 1.90 Å R-free 0.256
4EZS Crystal structure of the substrate binding domain of E.coli DnaK in complex with metchnikowin (residues 20 to 26) 提交 2012-05-03	构建体不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 5 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 389–607（219 aa）片段：UNP residues 389-607	未记录	SO4 SULFATE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；292 K；3.2 M ammonium sulfate 0.1 M tris, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 292K	分辨率 1.90 Å R-free 0.256
4EZT Crystal structure of the substrate binding domain of E.coli DnaK in complex with heliocin (residues 14 to 21) 提交 2012-05-03	构建体不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric	链 A 389–607（219 aa）片段：UNP residues 389-607	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；292 K；3.2 M ammonium sulfate, 0.1 M imidazole pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 292K	分辨率 2.00 Å R-free 0.271
4EZT Crystal structure of the substrate binding domain of E.coli DnaK in complex with heliocin (residues 14 to 21) 提交 2012-05-03	构建体不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 389–607（219 aa）片段：UNP residues 389-607	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；292 K；3.2 M ammonium sulfate, 0.1 M imidazole pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 292K	分辨率 2.00 Å R-free 0.271
4EZT Crystal structure of the substrate binding domain of E.coli DnaK in complex with heliocin (residues 14 to 21) 提交 2012-05-03	构建体不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 389–607（219 aa）片段：UNP residues 389-607	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；292 K；3.2 M ammonium sulfate, 0.1 M imidazole pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 292K	分辨率 2.00 Å R-free 0.271
4EZT Crystal structure of the substrate binding domain of E.coli DnaK in complex with heliocin (residues 14 to 21) 提交 2012-05-03	构建体不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 4 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 389–607（219 aa）片段：UNP residues 389-607	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；292 K；3.2 M ammonium sulfate, 0.1 M imidazole pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 292K	分辨率 2.00 Å R-free 0.271
4EZU Crystal structure of the substrate binding domain of E.coli DnaK in complex with PR-bombesin in space group I222 提交 2012-05-03	构建体不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric	链 A 389–607（219 aa）片段：UNP residues 389-607	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；292 K；3.0 M ammonium sulfate, 0.1 M HEPES pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 292K	分辨率 1.90 Å R-free 0.276
4EZU Crystal structure of the substrate binding domain of E.coli DnaK in complex with PR-bombesin in space group I222 提交 2012-05-03	构建体不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 389–607（219 aa）片段：UNP residues 389-607	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；292 K；3.0 M ammonium sulfate, 0.1 M HEPES pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 292K	分辨率 1.90 Å R-free 0.276
4EZU Crystal structure of the substrate binding domain of E.coli DnaK in complex with PR-bombesin in space group I222 提交 2012-05-03	构建体不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 389–607（219 aa）片段：UNP residues 389-607	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；292 K；3.0 M ammonium sulfate, 0.1 M HEPES pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 292K	分辨率 1.90 Å R-free 0.276
4EZU Crystal structure of the substrate binding domain of E.coli DnaK in complex with PR-bombesin in space group I222 提交 2012-05-03	构建体不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 4 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 389–607（219 aa）片段：UNP residues 389-607	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；292 K；3.0 M ammonium sulfate, 0.1 M HEPES pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 292K	分辨率 1.90 Å R-free 0.276
4EZV Crystal structure of the substrate binding domain of E.coli DnaK in complex with PR-bombesin in space group P21212 提交 2012-05-03	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric	链 A 389–607（219 aa）片段：UNP residues 389-607 链 B 389–607（219 aa）片段：UNP residues 389-607	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；292 K；2.8 M ammonium sulfate, 0.1 M HEPES pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 292K	分辨率 2.10 Å R-free 0.259
4EZV Crystal structure of the substrate binding domain of E.coli DnaK in complex with PR-bombesin in space group P21212 提交 2012-05-03	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 389–607（219 aa）片段：UNP residues 389-607 链 B 389–607（219 aa）片段：UNP residues 389-607	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；292 K；2.8 M ammonium sulfate, 0.1 M HEPES pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 292K	分辨率 2.10 Å R-free 0.259
4EZV Crystal structure of the substrate binding domain of E.coli DnaK in complex with PR-bombesin in space group P21212 提交 2012-05-03	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 389–607（219 aa）片段：UNP residues 389-607 链 B 389–607（219 aa）片段：UNP residues 389-607	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；292 K；2.8 M ammonium sulfate, 0.1 M HEPES pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 292K	分辨率 2.10 Å R-free 0.259
