3okj

Alpha-keto-aldehyde binding mechanism reveals a novel lead structure motif for proteasome inhibition

Method: X-RAY DIFFRACTION

▼

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Proteasome component Y7

物种未注明

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 28	Proteasome component Y13 × 2 （P23638） Proteasome component PRE6 × 2 （P40303） Proteasome component PUP2 × 2 （P32379） Proteasome component PRE5 × 2 （P40302） Proteasome component C1 × 2 （P21242） Proteasome component C7-alpha × 2 （P21243） Proteasome component PUP1 × 2 （P25043） Proteasome component PUP3 × 2 （P25451） Proteasome component C11 × 2 （P22141） Proteasome component PRE2 × 2 （P30656） Proteasome component C5 × 2 （P23724） Proteasome component PRE4 × 2 （P30657） Proteasome component PRE3 × 2 （P38624） N-[(benzyloxy)carbonyl]-L-leucyl-N-[(2S,3S)-3-hydroxy-1-(4-hydroxyphenyl)-4-oxobutan-2-yl]-L-leucinamide × 2 water × 28	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	PSA2_YEAST
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 1–250； UniProt 1–250 作者链 O； PDB构建体 1–250； UniProt 1–250

Proteasome component Y13

物种未注明

UniProt P23638

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 28	Proteasome component Y7 × 2 （P23639） Proteasome component PRE6 × 2 （P40303） Proteasome component PUP2 × 2 （P32379） Proteasome component PRE5 × 2 （P40302） Proteasome component C1 × 2 （P21242） Proteasome component C7-alpha × 2 （P21243） Proteasome component PUP1 × 2 （P25043） Proteasome component PUP3 × 2 （P25451） Proteasome component C11 × 2 （P22141） Proteasome component PRE2 × 2 （P30656） Proteasome component C5 × 2 （P23724） Proteasome component PRE4 × 2 （P30657） Proteasome component PRE3 × 2 （P38624） N-[(benzyloxy)carbonyl]-L-leucyl-N-[(2S,3S)-3-hydroxy-1-(4-hydroxyphenyl)-4-oxobutan-2-yl]-L-leucinamide × 2 water × 28	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	PSA4_YEAST
Isoform	—
PDB实体	2
链与序列区间	作者链 B； PDB构建体 1–244； UniProt 2–245 作者链 P； PDB构建体 1–244； UniProt 2–245

Proteasome component PRE6

物种未注明

UniProt P40303

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 28	Proteasome component Y7 × 2 （P23639） Proteasome component Y13 × 2 （P23638） Proteasome component PUP2 × 2 （P32379） Proteasome component PRE5 × 2 （P40302） Proteasome component C1 × 2 （P21242） Proteasome component C7-alpha × 2 （P21243） Proteasome component PUP1 × 2 （P25043） Proteasome component PUP3 × 2 （P25451） Proteasome component C11 × 2 （P22141） Proteasome component PRE2 × 2 （P30656） Proteasome component C5 × 2 （P23724） Proteasome component PRE4 × 2 （P30657） Proteasome component PRE3 × 2 （P38624） N-[(benzyloxy)carbonyl]-L-leucyl-N-[(2S,3S)-3-hydroxy-1-(4-hydroxyphenyl)-4-oxobutan-2-yl]-L-leucinamide × 2 water × 28	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	PSA7_YEAST
Isoform	—
PDB实体	3
链与序列区间	作者链 C； PDB构建体 1–241； UniProt 3–243 作者链 Q； PDB构建体 1–241； UniProt 3–243

Proteasome component PUP2

物种未注明

UniProt P32379

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 28	Proteasome component Y7 × 2 （P23639） Proteasome component Y13 × 2 （P23638） Proteasome component PRE6 × 2 （P40303） Proteasome component PRE5 × 2 （P40302） Proteasome component C1 × 2 （P21242） Proteasome component C7-alpha × 2 （P21243） Proteasome component PUP1 × 2 （P25043） Proteasome component PUP3 × 2 （P25451） Proteasome component C11 × 2 （P22141） Proteasome component PRE2 × 2 （P30656） Proteasome component C5 × 2 （P23724） Proteasome component PRE4 × 2 （P30657） Proteasome component PRE3 × 2 （P38624） N-[(benzyloxy)carbonyl]-L-leucyl-N-[(2S,3S)-3-hydroxy-1-(4-hydroxyphenyl)-4-oxobutan-2-yl]-L-leucinamide × 2 water × 28	与蛋白数一致

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UniProt名称	PSA5_YEAST
Isoform	—
PDB实体	4
链与序列区间	作者链 D； PDB构建体 1–242； UniProt 9–250 作者链 R； PDB构建体 1–242； UniProt 9–250

Proteasome component PRE5

物种未注明

UniProt P40302

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 28	Proteasome component Y7 × 2 （P23639） Proteasome component Y13 × 2 （P23638） Proteasome component PRE6 × 2 （P40303） Proteasome component PUP2 × 2 （P32379） Proteasome component C1 × 2 （P21242） Proteasome component C7-alpha × 2 （P21243） Proteasome component PUP1 × 2 （P25043） Proteasome component PUP3 × 2 （P25451） Proteasome component C11 × 2 （P22141） Proteasome component PRE2 × 2 （P30656） Proteasome component C5 × 2 （P23724） Proteasome component PRE4 × 2 （P30657） Proteasome component PRE3 × 2 （P38624） N-[(benzyloxy)carbonyl]-L-leucyl-N-[(2S,3S)-3-hydroxy-1-(4-hydroxyphenyl)-4-oxobutan-2-yl]-L-leucinamide × 2 water × 28	与蛋白数一致

