SAXSdb — 3n4i

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Beta-lactamase SHV-1

Klebsiella pneumoniae

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2）与蛋白拷贝数一致	链 A； UniProt 22–286	突变：D104E	Beta-lactamase inhibitory protein × 1 （P35804）	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；291 K；40% ammonium sulfate, 100mM Tris, pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K	分辨率 1.56 Å R-free 0.179

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB	相对当前条目 3N4I	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
2G2U Crystal Structure of the SHV-1 Beta-lactamase/Beta-lactamase inhibitor protein (BLIP) complex 提交 2006-02-16	突变/修饰不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 22–286（265 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 EVAPORATION；pH 6.5；293 K；30% Ammonium SO4,25mM cacodylate, 10mM BisTris, 25mM NaCl , pH 6.5, EVAPORATION, temperature 293K	分辨率 1.60 Å R-free 0.186
2G2W Crystal Structure of the SHV D104K Beta-lactamase/Beta-lactamase inhibitor protein (BLIP) complex 提交 2006-02-16	突变/修饰不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 22–286（265 aa）	突变：D104K	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 EVAPORATION；pH 6.5；293 K；4% PEG 8000, 25mM cacodylate, 10 mM BisTris, 25mM NaCl, pH 6.5, EVAPORATION, temperature 293K	分辨率 1.80 Å R-free 0.222
2H0Y Crystal structure of the M69V E166A double mutant of SHV-1 b-lactamase complexed to sulbactam 提交 2006-05-15	突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 22–286（265 aa）	突变：M69V, E166A	TSL TRANS-ENAMINE INTERMEDIATE OF SULBACTAM × 1 MA4 CYCLOHEXYL-HEXYL-BETA-D-MALTOSIDE × 2 ESA ETHANESULFONIC ACID × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；298 K；20% PEG 6000, 0.1 M HEPES, 0.56mM Cymal-6. Crystal soaked for 10 minutes in 50mM sublactam prior to freezing and data collection, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K	分辨率 1.70 Å R-free 0.211
2H10 Crystal structure of the M69V E166A double mutant of SHV-1 b-lactamase complexed to tazobactam 提交 2006-05-15	突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 22–286（265 aa）	突变：M69V, E166A	TBE TAZOBACTAM INTERMEDIATE × 1 MA4 CYCLOHEXYL-HEXYL-BETA-D-MALTOSIDE × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；298 K；20% PEG 6000, 0.1M HEPES, 0.56mM Cymal-6. Crystal soaked for 10 minutes in 50mM tazobactam prior to freezing and data collection, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K	分辨率 1.75 Å R-free 0.190
2ZD8 SHV-1 class A beta-lactamase complexed with meropenem 提交 2007-11-20	突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 22–286（265 aa）	未记录	MA4 CYCLOHEXYL-HEXYL-BETA-D-MALTOSIDE × 2 MER (4R,5S)-3-{[(3S,5S)-5-(dimethylcarbamoyl)pyrrolidin-3-yl]sulfanyl}-5-[(2S,3R)-3-hydroxy-1-oxobutan-2-yl]-4-methyl-4,5-d ihydro-1H-pyrrole-2-carboxylic acid × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；296 K；25% PEG6000, 0.1M HEPES, CYMAL-6, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 296K	分辨率 1.05 Å R-free 0.168
3C4O Crystal Structure of the SHV-1 Beta-lactamase/Beta-lactamase inhibitor protein (BLIP) E73M/S130K/S146M complex 提交 2008-01-30	突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 22–286（265 aa）	未记录	SO4 SULFATE ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.4；292 K；37.5% Ammonium Sulfate, 100mM Tris HCl, pH 8.4, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 292K	分辨率 1.70 Å R-free 0.196
3C4P Crystal Structure of the SHV-1 Beta-lactamase/Beta-lactamase inhibitor protein (BLIP) E73M complex 提交 2008-01-30	突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 22–286（265 aa）	未记录	SO4 SULFATE ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.4；292 K；37.5% Ammonium Sulfate, 100mM Tris HCl, pH 8.4, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 292K	分辨率 1.75 Å R-free 0.207
