3km6

Crystal Structure of the Human GST Pi C47S/Y108V Double Mutant in Complex with the Ethacrynic Acid-Glutathione Conjugate

Method: X-RAY DIFFRACTION D_max: 64.7 Å Quality: EXCELLENT

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Glutathione S-transferase P

Homo sapiens

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	蛋白同源多聚体同源多聚体蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2）与蛋白拷贝数一致	链 A； UniProt 2–210 链 B； UniProt 2–210	突变：C47S, Y108V	EAA ETHACRYNIC ACID × 2 GSH Glutathione × 2 CA CALCIUM ION × 6	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；298 K；4mg/ml, 267mM calcium acetate, 100mM MES pH 6.0, 20% (w/v) PEG 8000 , VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K	分辨率 2.10 Å R-free 0.206

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB	相对当前条目 3KM6	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
10GS HUMAN GLUTATHIONE S-TRANSFERASE P1-1, COMPLEX WITH TER117 提交 1997-08-14	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1–209（209 aa）链 B 1–209（209 aa）	未记录	VWW L-gamma-glutamyl-S-benzyl-N-[(S)-carboxy(phenyl)methyl]-L-cysteinamide × 2 MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 5.8；pH 5.8	分辨率 2.20 Å R-free 0.214
11GS Glutathione s-transferase complexed with ethacrynic acid-glutathione conjugate (form ii) 提交 1997-11-03	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1–209（209 aa）链 B 1–209（209 aa）	未记录	GSH Glutathione × 2 EAA ETHACRYNIC ACID × 2 MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 6.4；pH 6.4	分辨率 2.30 Å R-free 0.270
12GS GLUTATHIONE S-TRANSFERASE COMPLEXED WITH S-NONYL-GLUTATHIONE 提交 1997-11-19	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1–209（209 aa）链 B 1–209（209 aa）	未记录	0HH L-gamma-glutamyl-S-nonyl-L-cysteinylglycine × 2 MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 5.4；pH 5.4	分辨率 2.10 Å R-free 0.261
13GS GLUTATHIONE S-TRANSFERASE COMPLEXED WITH SULFASALAZINE 提交 1997-11-20	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1–209（209 aa）链 B 1–209（209 aa）	未记录	GSH Glutathione × 2 SAS 2-HYDROXY-(5-([4-(2-PYRIDINYLAMINO)SULFONYL]PHENYL)AZO)BENZOIC ACID × 2 MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 3	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 5.4；pH 5.4	分辨率 1.90 Å R-free 0.222
14GS GLUTATHIONE S-TRANSFERASE P1-1 APO FORM 1 提交 1997-11-29	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1–209（209 aa）链 B 1–209（209 aa）	未记录	MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 6.6；pH 6.6	分辨率 2.80 Å R-free 0.240
16GS GLUTATHIONE S-TRANSFERASE P1-1 APO FORM 3 提交 1997-11-30	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1–209（209 aa）链 B 1–209（209 aa）	未记录	SO4 SULFATE ION × 1 MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 5.8；pH 5.8	分辨率 1.90 Å R-free 0.263
17GS GLUTATHIONE S-TRANSFERASE P1-1 提交 1997-12-07	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1–209（209 aa）链 B 1–209（209 aa）	突变：K54A 突变：K54A	GTX S-HEXYLGLUTATHIONE × 2 MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 3	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 6.6；pH 6.6	分辨率 1.90 Å R-free 0.200
18GS GLUTATHIONE S-TRANSFERASE P1-1 COMPLEXED WITH 1-(S-GLUTATHIONYL)-2,4-DINITROBENZENE 提交 1997-12-07	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1–209（209 aa）链 B 1–209（209 aa）	未记录	GDN GLUTATHIONE S-(2,4 DINITROBENZENE) × 2 MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 5.4；pH 5.4	分辨率 1.90 Å R-free 0.238
19GS Glutathione s-transferase p1-1 提交 1997-12-14	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1–209（209 aa）链 B 1–209（209 aa）	未记录	BSP 3,3'-(4,5,6,7-TETRABROMO-3-OXO-1(3H)-ISOBENZOFURANYLIDENE)BIS [6-HYDROXYBENZENESULFONIC ACID]ANION × 2 GSH Glutathione × 2 MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 hanging drop；pH 6；CRYSTALLISATION PERFORMED USING THE HANGING DROP TECHNIQUE. 2 MICROL OF PROTEIN SOLUTION (8MG/ML) IN 10MM PHOSPHATE BUFFER PH7.0, 1MM EDTA AND 2MM BETA-MERCAPTOETHANOL WAS ADDED TO 2 MICROL OF RESERVOIR SOLUTION. THE RESERVOIR CONTAINED 20-25% AMMONIUM SULFATE, 30-60 MM DITHIOTHREITOL AND 100MM MORPHOLINOETHANESULFONIC ACID BUFFER PH5.4. DROPS WERE STREAK SEEDED AFTER 1 DAY USING A CAT'S WHISKER FROM CRYSTALS GROWN UNDER SIMILAR CONDITIONS. AFTER X DAYS, THE CRYSTAL WAS TRANSFERED TO ARTIFICIAL MOTHER LIQUOR WHICH LACKED DITHIOTHREITOL. SOLID BROMOSULFALEIN WAS SEEDED INTO THE DROP. SEVEN WEEKS LATER THE CRYSTALS WERE SUBJECTED TO X-RAY ANALYSIS., pH 6.0, hanging drop	分辨率 1.90 Å R-free 0.249
1AQV GLUTATHIONE S-TRANSFERASE IN COMPLEX WITH P-BROMOBENZYLGLUTATHIONE 提交 1997-08-01	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1–209（209 aa）链 B 1–209（209 aa）	未记录	0HG N-[(4S)-4-ammonio-4-carboxybutanoyl]-S-(4-bromobenzyl)-L-cysteinylglycine × 2 MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 6.5；pH 6.5	分辨率 1.94 Å R-free 0.252
1AQW GLUTATHIONE S-TRANSFERASE IN COMPLEX WITH GLUTATHIONE 提交 1997-08-03	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1–209（209 aa）链 B 1–209（209 aa）	未记录	GSH Glutathione × 2 MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 6.5；pH 6.5	分辨率 1.80 Å R-free 0.261
1AQW GLUTATHIONE S-TRANSFERASE IN COMPLEX WITH GLUTATHIONE 提交 1997-08-03	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 C 1–209（209 aa）链 D 1–209（209 aa）	未记录	GSH Glutathione × 2 MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 6.5；pH 6.5	分辨率 1.80 Å R-free 0.261
