Transcription factor BTF3
Homo sapiens
当前结构中的状态
| Assembly | 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与共同组分 | 实验方法与环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白拷贝数一致 | 链 A; UniProt 97–162 | 片段:UNP residues 97-162 | Nascent polypeptide-associated complex subunit alpha × 1 (Q13765) | X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件:VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 5.5;285 K;PEG 6000, Sodium citrate, pH 5.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 285K | 分辨率 2.50 Å R-free 0.253 |
数据库中的同蛋白其他状态
以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly, “相对当前条目”直接指出证据层面的不同;没有差异标签表示当前已读取字段一致。
| 其他 PDB | 相对当前条目 3LKX | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法与环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 28LN XBP1u-stalled RPL4 RNC in complex with NAC 提交 2026-02-05 | 构建体不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物;蛋白 × 80 PDB 声明:86-meric |
链 Bv
1–206(206 aa)
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 2.70 Å |
| 3MCB Crystal structure of NAC domains of human nascent polypeptide-associated complex (NAC) 提交 2010-03-29 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric |
链 B
97–154(58 aa)
片段:NAC domain (UNP RESIDUES 97-154)
|
未记录 | IOD IODIDE ION × 3 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION;pH 5.6;289 K;0.1M sodium citrate (pH 5.6), 0.1 M NaCl, 12% (w/v) PEG 4000, VAPOR DIFFUSION, temperature 289K
|
分辨率 1.90 Å R-free 0.247 |
| 7QWQ Ternary complex of ribosome nascent chain with SRP and NAC 提交 2022-01-25 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物;蛋白 × 48 PDB 声明:52-meric |
链 u
1–162(162 aa)
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 97 ZN ZINC ION × 5 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE-PROPANE
|
分辨率 2.83 Å |
| 7QWR Structure of the ribosome-nascent chain containing an ER signal sequence in complex with NAC 提交 2022-01-25 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物;蛋白 × 45 PDB 声明:48-meric |
链 u
1–162(162 aa)
|
未记录 | ZN ZINC ION × 5 MG MAGNESIUM ION × 97 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE-PROPANE
|
分辨率 2.90 Å |
| 9F1B Mammalian ternary complex of a translating 80S ribosome, NAC and NatA/E 提交 2024-04-18 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 异源复合物;蛋白 × 83 PDB 声明:89-meric |
链 Cu
45–206(162 aa)
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 420 ZN ZINC ION × 8 UNX UNKNOWN LIGAND × 306 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 SPD SPERMIDINE × 30 SPM SPERMINE × 3 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE-PROPANE
|
分辨率 3.01 Å |
| 9F1C Mammalian quaternary complex of a translating 80S ribosome, NAC, MetAP1 and NatA/E 提交 2024-04-18 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 异源复合物;蛋白 × 84 PDB 声明:90-meric |
链 Cu
45–206(162 aa)
|
未记录 | UNX UNKNOWN LIGAND × 277 MG MAGNESIUM ION × 420 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 SPD SPERMIDINE × 30 SPM SPERMINE × 3 ZN ZINC ION × 8 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE-PROPANE
|
分辨率 3.78 Å |
| 9F1D Mammalian quaternary complex of a translating 80S ribosome, NAC, MetAP1 and NatA/E-HYPK 提交 2024-04-18 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物;蛋白 × 85 PDB 声明:91-meric |
链 Cu
1–162(162 aa)
|
未记录 | UNX UNKNOWN LIGAND × 295 SPD SPERMIDINE × 30 MG MAGNESIUM ION × 420 SPM SPERMINE × 3 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 8 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE-PROPANE
|
分辨率 3.26 Å |
| 9FQ0 Human NatA-NAC-MAP1 80S ribosome complex 提交 2024-06-14 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物;蛋白 × 14 PDB 声明:hexadecameric |
链 D
1–206(206 aa)
|
未记录 | IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 4.67 Å |
| 9I2D NMT1-NAC bound human RNC with 10 amino acid ARF1-linker 提交 2025-01-20 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物;蛋白 × 82 PDB 声明:88-meric |
链 NB
1–162(162 aa)
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 191 ZN ZINC ION × 8 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.19 Å |
