Tubulin alpha-1A chain
物种未注明
当前结构中的状态
| Assembly | 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与共同组分 | 实验方法与环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白拷贝数一致 | 链 A; UniProt 1–451 | 未记录 | Tubulin beta chain × 1 (P02554) MG MAGNESIUM ION × 2 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 | ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液:pH 6.8 cryo-EM玻璃化条件:冷冻剂 ETHANE | 分辨率 8.90 Å |
数据库中的同蛋白其他状态
以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly, “相对当前条目”直接指出证据层面的不同;没有差异标签表示当前已读取字段一致。
| 其他 PDB | 相对当前条目 3J7I | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法与环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1FFX TUBULIN:STATHMIN-LIKE DOMAIN COMPLEX 提交 2000-07-26 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 5 PDB 声明:pentameric |
链 A
1–451(451 aa)
链 C
1–451(451 aa)
|
未记录 | GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7;293 K;PEG, pH 7.00, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293.K
|
分辨率 3.95 Å R-free 0.367 |
| 1IA0 KIF1A HEAD-MICROTUBULE COMPLEX STRUCTURE IN ATP-FORM 提交 2001-03-22 | 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric |
链 A
1–451(451 aa)
|
未记录 | GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 TXL TAXOTERE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ACP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID ADENYLATE ESTER × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
buf1;pH 7.4;IMIDAZOLE 50 MM, MG-ACETATE 5 MM, EGTA 1 MM, K-ACETATE 50 MM, DTT 10 MM, PACLITAXEL 10 MICRO M
cryo-EM玻璃化条件
PLUNGED INTO ETHANE
X-ray结晶条件
polymerization of the microtubule;pH 6.8;296 K;pH 6.8, polymerization of the microtubule, temperature 296K
|
分辨率 15.00 Å |
| 1SA0 TUBULIN-COLCHICINE: STATHMIN-LIKE DOMAIN COMPLEX 提交 2004-02-06 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 5 PDB 声明:pentameric |
链 A
1–451(451 aa)
链 C
1–451(451 aa)
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 3 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 CN2 2-MERCAPTO-N-[1,2,3,10-TETRAMETHOXY-9-OXO-5,6,7,9-TETRAHYDRO-BENZO[A]HEPTALEN-7-YL]ACETAMIDE × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7;291 K;PEG, PIPES BUFFER, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K
|
分辨率 3.58 Å R-free 0.249 |
| 1SA1 Tubulin-podophyllotoxin: stathmin-like domain complex 提交 2004-02-06 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 5 PDB 声明:pentameric |
链 A
1–451(451 aa)
链 C
1–451(451 aa)
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 2 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 POD 9-HYDROXY-5-(3,4,5-TRIMETHOXYPHENYL)-5,8,8A,9-TETRAHYDROFURO[3',4':6,7]NAPHTHO[2,3-D][1,3]DIOXOL-6(5AH)-ONE × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7;291 K;PEG, PIPES BUFFER, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K
|
分辨率 4.20 Å R-free 0.259 |
| 1TUB TUBULIN ALPHA-BETA DIMER, ELECTRON DIFFRACTION 提交 1997-09-23 | 构建体不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric |
链 A
1–440(440 aa)
|
未记录 | GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 TXL TAXOTERE × 1 |
ELECTRON CRYSTALLOGRAPHY
X-ray结晶条件
TWO-DIMENSIONAL SHEETS ARE FORMED UNDER NORMAL POLYMERIZING CONDITIONS WITH THE ADDITION OF 1 MM ZNCL2
|
分辨率 3.70 Å |
| 1TVK The binding mode of epothilone A on a,b-tubulin by electron crystallography 提交 2004-06-29 | 构建体不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric |
链 A
1–440(440 aa)
|
未记录 | GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 EP EPOTHILONE A × 1 | ELECTRON CRYSTALLOGRAPHY mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 2.89 Å R-free 0.321 |
| 2HXF KIF1A head-microtubule complex structure in amppnp-form 提交 2006-08-03 | 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric |
链 A
1–451(451 aa)