1AQX GLUTATHIONE S-TRANSFERASE IN COMPLEX WITH MEISENHEIMER COMPLEX 提交 1997-08-03	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1–209（209 aa）链 B 1–209（209 aa）	未记录	GTD 1-(S-GLUTATHIONYL)-2,4,6-TRINITROCYCLOHEXA-2,5-DIENE × 2 MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 6.5；pH 6.5	分辨率 2.00 Å R-free 0.283
1AQX GLUTATHIONE S-TRANSFERASE IN COMPLEX WITH MEISENHEIMER COMPLEX 提交 1997-08-03	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 C 1–209（209 aa）链 D 1–209（209 aa）	未记录	GTD 1-(S-GLUTATHIONYL)-2,4,6-TRINITROCYCLOHEXA-2,5-DIENE × 2 MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 6.5；pH 6.5	分辨率 2.00 Å R-free 0.283
1EOG CRYSTAL STRUCTURE OF PI CLASS GLUTATHIONE TRANSFERASE 提交 2000-03-22	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 3–210（208 aa）链 B 3–210（208 aa）	突变：S149A 突变：S149A	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；293 K；25% ammonium sulfate, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 20K	分辨率 2.10 Å R-free 0.238
1EOH GLUTATHIONE TRANSFERASE P1-1 提交 2000-03-22	突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 2–210（209 aa）链 B 2–210（209 aa）	突变：D152A 突变：D152A	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 2.50 Å R-free 0.286
1EOH GLUTATHIONE TRANSFERASE P1-1 提交 2000-03-22	突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 C 2–210（209 aa）链 D 2–210（209 aa）	突变：D152A 突变：D152A	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 2.50 Å R-free 0.286
1EOH GLUTATHIONE TRANSFERASE P1-1 提交 2000-03-22	突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 E 2–210（209 aa）链 F 2–210（209 aa）	突变：D152A 突变：D152A	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 2.50 Å R-free 0.286
1EOH GLUTATHIONE TRANSFERASE P1-1 提交 2000-03-22	突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 4 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 G 2–210（209 aa）链 H 2–210（209 aa）	突变：D152A 突变：D152A	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 2.50 Å R-free 0.286
1GSS THREE-DIMENSIONAL STRUCTURE OF CLASS PI GLUTATHIONE S-TRANSFERASE FROM HUMAN PLACENTA IN COMPLEX WITH S-HEXYLGLUTATHIONE AT 2.8 ANGSTROMS RESOLUTION 提交 1992-05-28	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1–209（209 aa）链 B 1–209（209 aa）	未记录	LEE L-gamma-glutamyl-S-hexyl-L-cysteinylglycine × 2	X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 2.80 Å
1KBN Glutathione transferase mutant 提交 2001-11-06	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1–209（209 aa）链 B 1–209（209 aa）	突变：I148A,Y153A 突变：I148A,Y153A	GSH Glutathione × 2 MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 2 GOL GLYCEROL × 2	X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 2.00 Å R-free 0.244
1LBK Crystal structure of a recombinant glutathione transferase, created by replacing the last seven residues of each subunit of the human class pi isoenzyme with the additional C-terminal helix of human class alpha isoenzyme 提交 2002-04-04	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1–202（202 aa）链 B 1–202（202 aa）	未记录	MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 2 GSH Glutathione × 2 SO4 SULFATE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；295 K；PEG 8000, calcium chloride, glutathione, (R,R)-1,4-dithiothreitol, 2-[N-morpholino]ethanesulphonic acid, pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295K	分辨率 1.86 Å R-free 0.224
1MD3 A folding mutant of human class pi glutathione transferase, created by mutating glycine 146 of the wild-type protein to alanine 提交 2002-08-06	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1–209（209 aa）链 B 1–209（209 aa）	突变：G145A 突变：G145A	MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 2 GSH Glutathione × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.6；295 K；MES, PEG 8000, calcium chloride, DTT(dithiothreitol), glutathione(reduced), pH 5.6, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295K	分辨率 2.03 Å R-free 0.218
1MD4 A folding mutant of human class pi glutathione transferase, created by mutating glycine 146 of the wild-type protein to valine 提交 2002-08-06	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1–209（209 aa）链 B 1–209（209 aa）	突变：G145V 突变：G145V	MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 2 GSH Glutathione × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.4；295 K；MES, PEG 8000, calcium chloride, DTT(dithiothreitol), glutathione(reduced), pH 5.4, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295K	分辨率 2.10 Å R-free 0.235
1PGT CRYSTAL STRUCTURE OF HUMAN GLUTATHIONE S-TRANSFERASE P1-1[V104] COMPLEXED WITH S-HEXYLGLUTATHIONE 提交 1997-02-17	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1–210（210 aa）链 B 1–210（210 aa）	突变：VAL 104 VARIANT 突变：VAL 104 VARIANT	GTX S-HEXYLGLUTATHIONE × 2 EPE 4-(2-HYDROXYETHYL)-1-PIPERAZINE ETHANESULFONIC ACID × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；CRYSTALS WERE GROWN IN HANGING DROPS WHICH INITIALLY CONSISTED OF 5.9 MG/ML PROTEIN IN 0.1 M HEPES BUFFER (PH 6.5) CONTAINING 8.3 MM S-HEXYLGLUTATHIONE AND 1.0 M BUFFERED (PH 6.5) AMMONIUM SULFATE. THE DROPS WERE EQUILIBRATED AT 293 K AGAINST WELL SOLUTION CONTAINING BETWEEN 1.9 - 2.0 M AMMONIUM SULFATE IN 0.1 M HEPES BUFFER (PH 6.5)., vapor diffusion - hanging drop	分辨率 1.80 Å
1PX6 A folding mutant of human class pi glutathione transferase, created by mutating aspartate 153 of the wild-type protein to asparagine 提交 2003-07-02	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1–209（209 aa）链 B 1–209（209 aa）	突变：D152N 突变：D152N	MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 2 GSH Glutathione × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；295 K；MES, PEG 8000, CALCIUM CHLORIDE, DTT(DITHIOTHREITOL), GLUTATHIONE(REDUCED), pH 5.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295K	分辨率 2.10 Å R-free 0.235