| 9I2E NMT1-NAC bound human ribosome (combined translational states) 提交 2025-01-20 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物;蛋白 × 81 PDB 声明:86-meric |
链 NB
1–162(162 aa)
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 256 ZN ZINC ION × 8 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.95 Å |
| 9MR4 NAC: Ribosome nascent chain complex(Oxa1L) 提交 2025-01-06 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物;蛋白 × 78 PDB 声明:84-meric |
链 EF
45–206(162 aa)
|
未记录 | ZN ZINC ION × 6 MG MAGNESIUM ION × 285 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.65 Å |
| 9NDP Structure of stalled ribosome and nascent chain in complex with NMT2 and NAC 提交 2025-02-18 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 异源复合物;蛋白 × 81 PDB 声明:87-meric |
链 EF
1–162(162 aa)
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 296 ZN ZINC ION × 6 COA COENZYME A × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.7
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.82 Å |
| 9P6Z In situ human P-Z state 80S ribosome 提交 2025-06-20 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物;蛋白 × 78 PDB 声明:84-meric |
链 CI
49–79(31 aa)
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 219 SPM SPERMINE × 7 SPD SPERMIDINE × 10 ZN ZINC ION × 6 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.97 Å |
| 9P72 In situ human P-E state 80S ribosome 提交 2025-06-20 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物;蛋白 × 78 PDB 声明:84-meric |
链 CI
49–79(31 aa)
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 219 SPM SPERMINE × 7 SPD SPERMIDINE × 10 ZN ZINC ION × 6 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.80 Å |
| 9P73 In situ human eEF2-A/P-P/E state 80S ribosome 提交 2025-06-20 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物;蛋白 × 79 PDB 声明:85-meric |
链 CI
49–79(31 aa)
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 218 ZN ZINC ION × 6 SPM SPERMINE × 7 SPD SPERMIDINE × 10 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.66 Å |
| 9P76 In situ human eEF1A-A/T-P state 80S ribosome 提交 2025-06-20 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物;蛋白 × 79 PDB 声明:85-meric |
链 CI
49–79(31 aa)
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 219 SPM SPERMINE × 7 SPD SPERMIDINE × 10 ZN ZINC ION × 6 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.83 Å |
| 9P78 In situ human Hibernating rotate 3 with E-site tRNA state 80S ribosome 提交 2025-06-20 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物;蛋白 × 81 PDB 声明:86-meric |
链 CI
49–79(31 aa)
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 218 SPM SPERMINE × 7 SPD SPERMIDINE × 10 ZN ZINC ION × 6 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.90 Å |
| 9P79 In situ human Hibernating rotate3 with Z site tRNA state 80S ribosome 提交 2025-06-20 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物;蛋白 × 81 PDB 声明:86-meric |
链 CI
49–79(31 aa)
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 218 SPM SPERMINE × 7 SPD SPERMIDINE × 10 ZN ZINC ION × 6 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.10 Å |
| 9P7A In situ human hibernating class2 80S ribosome 提交 2025-06-20 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物;蛋白 × 81 PDB 声明:86-meric |
链 CI
49–79(31 aa)
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 218 SPM SPERMINE × 7 SPD SPERMIDINE × 10 ZN ZINC ION × 6 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.81 Å |
| 9P7C In situ human Hibernating class3 80S ribosome 提交 2025-06-20 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物;蛋白 × 81 PDB 声明:86-meric |
链 CI
49–79(31 aa)
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 218 SPM SPERMINE × 7 SPD SPERMIDINE × 10 ZN ZINC ION × 6 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.78 Å |
| 9P7D In situ human Hibernating class4 80S ribosome 提交 2025-06-20 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物;蛋白 × 81 PDB 声明:86-meric |
链 CI
49–79(31 aa)
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 218 SPM SPERMINE × 7 SPD SPERMIDINE × 10 ZN ZINC ION × 6 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.57 Å |
