Thioredoxin reductase 1, cytoplasmic
Homo sapiens
当前结构中的状态
| Assembly | 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与共同组分 | 实验方法与环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric(4) 与蛋白拷贝数一致 | 链 A; UniProt 1–499 链 B; UniProt 1–499 | 突变:C497S, U498C | Thioredoxin × 2 (P10599) FAD FLAVIN-ADENINE DINUCLEOTIDE × 2 GOL GLYCEROL × 6 | X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件:VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6.5;297.15 K;15% PEG 6000, 0.1M MES, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 297.15 K | 分辨率 2.20 Å R-free 0.283 |
数据库中的同蛋白其他状态
以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly, “相对当前条目”直接指出证据层面的不同;没有差异标签表示当前已读取字段一致。
| 其他 PDB | 相对当前条目 3QFA | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法与环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 2CFY Crystal structure of human thioredoxin reductase 1 提交 2006-02-26 | 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric |
链 A
1–499(499 aa)
链 B
1–499(499 aa)
|
未记录 | FAD FLAVIN-ADENINE DINUCLEOTIDE × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;150 UL SITTING DROPS, 20% PEG3350, 0.1 M TRIS PH 7, ADDITIVE: NSDB-221
|
分辨率 2.70 Å R-free 0.248 |
| 2CFY Crystal structure of human thioredoxin reductase 1 提交 2006-02-26 | 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric |
链 C
1–499(499 aa)
链 D
1–499(499 aa)
|
未记录 | FAD FLAVIN-ADENINE DINUCLEOTIDE × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;150 UL SITTING DROPS, 20% PEG3350, 0.1 M TRIS PH 7, ADDITIVE: NSDB-221
|
分辨率 2.70 Å R-free 0.248 |
| 2CFY Crystal structure of human thioredoxin reductase 1 提交 2006-02-26 | 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 3 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric |
链 E
1–499(499 aa)
链 F
1–499(499 aa)
|
未记录 | FAD FLAVIN-ADENINE DINUCLEOTIDE × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;150 UL SITTING DROPS, 20% PEG3350, 0.1 M TRIS PH 7, ADDITIVE: NSDB-221
|
分辨率 2.70 Å R-free 0.248 |
| 2J3N X-ray structure of human thioredoxin reductase 1 提交 2006-08-22 | 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric |
链 A
1–499(499 aa)
链 B
1–499(499 aa)
|
未记录 | FAD FLAVIN-ADENINE DINUCLEOTIDE × 2 NAP NADP NICOTINAMIDE-ADENINE-DINUCLEOTIDE PHOSPHATE × 2 MPD (4S)-2-METHYL-2,4-PENTANEDIOL × 3 | X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 2.80 Å R-free 0.287 |
| 2J3N X-ray structure of human thioredoxin reductase 1 提交 2006-08-22 | 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric |
链 C
1–499(499 aa)
链 D
1–499(499 aa)
|
未记录 | FAD FLAVIN-ADENINE DINUCLEOTIDE × 2 NAP NADP NICOTINAMIDE-ADENINE-DINUCLEOTIDE PHOSPHATE × 2 MPD (4S)-2-METHYL-2,4-PENTANEDIOL × 1 | X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 2.80 Å R-free 0.287 |
| 2J3N X-ray structure of human thioredoxin reductase 1 提交 2006-08-22 | 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 3 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric |
链 E
1–499(499 aa)
链 F
1–499(499 aa)
|
未记录 | FAD FLAVIN-ADENINE DINUCLEOTIDE × 2 NAP NADP NICOTINAMIDE-ADENINE-DINUCLEOTIDE PHOSPHATE × 2 MPD (4S)-2-METHYL-2,4-PENTANEDIOL × 1 | X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 2.80 Å R-free 0.287 |
| 2ZZ0 Crystal structure of human thioredoxin reductase I (SeCys 498 Cys) 提交 2009-02-02 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric |
链 A
150–649(500 aa)
片段:residues (-13)-499
链 B
150–649(500 aa)
片段:residues (-13)-499
|
突变:SeCys498Cys 突变:SeCys498Cys | FAD FLAVIN-ADENINE DINUCLEOTIDE × 2 SO4 SULFATE ION × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6;298 K;5% PEG 3350, 0.005M magnesium Sulfate, 0.05M MES, pH 6.0, 20% 1,6 Hexanediol (0.001mL), VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K
|
分辨率 2.80 Å R-free 0.277 |
| 2ZZ0 Crystal structure of human thioredoxin reductase I (SeCys 498 Cys) 提交 2009-02-02 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric |
链 C
150–649(500 aa)
片段:residues (-13)-499
链 D
150–649(500 aa)
片段:residues (-13)-499
|
