SAXSdb — 3pwv

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

MHC class I antigen

Bos taurus

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3）与蛋白拷贝数一致	链 A； UniProt 26–299	片段：UNP RESIDUES 26-299	Beta-2-microglobulin × 1 （P01888） 9-mer peptide from Hemagglutinin × 1 （Q9YKD7）	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；291 K；pH 7, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K	分辨率 2.70 Å R-free 0.232
2	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3）与蛋白拷贝数一致	链 D； UniProt 26–299	片段：UNP RESIDUES 26-299	Beta-2-microglobulin × 1 （P01888） 9-mer peptide from Hemagglutinin × 1 （Q9YKD7）	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；291 K；pH 7, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K	分辨率 2.70 Å R-free 0.232

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB	相对当前条目 3PWV	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
3PWU An immmunodominant CTL epitope from rinderpest virus presented by cattle MHC class I molecule N*01801(BoLA-A11) 提交 2010-12-09	构建体不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 A 26–299（274 aa）片段：residues in UNP 26-299	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；291 K；pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K	分辨率 1.90 Å R-free 0.230

共 1 个其他 PDB 条目、1 个 assembly。打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	Q95477_BOVIN
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 1–274； UniProt 26–299 作者链 D； PDB构建体 1–274； UniProt 26–299

Beta-2-microglobulin

Bos taurus

UniProt P01888

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3）与蛋白拷贝数一致	链 B； UniProt 21–118	未记录	MHC class I antigen × 1 （Q95477） 9-mer peptide from Hemagglutinin × 1 （Q9YKD7）	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；291 K；pH 7, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K	分辨率 2.70 Å R-free 0.232
2	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3）与蛋白拷贝数一致	链 E； UniProt 21–118	未记录	MHC class I antigen × 1 （Q95477） 9-mer peptide from Hemagglutinin × 1 （Q9YKD7）	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；291 K；pH 7, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K	分辨率 2.70 Å R-free 0.232

