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3och

Chemically Self-assembled Antibody Nanorings (CSANs): Design and Characterization of an Anti-CD3 IgM Biomimetic

Method: X-RAY DIFFRACTION
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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Dihydrofolate reductase

Escherichia coli

UniProt P0ABQ4

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白单体 单体 蛋白 1 CHLORIDE ION × 1 ;(2S,2'S)-5,5'-(nonane-1,9-diyldiimino)bis(2-{[(4-{[(2,4-diaminopteridin-6-yl)methyl](methyl)amino}phenyl)carbonyl]amino}-5-oxopentanoic acid) (non-preferred name) ; × 1 water × 1 与蛋白数一致
2 蛋白单体 单体 蛋白 1 CHLORIDE ION × 2 MANGANESE (II) ION × 2 water × 1 与蛋白数一致
3 蛋白同源多聚体 同源多聚体 蛋白 2 CHLORIDE ION × 3 ;(2S,2'S)-5,5'-(nonane-1,9-diyldiimino)bis(2-{[(4-{[(2,4-diaminopteridin-6-yl)methyl](methyl)amino}phenyl)carbonyl]amino}-5-oxopentanoic acid) (non-preferred name) ; × 1 MANGANESE (II) ION × 2 water × 2 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

单体
1dre 1drh 1jom 1ra1 1ra2 1ra3 1ra8 1ra9 1rc4 1rf7 1rg7 1rh3

共 128 个 assembly，这里只显示前 12 个

同源二聚体
1ddr 1dds 1dhi 1dhj 1dra 1drb 1dyh 1dyi 1dyj 1jol 1rb2 1rb3

共 20 个 assembly，这里只显示前 12 个

同源四聚体

暂无

其他同源多聚体

暂无

异源或核酸复合物
3k74 4eig 4eiz 4eiz 4ej1 4ej1 4fhb 4i13 4i1n

共 9 个 assembly

查看构建体与数据证据
UniProt名称 DYR_ECOLI
Isoform —
PDB实体 1
链与序列区间 作者链 A； PDB构建体 1–159； UniProt 1–159 作者链 B； PDB构建体 1–159； UniProt 1–159

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id3och
沉积日期 deposition_date2010-08-10
结构标题 titleChemically Self-assembled Antibody Nanorings (CSANs): Design and Characterization of an Anti-CD3 IgM Biomimetic
关键词 keywordsOXIDOREDUCTASE; OXIDOREDUCTASE
实验方法 methodX-RAY DIFFRACTION
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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

3och__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

3och__assembly_1__model_1 | I(q)

10-2 10-1 105 106 q (1/Angstrom) I(q)
100 个绘图点；横轴和纵轴均采用对数尺度。

3och__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

新版 assembly/model P(r) 尚未计算 此处仅保留位置，不展示旧数据 r (Angstrom) P(r)
P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。
Rg（Guinier）17.01 Å
Rg（电子密度）15.54 Å
总 Rg16.59 Å
原子数1343
残基数159
排除体积23660 ų
最大 q0.500 Å⁻¹
Assembly Model 结构单元 聚集说明 状态 CRYSOL 操作
1 1 3och__assembly_1__model_1 monomeric （1） 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
2 1 3och__assembly_2__model_1 monomeric （1） 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
3 1 3och__assembly_3__model_1 dimeric （2） 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (5)

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6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 4 domains

SCOP 2.08 (2 domains)

结构域编号 domain_idd3ocha_
类 Class classc — Alpha and beta proteins (a/b)
折叠类型 Fold foldc.71 — Dihydrofolate reductase-like
超家族 Superfamily superfamilyc.71.1 — Dihydrofolate reductase-like
家族 Family familyc.71.1.1 — Dihydrofolate reductases
结构域编号 domain_idd3ochb_
类 Class classc — Alpha and beta proteins (a/b)
折叠类型 Fold foldc.71 — Dihydrofolate reductase-like
超家族 Superfamily superfamilyc.71.1 — Dihydrofolate reductase-like
家族 Family familyc.71.1.1 — Dihydrofolate reductases

CATH v4.4 (2 domains)

结构域编号 domain_id3ochA00
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture40 — 3-Layer(aba) Sandwich
拓扑 Topology topology430 — Dihydrofolate Reductase, subunit A
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — Dihydrofolate Reductase, subunit A
结构域编号 domain_id3ochB00
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture40 — 3-Layer(aba) Sandwich
拓扑 Topology topology430 — Dihydrofolate Reductase, subunit A
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — Dihydrofolate Reductase, subunit A
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7. 引用文献 (1)