1PX7 A folding mutant of human class pi glutathione transferase, created by mutating aspartate 153 of the wild-type protein to glutamate 提交 2003-07-02	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1–209（209 aa）链 B 1–209（209 aa）	突变：D152E 突变：D152E	MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 2 GSH Glutathione × 2 CA CALCIUM ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.6；295 K；MES, PEG 8000, CALCIUM CHLORIDE, DTT(DITHIOTHREITOL), GLUTATHIONE(REDUCED), pH 5.6, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295K	分辨率 2.03 Å R-free 0.218
1ZGN Crystal Structure of the Glutathione Transferase Pi in Complex with Dinitrosyl-diglutathionyl Iron Complex 提交 2005-04-21	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1–209（209 aa）链 B 1–209（209 aa）	未记录	FE FE (III) ION × 2 MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 2 GSH Glutathione × 2 NO NITRIC OXIDE × 4	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；295.15 K；MES, PEG 8000, Calcuim chloride, DTT, GSH, pH 5.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295.15K	分辨率 2.10 Å R-free 0.244
20GS GLUTATHIONE S-TRANSFERASE P1-1 COMPLEXED WITH CIBACRON BLUE 提交 1997-12-16	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1–209（209 aa）链 B 1–209（209 aa）	未记录	MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 2 CBD CIBACRON BLUE × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 vapor diffusion - hanging drop - streak seeding；pH 6；CRYSTALLISATION PERFORMED USING THE HANGING DROP TECHNIQUE. 2 MICROL OF PROTEIN SOLUTION (8MG/ML) IN 10MM PHOSPHATE BUFFER PH7.0, 1MM EDTA AND 2MM BETA-MERCAPTOETHANOL WAS ADDED TO 2 MICROL OF RESERVOIR SOLUTION. THE RESERVOIR CONTAINED 20-25% AMMONIUM SULFATE, 30-60 MM DITHIOTHREITOL AND 100MM MORPHOLINOETHANESULFONIC ACID BUFFER PH5.4. DROPS WERE STREAK SEEDED AFTER 1 DAY USING A CAT'S WHISKER FROM CRYSTALS GROWN UNDER SIMILAR CONDITIONS. SOLID CIBACRON BLUE WAS SEEDED INTO THE DROP. SIX WEEKS LATER THE CRYSTALS WERE SUBJECTED TO X-RAY ANALYSIS., pH 6.0, vapor diffusion - hanging drop - streak seeding	分辨率 2.45 Å R-free 0.280
22GS HUMAN GLUTATHIONE S-TRANSFERASE P1-1 Y49F MUTANT 提交 1998-03-10	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1–209（209 aa）链 B 1–209（209 aa）	突变：Y49F 突变：Y49F	MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 3	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 5.4；pH 5.4	分辨率 1.90 Å R-free 0.230
2A2R Crystal Structure of Glutathione Transferase Pi in complex with S-nitrosoglutathione 提交 2005-06-23	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1–209（209 aa）链 B 1–209（209 aa）	未记录	MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 2 GSN 2-AMINO-5-[1-(CARBOXYLATOMETHYLCARBAMOYL)-2-NITROSOSULFANYL-ETHYL]AMINO-5-OXO-PENTANOATE × 2 CA CALCIUM ION × 1 CO3 CARBONATE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；295.15 K；MES, PEG 8000, Calcium Chloride, DTT, GSH, pH 5.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295.15K	分辨率 1.40 Å R-free 0.213
2A2S Crystal Structure of Human Glutathione Transferase in complex with S-nitrosoglutathione in the absence of reducing agent 提交 2005-06-23	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1–209（209 aa）链 B 1–209（209 aa）	未记录	MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 2 GSN 2-AMINO-5-[1-(CARBOXYLATOMETHYLCARBAMOYL)-2-NITROSOSULFANYL-ETHYL]AMINO-5-OXO-PENTANOATE × 2 CA CALCIUM ION × 1 CO3 CARBONATE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；295.15 K；MES, PEG 8000, Calcium chloride, GSNO, pH 5.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295.15K	分辨率 1.70 Å R-free 0.208
2GSS HUMAN GLUTATHIONE S-TRANSFERASE P1-1 IN COMPLEX WITH ETHACRYNIC ACID 提交 1996-10-29	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1–209（209 aa）链 B 1–209（209 aa）	未记录	SO4 SULFATE ION × 1 EAA ETHACRYNIC ACID × 2 MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 3	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 5.4；pH 5.4	分辨率 1.90 Å R-free 0.229
2J9H Crystal structure of human glutathione-S-transferase P1-1 cys-free mutant in complex with S-hexylglutathione at 2.4 A resolution 提交 2006-11-08	突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 2–210（209 aa）链 B 2–210（209 aa）	突变：YES 突变：YES	GTX S-HEXYLGLUTATHIONE × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.4；SITTING DROP VAPOUR TECHNIQUE, 1 MICROLITRE OF PROTEIN AT 10 MG/ML IN 20 MM TRIS-HCL, PH 8.0 CONTAINING 5MM S-HEXYLGLUTATHIONE WAS MIXED WITH 1 MICROLITRE OF RESERVOIR SOLUTION, COMPOSED OF 1.5M AMMONIUM SULFATE AND 100MM SODIUM CITRATE	分辨率 2.40 Å R-free 0.310
2PGT CRYSTAL STRUCTURE OF HUMAN GLUTATHIONE S-TRANSFERASE P1-1[V104] COMPLEXED WITH (9R,10R)-9-(S-GLUTATHIONYL)-10-HYDROXY-9,10-DIHYDROPHENANTHRENE 提交 1997-02-17	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1–210（210 aa）链 B 1–210（210 aa）	突变：VAL 104 VARIANT 突变：VAL 104 VARIANT	SO4 SULFATE ION × 1 GPR (9R,10R)-9-(S-GLUTATHIONYL)-10-HYDROXY-9,10-DIHYDROPHENANTHRENE × 2 EPE 4-(2-HYDROXYETHYL)-1-PIPERAZINE ETHANESULFONIC ACID × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；CRYSTALS WERE GROWN IN HANGING DROPS WHICH INITIALLY CONSISTED OF 5.9 MG/ML PROTEIN IN 0.1 M HEPES BUFFER (PH 7.0) CONTAINING 8.3 MM S-HEXYLGLUTATHIONE AND 1.0 M BUFFERED (PH 7.0) AMMONIUM SULFATE. THE DROPS WERE EQUILIBRATED AT 293 K AGAINST WELL SOLUTION CONTAINING BETWEEN 1.9 - 2.0 M AMMONIUM SULFATE IN 0.1 M HEPES BUFFER (PH 7.0)., vapor diffusion - hanging drop	分辨率 1.90 Å