3D4F SHV-1 beta-lactamase complex with LN1-255 提交 2008-05-14	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–286（286 aa）	未记录	MA4 CYCLOHEXYL-HEXYL-BETA-D-MALTOSIDE × 2 LN1 (3R)-4-{[(3,4-dihydroxyphenyl)acetyl]oxy}-N-(2-formylindolizin-3-yl)-3-sulfino-D-valine × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；298 K；30% PEG6000, 0.1M HEPES pH7. 0.56mM Cymal-6, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K	分辨率 1.55 Å R-free 0.197
3MKE SHV-1 beta-lactamase complex with LP06 提交 2010-04-14	突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 22–286（265 aa）	未记录	MA4 CYCLOHEXYL-HEXYL-BETA-D-MALTOSIDE × 2 CB4 PINACOL[[2-AMINO-ALPHA-(1-CARBOXY-1-METHYLETHOXYIMINO)-4-THIAZOLEACETYL]AMINO]METHANEBORONATE × 1 CZ6 2-[(~{Z})-[1-(2-azanyl-1,3-thiazol-4-yl)-2-oxidanylidene-2-[[(6~{S})-4,4,6-trimethyl-1,3,2-dioxaborinan-2-yl]methylamino]ethylidene]amino]oxy-2-methyl-propanoic acid × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；293 K；20-30% PEG 6000, 0.1M HEPES, 0.56Mm Cymal-6, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293.0K	分辨率 1.75 Å R-free 0.181
3MKF SHV-1 beta-lactamase complex with GB0301 提交 2010-04-14	突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 22–286（265 aa）	未记录	CZ7 ({[(2R)-2-{[(4-ethyl-2,3-dioxo-3,4-dihydropyrazin-1(2H)-yl)carbonyl]amino}-2-(4-hydroxyphenyl)acetyl]amino}methyl)boronic acid × 1 MA4 CYCLOHEXYL-HEXYL-BETA-D-MALTOSIDE × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；293 K；20-30% PEG 6000, 0.1M HEPES, 0.56Mm Cymal-6, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293.0K	分辨率 1.33 Å R-free 0.190
3MXR SHV-1 beta-lactamase complex with compound 1 提交 2010-05-07	突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 22–286（265 aa）	未记录	CZ8 ({[(2R)-2-{[(4-ethyl-2,3-dioxopiperazin-1-yl)carbonyl]amino}-4-(4-hydroxyphenyl)butanoyl]amino}methyl)boronic acid × 1 MA4 CYCLOHEXYL-HEXYL-BETA-D-MALTOSIDE × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；293 K；20-30% PEG 6000, 0.1M HEPES, 0.56Mm Cymal-6, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293.0K	分辨率 1.30 Å R-free 0.203
3MXS SHV-1 beta-lactamase complex with compound 2 提交 2010-05-07	突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 22–286（265 aa）	未记录	CZ9 N-[(dihydroxyboranyl)methyl]-Nalpha-[(4-ethyl-2,3-dioxopiperazin-1-yl)carbonyl]-D-tyrosinamide × 1 MA4 CYCLOHEXYL-HEXYL-BETA-D-MALTOSIDE × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；293 K；20-30% PEG 6000, 0.1M HEPES, 0.56Mm Cymal-6, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293.0K	分辨率 1.24 Å R-free 0.194
3OPH ESBL R164S mutant of SHV-1 beta-lactamase 提交 2010-09-01	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–286（286 aa）	突变：R164S	MA4 CYCLOHEXYL-HEXYL-BETA-D-MALTOSIDE × 2 EPE 4-(2-HYDROXYETHYL)-1-PIPERAZINE ETHANESULFONIC ACID × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；295 K；21-30% PEG 6000, 0.5mM cymal-6, 100mM HEPES buffer, pH 6.6-7.6, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 295K	分辨率 1.34 Å R-free 0.190
3OPL ESBL R164H mutant SHV-1 beta-lactamase 提交 2010-09-01	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–286（286 aa）	突变：R164H	MA4 CYCLOHEXYL-HEXYL-BETA-D-MALTOSIDE × 2 EPE 4-(2-HYDROXYETHYL)-1-PIPERAZINE ETHANESULFONIC ACID × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；295 K；21-30% PEG 6000, 0.5mM cymal-6, 100mM HEPES buffer, pH 6.6-7.6, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 295K	分辨率 1.80 Å R-free 0.228