4EZV Crystal structure of the substrate binding domain of E.coli DnaK in complex with PR-bombesin in space group P21212 提交 2012-05-03	构建体不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 4 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 389–607（219 aa）片段：UNP residues 389-607	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；292 K；2.8 M ammonium sulfate, 0.1 M HEPES pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 292K	分辨率 2.10 Å R-free 0.259
4EZV Crystal structure of the substrate binding domain of E.coli DnaK in complex with PR-bombesin in space group P21212 提交 2012-05-03	构建体不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 5 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 389–607（219 aa）片段：UNP residues 389-607	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；292 K；2.8 M ammonium sulfate, 0.1 M HEPES pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 292K	分辨率 2.10 Å R-free 0.259
4EZW Crystal structure of the substrate binding domain of E.coli DnaK in complex with the designer peptide NRLLLTG 提交 2012-05-03	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 389–607（219 aa）片段：UNP residues 389-607	未记录	SO4 SULFATE ION × 4	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.1；292 K；2.4 M ammonium sulfate, 0.1 M citric acid pH 4.1, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 292K	分辨率 1.80 Å R-free 0.226
4EZW Crystal structure of the substrate binding domain of E.coli DnaK in complex with the designer peptide NRLLLTG 提交 2012-05-03	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 389–607（219 aa）片段：UNP residues 389-607	未记录	SO4 SULFATE ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.1；292 K；2.4 M ammonium sulfate, 0.1 M citric acid pH 4.1, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 292K	分辨率 1.80 Å R-free 0.226
4EZW Crystal structure of the substrate binding domain of E.coli DnaK in complex with the designer peptide NRLLLTG 提交 2012-05-03	构建体不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 C 389–607（219 aa）片段：UNP residues 389-607	未记录	SO4 SULFATE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.1；292 K；2.4 M ammonium sulfate, 0.1 M citric acid pH 4.1, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 292K	分辨率 1.80 Å R-free 0.226
4EZW Crystal structure of the substrate binding domain of E.coli DnaK in complex with the designer peptide NRLLLTG 提交 2012-05-03	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 4 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 D 389–607（219 aa）片段：UNP residues 389-607	未记录	SO4 SULFATE ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.1；292 K；2.4 M ammonium sulfate, 0.1 M citric acid pH 4.1, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 292K	分辨率 1.80 Å R-free 0.226
4EZX Crystal structure of the substrate binding domain of E.coli DnaK in complex with the designer peptide NRLMLTG 提交 2012-05-03	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 389–607（219 aa）片段：UNP residues 389-607 链 B 389–607（219 aa）片段：UNP residues 389-607	未记录	SO4 SULFATE ION × 5	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4；292 K；2.1 M ammonium sulfate, 0.1 M citric acid pH 4.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 292K	分辨率 1.70 Å R-free 0.209
4EZX Crystal structure of the substrate binding domain of E.coli DnaK in complex with the designer peptide NRLMLTG 提交 2012-05-03	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 389–607（219 aa）片段：UNP residues 389-607 链 B 389–607（219 aa）片段：UNP residues 389-607	未记录	SO4 SULFATE ION × 5	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4；292 K；2.1 M ammonium sulfate, 0.1 M citric acid pH 4.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 292K	分辨率 1.70 Å R-free 0.209
4EZX Crystal structure of the substrate binding domain of E.coli DnaK in complex with the designer peptide NRLMLTG 提交 2012-05-03	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 389–607（219 aa）片段：UNP residues 389-607	未记录	SO4 SULFATE ION × 5	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4；292 K；2.1 M ammonium sulfate, 0.1 M citric acid pH 4.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 292K	分辨率 1.70 Å R-free 0.209
4EZX Crystal structure of the substrate binding domain of E.coli DnaK in complex with the designer peptide NRLMLTG 提交 2012-05-03	构建体不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 4 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 389–607（219 aa）片段：UNP residues 389-607	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4；292 K；2.1 M ammonium sulfate, 0.1 M citric acid pH 4.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 292K	分辨率 1.70 Å R-free 0.209
4EZY Crystal structure of the substrate binding domain of E.coli DnaK in complex with the designer peptide NRLILTG 提交 2012-05-03	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric	链 A 389–607（219 aa）片段：UNP residues 389-607	未记录	SO4 SULFATE ION × 4	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；292 K；3.1 M ammonium sulfate, 0.1 M MES pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 292K	分辨率 1.85 Å R-free 0.280
4EZY Crystal structure of the substrate binding domain of E.coli DnaK in complex with the designer peptide NRLILTG 提交 2012-05-03	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 389–607（219 aa）片段：UNP residues 389-607	未记录	SO4 SULFATE ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；292 K；3.1 M ammonium sulfate, 0.1 M MES pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 292K	分辨率 1.85 Å R-free 0.280
