3gxe

Complex of a Low Affinity Collagen Site with the Fibronectin 8-9FnI Domain Pair

Method: X-RAY DIFFRACTION
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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Fibronectin

Homo sapiens

UniProt P02751

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 2 Collagen alpha-1(I) chain × 1 (P02452) 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 water × 2 与蛋白数一致
2 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 2 Collagen alpha-1(I) chain × 1 (P02452) 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 GLYCEROL × 1 water × 2 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 FINC_HUMAN
Isoform —
PDB实体 1
链与序列区间 作者链 A; PDB构建体 1–93; UniProt 516–608 作者链 B; PDB构建体 1–93; UniProt 516–608

Collagen alpha-1(I) chain

物种未注明

UniProt P02452

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 2 Fibronectin × 1 (P02751) 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 water × 2 与蛋白数一致
2 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 2 Fibronectin × 1 (P02751) 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 GLYCEROL × 1 water × 2 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 CO1A1_HUMAN
Isoform —
PDB实体 2, 3
链与序列区间 作者链 F; PDB构建体 1–22; UniProt 254–275 作者链 E; PDB构建体 1–22; UniProt 254–275

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中;数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护,因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id3gxe
沉积日期 deposition_date2009-04-02
结构标题 titleComplex of a Low Affinity Collagen Site with the Fibronectin 8-9FnI Domain Pair
关键词 keywordsprotein-peptide complex, CELL ADHESION; CELL ADHESION
实验方法 methodX-RAY DIFFRACTION
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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

3gxe__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

3gxe__assembly_1__model_1 | I(q)

10-2 10-1 105 106 q (1/Angstrom) I(q)
100 个绘图点;横轴和纵轴均采用对数尺度。

3gxe__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

新版 assembly/model P(r) 尚未计算 此处仅保留位置,不展示旧数据 r (Angstrom) P(r)
P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。
Rg(Guinier)17.86 Å
Rg(电子密度)17.62 Å
总 Rg18.20 Å
原子数825
残基数99
排除体积14268 ų
最大 q0.500 Å⁻¹
Assembly Model 结构单元 聚集说明 状态 CRYSOL 操作
1 1 3gxe__assembly_1__model_1 dimeric (2) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
2 1 3gxe__assembly_2__model_1 dimeric (2) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (6)

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6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 4 domains

CATH v4.4 (4 domains)

结构域编号 domain_id3gxeA01
类 Class class2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture10 — Ribbon
拓扑 Topology topology70 — Complement Module; domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — Complement Module, domain 1
结构域编号 domain_id3gxeA02
类 Class class2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture10 — Ribbon
拓扑 Topology topology70 — Complement Module; domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — Complement Module, domain 1
结构域编号 domain_id3gxeB01
类 Class class2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture10 — Ribbon
拓扑 Topology topology70 — Complement Module; domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — Complement Module, domain 1
结构域编号 domain_id3gxeB02
类 Class class2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture10 — Ribbon
拓扑 Topology topology70 — Complement Module; domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — Complement Module, domain 1
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7. 引用文献 (1)