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UniProt名称	PSA1_YEAST
Isoform	—
PDB实体	5
链与序列区间	作者链 E； PDB构建体 1–233； UniProt 2–234 作者链 S； PDB构建体 1–233； UniProt 2–234

Proteasome component C1

物种未注明

UniProt P21242

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 28	Proteasome component Y7 × 2 （P23639） Proteasome component Y13 × 2 （P23638） Proteasome component PRE6 × 2 （P40303） Proteasome component PUP2 × 2 （P32379） Proteasome component PRE5 × 2 （P40302） Proteasome component C7-alpha × 2 （P21243） Proteasome component PUP1 × 2 （P25043） Proteasome component PUP3 × 2 （P25451） Proteasome component C11 × 2 （P22141） Proteasome component PRE2 × 2 （P30656） Proteasome component C5 × 2 （P23724） Proteasome component PRE4 × 2 （P30657） Proteasome component PRE3 × 2 （P38624） N-[(benzyloxy)carbonyl]-L-leucyl-N-[(2S,3S)-3-hydroxy-1-(4-hydroxyphenyl)-4-oxobutan-2-yl]-L-leucinamide × 2 water × 28	与蛋白数一致

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UniProt名称	PSA3_YEAST
Isoform	—
PDB实体	6
链与序列区间	作者链 F； PDB构建体 1–244； UniProt 5–248 作者链 T； PDB构建体 1–244； UniProt 5–248

Proteasome component C7-alpha

物种未注明

UniProt P21243

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 28	Proteasome component Y7 × 2 （P23639） Proteasome component Y13 × 2 （P23638） Proteasome component PRE6 × 2 （P40303） Proteasome component PUP2 × 2 （P32379） Proteasome component PRE5 × 2 （P40302） Proteasome component C1 × 2 （P21242） Proteasome component PUP1 × 2 （P25043） Proteasome component PUP3 × 2 （P25451） Proteasome component C11 × 2 （P22141） Proteasome component PRE2 × 2 （P30656） Proteasome component C5 × 2 （P23724） Proteasome component PRE4 × 2 （P30657） Proteasome component PRE3 × 2 （P38624） N-[(benzyloxy)carbonyl]-L-leucyl-N-[(2S,3S)-3-hydroxy-1-(4-hydroxyphenyl)-4-oxobutan-2-yl]-L-leucinamide × 2 water × 28	与蛋白数一致

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UniProt名称	PSA6_YEAST
Isoform	—
PDB实体	7
链与序列区间	作者链 G； PDB构建体 1–243； UniProt 10–252 作者链 U； PDB构建体 1–243； UniProt 10–252

Proteasome component PUP1

物种未注明

UniProt P25043

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 28	Proteasome component Y7 × 2 （P23639） Proteasome component Y13 × 2 （P23638） Proteasome component PRE6 × 2 （P40303） Proteasome component PUP2 × 2 （P32379） Proteasome component PRE5 × 2 （P40302） Proteasome component C1 × 2 （P21242） Proteasome component C7-alpha × 2 （P21243） Proteasome component PUP3 × 2 （P25451） Proteasome component C11 × 2 （P22141） Proteasome component PRE2 × 2 （P30656） Proteasome component C5 × 2 （P23724） Proteasome component PRE4 × 2 （P30657） Proteasome component PRE3 × 2 （P38624） N-[(benzyloxy)carbonyl]-L-leucyl-N-[(2S,3S)-3-hydroxy-1-(4-hydroxyphenyl)-4-oxobutan-2-yl]-L-leucinamide × 2 water × 28	与蛋白数一致

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UniProt名称	PSB7_YEAST
Isoform	—
PDB实体	8
链与序列区间	作者链 H； PDB构建体 1–222； UniProt 30–251 作者链 V； PDB构建体 1–222； UniProt 30–251

Proteasome component PUP3

物种未注明

UniProt P25451

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 28	Proteasome component Y7 × 2 （P23639） Proteasome component Y13 × 2 （P23638） Proteasome component PRE6 × 2 （P40303） Proteasome component PUP2 × 2 （P32379） Proteasome component PRE5 × 2 （P40302） Proteasome component C1 × 2 （P21242） Proteasome component C7-alpha × 2 （P21243） Proteasome component PUP1 × 2 （P25043） Proteasome component C11 × 2 （P22141） Proteasome component PRE2 × 2 （P30656） Proteasome component C5 × 2 （P23724） Proteasome component PRE4 × 2 （P30657） Proteasome component PRE3 × 2 （P38624） N-[(benzyloxy)carbonyl]-L-leucyl-N-[(2S,3S)-3-hydroxy-1-(4-hydroxyphenyl)-4-oxobutan-2-yl]-L-leucinamide × 2 water × 28	与蛋白数一致

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UniProt名称	PSB3_YEAST
Isoform	—
PDB实体	9
链与序列区间	作者链 I； PDB构建体 1–204； UniProt 2–205 作者链 W； PDB构建体 1–204； UniProt 2–205

Proteasome component C11

物种未注明

UniProt P22141

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 28	Proteasome component Y7 × 2 （P23639） Proteasome component Y13 × 2 （P23638） Proteasome component PRE6 × 2 （P40303） Proteasome component PUP2 × 2 （P32379） Proteasome component PRE5 × 2 （P40302） Proteasome component C1 × 2 （P21242） Proteasome component C7-alpha × 2 （P21243） Proteasome component PUP1 × 2 （P25043） Proteasome component PUP3 × 2 （P25451） Proteasome component PRE2 × 2 （P30656） Proteasome component C5 × 2 （P23724） Proteasome component PRE4 × 2 （P30657） Proteasome component PRE3 × 2 （P38624） N-[(benzyloxy)carbonyl]-L-leucyl-N-[(2S,3S)-3-hydroxy-1-(4-hydroxyphenyl)-4-oxobutan-2-yl]-L-leucinamide × 2 water × 28	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	PSB2_YEAST
Isoform	—
PDB实体	10
链与序列区间	作者链 J； PDB构建体 1–198； UniProt 1–198 作者链 X； PDB构建体 1–198； UniProt 1–198