| 9P7E In situ human Hibernating class5 80S ribosome 提交 2025-06-20 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物;蛋白 × 81 PDB 声明:86-meric |
链 CI
1–206(206 aa)
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 218 SPM SPERMINE × 7 SPD SPERMIDINE × 10 ZN ZINC ION × 6 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.59 Å |
| 9P7F In situ HHT and CHX treated A-P state 80S ribosome 提交 2025-06-20 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物;蛋白 × 78 PDB 声明:84-meric |
链 CI
49–79(31 aa)
|
未记录 | ZN ZINC ION × 6 MG MAGNESIUM ION × 219 SPM SPERMINE × 7 SPD SPERMIDINE × 10 3HE 4-{(2R)-2-[(1S,3S,5S)-3,5-dimethyl-2-oxocyclohexyl]-2-hydroxyethyl}piperidine-2,6-dione × 1 HMT (3beta)-O~3~-[(2R)-2,6-dihydroxy-2-(2-methoxy-2-oxoethyl)-6-methylheptanoyl]cephalotaxine × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.56 Å |
| 9P7G In situ HHT and CHX treated A-P-Z state 80S ribosome 提交 2025-06-20 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物;蛋白 × 78 PDB 声明:85-meric |
链 CI
49–79(31 aa)
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 219 ZN ZINC ION × 6 SPM SPERMINE × 7 SPD SPERMIDINE × 10 3HE 4-{(2R)-2-[(1S,3S,5S)-3,5-dimethyl-2-oxocyclohexyl]-2-hydroxyethyl}piperidine-2,6-dione × 1 HMT (3beta)-O~3~-[(2R)-2,6-dihydroxy-2-(2-methoxy-2-oxoethyl)-6-methylheptanoyl]cephalotaxine × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.54 Å |
| 9P7H In situ HHT and CHX treated human eEF1A-A/T-P state 80S ribosome 提交 2025-06-20 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物;蛋白 × 79 PDB 声明:85-meric |
链 CI
49–79(31 aa)
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 219 SPM SPERMINE × 7 SPD SPERMIDINE × 10 HMT (3beta)-O~3~-[(2R)-2,6-dihydroxy-2-(2-methoxy-2-oxoethyl)-6-methylheptanoyl]cephalotaxine × 1 3HE 4-{(2R)-2-[(1S,3S,5S)-3,5-dimethyl-2-oxocyclohexyl]-2-hydroxyethyl}piperidine-2,6-dione × 1 ZN ZINC ION × 6 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.68 Å |
| 9P7I In situ HHT and CHX treated human eEF1A-A/T-P-Z state 80S ribosome 提交 2025-06-20 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物;蛋白 × 79 PDB 声明:86-meric |
链 CI
49–79(31 aa)
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 219 SPM SPERMINE × 7 SPD SPERMIDINE × 10 3HE 4-{(2R)-2-[(1S,3S,5S)-3,5-dimethyl-2-oxocyclohexyl]-2-hydroxyethyl}piperidine-2,6-dione × 1 HMT (3beta)-O~3~-[(2R)-2,6-dihydroxy-2-(2-methoxy-2-oxoethyl)-6-methylheptanoyl]cephalotaxine × 1 ZN ZINC ION × 6 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.69 Å |
| 9P7J In situ HHT and CHX treated human P state 80S ribosome 提交 2025-06-20 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物;蛋白 × 78 PDB 声明:83-meric |
链 CI
49–79(31 aa)
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 219 SPM SPERMINE × 7 SPD SPERMIDINE × 10 HMT (3beta)-O~3~-[(2R)-2,6-dihydroxy-2-(2-methoxy-2-oxoethyl)-6-methylheptanoyl]cephalotaxine × 1 3HE 4-{(2R)-2-[(1S,3S,5S)-3,5-dimethyl-2-oxocyclohexyl]-2-hydroxyethyl}piperidine-2,6-dione × 1 ZN ZINC ION × 6 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.91 Å |
| 9P7K In situ human post eEF1A-A/T-P-E state 80S ribosome 提交 2025-06-20 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物;蛋白 × 79 PDB 声明:86-meric |
链 CI
49–79(31 aa)
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 219 SPM SPERMINE × 7 SPD SPERMIDINE × 10 ZN ZINC ION × 6 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.80 Å |
| 9P7L In situ human Post-eEF1A-AT-P state 80S ribosome 提交 2025-06-20 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物;蛋白 × 79 PDB 声明:85-meric |
链 CI
49–79(31 aa)
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 219 SPM SPERMINE × 7 SPD SPERMIDINE × 10 ZN ZINC ION × 6 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.92 Å |
| 9P7N In situ human Post-eEF1A-A/T-P-Z state 80S ribosome 提交 2025-06-20 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物;蛋白 × 79 PDB 声明:86-meric |
链 CI
49–79(31 aa)
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 219 SPM SPERMINE × 7 SPD SPERMIDINE × 10 ZN ZINC ION × 6 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.83 Å |