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 2 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 TA1 TAXOL × 1 ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
IMIDAZOLE;pH 7.4;IMIDAZOLE
cryo-EM玻璃化条件
Ethan slash
|
分辨率 10.00 Å |
| 2HXH KIF1A head-microtubule complex structure in adp-form 提交 2006-08-03 | 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric |
链 A
1–451(451 aa)
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 2 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 TA1 TAXOL × 1 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
imidazole;pH 7.4;imidazole
cryo-EM玻璃化条件
Ethan slash
|
分辨率 11.00 Å |
| 2WBE Kinesin-5-Tubulin Complex with AMPPNP 提交 2009-02-26 | 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 A
1–451(451 aa)
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
80MM PIPES, 150MM NACL, 7MM MGCL2, 1MM EGTA, 1MM BETA-MERCAPTOETHANOL;pH 6.8;80MM PIPES, 150MM NACL, 7MM MGCL2, 1MM EGTA, 1MM BETA-MERCAPTOETHANOL
cryo-EM玻璃化条件
ETHANE
|
分辨率 9.40 Å |
| 3EDL Kinesin13-Microtubule Ring complex 提交 2008-09-03 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 165 PDB 声明:165-meric |
链 A
1–451(451 aa)
链 F
1–451(451 aa)
|
未记录 | ZN ZINC ION × 33 MG MAGNESIUM ION × 99 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 66 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 66 TA1 TAXOL × 33 ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 33 CN2 2-MERCAPTO-N-[1,2,3,10-TETRAMETHOXY-9-OXO-5,6,7,9-TETRAHYDRO-BENZO[A]HEPTALEN-7-YL]ACETAMIDE × 33 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 6.8;80 mM Pipes, pH 6.8, 2 mM MgCl2, 1 mM EGTA, 2 mM AMP-PNP, 0.02 mM taxol
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 28.00 Å |
| 3EDL Kinesin13-Microtubule Ring complex 提交 2008-09-03 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 5 PDB 声明:pentameric |
链 A
1–451(451 aa)
链 F
1–451(451 aa)
|
未记录 | ZN ZINC ION × 1 MG MAGNESIUM ION × 3 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 TA1 TAXOL × 1 ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 1 CN2 2-MERCAPTO-N-[1,2,3,10-TETRAMETHOXY-9-OXO-5,6,7,9-TETRAHYDRO-BENZO[A]HEPTALEN-7-YL]ACETAMIDE × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 6.8;80 mM Pipes, pH 6.8, 2 mM MgCl2, 1 mM EGTA, 2 mM AMP-PNP, 0.02 mM taxol
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 28.00 Å |
| 3EDL Kinesin13-Microtubule Ring complex 提交 2008-09-03 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 5 PDB 声明:pentameric |
链 A
1–451(451 aa)
链 F
1–451(451 aa)
|
未记录 | ZN ZINC ION × 1 MG MAGNESIUM ION × 3 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 TA1 TAXOL × 1 ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 1 CN2 2-MERCAPTO-N-[1,2,3,10-TETRAMETHOXY-9-OXO-5,6,7,9-TETRAHYDRO-BENZO[A]HEPTALEN-7-YL]ACETAMIDE × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 6.8;80 mM Pipes, pH 6.8, 2 mM MgCl2, 1 mM EGTA, 2 mM AMP-PNP, 0.02 mM taxol
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 28.00 Å |
| 3J6E Energy minimized average structure of Microtubules stabilized by GmpCpp 提交 2014-02-18 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 18 PDB 声明:octadecameric |
链 A
1–439(439 aa)
链 C
1–439(439 aa)
链 E
1–439(439 aa)
链 G
1–439(439 aa)
链 I
1–439(439 aa)
链 K
1–439(439 aa)
链 M
1–439(439 aa)
链 O
1–439(439 aa)
链 Q
1–439(439 aa)
|
未记录 | GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 9 MG MAGNESIUM ION × 18 G2P PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 9 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
80 mM PIPES, 1 mM EGTA, 1 mM MgCl2, 1 mM DTT, 0.05% Nonidet P-40;pH 6.8;80 mM PIPES, 1 mM EGTA, 1 mM MgCl2, 1 mM DTT, 0.05% Nonidet P-40
cryo-EM玻璃化条件
The grid was blotted for 2 seconds before plunging.;90.4 K;冷冻剂 ETHANE;The grid was blotted for 2 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK II).