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB	相对当前条目 3PWV	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
1BMG CRYSTAL STRUCTURE OF BOVINE BETA2-MICROGLOBULIN 提交 1995-07-18	聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 21–118（98 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 2.50 Å R-free 0.290
2XFX cattle MHC class I N01301 presenting an 11mer from Theileria parva 提交 2010-05-28	构建体不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 B 20–118（99 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 7；20% PEG 8000, 50MM POTASSIUM PHOSPHATE, PH 7.0	分辨率 1.90 Å R-free 0.238
3L9R Crystal structure of bovine CD1b3 with endogenously bound ligands 提交 2010-01-05	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 21–118（98 aa）片段：UNP residues 21-118	未记录	NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 L9R (2S)-3-(octadecanoyloxy)-2-[(9Z)-octadec-9-enoyloxy]propyl 2-(trimethylammonio)ethyl phosphate × 1 GOL GLYCEROL × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；277 K；100 mM Na cacodylate pH 6.5, 2 M ammonium sulfate, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K	分辨率 2.30 Å R-free 0.248
3L9R Crystal structure of bovine CD1b3 with endogenously bound ligands 提交 2010-01-05	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 其他组合异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 D 21–118（98 aa）片段：UNP residues 21-118	未记录	NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 GOL GLYCEROL × 3 L9Q (1S)-2-{[(S)-(2-aminoethoxy)(hydroxy)phosphoryl]oxy}-1-[(octadecanoyloxy)methyl]ethyl (9Z)-octadec-9-enoate × 1 CL CHLORIDE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；277 K；100 mM Na cacodylate pH 6.5, 2 M ammonium sulfate, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K	分辨率 2.30 Å R-free 0.248
3L9R Crystal structure of bovine CD1b3 with endogenously bound ligands 提交 2010-01-05	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 其他组合异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 F 21–118（98 aa）片段：UNP residues 21-118	未记录	NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2 L9R (2S)-3-(octadecanoyloxy)-2-[(9Z)-octadec-9-enoyloxy]propyl 2-(trimethylammonio)ethyl phosphate × 1 GOL GLYCEROL × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；277 K；100 mM Na cacodylate pH 6.5, 2 M ammonium sulfate, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K	分辨率 2.30 Å R-free 0.248
3L9R Crystal structure of bovine CD1b3 with endogenously bound ligands 提交 2010-01-05	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 4 其他组合异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 H 21–118（98 aa）片段：UNP residues 21-118	未记录	NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 GOL GLYCEROL × 4 L9Q (1S)-2-{[(S)-(2-aminoethoxy)(hydroxy)phosphoryl]oxy}-1-[(octadecanoyloxy)methyl]ethyl (9Z)-octadec-9-enoate × 1 CL CHLORIDE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；277 K；100 mM Na cacodylate pH 6.5, 2 M ammonium sulfate, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K	分辨率 2.30 Å R-free 0.248
4F7C Crystal structure of bovine CD1d with bound C12-di-sulfatide 提交 2012-05-15	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 21–118（98 aa）片段：UNP residues 21-118	未记录	0SG N-{(2S,3R,4E)-1-[(3,6-di-O-sulfo-beta-D-galactopyranosyl)oxy]-3-hydroxyoctadec-4-en-2-yl}dodecanamide × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；295 K；20% PEG3350, 200 mM sodium formate, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 295K	分辨率 2.86 Å R-free 0.291
4F7C Crystal structure of bovine CD1d with bound C12-di-sulfatide 提交 2012-05-15	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 其他组合异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 D 21–118（98 aa）片段：UNP residues 21-118	未记录	0SG N-{(2S,3R,4E)-1-[(3,6-di-O-sulfo-beta-D-galactopyranosyl)oxy]-3-hydroxyoctadec-4-en-2-yl}dodecanamide × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；295 K；20% PEG3350, 200 mM sodium formate, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 295K	分辨率 2.86 Å R-free 0.291
4F7E Crystal structure of bovine CD1d with bound C16:0-alpha-galactosyl ceramide 提交 2012-05-15	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 21–118（98 aa）片段：UNP residues 21-118	未记录	0SH N-[(2S,3S,4R)-1-(alpha-D-galactopyranosyloxy)-3,4-dihydroxyoctadecan-2-yl]hexadecanamide × 1 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 SO4 SULFATE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；295 K；20% PEG4000, 200 mM potassium sulfate, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 295K	分辨率 2.40 Å R-free 0.276
4IIQ Crystal structure of a human MAIT TCR in complex with bovine MR1 提交 2012-12-20	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 C 21–118（98 aa）片段：UNP C1ITJ8 residues 19-295, UNP P01888 residues 21-118	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	SO4 SULFATE ION × 3	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；291 K；0.1 M Hepes, 1.5 M Ammonium Sulfate, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 291K	分辨率 2.86 Å R-free 0.271
4L8S Crystal structure of a human Valpha7.2/Vbeta13.3 MAIT TCR in complex with bovine MR1 提交 2013-06-17	突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 C 21–118（98 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	SO4 SULFATE ION × 5	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；291 K；0.1 M Hepes, 1.7 M Ammonium Sulfate, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 291.0K	分辨率 2.90 Å R-free 0.278
4L9L Crystal structure of a human Valpha7.2/Vbeta13.2 MAIT TCR in complex with bovine MR1 提交 2013-06-18	突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 C 21–118（98 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	SO4 SULFATE ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；291 K；0.1 M Hepes, 1.6 M Ammonium Sulfate, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 291.0K	分辨率 3.40 Å R-free 0.312
4L9L Crystal structure of a human Valpha7.2/Vbeta13.2 MAIT TCR in complex with bovine MR1 提交 2013-06-18	突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 信息不足异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 C 21–118（98 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	SO4 SULFATE ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；291 K；0.1 M Hepes, 1.6 M Ammonium Sulfate, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 291.0K	分辨率 3.40 Å R-free 0.312
4LCC Crystal structure of a human MAIT TCR in complex with a bacterial antigen bound to humanized bovine MR1 提交 2013-06-21	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 C 21–118（98 aa）片段：P01888 residues 21-118, C1ITJ8 residues 19-295	突变：A185M, R260Q, Q264L	1XL 1-deoxy-1-[6-(hydroxymethyl)-2,4-dioxo-3,4-dihydropteridin-8(2H)-yl]-D-arabinitol × 1 SO4 SULFATE ION × 4	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；291 K；0.1 M Hepes, 1.5 M Ammonium Sulfate, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 291.0K	分辨率 3.26 Å R-free 0.312
7RNO Model of the Ac-6-FP/hpMR1/bB2m/TAPBPR complex from integrated docking, NMR and restrained MD 提交 2021-07-29	聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 B 21–118（98 aa）	未记录	30W N-(6-formyl-4-oxo-3,4-dihydropteridin-2-yl)acetamide × 1	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 7.2；298.15 K；离子强度（mmCIF原始值）50；压力 1.01325 NMR样品组成 100 uM hpMR1 (human platform MR1), 100 uM [U-100% 12C; U-100% 15N; Ala CB, Ile CD1, Leu CD1/CD2, Val CG1/CG2] bovine beta 2 microglobulin, 300 uM TAPBPR, 90% H2O/10% D2O \| 90% H2O/10% D2O	分辨率未提供