| 9P7O In situ human AT-P-Z state ribosome 提交 2025-06-20 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物;蛋白 × 79 PDB 声明:86-meric |
链 CI
49–79(31 aa)
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 219 SPM SPERMINE × 7 SPD SPERMIDINE × 10 ZN ZINC ION × 6 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.65 Å |
| 9P7W In situ human A-P state 80S ribosome 提交 2025-06-22 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物;蛋白 × 78 PDB 声明:84-meric |
链 CI
49–79(31 aa)
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 219 ZN ZINC ION × 6 SPM SPERMINE × 7 SPD SPERMIDINE × 10 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.93 Å |
| 9P7X In situ human A-P-Z state 80S ribosome 提交 2025-06-22 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物;蛋白 × 78 PDB 声明:85-meric |
链 CI
49–79(31 aa)
|
未记录 | ZN ZINC ION × 6 MG MAGNESIUM ION × 219 SPM SPERMINE × 7 SPD SPERMIDINE × 10 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.83 Å |
| 9P7Y In situ human A-P-E state 80S ribosome 提交 2025-06-22 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物;蛋白 × 78 PDB 声明:85-meric |
链 CI
49–79(31 aa)
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 219 ZN ZINC ION × 6 SPM SPERMINE × 7 SPD SPERMIDINE × 10 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.75 Å |
| 9P8B In situ human eEF1A-A/T-P-E state 80S ribosome 提交 2025-06-22 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物;蛋白 × 79 PDB 声明:86-meric |
链 CI
49–79(31 aa)
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 219 SPM SPERMINE × 7 SPD SPERMIDINE × 10 ZN ZINC ION × 6 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.48 Å |
| 9P8C In situ human Hibernating class1 (rotate3) without E tRNA state 80S ribosome 提交 2025-06-22 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物;蛋白 × 81 PDB 声明:85-meric |
链 CI
49–79(31 aa)
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 218 SPM SPERMINE × 7 SPD SPERMIDINE × 10 ZN ZINC ION × 6 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.11 Å |
| 9P8H In situ human A/P-P/E state 80S ribosome 提交 2025-06-23 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物;蛋白 × 78 PDB 声明:84-meric |
链 CI
49–79(31 aa)
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 218 ZN ZINC ION × 6 SPM SPERMINE × 7 SPD SPERMIDINE × 10 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.98 Å |
| 9P8I In situ HHT and CHX treated human P-Z state 80S ribosome 提交 2025-06-23 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物;蛋白 × 78 PDB 声明:84-meric |
链 CI
49–79(31 aa)
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 219 SPM SPERMINE × 7 SPD SPERMIDINE × 10 3HE 4-{(2R)-2-[(1S,3S,5S)-3,5-dimethyl-2-oxocyclohexyl]-2-hydroxyethyl}piperidine-2,6-dione × 1 HMT (3beta)-O~3~-[(2R)-2,6-dihydroxy-2-(2-methoxy-2-oxoethyl)-6-methylheptanoyl]cephalotaxine × 1 ZN ZINC ION × 6 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.89 Å |
| 9P9H In situ human unrotated hibernating with CCDC124 state 80S ribosome 提交 2025-06-24 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物;蛋白 × 80 PDB 声明:85-meric |
链 CI
49–79(31 aa)
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 219 SPM SPERMINE × 7 SPD SPERMIDINE × 10 ZN ZINC ION × 6 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.84 Å |
| 9P9I In situ human unrotated hibernating without CCDC124 state 80S ribosome 提交 2025-06-24 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物;蛋白 × 79 PDB 声明:84-meric |
链 CI
49–79(31 aa)
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 219 SPM SPERMINE × 7 SPD SPERMIDINE × 10 ZN ZINC ION × 6 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.77 Å |
| 9PA7 In situ human 80S consensus ribosome with EBP1 提交 2025-06-25 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物;蛋白 × 81 PDB 声明:87-meric |
链 CI
49–79(31 aa)
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 225 SPM SPERMINE × 8 SPD SPERMIDINE × 12 K POTASSIUM ION × 75 ZN ZINC ION × 7 PUT 1,4-DIAMINOBUTANE × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.67 Å |
