3h0g

RNA Polymerase II from Schizosaccharomyces pombe

Method: X-RAY DIFFRACTION

▼

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

DNA-directed RNA polymerase II subunit rpb1

物种未注明

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 12	DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB2 × 1 （Q02061） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB3 × 1 （P37382） DNA-directed RNA polymerase II subunit rpb4 × 1 （O74825） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC1 × 1 （Q09191） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC2 × 1 （P36595） DNA-directed RNA polymerase II subunit rpb7 × 1 （O14459） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC3 × 1 （Q92399） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB9 × 1 （O74635） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC5 × 1 （O13877） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB11 × 1 （P87123） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC4 × 1 （P48011） ZINC ION × 8 MAGNESIUM ION × 1	与蛋白数一致
2	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 12	DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB2 × 1 （Q02061） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB3 × 1 （P37382） DNA-directed RNA polymerase II subunit rpb4 × 1 （O74825） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC1 × 1 （Q09191） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC2 × 1 （P36595） DNA-directed RNA polymerase II subunit rpb7 × 1 （O14459） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC3 × 1 （Q92399） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB9 × 1 （O74635） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC5 × 1 （O13877） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB11 × 1 （P87123） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC4 × 1 （P48011） ZINC ION × 8 MAGNESIUM ION × 1	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	RPB1_SCHPO
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 1–1752； UniProt 1–1752 作者链 M； PDB构建体 1–1752； UniProt 1–1752

DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB2

物种未注明

UniProt Q02061

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 12	DNA-directed RNA polymerase II subunit rpb1 × 1 （P36594） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB3 × 1 （P37382） DNA-directed RNA polymerase II subunit rpb4 × 1 （O74825） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC1 × 1 （Q09191） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC2 × 1 （P36595） DNA-directed RNA polymerase II subunit rpb7 × 1 （O14459） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC3 × 1 （Q92399） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB9 × 1 （O74635） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC5 × 1 （O13877） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB11 × 1 （P87123） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC4 × 1 （P48011） ZINC ION × 8 MAGNESIUM ION × 1	与蛋白数一致
2	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 12	DNA-directed RNA polymerase II subunit rpb1 × 1 （P36594） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB3 × 1 （P37382） DNA-directed RNA polymerase II subunit rpb4 × 1 （O74825） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC1 × 1 （Q09191） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC2 × 1 （P36595） DNA-directed RNA polymerase II subunit rpb7 × 1 （O14459） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC3 × 1 （Q92399） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB9 × 1 （O74635） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC5 × 1 （O13877） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB11 × 1 （P87123） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC4 × 1 （P48011） ZINC ION × 8 MAGNESIUM ION × 1	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	RPB2_SCHPO
Isoform	—
PDB实体	2
链与序列区间	作者链 B； PDB构建体 1–1210； UniProt 1–1210 作者链 N； PDB构建体 1–1210； UniProt 1–1210

DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB3

物种未注明

UniProt P37382

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 12	DNA-directed RNA polymerase II subunit rpb1 × 1 （P36594） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB2 × 1 （Q02061） DNA-directed RNA polymerase II subunit rpb4 × 1 （O74825） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC1 × 1 （Q09191） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC2 × 1 （P36595） DNA-directed RNA polymerase II subunit rpb7 × 1 （O14459） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC3 × 1 （Q92399） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB9 × 1 （O74635） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC5 × 1 （O13877） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB11 × 1 （P87123） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC4 × 1 （P48011） ZINC ION × 8 MAGNESIUM ION × 1	与蛋白数一致
2	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 12	DNA-directed RNA polymerase II subunit rpb1 × 1 （P36594） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB2 × 1 （Q02061） DNA-directed RNA polymerase II subunit rpb4 × 1 （O74825） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC1 × 1 （Q09191） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC2 × 1 （P36595） DNA-directed RNA polymerase II subunit rpb7 × 1 （O14459） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC3 × 1 （Q92399） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB9 × 1 （O74635） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC5 × 1 （O13877） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB11 × 1 （P87123） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC4 × 1 （P48011） ZINC ION × 8 MAGNESIUM ION × 1	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	RPB3_SCHPO
Isoform	—
PDB实体	3
链与序列区间	作者链 C； PDB构建体 1–297； UniProt 1–297 作者链 O； PDB构建体 1–297； UniProt 1–297

DNA-directed RNA polymerase II subunit rpb4

物种未注明

UniProt O74825

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 12	DNA-directed RNA polymerase II subunit rpb1 × 1 （P36594） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB2 × 1 （Q02061） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB3 × 1 （P37382） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC1 × 1 （Q09191） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC2 × 1 （P36595） DNA-directed RNA polymerase II subunit rpb7 × 1 （O14459） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC3 × 1 （Q92399） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB9 × 1 （O74635） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC5 × 1 （O13877） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB11 × 1 （P87123） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC4 × 1 （P48011） ZINC ION × 8 MAGNESIUM ION × 1	与蛋白数一致
2	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 12	DNA-directed RNA polymerase II subunit rpb1 × 1 （P36594） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB2 × 1 （Q02061） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB3 × 1 （P37382） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC1 × 1 （Q09191） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC2 × 1 （P36595） DNA-directed RNA polymerase II subunit rpb7 × 1 （O14459） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC3 × 1 （Q92399） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB9 × 1 （O74635） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC5 × 1 （O13877） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB11 × 1 （P87123） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC4 × 1 （P48011） ZINC ION × 8 MAGNESIUM ION × 1	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	RPB4_SCHPO
Isoform	—
PDB实体	4
链与序列区间	作者链 D； PDB构建体 1–135； UniProt 1–135 作者链 P； PDB构建体 1–135； UniProt 1–135

DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC1

物种未注明

UniProt Q09191

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 12	DNA-directed RNA polymerase II subunit rpb1 × 1 （P36594） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB2 × 1 （Q02061） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB3 × 1 （P37382） DNA-directed RNA polymerase II subunit rpb4 × 1 （O74825） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC2 × 1 （P36595） DNA-directed RNA polymerase II subunit rpb7 × 1 （O14459） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC3 × 1 （Q92399） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB9 × 1 （O74635） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC5 × 1 （O13877） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB11 × 1 （P87123） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC4 × 1 （P48011） ZINC ION × 8 MAGNESIUM ION × 1	与蛋白数一致
2	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 12	DNA-directed RNA polymerase II subunit rpb1 × 1 （P36594） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB2 × 1 （Q02061） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB3 × 1 （P37382） DNA-directed RNA polymerase II subunit rpb4 × 1 （O74825） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC2 × 1 （P36595） DNA-directed RNA polymerase II subunit rpb7 × 1 （O14459） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC3 × 1 （Q92399） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB9 × 1 （O74635） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC5 × 1 （O13877） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB11 × 1 （P87123） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC4 × 1 （P48011） ZINC ION × 8 MAGNESIUM ION × 1	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	RPAB1_SCHPO
Isoform	—
PDB实体	5
链与序列区间	作者链 E； PDB构建体 1–210； UniProt 1–210 作者链 Q； PDB构建体 1–210； UniProt 1–210

DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC2

物种未注明

UniProt P36595

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 12	DNA-directed RNA polymerase II subunit rpb1 × 1 （P36594） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB2 × 1 （Q02061） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB3 × 1 （P37382） DNA-directed RNA polymerase II subunit rpb4 × 1 （O74825） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC1 × 1 （Q09191） DNA-directed RNA polymerase II subunit rpb7 × 1 （O14459） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC3 × 1 （Q92399） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB9 × 1 （O74635） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC5 × 1 （O13877） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB11 × 1 （P87123） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC4 × 1 （P48011） ZINC ION × 8 MAGNESIUM ION × 1	与蛋白数一致
2	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 12	DNA-directed RNA polymerase II subunit rpb1 × 1 （P36594） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB2 × 1 （Q02061） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB3 × 1 （P37382） DNA-directed RNA polymerase II subunit rpb4 × 1 （O74825） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC1 × 1 （Q09191） DNA-directed RNA polymerase II subunit rpb7 × 1 （O14459） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC3 × 1 （Q92399） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB9 × 1 （O74635） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC5 × 1 （O13877） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB11 × 1 （P87123） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC4 × 1 （P48011） ZINC ION × 8 MAGNESIUM ION × 1	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	RPAB2_SCHPO
Isoform	—
PDB实体	6
链与序列区间	作者链 F； PDB构建体 1–142； UniProt 1–142 作者链 R； PDB构建体 1–142； UniProt 1–142

DNA-directed RNA polymerase II subunit rpb7

物种未注明

UniProt O14459

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 12	DNA-directed RNA polymerase II subunit rpb1 × 1 （P36594） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB2 × 1 （Q02061） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB3 × 1 （P37382） DNA-directed RNA polymerase II subunit rpb4 × 1 （O74825） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC1 × 1 （Q09191） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC2 × 1 （P36595） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC3 × 1 （Q92399） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB9 × 1 （O74635） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC5 × 1 （O13877） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB11 × 1 （P87123） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC4 × 1 （P48011） ZINC ION × 8 MAGNESIUM ION × 1	与蛋白数一致
2	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 12	DNA-directed RNA polymerase II subunit rpb1 × 1 （P36594） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB2 × 1 （Q02061） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB3 × 1 （P37382） DNA-directed RNA polymerase II subunit rpb4 × 1 （O74825） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC1 × 1 （Q09191） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC2 × 1 （P36595） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC3 × 1 （Q92399） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB9 × 1 （O74635） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC5 × 1 （O13877） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB11 × 1 （P87123） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC4 × 1 （P48011） ZINC ION × 8 MAGNESIUM ION × 1	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	RPB7_SCHPO
Isoform	—
PDB实体	7
链与序列区间	作者链 G； PDB构建体 1–172； UniProt 1–172 作者链 S； PDB构建体 1–172； UniProt 1–172

DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC3

物种未注明

UniProt Q92399

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 12	DNA-directed RNA polymerase II subunit rpb1 × 1 （P36594） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB2 × 1 （Q02061） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB3 × 1 （P37382） DNA-directed RNA polymerase II subunit rpb4 × 1 （O74825） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC1 × 1 （Q09191） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC2 × 1 （P36595） DNA-directed RNA polymerase II subunit rpb7 × 1 （O14459） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB9 × 1 （O74635） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC5 × 1 （O13877） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB11 × 1 （P87123） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC4 × 1 （P48011） ZINC ION × 8 MAGNESIUM ION × 1	与蛋白数一致
2	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 12	DNA-directed RNA polymerase II subunit rpb1 × 1 （P36594） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB2 × 1 （Q02061） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB3 × 1 （P37382） DNA-directed RNA polymerase II subunit rpb4 × 1 （O74825） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC1 × 1 （Q09191） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC2 × 1 （P36595） DNA-directed RNA polymerase II subunit rpb7 × 1 （O14459） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB9 × 1 （O74635） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC5 × 1 （O13877） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB11 × 1 （P87123） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC4 × 1 （P48011） ZINC ION × 8 MAGNESIUM ION × 1	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	RPAB3_SCHPO
Isoform	—
PDB实体	8
链与序列区间	作者链 H； PDB构建体 1–125； UniProt 1–125 作者链 T； PDB构建体 1–125； UniProt 1–125

DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB9

物种未注明

UniProt O74635

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 12	DNA-directed RNA polymerase II subunit rpb1 × 1 （P36594） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB2 × 1 （Q02061） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB3 × 1 （P37382） DNA-directed RNA polymerase II subunit rpb4 × 1 （O74825） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC1 × 1 （Q09191） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC2 × 1 （P36595） DNA-directed RNA polymerase II subunit rpb7 × 1 （O14459） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC3 × 1 （Q92399） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC5 × 1 （O13877） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB11 × 1 （P87123） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC4 × 1 （P48011） ZINC ION × 8 MAGNESIUM ION × 1	与蛋白数一致
2	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 12	DNA-directed RNA polymerase II subunit rpb1 × 1 （P36594） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB2 × 1 （Q02061） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB3 × 1 （P37382） DNA-directed RNA polymerase II subunit rpb4 × 1 （O74825） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC1 × 1 （Q09191） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC2 × 1 （P36595） DNA-directed RNA polymerase II subunit rpb7 × 1 （O14459） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC3 × 1 （Q92399） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC5 × 1 （O13877） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB11 × 1 （P87123） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC4 × 1 （P48011） ZINC ION × 8 MAGNESIUM ION × 1	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	RPB9_SCHPO
Isoform	—
PDB实体	9
链与序列区间	作者链 I； PDB构建体 1–113； UniProt 1–113 作者链 U； PDB构建体 1–113； UniProt 1–113

DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC5

物种未注明

UniProt O13877

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 12	DNA-directed RNA polymerase II subunit rpb1 × 1 （P36594） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB2 × 1 （Q02061） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB3 × 1 （P37382） DNA-directed RNA polymerase II subunit rpb4 × 1 （O74825） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC1 × 1 （Q09191） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC2 × 1 （P36595） DNA-directed RNA polymerase II subunit rpb7 × 1 （O14459） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC3 × 1 （Q92399） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB9 × 1 （O74635） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB11 × 1 （P87123） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC4 × 1 （P48011） ZINC ION × 8 MAGNESIUM ION × 1	与蛋白数一致
2	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 12	DNA-directed RNA polymerase II subunit rpb1 × 1 （P36594） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB2 × 1 （Q02061） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB3 × 1 （P37382） DNA-directed RNA polymerase II subunit rpb4 × 1 （O74825） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC1 × 1 （Q09191） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC2 × 1 （P36595） DNA-directed RNA polymerase II subunit rpb7 × 1 （O14459） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC3 × 1 （Q92399） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB9 × 1 （O74635） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB11 × 1 （P87123） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC4 × 1 （P48011） ZINC ION × 8 MAGNESIUM ION × 1	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	RPAB5_SCHPO
Isoform	—
PDB实体	10
链与序列区间	作者链 J； PDB构建体 1–71； UniProt 1–71 作者链 V； PDB构建体 1–71； UniProt 1–71

DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB11

物种未注明

UniProt P87123

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 12	DNA-directed RNA polymerase II subunit rpb1 × 1 （P36594） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB2 × 1 （Q02061） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB3 × 1 （P37382） DNA-directed RNA polymerase II subunit rpb4 × 1 （O74825） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC1 × 1 （Q09191） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC2 × 1 （P36595） DNA-directed RNA polymerase II subunit rpb7 × 1 （O14459） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC3 × 1 （Q92399） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB9 × 1 （O74635） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC5 × 1 （O13877） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC4 × 1 （P48011） ZINC ION × 8 MAGNESIUM ION × 1	与蛋白数一致
2	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 12	DNA-directed RNA polymerase II subunit rpb1 × 1 （P36594） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB2 × 1 （Q02061） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB3 × 1 （P37382） DNA-directed RNA polymerase II subunit rpb4 × 1 （O74825） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC1 × 1 （Q09191） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC2 × 1 （P36595） DNA-directed RNA polymerase II subunit rpb7 × 1 （O14459） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC3 × 1 （Q92399） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB9 × 1 （O74635） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC5 × 1 （O13877） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC4 × 1 （P48011） ZINC ION × 8 MAGNESIUM ION × 1	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	RPB11_SCHPO
Isoform	—
PDB实体	11
链与序列区间	作者链 K； PDB构建体 1–123； UniProt 1–123 作者链 W； PDB构建体 1–123； UniProt 1–123

DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC4

物种未注明

UniProt P48011

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 12	DNA-directed RNA polymerase II subunit rpb1 × 1 （P36594） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB2 × 1 （Q02061） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB3 × 1 （P37382） DNA-directed RNA polymerase II subunit rpb4 × 1 （O74825） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC1 × 1 （Q09191） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC2 × 1 （P36595） DNA-directed RNA polymerase II subunit rpb7 × 1 （O14459） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC3 × 1 （Q92399） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB9 × 1 （O74635） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC5 × 1 （O13877） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB11 × 1 （P87123） ZINC ION × 8 MAGNESIUM ION × 1	与蛋白数一致
2	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 12	DNA-directed RNA polymerase II subunit rpb1 × 1 （P36594） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB2 × 1 （Q02061） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB3 × 1 （P37382） DNA-directed RNA polymerase II subunit rpb4 × 1 （O74825） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC1 × 1 （Q09191） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC2 × 1 （P36595） DNA-directed RNA polymerase II subunit rpb7 × 1 （O14459） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC3 × 1 （Q92399） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB9 × 1 （O74635） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC5 × 1 （O13877） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB11 × 1 （P87123） ZINC ION × 8 MAGNESIUM ION × 1	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	RPAB4_SCHPO
Isoform	—
PDB实体	12
链与序列区间	作者链 L； PDB构建体 1–63； UniProt 1–63 作者链 X； PDB构建体 1–63； UniProt 1–63

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	3h0g
沉积日期 deposition_date	2009-04-09
结构标题 title	RNA Polymerase II from Schizosaccharomyces pombe
关键词 keywords	;Transcription, Multi-protein complex, Polymerase, DNA-binding, DNA-directed RNA polymerase, Magnesium, Metal-binding, Nucleotidyltransferase, Nucleus, Phosphoprotein, Transferase, Zinc-finger ;; TRANSCRIPTION
实验方法 method	X-RAY DIFFRACTION

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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

3h0g__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

3h0g__assembly_1__model_1 | I(q)

100 个绘图点；横轴和纵轴均采用对数尺度。

3h0g__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。

Rg（Guinier）	52.05 Å
Rg（电子密度）	51.45 Å
总 Rg	51.67 Å
原子数	31503
残基数	3962
排除体积	560680 Å³
最大 q	0.500 Å⁻¹

Assembly	Model	结构单元	聚集说明	状态	CRYSOL	操作
1	1	`3h0g__assembly_1__model_1`	dodecameric （12）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
2	1	`3h0g__assembly_2__model_1`	dodecameric （12）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载

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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (14)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	DNA-directed RNA polymerase II subunit rpb1
分子量 formula_weight	194372.6 kDa
EC 编号 ec_number	2.7.7.6
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A,M
原子数 atom_count	62870