突变:SeCys498Cys 突变:SeCys498Cys | FAD FLAVIN-ADENINE DINUCLEOTIDE × 2 SO4 SULFATE ION × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6;298 K;5% PEG 3350, 0.005M magnesium Sulfate, 0.05M MES, pH 6.0, 20% 1,6 Hexanediol (0.001mL), VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K
|
分辨率 2.80 Å R-free 0.277 |
| 2ZZB Crystal structure of human thioredoxin reductase I and terpyridine platinum(II) 提交 2009-02-09 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric |
链 A
150–649(500 aa)
片段:residues (-13)-499
链 B
150–649(500 aa)
片段:residues (-13)-499
|
突变:SeCys498Cys 突变:SeCys498Cys | FAD FLAVIN-ADENINE DINUCLEOTIDE × 2 SO4 SULFATE ION × 2 TPT 2,2':6',2''-TERPYRIDINE PLATINUM(II) Chloride × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6;298 K;5% PEG 3350, 0.005M magnesium Sulfate, 0.05M MES, pH 6.0, additive: 20% 1,6 Hexanediol (0.001mL), VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K
|
分辨率 3.20 Å R-free 0.305 |
| 2ZZB Crystal structure of human thioredoxin reductase I and terpyridine platinum(II) 提交 2009-02-09 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric |
链 C
150–649(500 aa)
片段:residues (-13)-499
链 D
150–649(500 aa)
片段:residues (-13)-499
|
突变:SeCys498Cys 突变:SeCys498Cys | FAD FLAVIN-ADENINE DINUCLEOTIDE × 2 SO4 SULFATE ION × 2 TPT 2,2':6',2''-TERPYRIDINE PLATINUM(II) Chloride × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6;298 K;5% PEG 3350, 0.005M magnesium Sulfate, 0.05M MES, pH 6.0, additive: 20% 1,6 Hexanediol (0.001mL), VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K
|
分辨率 3.20 Å R-free 0.305 |
| 2ZZC Crystal structure of NADP(H):human thioredoxin reductase I 提交 2009-02-09 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric |
链 A
150–649(500 aa)
片段:residues (-13)-499
链 B
150–649(500 aa)
片段:residues (-13)-499
|
突变:SeCys498Cys 突变:SeCys498Cys | FAD FLAVIN-ADENINE DINUCLEOTIDE × 2 NAP NADP NICOTINAMIDE-ADENINE-DINUCLEOTIDE PHOSPHATE × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6;298 K;5% PEG 3350, 0.005M Magnesium Sulfate, 0.05M MES, pH 6.0, additive: 20% 1,6 Hexanediol (0.001mL), VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K
|
分辨率 2.60 Å R-free 0.260 |
| 2ZZC Crystal structure of NADP(H):human thioredoxin reductase I 提交 2009-02-09 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric |
链 C
150–649(500 aa)
片段:residues (-13)-499
链 D
150–649(500 aa)
片段:residues (-13)-499
|
突变:SeCys498Cys 突变:SeCys498Cys | FAD FLAVIN-ADENINE DINUCLEOTIDE × 2 NAP NADP NICOTINAMIDE-ADENINE-DINUCLEOTIDE PHOSPHATE × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6;298 K;5% PEG 3350, 0.005M Magnesium Sulfate, 0.05M MES, pH 6.0, additive: 20% 1,6 Hexanediol (0.001mL), VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K
|
分辨率 2.60 Å R-free 0.260 |
| 3QFB Crystal structure of the human thioredoxin reductase-thioredoxin complex 提交 2011-01-21 | 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric |
链 A
1–499(499 aa)
链 B
1–499(499 aa)
|
突变:C497S, U498C 突变:C497S, U498C | FAD FLAVIN-ADENINE DINUCLEOTIDE × 2 GOL GLYCEROL × 6 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7.6;297.15 K;15% PEG 4000, pH 7.6, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 297.15K
|
分辨率 2.60 Å R-free 0.297 |
| 7X1R Cryo-EM structure of human thioredoxin reductase bound by Au 提交 2022-02-24 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric |
链 A
152–649(498 aa)
链 B
152–649(498 aa)
|
未记录 | FAD FLAVIN-ADENINE DINUCLEOTIDE × 2 AU GOLD ION × 2 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.90 Å |
| 9UIN Human thioredoxin reductase 1 (SeCys 498 Cys) with Cu(I) 提交 2025-04-15 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric |
链 A
151–649(499 aa)
链 B
151–649(499 aa)
|
突变:SEC498C 突变:SEC498C | TXP 1,4,5,6-TETRAHYDRONICOTINAMIDE ADENINE DINUCLEOTIDE PHOSPHATE × 2 FAD FLAVIN-ADENINE DINUCLEOTIDE × 2 CU COPPER (II) ION × 6 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.03 Å |
共 8 个其他 PDB 条目、15 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态
查看构建体与数据证据
| UniProt名称 | TRXR1_HUMAN |
| Isoform | — |
| PDB实体 | 1 |
| 链与序列区间 | 作者链 A; PDB构建体 21–519; UniProt 1–499 作者链 B; PDB构建体 21–519; UniProt 1–499 |