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3nb3

The host outer membrane proteins OmpA and OmpC are packed at specific sites in the Shigella phage Sf6 virion as structural components

Method: ELECTRON MICROSCOPY
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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Outer membrane protein A

物种未注明

UniProt P0A910

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 240 Outer membrane protein C × 60 （P06996） 与蛋白数一致
2 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 4 Outer membrane protein C × 1 （P06996） 与蛋白数一致
3 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 20 Outer membrane protein C × 5 （P06996） 与蛋白数一致
4 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 24 Outer membrane protein C × 6 （P06996） 与蛋白数一致
5 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 4 Outer membrane protein C × 1 （P06996） 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

单体
1bxw 1g90 2ge4 2jmm

共 4 个 assembly

同源二聚体

暂无

同源四聚体

暂无

其他同源多聚体

暂无

异源或核酸复合物
3nb3 3nb3 3nb3 3nb3 3nb3 5m2q 5m2q 6lyr 9fzc 9fzc

共 10 个 assembly

查看构建体与数据证据
UniProt名称 OMPA_ECOLI
Isoform —
PDB实体 1
链与序列区间 作者链 A； PDB构建体 1–346； UniProt 1–346 作者链 B； PDB构建体 1–346； UniProt 1–346 作者链 C； PDB构建体 1–346； UniProt 1–346

Outer membrane protein C

物种未注明

UniProt P06996

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 240 Outer membrane protein A × 180 （P0A910） 与蛋白数一致
2 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 4 Outer membrane protein A × 3 （P0A910） 与蛋白数一致
3 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 20 Outer membrane protein A × 15 （P0A910） 与蛋白数一致
4 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 24 Outer membrane protein A × 18 （P0A910） 与蛋白数一致
5 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 4 Outer membrane protein A × 3 （P0A910） 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

单体

暂无

同源二聚体

暂无

同源四聚体

暂无

其他同源多聚体
2j1n

共 1 个 assembly

异源或核酸复合物
2j4u 2j4u 2zle 3nb3 3nb3 3nb3 3nb3 3nb3 4a8d 8i8r 8i8x

共 11 个 assembly

查看构建体与数据证据
UniProt名称 OMPC_ECOLI
Isoform —
PDB实体 2
链与序列区间 作者链 D； PDB构建体 1–346； UniProt 22–367

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id3nb3
沉积日期 deposition_date2010-06-02
结构标题 titleThe host outer membrane proteins OmpA and OmpC are packed at specific sites in the Shigella phage Sf6 virion as structural components
关键词 keywordsvirus assembly, cementing protein, bacteriophage, Sf6, Shigella, beta-barrel, outer membrane protein, icosahedral, MEMBRANE PROTEIN; MEMBRANE PROTEIN
实验方法 methodELECTRON MICROSCOPY
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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

3nb3__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

3nb3__assembly_1__model_1 | I(q)

10-2 10-1 106 107 108 109 1010 1011 q (1/Angstrom) I(q)
100 个绘图点；横轴和纵轴均采用对数尺度。

3nb3__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

新版 assembly/model P(r) 尚未计算 此处仅保留位置，不展示旧数据 r (Angstrom) P(r)
P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。
Rg（Guinier）0.00 Å
Rg（电子密度）248.10 Å
总 Rg248.10 Å
原子数356700
残基数45420
排除体积6250600 ų
最大 q0.500 Å⁻¹
Assembly Model 结构单元 聚集说明 状态 CRYSOL 操作
1 1 3nb3__assembly_1__model_1 240-MERIC （240） 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
2 1 3nb3__assembly_2__model_1 tetrameric （4） 排除 — —
排除原因： 辅助对称表示，不是完整或代表性的 biological assembly。
3 1 3nb3__assembly_3__model_1 eicosameric （20） 排除 — —
排除原因： 辅助对称表示，不是完整或代表性的 biological assembly。
4 1 3nb3__assembly_4__model_1 24-meric （24） 排除 — —
排除原因： 辅助对称表示，不是完整或代表性的 biological assembly。
5 1 3nb3__assembly_5__model_1 tetrameric （4） 排除 — —
排除原因： 辅助对称表示，不是完整或代表性的 biological assembly。
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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (2)

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7. 引用文献 (1)