Proteasome component PRE2

物种未注明

UniProt P30656

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 28	Proteasome component Y7 × 2 （P23639） Proteasome component Y13 × 2 （P23638） Proteasome component PRE6 × 2 （P40303） Proteasome component PUP2 × 2 （P32379） Proteasome component PRE5 × 2 （P40302） Proteasome component C1 × 2 （P21242） Proteasome component C7-alpha × 2 （P21243） Proteasome component PUP1 × 2 （P25043） Proteasome component PUP3 × 2 （P25451） Proteasome component C11 × 2 （P22141） Proteasome component C5 × 2 （P23724） Proteasome component PRE4 × 2 （P30657） Proteasome component PRE3 × 2 （P38624） N-[(benzyloxy)carbonyl]-L-leucyl-N-[(2S,3S)-3-hydroxy-1-(4-hydroxyphenyl)-4-oxobutan-2-yl]-L-leucinamide × 2 water × 28	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	PSB5_YEAST
Isoform	—
PDB实体	11
链与序列区间	作者链 K； PDB构建体 1–212； UniProt 76–287 作者链 Y； PDB构建体 1–212； UniProt 76–287

Proteasome component C5

物种未注明

UniProt P23724

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 28	Proteasome component Y7 × 2 （P23639） Proteasome component Y13 × 2 （P23638） Proteasome component PRE6 × 2 （P40303） Proteasome component PUP2 × 2 （P32379） Proteasome component PRE5 × 2 （P40302） Proteasome component C1 × 2 （P21242） Proteasome component C7-alpha × 2 （P21243） Proteasome component PUP1 × 2 （P25043） Proteasome component PUP3 × 2 （P25451） Proteasome component C11 × 2 （P22141） Proteasome component PRE2 × 2 （P30656） Proteasome component PRE4 × 2 （P30657） Proteasome component PRE3 × 2 （P38624） N-[(benzyloxy)carbonyl]-L-leucyl-N-[(2S,3S)-3-hydroxy-1-(4-hydroxyphenyl)-4-oxobutan-2-yl]-L-leucinamide × 2 water × 28	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	PSB1_YEAST
Isoform	—
PDB实体	12
链与序列区间	作者链 L； PDB构建体 1–222； UniProt 20–241 作者链 Z； PDB构建体 1–222； UniProt 20–241

Proteasome component PRE4

物种未注明

UniProt P30657

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 28	Proteasome component Y7 × 2 （P23639） Proteasome component Y13 × 2 （P23638） Proteasome component PRE6 × 2 （P40303） Proteasome component PUP2 × 2 （P32379） Proteasome component PRE5 × 2 （P40302） Proteasome component C1 × 2 （P21242） Proteasome component C7-alpha × 2 （P21243） Proteasome component PUP1 × 2 （P25043） Proteasome component PUP3 × 2 （P25451） Proteasome component C11 × 2 （P22141） Proteasome component PRE2 × 2 （P30656） Proteasome component C5 × 2 （P23724） Proteasome component PRE3 × 2 （P38624） N-[(benzyloxy)carbonyl]-L-leucyl-N-[(2S,3S)-3-hydroxy-1-(4-hydroxyphenyl)-4-oxobutan-2-yl]-L-leucinamide × 2 water × 28	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	PSB4_YEAST
Isoform	—
PDB实体	13
链与序列区间	作者链 1； PDB构建体 1–233； UniProt 34–266 作者链 M； PDB构建体 1–233； UniProt 34–266

Proteasome component PRE3

物种未注明

UniProt P38624

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 28	Proteasome component Y7 × 2 （P23639） Proteasome component Y13 × 2 （P23638） Proteasome component PRE6 × 2 （P40303） Proteasome component PUP2 × 2 （P32379） Proteasome component PRE5 × 2 （P40302） Proteasome component C1 × 2 （P21242） Proteasome component C7-alpha × 2 （P21243） Proteasome component PUP1 × 2 （P25043） Proteasome component PUP3 × 2 （P25451） Proteasome component C11 × 2 （P22141） Proteasome component PRE2 × 2 （P30656） Proteasome component C5 × 2 （P23724） Proteasome component PRE4 × 2 （P30657） N-[(benzyloxy)carbonyl]-L-leucyl-N-[(2S,3S)-3-hydroxy-1-(4-hydroxyphenyl)-4-oxobutan-2-yl]-L-leucinamide × 2 water × 28	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	PSB6_YEAST
Isoform	—
PDB实体	14
链与序列区间	作者链 2； PDB构建体 1–196； UniProt 20–215 作者链 N； PDB构建体 1–196； UniProt 20–215

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	3okj
沉积日期 deposition_date	2010-08-25
结构标题 title	Alpha-keto-aldehyde binding mechanism reveals a novel lead structure motif for proteasome inhibition
关键词 keywords	;ubiquitin, protease, inhibitor, central antiparallel beta-sheet flanked by helices, turnover of ubiquitinated substrates, nucleus, cytosol, HYDROLASE-HYDROLASE INHIBITOR complex ;; HYDROLASE/HYDROLASE INHIBITOR
实验方法 method	X-RAY DIFFRACTION

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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

3okj__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

3okj__assembly_1__model_1 | I(q)