|
分辨率 4.70 Å |
| 3J6F Minimized average structure of GDP-bound dynamic microtubules 提交 2014-02-19 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 18 PDB 声明:octadecameric |
链 A
1–439(439 aa)
链 C
1–439(439 aa)
链 E
1–439(439 aa)
链 G
1–439(439 aa)
链 I
1–439(439 aa)
链 K
1–439(439 aa)
链 M
1–439(439 aa)
链 O
1–439(439 aa)
链 Q
1–439(439 aa)
|
未记录 | GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 9 MG MAGNESIUM ION × 9 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 9 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
80 mM PIPES, 1 mM EGTA, 1 mM MgCl2, 1 mM DTT, 0.05% Nonidet P-40;pH 6.8;80 mM PIPES, 1 mM EGTA, 1 mM MgCl2, 1 mM DTT, 0.05% Nonidet P-40
cryo-EM玻璃化条件
The grid was blotted for 2 seconds before plunging.;90.4 K;冷冻剂 ETHANE;The grid was blotted for 2 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK II).
|
分辨率 4.90 Å |
| 3J6G Minimized average structure of microtubules stabilized by taxol 提交 2014-02-19 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 18 PDB 声明:octadecameric |
链 A
1–439(439 aa)
链 C
1–439(439 aa)
链 E
1–439(439 aa)
链 G
1–439(439 aa)
链 I
1–439(439 aa)
链 K
1–439(439 aa)
链 M
1–439(439 aa)
链 O
1–439(439 aa)
链 Q
1–439(439 aa)
|
未记录 | GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 9 MG MAGNESIUM ION × 9 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 9 TA1 TAXOL × 9 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
80 mM PIPES, 1 mM EGTA, 1 mM MgCl2, 1 mM DTT, 0.05% Nonidet P-40;pH 6.8;80 mM PIPES, 1 mM EGTA, 1 mM MgCl2, 1 mM DTT, 0.05% Nonidet P-40
cryo-EM玻璃化条件
The grid was blotted for 2 seconds before plunging.;90.4 K;冷冻剂 ETHANE;The grid was blotted for 2 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK II).
|
分辨率 5.50 Å |
| 3J6H Nucleotide-free Kinesin motor domain complexed with GMPCPP-microtubule 提交 2014-02-21 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric |
链 A
2–437(436 aa)
片段:UNP residues 2-437
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 2 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 G2P PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 SO4 SULFATE ION × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 6.8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 8.10 Å |
| 3J6P Pseudo-atomic model of dynein microtubule binding domain-tubulin complex based on a cryoEM map 提交 2014-03-20 | 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric |
链 A
1–451(451 aa)
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 TA1 TAXOL × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7
cryo-EM玻璃化条件
Blot for 3.5 seconds before plunging;冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 8.20 Å |
| 5MM4 Ustilago maydis kinesin-5 motor domain in the AMPPNP state bound to microtubules 提交 2016-12-08 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric |
链 A
1–439(439 aa)
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 2 ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 TA1 TAXOL × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 6.8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 4.50 Å |
| 5MM7 Ustilago maydis kinesin-5 motor domain with N-terminal extension in the AMPPNP state bound to microtubules 提交 2016-12-08 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric |
链 A
1–439(439 aa)
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 2 ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 TA1 TAXOL × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 6.8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 5.10 Å |
| 5XXT GDP-microtubule complexed with nucleotide-free KIF5C 提交 2017-07-05 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 18 PDB 声明:octadecameric |
链 A
2–439(438 aa)
片段:UNP residues 2-439
链 C
2–439(438 aa)
片段:UNP residues 2-439
链 E
2–439(438 aa)
片段:UNP residues 2-439
链 G
2–439(438 aa)
片段:UNP residues 2-439
链 I
2–439(438 aa)
片段:UNP residues 2-439
链 K