共 10 个其他 PDB 条目、15 个 assembly。打开独立比较页并筛选聚集状态

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UniProt名称	B2MG_BOVIN
Isoform	—
PDB实体	2
链与序列区间	作者链 B； PDB构建体 1–98； UniProt 21–118 作者链 E； PDB构建体 1–98； UniProt 21–118

9-mer peptide from Hemagglutinin

物种未注明

UniProt Q9YKD7

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3）与蛋白拷贝数一致	链 C； UniProt 407–415	未记录	MHC class I antigen × 1 （Q95477） Beta-2-microglobulin × 1 （P01888）	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；291 K；pH 7, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K	分辨率 2.70 Å R-free 0.232
2	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3）与蛋白拷贝数一致	链 F； UniProt 407–415	未记录	MHC class I antigen × 1 （Q95477） Beta-2-microglobulin × 1 （P01888）	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；291 K；pH 7, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K	分辨率 2.70 Å R-free 0.232

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

数据库中没有找到同一 UniProt 蛋白的其他 PDB 条目。

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UniProt名称	Q9YKD7_9PARA
Isoform	—
PDB实体	3
链与序列区间	作者链 C； PDB构建体 1–9； UniProt 407–415 作者链 F； PDB构建体 1–9； UniProt 407–415

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	3pwv
沉积日期 deposition_date	2010-12-09
结构标题 title	An immmunodominant CTL epitope from rinderpest virus presented by cattle MHC class I molecule N*01801 (BoLA-A11)
关键词 keywords	MHC BoLA-A11 conformation cattle, immunodominant epitope, IMMUNE SYSTEM; IMMUNE SYSTEM
实验方法 method	X-RAY DIFFRACTION

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3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

回转半径 Rg (Guinier) rg_guinier	32.06 Å
回转半径 Rg (电子) rg_electron	31.08 Å
零角强度 I(0) i0	130567000.00
分子量 molecular_weight	88589.0 kDa
排除体积 excluded_volume	109750 Å³
包络体积 envelope_volume	146710 Å³
水化壳体积 shell_volume	39089 Å³
包络直径 envelope_diameter	106.8 Å
壳层 Rg shell_rg	38.96 Å
包络 Rg envelope_rg	30.03 Å
形状 Rg shape_rg	31.07 Å
总 Rg total_rg	31.78 Å
总原子数 total_atoms	6266
残基数 n_residues	762
球谐函数阶数 n_harmonics	20
q 范围 q_range	— – 0.5000 Å⁻¹
数据点数 n_points	101
壳层类型 shell_type	directional
溶剂电子密度 solvent_density	0.3340 e/Å³
壳层衬度 contrast_shell	0.0300 e/Å³
CRYSOL 版本 crysol_version	4.1.3

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4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

最大尺寸 Dmax dmax	99.6 Å
Rg (实空间) rg_real	31.96 Å
Rg 误差 (实空间) rg_real_error	0.83 Å
I(0) (实空间) i0_real	1.3060e+08
I(0) 误差 (实空间) i0_real_error	2.2860e+06
Rg (倒空间) rg_reciprocal	32.01 Å
I(0) (倒空间) i0_reciprocal	130600000.0000
解质量估计 total_estimate	0.8364
解质量评级 solution_quality	GOOD a GOOD solution
P(r) 峰数 n_peaks	2
主峰位置 r_peak_primary	38.6 Å
偏度 Skewness skewness	0.185
峰度 Kurtosis kurtosis	-0.592
角度范围 angular_range	— – 0.2450 Å⁻¹
当前正则化参数 α current_alpha	0.0000
最高正则化参数 α highest_alpha	14900000.0000
实空间数据点数 n_real_points	50
GNOM 版本 gnom_version	4.1.3
质量判据 quality_criteria	AN1: 0.000; Oscil: 0.962; Stabil: 0.994; Sysdev: 1.000; Positv: 1.000; Valcen: 1.000; Smooth: 0.000