100 个绘图点；横轴和纵轴均采用对数尺度。

3okj__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。

Rg（Guinier）	60.25 Å
Rg（电子密度）	59.77 Å
总 Rg	59.91 Å
原子数	49549
残基数	6359
排除体积	883330 Å³
最大 q	0.500 Å⁻¹

Assembly	Model	结构单元	聚集说明	状态	CRYSOL	操作
1	1	`3okj__assembly_1__model_1`	28-meric （28）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载

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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (16)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	Proteasome component Y7
分子量 formula_weight	27191.8 kDa
EC 编号 ec_number	3.4.25.1
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A,O
原子数 atom_count	50851

MTDRYSFSLTTFSPSGKLGQIDYALTAVKQGVTSLGIKATNGVVIATEKKSSSPLAMSETLSKVSLLTPDIGAVYSGMGPDYRVLVDKSRKVAHTSYKRIYGEYPPTKLLVSEVAKIMQEATQSGGVRPFGVSLLIAGHDEFNGFSLYQVDPSGSYFPWKATAIGKGSVAAKTFLEKRWNDELELEDAIHIALLTLKESVEGEFNGDTIELAIIGDENPDLLGYTGIPTDKGPRFRKLTSQEINDRLEAL

实体 2 Entity 2 polymer

描述 description	Proteasome component Y13
分子量 formula_weight	27050.4 kDa
EC 编号 ec_number	3.4.25.1
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	B,P

GSRRYDSRTTIFSPEGRLYQVEYALESISHAGTAIGIMASDGIVLAAERKVTSTLLEQDTSTEKLYKLNDKIAVAVAGLTADAEILINTARIHAQNYLKTYNEDIPVEILVRRLSDIKQGYTQHGGLRPFGVSFIYAGYDDRYGYQLYTSNPSGNYTGWKAISVGANTSAAQTLLQMDYKDDMKVDDAIELALKTLSKTTDSSALTYDRLEFATIRKGANDGEVYQKIFKPQEIKDILVKTGIT

实体 3 Entity 3 polymer

描述 description	Proteasome component PRE6
分子量 formula_weight	26903.3 kDa
EC 编号 ec_number	3.4.25.1
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	C,Q

GYDRALSIFSPDGHIFQVEYALEAVKRGTCAVGVKGKNCVVLGCERRSTLKLQDTRITPSKVSKIDSHVVLSFSGLNADSRILIEKARVEAQSHRLTLEDPVTVEYLTRYVAGVQQRYTQSGGVRPFGVSTLIAGFDPRDDEPKLYQTEPSGIYSSWSAQTIGRNSKTVREFLEKNYDRKEPPATVEECVKLTVRSLLEVVQTGAKNIEITVVKPDSDIVALSSEEINQYVTQIEQEKQEQ

实体 4 Entity 4 polymer

描述 description	Proteasome component PUP2
分子量 formula_weight	26544.8 kDa
EC 编号 ec_number	3.4.25.1
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	D,R

DRGVSTFSPEGRLFQVEYSLEAIKLGSTAIGIATKEGVVLGVEKRATSPLLESDSIEKIVEIDRHIGCAMSGLTADARSMIEHARTAAVTHNLYYDEDINVESLTQSVCDLALRFGEGASGEERLMSRPFGVALLIAGHDADDGYQLFHAEPSGTFYRYNAKAIGSGSEGAQAELLNEWHSSLTLKEAELLVLKILKQVMEEKLDENNAQLSCITKQDGFKIYDNEKTAELIKELKEKEAAE

实体 5 Entity 5 polymer

描述 description	Proteasome component PRE5
分子量 formula_weight	25502.8 kDa
EC 编号 ec_number	3.4.25.1
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	E,S

FRNNYDGDTVTFSPTGRLFQVEYALEAIKQGSVTVGLRSNTHAVLVALKRNADELSSYQKKIIKCDEHMGLSLAGLAPDARVLSNYLRQQCNYSSLVFNRKLAVERAGHLLCDKAQKNTQSYGGRPYGVGLLIIGYDKSGAHLLEFQPSGNVTELYGTAIGARSQGAKTYLERTLDTFIKIDGNPDELIKAGVEAISQSLRDESLTVDNLSIAIVGKDTPFTIYDGEAVAKYI

实体 6 Entity 6 polymer

描述 description	Proteasome component C1
分子量 formula_weight	26892.5 kDa
EC 编号 ec_number	3.4.25.1
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	F,T

GTGYDLSNSVFSPDGRNFQVEYAVKAVENGTTSIGIKCNDGVVFAVEKLITSKLLVPQKNVKIQVVDRHIGCVYSGLIPDGRHLVNRGREEAASFKKLYKTPIPIPAFADRLGQYVQAHTLYNSVRPFGVSTIFGGVDKNGAHLYMLEPSGSYWGYKGAATGKGRQSAKAELEKLVDHHPEGLSAREAVKQAAKIIYLAHEDNKEKDFELEISWCSLSETNGLHKFVKGDLLQEAIDFAQKEIN

实体 7 Entity 7 polymer

描述 description	Proteasome component C7-alpha
分子量 formula_weight	27316.0 kDa
EC 编号 ec_number	3.4.25.1
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	G,U

AGYDRHITIFSPEGRLYQVEYAFKATNQTNINSLAVRGKDCTVVISQKKVPDKLLDPTTVSYIFCISRTIGMVVNGPIPDARNAALRAKAEAAEFRYKYGYDMPCDVLAKRMANLSQIYTQRAYMRPLGVILTFVSVDEELGPSIYKTDPAGYYVGYKATATGPKQQEITTNLENHFKKSKIDHINEESWEKVVEFAITHMIDALGTEFSKNDLEVGVATKDKFFTLSAENIEERLVAIAEQD