2–439(438 aa)
片段:UNP residues 2-439
链 M
2–439(438 aa)
片段:UNP residues 2-439
链 O
2–439(438 aa)
片段:UNP residues 2-439
链 Q
2–439(438 aa)
片段:UNP residues 2-439
|
未记录 | GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 9 MG MAGNESIUM ION × 9 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 9 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 5.35 Å |
| 5XXV GDP-microtubule complexed with KIF5C in AMPPNP state 提交 2017-07-05 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 18 PDB 声明:octadecameric |
链 A
2–439(438 aa)
片段:UNP residues 2-439
链 C
2–439(438 aa)
片段:UNP residues 2-439
链 E
2–439(438 aa)
片段:UNP residues 2-439
链 G
2–439(438 aa)
片段:UNP residues 2-439
链 I
2–439(438 aa)
片段:UNP residues 2-439
链 K
2–439(438 aa)
片段:UNP residues 2-439
链 M
2–439(438 aa)
片段:UNP residues 2-439
链 O
2–439(438 aa)
片段:UNP residues 2-439
链 Q
2–439(438 aa)
片段:UNP residues 2-439
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 9 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 9 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 9 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 6.46 Å |
| 5XXW GDP-microtubule complexed with KIF5C in ATP state 提交 2017-07-05 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 18 PDB 声明:octadecameric |
链 A
2–439(438 aa)
片段:UNP residues 2-439
链 C
2–439(438 aa)
片段:UNP residues 2-439
链 E
2–439(438 aa)
片段:UNP residues 2-439
链 G
2–439(438 aa)
片段:UNP residues 2-439
链 I
2–439(438 aa)
片段:UNP residues 2-439
链 K
2–439(438 aa)
片段:UNP residues 2-439
链 M
2–439(438 aa)
片段:UNP residues 2-439
链 O
2–439(438 aa)
片段:UNP residues 2-439
链 Q
2–439(438 aa)
片段:UNP residues 2-439
|
未记录 | GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 9 MG MAGNESIUM ION × 9 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 9 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 6.00 Å |
| 5XXX GMPCPP-microtubule complexed with nucleotide-free KIF5C 提交 2017-07-05 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 18 PDB 声明:octadecameric |
链 A
2–439(438 aa)
片段:UNP residues 2-439
链 C
2–439(438 aa)
片段:UNP residues 2-439
链 E
2–439(438 aa)
片段:UNP residues 2-439
链 G
2–439(438 aa)
片段:UNP residues 2-439
链 I
2–439(438 aa)
片段:UNP residues 2-439
链 K
2–439(438 aa)
片段:UNP residues 2-439
链 M
2–439(438 aa)
片段:UNP residues 2-439
链 O
2–439(438 aa)
片段:UNP residues 2-439
链 Q
2–439(438 aa)
片段:UNP residues 2-439
|
未记录 | GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 9 MG MAGNESIUM ION × 18 G2P PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 9 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 6.43 Å |
| 6MLQ Cryo-EM structure of microtubule-bound Kif7 in the ADP state 提交 2018-09-27 | 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric |
链 A
1–451(451 aa)
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 2 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 TA1 TAXOL × 1 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 6.8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE;Blotted from behind the grid for 2 seconds
|
分辨率 4.20 Å |
| 6MLR Cryo-EM structure of microtubule-bound Kif7 in the AMPPNP state 提交 2018-09-27 | 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric |
链 A
1–451(451 aa)
|
未记录 | GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 TA1 TAXOL × 1 ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 6.8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE;Blotted from behind the grid for 2 seconds
|
分辨率 4.20 Å |
| 6MZE Structural Basis of Tubulin Recruitment and Assembly by Microtubule Polymerases with Tumor Overexpressed Gene (TOG) Domain Arrays 提交 2018-11-05 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 14 PDB 声明:tetradecameric |
链 A
1–451(451 aa)
链 C
1–451(451 aa)
链 H
1–451(451 aa)
链 J
1–451(451 aa)
|
未记录 | GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 4 MG MAGNESIUM ION × 8 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7;293 K;50 mM PIPES, 100 mM MgCl2 [pH 7.0], and 10-15% PEG-8000