4EZY Crystal structure of the substrate binding domain of E.coli DnaK in complex with the designer peptide NRLILTG 提交 2012-05-03	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 389–607（219 aa）片段：UNP residues 389-607	未记录	SO4 SULFATE ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；292 K；3.1 M ammonium sulfate, 0.1 M MES pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 292K	分辨率 1.85 Å R-free 0.280
4EZY Crystal structure of the substrate binding domain of E.coli DnaK in complex with the designer peptide NRLILTG 提交 2012-05-03	构建体不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 4 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 389–607（219 aa）片段：UNP residues 389-607	未记录	SO4 SULFATE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；292 K；3.1 M ammonium sulfate, 0.1 M MES pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 292K	分辨率 1.85 Å R-free 0.280
4EZZ Crystal structure of the substrate binding domain of E.coli DnaK in complex with the designer peptide ELPLVKI 提交 2012-05-03	构建体不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric	链 A 389–607（219 aa）片段：UNP residues 389-607	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9；292 K；3.0 M ammonium sulfate, 0.1 M bicine pH 9.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 292K	分辨率 2.05 Å R-free 0.308
4EZZ Crystal structure of the substrate binding domain of E.coli DnaK in complex with the designer peptide ELPLVKI 提交 2012-05-03	构建体不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 389–607（219 aa）片段：UNP residues 389-607	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9；292 K；3.0 M ammonium sulfate, 0.1 M bicine pH 9.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 292K	分辨率 2.05 Å R-free 0.308
4EZZ Crystal structure of the substrate binding domain of E.coli DnaK in complex with the designer peptide ELPLVKI 提交 2012-05-03	构建体不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 389–607（219 aa）片段：UNP residues 389-607	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9；292 K；3.0 M ammonium sulfate, 0.1 M bicine pH 9.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 292K	分辨率 2.05 Å R-free 0.308
4EZZ Crystal structure of the substrate binding domain of E.coli DnaK in complex with the designer peptide ELPLVKI 提交 2012-05-03	构建体不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 4 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 389–607（219 aa）片段：UNP residues 389-607	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9；292 K；3.0 M ammonium sulfate, 0.1 M bicine pH 9.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 292K	分辨率 2.05 Å R-free 0.308
4F00 Crystal structure of the substrate binding domain of E.coli DnaK in complex with an apidaecin fragment from the bumblebee (residues 3 to 11) 提交 2012-05-03	构建体不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric	链 A 389–607（219 aa）片段：UNP residues 389-607	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4；292 K；2.4 M sodium malonate 0.1 M citric acid pH 4.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 292K	分辨率 1.95 Å R-free 0.242
4F00 Crystal structure of the substrate binding domain of E.coli DnaK in complex with an apidaecin fragment from the bumblebee (residues 3 to 11) 提交 2012-05-03	构建体不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 389–607（219 aa）片段：UNP residues 389-607	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4；292 K；2.4 M sodium malonate 0.1 M citric acid pH 4.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 292K	分辨率 1.95 Å R-free 0.242
4F00 Crystal structure of the substrate binding domain of E.coli DnaK in complex with an apidaecin fragment from the bumblebee (residues 3 to 11) 提交 2012-05-03	构建体不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 389–607（219 aa）片段：UNP residues 389-607	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4；292 K；2.4 M sodium malonate 0.1 M citric acid pH 4.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 292K	分辨率 1.95 Å R-free 0.242
4F00 Crystal structure of the substrate binding domain of E.coli DnaK in complex with an apidaecin fragment from the bumblebee (residues 3 to 11) 提交 2012-05-03	构建体不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 4 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 389–607（219 aa）片段：UNP residues 389-607	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4；292 K；2.4 M sodium malonate 0.1 M citric acid pH 4.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 292K	分辨率 1.95 Å R-free 0.242
4F01 Crystal structure of an artificial dimeric DnaK complex 提交 2012-05-03	构建体不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 389–607（219 aa）片段：UNP residues 389-607	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.4；292 K；2.9 M ammonium sulfate 0.1 M MES pH 6.4, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 292K	分辨率 1.40 Å R-free 0.213
4F01 Crystal structure of an artificial dimeric DnaK complex 提交 2012-05-03	构建体不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 389–607（219 aa）片段：UNP residues 389-607	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.4；292 K；2.9 M ammonium sulfate 0.1 M MES pH 6.4, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 292K	分辨率 1.40 Å R-free 0.213