3OPP ESBL R164S mutant of SHV-1 beta-lactamase complexed with SA2-13 提交 2010-09-01	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–286（286 aa）	突变：R164S	SA2 (3R)-4-[(4-CARBOXYBUTANOYL)OXY]-N-[(1E)-3-OXOPROP-1-EN-1-YL]-3-SULFINO-D-VALINE × 1 MA4 CYCLOHEXYL-HEXYL-BETA-D-MALTOSIDE × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；295 K；21-30% PEG 6000, 0.5mM cymal-6, 100mM HEPES buffer, pH 6.6-7.6, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295K	分辨率 1.80 Å R-free 0.192
3OPR ESBL R164H mutant of SHV-1 beta-lactamase complexed to SA2-13 提交 2010-09-01	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–286（286 aa）	突变：R164H	MA4 CYCLOHEXYL-HEXYL-BETA-D-MALTOSIDE × 2 SA2 (3R)-4-[(4-CARBOXYBUTANOYL)OXY]-N-[(1E)-3-OXOPROP-1-EN-1-YL]-3-SULFINO-D-VALINE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；295 K；21-30% PEG6000, 0.5mM cymal-6, 100mM HEPES buffer, pH 6.6-7.6, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295K	分辨率 1.65 Å R-free 0.211
4FCF K234R: apo structure of inhibitor resistant beta-lactamase 提交 2012-05-24	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 22–286（265 aa）片段：unp residues 22-286	突变：K234R	MA4 CYCLOHEXYL-HEXYL-BETA-D-MALTOSIDE × 2 TAU 2-AMINOETHANESULFONIC ACID × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；296 K；21-30% PEG6K, 0.1M Hepes pH 6.6-7.6, 0.56mM cymal-6, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 296K	分辨率 1.09 Å R-free 0.150
4FD8 Structure of apo S70C SHV beta-lactamase 提交 2012-05-26	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 22–286（265 aa）片段：unp residues 22-286	突变：S70C	MA4 CYCLOHEXYL-HEXYL-BETA-D-MALTOSIDE × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；296 K；21-30% PEG6k, 0.1M hepes pH 6.8-7.8, 0.56mM cymal-6, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 296K	分辨率 1.52 Å R-free 0.197
4FH2 Structure of s70c beta-lactamase bound to sulbactam 提交 2012-06-05	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 22–286（265 aa）片段：unp residues 22-286	突变：S70C	MA4 CYCLOHEXYL-HEXYL-BETA-D-MALTOSIDE × 2 0RN SULBACTAM × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；296 K；21-30%PEG6k, 0.1M hepes, 0.56mM cymal-6, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 296K	分辨率 1.44 Å R-free 0.220
4FH4 high-resolution structure of apo wt SHV-1 beta-lactamase 提交 2012-06-05	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 22–286（265 aa）片段：unp residues 22-286	未记录	MA4 CYCLOHEXYL-HEXYL-BETA-D-MALTOSIDE × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；296 K；21-30% peg6k, 0.1M hepes, 0.56mM cymal-6, pH 6.8-7.8, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 296K	分辨率 1.09 Å R-free 0.166
4GD6 SHV-1 beta-lactamase in complex with penam sulfone SA1-204 提交 2012-07-31	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–286（286 aa）	未记录	17K (3R)-N-(2-formylindolizin-3-yl)-4-[(phenylacetyl)oxy]-3-sulfino-D-valine × 1 MA4 CYCLOHEXYL-HEXYL-BETA-D-MALTOSIDE × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；293 K；25% PEG 6000, 100mM HEPES pH 7.0, 0.56mM Cymal-6, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K	分辨率 1.53 Å R-free 0.194
4GD8 SHV-1 beta-lactamase in complex with penam sulfone SA3-53 提交 2012-07-31	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–286（286 aa）	未记录	MXF (2S,3R)-4-(2-aminoethylcarbamoyloxy)-2-[(2-methanoylindolizin-3-yl)amino]-3-methyl-3-sulfino-butanoic acid × 1 MA4 CYCLOHEXYL-HEXYL-BETA-D-MALTOSIDE × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；293 K；25% PEG 6000, 100mM HEPES pH7.0, 0.56mM Cymal-6, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K	分辨率 1.60 Å R-free 0.242
4GDB SHV-1 in complex with 4H-pyrazolo[1,5-c][1,3]thiazole containing penem inhibitor 提交 2012-07-31	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–286（286 aa）	未记录	17O (7R)-6-formyl-7-(4H-pyrazolo[1,5-c][1,3]thiazol-2-yl)-4,7-dihydro-1,4-thiazepine-3-carboxylic acid × 1 MA4 CYCLOHEXYL-HEXYL-BETA-D-MALTOSIDE × 2 EPE 4-(2-HYDROXYETHYL)-1-PIPERAZINE ETHANESULFONIC ACID × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；293 K；25% PEG 6000, 100mM HEPES pH7.0, 0.56mM Cymal-6, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K	分辨率 1.84 Å R-free 0.234