|
分辨率 3.60 Å R-free 0.245 |
| 6MZE Structural Basis of Tubulin Recruitment and Assembly by Microtubule Polymerases with Tumor Overexpressed Gene (TOG) Domain Arrays 提交 2018-11-05 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 14 PDB 声明:tetradecameric |
链 O
1–451(451 aa)
链 Q
1–451(451 aa)
链 V
1–451(451 aa)
链 X
1–451(451 aa)
|
未记录 | GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 4 MG MAGNESIUM ION × 8 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7;293 K;50 mM PIPES, 100 mM MgCl2 [pH 7.0], and 10-15% PEG-8000
|
分辨率 3.60 Å R-free 0.245 |
| 6MZF Structural Basis of Tubulin Recruitment and Assembly by Microtubule Polymerases with Tumor Overexpressed Gene (TOG) Domain Arrays 提交 2018-11-05 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 14 PDB 声明:tetradecameric |
链 A
1–451(451 aa)
链 C
1–451(451 aa)
链 H
1–451(451 aa)
链 J
1–451(451 aa)
|
未记录 | GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 4 MG MAGNESIUM ION × 8 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7;293 K;50 mM PIPES, 100 mM MgCl2 [pH 7.0], and 10-15% PEG-8000
|
分辨率 4.40 Å R-free 0.252 |
| 6MZF Structural Basis of Tubulin Recruitment and Assembly by Microtubule Polymerases with Tumor Overexpressed Gene (TOG) Domain Arrays 提交 2018-11-05 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 14 PDB 声明:tetradecameric |
链 O
1–451(451 aa)
链 Q
1–451(451 aa)
链 V
1–451(451 aa)
链 X
1–451(451 aa)
|
未记录 | GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 4 MG MAGNESIUM ION × 8 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7;293 K;50 mM PIPES, 100 mM MgCl2 [pH 7.0], and 10-15% PEG-8000
|
分辨率 4.40 Å R-free 0.252 |
| 6MZG Structural Basis of Tubulin Recruitment and Assembly by Microtubule Polymerases with Tumor Overexpressed Gene (TOG) Domain Arrays 提交 2018-11-05 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 6 PDB 声明:hexameric |
链 A
1–451(451 aa)
链 C
1–451(451 aa)
|
未记录 | GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 4 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7;293 K;50 mM PIPES, 100 mM MgCl2 [pH 7.0], and 10-15% PEG-8000
|
分辨率 3.21 Å R-free 0.234 |
| 6MZG Structural Basis of Tubulin Recruitment and Assembly by Microtubule Polymerases with Tumor Overexpressed Gene (TOG) Domain Arrays 提交 2018-11-05 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 6 PDB 声明:hexameric |
链 G
1–451(451 aa)
链 I
1–451(451 aa)
|
未记录 | GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 4 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7;293 K;50 mM PIPES, 100 mM MgCl2 [pH 7.0], and 10-15% PEG-8000
|
分辨率 3.21 Å R-free 0.234 |
| 6VPO Cryo-EM structure of microtubule-bound KLP61F motor domain in the AMPPNP state 提交 2020-02-04 | 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric |
链 A
1–451(451 aa)
|
未记录 | GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 6.8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 4.40 Å |
| 6VPP Cryo-EM structure of microtubule-bound KLP61F motor with tail domain in the nucleotide-free state 提交 2020-02-04 | 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric |
链 A
1–451(451 aa)
|
未记录 | GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 6.8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 4.40 Å |
| 7RS5 Cryo-EM structure of Kip3 (AMPPNP) bound to Taxol-Stabilized Microtubules 提交 2021-08-10 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 27 PDB 声明:27-meric |
链 A
1–451(451 aa)
链 C
1–451(451 aa)
链 E
1–451(451 aa)
链 G
1–451(451 aa)
链 I
1–451(451 aa)
链 L
1–451(451 aa)
链 N
1–451(451 aa)
链 P
1–451(451 aa)
链 R
1–451(451 aa)
|
未记录 | GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 9 MG MAGNESIUM ION × 18 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 9 TA1 TAXOL × 9 ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 9 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 8;cryoEM buffer (50 mM Tris-HCl, pH 8.0, 1 mM MgCl2, 1 mM EGTA, 1 mM DTT supplemented with 2mM AMPPNP)