4F01 Crystal structure of an artificial dimeric DnaK complex 提交 2012-05-03	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 389–607（219 aa）片段：UNP residues 389-607 链 B 389–607（219 aa）片段：UNP residues 389-607	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.4；292 K；2.9 M ammonium sulfate 0.1 M MES pH 6.4, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 292K	分辨率 1.40 Å R-free 0.213
4HY9 Crystal structure of the substrate binding domain of E.coli DnaK in complex with pyrrhocoricin_LYZZ (residues 1 to 11) 提交 2012-11-13	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 389–607（219 aa）片段：UNP residues 389-607	未记录	SO4 SULFATE ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.1；292 K；2.2 M ammonium sulfate, 0.1 M citric acid pH 4.1, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 292K	分辨率 1.55 Å R-free 0.241
4HY9 Crystal structure of the substrate binding domain of E.coli DnaK in complex with pyrrhocoricin_LYZZ (residues 1 to 11) 提交 2012-11-13	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 389–607（219 aa）片段：UNP residues 389-607	未记录	SO4 SULFATE ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.1；292 K；2.2 M ammonium sulfate, 0.1 M citric acid pH 4.1, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 292K	分辨率 1.55 Å R-free 0.241
4HYB Crystal structure of the substrate binding domain of E.coli DnaK in complex with pyrrhocoricin_LYZI (residues 1 to 10) 提交 2012-11-13	构建体不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 389–607（219 aa）片段：UNP residues 389-607	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5；292 K；2.4 M ammonium sulfate, 0.1 M sodium acetate pH 5.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 292K	分辨率 1.70 Å R-free 0.244
4HYB Crystal structure of the substrate binding domain of E.coli DnaK in complex with pyrrhocoricin_LYZI (residues 1 to 10) 提交 2012-11-13	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 389–607（219 aa）片段：UNP residues 389-607	未记录	SO4 SULFATE ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5；292 K；2.4 M ammonium sulfate, 0.1 M sodium acetate pH 5.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 292K	分辨率 1.70 Å R-free 0.244
4JN4 Allosteric opening of the polypeptide-binding site when an Hsp70 binds ATP 提交 2013-03-14	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 2–610（609 aa）片段：UNP residues 2-610 链 B 2–610（609 aa）片段：UNP residues 2-610	突变：N432M,Q433G,S434G 突变：N432M,Q433G,S434G	MG MAGNESIUM ION × 2 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 SO4 SULFATE ION × 11 GOL GLYCEROL × 4	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；273 K；1.8-2.0 M ammonium sulfate, 0.1 M Hepes-NaOH, 2-3% PEG 400, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 273K	分辨率 2.30 Å R-free 0.197
4JNE Allosteric opening of the polypeptide-binding site when an Hsp70 binds ATP 提交 2013-03-15	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 2–610（609 aa）片段：UNP RESIDUES 2-610 链 B 2–610（609 aa）片段：UNP RESIDUES 2-610	突变：N432M,Q433G,S434G 突变：N432M,Q433G,S434G	MG MAGNESIUM ION × 2 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 SO4 SULFATE ION × 11 GOL GLYCEROL × 4	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；273 K；1.8-2.0 M ammonium sulfate, 0.1 M Hepes-NaOH, 2-3% PEG 400, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 273K	分辨率 1.96 Å R-free 0.201
4JNF Allosteric opening of the polypeptide-binding site when an Hsp70 binds ATP 提交 2013-03-15	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 389–610（222 aa）片段：Substrate binding domain, unp RESIDUES 389-610	突变：N432M,Q433G,S434G	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；293 K；2.0 M ammonium sulfate, 0.1 M Tris-HCl, pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 1.62 Å R-free 0.216
4JWC Crystal structure of the substrate binding domain of E.coli DnaK in complex with bovine Bac7(1-16) 提交 2013-03-27	构建体不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 389–607（219 aa）片段：uno residues 389-607	未记录	SO4 SULFATE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.4；292 K；2.4 M ammonium sulfate, 0.1 M citric acid, pH 4.4, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 292K	分辨率 1.80 Å R-free 0.225
4JWC Crystal structure of the substrate binding domain of E.coli DnaK in complex with bovine Bac7(1-16) 提交 2013-03-27	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 389–607（219 aa）片段：uno residues 389-607	未记录	SO4 SULFATE ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.4；292 K；2.4 M ammonium sulfate, 0.1 M citric acid, pH 4.4, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 292K	分辨率 1.80 Å R-free 0.225
4JWC Crystal structure of the substrate binding domain of E.coli DnaK in complex with bovine Bac7(1-16) 提交 2013-03-27	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 389–607（219 aa）片段：uno residues 389-607 链 B 389–607（219 aa）片段：uno residues 389-607	未记录	SO4 SULFATE ION × 3	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.4；292 K；2.4 M ammonium sulfate, 0.1 M citric acid, pH 4.4, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 292K	分辨率 1.80 Å R-free 0.225
4JWD Crystal structure of the substrate binding domain of E.coli DnaK in complex with bovine Bac7(15-28) 提交 2013-03-27	构建体不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 389–607（219 aa）片段：unp residues 389-607	未记录	SO4 SULFATE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.4；292 K；2.2 M ammonium sulfate, 0.1 M citric acid pH 4.4, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 292K	分辨率 1.95 Å R-free 0.217