4JPM Structure of SHV-1 beta-lactamase in complex with the 7-alkylidenecephalosporin DCM-1-10 at 1.14 Ang resolution 提交 2013-03-19	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–286（286 aa）片段：SVH-1 beta-lactamase	未记录	MA4 CYCLOHEXYL-HEXYL-BETA-D-MALTOSIDE × 2 1OG 7-alkylidenecephalosporin DCM-1-10, bound form × 1 EPE 4-(2-HYDROXYETHYL)-1-PIPERAZINE ETHANESULFONIC ACID × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；21-30% PEG 6000, 0.1M HEPES buffer, 0.56mM Cymal-6, pH 6.8-7.8, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K	分辨率 1.14 Å R-free 0.164
4MBF Crystal structure of Penam sulfone PSR-4-157 bound to SHV-1 beta-lactamase 提交 2013-08-19	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 22–286（265 aa）片段：unp residues 22-286	未记录	MA4 CYCLOHEXYL-HEXYL-BETA-D-MALTOSIDE × 2 2AW 6-({(2R,3S)-3-carboxy-2-methyl-3-[(3-oxopropyl)amino]-2-sulfinopropyl}oxy)-6-oxohexanoic acid × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；21-30% PEG 6000, 0.1M HEPES buffer, 0.56mM Cymal-6, pH 6.8-7.8, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K	分辨率 1.54 Å R-free 0.196
4MBH Penam sulfone PSR-3-226 bound to E166A variant of SHV-1 beta-lactamase 提交 2013-08-19	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 22–286（265 aa）片段：SHV-1 beta-lactamase	突变：E166A	MA4 CYCLOHEXYL-HEXYL-BETA-D-MALTOSIDE × 2 0RJ 3-(formylamino)-L-alanine × 1 EPE 4-(2-HYDROXYETHYL)-1-PIPERAZINE ETHANESULFONIC ACID × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；21-30% PEG 6000, 0.1M HEPES. 0.56mM Cymal-6, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K	分辨率 1.22 Å R-free 0.161
4MBK Crystal structure of K234R inhibitor-resistant variant of SHV beta-lactamase in complex with SA2-13 提交 2013-08-19	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 22–286（265 aa）片段：SHV-1 beta-lactamase	突变：K234R	MA4 CYCLOHEXYL-HEXYL-BETA-D-MALTOSIDE × 2 SA2 (3R)-4-[(4-CARBOXYBUTANOYL)OXY]-N-[(1E)-3-OXOPROP-1-EN-1-YL]-3-SULFINO-D-VALINE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；21-30% PEG 6000, 0.1M HEPES, 0.56mM Cymal-6, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K	分辨率 1.46 Å R-free 0.214
4R3B Crystal structure of SHV-1 b-lactamase in complex with 6b-(hydroxymethyl)penicillanic acid sulfone PSR-283A 提交 2014-08-14	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 22–286（265 aa）片段：SHV-1 beta-lactamase	未记录	MA4 CYCLOHEXYL-HEXYL-BETA-D-MALTOSIDE × 2 3GE N-[(1E)-2-formyl-3-hydroxyprop-1-en-1-yl]-3-[(S)-sulfino]-D-valine × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；21-30% PEG6000, 0.1M HEPES pH 6.2-8.2, 0.56mM Cymal-6, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K	分辨率 1.37 Å R-free 0.172
4ZAM Crystal structure of SHV-1 beta-lactamase bound to avibactam 提交 2015-04-13	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 22–286（265 aa）片段：UNP residues 22-286	未记录	MA4 CYCLOHEXYL-HEXYL-BETA-D-MALTOSIDE × 2 NXL (2S,5R)-1-formyl-5-[(sulfooxy)amino]piperidine-2-carboxamide × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；25% PEG6000, 100 mM Tris, pH 7.5, 0.56 mM Cymal-6	分辨率 1.42 Å R-free 0.193
5EE8 Crystal structure of S02030 boronic acid inhibitor complexed to SHV-1 beta-lactamase 提交 2015-10-22	突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 22–286（265 aa）	未记录	ZXM 1-{(2R)-2-(dihydroxyboranyl)-2-[(thiophen-2-ylacetyl)amino]ethyl}-1H-1,2,3-triazole-4-carboxylic acid × 1 MA4 CYCLOHEXYL-HEXYL-BETA-D-MALTOSIDE × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；20-30% PEG 6000, 100mM Tris pH 7.5, 0.56mM cymal-6	分辨率 1.54 Å R-free 0.175