| 9PBE In situ human 80S ribosome (composite map) 提交 2025-06-26 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物;蛋白 × 79 PDB 声明:84-meric |
链 CI
49–79(31 aa)
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 225 SPM SPERMINE × 8 SPD SPERMIDINE × 12 K POTASSIUM ION × 75 ZN ZINC ION × 7 PUT 1,4-DIAMINOBUTANE × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.19 Å |
| 9PKG In situ human P state 80S ribosome 提交 2025-07-14 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物;蛋白 × 78 PDB 声明:83-meric |
链 CI
49–79(31 aa)
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 219 SPM SPERMINE × 7 SPD SPERMIDINE × 10 ZN ZINC ION × 6 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.26 Å |
| 9QLO NMT1-NAC bound human RNC with full length ARF1 - State 1 提交 2025-03-21 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物;蛋白 × 82 PDB 声明:88-meric |
链 NB
1–162(162 aa)
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 191 G3D GUANOSINE-3'-MONOPHOSPHATE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 8 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.47 Å |
| 9QLP NMT1-NAC bound human RNC with full length ARF1 - State 2 提交 2025-03-21 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物;蛋白 × 82 PDB 声明:88-meric |
链 NB
1–162(162 aa)
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 191 G3D GUANOSINE-3'-MONOPHOSPHATE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 8 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.75 Å |
| 9QLQ NMT1-NAC bound human RNC with full length ARF1 - alternative State 提交 2025-03-21 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物;蛋白 × 82 PDB 声明:88-meric |
链 NB
1–162(162 aa)
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 191 ZN ZINC ION × 8 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.57 Å |
| 9QQA Ternary complex of translating ribosome, NAC and NMT1 提交 2025-03-31 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物;蛋白 × 81 PDB 声明:86-meric |
链 Nu
1–162(162 aa)
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 407 UNX UNKNOWN LIGAND × 187 SPD SPERMIDINE × 30 SPM SPERMINE × 3 ZN ZINC ION × 8 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE-PROPANE
|
分辨率 2.80 Å |
| 9QQB Quaternary complex of a translating ribosome, NAC, NMT1, and NatA 提交 2025-03-31 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物;蛋白 × 84 PDB 声明:89-meric |
链 Nu
1–162(162 aa)
|
未记录 | SPD SPERMIDINE × 30 SPM SPERMINE × 3 MG MAGNESIUM ION × 412 UNX UNKNOWN LIGAND × 168 ZN ZINC ION × 8 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE-PROPANE
|
分辨率 3.43 Å |
| 9S3B NMT1-NAC bound human RNC with 58 amino acid ARF1-linker - State 1 提交 2025-07-24 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物;蛋白 × 82 PDB 声明:88-meric |
链 NB
1–162(162 aa)
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 191 ZN ZINC ION × 8 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.38 Å |
| 9S3C NMT1-NAC bound human RNC with 58 amino acid ARF1-linker - State 2 提交 2025-07-24 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物;蛋白 × 82 PDB 声明:88-meric |
链 NB
1–162(162 aa)
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 191 ZN ZINC ION × 8 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.42 Å |
| 9S3D NAC bound human RNC with 58 amino acid ARF1-linker 提交 2025-07-24 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物;蛋白 × 81 PDB 声明:87-meric |
链 NB
1–162(162 aa)
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 191 ZN ZINC ION × 8 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.32 Å |
| 9SYR Human quaternary complex of a translating 80S ribosome, NAC, MetAP1 and NatD 提交 2025-10-13 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 异源复合物;蛋白 × 80 PDB 声明:86-meric |
链 Nb
1–162(162 aa)
|
未记录 | ZN ZINC ION × 10 COA COENZYME A × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE-PROPANE
|
分辨率 3.55 Å |
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查看构建体与数据证据
| UniProt名称 | BTF3_HUMAN |
| Isoform | — |
| PDB实体 | 1 |
| 链与序列区间 | 作者链 A; PDB构建体 1–66; UniProt 97–162 |