4JWD Crystal structure of the substrate binding domain of E.coli DnaK in complex with bovine Bac7(15-28) 提交 2013-03-27	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 389–607（219 aa）片段：unp residues 389-607	未记录	SO4 SULFATE ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.4；292 K；2.2 M ammonium sulfate, 0.1 M citric acid pH 4.4, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 292K	分辨率 1.95 Å R-free 0.217
4JWE Crystal structure of the substrate binding domain of E.coli DnaK in complex with sheep Bac7(1-21) 提交 2013-03-27	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 389–607（219 aa）片段：unp residues 389-607	未记录	SO4 SULFATE ION × 3	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5；292 K；2.4 M ammonium sulfate, 0.1 M sodium acetate pH 5.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 292K	分辨率 1.95 Å R-free 0.226
4JWE Crystal structure of the substrate binding domain of E.coli DnaK in complex with sheep Bac7(1-21) 提交 2013-03-27	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 389–607（219 aa）片段：unp residues 389-607	未记录	SO4 SULFATE ION × 3	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5；292 K；2.4 M ammonium sulfate, 0.1 M sodium acetate pH 5.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 292K	分辨率 1.95 Å R-free 0.226
4JWE Crystal structure of the substrate binding domain of E.coli DnaK in complex with sheep Bac7(1-21) 提交 2013-03-27	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 389–607（219 aa）片段：unp residues 389-607 链 B 389–607（219 aa）片段：unp residues 389-607	未记录	SO4 SULFATE ION × 6	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5；292 K；2.4 M ammonium sulfate, 0.1 M sodium acetate pH 5.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 292K	分辨率 1.95 Å R-free 0.226
4JWI Crystal structure of the substrate binding domain of E.coli DnaK in complex with sheep Bac7(35-43) 提交 2013-03-27	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 389–607（219 aa）片段：unp residues 389-607	未记录	SO4 SULFATE ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.4；292 K；2.2 M ammonium sulfate, 0.1 M citric acid, pH 4.4, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 292K	分辨率 1.90 Å R-free 0.229
4JWI Crystal structure of the substrate binding domain of E.coli DnaK in complex with sheep Bac7(35-43) 提交 2013-03-27	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 389–607（219 aa）片段：unp residues 389-607	未记录	SO4 SULFATE ION × 3	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.4；292 K；2.2 M ammonium sulfate, 0.1 M citric acid, pH 4.4, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 292K	分辨率 1.90 Å R-free 0.229
4JWI Crystal structure of the substrate binding domain of E.coli DnaK in complex with sheep Bac7(35-43) 提交 2013-03-27	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 389–607（219 aa）片段：unp residues 389-607 链 B 389–607（219 aa）片段：unp residues 389-607	未记录	SO4 SULFATE ION × 5	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.4；292 K；2.2 M ammonium sulfate, 0.1 M citric acid, pH 4.4, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 292K	分辨率 1.90 Å R-free 0.229
4R5G Crystal structure of the DnaK C-terminus with the inhibitor PET-16 提交 2014-08-21	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 389–607（219 aa）片段：C-terminus of DnaK 链 B 389–607（219 aa）片段：C-terminus of DnaK	未记录	3JE triphenyl(phenylethynyl)phosphonium × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；293 K；1.8M ammonium sulfate, 0.1M Bis-Tris pH 5.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293.0K	分辨率 3.45 Å R-free 0.328
4R5G Crystal structure of the DnaK C-terminus with the inhibitor PET-16 提交 2014-08-21	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 389–607（219 aa）片段：C-terminus of DnaK 链 B 389–607（219 aa）片段：C-terminus of DnaK	未记录	3JE triphenyl(phenylethynyl)phosphonium × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；293 K；1.8M ammonium sulfate, 0.1M Bis-Tris pH 5.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293.0K	分辨率 3.45 Å R-free 0.328
4R5I Crystal structure of the DnaK C-terminus with the substrate peptide NRLLLTG 提交 2014-08-21	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 389–607（219 aa）片段：C-terminus of DnaK	未记录	SO4 SULFATE ION × 3 PO4 PHOSPHATE ION × 4	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；293 K；2.2M ammonium sulfate, 0.1M Bis-Tris pH 5.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293.0K	分辨率 1.97 Å R-free 0.218
4R5J Crystal structure of the DnaK C-terminus (Dnak-SBD-A) 提交 2014-08-21	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 389–607（219 aa）片段：C-terminus of DnaK 链 C 389–607（219 aa）片段：C-terminus of DnaK	未记录	CA CALCIUM ION × 3 PO4 PHOSPHATE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；0.15 M potassium bromide, 30% w/v polyethylene glycol monomethyl ether 2000, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293.0K	分辨率 2.36 Å R-free 0.258
4R5J Crystal structure of the DnaK C-terminus (Dnak-SBD-A) 提交 2014-08-21	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 389–607（219 aa）片段：C-terminus of DnaK 链 D 389–607（219 aa）片段：C-terminus of DnaK	未记录	CA CALCIUM ION × 2 PO4 PHOSPHATE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；0.15 M potassium bromide, 30% w/v polyethylene glycol monomethyl ether 2000, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293.0K	分辨率 2.36 Å R-free 0.258