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5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

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6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (4)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	MHC class I antigen
分子量 formula_weight	31797.1 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A,D
原子数 atom_count	6381

SHSLRYFYTAVSRPGLGEPRFIAVGYVDDTQFTRFDSDAPNPRDEPRVPWMEQEGPEYWDRNTRIYKDTAQIFRANLNTALGYYNQSEAGSHTFQEMYGCYVGPDGRLLLGFMQFAYDGRDYIALNEDLRSWTAADTAAQITKRKWEAAGEAERQRNYLEGRCVEGLRRYLENGKDTLLRADPPKAHVTHHPISDREVTLRCWALGFYPEEISLTWQHEGEDQTQDMELVETRPSGDGTFQKWAALVVPSGEEQRYTCRVQHEGLQEPLTLRWE

来源 Source

来源生物 organism	Bos taurus
通用名 common_name	bovine
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9913
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

实体 2 Entity 2 polymer

描述 description	Beta-2-microglobulin
分子量 formula_weight	11653.1 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	B,E

IQRPPKIQVYSRHPPEDGKPNYLNCYVYGFHPPQIEIDLLKNGEKIKSEQSDLSFSKDWSFYLLSHAEFTPNSKDQYSCRVKHVTLEQPRIVKWDRDL

来源 Source

来源生物 organism	Bos taurus
通用名 common_name	bovine
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9913
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

实体 3 Entity 3 polymer

描述 description	9-mer peptide from Hemagglutinin
分子量 formula_weight	946.1 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	C,F

IPAYGVLTI

实体 4 Entity 4 water

描述 description	water
分子量 formula_weight	18.0 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	115

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7. 折叠分类 (SCOP + CATH) 7 domains

SCOP 2.08 (1 domains)

结构域编号 domain_id	d3pwve_
类 Class class	b — All beta proteins
折叠类型 Fold fold	b.1 — Immunoglobulin-like beta-sandwich
超家族 Superfamily superfamily	b.1.1 — Immunoglobulin
家族 Family family	b.1.1.2 — C1 set domains (antibody constant domain-like)

CATH v4.4 (6 domains)

结构域编号 domain_id	3pwvA01
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	500 — Murine Class I Major Histocompatibility Complex, H2-DB; Chain A, domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — MHC class I-like antigen recognition-like

结构域编号 domain_id	3pwvA02
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	60 — Sandwich
拓扑 Topology topology	40 — Immunoglobulin-like
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Immunoglobulins

结构域编号 domain_id	3pwvB00
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	60 — Sandwich
拓扑 Topology topology	40 — Immunoglobulin-like
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Immunoglobulins

结构域编号 domain_id	3pwvD01
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	500 — Murine Class I Major Histocompatibility Complex, H2-DB; Chain A, domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — MHC class I-like antigen recognition-like

结构域编号 domain_id	3pwvD02
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	60 — Sandwich
拓扑 Topology topology	40 — Immunoglobulin-like
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Immunoglobulins

结构域编号 domain_id	3pwvE00
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	60 — Sandwich
拓扑 Topology topology	40 — Immunoglobulin-like
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Immunoglobulins

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8. 引用文献 (1)

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晶胞边长 a length_a	83.905 Å
晶胞边长 b length_b	83.905 Å
晶胞边长 c length_c	153.005 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	90.00 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	90.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	8

空间群 space_group	P 41
空间群编号 int_tables_number	76
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	2.696 Å
最低分辨率 resolution_low	30.225 Å
R 因子 r_factor	0.1905
R_work r_work	0.1882
R_free r_free	0.2323

fit	/app/data/saxs_computation/pw/3pwv/3pwv.fit
pddf	/app/data/pr_computation/pw/3pwv/3pwv.pr.out
profile	/app/data/saxs_computation/pw/3pwv/3pwv.dat

An immmunodominant CTL epitope from rinderpest virus presented by cattle MHC class I molecule N*01801 (BoLA-A11)

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

MHC class I antigen

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

Beta-2-microglobulin

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

9-mer peptide from Hemagglutinin

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (4)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 3 Entity 3 polymer

聚合物 Polymer

实体 4 Entity 4 water

7. 折叠分类 (SCOP + CATH) 7 domains

SCOP 2.08 (1 domains)

CATH v4.4 (6 domains)

8. 引用文献 (1)

9. 文件与曲线 (10)

Files (7)

Curves (3)