3CSH Crystal Structure of Glutathione Transferase Pi in complex with the Chlorambucil-Glutathione Conjugate 提交 2008-04-09	突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 2–210（209 aa）链 B 2–210（209 aa）	未记录	CL CHLORIDE ION × 2 MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 2 LZ6 L-gamma-glutamyl-S-(2-{[4-(3-carboxypropyl)phenyl](2-chloroethyl)amino}ethyl)-L-cysteinylglycine × 2 GSH Glutathione × 2 CA CALCIUM ION × 1 SO4 SULFATE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；295 K；Solid chlorambucil was added to preformed GST crystals cocrystallised with glutathione , pH 5.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295K	分辨率 1.55 Å R-free 0.200
3CSI Crystal Structure of the Glutathione Transferase Pi allelic variant*C, I104V/A113V, in complex with the Chlorambucil-Glutathione Conjugate 提交 2008-04-09	突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 C 2–210（209 aa）链 D 2–210（209 aa）	突变：I105V, A114V 突变：I105V, A114V	CL CHLORIDE ION × 2 MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 1 LZ6 L-gamma-glutamyl-S-(2-{[4-(3-carboxypropyl)phenyl](2-chloroethyl)amino}ethyl)-L-cysteinylglycine × 2 GSH Glutathione × 2 CA CALCIUM ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；295 K；Resevior solution contained: 100mM MES, 22% PEG 8000, 20mM CaCl2, 10mM DTT and 10mM GSH. Soaking conditions as above, minus DTT, plus 2mM Chlorambucil dissolved in ethanol., pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295K	分辨率 1.90 Å R-free 0.222
3CSI Crystal Structure of the Glutathione Transferase Pi allelic variant*C, I104V/A113V, in complex with the Chlorambucil-Glutathione Conjugate 提交 2008-04-09	突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 2–210（209 aa）链 B 2–210（209 aa）	突变：I105V, A114V 突变：I105V, A114V	CL CHLORIDE ION × 2 MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 2 LZ6 L-gamma-glutamyl-S-(2-{[4-(3-carboxypropyl)phenyl](2-chloroethyl)amino}ethyl)-L-cysteinylglycine × 2 GSH Glutathione × 2 CO3 CARBONATE ION × 1 CA CALCIUM ION × 1 SO4 SULFATE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；295 K；Resevior solution contained: 100mM MES, 22% PEG 8000, 20mM CaCl2, 10mM DTT and 10mM GSH. Soaking conditions as above, minus DTT, plus 2mM Chlorambucil dissolved in ethanol., pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295K	分辨率 1.90 Å R-free 0.222
3CSJ Human glutathione s-transferase p1-1 in complex with chlorambucil 提交 2008-04-09	突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 2–210（209 aa）链 B 2–210（209 aa）	未记录	CL CHLORIDE ION × 1 MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 2 CBL CHLORAMBUCIL × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.4；277 K；Resevior solution contained: 25% (w/v) ammonium sulfate, 60mM DTT, 100mM MES and 10% (v/v) glycerol. Solid chlorambucil was streaked into the drop., pH 5.4, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K	分辨率 1.90 Å R-free 0.233
3DD3 Crystal Structure of the Glutathione Transferase Pi enzyme in complex with the bifunctional inhibitor, Etharapta 提交 2008-06-05	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1–210（210 aa）链 B 1–210（210 aa）	未记录	MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 2 RUC (eta6-benzene)ruthenium × 1 GSH Glutathione × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；298 K；100mM MES buffer pH 5.5 or 6.0, 22%(w/v) PEG 8000, 20mM CaCl2, 10mM DTT, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K	分辨率 2.25 Å R-free 0.260
3DGQ Crystal structure of the glutathione transferase PI enzyme in complex with the bifunctional inhibitor, etharapta 提交 2008-06-15	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1–210（210 aa）链 B 1–210（210 aa）	未记录	CL CHLORIDE ION × 2 EAA ETHACRYNIC ACID × 1 MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 2 CA CALCIUM ION × 1 SO4 SULFATE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；298 K；100mM MES BUFFER PH 5.5, 22%(W/V) PEG 8000, 20mM CACL2, 10mM DTT, Small amounts of solid compound were streaked through the drops containing preformed crystals. These were soaked for 48hours., VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K	分辨率 1.60 Å R-free 0.227
3GSS HUMAN GLUTATHIONE S-TRANSFERASE P1-1 IN COMPLEX WITH ETHACRYNIC ACID-GLUTATHIONE CONJUGATE 提交 1996-10-29	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1–209（209 aa）链 B 1–209（209 aa）	未记录	SO4 SULFATE ION × 1 GSH Glutathione × 2 EAA ETHACRYNIC ACID × 2 MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 5.2；pH 5.2	分辨率 1.90 Å R-free 0.233
3GUS Crystal strcture of human Pi class glutathione S-transferase GSTP1-1 in complex with 6-(7-Nitro-2,1,3-benzoxadiazol-4-ylthio)hexanol (NBDHEX) 提交 2009-03-30	突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 2–210（209 aa）链 B 2–210（209 aa）	未记录	GSH Glutathione × 2 N11 6-[(7-nitro-2,1,3-benzoxadiazol-4-yl)sulfanyl]hexan-1-ol × 2 MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 2 SO4 SULFATE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；277 K；1.8M Ammonium sulfate, 100mM MES, pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K	分辨率 1.53 Å R-free 0.195
