3q3m

Toluene 4 monooxygenase HD Complex with Inhibitor 4-Bromobenzoate

Method: X-RAY DIFFRACTION

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Toluene-4-monooxygenase system protein A

Pseudomonas mendocina

UniProt Q6Q8Q7

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 8 Toluene-4-monooxygenase system protein E × 2 (Q00460) Toluene-4-monooxygenase system protein B × 2 (Q00457) Toluene-4-monooxygenase system protein D × 2 (Q00459) FE (III) ION × 4 4-bromobenzoic acid × 7 water × 8 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 Q6Q8Q7_PSEME
Isoform
PDB实体 1
链与序列区间 作者链 A; PDB构建体 1–500; UniProt 1–500 作者链 D; PDB构建体 1–500; UniProt 1–500

Toluene-4-monooxygenase system protein E

Pseudomonas mendocina

UniProt Q00460

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 8 Toluene-4-monooxygenase system protein A × 2 (Q6Q8Q7) Toluene-4-monooxygenase system protein B × 2 (Q00457) Toluene-4-monooxygenase system protein D × 2 (Q00459) FE (III) ION × 4 4-bromobenzoic acid × 7 water × 8 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 TMOE_PSEME
Isoform
PDB实体 2
链与序列区间 作者链 B; PDB构建体 1–307; UniProt 1–307 作者链 F; PDB构建体 1–307; UniProt 1–307

Toluene-4-monooxygenase system protein B

Pseudomonas mendocina

UniProt Q00457

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 8 Toluene-4-monooxygenase system protein A × 2 (Q6Q8Q7) Toluene-4-monooxygenase system protein E × 2 (Q00460) Toluene-4-monooxygenase system protein D × 2 (Q00459) FE (III) ION × 4 4-bromobenzoic acid × 7 water × 8 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 TMOB_PSEME
Isoform
PDB实体 3
链与序列区间 作者链 C; PDB构建体 1–84; UniProt 1–84 作者链 G; PDB构建体 1–84; UniProt 1–84

Toluene-4-monooxygenase system protein D

Pseudomonas mendocina

UniProt Q00459

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 8 Toluene-4-monooxygenase system protein A × 2 (Q6Q8Q7) Toluene-4-monooxygenase system protein E × 2 (Q00460) Toluene-4-monooxygenase system protein B × 2 (Q00457) FE (III) ION × 4 4-bromobenzoic acid × 7 water × 8 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 TMOD_PSEME
Isoform
PDB实体 4
链与序列区间 作者链 E; PDB构建体 1–103; UniProt 1–103 作者链 H; PDB构建体 1–103; UniProt 1–103

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中;数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护,因此不在读者页面展示。

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id3q3m
沉积日期 deposition_date2010-12-22
结构标题 titleToluene 4 monooxygenase HD Complex with Inhibitor 4-Bromobenzoate
关键词 keywords;aromatic hydrocarbon catabolism, iron, multi-component monooxygenase, aromatic hydroxylation, OXIDOREDUCTASE-OXIDOREDUCTASE INHIBITOR complex ;; OXIDOREDUCTASE/OXIDOREDUCTASE INHIBITOR
实验方法 methodX-RAY DIFFRACTION

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

3q3m__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

3q3m__assembly_1__model_1 | I(q)

10-2 10-1 106 107 108 q (1/Angstrom) I(q)
100 个绘图点;横轴和纵轴均采用对数尺度。

3q3m__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

新版 assembly/model P(r) 尚未计算 此处仅保留位置,不展示旧数据 r (Angstrom) P(r)
P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。
Rg(Guinier)39.85 Å
Rg(电子密度)39.35 Å
总 Rg39.74 Å
原子数16128
残基数1960
排除体积284310 ų
最大 q0.500 Å⁻¹
Assembly Model 结构单元 聚集说明 状态 CRYSOL 操作
1 1 3q3m__assembly_1__model_1 octameric (8) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (7)

6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 14 domains

SCOP 2.08 (6 domains)

结构域编号 domain_idd3q3ma_
类 Class classa — All alpha proteins
折叠类型 Fold folda.25 — Ferritin-like
超家族 Superfamily superfamilya.25.1 — Ferritin-like
家族 Family familya.25.1.2 — Ribonucleotide reductase-like
结构域编号 domain_idd3q3mc_
类 Class classd — Alpha and beta proteins (a+b)
折叠类型 Fold foldd.15 — beta-Grasp (ubiquitin-like)
超家族 Superfamily superfamilyd.15.12 — TmoB-like
家族 Family familyd.15.12.0 — automated matches
结构域编号 domain_idd3q3md_
类 Class classa — All alpha proteins
折叠类型 Fold folda.25 — Ferritin-like
超家族 Superfamily superfamilya.25.1 — Ferritin-like
家族 Family familya.25.1.2 — Ribonucleotide reductase-like
结构域编号 domain_idd3q3me_
类 Class classd — Alpha and beta proteins (a+b)
折叠类型 Fold foldd.137 — Monooxygenase (hydroxylase) regulatory protein
超家族 Superfamily superfamilyd.137.1 — Monooxygenase (hydroxylase) regulatory protein
家族 Family familyd.137.1.1 — Monooxygenase (hydroxylase) regulatory protein
结构域编号 domain_idd3q3mg_
类 Class classd — Alpha and beta proteins (a+b)
折叠类型 Fold foldd.15 — beta-Grasp (ubiquitin-like)
超家族 Superfamily superfamilyd.15.12 — TmoB-like
家族 Family familyd.15.12.0 — automated matches
结构域编号 domain_idd3q3mh_
类 Class classd — Alpha and beta proteins (a+b)
折叠类型 Fold foldd.137 — Monooxygenase (hydroxylase) regulatory protein
超家族 Superfamily superfamilyd.137.1 — Monooxygenase (hydroxylase) regulatory protein
家族 Family familyd.137.1.1 — Monooxygenase (hydroxylase) regulatory protein

CATH v4.4 (8 domains)

结构域编号 domain_id3q3mA00
类 Class class1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology620 — Ribonucleotide Reductase, subunit A
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily20 — Ribonucleotide Reductase, subunit A
结构域编号 domain_id3q3mB00
类 Class class1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology620 — Ribonucleotide Reductase, subunit A
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily20 — Ribonucleotide Reductase, subunit A
结构域编号 domain_id3q3mC00
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture10 — Roll
拓扑 Topology topology20 — Ubiquitin-like (UB roll)
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily270 — TmoB-like
结构域编号 domain_id3q3mD00
类 Class class1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology620 — Ribonucleotide Reductase, subunit A
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily20 — Ribonucleotide Reductase, subunit A
结构域编号 domain_id3q3mE00
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture90 — Alpha-Beta Complex
拓扑 Topology topology56 — Phenol Hydroxylase P2 Protein
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — Monooxygenase component MmoB/DmpM
结构域编号 domain_id3q3mF00
类 Class class1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology620 — Ribonucleotide Reductase, subunit A
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily20 — Ribonucleotide Reductase, subunit A
结构域编号 domain_id3q3mG00
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture10 — Roll
拓扑 Topology topology20 — Ubiquitin-like (UB roll)
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily270 — TmoB-like
结构域编号 domain_id3q3mH00
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture90 — Alpha-Beta Complex
拓扑 Topology topology56 — Phenol Hydroxylase P2 Protein
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — Monooxygenase component MmoB/DmpM

7. 引用文献 (1)