实体 8 Entity 8 polymer

描述 description	Proteasome component PUP1
分子量 formula_weight	23987.3 kDa
EC 编号 ec_number	3.4.25.1
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	H,V

TTIVGVKFNNGVVIAADTRSTQGPIVADKNCAKLHRISPKIWCAGAGTAADTEAVTQLIGSNIELHSLYTSREPRVVSALQMLKQHLFKYQGHIGAYLIVAGVDPTGSHLFSIHAHGSTDVGYYLSLGSGSLAAMAVLESHWKQDLTKEEAIKLASDAIQAGIWNDLGSGSNVDVCVMEIGKDAEYLRNYLTPNVREEKQKSYKFPRGTTAVLKESIVNICD

实体 9 Entity 9 polymer

描述 description	Proteasome component PUP3
分子量 formula_weight	22496.6 kDa
EC 编号 ec_number	3.4.25.1
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	I,W

SDPSSINGGIVVAMTGKDCVAIACDLRLGSQSLGVSNKFEKIFHYGHVFLGITGLATDVTTLNEMFRYKTNLYKLKEERAIEPETFTQLVSSSLYERRFGPYFVGPVVAGINSKSGKPFIAGFDLIGCIDEAKDFIVSGTASDQLFGMCESLYEPNLEPEDLFETISQALLNAADRDALSGWGAVVYIIKKDEVVKRYLKMRQD

实体 10 Entity 10 polymer

描述 description	Proteasome component C11
分子量 formula_weight	22545.7 kDa
EC 编号 ec_number	3.4.25.1
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	J,X

MDIILGIRVQDSVILASSKAVTRGISVLKDSDDKTRQLSPHTLMSFAGEAGDTVQFAEYIQANIQLYSIREDYELSPQAVSSFVRQELAKSIRSRRPYQVNVLIGGYDKKKNKPELYQIDYLGTKVELPYGAHGYSGFYTFSLLDHHYRPDMTTEEGLDLLKLCVQELEKRMPMDFKGVIVKIVDKDGIRQVDDFQAQ

实体 11 Entity 11 polymer

描述 description	Proteasome component PRE2
分子量 formula_weight	23325.2 kDa
EC 编号 ec_number	3.4.25.1
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	K,Y

TTTLAFRFQGGIIVAVDSRATAGNWVASQTVKKVIEINPFLLGTMAGGAADCQFWETWLGSQCRLHELREKERISVAAASKILSNLVYQYKGAGLSMGTMICGYTRKEGPTIYYVDSDGTRLKGDIFCVGSGQTFAYGVLDSNYKWDLSVEDALYLGKRSILAAAHRDAYSGGSVNLYHVTEDGWIYHGNHDVGELFWKVKEEEGSFNNVIG

实体 12 Entity 12 polymer

描述 description	Proteasome component C5
分子量 formula_weight	24883.9 kDa
EC 编号 ec_number	3.4.25.1
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	L,Z

QFNPYGDNGGTILGIAGEDFAVLAGDTRNITDYSINSRYEPKVFDCGDNIVMSANGFAADGDALVKRFKNSVKWYHFDHNDKKLSINSAARNIQHLLYGKRFFPYYVHTIIAGLDEDGKGAVYSFDPVGSYEREQCRAGGAAASLIMPFLDNQVNFKNQYEPGTNGKVKKPLKYLSVEEVIKLVRDSFTSATERHIQVGDGLEILIVTKDGVRKEFYELKRD

实体 13 Entity 13 polymer

描述 description	Proteasome component PRE4
分子量 formula_weight	25945.5 kDa
EC 编号 ec_number	3.4.25.1
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	M,1

TQQPIVTGTSVISMKYDNGVIIAADNLGSYGSLLRFNGVERLIPVGDNTVVGISGDISDMQHIERLLKDLVTENAYDNPLADAEEALEPSYIFEYLATVMYQRRSKMNPLWNAIIVAGVQSNGDQFLRYVNLLGVTYSSPTLATGFGAHMANPLLRKVVDRESDIPKTTVQVAEEAIVNAMRVLYYRDARSSRNFSLAIIDKNTGLTFKKNLQVENMKWDFAKDIKGYGTQKI

实体 14 Entity 14 polymer

描述 description	Proteasome component PRE3
分子量 formula_weight	21517.2 kDa
EC 编号 ec_number	3.4.25.1
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	N,2

TSIMAVTFKDGVILGADSRTTTGAYIANRVTDKLTRVHDKIWCCRSGSAADTQAIADIVQYHLELYTSQYGTPSTETAASVFKELCYENKDNLTAGIIVAGYDDKNKGEVYTIPLGGSVHKLPYAIAGSGSTFIYGYCDKNFRENMSKEETVDFIKHSLSQAIKWDGSSGGVIRMVVLTAAGVERLIFYPDEYEQL

实体 15 Entity 15 non-polymer

描述 description	N-[(benzyloxy)carbonyl]-L-leucyl-N-[(2S,3S)-3-hydroxy-1-(4-hydroxyphenyl)-4-oxobutan-2-yl]-L-leucinamide
分子量 formula_weight	555.7 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	2

实体 16 Entity 16 water

描述 description	water
分子量 formula_weight	18.0 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1293

▼

6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 56 domains

SCOP 2.08 (28 domains)

结构域编号 domain_id	d3okj1_
类 Class class	d — Alpha and beta proteins (a+b)
折叠类型 Fold fold	d.153 — Ntn hydrolase-like
超家族 Superfamily superfamily	d.153.1 — N-terminal nucleophile aminohydrolases (Ntn hydrolases)
家族 Family family	d.153.1.4 — Proteasome subunits