3HJM Crystal structure of human Glutathione Transferase Pi Y108V mutant 提交 2009-05-22	突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 2–210（209 aa）链 B 2–210（209 aa）	突变：Y108V 突变：Y108V	MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 2 CA CALCIUM ION × 2 CO3 CARBONATE ION × 3 CL CHLORIDE ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.4；298 K；270mM Calcium Acetate, 20% PEG8000, 100mM MES, pH5.4, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K	分辨率 2.10 Å R-free 0.230
3HJM Crystal structure of human Glutathione Transferase Pi Y108V mutant 提交 2009-05-22	突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 C 2–210（209 aa）链 D 2–210（209 aa）	突变：Y108V 突变：Y108V	MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 1 CA CALCIUM ION × 3 CO3 CARBONATE ION × 2 CL CHLORIDE ION × 1 PO4 PHOSPHATE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.4；298 K；270mM Calcium Acetate, 20% PEG8000, 100mM MES, pH5.4, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K	分辨率 2.10 Å R-free 0.230
3HJO Crystal Structure of Glutathione Transferase Pi Y108V Mutant in Complex with the Glutathione Conjugate of Ethacrynic Acid 提交 2009-05-22	突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 2–210（209 aa）链 B 2–210（209 aa）	突变：Y108V 突变：Y108V	GSH Glutathione × 2 EAA ETHACRYNIC ACID × 2 CA CALCIUM ION × 6 CO3 CARBONATE ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.4；298 K；133mM Calcium Acetate, 18% PEG8000, 100mM MES, pH5.4, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K	分辨率 1.95 Å R-free 0.210
3HKR Crystal Structure of Glutathione Transferase Pi Y108V Mutant 提交 2009-05-25	突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 2–210（209 aa）链 B 2–210（209 aa）	突变：Y108V 突变：Y108V	CA CALCIUM ION × 5 MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 2 CO3 CARBONATE ION × 3	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；298 K；267mM Calcium Acetate, 20% PEG8000, 100mM MES, pH6.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K	分辨率 1.80 Å R-free 0.210
3IE3 Structural basis for the binding of the anti-cancer compound 6-(7-Nitro-2,1,3-benzoxadiazol-4-ylthio)hexanol (NBDHEX) to human glutathione S-transferases 提交 2009-07-22	突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 2–210（209 aa）链 B 2–210（209 aa）	突变：I104A 突变：I104A	GSH Glutathione × 2 N11 6-[(7-nitro-2,1,3-benzoxadiazol-4-yl)sulfanyl]hexan-1-ol × 2 MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；277 K；1.8M AMMONIUM SULFATE, 100MM MES, pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K	分辨率 1.80 Å R-free 0.209
3KMN Crystal Structure of the Human Apo GST Pi C47S/Y108V Double Mutant 提交 2009-11-11	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 2–210（209 aa）链 B 2–210（209 aa）	突变：C47S, Y108V 突变：C47S, Y108V	CA CALCIUM ION × 6 CO3 CARBONATE ION × 2 PO4 PHOSPHATE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；298 K；7.5mg/ml C47S/Y108V GST, 22% (w/v) PEG 8000, 100mM MES pH 6.0, 350mM Ca acetate, 10mM DTT, vapor diffusion, hanging drop, temperature 298K	分辨率 1.80 Å R-free 0.210
3KMO Crystal Structure of the Human GST Pi C47S/Y108V Double Mutant in Complex with the Ethacrynic Acid-Glutathione Conjugate (Grown in the Absence of the Reducing Agent DTT) 提交 2009-11-11	结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 2–210（209 aa）链 B 2–210（209 aa）	突变：C47S, Y108V 突变：C47S, Y108V	GSH Glutathione × 2 CA CALCIUM ION × 6 EAA ETHACRYNIC ACID × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；298 K；4mg/ml, 267mM calcium acetate, 100mM MES pH 6.0, 20% (w/v) PEG 8000 , VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K	分辨率 2.60 Å R-free 0.254
3N9J Structure of human Glutathione Transferase Pi class in complex with Ethacraplatin 提交 2010-05-30	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1–210（210 aa）链 B 1–210（210 aa）	未记录	PT PLATINUM (II) ION × 1 MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 2 EAA ETHACRYNIC ACID × 2 CA CALCIUM ION × 3 CL CHLORIDE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；293 K；100mM MES, pH 5.5, pH 6.0, 28% (w/v) PEG 8000, 20mM CaCl2 10mM DTT, 3mM EACPT, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 1.85 Å R-free 0.218
3PGT CRYSTAL STRUCTURE OF HGSTP1-1[I104] COMPLEXED WITH THE GSH CONJUGATE OF (+)-ANTI-BPDE 提交 1999-03-22	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1–210（210 aa）链 B 1–210（210 aa）	未记录	SO4 SULFATE ION × 7 GBX 2-AMINO-4-[1-(CARBOXYMETHYL-CARBAMOYL)-2-(9-HYDROXY-7,8-DIOXO-7,8,9,10-TETRAHYDRO-BENZO[DEF]CHRYSEN-10-YLSULFANYL)-ETHYLCARBAMOYL]-BUTYRIC ACID × 2 MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 4	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 6.5；pH 6.5	分辨率 2.14 Å R-free 0.159
4GSS HUMAN GLUTATHIONE S-TRANSFERASE P1-1 Y108F MUTANT 提交 1997-01-20	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1–209（209 aa）链 B 1–209（209 aa）	突变：Y108F 突变：Y108F	GTX S-HEXYLGLUTATHIONE × 2 MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 6；pH 6.0	分辨率 2.50 Å R-free 0.262
4PGT CRYSTAL STRUCTURE OF HGSTP1-1[V104] COMPLEXED WITH THE GSH CONJUGATE OF (+)-ANTI-BPDE 提交 1999-03-22	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1–210（210 aa）链 B 1–210（210 aa）	突变：VAL 104 VARIANT 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）突变：VAL 104 VARIANT 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	SO4 SULFATE ION × 2 GBX 2-AMINO-4-[1-(CARBOXYMETHYL-CARBAMOYL)-2-(9-HYDROXY-7,8-DIOXO-7,8,9,10-TETRAHYDRO-BENZO[DEF]CHRYSEN-10-YLSULFANYL)-ETHYLCARBAMOYL]-BUTYRIC ACID × 2 MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 6；CRYSTALS WERE GROWN IN HANGING DROPS WHICH INITIALLY CONSISTED OF 4.3 MG/ML PROTEIN, 0.55 MM GSH CONJUGATE OF (+)-ANTI-BPDE, 0.8 M AMMONIUM SULFATE IN 50 MM MES BUFFER (PH 6.0). THE DROPS WERE EQUILIBRATED AT 293 K AGAINST WELL SOLUTION CONTAINING 1.6 M AMMONIUM SULFATE IN 0.1 M MES BUFFER (PH 6.0).	分辨率 2.10 Å R-free 0.179