共 30 个其他 PDB 条目、30 个 assembly。打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	BLA1_KLEPN
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 1–265； UniProt 22–286

Beta-lactamase inhibitory protein

Streptomyces clavuligerus

UniProt P35804

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2）与蛋白拷贝数一致	链 B； UniProt 37–201	未记录	Beta-lactamase SHV-1 × 1 （P0AD64）	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；291 K；40% ammonium sulfate, 100mM Tris, pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K	分辨率 1.56 Å R-free 0.179

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB	相对当前条目 3N4I	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
1JTG CRYSTAL STRUCTURE OF TEM-1 BETA-LACTAMASE / BETA-LACTAMASE INHIBITOR PROTEIN COMPLEX 提交 2001-08-20	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 37–201（165 aa）	未记录	CA CALCIUM ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 8.8；pH 8.8	分辨率 1.73 Å R-free 0.205
1JTG CRYSTAL STRUCTURE OF TEM-1 BETA-LACTAMASE / BETA-LACTAMASE INHIBITOR PROTEIN COMPLEX 提交 2001-08-20	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 D 37–201（165 aa）	未记录	CA CALCIUM ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 8.8；pH 8.8	分辨率 1.73 Å R-free 0.205
1S0W 1b Lactamse/ b Lactamase Inhibitor 提交 2004-01-05	突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 C 37–201（165 aa）	突变：F1142A	CA CALCIUM ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 MICROBATCH；pH 7.5；293 K；PEG 8000, Dioxane, pH 7.5, Microbatch, temperature 293K	分辨率 2.30 Å
1S0W 1b Lactamse/ b Lactamase Inhibitor 提交 2004-01-05	突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 D 37–201（165 aa）	突变：F1142A	CA CALCIUM ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 MICROBATCH；pH 7.5；293 K；PEG 8000, Dioxane, pH 7.5, Microbatch, temperature 293K	分辨率 2.30 Å
1XXM The modular architecture of protein-protein binding site 提交 2004-11-07	突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 C 37–201（165 aa）	突变：K74A; F142A; Y143A	CA CALCIUM ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 MICROBATCH；pH 5；298 K；LiCl; sodium Acetate; PEG 6000, pH 5., Microbatch, temperature 298K	分辨率 1.90 Å R-free 0.247
1XXM The modular architecture of protein-protein binding site 提交 2004-11-07	突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 D 37–201（165 aa）	突变：K74A; F142A; Y143A	CA CALCIUM ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 MICROBATCH；pH 5；298 K；LiCl; sodium Acetate; PEG 6000, pH 5., Microbatch, temperature 298K	分辨率 1.90 Å R-free 0.247
2B5R 1B Lactamase / B Lactamase Inhibitor 提交 2005-09-29	实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 C 37–201（165 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 8.5；298 K；PEG 3350, NH4 Acetate, pH 8.5, Microbatch, temperature 298K	分辨率 1.65 Å R-free 0.222
2B5R 1B Lactamase / B Lactamase Inhibitor 提交 2005-09-29	实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 D 37–201（165 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 8.5；298 K；PEG 3350, NH4 Acetate, pH 8.5, Microbatch, temperature 298K	分辨率 1.65 Å R-free 0.222
2G2U Crystal Structure of the SHV-1 Beta-lactamase/Beta-lactamase inhibitor protein (BLIP) complex 提交 2006-02-16	实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 37–201（165 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 EVAPORATION；pH 6.5；293 K；30% Ammonium SO4,25mM cacodylate, 10mM BisTris, 25mM NaCl , pH 6.5, EVAPORATION, temperature 293K	分辨率 1.60 Å R-free 0.186
2G2W Crystal Structure of the SHV D104K Beta-lactamase/Beta-lactamase inhibitor protein (BLIP) complex 提交 2006-02-16	实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 37–201（165 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 EVAPORATION；pH 6.5；293 K；4% PEG 8000, 25mM cacodylate, 10 mM BisTris, 25mM NaCl, pH 6.5, EVAPORATION, temperature 293K	分辨率 1.80 Å R-free 0.222
3C4O Crystal Structure of the SHV-1 Beta-lactamase/Beta-lactamase inhibitor protein (BLIP) E73M/S130K/S146M complex 提交 2008-01-30	突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 37–201（165 aa）	突变：E109M,S166K,S182M	SO4 SULFATE ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.4；292 K；37.5% Ammonium Sulfate, 100mM Tris HCl, pH 8.4, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 292K	分辨率 1.70 Å R-free 0.196
3C4P Crystal Structure of the SHV-1 Beta-lactamase/Beta-lactamase inhibitor protein (BLIP) E73M complex 提交 2008-01-30	突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 37–201（165 aa）	突变：E109M	SO4 SULFATE ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.4；292 K；37.5% Ammonium Sulfate, 100mM Tris HCl, pH 8.4, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 292K	分辨率 1.75 Å R-free 0.207