MSGIQFSPSSVPLRRVEEVQFGILSPEEIRSMSVAKIEFPETMDESGQRPRVGGLLDPRLGTIDRQFKCQTCGETMADCPGHFGHIELAKPVFHIGFLSKIKKILECVCWNCGKLKIDSSNPKFNDTQRYRDPKNRLNAVWNVCKTKMVCDTGLSAGSDNFDLSNPSANMGHGGCGAAQPTIRKDGLRLWGSWKRGKDESDLPEKRLLSPLEVHTIFTHISSEDLAHLGLNEQYARPDWMIITVLPVPPPSVRPSISVDGTSRGEDDLTHKLSDIIKANANVRRCEQEGAPAHIVSEYEQLLQFHVATYMDNEIAGQPQALQKSGRPLKSIRARLKGKEGRLRGNLMGKRVDFSARTVITGDPNLSLDELGVPRSIAKTLTYPETVTPYNIYQLQELVRNGPDEHPGAKYIIRDTGERIDLRYHKRAGDIPLRYGWRVERHIRDGDVVIFNRQPSLHKMSMMGHRIRVMPYSTFRLNLSVTSPYNADFDGDEMNMHVPQSEETRAEIQEITMVPKQIVSPQSNKPVMGIVQDTLAGVRKFSLRDNFLTRNAVMNIMLWVPDWDGILPPPVILKPKVLWTGKQILSLIIPKGINLIRDDDKQSLSNPTDSGMLIENGEIIYGVVDKKTVGASQGGLVHTIWKEKGPEICKGFFNGIQRVVNYWLLHNGFSIGIGDTIADADTMKEVTRTVKEARRQVAECIQDAQHNRLKPEPGMTLRESFEAKVSRILNQARDNAGRSAEHSLKDSNNVKQMVAAGSKGSFINISQMSACVGQQIVEGKRIPFGFKYRTLPHFPKDDDSPESRGFIENSYLRGLTPQEFFFHAMAGREGLIDTAVKTAETGYIQRRLVKAMEDVMVRYDGTVRNAMGDIIQFAYGEDGLDATLVEYQVFDSLRLSTKQFEKKYRIDLMEDRSLSLYMENSIENDSSVQDLLDEEYTQLVADRELLCKFIFPKGDARWPLPVNVQRIIQNALQIFHLEAKKPTDLLPSDIINGLNELIAKLTIFRGSDRITRDVQNNATLLFQILLRSKFAVKRVIMEYRLNKVAFEWIMGEVEARFQQAVVSPGEMVGTLAAQSIGEPATQMTLNTFHYAGVSSKNVTLGVPRLKEILNVAKNIKTPSLTIYLMPWIAANMDLAKNVQTQIEHTTLSTVTSATEIHYDPDPQDTVIEEDKDFVEAFFAIPDEEVEENLYKQSPWLLRLELDRAKMLDKKLSMSDVAGKIAESFERDLFTIWSEDNADKLIIRCRIIRDDDRKAEDDDNMIEEDVFLKTIEGHMLESISLRGVPNITRVYMMEHKIVRQIEDGTFERADEWVLETDGINLTEAMTVEGVDATRTYSNSFVEILQILGIEATRSALLKELRNVIEFDGSYVNYRHLALLCDVMTSRGHLMAITRHGINRAETGALMRCSFEETVEILMDAAASGEKDDCKGISENIMLGQLAPMGTGAFDIYLDQDMLMNYSLGTAVPTLAGSGMGTSQLPEGAGTPYERSPMVDSGFVGSPDAAAFSPLVQGGSEGREGFGDYGLLGAASPYKGVQSPGYTSPFSSAMSPGYGLTSPSYSPSSPGYSTSPAYMPSSPSYSPTSPSYSPTSPSYSPTSPSYSPTSPSYSATSPSYSPTSPSYSPTSPSYSPTSPSYSPTSPSYSPTSPSYSPTSPSYSPTSPSYSPTSPSYSPTSPSYSPTSPSYSPTSPSYSPTSPSYSPTSPSYSPTSPSYSPTSPSYSPTSPSYSPTSPSYSPTSPSYSPTSPSYSPTSPS

实体 2 Entity 2 polymer

描述 description	DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB2
分子量 formula_weight	138027.2 kDa
EC 编号 ec_number	2.7.7.6
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	B,N

MSYEDYQYNETLTQEDCWTVISSFFEETSLARQQLFSFDEFVQNTMQEIVDDDSTLTLDQYAQHTGAQGDVTRRYEINFGQIYLSRPTMTEADGSTTTMFPQEARLRNLTYSSPLYVDMRKKVMVAADSNVPIGEEEWLVEEEDEEPSKVFIGKIPIMLRSTFCILNGVSDSELYDLNECPYDQGGYFIINGSEKVIIAQERSAANIVQVFKKAAPSPIAYVAEIRSALERGSRLISSMQIKLMARNTENSGQTIRATLPYIRSDIPIVIVFRALGVVPDRDILEHICYDPNDFQMLEMMKPCIEEAFVIQDKDIALDYIGKRGSTTGVTREKRLRYAHDILQKELLPHITTMEGFETRKAFFLGYMIHRMLLCALERREPDDRDHFGKKRLDLAGPLLASLFRMLFRKMTRDVYKYMQKCVETNREFNLTLAVKSNIITNGLRYSLATGNWGDQKRSMVNRVGVSQVLNRYTFASTLSHLRRTNTPIGRDGKLAKPRQLHNTHWGMVCPAETPEGQACGLVKNLSLMSYVSVGSPSAPIIEFLEEWGLETLEDYNPSASPNATKVFVNGVWLGVHRDPAHLTETLRSLRRRLDISAEVSIVRDIREKELRLFTDAGRICRPLFIVDNNPNSERRGELCIRKEHIQQLIEDKDRYDIDPEQRFGWTALVSSGLIEYLDAEEEETVMIAMSPEDLEASRQMQAGYEVKEELDPAQRVKPAPNPHVHAWTHCEIHPAMILGILASIIPFPDHNQSPRNTYQSAMGKQAMGVYLTNYQVRMDTMANILYYPQKPLATTRSMEYLKFRELPAGQNAIVAILCYSGYNQEDSIIMNQASIDRGLFRSIFYRTYTDQEKKIGMTVMEEFERPVRSTTLRMKHGTYDKLEDDGLIAPGTRVSGEDIIIGKTAPIPLDHEELGQRTQLHAKRDVSTPLRSTESGIVDQVMVTTNQEGLKFVKVRMRSTRIPQIGDKFASRHGQKGTIGMTYRHEDMPFSAQGIVPDIIINPHAIPSRMTVAHLVECQLSKVSALSGFEGDATPFTDVTVEAVSKLLRSHGFQSRGFEVMYHGHTGRKLVAQVFLGPTYYQRLKHLVDDKIHARARGPVQILTRQPVEGRSRDGGLRFGEMERDCQISHGCSSVLRERLFDCSDAYRVIVCDICGLIAIASYKKDSYECRSCQNRTRFSQVYLPYAAKLLFQELMSMNIAPRLFTKNHK