5DAK Crystal Structure of human Glutathione Transferase Pi complexed with a metalloid in the absence of Glutathione 提交 2015-08-20	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1–210（210 aa）链 B 1–210（210 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 2 ARS ARSENIC × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；100MM MES, PH 6.0, 28% (W/V) PEG 8000, 20MM CACL2 10MM DTT. Soaked in 2mM PAO dissolved in DMSO	分辨率 2.11 Å R-free 0.204
5DAL Crystal Structure of human Glutathione Transferase Pi complexed with a metalloid in the presence of Glutathione 提交 2015-08-20	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1–210（210 aa）链 B 1–210（210 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 2 5AU Di-glutathione-PhenylArsine × 2 GSH Glutathione × 2 PA0 Phenylarsine oxide × 2 SO4 SULFATE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；293 K；100MM MES, PH 6.0, 28% (W/V) PEG 8000, 20MM CACL2, 10MM DTT, 10MM GSH. Soaked in 2MM PAO dissolved in DMSO	分辨率 1.50 Å R-free 0.212
5DCG Crystal Structure of WT Apo Human Glutathione Transferase Pi 提交 2015-08-24	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1–210（210 aa）链 B 1–210（210 aa）	未记录	MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 2 PO4 PHOSPHATE ION × 2 CA CALCIUM ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；293 K；100MM MES, PH 6.0, 28% (W/V) PEG 8000, 20MM CACL2, 10MM DTT	分辨率 2.01 Å R-free 0.190
5DDL Crystal Structure of WT Human Glutathione Transferase Pi soaked with a metalloid then back-soaked with glutathione 提交 2015-08-25	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1–210（210 aa）链 B 1–210（210 aa）	未记录	MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 2 5AU Di-glutathione-PhenylArsine × 2 GSH Glutathione × 2 SO4 SULFATE ION × 1 CA CALCIUM ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；293 K；100MM MES, PH 6.0, 28% (W/V) PEG 8000, 20MM CACL2, 10MM DTT. Soaked in 2mM PAO dissolved in DMSO, Then back soaked in 10mM GSH after 2 days	分辨率 1.98 Å R-free 0.178
5DJL Structure of WT Human Glutathione Transferase in complex with cisplatin in the presence of glutathione. 提交 2015-09-02	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1–210（210 aa）链 B 1–210（210 aa）	未记录	MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 2 PT PLATINUM (II) ION × 3 GSH Glutathione × 2 CA CALCIUM ION × 2 CO3 CARBONATE ION × 1 SO4 SULFATE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；100MM MES, PH 5.5, PH 6.0, 28% (W/V) PEG 8000, 20MM CACL2 10MM DTT, 10MM GSH. Soaked in 0.1MM Cisplatin for 24hrs.	分辨率 1.80 Å R-free 0.177
5DJM Structure of WT Human Glutathione Transferase in complex with cisplatin in the absence of glutathione. 提交 2015-09-02	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1–210（210 aa）链 B 1–210（210 aa）	未记录	MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 2 PT PLATINUM (II) ION × 3	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；100MM MES, PH 5.5, PH 6.0, 28% (W/V) PEG 8000, 20MM CACL2 10MM DTT. Soaked in 0.1MM Cisplatin for 24hrs	分辨率 1.90 Å R-free 0.240
5GSS HUMAN GLUTATHIONE S-TRANSFERASE P1-1, COMPLEX WITH GLUTATHIONE 提交 1997-08-11	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1–209（209 aa）片段：TWO INTACT MONOMERS 链 B 1–209（209 aa）片段：TWO INTACT MONOMERS	未记录	GSH Glutathione × 2 MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 3	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 5.8；pH 5.8	分辨率 1.95 Å R-free 0.255
5J41 Glutathione S-transferase bound with hydrolyzed Piperlongumine 提交 2016-03-31	突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 2–210（209 aa）链 B 2–210（209 aa）	未记录	3LF 3-(3,4,5-trimethoxyphenyl)propanoic acid × 2 GSH Glutathione × 2 MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；1.6M ammonium sulfate, 100mM MES pH 6.5	分辨率 1.19 Å R-free 0.186
5JCW Crystal Structure of hGSTP1-1 with Glutathione Adduct of Phenethyl Isothiocyanate 提交 2016-04-15	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1–210（210 aa）链 B 1–210（210 aa）	未记录	GVX L-gamma-glutamyl-S-[(2-phenylethyl)carbamothioyl]-L-cysteinylglycine × 2 MPD (4S)-2-METHYL-2,4-PENTANEDIOL × 2 ACT ACETATE ION × 2 CA CALCIUM ION × 8 GSH Glutathione × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；293 K；PEG 8000, MES, Ca(OAC)2	分辨率 1.95 Å R-free 0.193
5L6X CRYSTAL STRUCTURE OF HGSTP1-1 COMPLEXED WITH FERROCENE-GLUTATHIONE CONJUGATE 提交 2016-06-01	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1–210（210 aa）链 B 1–210（210 aa）	突变：P2A 突变：P2A	AZI AZIDE ION × 11 6SG S-[N-(ferrocenylmethyl)carbamoylmethyl]-glutathione × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；298 K；100 mM HEPES pH 6, 10 mM DTT, 100 mM CaCl2, 30% PEG 6000, Ligand was soaked o/n prior diffraction	分辨率 2.00 Å R-free 0.213
5X79 Human GST Pi conjugated with novel inhibitor, GS-ESF 提交 2017-02-24	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1–210（210 aa）链 B 1–210（210 aa）	未记录	GF5 (2S)-2-azanyl-5-[[(2R)-3-(2-fluorosulfonylethylsulfanyl)-1-(2-hydroxy-2-oxoethylamino)-1-oxidanylidene-propan-2-yl]amino]-5-oxidanylidene-pentanoic acid × 2 MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；277 K；100 mM MES, pH 6.0, 22% PEG8000, 20 mM calcium chloride, 10 mM DTT	分辨率 1.90 Å R-free 0.242