4R5K Crystal structure of the DnaK C-terminus (Dnak-SBD-B) 提交 2014-08-21	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 389–607（219 aa）片段：C-terminus of DnaK 链 B 389–607（219 aa）片段：C-terminus of DnaK	未记录	SO4 SULFATE ION × 4 CA CALCIUM ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；0.15 M potassium bromide, 30% w/v polyethylene glycol monomethyl ether 2000, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293.0K	分辨率 1.75 Å R-free 0.218
4R5L Crystal structure of the DnaK C-terminus (Dnak-SBD-C) 提交 2014-08-21	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 389–607（219 aa）片段：C-terminus of DnaK 链 B 389–607（219 aa）片段：C-terminus of DnaK	未记录	SO4 SULFATE ION × 6 PO4 PHOSPHATE ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；293 K；2.1M ammonium sulfate, 0.1M Bis-Tris pH 5.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293.0K	分辨率 2.97 Å R-free 0.243
4R5L Crystal structure of the DnaK C-terminus (Dnak-SBD-C) 提交 2014-08-21	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 C 389–607（219 aa）片段：C-terminus of DnaK 链 D 389–607（219 aa）片段：C-terminus of DnaK	未记录	SO4 SULFATE ION × 4 PO4 PHOSPHATE ION × 1 CA CALCIUM ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；293 K；2.1M ammonium sulfate, 0.1M Bis-Tris pH 5.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293.0K	分辨率 2.97 Å R-free 0.243
5NRO Structure of full-length DnaK with bound J-domain 提交 2017-04-25	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1–605（605 aa）	突变：E47C, T199A, F529C	ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；9% w/v PEG 8000 0.1M calcium acetate 0.1 M imidazole pH 6.5 protein at 18 mg/ml crystalization drop contained 200 nl protein + 100 nl reservoir solution	分辨率 3.25 Å R-free 0.234
5OOW Crystal structure of lobe II from the nucleotide binding domain of DnaK in complex with AMPPCP 提交 2017-08-09	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 183–383（201 aa）	未记录	ACP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID ADENYLATE ESTER × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；277 K；25% PEG1500, 0.1 M MIB buffer pH 7.0	分辨率 2.90 Å R-free 0.249
5OOW Crystal structure of lobe II from the nucleotide binding domain of DnaK in complex with AMPPCP 提交 2017-08-09	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 183–383（201 aa）	未记录	ACP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID ADENYLATE ESTER × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；277 K；25% PEG1500, 0.1 M MIB buffer pH 7.0	分辨率 2.90 Å R-free 0.249
7JMM Crystal structure of the substrate-binding domain of E. coli DnaK in complex with the peptide RAKNIILLSR 提交 2020-08-02	构建体不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 389–607（219 aa）	未记录	SO4 SULFATE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；293 K；2.4 M (NH4)2SO4, 0.1 M K3PO4	分辨率 2.56 Å R-free 0.327
7JN8 Crystal structure of the substrate-binding domain of E. coli DnaK in complex with the peptide RGNTLVIVSR 提交 2020-08-04	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 389–607（219 aa）	未记录	SO4 SULFATE ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；293 K；2.8 M (NH4)2SO4, 0.1 M K3PO4	分辨率 3.09 Å R-free 0.319
7JN9 Crystal structure of the substrate-binding domain of E. coli DnaK in complex with the peptide QEHTGSQLRIAAYGP 提交 2020-08-04	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 389–607（219 aa）	未记录	SO4 SULFATE ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；293 K；2.4 M (NH4)2SO4, 0.1 M K3PO4	分辨率 2.40 Å R-free 0.286
7JNE Crystal structure of the substrate-binding domain of E. coli DnaK in complex with the peptide RGSQLRIASR 提交 2020-08-04	构建体不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 389–607（219 aa）	未记录	SO4 SULFATE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；293 K；2.4 M (NH4)2SO4, 0.1 M K3PO4	分辨率 2.54 Å R-free 0.334
7N6J Crystal structure of the substrate-binding domain of E. coli DnaK in complex with the peptide RKQSTIALALLPLLFTPRR 提交 2021-06-08	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 389–607（219 aa）	未记录	SO4 SULFATE ION × 4	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；293 K；2.4 M (NH4)2SO4, 0.1 M K3PO4 pH 7.0	分辨率 2.00 Å R-free 0.265
7N6K Crystal structure of the substrate-binding domain of E. coli DnaK in complex with the peptide RALALLPLSR 提交 2021-06-08	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 389–607（219 aa）	未记录	SO4 SULFATE ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.9；293 K；2.6 M (NH4)2SO4, 0.1 M K3PO4	分辨率 2.55 Å R-free 0.306
7N6L Crystal structure of the substrate-binding domain of E. coli DnaK in complex with the peptide EANQQKPLLGLFADG 提交 2021-06-08	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 389–607（219 aa）	未记录	GOL GLYCEROL × 2 SO4 SULFATE ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；293 K；2.8 M (NH4)2SO4, 0.1 M K3PO4	分辨率 2.40 Å R-free 0.332
7N6M Crystal structure of the substrate-binding domain of E. coli DnaK in complex with the peptide RQKPLLGLSR 提交 2021-06-08	构建体不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 389–607（219 aa）	未记录	SO4 SULFATE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；293 K；2.6 M (NH4)2SO4, 0.1 M K3PO4	分辨率 1.82 Å R-free 0.287