实体 3 Entity 3 polymer

描述 description	DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB3
分子量 formula_weight	33748.8 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	C,O

MDSETHITIRNISKNSVDFVLTNTSLAVANSLRRVVLAEIPTVAIDLVEINVNTSVMPDEFLAHRLGMIPLDSSNIDEPPPVGLEYTRNCDCDQYCPKCSVELFLNAKCTGEGTMEIYARDLVVSSNSSLGHPILADPKSRGPLICKLRKEQEISLRCIAKKGIAKEHAKWSPTSAVAFEYDPWNKLQHTDYWFENDADAEWPKSKNADWEEPPREGEPFNFQEEPRRFYMDVESVGSIPPNEIMVQGLRILQEKLAVLVRDLDEEQPTQLSANELNMEENAEMNWSPYQNGEENTW

实体 4 Entity 4 polymer

描述 description	DNA-directed RNA polymerase II subunit rpb4
分子量 formula_weight	15379.5 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	D,P

MPRAIFEEDAAQLKLGPEFENEDMLTVSEAKILIETVLAQRARETNGEIPMTDVMKKTVAYFNVFARFKTAEATYACERILGNRFHKFERAQLGTLCCEDAEEARTLIPSLANKIDDQNLQGILDELSTLRKFQD

实体 5 Entity 5 polymer

描述 description	DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC1
分子量 formula_weight	23954.5 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	E,Q

MSAEEKNIVRVFRAWKTAHQLVHDRGYGVSQAELDLTLDQFKAMHCGMGRNLDRTTLSFYAKPSNDSNKGTIYIEFAKEPSVGIKEMRTFVHTLGDHNHKTGILIYANSMTPSAAKIIATVTGQFTIETFQESDLIVNITHHELVPKHILLSPDEKKELLDRYKLRETQLPRIQLADPVARYLGLKRGEVVKIVRRSETSGRYNSYRICA

实体 6 Entity 6 polymer

描述 description	DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC2
分子量 formula_weight	15742.5 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	F,R

MSDYEEDEAFGMDGAVMEEEVDELEMIDENGQSQQGVSHPGEPSTTVITEDVASSKTAQSGKAVAKEDRTTTPYMTKYERARILGTRALQISMNAPVLVDLEGETDPLQIAMKELAQKKIPLLVRRYLPDGSYEDWSVAELI

实体 7 Entity 7 polymer

描述 description	DNA-directed RNA polymerase II subunit rpb7
分子量 formula_weight	19122.0 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	G,S

MPFFLKELSLTISLHPSYFGPRMQDYLKAKLLADVEGTCSGQYGYIICVLDSNTIDIDKGRVVPGQGFAEFEVKYRAVLWRPFRGEVVDAIVTTVNKMGFFANIGPLNVFVSSHLVPPDMKFDPTANPPNYSGEDQVIEKGSNVRLKIVGTRTDATEIFAIATMKEDYLGVL

实体 8 Entity 8 polymer

描述 description	DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC3
分子量 formula_weight	14317.3 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	H,T

MSESVLLDEIFTVTSVDKQKYQRVSRITAVSGQNDMNLTLDINSQIYPLEKDATFSLQITSNLNSPDLKEAADYIMYGKVYRVEEAKDEKVSVYVSFGGLLMAIEGSHRKLYRLSLDHVYLLLRR

实体 9 Entity 9 polymer

描述 description	DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB9
分子量 formula_weight	13192.8 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	I,U

MSNFQYCIECNNMLYPREDKVDRVLRLACRNCDYSEIAATSKVYRHELQSSNVENTTVSHDASTDPTLPRSDKECPRCHQHEAVFYQTHSRRGDTMMTLIYVCVHCGFAFEEQ

实体 10 Entity 10 polymer

描述 description	DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC5
分子量 formula_weight	8286.8 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	J,V

MIIPIRCFSCGKVIGDKWDTYLTLLQEDNTEGEALDKLGLQRYCCRRMILTHVDLIEKLLCYNPLSKQKNL

实体 11 Entity 11 polymer

描述 description	DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB11
分子量 formula_weight	14143.3 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	K,W

MNQPERYELIELMGLPKVTYELDSKSPNAAVVTLEKEDHTLANMLANQLLSDERVLFAGYKVPHPLNHNFILRVQTVEDCSPKQVIVDAAKSLITHLEEIKVNFMREWELKMISVEGVEMEFS

实体 12 Entity 12 polymer

描述 description	DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC4
分子量 formula_weight	7216.5 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	L,X

MNHPTSTGGTAFNPPRPATMIYLCADCGARNTIQAKEVIRCRECGHRVMYKMRTKRMVQFEAR

实体 13 Entity 13 non-polymer

描述 description	ZINC ION
分子量 formula_weight	65.4 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	16

实体 14 Entity 14 non-polymer

描述 description	MAGNESIUM ION
分子量 formula_weight	24.3 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	2

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6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 48 domains

CATH v4.4 (48 domains)