结构域编号 domain_id	d3okj2_
类 Class class	d — Alpha and beta proteins (a+b)
折叠类型 Fold fold	d.153 — Ntn hydrolase-like
超家族 Superfamily superfamily	d.153.1 — N-terminal nucleophile aminohydrolases (Ntn hydrolases)
家族 Family family	d.153.1.4 — Proteasome subunits

结构域编号 domain_id	d3okja_
类 Class class	d — Alpha and beta proteins (a+b)
折叠类型 Fold fold	d.153 — Ntn hydrolase-like
超家族 Superfamily superfamily	d.153.1 — N-terminal nucleophile aminohydrolases (Ntn hydrolases)
家族 Family family	d.153.1.4 — Proteasome subunits

结构域编号 domain_id	d3okjb_
类 Class class	d — Alpha and beta proteins (a+b)
折叠类型 Fold fold	d.153 — Ntn hydrolase-like
超家族 Superfamily superfamily	d.153.1 — N-terminal nucleophile aminohydrolases (Ntn hydrolases)
家族 Family family	d.153.1.4 — Proteasome subunits

结构域编号 domain_id	d3okjc_
类 Class class	d — Alpha and beta proteins (a+b)
折叠类型 Fold fold	d.153 — Ntn hydrolase-like
超家族 Superfamily superfamily	d.153.1 — N-terminal nucleophile aminohydrolases (Ntn hydrolases)
家族 Family family	d.153.1.4 — Proteasome subunits

结构域编号 domain_id	d3okjd_
类 Class class	d — Alpha and beta proteins (a+b)
折叠类型 Fold fold	d.153 — Ntn hydrolase-like
超家族 Superfamily superfamily	d.153.1 — N-terminal nucleophile aminohydrolases (Ntn hydrolases)
家族 Family family	d.153.1.4 — Proteasome subunits

结构域编号 domain_id	d3okje_
类 Class class	d — Alpha and beta proteins (a+b)
折叠类型 Fold fold	d.153 — Ntn hydrolase-like
超家族 Superfamily superfamily	d.153.1 — N-terminal nucleophile aminohydrolases (Ntn hydrolases)
家族 Family family	d.153.1.4 — Proteasome subunits

结构域编号 domain_id	d3okjf_
类 Class class	d — Alpha and beta proteins (a+b)
折叠类型 Fold fold	d.153 — Ntn hydrolase-like
超家族 Superfamily superfamily	d.153.1 — N-terminal nucleophile aminohydrolases (Ntn hydrolases)
家族 Family family	d.153.1.4 — Proteasome subunits

结构域编号 domain_id	d3okjg_
类 Class class	d — Alpha and beta proteins (a+b)
折叠类型 Fold fold	d.153 — Ntn hydrolase-like
超家族 Superfamily superfamily	d.153.1 — N-terminal nucleophile aminohydrolases (Ntn hydrolases)
家族 Family family	d.153.1.4 — Proteasome subunits

结构域编号 domain_id	d3okjh_
类 Class class	d — Alpha and beta proteins (a+b)
折叠类型 Fold fold	d.153 — Ntn hydrolase-like
超家族 Superfamily superfamily	d.153.1 — N-terminal nucleophile aminohydrolases (Ntn hydrolases)
家族 Family family	d.153.1.4 — Proteasome subunits

结构域编号 domain_id	d3okji_
类 Class class	d — Alpha and beta proteins (a+b)
折叠类型 Fold fold	d.153 — Ntn hydrolase-like
超家族 Superfamily superfamily	d.153.1 — N-terminal nucleophile aminohydrolases (Ntn hydrolases)
家族 Family family	d.153.1.4 — Proteasome subunits

结构域编号 domain_id	d3okjj_
类 Class class	d — Alpha and beta proteins (a+b)
折叠类型 Fold fold	d.153 — Ntn hydrolase-like
超家族 Superfamily superfamily	d.153.1 — N-terminal nucleophile aminohydrolases (Ntn hydrolases)
家族 Family family	d.153.1.4 — Proteasome subunits

结构域编号 domain_id	d3okjk_
类 Class class	d — Alpha and beta proteins (a+b)
折叠类型 Fold fold	d.153 — Ntn hydrolase-like
超家族 Superfamily superfamily	d.153.1 — N-terminal nucleophile aminohydrolases (Ntn hydrolases)
家族 Family family	d.153.1.4 — Proteasome subunits

结构域编号 domain_id	d3okjl_
类 Class class	d — Alpha and beta proteins (a+b)
折叠类型 Fold fold	d.153 — Ntn hydrolase-like
超家族 Superfamily superfamily	d.153.1 — N-terminal nucleophile aminohydrolases (Ntn hydrolases)
家族 Family family	d.153.1.4 — Proteasome subunits

结构域编号 domain_id	d3okjm_
类 Class class	d — Alpha and beta proteins (a+b)
折叠类型 Fold fold	d.153 — Ntn hydrolase-like
超家族 Superfamily superfamily	d.153.1 — N-terminal nucleophile aminohydrolases (Ntn hydrolases)
家族 Family family	d.153.1.4 — Proteasome subunits

结构域编号 domain_id	d3okjn_
类 Class class	d — Alpha and beta proteins (a+b)
折叠类型 Fold fold	d.153 — Ntn hydrolase-like
超家族 Superfamily superfamily	d.153.1 — N-terminal nucleophile aminohydrolases (Ntn hydrolases)
家族 Family family	d.153.1.4 — Proteasome subunits