共 52 个其他 PDB 条目、124 个 assembly。打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	DNAK_ECOLI
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 1–219； UniProt 389–607 作者链 B； PDB构建体 1–219； UniProt 389–607

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

下载 Download SAXS (.dat) P(r) (.pr.out) CIF

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	3dpp
沉积日期 deposition_date	2008-07-09
结构标题 title	Crystal structure of the substrate binding domain of E. coli DnaK in complex with a long pyrrhocoricin-derived inhibitor peptide (form A)
关键词 keywords	;molecular chaperone, dnaK, Hsp70, substrate-binding domain, pyrrhocoricin inhibitor, ATP-binding, Chaperone, Cytoplasm, DNA replication, Membrane, Nucleotide-binding, Phosphoprotein, Stress response, Peptide Binding Protein ;; Chaperone, Peptide Binding Protein
实验方法 method	X-RAY DIFFRACTION

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3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

回转半径 Rg (Guinier) rg_guinier	25.80 Å
回转半径 Rg (电子) rg_electron	25.22 Å
零角强度 I(0) i0	41120200.00
分子量 molecular_weight	48030.0 kDa
排除体积 excluded_volume	59729 Å³
包络体积 envelope_volume	77769 Å³
水化壳体积 shell_volume	26734 Å³
包络直径 envelope_diameter	86.6 Å
壳层 Rg shell_rg	31.19 Å
包络 Rg envelope_rg	25.29 Å
形状 Rg shape_rg	25.21 Å
总 Rg total_rg	25.92 Å
总原子数 total_atoms	3368
残基数 n_residues	446
球谐函数阶数 n_harmonics	20
q 范围 q_range	— – 0.5000 Å⁻¹
数据点数 n_points	101
壳层类型 shell_type	directional
溶剂电子密度 solvent_density	0.3340 e/Å³
壳层衬度 contrast_shell	0.0300 e/Å³
CRYSOL 版本 crysol_version	4.1.3