3C7U Structural Insight into the Kinetics and Cp of interactions between TEM-1-Lactamase and BLIP 提交 2008-02-08	实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 37–201（165 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 4.5；298 K；15% PEG 8000, 0.1M Phosphate-Citrate, 0.1M NaCl, pH 4.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K	分辨率 2.20 Å R-free 0.232
3C7U Structural Insight into the Kinetics and Cp of interactions between TEM-1-Lactamase and BLIP 提交 2008-02-08	实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 D 37–201（165 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 4.5；298 K；15% PEG 8000, 0.1M Phosphate-Citrate, 0.1M NaCl, pH 4.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K	分辨率 2.20 Å R-free 0.232
3C7V Structural Insight into the Kinetics and Delta-Cp of interactions between TEM-1 Beta-Lactamase and BLIP 提交 2008-02-08	实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 37–201（165 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 4.2；298 K；12% PEG 8000, 0.1M Phosphate-Citrate, 0.1M NaCl, pH 4.2, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K	分辨率 2.07 Å R-free 0.238
3C7V Structural Insight into the Kinetics and Delta-Cp of interactions between TEM-1 Beta-Lactamase and BLIP 提交 2008-02-08	实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 D 37–201（165 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 4.2；298 K；12% PEG 8000, 0.1M Phosphate-Citrate, 0.1M NaCl, pH 4.2, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K	分辨率 2.07 Å R-free 0.238
3E2K Crystal Structure of the KPC-2 Beta-lactamase/Beta-lactamase inhibitor protein (BLIP) 提交 2008-08-05	实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 D 37–201（165 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.5；290 K；20% PEG 8000, 4% ethylene glycol, 100mM citrate, pH 4.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 290K	分辨率 2.10 Å R-free 0.234
3E2K Crystal Structure of the KPC-2 Beta-lactamase/Beta-lactamase inhibitor protein (BLIP) 提交 2008-08-05	实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 C 37–201（165 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.5；290 K；20% PEG 8000, 4% ethylene glycol, 100mM citrate, pH 4.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 290K	分辨率 2.10 Å R-free 0.234
3E2L Crystal Structure of the KPC-2 Beta-lactamase/Beta-lactamase inhibitor protein (BLIP) 提交 2008-08-05	实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 C 37–201（165 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5；290 K；20% PEG 8000, 6% ethylene glycol, 100mM citrate, pH 5.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 290K	分辨率 1.87 Å R-free 0.213
3E2L Crystal Structure of the KPC-2 Beta-lactamase/Beta-lactamase inhibitor protein (BLIP) 提交 2008-08-05	实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 D 37–201（165 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5；290 K；20% PEG 8000, 6% ethylene glycol, 100mM citrate, pH 5.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 290K	分辨率 1.87 Å R-free 0.213
3GMU Crystal Structure of Beta-Lactamse Inhibitory Protein (BLIP) in Apo Form 提交 2009-03-15	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 37–201（165 aa）	未记录	NH4 AMMONIUM ION × 1 SO4 SULFATE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 5.5；298 K；10 mg/ml protein, 20% saturated ammonium sulfate, 50 mM sodium citrate, pH 5.5, vapor diffusion, temperature 298K	分辨率 1.98 Å R-free 0.229
7S5S CTX-M-15 WT in complex with BLIP WT 提交 2021-09-11	实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 37–201（165 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；298 K；20% w/v PEG3350, 0.2 M NaF, 0.1 M Bis-Tris-propane pH 6.5	分辨率 1.40 Å R-free 0.166
9Q0A CTX-M-14 WT in complex with BLIP E73W 提交 2025-08-12	突变/修饰不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 37–201（165 aa）	突变：E73W	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；298 K；0.2 M calcium chloride, 0.1 M sodium acetate pH 5, 20% (w/v) PEG 6000	分辨率 1.65 Å R-free 0.211
9Q0B CTX-M-15 WT in complex with BLIP E73W 提交 2025-08-12	构建体不同突变/修饰不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 38–201（164 aa）	突变：E73W	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；298 K；0.1 M MES pH 6.5, 25% (w/v) PEG 4000	分辨率 1.58 Å R-free 0.182
9Q0C TEM-1 WT in complex with BLIP E73W 提交 2025-08-12	突变/修饰不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 37–201（165 aa）	突变：E73W	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；298 K；0.1 M magnesium chloride, 0.1 M sodium acetate pH 4.6, 25% (w/v) PEG 400	分辨率 1.78 Å R-free 0.215
9Q0C TEM-1 WT in complex with BLIP E73W 提交 2025-08-12	突变/修饰不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 D 37–201（165 aa）	突变：E73W	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；298 K；0.1 M magnesium chloride, 0.1 M sodium acetate pH 4.6, 25% (w/v) PEG 400	分辨率 1.78 Å R-free 0.215