结构域编号 domain_id	d3okjo_
类 Class class	d — Alpha and beta proteins (a+b)
折叠类型 Fold fold	d.153 — Ntn hydrolase-like
超家族 Superfamily superfamily	d.153.1 — N-terminal nucleophile aminohydrolases (Ntn hydrolases)
家族 Family family	d.153.1.4 — Proteasome subunits

结构域编号 domain_id	d3okjp_
类 Class class	d — Alpha and beta proteins (a+b)
折叠类型 Fold fold	d.153 — Ntn hydrolase-like
超家族 Superfamily superfamily	d.153.1 — N-terminal nucleophile aminohydrolases (Ntn hydrolases)
家族 Family family	d.153.1.4 — Proteasome subunits

结构域编号 domain_id	d3okjq_
类 Class class	d — Alpha and beta proteins (a+b)
折叠类型 Fold fold	d.153 — Ntn hydrolase-like
超家族 Superfamily superfamily	d.153.1 — N-terminal nucleophile aminohydrolases (Ntn hydrolases)
家族 Family family	d.153.1.4 — Proteasome subunits

结构域编号 domain_id	d3okjr_
类 Class class	d — Alpha and beta proteins (a+b)
折叠类型 Fold fold	d.153 — Ntn hydrolase-like
超家族 Superfamily superfamily	d.153.1 — N-terminal nucleophile aminohydrolases (Ntn hydrolases)
家族 Family family	d.153.1.4 — Proteasome subunits

结构域编号 domain_id	d3okjs_
类 Class class	d — Alpha and beta proteins (a+b)
折叠类型 Fold fold	d.153 — Ntn hydrolase-like
超家族 Superfamily superfamily	d.153.1 — N-terminal nucleophile aminohydrolases (Ntn hydrolases)
家族 Family family	d.153.1.4 — Proteasome subunits

结构域编号 domain_id	d3okjt_
类 Class class	d — Alpha and beta proteins (a+b)
折叠类型 Fold fold	d.153 — Ntn hydrolase-like
超家族 Superfamily superfamily	d.153.1 — N-terminal nucleophile aminohydrolases (Ntn hydrolases)
家族 Family family	d.153.1.4 — Proteasome subunits

结构域编号 domain_id	d3okju_
类 Class class	d — Alpha and beta proteins (a+b)
折叠类型 Fold fold	d.153 — Ntn hydrolase-like
超家族 Superfamily superfamily	d.153.1 — N-terminal nucleophile aminohydrolases (Ntn hydrolases)
家族 Family family	d.153.1.4 — Proteasome subunits

结构域编号 domain_id	d3okjv_
类 Class class	d — Alpha and beta proteins (a+b)
折叠类型 Fold fold	d.153 — Ntn hydrolase-like
超家族 Superfamily superfamily	d.153.1 — N-terminal nucleophile aminohydrolases (Ntn hydrolases)
家族 Family family	d.153.1.4 — Proteasome subunits

结构域编号 domain_id	d3okjw_
类 Class class	d — Alpha and beta proteins (a+b)
折叠类型 Fold fold	d.153 — Ntn hydrolase-like
超家族 Superfamily superfamily	d.153.1 — N-terminal nucleophile aminohydrolases (Ntn hydrolases)
家族 Family family	d.153.1.4 — Proteasome subunits

结构域编号 domain_id	d3okjx_
类 Class class	d — Alpha and beta proteins (a+b)
折叠类型 Fold fold	d.153 — Ntn hydrolase-like
超家族 Superfamily superfamily	d.153.1 — N-terminal nucleophile aminohydrolases (Ntn hydrolases)
家族 Family family	d.153.1.4 — Proteasome subunits

结构域编号 domain_id	d3okjy_
类 Class class	d — Alpha and beta proteins (a+b)
折叠类型 Fold fold	d.153 — Ntn hydrolase-like
超家族 Superfamily superfamily	d.153.1 — N-terminal nucleophile aminohydrolases (Ntn hydrolases)
家族 Family family	d.153.1.4 — Proteasome subunits

结构域编号 domain_id	d3okjz_
类 Class class	d — Alpha and beta proteins (a+b)
折叠类型 Fold fold	d.153 — Ntn hydrolase-like
超家族 Superfamily superfamily	d.153.1 — N-terminal nucleophile aminohydrolases (Ntn hydrolases)
家族 Family family	d.153.1.4 — Proteasome subunits

CATH v4.4 (28 domains)

结构域编号 domain_id	3okj100
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	60 — 4-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	20 — Glutamine Phosphoribosylpyrophosphate, subunit 1, domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Aminohydrolase, N-terminal nucleophile (Ntn) domain

结构域编号 domain_id	3okj200
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	60 — 4-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	20 — Glutamine Phosphoribosylpyrophosphate, subunit 1, domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Aminohydrolase, N-terminal nucleophile (Ntn) domain

结构域编号 domain_id	3okjA00
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	60 — 4-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	20 — Glutamine Phosphoribosylpyrophosphate, subunit 1, domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Aminohydrolase, N-terminal nucleophile (Ntn) domain

结构域编号 domain_id	3okjB00
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	60 — 4-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	20 — Glutamine Phosphoribosylpyrophosphate, subunit 1, domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Aminohydrolase, N-terminal nucleophile (Ntn) domain

结构域编号 domain_id	3okjC00
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	60 — 4-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	20 — Glutamine Phosphoribosylpyrophosphate, subunit 1, domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Aminohydrolase, N-terminal nucleophile (Ntn) domain

结构域编号 domain_id	3okjD00
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	60 — 4-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	20 — Glutamine Phosphoribosylpyrophosphate, subunit 1, domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Aminohydrolase, N-terminal nucleophile (Ntn) domain