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4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

最大尺寸 Dmax dmax	83.2 Å
Rg (实空间) rg_real	25.78 Å
Rg 误差 (实空间) rg_real_error	0.55 Å
I(0) (实空间) i0_real	4.1120e+07
I(0) 误差 (实空间) i0_real_error	5.7870e+05
Rg (倒空间) rg_reciprocal	25.79 Å
I(0) (倒空间) i0_reciprocal	41120000.0000
解质量估计 total_estimate	0.8992
解质量评级 solution_quality	GOOD a GOOD solution
P(r) 峰数 n_peaks	2
主峰位置 r_peak_primary	30.9 Å
偏度 Skewness skewness	0.314
峰度 Kurtosis kurtosis	-0.362
角度范围 angular_range	— – 0.3100 Å⁻¹
当前正则化参数 α current_alpha	0.0000
最高正则化参数 α highest_alpha	5651000.0000
实空间数据点数 n_real_points	63
GNOM 版本 gnom_version	4.1.3
质量判据 quality_criteria	AN1: 0.000; Oscil: 0.917; Stabil: 1.000; Sysdev: 1.000; Positv: 1.000; Valcen: 0.998; Smooth: 0.939

▶

5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

▶

6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (4)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	Chaperone protein dnaK
分子量 formula_weight	23820.8 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A,B
原子数 atom_count	3748

VLLLDVTPLSLGIETMGGVMTTLIAKNTTIPTKHSQVFSTAEDNQSAVTIHVLQGERKRAADNKSLGQFNLDGINPAPRGMPQIEVTFDIDADGILHVSAKDKNSGKEQKITIKASSGLNEDEIQKMVRDAEANAEADRKFEELVQTRNQGDHLLHSTRKQVEEAGDKLPADDKTAIESALTALETALKGEDKAAIEAKMQELAQVSQKLMEIAQQQHA

来源 Source

来源生物 organism	Escherichia coli
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	83333
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

实体 2 Entity 2 polymer

描述 description	inhibitor peptide
分子量 formula_weight	2466.9 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	C,D

VDKLYALPRPTPPRPIYNRN

实体 3 Entity 3 non-polymer

描述 description	SULFATE ION
分子量 formula_weight	96.1 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	1

实体 4 Entity 4 water

描述 description	water
分子量 formula_weight	18.0 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	309

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7. 折叠分类 (SCOP + CATH) 4 domains

CATH v4.4 (4 domains)

结构域编号 domain_id	3dppA01
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	60 — Sandwich
拓扑 Topology topology	34 — Substrate Binding Domain Of DNAk; Chain A, domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Substrate Binding Domain Of DNAk; Chain A, domain 1

结构域编号 domain_id	3dppA02
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	20 — Up-down Bundle
拓扑 Topology topology	1270 — Substrate Binding Domain Of Dnak; Chain:A; Domain 2
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 —

结构域编号 domain_id	3dppB01
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	60 — Sandwich
拓扑 Topology topology	34 — Substrate Binding Domain Of DNAk; Chain A, domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Substrate Binding Domain Of DNAk; Chain A, domain 1

结构域编号 domain_id	3dppB02
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	20 — Up-down Bundle
拓扑 Topology topology	1270 — Substrate Binding Domain Of Dnak; Chain:A; Domain 2
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 —

▶

8. 引用文献 (1)

▶

晶胞边长 a length_a	77.870 Å
晶胞边长 b length_b	159.120 Å
晶胞边长 c length_c	44.790 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	90.00 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	90.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	8

空间群 space_group	P 21 21 2
空间群编号 int_tables_number	18
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	2.500 Å
最低分辨率 resolution_low	15.000 Å
R 因子 r_factor	0.2410
R_work r_work	0.2370
R_free r_free	0.3160

fit	/app/data/saxs_computation/dp/3dpp/3dpp.fit
pddf	/app/data/pr_computation/dp/3dpp/3dpp.pr.out
profile	/app/data/saxs_computation/dp/3dpp/3dpp.dat

Crystal structure of the substrate binding domain of E. coli DnaK in complex with a long pyrrhocoricin-derived inhibitor peptide (form A)

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Chaperone protein dnaK

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (4)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

实体 3 Entity 3 non-polymer

实体 4 Entity 4 water

7. 折叠分类 (SCOP + CATH) 4 domains

CATH v4.4 (4 domains)

8. 引用文献 (1)

9. 文件与曲线 (10)

Files (7)

Curves (3)