共 17 个其他 PDB 条目、26 个 assembly。打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	BLIP_STRCL
Isoform	—
PDB实体	2
链与序列区间	作者链 B； PDB构建体 1–165； UniProt 37–201

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	3n4i
沉积日期 deposition_date	2010-05-21
结构标题 title	Crystal structure of the SHV-1 D104E beta-lactamase/beta-lactamase inhibitor protein (BLIP) complex
关键词 keywords	;beta-lactamase, protein-protein complex, BLIP, SHV-1, HYDROLASE - HYDROLASE INHIBITOR complex, HYDROLASE-HYDROLASE INHIBITOR complex ;; HYDROLASE/HYDROLASE INHIBITOR
实验方法 method	X-RAY DIFFRACTION

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3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

回转半径 Rg (Guinier) rg_guinier	22.81 Å
回转半径 Rg (电子) rg_electron	21.91 Å
零角强度 I(0) i0	38086600.00
分子量 molecular_weight	46428.0 kDa
排除体积 excluded_volume	57652 Å³
包络体积 envelope_volume	65599 Å³
水化壳体积 shell_volume	24855 Å³
包络直径 envelope_diameter	74.8 Å
壳层 Rg shell_rg	28.89 Å
包络 Rg envelope_rg	22.15 Å
形状 Rg shape_rg	21.90 Å
总 Rg total_rg	22.76 Å
总原子数 total_atoms	3260
残基数 n_residues	430
球谐函数阶数 n_harmonics	20
q 范围 q_range	— – 0.5000 Å⁻¹
数据点数 n_points	101
壳层类型 shell_type	directional
溶剂电子密度 solvent_density	0.3340 e/Å³
壳层衬度 contrast_shell	0.0300 e/Å³
CRYSOL 版本 crysol_version	4.1.3

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4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

最大尺寸 Dmax dmax	74.1 Å
Rg (实空间) rg_real	22.74 Å
Rg 误差 (实空间) rg_real_error	0.39 Å
I(0) (实空间) i0_real	3.8090e+07
I(0) 误差 (实空间) i0_real_error	4.8110e+05
Rg (倒空间) rg_reciprocal	22.76 Å
I(0) (倒空间) i0_reciprocal	38090000.0000
解质量估计 total_estimate	0.7186
解质量评级 solution_quality	REASONABLE a REASONABLE solution
P(r) 峰数 n_peaks	2
主峰位置 r_peak_primary	27.0 Å
偏度 Skewness skewness	0.275
峰度 Kurtosis kurtosis	-0.367
角度范围 angular_range	— – 0.3500 Å⁻¹
当前正则化参数 α current_alpha	0.0000
最高正则化参数 α highest_alpha	9988000.0000
实空间数据点数 n_real_points	67
GNOM 版本 gnom_version	4.1.3
质量判据 quality_criteria	AN1: 0.000; Oscil: 0.872; Stabil: 1.000; Sysdev: 0.242; Positv: 1.000; Valcen: 1.000; Smooth: 0.993