结构域编号 domain_id	3okjE00
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	60 — 4-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	20 — Glutamine Phosphoribosylpyrophosphate, subunit 1, domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Aminohydrolase, N-terminal nucleophile (Ntn) domain

结构域编号 domain_id	3okjF00
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	60 — 4-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	20 — Glutamine Phosphoribosylpyrophosphate, subunit 1, domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Aminohydrolase, N-terminal nucleophile (Ntn) domain

结构域编号 domain_id	3okjG00
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	60 — 4-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	20 — Glutamine Phosphoribosylpyrophosphate, subunit 1, domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Aminohydrolase, N-terminal nucleophile (Ntn) domain

结构域编号 domain_id	3okjH00
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	60 — 4-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	20 — Glutamine Phosphoribosylpyrophosphate, subunit 1, domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Aminohydrolase, N-terminal nucleophile (Ntn) domain

结构域编号 domain_id	3okjI00
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	60 — 4-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	20 — Glutamine Phosphoribosylpyrophosphate, subunit 1, domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Aminohydrolase, N-terminal nucleophile (Ntn) domain

结构域编号 domain_id	3okjJ00
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	60 — 4-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	20 — Glutamine Phosphoribosylpyrophosphate, subunit 1, domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Aminohydrolase, N-terminal nucleophile (Ntn) domain

结构域编号 domain_id	3okjK00
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	60 — 4-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	20 — Glutamine Phosphoribosylpyrophosphate, subunit 1, domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Aminohydrolase, N-terminal nucleophile (Ntn) domain

结构域编号 domain_id	3okjL00
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	60 — 4-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	20 — Glutamine Phosphoribosylpyrophosphate, subunit 1, domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Aminohydrolase, N-terminal nucleophile (Ntn) domain

结构域编号 domain_id	3okjM00
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	60 — 4-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	20 — Glutamine Phosphoribosylpyrophosphate, subunit 1, domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Aminohydrolase, N-terminal nucleophile (Ntn) domain

结构域编号 domain_id	3okjN00
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	60 — 4-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	20 — Glutamine Phosphoribosylpyrophosphate, subunit 1, domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Aminohydrolase, N-terminal nucleophile (Ntn) domain

结构域编号 domain_id	3okjO00
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	60 — 4-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	20 — Glutamine Phosphoribosylpyrophosphate, subunit 1, domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Aminohydrolase, N-terminal nucleophile (Ntn) domain

结构域编号 domain_id	3okjP00
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	60 — 4-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	20 — Glutamine Phosphoribosylpyrophosphate, subunit 1, domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Aminohydrolase, N-terminal nucleophile (Ntn) domain

结构域编号 domain_id	3okjQ00
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	60 — 4-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	20 — Glutamine Phosphoribosylpyrophosphate, subunit 1, domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Aminohydrolase, N-terminal nucleophile (Ntn) domain

结构域编号 domain_id	3okjR00
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	60 — 4-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	20 — Glutamine Phosphoribosylpyrophosphate, subunit 1, domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Aminohydrolase, N-terminal nucleophile (Ntn) domain

结构域编号 domain_id	3okjS00
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	60 — 4-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	20 — Glutamine Phosphoribosylpyrophosphate, subunit 1, domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Aminohydrolase, N-terminal nucleophile (Ntn) domain

结构域编号 domain_id	3okjT00
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	60 — 4-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	20 — Glutamine Phosphoribosylpyrophosphate, subunit 1, domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Aminohydrolase, N-terminal nucleophile (Ntn) domain

结构域编号 domain_id	3okjU00
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	60 — 4-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	20 — Glutamine Phosphoribosylpyrophosphate, subunit 1, domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Aminohydrolase, N-terminal nucleophile (Ntn) domain

结构域编号 domain_id	3okjV00
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	60 — 4-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	20 — Glutamine Phosphoribosylpyrophosphate, subunit 1, domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Aminohydrolase, N-terminal nucleophile (Ntn) domain

结构域编号 domain_id	3okjW00
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	60 — 4-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	20 — Glutamine Phosphoribosylpyrophosphate, subunit 1, domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Aminohydrolase, N-terminal nucleophile (Ntn) domain

结构域编号 domain_id	3okjX00
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	60 — 4-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	20 — Glutamine Phosphoribosylpyrophosphate, subunit 1, domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Aminohydrolase, N-terminal nucleophile (Ntn) domain

结构域编号 domain_id	3okjY00
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	60 — 4-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	20 — Glutamine Phosphoribosylpyrophosphate, subunit 1, domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Aminohydrolase, N-terminal nucleophile (Ntn) domain

结构域编号 domain_id	3okjZ00
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	60 — 4-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	20 — Glutamine Phosphoribosylpyrophosphate, subunit 1, domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Aminohydrolase, N-terminal nucleophile (Ntn) domain

▶

晶胞边长 a length_a	134.590 Å
晶胞边长 b length_b	299.830 Å
晶胞边长 c length_c	143.600 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	112.60 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	90.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	4

空间群 space_group	P 1 21 1
空间群编号 int_tables_number	4
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	2.700 Å
最低分辨率 resolution_low	15.000 Å
R 因子 r_factor	0.2320
R_work r_work	0.2320
R_free r_free	0.2590

Alpha-keto-aldehyde binding mechanism reveals a novel lead structure motif for proteasome inhibition

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Proteasome component Y7

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Proteasome component Y13

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Proteasome component PRE6

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Proteasome component PUP2

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Proteasome component PRE5

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Proteasome component C1

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Proteasome component C7-alpha

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Proteasome component PUP1

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Proteasome component PUP3

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Proteasome component C11

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体