结构域编号 domain_id	3h0gA02
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	40 — Beta Barrel
拓扑 Topology topology	40 — Barwin-like endoglucanases
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	20 —

结构域编号 domain_id	3h0gA03
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	1490 — Dna Ligase; domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	180 — RNA polymerase ii

结构域编号 domain_id	3h0gA04
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology	274 — Enzyme I; Chain A, domain 2
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	100 — RNA polymerase Rpb1, domain 3

结构域编号 domain_id	3h0gA05
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology	132 — Topoisomerase I; Chain A, domain 4
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	30 — RNA polymerase Rpb1 funnel domain

结构域编号 domain_id	3h0gA08
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	1360 — Gyrase A; domain 2
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	140 —

结构域编号 domain_id	3h0gB04
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	90 — Alpha-Beta Complex
拓扑 Topology topology	1110 — Dna-directed Rna Polymerase Ii 140kd Polypeptide; Chain: B; domain 3
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — RNA polymerase Rpb2, domain 2

结构域编号 domain_id	3h0gB05
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	90 — Alpha-Beta Complex
拓扑 Topology topology	1070 — Hypothetical Protein Ta0175; Chain: A, domain 2
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	20 —

结构域编号 domain_id	3h0gB06
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	40 — Beta Barrel
拓扑 Topology topology	270 — Dna-directed Rna Polymerase Ii 140kd Polypeptide; Chain: B; Domain 6
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — DNA-directed RNA polymerase, subunit 2, domain 6

结构域编号 domain_id	3h0gB07
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	40 — Beta Barrel
拓扑 Topology topology	50 — OB fold (Dihydrolipoamide Acetyltransferase, E2P)
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	150 — RNA polymerase II, Rpb2 subunit, wall domain

结构域编号 domain_id	3h0gB08
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	90 — Alpha-Beta Complex
拓扑 Topology topology	1800 — DCoH-like
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — RNA polymerase alpha subunit dimerisation domain

结构域编号 domain_id	3h0gC01
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	1360 — Gyrase A; domain 2
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — RNA polymerase, RBP11-like subunit

结构域编号 domain_id	3h0gC02
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	170 — Beta Complex
拓扑 Topology topology	120 — RNA Polymerase Alpha Subunit; Chain A, domain 2
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	12 — DNA-directed RNA polymerase, insert domain

结构域编号 domain_id	3h0gD00
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	20 — Up-down Bundle
拓扑 Topology topology	1250 — Growth Hormone; Chain: A;
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	40 — RNA Polymerase II, Rpb4 subunit

结构域编号 domain_id	3h0gE01
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	40 — 3-Layer(aba) Sandwich
拓扑 Topology topology	1340 — Dna-directed Rna Polymerases I, Ii, And Iii 27 Kd Polypeptide; Chain: A; domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — RNA polymerase, Rpb5, N-terminal domain

结构域编号 domain_id	3h0gE02
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	90 — Alpha-Beta Complex
拓扑 Topology topology	940 — Eukaryotic RPB6 RNA polymerase subunit
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	20 — RPB5-like RNA polymerase subunit

结构域编号 domain_id	3h0gF00
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	90 — Alpha-Beta Complex
拓扑 Topology topology	940 — Eukaryotic RPB6 RNA polymerase subunit
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — RNA polymerase subunit, RPB6/omega

结构域编号 domain_id	3h0gG01
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	1490 — Dna Ligase; domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	120 — RNA polymerase Rpb7-like, N-terminal domain

结构域编号 domain_id	3h0gG02
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	40 — Beta Barrel
拓扑 Topology topology	50 — OB fold (Dihydrolipoamide Acetyltransferase, E2P)
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	140 — Nucleic acid-binding proteins

结构域编号 domain_id	3h0gH00
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	40 — Beta Barrel
拓扑 Topology topology	50 — OB fold (Dihydrolipoamide Acetyltransferase, E2P)
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	140 — Nucleic acid-binding proteins

结构域编号 domain_id	3h0gI01
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	20 — Single Sheet
拓扑 Topology topology	25 — N-terminal domain of TfIIb
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 —

结构域编号 domain_id	3h0gI02
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	20 — Single Sheet
拓扑 Topology topology	25 — N-terminal domain of TfIIb
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 —

结构域编号 domain_id	3h0gJ00
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology	10 — Arc Repressor Mutant, subunit A
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	60 — Homeodomain-like

结构域编号 domain_id	3h0gK00
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	1360 — Gyrase A; domain 2
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — RNA polymerase, RBP11-like subunit

结构域编号 domain_id	3h0gL00
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	20 — Single Sheet
拓扑 Topology topology	28 — Rubrerythrin, domain 2
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	30 — RNA polymerase ii, chain L

结构域编号 domain_id	3h0gM03
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	40 — Beta Barrel
拓扑 Topology topology	40 — Barwin-like endoglucanases
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	20 —

结构域编号 domain_id	3h0gM04
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	1490 — Dna Ligase; domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	180 — RNA polymerase ii

结构域编号 domain_id	3h0gM05
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology	274 — Enzyme I; Chain A, domain 2
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	100 — RNA polymerase Rpb1, domain 3