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5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

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6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (3)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	Beta-lactamase SHV-1
分子量 formula_weight	28921.0 kDa
EC 编号 ec_number	3.5.2.6
突变 mutation	D104E
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A
原子数 atom_count	3622

SPQPLEQIKLSESQLSGRVGMIEMDLASGRTLTAWRADERFPMMSTFKVVLCGAVLARVDAGDEQLERKIHYRQQDLVEYSPVSEKHLADGMTVGELCAAAITMSDNSAANLLLATVGGPAGLTAFLRQIGDNVTRLDRWETELNEALPGDARDTTTPASMAATLRKLLTSQRLSARSQRQLLQWMVDDRVAGPLIRSVLPAGWFIADKTGAGERGARGIVALLGPNNKAERIVVIYLRDTPASMAERNQQIAGIGAALIEHWQR

来源 Source

来源生物 organism	Klebsiella pneumoniae
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	573
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

实体 2 Entity 2 polymer

描述 description	Beta-lactamase inhibitory protein
分子量 formula_weight	17556.5 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	B

AGVMTGAKFTQIQFGMTRQQVLDIAGAENCETGGSFGDSIHCRGHAAGDYYAYATFGFTSAAADAKVDSKSQEKLLAPSAPTLTLAKFNQVTVGMTRAQVLATVGQGSCTTWSEYYPAYPSTAGVTLSLSCFDVDGYSSTGFYRGSAHLWFTDGVLQGKRQWDLV

来源 Source

来源生物 organism	Streptomyces clavuligerus
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	1901
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

实体 3 Entity 3 water

描述 description	water
分子量 formula_weight	18.0 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	362

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7. 折叠分类 (SCOP + CATH) 5 domains

SCOP 2.08 (2 domains)

结构域编号 domain_id	d3n4ia_
类 Class class	e — Multi-domain proteins (alpha and beta)
折叠类型 Fold fold	e.3 — beta-lactamase/transpeptidase-like
超家族 Superfamily superfamily	e.3.1 — beta-lactamase/transpeptidase-like
家族 Family family	e.3.1.1 — beta-Lactamase/D-ala carboxypeptidase

结构域编号 domain_id	d3n4ib_
类 Class class	d — Alpha and beta proteins (a+b)
折叠类型 Fold fold	d.98 — BLIP-like
超家族 Superfamily superfamily	d.98.1 — beta-lactamase-inhibitor protein, BLIP
家族 Family family	d.98.1.1 — beta-lactamase-inhibitor protein, BLIP

CATH v4.4 (3 domains)

结构域编号 domain_id	3n4iA00
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	40 — 3-Layer(aba) Sandwich
拓扑 Topology topology	710 — Beta-lactamase
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — DD-peptidase/beta-lactamase superfamily

结构域编号 domain_id	3n4iB01
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	1450 — Beta-lactamase Inhibitory Protein; Chain:B, domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 —

结构域编号 domain_id	3n4iB02
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	1450 — Beta-lactamase Inhibitory Protein; Chain:B, domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 —

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8. 引用文献 (1)

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晶胞边长 a length_a	127.850 Å
晶胞边长 b length_b	127.850 Å
晶胞边长 c length_c	73.183 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	90.00 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	120.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	6

空间群 space_group	P 63
空间群编号 int_tables_number	173
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	1.560 Å
最低分辨率 resolution_low	36.900 Å
R 因子 r_factor	0.1710
R_work r_work	0.1700
R_free r_free	0.1790

fit	/app/data/saxs_computation/n4/3n4i/3n4i.fit
pddf	/app/data/pr_computation/n4/3n4i/3n4i.pr.out
profile	/app/data/saxs_computation/n4/3n4i/3n4i.dat

Crystal structure of the SHV-1 D104E beta-lactamase/beta-lactamase inhibitor protein (BLIP) complex

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Beta-lactamase SHV-1

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

Beta-lactamase inhibitory protein

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (3)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 3 Entity 3 water

7. 折叠分类 (SCOP + CATH) 5 domains

SCOP 2.08 (2 domains)

CATH v4.4 (3 domains)

8. 引用文献 (1)

9. 文件与曲线 (10)

Files (7)

Curves (3)