6AP9 Crystal Structure of hGSTP1-1 with S-nitrosation of Cys101 提交 2017-08-17	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1–210（210 aa）链 B 1–210（210 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	GSH Glutathione × 2 GDS OXIDIZED GLUTATHIONE DISULFIDE × 2 MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 2 ACT ACETATE ION × 2 CA CALCIUM ION × 5	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；293 K；PEG 8000, MES, Ca(OAc)2	分辨率 1.55 Å R-free 0.181
6GSS HUMAN GLUTATHIONE S-TRANSFERASE P1-1, COMPLEX WITH GLUTATHIONE 提交 1997-08-13	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1–209（209 aa）片段：TWO INTACT MONOMERS 链 B 1–209（209 aa）片段：TWO INTACT MONOMERS	未记录	GSH Glutathione × 2 MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 5.4；pH 5.4	分辨率 1.90 Å R-free 0.218
6LLX Discovery of A Dual Inhibitor of NQO1 and GSTP1 for Treating Malignant Glioblastoma 提交 2019-12-24	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–210（210 aa）	未记录	GSH Glutathione × 1 MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.1M MES PH5.8 ,30% PEG6000 ,10mM DTT	分辨率 1.58 Å R-free 0.223
6LLX Discovery of A Dual Inhibitor of NQO1 and GSTP1 for Treating Malignant Glioblastoma 提交 2019-12-24	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 1–210（210 aa）	未记录	GSH Glutathione × 1 MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.1M MES PH5.8 ,30% PEG6000 ,10mM DTT	分辨率 1.58 Å R-free 0.223
6Y1E Crystal structure of human glutathione transferase P1-1 (hGSTP1-1) that was co-crystallised in the presence of indanyloxyacetic acid-94 (IAA-94) 提交 2020-02-12	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1–210（210 aa）链 B 1–210（210 aa）	未记录	GSH Glutathione × 2 MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 3 O7Z 2-[[6,7-bis(chloranyl)-2-cyclopentyl-2-methyl-1-oxidanylidene-3~{H}-inden-5-yl]oxy]ethanoic acid × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；293 K；10 mg/ml hGSTP1-1 (50 mM dipotassium phosphate, 1.5 mM EDTA, 10 mM DTT, 10 mM GSH and 0.02 % (w/v) sodium azide, pH 7.0) with 3.5 mM IAA-94 (5% DMSO (v/v)) was crystallized in 100 mM MES and 16 % (w/v) PEG-6000, pH 6.5. The crystals were harvested and then immersed two to three times in 100% (v/v) Parabar 10312 (Paratone)	分辨率 1.40 Å R-free 0.251
6Y1E Crystal structure of human glutathione transferase P1-1 (hGSTP1-1) that was co-crystallised in the presence of indanyloxyacetic acid-94 (IAA-94) 提交 2020-02-12	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 C 1–210（210 aa）链 D 1–210（210 aa）	未记录	GSH Glutathione × 2 MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 3 O7Z 2-[[6,7-bis(chloranyl)-2-cyclopentyl-2-methyl-1-oxidanylidene-3~{H}-inden-5-yl]oxy]ethanoic acid × 1 PGE TRIETHYLENE GLYCOL × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；293 K；10 mg/ml hGSTP1-1 (50 mM dipotassium phosphate, 1.5 mM EDTA, 10 mM DTT, 10 mM GSH and 0.02 % (w/v) sodium azide, pH 7.0) with 3.5 mM IAA-94 (5% DMSO (v/v)) was crystallized in 100 mM MES and 16 % (w/v) PEG-6000, pH 6.5. The crystals were harvested and then immersed two to three times in 100% (v/v) Parabar 10312 (Paratone)	分辨率 1.40 Å R-free 0.251
7BIA Crystal structure of human GSTP1 bound to iberin 提交 2021-01-12	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1–210（210 aa）链 B 1–210（210 aa）	未记录	MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 2 GSH Glutathione × 2 TVQ 1-isothiocyanato-3-methylsulfinyl-propane × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；0.1M MES pH 6.0, 25% PEG8000, 0.02M CaCl2, 5mM DTT	分辨率 1.73 Å R-free 0.214
7GSS Human glutathione S-transferase P1-1, complex with glutathione 提交 1997-08-13	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1–209（209 aa）片段：TWO INTACT MONOMERS 链 B 1–209（209 aa）片段：TWO INTACT MONOMERS	未记录	GSH Glutathione × 2 MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 6.2；pH 6.2	分辨率 2.20 Å R-free 0.259
7XBA Glutathione S-transferase bound with a covalent inhibitor 提交 2022-03-21	突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 2–210（209 aa）链 B 2–210（209 aa）	未记录	GSH Glutathione × 1 HJ6 3-[3-[[2-[5-[(3,5-dimethyl-4-nitro-pyrazol-1-yl)methyl]furan-2-yl]-5-(methylcarbamoyl)benzimidazol-1-yl]methyl]azetidin-1-yl]sulfonylbenzenesulfonic acid × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；289 K；Magnesium acetate tetrahydrate, Sodium cacodylate trihydrate pH 6.5, Polyethylene glycol 8000	分辨率 2.83 Å R-free 0.248
8GSS Human glutathione S-transferase P1-1, complex with glutathione 提交 1997-08-14	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1–209（209 aa）片段：THREE INTACT MONOMERS 链 B 1–209（209 aa）片段：THREE INTACT MONOMERS	未记录	SO4 SULFATE ION × 1 GSH Glutathione × 2 MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 5.4；pH 5.4	分辨率 1.90 Å R-free 0.229
8GSS Human glutathione S-transferase P1-1, complex with glutathione 提交 1997-08-14	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 C 1–209（209 aa）片段：THREE INTACT MONOMERS	未记录	SO4 SULFATE ION × 2 GSH Glutathione × 2 MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 5.4；pH 5.4	分辨率 1.90 Å R-free 0.229
9GSS HUMAN GLUTATHIONE S-TRANSFERASE P1-1, COMPLEX WITH S-HEXYL GLUTATHIONE 提交 1997-08-14	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1–209（209 aa）片段：TWO INTACT MONOMERS 链 B 1–209（209 aa）片段：TWO INTACT MONOMERS	未记录	SO4 SULFATE ION × 1 GTX S-HEXYLGLUTATHIONE × 2 MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 6；pH 6.0	分辨率 1.97 Å R-free 0.232