结构域编号 domain_id	3h0gM06
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology	132 — Topoisomerase I; Chain A, domain 4
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	30 — RNA polymerase Rpb1 funnel domain

结构域编号 domain_id	3h0gM10
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	1360 — Gyrase A; domain 2
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	140 —

结构域编号 domain_id	3h0gN04
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	90 — Alpha-Beta Complex
拓扑 Topology topology	1110 — Dna-directed Rna Polymerase Ii 140kd Polypeptide; Chain: B; domain 3
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — RNA polymerase Rpb2, domain 2

结构域编号 domain_id	3h0gN05
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	90 — Alpha-Beta Complex
拓扑 Topology topology	1070 — Hypothetical Protein Ta0175; Chain: A, domain 2
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	20 —

结构域编号 domain_id	3h0gN06
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	40 — Beta Barrel
拓扑 Topology topology	270 — Dna-directed Rna Polymerase Ii 140kd Polypeptide; Chain: B; Domain 6
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — DNA-directed RNA polymerase, subunit 2, domain 6

结构域编号 domain_id	3h0gN07
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	40 — Beta Barrel
拓扑 Topology topology	50 — OB fold (Dihydrolipoamide Acetyltransferase, E2P)
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	150 — RNA polymerase II, Rpb2 subunit, wall domain

结构域编号 domain_id	3h0gN08
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	90 — Alpha-Beta Complex
拓扑 Topology topology	1800 — DCoH-like
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — RNA polymerase alpha subunit dimerisation domain

结构域编号 domain_id	3h0gO01
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	1360 — Gyrase A; domain 2
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — RNA polymerase, RBP11-like subunit

结构域编号 domain_id	3h0gO02
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	170 — Beta Complex
拓扑 Topology topology	120 — RNA Polymerase Alpha Subunit; Chain A, domain 2
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	12 — DNA-directed RNA polymerase, insert domain

结构域编号 domain_id	3h0gP00
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	20 — Up-down Bundle
拓扑 Topology topology	1250 — Growth Hormone; Chain: A;
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	40 — RNA Polymerase II, Rpb4 subunit

结构域编号 domain_id	3h0gQ01
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	40 — 3-Layer(aba) Sandwich
拓扑 Topology topology	1340 — Dna-directed Rna Polymerases I, Ii, And Iii 27 Kd Polypeptide; Chain: A; domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — RNA polymerase, Rpb5, N-terminal domain

结构域编号 domain_id	3h0gQ02
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	90 — Alpha-Beta Complex
拓扑 Topology topology	940 — Eukaryotic RPB6 RNA polymerase subunit
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	20 — RPB5-like RNA polymerase subunit

结构域编号 domain_id	3h0gR00
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	90 — Alpha-Beta Complex
拓扑 Topology topology	940 — Eukaryotic RPB6 RNA polymerase subunit
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — RNA polymerase subunit, RPB6/omega

结构域编号 domain_id	3h0gS01
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	1490 — Dna Ligase; domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	120 — RNA polymerase Rpb7-like, N-terminal domain

结构域编号 domain_id	3h0gS02
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	40 — Beta Barrel
拓扑 Topology topology	50 — OB fold (Dihydrolipoamide Acetyltransferase, E2P)
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	140 — Nucleic acid-binding proteins

结构域编号 domain_id	3h0gT00
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	40 — Beta Barrel
拓扑 Topology topology	50 — OB fold (Dihydrolipoamide Acetyltransferase, E2P)
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	140 — Nucleic acid-binding proteins

结构域编号 domain_id	3h0gU01
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	20 — Single Sheet
拓扑 Topology topology	25 — N-terminal domain of TfIIb
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 —

结构域编号 domain_id	3h0gU02
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	20 — Single Sheet
拓扑 Topology topology	25 — N-terminal domain of TfIIb
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 —

结构域编号 domain_id	3h0gV00
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology	10 — Arc Repressor Mutant, subunit A
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	60 — Homeodomain-like

结构域编号 domain_id	3h0gW00
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	1360 — Gyrase A; domain 2
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — RNA polymerase, RBP11-like subunit

结构域编号 domain_id	3h0gX00
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	20 — Single Sheet
拓扑 Topology topology	28 — Rubrerythrin, domain 2
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	30 — RNA polymerase ii, chain L

▶

晶胞边长 a length_a	163.034 Å
晶胞边长 b length_b	202.684 Å
晶胞边长 c length_c	391.258 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	90.00 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	90.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	8

空间群 space_group	P 21 21 21
空间群编号 int_tables_number	19
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	3.650 Å
最低分辨率 resolution_low	48.695 Å
R 因子 r_factor	0.2970
R_work r_work	0.2970
R_free r_free	0.3210

RNA Polymerase II from Schizosaccharomyces pombe

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

DNA-directed RNA polymerase II subunit rpb1

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB2

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB3

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

DNA-directed RNA polymerase II subunit rpb4

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC1

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC2

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

DNA-directed RNA polymerase II subunit rpb7

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC3

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB9

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC5

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体