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.90 Å |
| 7RX0 Complex of AMPPNP-Kif7 and Gli2 Zinc-Finger domain bound to microtubules 提交 2021-08-20 | 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric |
链 A
1–451(451 aa)
|
未记录 | ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 G2P PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 6.8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE;Blotted from behind the grid for 2 seconds
|
分辨率 3.89 Å |
| 7U0F HIV-1 Rev in complex with tubulin 提交 2022-02-18 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 150 PDB 声明:150-meric |
链 A
1–451(451 aa)
链 C
1–451(451 aa)
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.53 Å |
| 7U0F HIV-1 Rev in complex with tubulin 提交 2022-02-18 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 10 PDB 声明:decameric |
链 A
1–451(451 aa)
链 C
1–451(451 aa)
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.53 Å |
| 7U0F HIV-1 Rev in complex with tubulin 提交 2022-02-18 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 10 PDB 声明:decameric |
链 A
1–451(451 aa)
链 C
1–451(451 aa)
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.53 Å |
| 7X4N Crystal Structure of C. elegans kinesin-4 KLP-12 complexed with tubulin and DARPin 提交 2022-03-03 | 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric |
链 A
1–451(451 aa)
|
未记录 | GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 2 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;293 K;ammonium acetate, HEPES, polyethylene glycol (PEG) 3350
|
分辨率 2.88 Å R-free 0.296 |
| 8QAU Outer kinetochore Ndc80-Dam1 alpha/beta-tubulin complex 提交 2023-08-23 | 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 5 PDB 声明:pentameric |
链 C
1–451(451 aa)
|
未记录 | GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 TA1 TAXOL × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 6.8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.54 Å |
| 9EDR Tubulin Cofactors D,E,G,C and Tubulin complex -- TBCC N Terminus Bound to Tubulin 提交 2024-11-17 | 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 7 PDB 声明:heptameric |
链 A
1–451(451 aa)
|
未记录 | GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.80 Å |
| 9EDS Tubulin cofactors D,E,G,C bound to tubulin dimer -- TBCC N terminus unbound 提交 2024-11-18 | 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 7 PDB 声明:heptameric |
链 A
1–451(451 aa)
|
未记录 | GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.80 Å |
| 9EDT Tubulin cofactors D,E,G bound to tubulin dimer 提交 2024-11-18 | 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 6 PDB 声明:hexameric |
链 A
1–451(451 aa)
|
未记录 | GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.70 Å |
| 9EEB Tubulin cofactors D,E,G bound to tubulin dimer 提交 2024-11-18 | 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 6 PDB 声明:hexameric |
链 A
1–451(451 aa)
|
未记录 | GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.70 Å |
| 9RPD D. melanogaster Augmin TII N-clamp (GST-fusion) bound to a microtubule, well-defined subset of particles 提交 2025-06-24 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 异源复合物;蛋白 × 9 PDB 声明:nonameric |
链 A
1–451(451 aa)
链 C
1–451(451 aa)
链 E
1–451(451 aa)
链 G
1–451(451 aa)
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 6.8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 4.90 Å |
| 9T1D Cryo-EM reconstruction of undecorated GDP microtubule 提交 2025-10-21 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric |
链 A
1–439(439 aa)
|
未记录 | GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 6.8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE-PROPANE
|
分辨率 2.90 Å |
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| UniProt名称 | TBA1A_PIG |
| Isoform | — |
| PDB实体 | 1 |
| 链与序列区间 | 作者链 A; PDB构建体 1–451; UniProt 1–451 |