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查看构建体与数据证据

UniProt名称	GSTP1_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 1–209； UniProt 2–210 作者链 B； PDB构建体 1–209； UniProt 2–210

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SAXS 散射曲线 SAXS Profile

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

下载 Download SAXS (.dat) P(r) (.pr.out) CIF

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	3km6
沉积日期 deposition_date	2009-11-10
结构标题 title	Crystal Structure of the Human GST Pi C47S/Y108V Double Mutant in Complex with the Ethacrynic Acid-Glutathione Conjugate
关键词 keywords	TRANSFERASE, GLUTATHIONE, DETOXIFICATION, DOUBLE MUTANT, ETHACRYNIC ACID, DIURETIC DRUG, DIMER INTERFACE; TRANSFERASE
实验方法 method	X-RAY DIFFRACTION

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3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

回转半径 Rg (Guinier) rg_guinier	21.95 Å
回转半径 Rg (电子) rg_electron	20.88 Å
零角强度 I(0) i0	36021400.00
分子量 molecular_weight	47647.0 kDa
排除体积 excluded_volume	60167 Å³
包络体积 envelope_volume	68874 Å³
水化壳体积 shell_volume	26449 Å³
包络直径 envelope_diameter	66.7 Å
壳层 Rg shell_rg	28.37 Å
包络 Rg envelope_rg	20.99 Å
形状 Rg shape_rg	20.86 Å
总 Rg total_rg	21.87 Å
总原子数 total_atoms	3343
残基数 n_residues	417
球谐函数阶数 n_harmonics	20
q 范围 q_range	— – 0.5000 Å⁻¹
数据点数 n_points	101
壳层类型 shell_type	directional
溶剂电子密度 solvent_density	0.3340 e/Å³
壳层衬度 contrast_shell	0.0300 e/Å³
CRYSOL 版本 crysol_version	4.1.3

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4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

最大尺寸 Dmax dmax	64.7 Å
Rg (实空间) rg_real	21.76 Å
Rg 误差 (实空间) rg_real_error	0.23 Å
I(0) (实空间) i0_real	3.6020e+07
I(0) 误差 (实空间) i0_real_error	4.5300e+05
Rg (倒空间) rg_reciprocal	21.80 Å
I(0) (倒空间) i0_reciprocal	36020000.0000
解质量估计 total_estimate	0.9075
解质量评级 solution_quality	EXCELLENT a EXCELLENT solution
P(r) 峰数 n_peaks	2
主峰位置 r_peak_primary	28.0 Å
偏度 Skewness skewness	0.091
峰度 Kurtosis kurtosis	-0.516
角度范围 angular_range	— – 0.3600 Å⁻¹
当前正则化参数 α current_alpha	0.0000
最高正则化参数 α highest_alpha	10720000.0000
实空间数据点数 n_real_points	68
GNOM 版本 gnom_version	4.1.3
质量判据 quality_criteria	AN1: 0.000; Oscil: 0.946; Stabil: 1.000; Sysdev: 1.000; Positv: 1.000; Valcen: 0.976; Smooth: 0.981

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5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

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6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (5)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	Glutathione S-transferase P
分子量 formula_weight	23166.5 kDa
EC 编号 ec_number	2.5.1.18
突变 mutation	C47S, Y108V
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A,B
原子数 atom_count	3823

PPYTVVYFPVRGRCAALRMLLADQGQSWKEEVVTVETWQEGSLKASSLYGQLPKFQDGDLTLYQSNTILRHLGRTLGLYGKDQQEAALVDMVNDGVEDLRCKYISLIVTNYEAGKDDYVKALPGQLKPFETLLSQNQGGKTFIVGDQISFADYNLLDLLLIHEVLAPGCLDAFPLLSAYVGRLSARPKLKAFLASPEYVNLPINGNGKQ

来源 Source

来源生物 organism	Homo sapiens
通用名 common_name	human
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9606
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

实体 2 Entity 2 non-polymer

描述 description	ETHACRYNIC ACID
分子量 formula_weight	303.1 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	2

实体 3 Entity 3 non-polymer

描述 description	GLUTATHIONE
分子量 formula_weight	307.3 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	2

实体 4 Entity 4 non-polymer

描述 description	CALCIUM ION
分子量 formula_weight	40.1 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	6

实体 5 Entity 5 water

描述 description	water
分子量 formula_weight	18.0 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	477

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7. 折叠分类 (SCOP + CATH) 8 domains

SCOP 2.08 (4 domains)

结构域编号 domain_id	d3km6a1
类 Class class	c — Alpha and beta proteins (a/b)
折叠类型 Fold fold	c.47 — Thioredoxin fold
超家族 Superfamily superfamily	c.47.1 — Thioredoxin-like
家族 Family family	c.47.1.0 — automated matches

结构域编号 domain_id	d3km6a2
类 Class class	a — All alpha proteins
折叠类型 Fold fold	a.45 — GST C-terminal domain-like
超家族 Superfamily superfamily	a.45.1 — GST C-terminal domain-like
家族 Family family	a.45.1.1 — Glutathione S-transferase (GST), C-terminal domain

结构域编号 domain_id	d3km6b1
类 Class class	c — Alpha and beta proteins (a/b)
折叠类型 Fold fold	c.47 — Thioredoxin fold
超家族 Superfamily superfamily	c.47.1 — Thioredoxin-like
家族 Family family	c.47.1.0 — automated matches

结构域编号 domain_id	d3km6b2
类 Class class	a — All alpha proteins
折叠类型 Fold fold	a.45 — GST C-terminal domain-like
超家族 Superfamily superfamily	a.45.1 — GST C-terminal domain-like
家族 Family family	a.45.1.1 — Glutathione S-transferase (GST), C-terminal domain

CATH v4.4 (4 domains)

结构域编号 domain_id	3km6A01
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	40 — 3-Layer(aba) Sandwich
拓扑 Topology topology	30 — Glutaredoxin
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Glutaredoxin

结构域编号 domain_id	3km6A02
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	20 — Up-down Bundle
拓扑 Topology topology	1050 — Glutathione S-transferase Yfyf (Class Pi); Chain A, domain 2
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 —

结构域编号 domain_id	3km6B01
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	40 — 3-Layer(aba) Sandwich
拓扑 Topology topology	30 — Glutaredoxin
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Glutaredoxin

结构域编号 domain_id	3km6B02
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	20 — Up-down Bundle
拓扑 Topology topology	1050 — Glutathione S-transferase Yfyf (Class Pi); Chain A, domain 2
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 —

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8. 引用文献 (1)

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晶胞边长 a length_a	75.876 Å
晶胞边长 b length_b	89.242 Å
晶胞边长 c length_c	69.206 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	89.89 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	90.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	8

空间群 space_group	C 1 2 1
空间群编号 int_tables_number	5
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	2.100 Å
最低分辨率 resolution_low	44.630 Å
R 因子 r_factor	0.1550
R_work r_work	0.1530
R_free r_free	0.2060

fit	/app/data/saxs_computation/km/3km6/3km6.fit
pddf	/app/data/pr_computation/km/3km6/3km6.pr.out
profile	/app/data/saxs_computation/km/3km6/3km6.dat